传统的因果推理方法利用观察性研究数据来估计潜在治疗的观察到的差异和未观察到的结果,称为条件平均治疗效果(CATE)。然而,凯特就对应于仅第一刻的比较,因此可能不足以反映治疗效果的全部情况。作为替代方案,估计全部潜在结果分布可以提供更多的见解。但是,估计治疗效果的现有方法潜在的结果分布通常对这些分布施加限制性或简单的假设。在这里,我们提出了合作因果网络(CCN),这是一种新颖的方法,它通过学习全部潜在结果分布而超出了CATE的估计。通过CCN框架估算结果分布不需要对基础数据生成过程的限制性假设。此外,CCN促进了每种可能处理的效用的估计,并允许通过效用函数进行特定的特定变异。 CCN不仅将结果估计扩展到传统的风险差异之外,而且还可以通过定义灵活的比较来实现更全面的决策过程。根据因果文献中通常做出的假设,我们表明CCN学习了渐近捕获真正潜在结果分布的分布。此外,我们提出了一种调整方法,该方法在经验上可以有效地减轻观察数据中治疗组之间的样本失衡。最后,我们评估了CCN在多个合成和半合成实验中的性能。我们证明,与现有的贝叶斯和深层生成方法相比,CCN学会了改进的分布估计值,以及对各种效用功能的改进决策。
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有效的决策需要了解预测中固有的不确定性。在回归中,这种不确定性可以通过各种方法估算;然而,许多这些方法对调谐进行费力,产生过度自确性的不确定性间隔,或缺乏敏锐度(给予不精确的间隔)。我们通过提出一种通过定义具有两个不同损失功能的神经网络来捕获回归中的预测分布的新方法来解决这些挑战。具体地,一个网络近似于累积分布函数,第二网络近似于其逆。我们将此方法称为合作网络(CN)。理论分析表明,优化的固定点处于理想化的解决方案,并且该方法是渐近的与地面真理分布一致。凭经验,学习是简单且强大的。我们基准CN对两个合成和六个现实世界数据集的几种常见方法,包括预测来自电子健康记录的糖尿病患者的A1C值,其中不确定是至关重要的。在合成数据中,所提出的方法与基本上匹配地面真理。在真实世界数据集中,CN提高了许多性能度量的结果,包括对数似然估计,平均误差,覆盖估计和预测间隔宽度。
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大型观察数据越来越多地提供健康,经济和社会科学等学科,研究人员对因果问题而不是预测感兴趣。在本文中,从旨在调查参与学校膳食计划对健康指标的实证研究,研究了使用非参数回归的方法估算异质治疗效果的问题。首先,我们介绍了与观察或非完全随机数据进行因果推断相关的设置和相关的问题,以及如何在统计学习工具的帮助下解决这些问题。然后,我们审查并制定现有最先进的框架的统一分类,允许通过非参数回归模型来估算单个治疗效果。在介绍模型选择问题的简要概述后,我们说明了一些关于三种不同模拟研究的方法的性能。我们通过展示一些关于学校膳食计划数据的实证分析的一些方法的使用来结束。
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因果推断能够估计治疗效果(即,治疗结果的因果效果),使各个领域的决策受益。本研究中的一个基本挑战是观察数据的治疗偏见。为了提高对因果推断的观察研究的有效性,基于代表的方法作为最先进的方法表明了治疗效果估计的卓越性能。基于大多数基于表示的方法假设所有观察到的协变量都是预处理的(即,不受治疗影响的影响),并学习这些观察到的协变量的平衡表示,以估算治疗效果。不幸的是,这种假设往往在实践中往往是太严格的要求,因为一些协调因子是通过对治疗的干预进行改变(即,后治疗)来改变。相比之下,从不变的协变量中学到的平衡表示因此偏置治疗效果估计。
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There is intense interest in applying machine learning to problems of causal inference in fields such as healthcare, economics and education. In particular, individual-level causal inference has important applications such as precision medicine. We give a new theoretical analysis and family of algorithms for predicting individual treatment effect (ITE) from observational data, under the assumption known as strong ignorability. The algorithms learn a "balanced" representation such that the induced treated and control distributions look similar. We give a novel, simple and intuitive generalization-error bound showing that the expected ITE estimation error of a representation is bounded by a sum of the standard generalization-error of that representation and the distance between the treated and control distributions induced by the representation. We use Integral Probability Metrics to measure distances between distributions, deriving explicit bounds for the Wasserstein and Maximum Mean Discrepancy (MMD) distances. Experiments on real and simulated data show the new algorithms match or outperform the state-of-the-art.
