通过源至目标模态丢失图像的插图可以促进医学成像中的下游任务。合成目标图像的普遍方法涉及通过生成对抗网络(GAN)的单发映射。然而,隐式表征图像分布的GAN模型可能会受到样本保真度和多样性的有限。在这里,我们提出了一种基于对抗扩散建模Syndiff的新方法,以提高医学图像合成的可靠性。为了捕获图像分布的直接相关性,Syndiff利用条件扩散过程逐步将噪声和源图像映射到目标图像上。对于推断期间的快速准确图像采样,大扩散步骤与反向扩散方向的对抗投影结合在一起。为了对未配对的数据集进行培训,设计了一个循环一致的体系结构,并使用两个耦合的扩散过程,以合成给定源的目标和给定的目标。报告了有关联合竞争性GAN和扩散模型在多对比度MRI和MRI-CT翻译中的效用的广泛评估。我们的示威表明,Syndiff在定性和定量上都可以针对竞争基线提供出色的性能。
translated by 谷歌翻译
深度MRI重建通常是使用有条件的模型进行的,该模型将其映射到完全采样的数据作为输出中。有条件的模型在加速成像运算符的知识下执行了脱氧,因此在操作员的域转移下,它们概括了很差。无条件模型是一种强大的替代方法,相反,它可以学习生成图像先验,以提高针对领域转移的可靠性。鉴于它们的高度代表性多样性和样本质量,最近的扩散模型特别有希望。然而,事先通过静态图像进行预测会导致次优性能。在这里,我们提出了一种基于适应性扩散的新型MRI重建Adadiff。为了启用有效的图像采样,引入了一个可以使用大扩散步骤的对抗映射器。使用受过训练的先验进行两阶段的重建:一个快速扩散阶段,产生初始重建阶段,以及一个适应阶段,其中更新扩散先验以最大程度地减少获得的K空间数据的重建损失。关于多对比的大脑MRI的演示清楚地表明,Adadiff在跨域任务中的竞争模型以及域内任务中的卓越或PAR性能方面取得了出色的性能。
translated by 谷歌翻译
基于学习的MRI翻译涉及一个合成模型,该模型将源对比度映射到目标对比图像上。多机构合作是跨广泛数据集培训合​​成模型的关键,但是集中式培训涉及隐私风险。联合学习(FL)是一个协作框架,相反,采用分散培训,以避免共享成像数据并减轻隐私问题。但是,成像数据的分布中固有的异质性可能会损害训练的模型。一方面,即使对于具有固定源目标配置的常见翻译任务,图像分布的隐式变化也很明显。相反,当规定具有不同源目标配置的不同翻译任务时,在站点内和跨站点内会出现明确的变化。为了提高针对域转移的可靠性,我们在这里介绍了MRI合成的第一种个性化FL方法(PFLSYNTH)。 PFLSYNTH基于配备映射器的对抗模型,该映射器会产生特定于单个站点和源目标对比的潜伏期。它利用新颖的个性化阻滞了基于这些潜伏期的发电机跨发电机图的统计和加权。为了进一步促进位点特异性,在发电机的下游层上采用了部分模型聚集,而上游层则保留在本地。因此,PFLSYNTH可以培训统一的合成模型,该模型可以可靠地跨越多个站点和翻译任务。在多站点数据集上进行的全面实验清楚地证明了PFLSHNTH在多对比度MRI合成中对先前联合方法的增强性能。
translated by 谷歌翻译
MRI和CT是最广泛使用的医学成像方式。通常有必要获取用于诊断和治疗的多模式图像,例如放射疗法计划。但是,多模式成像不仅昂贵,而且还引入了MRI和CT图像之间的错位。为了应对这一挑战,计算转换是MRI和CT图像之间的可行方法,尤其是从MRI到CT图像。在本文中,我们建议在这种情况下使用一个名为“扩散和得分匹配模型”的新兴深度学习框架。具体而言,我们适应了deno的扩散概率和得分匹配模型,使用四种不同的抽样策略,并将其性能指标与使用卷积神经网络和生成的对抗网络模型进行比较。我们的结果表明,扩散和得分匹配模型比CNN和GAN模型产生更好的合成CT图像。此外,我们使用蒙特卡洛方法研究了与扩散和得分匹配网络相关的不确定性,并通过平均其蒙特卡洛输出来改善结果。我们的研究表明,扩散和得分匹配模型具有强大的功能,可以生成以使用互补成像方式获得的图像来调节的高质量图像,在分析上进行了严格的解释性,并具有清晰的解释性,并且具有CNNS和GAN的高度竞争,以进行图像合成。
translated by 谷歌翻译
DeNoising扩散模型代表了计算机视觉中最新的主题,在生成建模领域表现出了显着的结果。扩散模型是一个基于两个阶段的深层生成模型,一个正向扩散阶段和反向扩散阶段。在正向扩散阶段,通过添加高斯噪声,输入数据在几个步骤中逐渐受到干扰。在反向阶段,模型的任务是通过学习逐步逆转扩散过程来恢复原始输入数据。尽管已知的计算负担,即由于采样过程中涉及的步骤数量,扩散模型对生成样品的质量和多样性得到了广泛赞赏。在这项调查中,我们对视觉中应用的denoising扩散模型的文章进行了全面综述,包括该领域的理论和实际贡献。首先,我们识别并介绍了三个通用扩散建模框架,这些框架基于扩散概率模型,噪声调节得分网络和随机微分方程。我们进一步讨论了扩散模型与其他深层生成模型之间的关系,包括变异自动编码器,生成对抗网络,基于能量的模型,自回归模型和正常流量。然后,我们介绍了计算机视觉中应用的扩散模型的多角度分类。最后,我们说明了扩散模型的当前局限性,并设想了一些有趣的未来研究方向。
