Observational studies have recently received significant attention from the machine learning community due to the increasingly available non-experimental observational data and the limitations of the experimental studies, such as considerable cost, impracticality, small and less representative sample sizes, etc. In observational studies, de-confounding is a fundamental problem of individualised treatment effects (ITE) estimation. This paper proposes disentangled representations with adversarial training to selectively balance the confounders in the binary treatment setting for the ITE estimation. The adversarial training of treatment policy selectively encourages treatment-agnostic balanced representations for the confounders and helps to estimate the ITE in the observational studies via counterfactual inference. Empirical results on synthetic and real-world datasets, with varying degrees of confounding, prove that our proposed approach improves the state-of-the-art methods in achieving lower error in the ITE estimation.
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选择每个患者的最佳治疗计划需要随着时间的推移而准确地预测其结果轨迹的函数。虽然大型观察数据集构成丰富的信息来源,但他们也包含偏差,因为处理很少在实践中随机分配。为了提供准确和无偏见的预测,我们介绍了解除戒备的反事实经常性网络(DCRN),一种新的序列到序列架构,其通过学习患者历史的时间随时间估计治疗结果,这些历史记录被解除为三个单独的潜在因子:治疗因素,影响只有治疗选择;结果因素,影响结果;和一个混杂因素,影响两者。通过架构,完全受到治疗影响的因果结构随着时间的推移,我们推进预测准确性和疾病的理解,因为我们的建筑允许从业者推断哪个患者的轨迹影响哪些患者的轨迹,对比该领域的其他方法对比其他方法。我们证明DCRN在预测治疗响应中的当前最先进的方法,在实际和模拟数据中优于最新的方法。
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因果推断能够估计治疗效果(即,治疗结果的因果效果),使各个领域的决策受益。本研究中的一个基本挑战是观察数据的治疗偏见。为了提高对因果推断的观察研究的有效性,基于代表的方法作为最先进的方法表明了治疗效果估计的卓越性能。基于大多数基于表示的方法假设所有观察到的协变量都是预处理的(即,不受治疗影响的影响),并学习这些观察到的协变量的平衡表示,以估算治疗效果。不幸的是,这种假设往往在实践中往往是太严格的要求,因为一些协调因子是通过对治疗的干预进行改变(即,后治疗)来改变。相比之下,从不变的协变量中学到的平衡表示因此偏置治疗效果估计。
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因果关系的概念在人类认知中起着重要作用。在过去的几十年中,在许多领域(例如计算机科学,医学,经济学和教育)中,因果推论已经得到很好的发展。随着深度学习技术的发展,它越来越多地用于针对反事实数据的因果推断。通常,深层因果模型将协变量的特征映射到表示空间,然后设计各种客观优化函数,以根据不同的优化方法公正地估算反事实数据。本文重点介绍了深层因果模型的调查,其核心贡献如下:1)我们在多种疗法和连续剂量治疗下提供相关指标; 2)我们从时间开发和方法分类的角度综合了深层因果模型的全面概述; 3)我们协助有关相关数据集和源代码的详细且全面的分类和分析。
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大型观察数据越来越多地提供健康,经济和社会科学等学科,研究人员对因果问题而不是预测感兴趣。在本文中,从旨在调查参与学校膳食计划对健康指标的实证研究,研究了使用非参数回归的方法估算异质治疗效果的问题。首先,我们介绍了与观察或非完全随机数据进行因果推断相关的设置和相关的问题,以及如何在统计学习工具的帮助下解决这些问题。然后,我们审查并制定现有最先进的框架的统一分类,允许通过非参数回归模型来估算单个治疗效果。在介绍模型选择问题的简要概述后,我们说明了一些关于三种不同模拟研究的方法的性能。我们通过展示一些关于学校膳食计划数据的实证分析的一些方法的使用来结束。
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为目标疾病开发新药物是一项耗时且昂贵的任务,药物重新利用已成为药物开发领域的流行话题。随着许多健康索赔数据可用,已经对数据进行了许多研究。现实世界的数据嘈杂,稀疏,并且具有许多混杂因素。此外,许多研究表明,药物的作用在人群中是异质的。近年来已经出现了许多有关估计异构治疗效果(HTE)(HTE)的高级机器学习模型,并已应用于计量经济学和机器学习社区。这些研究将医学和药物开发视为主要应用领域,但是从HTE方法论到药物开发的转化研究有限。我们旨在将HTE方法介绍到医疗保健领域,并在通过基准实验进行医疗保健行政索赔数据进行基准实验时提供可行性考虑。另外,我们希望使用基准实验来展示如何将模型应用于医疗保健研究时如何解释和评估模型。通过将最近的HTE技术引入生物医学信息学社区的广泛读者,我们希望通过机器学习促进广泛采用因果推断。我们还希望提供HTE具有个性化药物有效性的可行性。
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在广泛的任务中,在包括医疗处理,广告和营销和政策制定的发​​展中,对观测数据进行因果推断非常有用。使用观察数据进行因果推断有两种重大挑战:治疗分配异质性(\ Texit {IE},治疗和未经处理的群体之间的差异),并且没有反事实数据(\ TEXTIT {IE},不知道是什么已经发生了,如果确实得到治疗的人,反而尚未得到治疗)。通过组合结构化推论和有针对性的学习来解决这两个挑战。在结构方面,我们将联合分布分解为风险,混淆,仪器和杂项因素,以及在目标学习方面,我们应用来自影响曲线的规则器,以减少残余偏差。进行了一项消融研究,对基准数据集进行评估表明,TVAE具有竞争力和最先进的艺术表现。