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本文开发了贝叶斯因果林的稀疏诱导版本,最近提出的非参数因果回归模型采用贝叶斯添加剂回归树,专门设计用于使用观察数据来估计异质治疗效果。我们介绍的稀疏诱导组件是通过实证研究的动机,其中不是所有可用的协变量相关的,导致在估计个体治疗效果的兴趣表面底层的不同程度。在这项工作中提供的扩展版本,我们命名贝叶斯因果森林,配备了一对允许模型通过树集合中的相应数量的分裂调节每个协变量的重量。这些前瞻改善了模型对稀疏数据产生过程的适应性,并且允许在治疗效果估计的框架中进行完全贝叶斯特征缩收,从而揭示推动异质性的调节因子。此外,该方法允许先前了解相关的混杂协变量和对模型中掺入结果的影响的相对幅度。我们说明了我们在模拟研究中的方法的表现,与贝叶斯因果林和其他最先进的模型相比,展示如何与越来越多的协变量以及其如何处理强烈混淆的情景。最后,我们还提供了使用真实数据的应用程序的示例。
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Causal inference is the process of using assumptions, study designs, and estimation strategies to draw conclusions about the causal relationships between variables based on data. This allows researchers to better understand the underlying mechanisms at work in complex systems and make more informed decisions. In many settings, we may not fully observe all the confounders that affect both the treatment and outcome variables, complicating the estimation of causal effects. To address this problem, a growing literature in both causal inference and machine learning proposes to use Instrumental Variables (IV). This paper serves as the first effort to systematically and comprehensively introduce and discuss the IV methods and their applications in both causal inference and machine learning. First, we provide the formal definition of IVs and discuss the identification problem of IV regression methods under different assumptions. Second, we categorize the existing work on IV methods into three streams according to the focus on the proposed methods, including two-stage least squares with IVs, control function with IVs, and evaluation of IVs. For each stream, we present both the classical causal inference methods, and recent developments in the machine learning literature. Then, we introduce a variety of applications of IV methods in real-world scenarios and provide a summary of the available datasets and algorithms. Finally, we summarize the literature, discuss the open problems and suggest promising future research directions for IV methods and their applications. We also develop a toolkit of IVs methods reviewed in this survey at https://github.com/causal-machine-learning-lab/mliv.
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估计平均因果效应的理想回归(如果有)是什么?我们在离散协变量的设置中研究了这个问题,从而得出了各种分层估计器的有限样本方差的表达式。这种方法阐明了许多广泛引用的结果的基本统计现象。我们的博览会结合了研究因果效应估计的三种不同的方法论传统的见解:潜在结果,因果图和具有加性误差的结构模型。
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The intersection of causal inference and machine learning for decision-making is rapidly expanding, but the default decision criterion remains an \textit{average} of individual causal outcomes across a population. In practice, various operational restrictions ensure that a decision-maker's utility is not realized as an \textit{average} but rather as an \textit{output} of a downstream decision-making problem (such as matching, assignment, network flow, minimizing predictive risk). In this work, we develop a new framework for off-policy evaluation with \textit{policy-dependent} linear optimization responses: causal outcomes introduce stochasticity in objective function coefficients. Under this framework, a decision-maker's utility depends on the policy-dependent optimization, which introduces a fundamental challenge of \textit{optimization} bias even for the case of policy evaluation. We construct unbiased estimators for the policy-dependent estimand by a perturbation method, and discuss asymptotic variance properties for a set of adjusted plug-in estimators. Lastly, attaining unbiased policy evaluation allows for policy optimization: we provide a general algorithm for optimizing causal interventions. We corroborate our theoretical results with numerical simulations.
