由低级别正则化驱动的深度学习方法在动态磁共振(MR)成像中实现了有吸引力的性能。但是,这些方法中的大多数代表了手工制作的核标准的低级别先验,该规范无法通过固定的正则化参数准确地近似整个数据集的低排名先验。在本文中,我们提出了一种学习动态MR成像的低级方法。特别是,我们将部分可分离(PS)模型的半季度分裂方法(HQS)算法传输到网络中,其中低级别以可学习的空空间变换自适应地表征。心脏CINE数据集的实验表明,所提出的模型的表现优于最新的压缩传感(CS)方法和现有的深度学习方法,既有定量和质量上的深度学习方法。
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Supervised Deep-Learning (DL)-based reconstruction algorithms have shown state-of-the-art results for highly-undersampled dynamic Magnetic Resonance Imaging (MRI) reconstruction. However, the requirement of excessive high-quality ground-truth data hinders their applications due to the generalization problem. Recently, Implicit Neural Representation (INR) has appeared as a powerful DL-based tool for solving the inverse problem by characterizing the attributes of a signal as a continuous function of corresponding coordinates in an unsupervised manner. In this work, we proposed an INR-based method to improve dynamic MRI reconstruction from highly undersampled k-space data, which only takes spatiotemporal coordinates as inputs. Specifically, the proposed INR represents the dynamic MRI images as an implicit function and encodes them into neural networks. The weights of the network are learned from sparsely-acquired (k, t)-space data itself only, without external training datasets or prior images. Benefiting from the strong implicit continuity regularization of INR together with explicit regularization for low-rankness and sparsity, our proposed method outperforms the compared scan-specific methods at various acceleration factors. E.g., experiments on retrospective cardiac cine datasets show an improvement of 5.5 ~ 7.1 dB in PSNR for extremely high accelerations (up to 41.6-fold). The high-quality and inner continuity of the images provided by INR has great potential to further improve the spatiotemporal resolution of dynamic MRI, without the need of any training data.
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最近,对深度学习进行了广泛的研究,以加速动态磁共振(MR)成像,并取得了令人鼓舞的进步。但是,如果没有完全采样的参考数据进行培训,当前方法可能在恢复细节或结构方面具有有限的能力。为了应对这一挑战,本文提出了一个自我监督的协作学习框架(SelfCollearn),以从无效的K-Space数据中进行准确的动态MR图像重建。拟议的框架配备了三个重要组成部分,即双网络协作学习,重新启动数据增强和专门设计的共同培训损失。该框架可以灵活地与数据驱动的网络和基于模型的迭代未滚动网络集成。我们的方法已在体内数据集上进行了评估,并将其与四种最新方法进行了比较。结果表明,我们的方法具有很强的能力,可以从无效的K空间数据捕获直接重建的基本和固有表示形式,因此可以实现高质量且快速的动态MR成像。
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Dynamic magnetic resonance image reconstruction from incomplete k-space data has generated great research interest due to its capability to reduce scan time. Never-theless, the reconstruction problem is still challenging due to its ill-posed nature. Recently, diffusion models espe-cially score-based generative models have exhibited great potential in algorithm robustness and usage flexi-bility. Moreover, the unified framework through the variance exploding stochastic differential equation (VE-SDE) is proposed to enable new sampling methods and further extend the capabilities of score-based gener-ative models. Therefore, by taking advantage of the uni-fied framework, we proposed a k-space and image Du-al-Domain collaborative Universal Generative Model (DD-UGM) which combines the score-based prior with low-rank regularization penalty to reconstruct highly under-sampled measurements. More precisely, we extract prior components from both image and k-space domains via a universal generative model and adaptively handle these prior components for faster processing while maintaining good generation quality. Experimental comparisons demonstrated the noise reduction and detail preservation abilities of the proposed method. Much more than that, DD-UGM can reconstruct data of differ-ent frames by only training a single frame image, which reflects the flexibility of the proposed model.
