统计模型是机器学习的核心,具有广泛适用性,跨各种下游任务。模型通常由通过最大似然估计从数据估计的自由参数控制。但是,当面对现实世界数据集时,许多模型运行到一个关键问题:它们是在完全观察到的数据方面配制的,而在实践中,数据集会困扰缺失数据。来自不完整数据的统计模型估计理论在概念上类似于潜在变量模型的估计,其中存在强大的工具,例如变分推理(VI)。然而,与标准潜在变量模型相比,具有不完整数据的参数估计通常需要估计缺失变量的指数 - 许多条件分布,因此使标准的VI方法是棘手的。通过引入变分Gibbs推理(VGI),是一种新的通用方法来解决这个差距,以估计来自不完整数据的统计模型参数。我们在一组合成和实际估算任务上验证VGI,从不完整的数据中估算重要的机器学习模型,VAE和标准化流程。拟议的方法,同时通用,实现比现有的特定模型特定估计方法竞争或更好的性能。
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变异推理(VI)的核心原理是将计算复杂后概率密度计算的统计推断问题转换为可拖动的优化问题。该属性使VI比几种基于采样的技术更快。但是,传统的VI算法无法扩展到大型数据集,并且无法轻易推断出越野数据点,而无需重新运行优化过程。该领域的最新发展,例如随机,黑框和摊销VI,已帮助解决了这些问题。如今,生成的建模任务广泛利用摊销VI来实现其效率和可扩展性,因为它利用参数化函数来学习近似的后验密度参数。在本文中,我们回顾了各种VI技术的数学基础,以构成理解摊销VI的基础。此外,我们还概述了最近解决摊销VI问题的趋势,例如摊销差距,泛化问题,不一致的表示学习和后验崩溃。最后,我们分析了改善VI优化的替代差异度量。
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项目反应理论(IRT)是一个无处不在的模型,可以根据他们对问题的回答理解人类行为和态度。大型现代数据集为捕捉人类行为的更多细微差别提供了机会,从而有可能改善心理测量模型,从而改善科学理解和公共政策。但是,尽管较大的数据集允许采用更灵活的方法,但许多用于拟合IRT模型的当代算法也可能具有禁止现实世界应用的巨大计算需求。为了解决这种瓶颈,我们引入了IRT的变异贝叶斯推理算法,并表明它在不牺牲准确性的情况下快速可扩展。将此方法应用于认知科学和教育的五个大规模项目响应数据集中,比替代推理算法更高的对数可能性和更高的准确性。然后,使用这种新的推论方法,我们将IRT概括为具有表现力的贝叶斯响应模型,利用深度学习的最新进展来捕获具有神经网络的非线性项目特征曲线(ICC)。使用TIMSS的特定级数学测试,我们显示我们的非线性IRT模型可以捕获有趣的不对称ICC。该算法实现是开源的,易于使用。
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变异推理通常从近似分布q到后p中最小化“反向” kullbeck-leibeler(kl)kl(q || p)。最近的工作研究“正向” KL KL(P || Q),它与反向KL不同并不能导致低估不确定性的变异近似值。本文介绍了运输评分攀登(TSC),该方法通过使用汉密尔顿蒙特卡洛(HMC)和新型的自适应传输图来优化KL(P || Q)。传输图通过充当潜在变量空间和扭曲空间之间变量的变化来改善HMC的轨迹。TSC使用HMC样品在优化KL时动态训练传输图(P || Q)。TSC利用协同作用,在该协同作用下,更好的运输地图会导致更好的HMC采样,从而导致更好的传输地图。我们在合成和真实数据上演示了TSC。我们发现,在训练大规模数据的变异自动编码器时,TSC可以实现竞争性能。
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近年来,深度学习(DL)方法的流行程度大大增加。尽管在图像数据的分类和操纵中证明了其最初的成功,但DL方法应用于生物医学科学中的问题的应用已显着增长。但是,生物医学数据集中缺失数据的较高流行率和复杂性对DL方法提出了重大挑战。在这里,我们在变化自动编码器(VAE)的背景下提供了对缺失数据的正式处理,这是一种普遍用于缩小尺寸,插补和学习复杂数据的潜在表示的流行无监督的DL体系结构。我们提出了一种新的VAE架构Nimiwae,这是第一个在训练时在输入功能中灵活解释可忽视和不可忽视的缺失模式之一。训练后,可以从缺失数据的后验分布中得出样本,可用于多个插补,从而促进高维不完整数据集的下游分析。我们通过统计模拟证明,我们的方法优于无监督的学习任务和插定精度的现有方法。我们以与12,000名ICU患者有关的EHR数据集的案例研究结束,该数据集具有大量诊断测量和临床结果,其中仅观察到许多特征。
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马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC),例如langevin Dynamics,有效地近似顽固的分布。但是,由于昂贵的数据采样迭代和缓慢的收敛性,它的用法在深层可变模型的背景下受到限制。本文提出了摊销的langevin Dynamics(ALD),其中数据划分的MCMC迭代完全被编码器的更新替换为将观测值映射到潜在变量中。这种摊销可实现有效的后验采样,而无需数据迭代。尽管具有效率,但我们证明ALD是MCMC算法有效的,其马尔可夫链在轻度假设下将目标后部作为固定分布。基于ALD,我们还提出了一个名为Langevin AutoCodeer(LAE)的新的深层变量模型。有趣的是,可以通过稍微修改传统自动编码器来实现LAE。使用多个合成数据集,我们首先验证ALD可以从目标后代正确获取样品。我们还在图像生成任务上评估了LAE,并证明我们的LAE可以根据变异推断(例如变异自动编码器)和其他基于MCMC的方法在测试可能性方面胜过现有的方法。
