我们考虑将贝叶斯网络表征到无条件等效的问题,即,当定向无环形图(DAGS)具有相同的无条件$ d $分离式语句。每个无条件的等效类(UEC)均以一个无方向的图形为唯一表示,其集团结构编码了类的成员。通过这种结构,我们提供了无条件对等的变革性表征。也就是说,我们证明当一个DAG在同一UEC中,并且仅当一个可以通过有限的指定移动序列转换为另一个DAG。我们还将此特征扩展到代表UEC中Markov等效类(MEC)的基本图。UEC分配了MEC的空间,并且可以从边际独立性测试中估算。因此,无条件等价的表征在涉及搜索贝叶斯网络空间的方法中应用。
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在观察性研究中,经常遇到有关存在或缺乏因果边缘和路径的因果背景知识。由于背景知识而导致的马尔可夫等效dag的子类共享的指向边缘和链接可以由因果关系最大部分定向的无循环图(MPDAG)表示。在本文中,我们首先提供了因果MPDAG的声音和完整的图形表征,并提供了因果MPDAG的最小表示。然后,我们介绍了一种名为Direct Causal子句(DCC)的新颖表示,以统一形式表示所有类型的因果背景知识。使用DCC,我们研究因果背景知识的一致性和等效性,并表明任何因果背景知识集都可以等效地分解为因果MPDAG,以及最小的残留DCC。还提供了多项式时间算法,以检查一致性,等效性并找到分解的MPDAG和残留DCC。最后,有了因果背景知识,我们证明了一个足够且必要的条件来识别因果关系,并且出人意料地发现因果效应的可识别性仅取决于分解的MPDAG。我们还开发了局部IDA型算法,以估计无法识别效应的可能值。模拟表明因果背景知识可以显着提高因果影响的识别性。
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在原因指导的非循环图(DAG)的结构学习问题中出现的良好研究挑战是,使用观测数据,一个人只能将图形到“马尔可夫等价类”(MEC)。剩余的无向边缘必须使用干预率定向,这可以在应用中执行昂贵。因此,最小化了全面定向MEC所需的干预次数的问题已经得到了很多最近的关注,并且也是这项工作的重点。我们证明了两个主要结果。第一个是一种新的通用下限,在任何算法(无论是主动或被动)需要执行的原子干预次数,以便定向给定的MEC。我们的第二个结果表明,这一界限实际上是可以定位MEC的最小原子干预措施的两个大小的因素。我们的下限比以前已知的下限更好。我们的下限证明是基于CBSP订购的新概念,这是没有V-Surructure的DAG的拓扑排序,并满足某些特殊属性。此外,在综合图上使用模拟,并通过赋予特殊图家庭的示例,我们表明我们的界限往往明显更好。
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Wien \ \'inst,Bannach和li \'Skiewicz(AAAI 2021)最近给出了一种用于计算马尔可夫等效类中定向无环形数量数量的多项式精确算法。在本文中,我们考虑了更一般的问题当某些边缘的方向也固定时,计算马尔可夫等效类中有向无环的数量的数量(例如,在部分可用的介入数据时会出现此设置)。从理论上讲,复杂性。相比之下,我们证明了问题在有趣的一类实例中仍然可以解决,它是通过确定``固定参数tractable''。特别是,我们的计数算法在时间范围内运行。多项式在图的大小中,其中多项式的程度\ emph {not}取决于提供的附加边数作为输入的数量。
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In this paper we prove the so-called "Meek Conjecture". In particular, we show that if a DAG H is an independence map of another DAG G, then there exists a finite sequence of edge additions and covered edge reversals in G such that (1) after each edge modification H remains an independence map of G and ( 2) after all modifications G = H. As shown by Meek (1997), this result has an important consequence for Bayesian approaches to learning Bayesian networks from data: in the limit of large sample size, there exists a twophase greedy search algorithm that-when applied to a particular sparsely-connected search space-provably identifies a perfect map of the generative distribution if that perfect map is a DAG. We provide a new implementation of the search space, using equivalence classes as states, for which all operators used in the greedy search can be scored efficiently using local functions of the nodes in the domain. Finally, using both synthetic and real-world datasets, we demonstrate that the two-phase greedy approach leads to good solutions when learning with finite sample sizes.