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降解扩散概率模型(DDPM)已显示在MRI重建中具有出色的性能。从连续的随机微分方程(SDE)的角度来看,DDPM的反向过程可被视为最大化重建的MR图像的能量,从而导致SDE序列发散。因此,提出了用于MRI重建的修改高频DDPM模型。从其连续的SDE观点(称为高频空间SDE)(HFS-SDE),MR图像的能量浓缩低频部分不再得到放大,并且扩散过程更多地集中在获取高频的先验信息上。它不仅提高了扩散模型的稳定性,而且还提供了更好地恢复高频细节的可能性。公开FastMRI数据集的实验表明,我们提出的HFS-SDE优于DDPM驱动的VP-SDE,有监督的深度学习方法和传统的平行成像方法,就稳定性和重建精度而言。
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深度学习在加速磁共振成像(MRI)中表现出惊人的性能。最先进的深度学习重建采用强大的卷积神经网络,并且由于许多磁共振图像或其对应的k空间是2D的许多磁共振图像或其对应的k空间。在这项工作中,我们展示了一种探讨了1D卷积的新方法,使得深度网络更容易受到培训和广义。我们进一步将1D卷积集成到所提出的深网络中,命名为一维深度低级和稀疏网络(ODL),它展开了低级和稀疏重建模型的迭代过程。在体内膝盖和脑数据集中的广泛结果表明,所提出的ODLS非常适合培训受试者的情况,并提供比视觉和定量的最先进的方法改进的重建性能。此外,ODL还向不同的欠采样场景显示出良好的稳健性以及培训和测试数据之间的一些不匹配。总之,我们的工作表明,在快速MRI中,1D深度学习方案是内存高效且强大的。
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最近,未经训练的神经网络(UNNS)显示了在随机采样轨迹上对MR图像重建的令人满意的性能,而无需使用其他全面采样训练数据。但是,现有的基于UNN的方法并未完全使用MR图像物理先验,导致某些常见情况(例如部分傅立叶,常规采样等)的性能差,并且缺乏重建准确性的理论保证。为了弥合这一差距,我们使用特殊设计的UNN提出了一种保障的K空间插值方法,该方法使用特殊设计的UNN,该方法由MR图像的三个物理先验(或K空间数据)驱动,包括稀疏,线圈灵敏度平稳性和相位平滑度。我们还证明,所提出的方法保证了插值K空间数据准确性的紧密界限。最后,消融实验表明,所提出的方法比现有传统方法更准确地表征了MR图像的物理先验。此外,在一系列常用的采样轨迹下,实验还表明,所提出的方法始终优于传统的平行成像方法和现有的UNN,甚至超过了最先进的监督训练的K空间深度学习方法案例。
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近年来,基于深度学习的平行成像(PI)取得了巨大进展,以加速磁共振成像(MRI)。然而,现有方法的性能和鲁棒性仍然可以是不受欢迎的。在这项工作中,我们建议通过柔性PI重建,创建的重量K-Space Genera-Tive模型(WKGM)来探索K空间域学习。具体而言,WKGM是一种通用的K空间域模型,在其中有效地纳入了K空间加权技术和高维空间增强设计,用于基于得分的Genererative模型训练,从而实现良好和强大的重建。此外,WKGM具有灵活性,因此可以与各种传统的K空间PI模型协同结合,从而产生基于学习的先验以产生高保真重建。在具有不同采样模式和交流电因子的数据集上进行实验性重新构建表明,WKGM可以通过先验良好的K-Space生成剂获得最新的重建结果。
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尽管利用张量低级别先验的方法是在高维数据处理中蓬勃发展并获得了令人满意的性能,但它们在动态磁共振(MR)图像重建中的应用受到限制。在本文中,我们集中于基于快速傅立叶变换(FFT)的张量奇异值分解(T-SVD),并且仅提供了FFT域中的确定且有限的张量低级别先验密切的数据和FFT域匹配。通过将FFT推广到转换的T-SVD的任意统一转换并提出了转换的张量核标准(TTNN),我们引入了一个基于TTNN的灵活模型,能够利用张量的低量量,在变换的域中的张量低级别。更大的转换空间并精心设计了基于乘数交替方向方法(ADMM)的迭代优化算法,该算法进一步将其进一步展开为基于模型的深层展开的重建网络,以学习转换后的张量低率之前(t $^2) $ LR-NET)。卷积神经网络(CNN)被合并到T $^2 $ LR-NET中,以从动态MR Image数据集中学习最匹配的转换。展开的重建网络还通过利用CNN提取的特征域中的低级别先验来提供有关低级先验利用率的新观点。两个心脏CINE MR数据集的实验结果表明,与基于最新优化和基于网络的最先进的基于网络的方法相比,提出的框架可以提供改进的恢复结果。
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In this work, we propose a novel image reconstruction framework that directly learns a neural implicit representation in k-space for ECG-triggered non-Cartesian Cardiac Magnetic Resonance Imaging (CMR). While existing methods bin acquired data from neighboring time points to reconstruct one phase of the cardiac motion, our framework allows for a continuous, binning-free, and subject-specific k-space representation.We assign a