translated by 谷歌翻译
多模式的医学图像完成已广泛应用,以减轻许多多模式诊断任务中缺失的模式问题。但是,对于大多数现有的合成方法,它们缺失模式的推断可能会崩溃为确定性映射,从而忽略了跨模式关系中固有的不确定性。在这里,我们提出了统一的多模式条件分数的生成模型(UMM-CSGM),以利用基于得分的生成模型(SGM)在建模和随机采样目标概率分布中,并进一步将SGM扩展到交叉模式统一框架中各种缺失模式配置的条件合成。具体而言,UMM-CSGM采用一种新型的多中心条件分数网络(MM-CSN),通过在完整的模态空间中的条件扩散和反向产生来学习一组综合的跨模式条件分布。通过这种方式,可以通过所有可用信息来准确地制定生成过程,并可以符合单个网络中缺少模式的所有可能配置。 BRATS19数据集的实验表明,UMM-CSGM可以更可靠地合成肿瘤诱导的任何缺失方式的肿瘤诱导病变中的异质增强和不规则面积。
translated by 谷歌翻译
Human organs constantly undergo anatomical changes due to a complex mix of short-term (e.g., heartbeat) and long-term (e.g., aging) factors. Evidently, prior knowledge of these factors will be beneficial when modeling their future state, i.e., via image generation. However, most of the medical image generation tasks only rely on the input from a single image, thus ignoring the sequential dependency even when longitudinal data is available. Sequence-aware deep generative models, where model input is a sequence of ordered and timestamped images, are still underexplored in the medical imaging domain that is featured by several unique challenges: 1) Sequences with various lengths; 2) Missing data or frame, and 3) High dimensionality. To this end, we propose a sequence-aware diffusion model (SADM) for the generation of longitudinal medical images. Recently, diffusion models have shown promising results on high-fidelity image generation. Our method extends this new technique by introducing a sequence-aware transformer as the conditional module in a diffusion model. The novel design enables learning longitudinal dependency even with missing data during training and allows autoregressive generation of a sequence of images during inference. Our extensive experiments on 3D longitudinal medical images demonstrate the effectiveness of SADM compared with baselines and alternative methods.