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传统的因果推理方法利用观察性研究数据来估计潜在治疗的观察到的差异和未观察到的结果,称为条件平均治疗效果(CATE)。然而,凯特就对应于仅第一刻的比较,因此可能不足以反映治疗效果的全部情况。作为替代方案,估计全部潜在结果分布可以提供更多的见解。但是,估计治疗效果的现有方法潜在的结果分布通常对这些分布施加限制性或简单的假设。在这里,我们提出了合作因果网络(CCN),这是一种新颖的方法,它通过学习全部潜在结果分布而超出了CATE的估计。通过CCN框架估算结果分布不需要对基础数据生成过程的限制性假设。此外,CCN促进了每种可能处理的效用的估计,并允许通过效用函数进行特定的特定变异。 CCN不仅将结果估计扩展到传统的风险差异之外,而且还可以通过定义灵活的比较来实现更全面的决策过程。根据因果文献中通常做出的假设,我们表明CCN学习了渐近捕获真正潜在结果分布的分布。此外,我们提出了一种调整方法,该方法在经验上可以有效地减轻观察数据中治疗组之间的样本失衡。最后,我们评估了CCN在多个合成和半合成实验中的性能。我们证明,与现有的贝叶斯和深层生成方法相比,CCN学会了改进的分布估计值,以及对各种效用功能的改进决策。
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Estimating treatment effects from observational data is a central problem in causal inference. Methods to solve this problem exploit inductive biases and heuristics from causal inference to design multi-head neural network architectures and regularizers. In this work, we propose to use neurosymbolic program synthesis, a data-efficient, and interpretable technique, to solve the treatment effect estimation problem. We theoretically show that neurosymbolic programming can solve the treatment effect estimation problem. By designing a Domain Specific Language (DSL) for treatment effect estimation problem based on the inductive biases used in literature, we argue that neurosymbolic programming is a better alternative to treatment effect estimation than traditional methods. Our empirical study reveals that our method, which implicitly encodes inductive biases in a DSL, achieves better performance on benchmark datasets than the state-of-the-art methods.
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Causal inference is the process of using assumptions, study designs, and estimation strategies to draw conclusions about the causal relationships between variables based on data. This allows researchers to better understand the underlying mechanisms at work in complex systems and make more informed decisions. In many settings, we may not fully observe all the confounders that affect both the treatment and outcome variables, complicating the estimation of causal effects. To address this problem, a growing literature in both causal inference and machine learning proposes to use Instrumental Variables (IV). This paper serves as the first effort to systematically and comprehensively introduce and discuss the IV methods and their applications in both causal inference and machine learning. First, we provide the formal definition of IVs and discuss the identification problem of IV regression methods under different assumptions. Second, we categorize the existing work on IV methods into three streams according to the focus on the proposed methods, including two-stage least squares with IVs, control function with IVs, and evaluation of IVs. For each stream, we present both the classical causal inference methods, and recent developments in the machine learning literature. Then, we introduce a variety of applications of IV methods in real-world scenarios and provide a summary of the available datasets and algorithms. Finally, we summarize the literature, discuss the open problems and suggest promising future research directions for IV methods and their applications. We also develop a toolkit of IVs methods reviewed in this survey at https://github.com/causal-machine-learning-lab/mliv.
