深度学习网络在快速磁共振成像(MRI)重建中显示出令人鼓舞的结果。在我们的工作中,我们开发了深层网络,以进一步提高重建的定量和感知质量。首先,我们提出了Reconsynergynet(RSN),该网络结合了在图像和傅立叶域上独立运行的互补益处。对于单线采集,我们引入了深层级联RSN(DC-RSN),这是一个与数据保真度(DF)单位交织在一起的RSN块的级联。其次,我们通过协助T1加权成像(T1WI)的帮助,这是T2加权成像(T2WI)的DC-RSN的结构恢复,这是一个短时间采集时间的序列。通过日志功能(高尔夫)融合的梯度为DC-RSN提供T1援助。此外,我们建议感知改进网络(PRN)来完善重建以获得更好的视觉信息保真度(VIF),这是一种与放射科医生对图像质量高度相关的指标。最后,对于多线圈采集,我们提出了可变拆分RSN(VS-RSN),深层块,每个块,包含RSN,多圈DF单元和加权平均模块。我们广泛验证了单线和多线圈采集的模型DC-RSN和VS-RSN,并报告最先进的性能。我们在FastMRI中获得了0.768、0.923、0.878的SSIM,单线圈-4X,多螺旋-4X和多型圈-8X的SSIM为0.878。我们还进行了实验,以证明基于高尔夫的T1援助和PRN的功效。
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基于卷积神经网络的MR重建方法已经显示出提供快速和高质量的重建。具有基于CNN的模型的主要缺点是它缺乏灵活性,并且可以仅针对特定采集上下文限制实际适用性有效运行。通过获取上下文,我们的意思是三个输入设置的特定组合,即所认为的三种输入,在研究中的解剖学,欠采样掩模图案和欠采样的加速度。该模型可以在组合多个上下文的图像上共同培训。然而,该模型不符合上下文特定模型的性能,也不符合在火车时间内看不见的上下文。这需要在生成上下文特定权重时修改现有体系结构,以便将灵活性合并到多个上下文。我们提出了一个多次采集的上下文基础网络,称为MAC-Recordnet,用于MRI重建,灵活地到多个获取上下文,并更广泛地概括为在实际方案中适用性的未操作性上下文。所提出的网络具有MRI重建模块和动态重量预测(DWP)模块。 DWP模块将相应的获取上下文信息作为输入,并学习重建模块的上下文专用权重,在运行时使用上下文动态变化。我们表明,所提出的方法可以根据心脏和大脑数据集,高斯和笛卡尔欠采样模式和五个加速因子处理多个上下文。所提出的网络优于Naive联合训练的模型,并通过定量和定性地具有与上下文专用模型具有竞争力的结果。我们还通过在火车时间看不见的背景下测试了我们模型的普遍性。
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目的:并行成像通过用一系列接收器线圈获取其他灵敏度信息,从而加速了磁共振成像(MRI)数据,从而降低了相位编码步骤。压缩传感磁共振成像(CS-MRI)在医学成像领域中获得了普及,因为其数据要求较少,而不是平行成像。并行成像和压缩传感(CS)均通过最大程度地减少K空间中捕获的数据量来加快传统MRI获取。由于采集时间与样品的数量成反比,因此从缩短的K空间样品中的图像的反向形成会导致收购更快,但具有混乱的伪像。本文提出了一种新型的生成对抗网络(GAN),即雷德格尔(Recgan-gr)受到多模式损失的监督,以消除重建的图像。方法:与现有的GAN网络相反,我们提出的方法引入了一种新型的发电机网络,即与双域损耗函数集成的弹药网络,包括加权幅度和相位损耗函数以及基于平行成像的损失,即Grappa一致性损失。提出了K空间校正块,以使GAN网络自动化生成不必要的数据,从而使重建过程的收敛性更快。结果:全面的结果表明,拟议的Recgan-GR在基于GAN的方法中的PSNR有4 dB的改善,并且在文献中可用的传统最先进的CNN方法中有2 dB的改进。结论和意义:拟议的工作有助于显着改善低保留数据的图像质量,从而更快地获取了5倍或10倍。
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磁共振成像可以产生人体解剖和生理学的详细图像,可以帮助医生诊断和治疗肿瘤等病理。然而,MRI遭受了非常长的收购时间,使其易于患者运动伪影并限制其潜力以提供动态治疗。诸如并行成像和压缩感测的常规方法允许通过使用多个接收器线圈获取更少的MRI数据来改变MR图像来增加MRI采集速度。深度学习的最新进步与平行成像和压缩传感技术相结合,具有从高度加速的MRI数据产生高保真重建。在这项工作中,我们通过利用卷积复发网络的特性和展开算法来解决复发变分网络(RevurrentVarnet)的加速改变网络(RevurrentVarnet)的任务,提出了一种基于深入的深度学习的反问题解决者。 RevurrentVarnet由多个块组成,每个块都负责梯度下降优化算法的一个展开迭代,以解决逆问题。与传统方法相反,优化步骤在观察域($ k $ -space)而不是图像域中进行。每次反复出的Varnet块都会通过观察到的$ k $ -space,并由数据一致性术语和复制单元组成,它将作为输入的隐藏状态和前一个块的预测。我们所提出的方法实现了新的最新状态,定性和定量重建导致来自公共多通道脑数据集的5倍和10倍加速数据,优于以前的传统和基于深度学习的方法。我们将在公共存储库上释放所有型号代码和基线。