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因果关系的概念在人类认知中起着重要作用。在过去的几十年中,在许多领域(例如计算机科学,医学,经济学和教育)中,因果推论已经得到很好的发展。随着深度学习技术的发展,它越来越多地用于针对反事实数据的因果推断。通常,深层因果模型将协变量的特征映射到表示空间,然后设计各种客观优化函数,以根据不同的优化方法公正地估算反事实数据。本文重点介绍了深层因果模型的调查,其核心贡献如下:1)我们在多种疗法和连续剂量治疗下提供相关指标; 2)我们从时间开发和方法分类的角度综合了深层因果模型的全面概述; 3)我们协助有关相关数据集和源代码的详细且全面的分类和分析。
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绘制因果推断的基本挑战是,任何单位都没有完全观察到反事实。此外,在观察性研究中,治疗分配可能会混淆。在不满足的条件下,已经出现了许多统计方法,这些方法在给定预处理的协变量下,包括基于倾向得分的方法,基于预后分数的方法和双重稳健方法。不幸的是,对于应用研究人员而言,没有“一定大小的”因果方法可以在普遍上表现出色。实际上,因果方法主要根据手工制作的模拟数据进行定量评估。这样的数据产生程序可能具有有限的价值,因为它们通常是现实的风格化模型。它们被简化为障碍性,缺乏现实世界数据的复杂性。对于应用研究人员,了解方法对手头数据的表现效果很好至关重要。我们的工作介绍了基于生成模型的深层框架,以验证因果推理方法。该框架的新颖性源于其产生锚定在观察到的样品的经验分布上的合成数据的能力,因此与后者几乎没有区别。该方法使用户可以为因果效应的形式和幅度指定地面真理,并将偏见作为协变量的功能。因此,模拟数据集用于评估与观察到的样本相似的数据时,各种因果估计方法的潜在性能。我们证明了Credence在广泛的仿真研究中准确评估因果估计技术的相对性能以及来自Lalonde和Project Star研究的两个现实世界数据应用的能力。
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我们引入了一个灵活的框架,该框架可为因果推理产生高质量的几乎享用的匹配。匹配中的大多数先前工作都使用临时距离指标,通常会导致质量差,尤其是在有无关的协变量时。在这项工作中,我们学习了一个可解释的距离度量,以实现更高质量的匹配。学到的距离度量标准根据每个协变量对结果预测的贡献延伸协变量空间:这种拉伸意味着,对重要协变量的不匹配比对无关协变量的不匹配的惩罚更大。我们学习柔性距离指标的能力会导致匹配,这些匹配对于估计有条件的平均治疗效果有用。
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在广泛的任务中,在包括医疗处理,广告和营销和政策制定的发​​展中,对观测数据进行因果推断非常有用。使用观察数据进行因果推断有两种重大挑战:治疗分配异质性(\ Texit {IE},治疗和未经处理的群体之间的差异),并且没有反事实数据(\ TEXTIT {IE},不知道是什么已经发生了,如果确实得到治疗的人,反而尚未得到治疗)。通过组合结构化推论和有针对性的学习来解决这两个挑战。在结构方面,我们将联合分布分解为风险,混淆,仪器和杂项因素,以及在目标学习方面,我们应用来自影响曲线的规则器,以减少残余偏差。进行了一项消融研究,对基准数据集进行评估表明,TVAE具有竞争力和最先进的艺术表现。
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通常使用参数模型进行经验领域的参数估计,并且此类模型很容易促进统计推断。不幸的是,它们不太可能足够灵活,无法充分建模现实现象,并可能产生偏见的估计。相反,非参数方法是灵活的,但不容易促进统计推断,并且仍然可能表现出残留的偏见。我们探索了影响功能(IFS)的潜力(a)改善初始估计器而无需更多数据(b)增加模型的鲁棒性和(c)促进统计推断。我们首先对IFS进行广泛的介绍,并提出了一种神经网络方法“ Multinet”,该方法使用单个体系结构寻求合奏的多样性。我们还介绍了我们称为“ Multistep”的IF更新步骤的变体,并对不同方法提供了全面的评估。发现这些改进是依赖数据集的,这表明所使用的方法与数据生成过程的性质之间存在相互作用。我们的实验强调了从业人员需要通过不同的估计器组合进行多次分析来检查其发现的一致性。我们还表明,可以改善“自由”的现有神经网络,而无需更多数据,而无需重新训练。
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观察数据中估算单个治疗效果(ITE)在许多领域,例如个性化医学等领域。但是,实际上,治疗分配通常被未观察到的变量混淆,因此引入了偏见。消除偏见的一种补救措施是使用仪器变量(IVS)。此类环境在医学中广泛存在(例如,将合规性用作二进制IV的试验)。在本文中,我们提出了一个新颖的,可靠的机器学习框架,称为MRIV,用于使用二进制IV估算ITES,从而产生无偏见的ITE估计器。与以前的二进制IV的工作不同,我们的框架通过伪结果回归直接估算了ITE。 (1)我们提供了一个理论分析,我们表明我们的框架产生了多重稳定的收敛速率:即使几个滋扰估计器的收敛缓慢,我们的ITE估计器也会达到快速收敛。 (2)我们进一步表明,我们的框架渐近地优于最先进的插件IV方法,以进行ITE估计。 (3)我们以理论结果为基础,并提出了一种使用二进制IVS的ITE估算的定制的,称为MRIV-NET的深度神经网络结构。在各种计算实验中,我们从经验上证明了我们的MRIV-NET实现最先进的性能。据我们所知,我们的MRIV是第一个机器学习框架,用于估算显示出倍增功能的二进制IV设置。
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Causal learning has attracted much attention in recent years because causality reveals the essential relationship between things and indicates how the world progresses. However, there are many problems and bottlenecks in traditional causal learning methods, such as high-dimensional unstructured variables, combinatorial optimization problems, unknown intervention, unobserved confounders, selection bias and estimation bias. Deep causal learning, that is, causal learning based on deep neural networks, brings new insights for addressing these problems. While many deep learning-based causal discovery and causal inference methods have been proposed, there is a lack of reviews exploring the internal mechanism of deep learning to improve causal learning. In this article, we comprehensively review how deep learning can contribute to causal learning by addressing conventional challenges from three aspects: representation, discovery, and inference. We point out that deep causal learning is important for the theoretical extension and application expansion of causal science and is also an indispensable part of general artificial intelligence. We conclude the article with a summary of open issues and potential directions for future work.