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变异自动编码器(VAE)最近在归类和获取异质缺失数据方面非常成功。但是,在此特定应用程序域中,仅使用一层潜在变量和严格的高斯后近似值来限制现有的VAE方法。为了解决这些局限性,我们提出了HH-VAEM,这是一种用于混合型不完整数据的层次VAE模型,该模型使用Hamiltonian Monte Carlo和自动超参数调谐,以改善近似推断。我们的实验表明,HH-VAEM在缺少数据插补和有缺少功能的监督学习的任务中优于现有基线。最后,我们还提出了一种基于抽样的方法,用于在使用HH-VAEM获取缺失功能时有效地计算信息增益。我们的实验表明,基于抽样的方法优于基于高斯近似值的替代方法。
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现代深度学习方法构成了令人难以置信的强大工具,以解决无数的挑战问题。然而,由于深度学习方法作为黑匣子运作,因此与其预测相关的不确定性往往是挑战量化。贝叶斯统计数据提供了一种形式主义来理解和量化与深度神经网络预测相关的不确定性。本教程概述了相关文献和完整的工具集,用于设计,实施,列车,使用和评估贝叶斯神经网络,即使用贝叶斯方法培训的随机人工神经网络。
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概率分布允许从业者发现数据中的隐藏结构,并构建模型,以使用有限的数据解决监督的学习问题。该报告的重点是变异自动编码器,这是一种学习大型复杂数据集概率分布的方法。该报告提供了对变异自动编码器的理论理解,并巩固了该领域的当前研究。该报告分为多个章节,第一章介绍了问题,描述了变异自动编码器并标识了该领域的关键研究方向。第2、3、4和5章深入研究了每个关键研究领域的细节。第6章总结了报告,并提出了未来工作的指示。具有机器学习基本思想但想了解机器学习研究中的一般主题的读者可以从报告中受益。该报告解释了有关学习概率分布的中心思想,人们为使这种危险做些什么,并介绍了有关当前如何应用深度学习的细节。该报告还为希望为这个子场做出贡献的人提供了温和的介绍。
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数据和标签的联合分布的KL差异目标允许在随机变异推断的一个保护伞下统一监督的学习和变异自动编码器(VAE)。统一激发了扩展的监督方案,该方案允许计算神经网络模型的合适性P值。通过神经网络摊销的条件归一化流在这种结构中至关重要。我们讨论了它们如何允许在产品空间上共同定义的后代定义的覆盖范围,例如$ \ mathbb {r}^n \ times \ times \ mathcal {s}^m $,它包含在方向上的海报。最后,系统的不确定性自然包含在变化观点中。在经典的可能性方法或其他机器学习模型中,(1)系统,(2)覆盖范围和(3)拟合优度的成分通常并非全部可用,或者至少有一个受到严格限制。相比之下,拟议的扩展监督培训和摊销标准化流量可容纳所有三个,用于在产品空间上定义的任意统计分布的变异推理,例如$ \ mathbb {r}^n \ times \ times \ ldots \ ldots \ times \ times \ mathcal {s}^m {s}^m $,没有基本数据复杂性的基本障碍。因此,它具有当代(Astro-)粒子物理学家的统计工具箱的巨大潜力。
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Normalizing flows provide a general mechanism for defining expressive probability distributions, only requiring the specification of a (usually simple) base distribution and a series of bijective transformations. There has been much recent work on normalizing flows, ranging from improving their expressive power to expanding their application. We believe the field has now matured and is in need of a unified perspective. In this review, we attempt to provide such a perspective by describing flows through the lens of probabilistic modeling and inference. We place special emphasis on the fundamental principles of flow design, and discuss foundational topics such as expressive power and computational trade-offs. We also broaden the conceptual framing of flows by relating them to more general probability transformations. Lastly, we summarize the use of flows for tasks such as generative modeling, approximate inference, and supervised learning.