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减少磁共振(MR)图像采集时间可能会使MR检查更容易获得。包括深度学习模型在内的先前艺术已致力于解决长期MRI成像时间的问题。最近,深层生成模型在算法鲁棒性和使用灵活性方面具有巨大的潜力。然而,无法直接学习或使用任何现有方案。此外,还值得研究的是,深层生成模型如何在混合域上很好地工作。在这项工作中,通过利用基于深度能量的模型,我们提出了一个K空间和图像域协作生成模型,以全面估算从采样量未采样的测量中的MR数据。与最先进的实验比较表明,所提出的混合方法的重建精度较小,在不同的加速因子下更稳定。
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由于组织和骨骼之间的相似性,在人解剖结构中广泛看到了全球相关性。由于近距离质子密度和T1/T2参数,这些相关性反映在磁共振成像(MRI)扫描中。此外,为了实现加速的MRI,k空间数据的采样不足,从而导致全球混叠伪像。卷积神经网络(CNN)模型被广泛用于加速MRI重建,但是由于卷积操作的固有位置,这些模型在捕获全球相关性方面受到限制。基于自发的变压器模型能够捕获图像特征之间的全局相关性,但是,变压器模型对MRI重建的当前贡献是微小的。现有的贡献主要提供CNN转换器混合解决方案,并且很少利用MRI的物理学。在本文中,我们提出了一种基于物理的独立(无卷积)变压器模型,标题为“多头级联SWIN变压器(MCSTRA),用于加速MRI重建。 MCSTRA将几种相互关联的MRI物理相关概念与变压器网络相结合:它通过移动的窗口自我发场机制利用了全局MR特征;它使用多头设置分别提取属于不同光谱组件的MR特征;它通过级联的网络在中间脱氧和K空间校正之间进行迭代,该网络具有K空间和中间损耗计算中的数据一致性;此外,我们提出了一种新型的位置嵌入生成机制,以使用对应于底面采样掩码的点扩散函数来指导自我发作。我们的模型在视觉上和定量上都大大优于最先进的MRI重建方法,同时描述了改善的分辨率和去除词法。
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磁共振(MR)图像重建来自高度缺点$ K $ -space数据在加速MR成像(MRI)技术中至关重要。近年来,基于深度学习的方法在这项任务中表现出很大的潜力。本文提出了一种学习的MR图像重建半二次分割算法,并在展开的深度学习网络架构中实现算法。我们比较我们提出的方法对针对DC-CNN和LPDNET的公共心先生数据集的性能,我们的方法在定量结果和定性结果中表现出其他方法,具有更少的模型参数和更快的重建速度。最后,我们扩大了我们的模型,实现了卓越的重建质量,并且改善为1.76美元$ 276 $ 274美元的LPDNET以5美元\倍率为5美元的峰值信噪比。我们的方法的代码在https://github.com/hellopipu/hqs-net上公开使用。
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基于深度学习的脑磁共振成像(MRI)重建方法有可能加速MRI采集过程。尽管如此,科学界缺乏适当的基准,以评估高分辨率大脑图像的MRI重建质量,并评估这些所提出的算法在存在小而且预期的数据分布班次存在下的表现。多线圈磁共振图像(MC-MRI)重建挑战提供了一种基准,其目的在于使用高分辨率,三维,T1加权MRI扫描的大型数据集。挑战有两个主要目标:1)比较该数据集和2)上的不同的MRI重建模型,并评估这些模型的概括性,以通过不同数量的接收器线圈获取的数据。在本文中,我们描述了挑战实验设计,并总结了一系列基线和艺术脑MRI重建模型的结果。我们提供有关目前MRI重建最先进的相关比较信息,并突出挑战在更广泛的临床采用之前获得所需的普遍模型。 MC-MRI基准数据,评估代码和当前挑战排行榜可公开可用。它们为脑MRI重建领域的未来发展提供了客观性能评估。
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压缩传感(CS)一直在加速磁共振成像(MRI)采集过程中的关键作用。随着人工智能的复苏,深神经网络和CS算法正在集成以重新定义快速MRI的领域。过去几年目睹了基于深度学习的CS技术的复杂性,多样性和表现的大量增长,这些技术致力于快速MRI。在该荟萃分析中,我们系统地审查了快速MRI的深度学习的CS技术,描述了关键模型设计,突出突破,并讨论了有希望的方向。我们还介绍了一个综合分析框架和分类系统,以评估深度学习在基于CS的加速度的MRI的关键作用。
