Test log-likelihood is commonly used to compare different models of the same data and different approximate inference algorithms for fitting the same probabilistic model. We present simple examples demonstrating how comparisons based on test log-likelihood can contradict comparisons according to other objectives. Specifically, our examples show that (i) conclusions about forecast accuracy based on test log-likelihood comparisons may not agree with conclusions based on other distributional quantities like means; and (ii) that approximate Bayesian inference algorithms that attain higher test log-likelihoods need not also yield more accurate posterior approximations.
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贝叶斯神经网络具有潜在变量(BNN + LVS)通过明确建模模型不确定性(通过网络权重)和环境暂停(通过潜在输入噪声变量)来捕获预测的不确定性。在这项工作中,我们首先表明BNN + LV具有严重形式的非可识别性:可以在模型参数和潜在变量之间传输解释性,同时拟合数据。我们证明,在无限数据的极限中,网络权重和潜变量的后部模式从地面真理渐近地偏离。由于这种渐近偏差,传统的推理方法可以在实践中,产量参数概括不确定和不确定的不确定性。接下来,我们开发一种新推断过程,明确地减轻了训练期间不可识别性的影响,并产生高质量的预测以及不确定性估计。我们展示我们的推理方法在一系列合成和实际数据集中改善了基准方法。
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无似然方法是对可以模拟的隐式模型执行推断的必不可少的工具,但相应的可能性是棘手的。但是,常见的无可能方法不能很好地扩展到大量模型参数。一种有前途的无可能推理的有前途的方法涉及通过仅根据据信为低维成分提供信息的摘要统计数据来估计低维边缘后期,然后在某种程度上结合了低维近似值。在本文中,我们证明,对于看似直观的汇总统计选择,这种低维近似值在实践中可能是差的。我们描述了一个理想化的低维汇总统计量,原则上适用于边际估计。但是,在实践中很难直接近似理想的选择。因此,我们提出了一种替代的边际估计方法,该方法更容易实施和自动化。考虑到初始选择的低维摘要统计量可能仅对边缘后验位置有用,新方法通过使用所有摘要统计数据来确保全局可识别性来提高性能,从而提高性能使用低维摘要统计量进行精确的低维近似。我们表明,该方法的后部可以分别基于低维和完整的摘要统计数据将其表示为后验分布的对数库。在几个示例中说明了我们方法的良好性能。
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隐式过程(IPS)代表一个灵活的框架,可用于描述各种模型,从贝叶斯神经网络,神经抽样器和数据生成器到许多其他模型。 IP还允许在功能空间上进行大致推断。公式的这种变化解决了参数空间的固有退化问题近似推断,即参数数量及其在大型模型中的强大依赖性。为此,文献中先前的作品试图采用IPS来设置先验并近似产生的后部。但是,这被证明是一项具有挑战性的任务。现有的方法可以调整先前的IP导致高斯预测分布,该分布未能捕获重要的数据模式。相比之下,通过使用另一个IP近似后验过程产生灵活预测分布的方法不能将先前的IP调整到观察到的数据中。我们在这里建议第一个可以实现这两个目标的方法。为此,我们依赖于先前IP的诱导点表示,就像在稀疏高斯过程中所做的那样。结果是一种可扩展的方法,用于与IP的近似推断,可以将先前的IP参数调整到数据中,并提供准确的非高斯预测分布。
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我们通过Pac-Bayes概括界的镜头研究冷后效应。我们认为,在非反应环境中,当训练样本的数量相对较小时,应考虑到冷后效应的讨论,即大概贝叶斯推理并不能容易地提供对样本外数据的性能的保证。取而代之的是,通过泛化结合更好地描述了样本外误差。在这种情况下,我们探讨了各种推理与PAC-Bayes目标的ELBO目标之间的联系。我们注意到,虽然Elbo和Pac-Bayes目标相似,但后一个目标自然包含温度参数$ \ lambda $,不限于$ \ lambda = 1 $。对于回归和分类任务,在各向同性拉普拉斯与后部的近似值的情况下,我们展示了这种对温度参数的PAC-bayesian解释如何捕获冷后效应。
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结构方程模型(SEM)是一种有效的框架,其原因是通过定向非循环图(DAG)表示的因果关系。最近的进步使得能够从观察数据中实现了DAG的最大似然点估计。然而,在实际场景中,可以不能准确地捕获在推断下面的底层图中的不确定性,其中真正的DAG是不可识别的并且/或观察到的数据集是有限的。我们提出了贝叶斯因果发现网(BCD网),一个变分推理框架,用于估算表征线性高斯SEM的DAG的分布。由于图形的离散和组合性质,开发一个完整的贝叶斯后面是挑战。我们通过表达变分别家庭分析可扩展VI的可扩展VI的关键设计选择,例如1)表达性变分别家庭,2)连续弛豫,使低方差随机优化和3)在潜在变量上具有合适的前置。我们提供了一系列关于实际和合成数据的实验,显示BCD网在低数据制度中的标准因果发现度量上的最大似然方法,例如结构汉明距离。
