The data consistency for the physical forward model is crucial in inverse problems, especially in MR imaging reconstruction. The standard way is to unroll an iterative algorithm into a neural network with a forward model embedded. The forward model always changes in clinical practice, so the learning component's entanglement with the forward model makes the reconstruction hard to generalize. The proposed method is more generalizable for different MR acquisition settings by separating the forward model from the deep learning component. The deep learning-based proximal gradient descent was proposed to create a learned regularization term independent of the forward model. We applied the one-time trained regularization term to different MR acquisition settings to validate the proposed method and compared the reconstruction with the commonly used $\ell_1$ regularization. We showed ~3 dB improvement in the peak signal to noise ratio, compared with conventional $\ell_1$ regularized reconstruction. We demonstrated the flexibility of the proposed method in choosing different undersampling patterns. We also evaluated the effect of parameter tuning for the deep learning regularization.
translated by 谷歌翻译
减少磁共振(MR)图像采集时间可能会使MR检查更容易获得。包括深度学习模型在内的先前艺术已致力于解决长期MRI成像时间的问题。最近,深层生成模型在算法鲁棒性和使用灵活性方面具有巨大的潜力。然而,无法直接学习或使用任何现有方案。此外,还值得研究的是,深层生成模型如何在混合域上很好地工作。在这项工作中,通过利用基于深度能量的模型,我们提出了一个K空间和图像域协作生成模型,以全面估算从采样量未采样的测量中的MR数据。与最先进的实验比较表明,所提出的混合方法的重建精度较小,在不同的加速因子下更稳定。
translated by 谷歌翻译
近年来,基于深度学习的平行成像(PI)取得了巨大进展,以加速磁共振成像(MRI)。然而,现有方法的性能和鲁棒性仍然可以是不受欢迎的。在这项工作中,我们建议通过柔性PI重建,创建的重量K-Space Genera-Tive模型(WKGM)来探索K空间域学习。具体而言,WKGM是一种通用的K空间域模型,在其中有效地纳入了K空间加权技术和高维空间增强设计,用于基于得分的Genererative模型训练,从而实现良好和强大的重建。此外,WKGM具有灵活性,因此可以与各种传统的K空间PI模型协同结合,从而产生基于学习的先验以产生高保真重建。在具有不同采样模式和交流电因子的数据集上进行实验性重新构建表明,WKGM可以通过先验良好的K-Space生成剂获得最新的重建结果。
translated by 谷歌翻译
磁共振(MR)图像重建来自高度缺点$ K $ -space数据在加速MR成像(MRI)技术中至关重要。近年来,基于深度学习的方法在这项任务中表现出很大的潜力。本文提出了一种学习的MR图像重建半二次分割算法,并在展开的深度学习网络架构中实现算法。我们比较我们提出的方法对针对DC-CNN和LPDNET的公共心先生数据集的性能,我们的方法在定量结果和定性结果中表现出其他方法,具有更少的模型参数和更快的重建速度。最后,我们扩大了我们的模型,实现了卓越的重建质量,并且改善为1.76美元$ 276 $ 274美元的LPDNET以5美元\倍率为5美元的峰值信噪比。我们的方法的代码在https://github.com/hellopipu/hqs-net上公开使用。
translated by 谷歌翻译
目的:并行成像通过用一系列接收器线圈获取其他灵敏度信息,从而加速了磁共振成像(MRI)数据,从而降低了相位编码步骤。压缩传感磁共振成像(CS-MRI)在医学成像领域中获得了普及,因为其数据要求较少,而不是平行成像。并行成像和压缩传感(CS)均通过最大程度地减少K空间中捕获的数据量来加快传统MRI获取。由于采集时间与样品的数量成反比,因此从缩短的K空间样品中的图像的反向形成会导致收购更快,但具有混乱的伪像。本文提出了一种新型的生成对抗网络(GAN),即雷德格尔(Recgan-gr)受到多模式损失的监督,以消除重建的图像。方法:与现有的GAN网络相反,我们提出的方法引入了一种新型的发电机网络,即与双域损耗函数集成的弹药网络,包括加权幅度和相位损耗函数以及基于平行成像的损失,即Grappa一致性损失。提出了K空间校正块,以使GAN网络自动化生成不必要的数据,从而使重建过程的收敛性更快。结果:全面的结果表明,拟议的Recgan-GR在基于GAN的方法中的PSNR有4 dB的改善,并且在文献中可用的传统最先进的CNN方法中有2 dB的改进。结论和意义:拟议的工作有助于显着改善低保留数据的图像质量,从而更快地获取了5倍或10倍。