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我们研究了与从介入数据中恢复因果图有关的两个问题:(i)$ \ textIt {verification} $,其中的任务是检查声称的因果图是否正确,并且(ii)$ \ textit {search} $,任务是恢复正确的因果图。对于这两者,我们都希望最大程度地减少执行的干预措施的数量。对于第一个问题,我们给出了一组最小尺寸的原子干预措施的表征,这些干预措施是必要且足以检查所要求的因果图的正确性。我们的表征使用$ \ textit {coving edges} $的概念,这使我们能够获得简单的证据,并且很容易理解早期结果。我们还将结果推广到有限尺寸干预措施和节点依赖性干预成本的设置。对于上述所有设置,我们提供了第一种已知的可验证算法,用于有效地计算(接近)一般图上的最佳验证集。对于第二个问题,我们给出了一种基于图形分离器的简单自适应算法,该算法会产生一个原子干预集,该集合在使用$ \ MATHCAL {O}(\ log n)$ times $ times所需的$所需干预措施时,该算法完全围绕任何必需图表。 \ textIt {verify} $(验证大小)$ n $顶点上的基础dag。相对于验证大小而言,此近似值是紧密的,因为$ \ textit {any} $搜索算法的最差情况是$ \ omega(\ log n)$的最差情况。使用有限的大小干预措施,每个大小$ \ leq k $,我们的算法给出了$ \ mathcal {o}(\ log n \ cdot \ log \ log \ log k)$ factor actialation。我们的结果是第一种已知的算法,该算法对一般未加权图和有界尺寸干预的验证尺寸提供了非平凡的近似保证。
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我们考虑代表代理模型的问题,该模型使用我们称之为CSTREES的阶段树模型的适当子类对离散数据编码离散数据的原因模型。我们表明,可以通过集合表达CSTREE编码的上下文专用信息。由于并非所有阶段树模型都承认此属性,CSTREES是一个子类,可提供特定于上下文的因果信息的透明,直观和紧凑的表示。我们证明了CSTREEES承认全球性马尔可夫属性,它产生了模型等价的图形标准,概括了Verma和珍珠的DAG模型。这些结果延伸到一般介入模型设置,使CSTREES第一族的上下文专用模型允许介入模型等价的特征。我们还为CSTREE的最大似然估计器提供了一种封闭式公式,并使用它来表示贝叶斯信息标准是该模型类的本地一致的分数函数。在模拟和实际数据上分析了CSTHEELE的性能,在那里我们看到与CSTREELE而不是一般上演树的建模不会导致预测精度的显着损失,同时提供了特定于上下文的因果信息的DAG表示。
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常用图是表示和可视化因果关系的。对于少量变量,这种方法提供了简洁和清晰的方案的视图。随着下属的变量数量增加,图形方法可能变得不切实际,并且表示的清晰度丢失。变量的聚类是减少因果图大小的自然方式,但如果任意实施,可能会错误地改变因果关系的基本属性。我们定义了一种特定类型的群集,称为Transit Cluster,保证在某些条件下保留因果效应的可识别性属性。我们提供了一种用于在给定图中查找所有传输群集的声音和完整的算法,并演示集群如何简化因果效应的识别。我们还研究了逆问题,其中一个人以群集的图形开始,寻找扩展图,其中因果效应的可识别性属性保持不变。我们表明这种结构稳健性与过境集群密切相关。
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Variational autoencoders and Helmholtz machines use a recognition network (encoder) to approximate the posterior distribution of a generative model (decoder). In this paper we study the necessary and sufficient properties of a recognition network so that it can model the true posterior distribution exactly. These results are derived in the general context of probabilistic graphical modelling / Bayesian networks, for which the network represents a set of conditional independence statements. We derive both global conditions, in terms of d-separation, and local conditions for the recognition network to have the desired qualities. It turns out that for the local conditions the property perfectness (for every node, all parents are joined) plays an important role.