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统计模型是机器学习的核心,具有广泛适用性,跨各种下游任务。模型通常由通过最大似然估计从数据估计的自由参数控制。但是,当面对现实世界数据集时,许多模型运行到一个关键问题:它们是在完全观察到的数据方面配制的,而在实践中,数据集会困扰缺失数据。来自不完整数据的统计模型估计理论在概念上类似于潜在变量模型的估计,其中存在强大的工具,例如变分推理(VI)。然而,与标准潜在变量模型相比,具有不完整数据的参数估计通常需要估计缺失变量的指数 - 许多条件分布,因此使标准的VI方法是棘手的。通过引入变分Gibbs推理(VGI),是一种新的通用方法来解决这个差距,以估计来自不完整数据的统计模型参数。我们在一组合成和实际估算任务上验证VGI,从不完整的数据中估算重要的机器学习模型,VAE和标准化流程。拟议的方法,同时通用,实现比现有的特定模型特定估计方法竞争或更好的性能。
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Large multilayer neural networks trained with backpropagation have recently achieved state-ofthe-art results in a wide range of problems. However, using backprop for neural net learning still has some disadvantages, e.g., having to tune a large number of hyperparameters to the data, lack of calibrated probabilistic predictions, and a tendency to overfit the training data. In principle, the Bayesian approach to learning neural networks does not have these problems. However, existing Bayesian techniques lack scalability to large dataset and network sizes. In this work we present a novel scalable method for learning Bayesian neural networks, called probabilistic backpropagation (PBP). Similar to classical backpropagation, PBP works by computing a forward propagation of probabilities through the network and then doing a backward computation of gradients. A series of experiments on ten real-world datasets show that PBP is significantly faster than other techniques, while offering competitive predictive abilities. Our experiments also show that PBP provides accurate estimates of the posterior variance on the network weights.
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在使用多模式贝叶斯后部分布时,马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)算法难以在模式之间移动,并且默认变分或基于模式的近似推动将低估后不确定性。并且,即使找到最重要的模式,难以评估后部的相对重量。在这里,我们提出了一种使用MCMC,变分或基于模式的模式的并行运行的方法,以便尽可能多地击中多种模式或分离的区域,然后使用贝叶斯堆叠来组合这些用于构建分布的加权平均值的可扩展方法。通过堆叠从多模式后分布的堆叠,最小化交叉验证预测误差的结果,并且代表了比变分推断更好的不确定度,但它不一定是相当于渐近的,以完全贝叶斯推断。我们呈现理论一致性,其中堆叠推断逼近来自未衰退的模型和非混合采样器的真实数据生成过程,预测性能优于完全贝叶斯推断,因此可以被视为祝福而不是模型拼写下的诅咒。我们展示了几个模型家庭的实际实施:潜在的Dirichlet分配,高斯过程回归,分层回归,马蹄素变量选择和神经网络。
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Simulator-based models are models for which the likelihood is intractable but simulation of synthetic data is possible. They are often used to describe complex real-world phenomena, and as such can often be misspecified in practice. Unfortunately, existing Bayesian approaches for simulators are known to perform poorly in those cases. In this paper, we propose a novel algorithm based on the posterior bootstrap and maximum mean discrepancy estimators. This leads to a highly-parallelisable Bayesian inference algorithm with strong robustness properties. This is demonstrated through an in-depth theoretical study which includes generalisation bounds and proofs of frequentist consistency and robustness of our posterior. The approach is then assessed on a range of examples including a g-and-k distribution and a toggle-switch model.