translated by 谷歌翻译
我们引入了一个框架,该框架可以从学习概率分布中进行有效的MRI重建。与传统的基于深度学习的MRI重建技术不同,鉴于使用Markov链蒙特卡洛(MCMC)方法测得的K空间,样品是从后部分布中得出的。除了可以通过常规方法获得的图像的最大后验(MAP)估计值外,还可以计算最小平方误差(MMSE)估计值和不确定性图。数据驱动的马尔可夫链是根据从给定的图像数据库中学到的生成模型构建的,并且独立于用于建模K空间测量的前向操作员。这提供了灵活性,因为该方法可以应用于使用不同的采样方案获得的K空间或使用相同的预训练模型接收线圈。此外,我们使用基于反向扩散过程的框架来利用高级生成模型。该方法的性能使用K空间中的10倍下采样在开放数据集上进行评估。
translated by 谷歌翻译
可解释性和鲁棒性必须在临床应用中整合加速磁共振成像(MRI)重建的机器学习方法。这样做会允许快速高质量的解剖和病理学成像。数据一致性(DC)对于多模态数据的泛化至关重要,以及检测病理学的鲁棒性。这项工作提出了独立复发推理机(CIRIM)的级联,通过展开优化来评估DC,通过梯度下降,并通过设计的术语明确地明确。我们对CIRIM与其他展开的优化方法进行广泛的比较,是端到端变分网络(E2EVN)和轮辋,以及UNET和压缩感测(CS)。评估是分两个阶段完成的。首先,评估关于多次训练的MRI模型的学习,即用{t_1} $ - 加权和平凡对比,以及$ {t_2} $ - 加权膝盖数据。其次,在通过3D Flair MRI数据中重建依赖多发性硬化(MS)患者的3D Flair MRI数据来测试鲁棒性。结果表明,CIRIM在隐式强制执行DC时表现最佳,而E2EVN需要明确制定的DC。 CIRIM在重建临床MS数据时显示出最高病变对比度分辨率。与CS相比,性能提高了大约11%,而重建时间是二十次减少。
translated by 谷歌翻译
物理驱动的深度学习方法已成为计算磁共振成像(MRI)问题的强大工具,将重建性能推向新限制。本文概述了将物理信息纳入基于学习的MRI重建中的最新发展。我们考虑了用于计算MRI的线性和非线性正向模型的逆问题,并回顾了解决这些方法的经典方法。然后,我们专注于物理驱动的深度学习方法,涵盖了物理驱动的损失功能,插件方法,生成模型和展开的网络。我们重点介绍了特定于领域的挑战,例如神经网络的实现和复杂值的构建基块,以及具有线性和非线性正向模型的MRI转换应用。最后,我们讨论常见问题和开放挑战,并与物理驱动的学习与医学成像管道中的其他下游任务相结合时,与物理驱动的学习的重要性联系在一起。
translated by 谷歌翻译
尽管几乎每种医学诊断和检查和检查应用中的广泛适应,但磁共振成像(MRI)仍然是慢的成像模态,其限制了其用于动态成像的用途。近年来,已利用平行成像(PI)和压缩传感(CS)加速MRI采集。在临床设置中,使用笛卡尔轨迹(例如直线采样)的扫描时间期间的k空间测量值是目前最常规的CS方法,然而,易于产生锯齿化重建。随着深度学习(DL)参与的出现,在加速MRI时,重建来自离心数据的忠实形象变得越来越有前途。回顾性地将数据采样掩模应用到k空间数据上是模拟真实临床环境中的k空间数据的加速获取的一种方式。在本文中,我们比较并提供审查对由训练的深神经网络输出的重建质量应用的效果进行审查。具有相同的超参数选择,我们训练并评估两个不同的反复推理机(轮辋),一个用于每种类型的重叠采样。我们的实验的定性和定量结果表明,具有径向子采样的数据培训的模型达到了更高的性能,并学会估计具有较高保真度的重建,为其他DL接近涉及径向辐射轮换。
translated by 谷歌翻译
压缩传感(CS)一直在加速磁共振成像(MRI)采集过程中的关键作用。随着人工智能的复苏,深神经网络和CS算法正在集成以重新定义快速MRI的领域。过去几年目睹了基于深度学习的CS技术的复杂性,多样性和表现的大量增长,这些技术致力于快速MRI。在该荟萃分析中,我们系统地审查了快速MRI的深度学习的CS技术,描述了关键模型设计,突出突破,并讨论了有希望的方向。我们还介绍了一个综合分析框架和分类系统,以评估深度学习在基于CS的加速度的MRI的关键作用。
translated by 谷歌翻译
目的:开发一种适用于具有非平滑相位变化的扩散加权(DW)图像的鲁棒部分傅里叶(PF)重建算法。方法:基于展开的近端分裂算法,导出了一种神经网络架构,其在经常复卷卷积实现的数据一致性操作和正则化之间交替。为了利用相关性,在考虑到置换方面,共同重建相同切片的多重重复。该算法在60名志愿者的DW肝脏数据上培训,并回顾性和预期的不同解剖和分辨率的次样本数据评估。结果:该方法能够在定量措施以及感知图像质量方面具有显着优异地优于追溯子采样数据的传统PF技术。在这种情况下,发现重复的联合重建以及特定类型的经常性网络展开展开是有益的重建质量。在预期的PF采样数据上,所提出的方法使得DW成像能够在不牺牲图像分辨率或引入额外的伪影的情况下进行DW成像。或者,它可以用来对抗具有更高分辨率的获取的TE增加。此外,可以向展示训练集中的解剖学和对比度显示普遍性的脑数据。结论:这项工作表明,即使在易于相位变化的解剖中的强力PF因子中,DW数据的强大PF重建也是可行的。由于所提出的方法不依赖于阶段的平滑度前沿,而是使用学习的经常性卷积,因此可以避免传统PF方法的伪像。
translated by 谷歌翻译
最近关于其他方式的核化图像T1辅助MRI重建的研究表明,进一步加速MRI收购其他方式的潜力。大多数最先进的方法通过开发用于固定的欠采样模式的网络架构来实现改进,而不完全利用方式之间的互补信息。尽管可以简单地修改现有的下采样模式学习算法以允许完全采样的T1加权MR图像来辅助模式学习,但是可以实现重建任务的显着改进。为此,我们提出了一个迭代框架,优化了MRI获取的另一种方式的采样下采样模式,可以在不同的下抽样因子中补充完全采样的T1加权MR图像,同时共同优化T1辅助MRI重建模型。具体地,我们所提出的方法利用两种模式之间的潜在信息的差异来确定可以最大化T1加权MR图像的辅助功率在改善MRI重建时最大化的采样模式。与常用的下采样模式和最先进的方法相比,我们在公共数据集中展示了我们在公共数据集上的学习的下采样模式的卓越表现,可以联合优化重建网络和欠采样模式以8倍的取样因子。