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There is intense interest in applying machine learning to problems of causal inference in fields such as healthcare, economics and education. In particular, individual-level causal inference has important applications such as precision medicine. We give a new theoretical analysis and family of algorithms for predicting individual treatment effect (ITE) from observational data, under the assumption known as strong ignorability. The algorithms learn a "balanced" representation such that the induced treated and control distributions look similar. We give a novel, simple and intuitive generalization-error bound showing that the expected ITE estimation error of a representation is bounded by a sum of the standard generalization-error of that representation and the distance between the treated and control distributions induced by the representation. We use Integral Probability Metrics to measure distances between distributions, deriving explicit bounds for the Wasserstein and Maximum Mean Discrepancy (MMD) distances. Experiments on real and simulated data show the new algorithms match or outperform the state-of-the-art.
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Observational studies are rising in importance due to the widespread accumulation of data in fields such as healthcare, education, employment and ecology. We consider the task of answering counterfactual questions such as, "Would this patient have lower blood sugar had she received a different medication?". We propose a new algorithmic framework for counterfactual inference which brings together ideas from domain adaptation and representation learning. In addition to a theoretical justification, we perform an empirical comparison with previous approaches to causal inference from observational data. Our deep learning algorithm significantly outperforms the previous state-of-the-art.
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Causal learning has attracted much attention in recent years because causality reveals the essential relationship between things and indicates how the world progresses. However, there are many problems and bottlenecks in traditional causal learning methods, such as high-dimensional unstructured variables, combinatorial optimization problems, unknown intervention, unobserved confounders, selection bias and estimation bias. Deep causal learning, that is, causal learning based on deep neural networks, brings new insights for addressing these problems. While many deep learning-based causal discovery and causal inference methods have been proposed, there is a lack of reviews exploring the internal mechanism of deep learning to improve causal learning. In this article, we comprehensively review how deep learning can contribute to causal learning by addressing conventional challenges from three aspects: representation, discovery, and inference. We point out that deep causal learning is important for the theoretical extension and application expansion of causal science and is also an indispensable part of general artificial intelligence. We conclude the article with a summary of open issues and potential directions for future work.