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贝叶斯拉索是在线性回归框架中构建的,并应用了吉布斯采样以估计回归参数。本文开发了一种新的稀疏学习模型,称为贝叶斯套索稀疏(BLS)模型,该模型采用了贝叶斯拉索的层次模型公式。与原始贝叶斯套索的主要区别在于估计程序;BLS方法使用基于II类型最大似然过程的学习算法。与贝叶斯拉索相反,BLS提供了回归参数的稀疏估计值。BLS方法还通过引入内核功能来得出非线性监督学习问题。我们将BLS模型与众所周知的相关矢量机,快速拉普拉斯法,再见套索和套索在模拟和真实数据上进行了比较。数值结果表明,BLS稀疏而精确,尤其是在处理嘈杂和不规则数据集时。
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贝叶斯范式有可能解决深度神经网络的核心问题,如校准和数据效率低差。唉,缩放贝叶斯推理到大量的空间通常需要限制近似。在这项工作中,我们表明它足以通过模型权重的小子集进行推动,以便获得准确的预测后断。另一个权重被保存为点估计。该子网推断框架使我们能够在这些子集上使用表现力,否则难以相容的后近近似。特别是,我们将子网线性化LAPLACE作为一种简单,可扩展的贝叶斯深度学习方法:我们首先使用线性化的拉普拉斯近似来获得所有重量的地图估计,然后在子网上推断出全协方差高斯后面。我们提出了一个子网选择策略,旨在最大限度地保护模型的预测性不确定性。经验上,我们的方法对整个网络的集合和较少的表达后近似进行了比较。
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One of the core problems of modern statistics is to approximate difficult-to-compute probability densities. This problem is especially important in Bayesian statistics, which frames all inference about unknown quantities as a calculation involving the posterior density. In this paper, we review variational inference (VI), a method from machine learning that approximates probability densities through optimization. VI has been used in many applications and tends to be faster than classical methods, such as Markov chain Monte Carlo sampling. The idea behind VI is to first posit a family of densities and then to find the member of that family which is close to the target. Closeness is measured by Kullback-Leibler divergence. We review the ideas behind mean-field variational inference, discuss the special case of VI applied to exponential family models, present a full example with a Bayesian mixture of Gaussians, and derive a variant that uses stochastic optimization to scale up to massive data. We discuss modern research in VI and highlight important open problems. VI is powerful, but it is not yet well understood. Our hope in writing this paper is to catalyze statistical research on this class of algorithms.
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我们引入了一种新的经验贝叶斯方法,用于大规模多线性回归。我们的方法结合了两个关键思想:(i)使用灵活的“自适应收缩”先验,该先验近似于正常分布的有限混合物,近似于正常分布的非参数家族; (ii)使用变分近似来有效估计先前的超参数并计算近似后期。将这两个想法结合起来,将快速,灵活的方法与计算速度相当,可与快速惩罚的回归方法(例如Lasso)相当,并在各种场景中具有出色的预测准确性。此外,我们表明,我们方法中的后验平均值可以解释为解决惩罚性回归问题,并通过直接解决优化问题(而不是通过交叉验证来调整)从数据中学到的惩罚函数的精确形式。 。我们的方法是在r https://github.com/stephenslab/mr.ash.ash.alpha的r软件包中实现的
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近似贝叶斯计算(ABC)使复杂模型中的统计推断能够计算,其可能性难以计算,但易于模拟。 ABC通过接受/拒绝机制构建到后部分布的内核类型近似,该机制比较真实和模拟数据的摘要统计信息。为了避免对汇总统计数据的需求,我们直接将经验分布与通过分类获得的Kullback-Leibler(KL)发散估计值进行比较。特别是,我们将灵活的机器学习分类器混合在ABC中以自动化虚假/真实数据比较。我们考虑传统的接受/拒绝内核以及不需要ABC接受阈值的指数加权方案。我们的理论结果表明,我们的ABC后部分布集中在真实参数周围的速率取决于分类器的估计误差。我们得出了限制后形状的结果,并找到了一个正确缩放的指数内核,渐近常态持有。我们展示了我们对模拟示例以及在股票波动率估计的背景下的真实数据的有用性。