translated by 谷歌翻译
磁共振成像可以产生人体解剖和生理学的详细图像,可以帮助医生诊断和治疗肿瘤等病理。然而,MRI遭受了非常长的收购时间,使其易于患者运动伪影并限制其潜力以提供动态治疗。诸如并行成像和压缩感测的常规方法允许通过使用多个接收器线圈获取更少的MRI数据来改变MR图像来增加MRI采集速度。深度学习的最新进步与平行成像和压缩传感技术相结合,具有从高度加速的MRI数据产生高保真重建。在这项工作中,我们通过利用卷积复发网络的特性和展开算法来解决复发变分网络(RevurrentVarnet)的加速改变网络(RevurrentVarnet)的任务,提出了一种基于深入的深度学习的反问题解决者。 RevurrentVarnet由多个块组成,每个块都负责梯度下降优化算法的一个展开迭代,以解决逆问题。与传统方法相反,优化步骤在观察域($ k $ -space)而不是图像域中进行。每次反复出的Varnet块都会通过观察到的$ k $ -space,并由数据一致性术语和复制单元组成,它将作为输入的隐藏状态和前一个块的预测。我们所提出的方法实现了新的最新状态,定性和定量重建导致来自公共多通道脑数据集的5倍和10倍加速数据,优于以前的传统和基于深度学习的方法。我们将在公共存储库上释放所有型号代码和基线。
translated by 谷歌翻译
In this work, we propose a novel image reconstruction framework that directly learns a neural implicit representation in k-space for ECG-triggered non-Cartesian Cardiac Magnetic Resonance Imaging (CMR). While existing methods bin acquired data from neighboring time points to reconstruct one phase of the cardiac motion, our framework allows for a continuous, binning-free, and subject-specific k-space representation.We assign a unique coordinate that consists of time, coil index, and frequency domain location to each sampled k-space point. We then learn the subject-specific mapping from these unique coordinates to k-space intensities using a multi-layer perceptron with frequency domain regularization. During inference, we obtain a complete k-space for Cartesian coordinates and an arbitrary temporal resolution. A simple inverse Fourier transform recovers the image, eliminating the need for density compensation and costly non-uniform Fourier transforms for non-Cartesian data. This novel imaging framework was tested on 42 radially sampled datasets from 6 subjects. The proposed method outperforms other techniques qualitatively and quantitatively using data from four and one heartbeat(s) and 30 cardiac phases. Our results for one heartbeat reconstruction of 50 cardiac phases show improved artifact removal and spatio-temporal resolution, leveraging the potential for real-time CMR.
translated by 谷歌翻译
磁共振成像是临床诊断的重要工具。但是,它遭受了漫长的收购时间。深度学习的利用,尤其是深层生成模型,在磁共振成像中提供了积极的加速和更好的重建。然而,学习数据分布作为先验知识并从有限数据中重建图像仍然具有挑战性。在这项工作中,我们提出了一种新颖的Hankel-K空间生成模型(HKGM),该模型可以从一个k-空间数据的训练集中生成样品。在先前的学习阶段,我们首先从k空间数据构建一个大的Hankel矩阵,然后从大型Hankel矩阵中提取多个结构化的K空间贴片,以捕获不同斑块之间的内部分布。从Hankel矩阵中提取斑块使生成模型可以从冗余和低级别的数据空间中学习。在迭代重建阶段,可以观察到所需的解决方案遵守学识渊博的先验知识。通过将其作为生成模型的输入来更新中间重建解决方案。然后,通过对测量数据对其Hankel矩阵和数据一致性组合施加低排名的惩罚来替代地进行操作。实验结果证实,单个K空间数据中斑块的内部统计数据具有足够的信息来学习强大的生成模型并提供最新的重建。
translated by 谷歌翻译