unique coordinate that consists of time, coil index, and frequency domain location to each sampled k-space point. We then learn the subject-specific mapping from these unique coordinates to k-space intensities using a multi-layer perceptron with frequency domain regularization. During inference, we obtain a complete k-space for Cartesian coordinates and an arbitrary temporal resolution. A simple inverse Fourier transform recovers the image, eliminating the need for density compensation and costly non-uniform Fourier transforms for non-Cartesian data. This novel imaging framework was tested on 42 radially sampled datasets from 6 subjects. The proposed method outperforms other techniques qualitatively and quantitatively using data from four and one heartbeat(s) and 30 cardiac phases. Our results for one heartbeat reconstruction of 50 cardiac phases show improved artifact removal and spatio-temporal resolution, leveraging the potential for real-time CMR.
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目的:提出一种新的基于深度学习的方法,称为RG-NET(重建和生成网络),用于通过向下采样k空间高度加速的MR参数映射,并同时减少所获取的对比度。方法:所提出的框架包括重建模块和生成模块。在先前的帮助下,重建模块从所获取的少数下采样的k空间数据重建MR图像。然后,生成模块从重建的图像中综合剩余的多对比度图像,其中通过对完全采样标签的监督隐式模型被隐式地结合到图像生成中。在不同的加速率下对膝关节和大脑的映射数据进行评估RG-Net。 Cartilage和大脑的区域T1 \ R {HO}进行了分析,以获得RG-Net的性能。结果:RG-Net以高速加速度为17的高质量T1 \ R {Ho}地图。与仅借出k空间的竞争方法相比,我们的框架在T1 \ R {Ho}值中实现了更好的性能分析。我们的方法还提高了胶质瘤患者T1 \ R {Ho}的质量。结论:提出的RG-NET通过欠采样k空间采用新策略并同时减少快速先生参数映射的对比度,可以实现高加速率,同时保持良好的重建质量。我们的框架的生成模块也可以用作其他快速MR参数映射方法的插入模块。关键词:深度学习,卷积神经网络,快速先生参数映射
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磁共振(MR)图像重建来自高度缺点$ K $ -space数据在加速MR成像(MRI)技术中至关重要。近年来,基于深度学习的方法在这项任务中表现出很大的潜力。本文提出了一种学习的MR图像重建半二次分割算法,并在展开的深度学习网络架构中实现算法。我们比较我们提出的方法对针对DC-CNN和LPDNET的公共心先生数据集的性能,我们的方法在定量结果和定性结果中表现出其他方法,具有更少的模型参数和更快的重建速度。最后,我们扩大了我们的模型,实现了卓越的重建质量,并且改善为1.76美元$ 276 $ 274美元的LPDNET以5美元\倍率为5美元的峰值信噪比。我们的方法的代码在https://github.com/hellopipu/hqs-net上公开使用。
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磁共振成像是临床诊断的重要工具。但是,它遭受了漫长的收购时间。深度学习的利用,尤其是深层生成模型,在磁共振成像中提供了积极的加速和更好的重建。然而,学习数据分布作为先验知识并从有限数据中重建图像仍然具有挑战性。在这项工作中,我们提出了一种新颖的Hankel-K空间生成模型(HKGM),该模型可以从一个k-空间数据的训练集中生成样品。在先前的学习阶段,我们首先从k空间数据构建一个大的Hankel矩阵,然后从大型Hankel矩阵中提取多个结构化的K空间贴片,以捕获不同斑块之间的内部分布。从Hankel矩阵中提取斑块使生成模型可以从冗余和低级别的数据空间中学习。在迭代重建阶段,可以观察到所需的解决方案遵守学识渊博的先验知识。通过将其作为生成模型的输入来更新中间重建解决方案。然后,通过对测量数据对其Hankel矩阵和数据一致性组合施加低排名的惩罚来替代地进行操作。实验结果证实,单个K空间数据中斑块的内部统计数据具有足够的信息来学习强大的生成模型并提供最新的重建。