translated by 谷歌翻译
可变形图像配准是医学成像和计算机视觉的基本任务之一。经典登记算法通常依赖于迭代优化方法来提供准确的变形,这需要高计算成本。虽然已经开发了许多基于深度学习的方法来进行快速图像登记,但估计具有较少拓扑折叠问题的变形场仍然挑战。此外,这些方法仅使登记到单个固定图像,并且不可能在移动和固定图像之间获得连续变化的登记结果。为了解决这个问题,我们介绍了一种新的扩散模型的概率图像配准方法,称为DemageUseMorph。具体而言,我们的模型了解移动和固定图像之间变形的得分函数。类似于现有的扩散模型,DiffUsemorph不仅通过反向扩散过程提供合成变形图像,而且还使运动图像的各种水平与潜在的空间一起。在2D面部表达图像和3D脑图像登记任务上的实验结果表明,我们的方法可以通过拓扑保存能力提供灵活和准确的变形。
translated by 谷歌翻译
由于受试者辍学或扫描失败,在纵向研究中不可避免地扫描是不可避免的。在本文中,我们提出了一个深度学习框架,以预测获得的扫描中缺少扫描,从而迎合纵向婴儿研究。由于快速的对比和结构变化,特别是在生命的第一年,对婴儿脑MRI的预测具有挑战性。我们引入了值得信赖的变质生成对抗网络(MGAN),用于将婴儿脑MRI从一个时间点转换为另一个时间点。MGAN具有三个关键功能:(i)图像翻译利用空间和频率信息以进行详细信息提供映射;(ii)将注意力集中在具有挑战性地区的质量指导学习策略。(iii)多尺度杂种损失函数,可改善组织对比度和结构细节的翻译。实验结果表明,MGAN通过准确预测对比度和解剖学细节来优于现有的gan。
translated by 谷歌翻译
过去十年已经开发了各种各样的深度生成模型。然而,这些模型通常同时努力解决三个关键要求,包括:高样本质量,模式覆盖和快速采样。我们称之为这些要求所征收的挑战是生成的学习Trielemma,因为现有模型经常为他人交易其中一些。特别是,去噪扩散模型表明了令人印象深刻的样本质量和多样性,但它们昂贵的采样尚未允许它们在许多现实世界应用中应用。在本文中,我们认为这些模型中的缓慢采样基本上归因于去噪步骤中的高斯假设,这些假设仅针对小型尺寸的尺寸。为了使得具有大步骤的去噪,从而减少去噪步骤的总数,我们建议使用复杂的多模态分布来模拟去噪分布。我们引入了去噪扩散生成的对抗网络(去噪扩散GANS),其使用多模式条件GaN模拟每个去噪步骤。通过广泛的评估,我们表明去噪扩散GAN获得原始扩散模型的样本质量和多样性,而在CIFAR-10数据集中是2000 $ \时代。与传统的GAN相比,我们的模型表现出更好的模式覆盖和样本多样性。据我们所知,去噪扩散GaN是第一模型,可在扩散模型中降低采样成本,以便允许它们廉价地应用于现实世界应用。项目页面和代码:https://nvlabs.github.io/denoising-diffusion-gan
translated by 谷歌翻译
在不利天气条件下的图像恢复对各种计算机视觉应用引起了重大兴趣。最近的成功方法取决于深度神经网络架构设计(例如,具有视觉变压器)的当前进展。由最新的条件生成模型取得的最新进展的动机,我们提出了一种基于贴片的图像恢复算法,基于脱氧扩散概率模型。我们的基于贴片的扩散建模方法可以通过使用指导的DeNoising过程进行尺寸 - 不足的图像恢复,并在推理过程中对重叠贴片进行平滑的噪声估计。我们在基准数据集上经验评估了我们的模型,以进行图像,混合的降低和飞行以及去除雨滴的去除。我们展示了我们在特定天气和多天气图像恢复上实现最先进的表演的方法,并在质量上表现出对现实世界测试图像的强烈概括。
translated by 谷歌翻译
Recent advances in computer vision have shown promising results in image generation. Diffusion probabilistic models in particular have generated realistic images from textual input, as demonstrated by DALL-E 2, Imagen and Stable Diffusion. However, their use in medicine, where image data typically comprises three-dimensional volumes, has not been systematically evaluated. Synthetic images may play a crucial role in privacy preserving artificial intelligence and can also be used to augment small datasets. Here we show that diffusion probabilistic models can synthesize high quality medical imaging data, which we show for Magnetic Resonance Images (MRI) and Computed Tomography (CT) images. We provide quantitative measurements of their performance through a reader study with two medical experts who rated the quality of the synthesized images in three categories: Realistic image appearance, anatomical correctness and consistency between slices. Furthermore, we demonstrate that synthetic images can be used in a self-supervised pre-training and improve the performance of breast segmentation models when data is scarce (dice score 0.91 vs. 0.95 without vs. with synthetic data).