在过去的几年中,提出了多种基于深神经网络(DNN)的方法,以解决来自未取消采样的“ K-Space”(傅立叶域)数据的挑战性不足的反向问题。然而,反对采集过程中的变化和解剖学分布的不稳定性表明,与其经典的对应物相比,DNN体系结构对相关物理模型的概括不佳。较差的概括有效地排除了DNN适用于临床环境中不足采样的MRI重建。我们通过引入物理培养的DNN体系结构和培训方法来提高DNN方法的泛化MRI重建能力。除了模型体系结构中观察到的数据外,我们的体系结构还编码底面采样掩码,并采用适当的培训方法,该方法使用与各种无底采样掩码生成的数据一起鼓励模型概括了未散布的MRI重建问题。我们通过对公开可用的快速MRI数据集进行了广泛的实验,证明了我们的方法的附加价值。我们的物理提出的方法达到了增强的概括能力,这使得与获得的稳健性和解剖学分布的变化相比,尤其是在病理区域中,与香草DNN方法和DNN进行了显着提高,并在病理区域中进行了显着提高,并且受过培训的DNN训练,并接受了强烈的掩盖掩模的增强。接受训练的模型和代码以复制我们的实验,将在接受后用于研究目的。
translated by 谷歌翻译
深度学习在加速磁共振成像(MRI)中表现出惊人的性能。最先进的深度学习重建采用强大的卷积神经网络,并且由于许多磁共振图像或其对应的k空间是2D的许多磁共振图像或其对应的k空间。在这项工作中,我们展示了一种探讨了1D卷积的新方法,使得深度网络更容易受到培训和广义。我们进一步将1D卷积集成到所提出的深网络中,命名为一维深度低级和稀疏网络(ODL),它展开了低级和稀疏重建模型的迭代过程。在体内膝盖和脑数据集中的广泛结果表明,所提出的ODLS非常适合培训受试者的情况,并提供比视觉和定量的最先进的方法改进的重建性能。此外,ODL还向不同的欠采样场景显示出良好的稳健性以及培训和测试数据之间的一些不匹配。总之,我们的工作表明,在快速MRI中,1D深度学习方案是内存高效且强大的。
translated by 谷歌翻译
Supervised Deep-Learning (DL)-based reconstruction algorithms have shown state-of-the-art results for highly-undersampled dynamic Magnetic Resonance Imaging (MRI) reconstruction. However, the requirement of excessive high-quality ground-truth data hinders their applications due to the generalization problem. Recently, Implicit Neural Representation (INR) has appeared as a powerful DL-based tool for solving the inverse problem by characterizing the attributes of a signal as a continuous function of corresponding coordinates in an unsupervised manner. In this work, we proposed an INR-based method to improve dynamic MRI reconstruction from highly undersampled k-space data, which only takes spatiotemporal coordinates as inputs. Specifically, the proposed INR represents the dynamic MRI images as an implicit function and encodes them into neural networks. The weights of the network are learned from sparsely-acquired (k, t)-space data itself only, without external training datasets or prior images. Benefiting from the strong implicit continuity regularization of INR together with explicit regularization for low-rankness and sparsity, our proposed method outperforms the compared scan-specific methods at various acceleration factors. E.g., experiments on retrospective cardiac cine datasets show an improvement of 5.5 ~ 7.1 dB in PSNR for extremely high accelerations (up to 41.6-fold). The high-quality and inner continuity of the images provided by INR has great potential to further improve the spatiotemporal resolution of dynamic MRI, without the need of any training data.
translated by 谷歌翻译