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Deep unfolding networks (DUNs) have proven to be a viable approach to compressive sensing (CS). In this work, we propose a DUN called low-rank CS network (LR-CSNet) for natural image CS. Real-world image patches are often well-represented by low-rank approximations. LR-CSNet exploits this property by adding a low-rank prior to the CS optimization task. We derive a corresponding iterative optimization procedure using variable splitting, which is then translated to a new DUN architecture. The architecture uses low-rank generation modules (LRGMs), which learn low-rank matrix factorizations, as well as gradient descent and proximal mappings (GDPMs), which are proposed to extract high-frequency features to refine image details. In addition, the deep features generated at each reconstruction stage in the DUN are transferred between stages to boost the performance. Our extensive experiments on three widely considered datasets demonstrate the promising performance of LR-CSNet compared to state-of-the-art methods in natural image CS.
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将优化算法映射到神经网络中,深度展开的网络(DUNS)在压缩传感(CS)方面取得了令人印象深刻的成功。从优化的角度来看,Duns从迭代步骤中继承了一个明确且可解释的结构。但是,从神经网络设计的角度来看,大多数现有的Dun是基于传统图像域展开而固有地建立的,该图像域的展开将一通道图像作为相邻阶段之间的输入和输出,从而导致信息传输能力不足,并且不可避免地会损失图像。细节。在本文中,为了打破上述瓶颈,我们首先提出了一个广义的双域优化框架,该框架是逆成像的一般性,并将(1)图像域和(2)卷积编码域先验的优点整合到限制解决方案空间中的可行区域。通过将所提出的框架展开到深神经网络中,我们进一步设计了一种新型的双域深卷积编码网络(D3C2-NET),用于CS成像,具有通过所有展开的阶段传输高通量特征级图像表示的能力。关于自然图像和MR图像的实验表明,与其他最先进的艺术相比,我们的D3C2-NET实现更高的性能和更好的准确性权衡权衡。
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The data consistency for the physical forward model is crucial in inverse problems, especially in MR imaging reconstruction. The standard way is to unroll an iterative algorithm into a neural network with a forward model embedded. The forward model always changes in clinical practice, so the learning component's entanglement with the forward model makes the reconstruction hard to generalize. The proposed method is more generalizable for different MR acquisition settings by separating the forward model from the deep learning component. The deep learning-based proximal gradient descent was proposed to create a learned regularization term independent of the forward model. We applied the one-time trained regularization term to different MR acquisition settings to validate the proposed method and compared the reconstruction with the commonly used $\ell_1$ regularization. We showed ~3 dB improvement in the peak signal to noise ratio, compared with conventional $\ell_1$ regularized reconstruction. We demonstrated the flexibility of the proposed method in choosing different undersampling patterns. We also evaluated the effect of parameter tuning for the deep learning regularization.