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由于选择偏差,观察数据估算平均治疗效果(ATE)是有挑战性的。现有作品主要以两种方式应对这一挑战。一些研究人员建议构建满足正交条件的分数函数,该函数确保已建立的估计量“正交”更加健壮。其他人探索表示模型,以实现治疗组和受控群体之间的平衡表示。但是,现有研究未能进行1)在表示空间中歧视受控单元以避免过度平衡的问题; 2)充分利用“正交信息”。在本文中,我们提出了一个基于最新协变量平衡表示方法和正交机器学习理论的中等平衡的表示学习(MBRL)框架。该框架可保护表示形式免于通过多任务学习过度平衡。同时,MBRL将噪声正交性信息纳入培训和验证阶段,以实现更好的ATE估计。与现有的最新方法相比,基准和模拟数据集的全面实验表明,我们方法对治疗效应估计的优越性和鲁棒性。
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在制定政策指南时,随机对照试验(RCT)代表了黄金标准。但是,RCT通常是狭窄的,并且缺乏更广泛的感兴趣人群的数据。这些人群中的因果效应通常是使用观察数据集估算的,这可能会遭受未观察到的混杂和选择偏见。考虑到一组观察估计(例如,来自多项研究),我们提出了一个试图拒绝偏见的观察性估计值的元偏值。我们使用验证效应,可以从RCT和观察数据中推断出的因果效应。在拒绝未通过此测试的估计器之后,我们对RCT中未观察到的亚组的外推性效应产生了保守的置信区间。假设至少一个观察估计量在验证和外推效果方面是渐近正常且一致的,我们为我们算法输出的间隔的覆盖率概率提供了保证。为了促进在跨数据集的因果效应运输的设置中,我们给出的条件下,即使使用灵活的机器学习方法用于估计滋扰参数,群体平均治疗效应的双重稳定估计值也是渐近的正常。我们说明了方法在半合成和现实世界数据集上的特性,并表明它与标准的荟萃分析技术相比。
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估算随机实验的因果效应是临床研究的核心。降低这些分析中的统计不确定性是统计学家的重要目标。注册管理机构,事先审判和健康记录构成了对患者的历史数据汇编,其在可能是可利用至此的患者下的历史数据。但是,大多数历史借贷方法通过牺牲严格的I型错误率控制来达到方差的减少。在这里,我们建议使用利用线性协变调整的历史数据来提高试验分析的效率而不会产生偏见。具体而言,我们在历史数据上培训预后模型,然后使用线性回归估计治疗效果,同时调整试验受试者预测结果(其预后分数)。我们证明,在某些条件下,这种预后调整程序在大类估算仪中获得了最低差异。当不符合这些条件时,预后的协变量调整仍然比原始协变量调整更有效,并且效率的增益与上述预后模型的预测准确性的衡量标准成正比,与原始协变量的线性关系的预测准确性。我们展示了使用模拟的方法和阿尔茨海默病的临床试验的再分析,并观察平均平均误差的有意义减少和估计方差。最后,我们提供了一种简化的渐近方差公式,使得能够计算这些收益的功率计算。在使用预后模型的预后模型中,可以实现10%和30%的样品尺寸减少。
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为目标疾病开发新药物是一项耗时且昂贵的任务,药物重新利用已成为药物开发领域的流行话题。随着许多健康索赔数据可用,已经对数据进行了许多研究。现实世界的数据嘈杂,稀疏,并且具有许多混杂因素。此外,许多研究表明,药物的作用在人群中是异质的。近年来已经出现了许多有关估计异构治疗效果(HTE)(HTE)的高级机器学习模型,并已应用于计量经济学和机器学习社区。这些研究将医学和药物开发视为主要应用领域,但是从HTE方法论到药物开发的转化研究有限。我们旨在将HTE方法介绍到医疗保健领域,并在通过基准实验进行医疗保健行政索赔数据进行基准实验时提供可行性考虑。另外,我们希望使用基准实验来展示如何将模型应用于医疗保健研究时如何解释和评估模型。通过将最近的HTE技术引入生物医学信息学社区的广泛读者,我们希望通过机器学习促进广泛采用因果推断。我们还希望提供HTE具有个性化药物有效性的可行性。
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