translated by 谷歌翻译
Magnetic Resonance Fingerprinting (MRF) is an efficient quantitative MRI technique that can extract important tissue and system parameters such as T1, T2, B0, and B1 from a single scan. This property also makes it attractive for retrospectively synthesizing contrast-weighted images. In general, contrast-weighted images like T1-weighted, T2-weighted, etc., can be synthesized directly from parameter maps through spin-dynamics simulation (i.e., Bloch or Extended Phase Graph models). However, these approaches often exhibit artifacts due to imperfections in the mapping, the sequence modeling, and the data acquisition. Here we propose a supervised learning-based method that directly synthesizes contrast-weighted images from the MRF data without going through the quantitative mapping and spin-dynamics simulation. To implement our direct contrast synthesis (DCS) method, we deploy a conditional Generative Adversarial Network (GAN) framework and propose a multi-branch U-Net as the generator. The input MRF data are used to directly synthesize T1-weighted, T2-weighted, and fluid-attenuated inversion recovery (FLAIR) images through supervised training on paired MRF and target spin echo-based contrast-weighted scans. In-vivo experiments demonstrate excellent image quality compared to simulation-based contrast synthesis and previous DCS methods, both visually as well as by quantitative metrics. We also demonstrate cases where our trained model is able to mitigate in-flow and spiral off-resonance artifacts that are typically seen in MRF reconstructions and thus more faithfully represent conventional spin echo-based contrast-weighted images.
translated by 谷歌翻译
Diffusion models are rising as a powerful solution for high-fidelity image generation, which exceeds GANs in quality in many circumstances. However, their slow training and inference speed is a huge bottleneck, blocking them from being used in real-time applications. A recent DiffusionGAN method significantly decreases the models' running time by reducing the number of sampling steps from thousands to several, but their speeds still largely lag behind the GAN counterparts. This paper aims to reduce the speed gap by proposing a novel wavelet-based diffusion structure. We extract low-and-high frequency components from both image and feature levels via wavelet decomposition and adaptively handle these components for faster processing while maintaining good generation quality. Furthermore, we propose to use a reconstruction term, which effectively boosts the model training convergence. Experimental results on CelebA-HQ, CIFAR-10, LSUN-Church, and STL-10 datasets prove our solution is a stepping-stone to offering real-time and high-fidelity diffusion models. Our code and pre-trained checkpoints will be available at \url{https://github.com/VinAIResearch/WaveDiff.git}.
translated by 谷歌翻译
The existence of completely aligned and paired multi-modal neuroimaging data has proved its effectiveness in diagnosis of brain diseases. However, collecting the full set of well-aligned and paired data is expensive or even impractical, since the practical difficulties may include high cost, long time acquisition, image corruption, and privacy issues. A realistic solution is to explore either an unsupervised learning or a semi-supervised learning to synthesize the absent neuroimaging data. In this paper, we are the first one to comprehensively approach cross-modality neuroimage synthesis task from different perspectives, which include the level of the supervision (especially for weakly-supervised and unsupervised), loss function, evaluation metrics, the range of modality synthesis, datasets (aligned, private and public) and the synthesis-based downstream tasks. To begin with, we highlight several opening challenges for cross-modality neuroimage sysnthesis. Then we summarize the architecture of cross-modality synthesis under various of supervision level. In addition, we provide in-depth analysis of how cross-modality neuroimage synthesis can improve the performance of different downstream tasks. Finally, we re-evaluate the open challenges and point out the future directions for the remaining challenges. All resources are available at https://github.com/M-3LAB/awesome-multimodal-brain-image-systhesis
translated by 谷歌翻译
\ textit {objection:}基于gadolinium的对比剂(GBCA)已被广泛用于更好地可视化脑磁共振成像中的疾病(MRI)。然而,大脑和身体内部的gadolin量引起了人们对使用GBCA的安全问题。因此,在提供类似的对比度信息的同时,可以减少甚至消除GBCA暴露的新方法的发展将在临床上具有重大用途。 \ textit {方法:}在这项工作中,我们提出了一种基于深度学习的方法,用于对脑肿瘤患者的对比增强T1合成。 3D高分辨率完全卷积网络(FCN)通过处理和聚合并行的多尺度信息保持高分辨率信息,旨在将前对比度MRI序列映射到对比度增强的MRI序列。具体而言,将三个前对比的MRI序列T1,T2和表观扩散系数图(ADC)用作输入,而对比后T1序列则被用作目标输出。为了减轻正常组织与肿瘤区域之间的数据不平衡问题,我们引入了局部损失,以改善肿瘤区域的贡献,从而可以更好地增强对肿瘤的增强结果。 \ textIt {结果:}进行了广泛的定量和视觉评估,我们提出的模型在大脑中达到28.24db的PSNR,在肿瘤区域达到21.2db。 \ textit {结论和意义:}我们的结果表明,用深度学习产生的合成对比图像代替GBCA的潜力。代码可在\ url {https://github.com/chenchao666/contrast-enhanced-mri-synthesis中获得
translated by 谷歌翻译
扩散概率模型采用前向马尔可夫扩散链逐渐将数据映射到噪声分布,学习如何通过推断一个反向马尔可夫扩散链来生成数据以颠倒正向扩散过程。为了实现竞争性数据生成性能,他们需要一条长长的扩散链,这使它们在培训中不仅在培训中而且发电。为了显着提高计算效率,我们建议通过废除将数据扩散到随机噪声的要求来截断正向扩散链。因此,我们从隐式生成分布而不是随机噪声启动逆扩散链,并通过将其与截断的正向扩散链损坏的数据的分布相匹配来学习其参数。实验结果表明,就发电性能和所需的逆扩散步骤的数量而言,我们的截短扩散概率模型对未截断的概率模型提供了一致的改进。
translated by 谷歌翻译
Conditional diffusion probabilistic models can model the distribution of natural images and can generate diverse and realistic samples based on given conditions. However, oftentimes their results can be unrealistic with observable color shifts and textures. We believe that this issue results from the divergence between the probabilistic distribution learned by the model and the distribution of natural images. The delicate conditions gradually enlarge the divergence during each sampling timestep. To address this issue, we introduce a new method that brings the predicted samples to the training data manifold using a pretrained unconditional diffusion model. The unconditional model acts as a regularizer and reduces the divergence introduced by the conditional model at each sampling step. We perform comprehensive experiments to demonstrate the effectiveness of our approach on super-resolution, colorization, turbulence removal, and image-deraining tasks. The improvements obtained by our method suggest that the priors can be incorporated as a general plugin for improving conditional diffusion models.
translated by 谷歌翻译
通过将图像形成过程分解成逐个申请的去噪自身额,扩散模型(DMS)实现了最先进的合成导致图像数据和超越。另外,它们的配方允许引导机构来控制图像生成过程而不会再刷新。然而,由于这些模型通常在像素空间中直接操作,因此强大的DMS的优化通常消耗数百个GPU天,并且由于顺序评估,推理是昂贵的。为了在保留其质量和灵活性的同时启用有限计算资源的DM培训,我们将它们应用于强大的佩带自动化器的潜在空间。与以前的工作相比,这种代表上的培训扩散模型允许第一次达到复杂性降低和细节保存之间的近乎最佳点,极大地提高了视觉保真度。通过将跨关注层引入模型架构中,我们将扩散模型转化为强大而柔性的发电机,以进行诸如文本或边界盒和高分辨率合成的通用调节输入,以卷积方式变得可以实现。我们的潜在扩散模型(LDMS)实现了一种新的技术状态,可在各种任务中进行图像修复和高竞争性能,包括无条件图像生成,语义场景合成和超级分辨率,同时与基于像素的DMS相比显着降低计算要求。代码可在https://github.com/compvis/lattent-diffusion获得。
translated by 谷歌翻译
在临床医学中,磁共振成像(MRI)是诊断,分类,预后和治疗计划中最重要的工具之一。然而,MRI遭受了固有的慢数据采集过程,因为数据在k空间中顺序收集。近年来,大多数MRI重建方法在文献中侧重于整体图像重建而不是增强边缘信息。这项工作通过详细说明了对边缘信息的提高来阐述了这一趋势。具体地,我们通过结合多视图信息介绍一种用于快速多通道MRI重建的新型并行成像耦合双鉴别器生成的对抗网络(PIDD-GaN)。双判别设计旨在改善MRI重建中的边缘信息。一个鉴别器用于整体图像重建,而另一个鉴别器是负责增强边缘信息的负责。为发电机提出了一种具有本地和全局剩余学习的改进的U-Net。频率通道注意块(FCA块)嵌入在发电机中以结合注意力机制。引入内容损耗以培训发电机以获得更好的重建质量。我们对Calgary-Campinas公共大脑MR DataSet进行了全面的实验,并将我们的方法与最先进的MRI重建方法进行了比较。在MICCAI13数据集上进行了对剩余学习的消融研究,以验证所提出的模块。结果表明,我们的PIDD-GaN提供高质量的重建MR图像,具有良好的边缘信息。单图像重建的时间低于5ms,符合加快处理的需求。
translated by 谷歌翻译