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Although recent deep learning methods, especially generative models, have shown good performance in fast magnetic resonance imaging, there is still much room for improvement in high-dimensional generation. Considering that internal dimensions in score-based generative models have a critical impact on estimating the gradient of the data distribution, we present a new idea, low-rank tensor assisted k-space generative model (LR-KGM), for parallel imaging reconstruction. This means that we transform original prior information into high-dimensional prior information for learning. More specifically, the multi-channel data is constructed into a large Hankel matrix and the matrix is subsequently folded into tensor for prior learning. In the testing phase, the low-rank rotation strategy is utilized to impose low-rank constraints on tensor output of the generative network. Furthermore, we alternately use traditional generative iterations and low-rank high-dimensional tensor iterations for reconstruction. Experimental comparisons with the state-of-the-arts demonstrated that the proposed LR-KGM method achieved better performance.
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最近关于其他方式的核化图像T1辅助MRI重建的研究表明,进一步加速MRI收购其他方式的潜力。大多数最先进的方法通过开发用于固定的欠采样模式的网络架构来实现改进,而不完全利用方式之间的互补信息。尽管可以简单地修改现有的下采样模式学习算法以允许完全采样的T1加权MR图像来辅助模式学习,但是可以实现重建任务的显着改进。为此,我们提出了一个迭代框架,优化了MRI获取的另一种方式的采样下采样模式,可以在不同的下抽样因子中补充完全采样的T1加权MR图像,同时共同优化T1辅助MRI重建模型。具体地,我们所提出的方法利用两种模式之间的潜在信息的差异来确定可以最大化T1加权MR图像的辅助功率在改善MRI重建时最大化的采样模式。与常用的下采样模式和最先进的方法相比,我们在公共数据集中展示了我们在公共数据集上的学习的下采样模式的卓越表现,可以联合优化重建网络和欠采样模式以8倍的取样因子。
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深度学习方法已成功用于各种计算机视觉任务。受到成功的启发,已经在磁共振成像(MRI)重建中探索了深度学习。特别是,整合深度学习和基于模型的优化方法已显示出很大的优势。但是,对于高重建质量,通常需要大量标记的培训数据,这对于某些MRI应用来说是具有挑战性的。在本文中,我们提出了一种名为DUREN-NET的新型重建方法,该方法可以通过组合无监督的DeNoising网络和插件方法来为MR图像重建提供可解释的无监督学习。我们的目标是通过添加明确的先验利用成像物理学来提高无监督学习的重建性能。具体而言,使用denoising(红色)正规化实现了MRI重建网络的杠杆作用。实验结果表明,所提出的方法需要减少训练数据的数量才能达到高重建质量。
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最近,基于得分的扩散模型在MRI重建中表现出令人满意的性能。这些方法中的大多数都需要大量完全采样的MRI数据作为培训集,有时在实践中很难获得。本文提出了用于MRI重建的完全采样的基于无DATA的分数扩散模型,该模型以不足的采样数据以自我监督的方式学习了完全采样的MR图像。具体而言,我们首先通过贝叶斯深度学习从未采样的数据中推断出完全采样的MR图像分布,然后通过训练分数函数来扰动数据分布并近似其概率密度梯度。利用学到的分数函数为先验,我们可以通过执行条件的Langevin Markov链蒙特卡洛(MCMC)采样来重建MR图像。公共数据集的实验表明,所提出的方法优于现有的自我监督的MRI重建方法,并与常规(完全采样的数据训练)基于得分的扩散方法实现可比性的性能。
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