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In this review, we discuss approaches for learning causal structure from data, also called causal discovery. In particular, we focus on approaches for learning directed acyclic graphs (DAGs) and various generalizations which allow for some variables to be unobserved in the available data. We devote special attention to two fundamental combinatorial aspects of causal structure learning. First, we discuss the structure of the search space over causal graphs. Second, we discuss the structure of equivalence classes over causal graphs, i.e., sets of graphs which represent what can be learned from observational data alone, and how these equivalence classes can be refined by adding interventional data.
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概括指向的最大祖先图形,我们介绍了一类图形模型,用于表示与未观察的变量的多变量时间序列的多变量时间序列的多变量的多种定样和定期分配时间步骤中的时间滞后特定因果关系和独立性。我们完全阐述了这些图表,并表明他们需要超出以前在文献中被考虑的那些的限制。这允许在没有强加的额外假设的情况下更强的因果推断。在指向部分祖先图的概括中,我们进一步介绍了新颖类型的图表的马尔可夫等同类的图形表示,并显示这些比当前最先进的因果发现算法学习的更具信息量。我们还通过增加观察时间步骤的数量来分析所获得的附加信息。
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We study experiment design for unique identification of the causal graph of a system where the graph may contain cycles. The presence of cycles in the structure introduces major challenges for experiment design as, unlike acyclic graphs, learning the skeleton of causal graphs with cycles may not be possible from merely the observational distribution. Furthermore, intervening on a variable in such graphs does not necessarily lead to orienting all the edges incident to it. In this paper, we propose an experiment design approach that can learn both cyclic and acyclic graphs and hence, unifies the task of experiment design for both types of graphs. We provide a lower bound on the number of experiments required to guarantee the unique identification of the causal graph in the worst case, showing that the proposed approach is order-optimal in terms of the number of experiments up to an additive logarithmic term. Moreover, we extend our result to the setting where the size of each experiment is bounded by a constant. For this case, we show that our approach is optimal in terms of the size of the largest experiment required for uniquely identifying the causal graph in the worst case.
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人们对利用置换推理来搜索定向的无环因果模型的方法越来越兴趣,包括Teysier和Kohler和Solus,Wang和Uhler的GSP的“订购搜索”。我们通过基于置换的操作Tuck扩展了后者的方法,并开发了一类算法,即掌握,这些算法在越来越弱的假设下比忠诚度更有效且方向保持一致。最放松的掌握形式优于模拟中许多最新的因果搜索算法,即使对于具有超过100个变量的密集图和图形,也可以有效,准确地搜索。
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我们研究在有关系统的结构侧信息时学习一组变量的贝叶斯网络(BN)的问题。众所周知,学习一般BN的结构在计算上和统计上具有挑战性。然而,通常在许多应用中,关于底层结构的侧面信息可能会降低学习复杂性。在本文中,我们开发了一种基于递归约束的算法,其有效地将这些知识(即侧信息)纳入学习过程。特别地,我们研究了关于底层BN的两种类型的结构侧信息:(i)其集团数的上限是已知的,或者(ii)它是无菱形的。我们为学习算法提供理论保证,包括每个场景所需的最坏情况的测试数量。由于我们的工作,我们表明可以通过多项式复杂性学习有界树木宽度BNS。此外,我们评估了综合性和现实世界结构的算法的性能和可扩展性,并表明它们优于最先进的结构学习算法。