Image reconstruction using deep learning algorithms offers improved reconstruction quality and lower reconstruction time than classical compressed sensing and model-based algorithms. Unfortunately, clean and fully sampled ground-truth data to train the deep networks is often unavailable in several applications, restricting the applicability of the above methods. We introduce a novel metric termed the ENsemble Stein's Unbiased Risk Estimate (ENSURE) framework, which can be used to train deep image reconstruction algorithms without fully sampled and noise-free images. The proposed framework is the generalization of the classical SURE and GSURE formulation to the setting where the images are sampled by different measurement operators, chosen randomly from a set. We evaluate the expectation of the GSURE loss functions over the sampling patterns to obtain the ENSURE loss function. We show that this loss is an unbiased estimate for the true mean-square error, which offers a better alternative to GSURE, which only offers an unbiased estimate for the projected error. Our experiments show that the networks trained with this loss function can offer reconstructions comparable to the supervised setting. While we demonstrate this framework in the context of MR image recovery, the ENSURE framework is generally applicable to arbitrary inverse problems.
translated by 谷歌翻译
Dynamic magnetic resonance image reconstruction from incomplete k-space data has generated great research interest due to its capability to reduce scan time. Never-theless, the reconstruction problem is still challenging due to its ill-posed nature. Recently, diffusion models espe-cially score-based generative models have exhibited great potential in algorithm robustness and usage flexi-bility. Moreover, the unified framework through the variance exploding stochastic differential equation (VE-SDE) is proposed to enable new sampling methods and further extend the capabilities of score-based gener-ative models. Therefore, by taking advantage of the uni-fied framework, we proposed a k-space and image Du-al-Domain collaborative Universal Generative Model (DD-UGM) which combines the score-based prior with low-rank regularization penalty to reconstruct highly under-sampled measurements. More precisely, we extract prior components from both image and k-space domains via a universal generative model and adaptively handle these prior components for faster processing while maintaining good generation quality. Experimental comparisons demonstrated the noise reduction and detail preservation abilities of the proposed method. Much more than that, DD-UGM can reconstruct data of differ-ent frames by only training a single frame image, which reflects the flexibility of the proposed model.
translated by 谷歌翻译