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近年来,深度学习(DL)方法的流行程度急剧增加,并且在生物医学科学中的监督学习问题中的应用显着增长。但是,现代生物医学数据集中缺失数据的较高流行率和复杂性对DL方法提出了重大挑战。在这里,我们在深入学习的广义线性模型的背景下,对缺失数据进行了正式处理,这是一种监督的DL架构,用于回归和分类问题。我们提出了一种新的体系结构,即\ textit {dlglm},这是第一个能够在训练时在输入功能和响应中灵活地说明忽略和不可忽视的缺失模式之一。我们通过统计模拟证明,我们的方法在没有随机(MNAR)缺失的情况下胜过现有的监督学习任务方法。我们从UCI机器学习存储库中对银行营销数据集进行了案例研究,在该数据集中我们预测客户是否基于电话调查数据订阅了产品。
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最近推出的热集成技术已经了解并改善变推理(VI),提供了一个新的框架。在这项工作中,我们提出了热力学变目标(TVO)的仔细分析,弥合现有的变分目标和脱落的新见解,以推动该领域的差距。特别是,我们阐明了如何将TVO自然连接三个关键变方案,即重要性加权VI,仁义-VI,和MCMC-VI,它包含了最VI目标在实践中采用。为了解释理论和实践之间的性能差距,我们揭示热力学曲线的病理几何形状是如何产生负面影响TVO。通过推广加权平均持有人从几何平均值的整合路径,我们扩展TVO的理论和发现提高VI新的机遇。这促使我们的新VI的目标,命名为持有人的边界,这拼合热力学曲线和承诺,以实现精确的边缘数似然的一步逼近。提供对数字估计的选择的全面讨论。我们目前的合成和真实世界的数据集强有力的实证证据来支持我们的要求。
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近似复杂的概率密度是现代统计中的核心问题。在本文中,我们介绍了变分推理(VI)的概念,这是一种机器学习中的流行方法,该方法使用优化技术来估计复杂的概率密度。此属性允许VI汇聚速度比经典方法更快,例如Markov Chain Monte Carlo采样。概念上,VI通过选择一个概率密度函数,然后找到最接近实际概率密度的家庭 - 通常使用Kullback-Leibler(KL)发散作为优化度量。我们介绍了缩窄的证据,以促进近似的概率密度,我们审查了平均场变分推理背后的想法。最后,我们讨论VI对变分式自动编码器(VAE)和VAE-生成的对抗网络(VAE-GAN)的应用。用本文,我们的目标是解释VI的概念,并通过这种方法协助协助。
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我们提出了连续重复的退火流传输蒙特卡洛(CRAFT),该方法结合了顺序的蒙特卡洛(SMC)采样器(本身是退火重要性采样的概括)与使用归一化流量的变异推断。直接训练了归一化的流量,可用于使用KL差异进行每个过渡,以在退火温度之间运输。使用归一化流/SMC近似值估算了此优化目标。我们从概念上展示并使用多个经验示例,这些示例可以改善退火流运输蒙特卡洛(Arbel等,2021),并在其上建造,也可以在基于马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)基于基于的随机归一化流(Wu等人。2020)。通过将工艺纳入粒子MCMC中,我们表明,这种学识渊博的采样器可以在具有挑战性的晶格场理论示例中获得令人印象深刻的准确结果。
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We marry ideas from deep neural networks and approximate Bayesian inference to derive a generalised class of deep, directed generative models, endowed with a new algorithm for scalable inference and learning. Our algorithm introduces a recognition model to represent an approximate posterior distribution and uses this for optimisation of a variational lower bound. We develop stochastic backpropagation -rules for gradient backpropagation through stochastic variables -and derive an algorithm that allows for joint optimisation of the parameters of both the generative and recognition models. We demonstrate on several real-world data sets that by using stochastic backpropagation and variational inference, we obtain models that are able to generate realistic samples of data, allow for accurate imputations of missing data, and provide a useful tool for high-dimensional data visualisation.