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也称为(非参数)结构方程模型(SEMS)的结构因果模型(SCM)被广泛用于因果建模目的。特别是,也称为递归SEM的无循环SCMS,形成了一个研究的SCM的良好的子类,概括了因果贝叶斯网络来允许潜在混淆。在本文中,我们调查了更多普通环境中的SCM,允许存在潜在混杂器和周期。我们展示在存在周期中,无循环SCM的许多方便的性质通常不会持有:它们并不总是有解决方案;它们并不总是诱导独特的观察,介入和反事实分布;边缘化并不总是存在,如果存在边缘模型并不总是尊重潜在的投影;他们并不总是满足马尔可夫财产;他们的图表并不总是与他们的因果语义一致。我们证明,对于SCM一般,这些属性中的每一个都在某些可加工条件下保持。我们的工作概括了SCM的结果,迄今为止仅针对某些特殊情况所知的周期。我们介绍了将循环循环设置扩展到循环设置的简单SCM的类,同时保留了许多方便的无环SCM的性能。用本文,我们的目标是为SCM提供统计因果建模的一般理论的基础。
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在图形因果发现的背景下,我们适应了线性非高斯无环模型(Lingams)的多功能框架,以提出新算法以有效地学习polytrees的图形。我们的方法结合了Chow- Liu算法,该算法首先学习了无向树结构,并与新的方案定向边缘。方向方案评估数据生成分布的矩之间的代数关系,并且计算便宜。我们为我们的方法建立了高维的一致性结果,并比较了数值实验中的不同算法版本。
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我们分析了在没有特定分布假设的常规设置中从观察数据的学习中学循环图形模型的复杂性。我们的方法是信息定理,并使用本地马尔可夫边界搜索程序,以便在基础图形模型中递归地构建祖先集。也许令人惊讶的是,我们表明,对于某些图形集合,一个简单的前向贪婪搜索算法(即没有向后修剪阶段)足以学习每个节点的马尔可夫边界。这显着提高了我们在节点的数量中显示的样本复杂性。然后应用这一点以在从文献中概括存在现有条件的新型标识性条件下学习整个图。作为独立利益的问题,我们建立了有限样本的保障,以解决从数据中恢复马尔可夫边界的问题。此外,我们将我们的结果应用于特殊情况的Polytrees,其中假设简化,并提供了多项识别的明确条件,并且在多项式时间中可以识别和可知。我们进一步说明了算法在仿真研究中易于实现的算法的性能。我们的方法是普遍的,用于无需分布假设的离散或连续分布,并且由于这种棚灯对有效地学习来自数据的定向图形模型结构所需的最小假设。
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我们研究了因果结构学习的问题,没有关于功能关系和噪声的假设。我们开发DAG-Foci,这是一种基于\ Cite {Azadkia2019Simple}的焦点变量选择算法的计算快速算法。DAG-Foci不需要调整参数并输出父母和Markov边界的响应变量的响应变量。当底层图形是多料时,我们提供了我们程序的高维保证。此外,我们展示了DAG-Foci在计算生物学\ Cite {Sachs2005Causal}的真实数据上的适用性,并说明了我们对侵犯假设的方法的稳健性。
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公平的机器学习旨在避免基于\ textit {敏感属性}(例如性别和种族)对个人或子人群的治疗。公平机器学习中的那些方法是基于因果推理确定的歧视和偏见的。尽管基于因果关系的公平学习吸引了越来越多的关注,但当前的方法假设真正的因果图是完全已知的。本文提出了一种一般方法,以实现反事实公平的概念时,当真实的因果图未知。为了能够选择导致反事实公平性的功能,我们得出了条件和算法,以识别\ textit上变量之间的祖先关系{部分定向的无循环图(pdag)},具体来说,可以从一类可学到的dag中学到。观察数据与域知识相结合。有趣的是,我们发现可以实现反事实公平,就好像真正的因果图是完全知道的一样,当提供了特定的背景知识时:敏感属性在因果图中没有祖先。模拟和实际数据集的结果证明了我们方法的有效性。
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We consider the problem of recovering the causal structure underlying observations from different experimental conditions when the targets of the interventions in each experiment are unknown. We assume a linear structural causal model with additive Gaussian noise and consider interventions that perturb their targets while maintaining the causal relationships in the system. Different models may entail the same distributions, offering competing causal explanations for the given observations. We fully characterize this equivalence class and offer identifiability results, which we use to derive a greedy algorithm called GnIES to recover the equivalence class of the data-generating model without knowledge of the intervention targets. In addition, we develop a novel procedure to generate semi-synthetic data sets with known causal ground truth but distributions closely resembling those of a real data set of choice. We leverage this procedure and evaluate the performance of GnIES on synthetic, real, and semi-synthetic data sets. Despite the strong Gaussian distributional assumption, GnIES is robust to an array of model violations and competitive in recovering the causal structure in small- to large-sample settings. We provide, in the Python packages "gnies" and "sempler", implementations of GnIES and our semi-synthetic data generation procedure.
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