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估计治疗的个性化影响是一个复杂但普遍存在的问题。为了解决这个问题,机器学习(ML)关于异质治疗效果估计的最新发展引起了许多复杂的,但不透明的工具:由于它们的灵活性,模块化和学习受限的表示的能力,尤其是神经网络,因此已成为中心对此文学。不幸的是,这种黑匣子的资产是有代价的:模型通常涉及无数的非平凡操作,因此很难理解他们所学到的知识。然而,理解这些模型可能至关重要 - 例如,在医学背景下,发现有关治疗效果的知识异质性可以在临床实践中为治疗处方提供信息。因此,在这项工作中,我们使用事后特征重要性方法来识别影响模型预测的功能。这使我们能够评估沿着先前工作中忽略的新重要维度的治疗效应估计量:我们构建了一个基准测试环境,以经验研究个性化治疗效果模型鉴定预测协变量的能力 - 确定治疗差异反应的协变量。然后,我们的基准测量环境使我们能够对不同类型的治疗效果模型的优势和劣势提供新的见解,因为我们调节了针对治疗效果估计的不同挑战 - 例如预后与预测信息的比率,潜在结果的可能非线性以及混杂的存在和类型。
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随着时间的流逝,估计反事实结果有可能通过协助决策者回答“假设”问题来解锁个性化医疗保健。现有的因果推理方法通常考虑观察和治疗决策之间的定期离散时间间隔,因此无法自然地模拟不规则采样的数据,这是实践中的共同环境。为了处理任意观察模式,我们将数据解释为基础连续时间过程中的样本,并建议使用受控微分方程的数学明确地对其潜在轨迹进行建模。这导致了一种新方法,即治疗效果神经控制的微分方程(TE-CDE),该方程可在任何时间点评估潜在的结果。此外,对抗性训练用于调整时间依赖性混杂,这在纵向环境中至关重要,这是常规时间序列中未遇到的额外挑战。为了评估解决此问题的解决方案,我们提出了一个基于肿瘤生长模型的可控仿真环境,以反映出各种临床方案的一系列场景。在所有模拟场景中,TE-CDE始终优于现有方法,并具有不规则采样。
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由于混杂偏见的复杂情况,使用观察数据估算治疗效果,尤其是个性化治疗效果(ITE),这是具有挑战性的。纵向观察数据估算治疗效果的现有方法通常是基于“不满意”的强烈假设,在现实世界实践中很难实现。在本文中,我们提出了变异的时间变形器(VTD),这种方法使用代理(即用于无法观察到的变量)来利用纵向设置中深层嵌入的方法。具体而言,VTD利用观察到的代理学习隐藏的嵌入,以反映观测数据中真正隐藏的混杂因素。因此,我们的VTD方法不依赖“不符”假设。我们在合成和实际临床数据上测试了VTD方法,结果表明,与其他现有模型相比,隐藏混杂性是主要偏见时我们的方法有效。
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训练因果效果变分性自身摩托(CEVAE)以预测给定的观察治疗数据的结果,而使用重要性采样均匀的处理分布训练均匀治疗变分性自身培训(UTVAE)。在本文中,我们表明,通过减轻训练训练以测试时间发生的分布换档,使用对观察治疗分布的均匀处理导致更好的因果化推断。我们还探讨了统一和观察治疗分布的组合,推断和生成网络培训目标,以找到更好的培训程序,用于推断治疗效果。实验,我们发现所提出的Utvae在综合效应误差估计比Sycleiny和IHDP数据集上的CEVAE估计的估计是更好的绝对平均处理效果误差和精度。
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估算观察数据(个人 - 或人口层面)的因果效应对于制作许多类型的决策至关重要。解决此任务的一种方法是学习数据潜在因素的分解表示;当有混淆因素时(影响原因和效果),这变得明显更具挑战性。在本文中,我们采取了一种生成的方法,在变分自动编码器的最近进步上建立了同时学习这些潜在因素以及因果效应。我们提出了一种渐进模型序列,每个模型序列都改善了前一个,最终在混合模型中。我们的经验结果表明,所有三种拟议模型的性能优于最先进的判别以及文献中的其他生成方法。
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由于选择偏差,观察数据估算平均治疗效果(ATE)是有挑战性的。现有作品主要以两种方式应对这一挑战。一些研究人员建议构建满足正交条件的分数函数,该函数确保已建立的估计量“正交”更加健壮。其他人探索表示模型,以实现治疗组和受控群体之间的平衡表示。但是,现有研究未能进行1)在表示空间中歧视受控单元以避免过度平衡的问题; 2)充分利用“正交信息”。在本文中,我们提出了一个基于最新协变量平衡表示方法和正交机器学习理论的中等平衡的表示学习(MBRL)框架。该框架可保护表示形式免于通过多任务学习过度平衡。同时,MBRL将噪声正交性信息纳入培训和验证阶段,以实现更好的ATE估计。与现有的最新方法相比,基准和模拟数据集的全面实验表明,我们方法对治疗效应估计的优越性和鲁棒性。
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对于许多具有观察数据的生物医学应用,估计治疗效果至关重要。特别是,对于许多生物医学研究人员来说,可解释性可解释性。在本文中,我们首先提供理论分析,并在强大的无知性假设下获得平均治疗效果(ATE)估计的偏差的上限。通过利用加权能量距离的吸引力性能得出,我们的上限比文献中报道的更紧密。在理论分析的激励下,我们提出了一个新的目标函数,用于估计使用能量距离平衡评分的ATE,因此不需要正确规范倾向得分模型。我们还利用最近开发的神经添加剂模型来改善用于潜在结果预测的深度学习模型的可解释性。我们通过能量距离平衡评分加权正则化进一步增强了我们提出的模型。在半合成实验中,使用两个基准数据集(即IHDP和ACIC)证明了我们提出的模型比当前最新方法的优势。
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