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标准化流是可易处理的密度模型,可以近似复杂的目标分布,例如物理系统的玻尔兹曼分布。但是,当前的训练流量要么具有寻求模式的行为,要么使用昂贵的MCMC模拟事先生成的目标样本,要么使用具有很高差异的随机损失。为了避免这些问题,我们以退火重要性采样(AIS)增强流量,并最大程度地减少覆盖$ \ alpha $ -divergence的质量,并使用$ \ alpha = 2 $,从而最大程度地减少了重要性的重量差异。我们的方法是流动性Bootstrap(Fab),使用AIS在流动较差的目标区域中生成样品,从而促进了新模式的发现。我们以AIS的最小差异分布来定位,以通过重要性抽样来估计$ \ alpha $ -Divergence。我们还使用优先的缓冲区来存储和重复使用AIS样本。这两个功能显着提高了Fab的性能。我们将FAB应用于复杂的多模式目标,并表明我们可以在以前的方法失败的情况下非常准确地近似它们。据我们所知,我们是第一个仅使用非均衡目标密度学习丙氨酸二肽分子的玻璃体分布,而无需通过分子动力学(MD)模拟生成的样品:FAB与通过最大可能性训练更好的效果,而不是通过最大可能性产生的结果。在MD样品上使用100倍的目标评估。在重新获得重要权重的样品后,我们获得了与地面真相几乎相同的二面角的无偏直方图。
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我们提出了一种新的非参数混合物模型,用于多变量回归问题,灵感来自概率K-Nearthimest邻居算法。使用有条件指定的模型,对样本外输入的预测基于与每个观察到的数据点的相似性,从而产生高斯混合物表示的预测分布。在混合物组件的参数以及距离度量标准的参数上,使用平均场变化贝叶斯算法进行后推断,并具有基于随机梯度的优化过程。在与数据大小相比,输入 - 输出关系很复杂,预测分布可能偏向或多模式的情况下,输入相对较高的尺寸,该方法尤其有利。对五个数据集进行的计算研究,其中两个是合成生成的,这说明了我们的高维输入的专家混合物方法的明显优势,在验证指标和视觉检查方面都优于竞争者模型。
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Leveraging well-established MCMC strategies, we propose MCMC-interactive variational inference (MIVI) to not only estimate the posterior in a time constrained manner, but also facilitate the design of MCMC transitions. Constructing a variational distribution followed by a short Markov chain that has parameters to learn, MIVI takes advantage of the complementary properties of variational inference and MCMC to encourage mutual improvement. On one hand, with the variational distribution locating high posterior density regions, the Markov chain is optimized within the variational inference framework to efficiently target the posterior despite a small number of transitions. On the other hand, the optimized Markov chain with considerable flexibility guides the variational distribution towards the posterior and alleviates its underestimation of uncertainty. Furthermore, we prove the optimized Markov chain in MIVI admits extrapolation, which means its marginal distribution gets closer to the true posterior as the chain grows. Therefore, the Markov chain can be used separately as an efficient MCMC scheme. Experiments show that MIVI not only accurately and efficiently approximates the posteriors but also facilitates designs of stochastic gradient MCMC and Gibbs sampling transitions.
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One of the core problems of modern statistics is to approximate difficult-to-compute probability densities. This problem is especially important in Bayesian statistics, which frames all inference about unknown quantities as a calculation involving the posterior density. In this paper, we review variational inference (VI), a method from machine learning that approximates probability densities through optimization. VI has been used in many applications and tends to be faster than classical methods, such as Markov chain Monte Carlo sampling. The idea behind VI is to first posit a family of densities and then to find the member of that family which is close to the target. Closeness is measured by Kullback-Leibler divergence. We review the ideas behind mean-field variational inference, discuss the special case of VI applied to exponential family models, present a full example with a Bayesian mixture of Gaussians, and derive a variant that uses stochastic optimization to scale up to massive data. We discuss modern research in VI and highlight important open problems. VI is powerful, but it is not yet well understood. Our hope in writing this paper is to catalyze statistical research on this class of algorithms.
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