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重要的加权是调整蒙特卡洛集成以说明错误分布中抽取的一种一般方法,但是当重要性比的右尾巴较重时,最终的估计值可能是高度可变的。当目标分布的某些方面无法通过近似分布捕获,在这种情况下,可以通过修改极端重要性比率来获得更稳定的估计。我们提出了一种新的方法,该方法使用拟合模拟重要性比率的上尾的广义帕累托分布来稳定重要性权重。该方法在经验上的性能要比现有方法稳定重要性采样估计值更好,包括稳定的有效样本量估计,蒙特卡洛误差估计和收敛诊断。提出的帕累托$ \ hat {k} $有限样本收敛率诊断对任何蒙特卡洛估计器都有用。
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最近推出的热集成技术已经了解并改善变推理(VI),提供了一个新的框架。在这项工作中,我们提出了热力学变目标(TVO)的仔细分析,弥合现有的变分目标和脱落的新见解,以推动该领域的差距。特别是,我们阐明了如何将TVO自然连接三个关键变方案,即重要性加权VI,仁义-VI,和MCMC-VI,它包含了最VI目标在实践中采用。为了解释理论和实践之间的性能差距,我们揭示热力学曲线的病理几何形状是如何产生负面影响TVO。通过推广加权平均持有人从几何平均值的整合路径,我们扩展TVO的理论和发现提高VI新的机遇。这促使我们的新VI的目标,命名为持有人的边界,这拼合热力学曲线和承诺,以实现精确的边缘数似然的一步逼近。提供对数字估计的选择的全面讨论。我们目前的合成和真实世界的数据集强有力的实证证据来支持我们的要求。
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通过最小化kullback-leibler(kl)差异,变化推断近似于非差异分布。尽管这种差异对于计算有效,并且已在应用中广泛使用,但它具有一些不合理的属性。例如,它不是一个适当的度量标准,即,它是非对称的,也不保留三角形不等式。另一方面,最近的最佳运输距离显示出比KL差异的一些优势。在这些优势的帮助下,我们通过最大程度地减少切片的瓦斯汀距离,这是一种由最佳运输产生的有效度量,提出了一种新的变异推理方法。仅通过运行MCMC而不能解决任何优化问题,就可以简单地近似切片的Wasserstein距离。我们的近似值也不需要变异分布的易于处理密度函数,因此诸如神经网络之类的发电机可以摊销近似家庭。此外,我们提供了方法的理论特性分析。说明了关于合成和真实数据的实验,以显示提出的方法的性能。
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Scientists continue to develop increasingly complex mechanistic models to reflect their knowledge more realistically. Statistical inference using these models can be highly challenging, since the corresponding likelihood function is often intractable, and model simulation may be computationally burdensome or infeasible. Fortunately, in many of these situations, it is possible to adopt a surrogate model or approximate likelihood function. It may be convenient to base Bayesian inference directly on the surrogate, but this can result in bias and poor uncertainty quantification. In this paper we propose a new method for adjusting approximate posterior samples to reduce bias and produce more accurate uncertainty quantification. We do this by optimising a transform of the approximate posterior that minimises a scoring rule. Our approach requires only a (fixed) small number of complex model simulations and is numerically stable. We demonstrate good performance of the new method on several examples of increasing complexity.
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Machine Unering是指删除培训数据子集的任务,从而删除其对训练有素的模型的贡献。近似学习是该任务的一类方法,避免了需要在保留数据上从头开始重新研究模型。贝叶斯的规则可用于将近似学习作为推理问题,其中目的是通过划分删除数据的可能性来获得更新后的后部。但是,这有自己的挑战集,因为人们通常无法访问模型参数的确切后验。在这项工作中,我们检查了拉普拉斯近似和变异推理的使用以获得更新的后验。通过对指导示例进行回归任务的神经网络培训,我们在实践场景中就贝叶斯学习的适用性进行了见解。
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