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可解释性和鲁棒性必须在临床应用中整合加速磁共振成像(MRI)重建的机器学习方法。这样做会允许快速高质量的解剖和病理学成像。数据一致性(DC)对于多模态数据的泛化至关重要,以及检测病理学的鲁棒性。这项工作提出了独立复发推理机(CIRIM)的级联,通过展开优化来评估DC,通过梯度下降,并通过设计的术语明确地明确。我们对CIRIM与其他展开的优化方法进行广泛的比较,是端到端变分网络(E2EVN)和轮辋,以及UNET和压缩感测(CS)。评估是分两个阶段完成的。首先,评估关于多次训练的MRI模型的学习,即用{t_1} $ - 加权和平凡对比,以及$ {t_2} $ - 加权膝盖数据。其次,在通过3D Flair MRI数据中重建依赖多发性硬化(MS)患者的3D Flair MRI数据来测试鲁棒性。结果表明,CIRIM在隐式强制执行DC时表现最佳,而E2EVN需要明确制定的DC。 CIRIM在重建临床MS数据时显示出最高病变对比度分辨率。与CS相比,性能提高了大约11%,而重建时间是二十次减少。
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多对比度MRI(MC-MRI)捕获了多种互补成像方式,以帮助放射决策。鉴于需要降低多次收购的时间成本,当前的深度加速MRI重建网络集中于利用多个对比度之间的冗余。但是,现有的作品在很大程度上受到了配对数据和/或过度昂贵的完全采样的MRI序列的监督。此外,重建网络通常依赖于卷积体系结构,这些卷积体系结构在建模远程相互作用的能力上受到限制,并可能导致良好的解剖学细节的次优恢复。对于这些目的,我们提出了一个双域自我监督的变压器(DSFORMER),用于加速MC-MRI重建。 DSFormer开发了一个深层条件级联变压器(DCCT),该变压器由几个级联的Swin Transformer重建网络(SWINRN)组成,该网络(SWINRN)在两种深层调理策略下训练,以实现MC-MRI信息共享。我们进一步提出了DCCT的双域(图像和K空间)自我监督的学习策略,以减轻获取完全采样的培训数据的成本。 DSFormer会生成高保真重建,从而超过电流完全监督的基线。此外,我们发现,通过全面监督或我们提出的双域自学训练,DSFORMER可以实现几乎相同的性能。
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在临床医学中,磁共振成像(MRI)是诊断,分类,预后和治疗计划中最重要的工具之一。然而,MRI遭受了固有的慢数据采集过程,因为数据在k空间中顺序收集。近年来,大多数MRI重建方法在文献中侧重于整体图像重建而不是增强边缘信息。这项工作通过详细说明了对边缘信息的提高来阐述了这一趋势。具体地,我们通过结合多视图信息介绍一种用于快速多通道MRI重建的新型并行成像耦合双鉴别器生成的对抗网络(PIDD-GaN)。双判别设计旨在改善MRI重建中的边缘信息。一个鉴别器用于整体图像重建,而另一个鉴别器是负责增强边缘信息的负责。为发电机提出了一种具有本地和全局剩余学习的改进的U-Net。频率通道注意块(FCA块)嵌入在发电机中以结合注意力机制。引入内容损耗以培训发电机以获得更好的重建质量。我们对Calgary-Campinas公共大脑MR DataSet进行了全面的实验,并将我们的方法与最先进的MRI重建方法进行了比较。在MICCAI13数据集上进行了对剩余学习的消融研究,以验证所提出的模块。结果表明,我们的PIDD-GaN提供高质量的重建MR图像,具有良好的边缘信息。单图像重建的时间低于5ms,符合加快处理的需求。
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目的:通过密集连接的深度学习重建框架来改善加速的MRI重建。材料和方法:通过应用三个架构修改来修改级联的深度学习重建框架(基线模型):级联输入和输出之间的输入级级密集连接,改进的深度学习子网络和随后的SKIP连接之间的改进深度学习网络。进行了一项消融研究,其中在NYU FastMRI Neuro数据集上训练了五个模型配置,并在四倍和八倍的加速度上结合了端到端方案。通过比较其各自的结构相似性指数度量(SSIM),归一化平方误差(NMSE)和峰信号与噪声比(PSNR)来评估训练的模型。结果:提出的密集互连的残留级联网络(DIRCN)利用了所有三种建议的修改,分别为四倍和八倍加速度获得了8%和11%的SSIM提高。对于八倍的加速度,与基线模型相比,该模型的NMSE降低了23%。在一项消融研究中,单个体系结构的修饰都通过分别减少SSIM和NMSE的四倍加速度减少了SSIM和NMSE,这都促进了这一改进。结论:所提出的架构修改允许对已经存在的级联框架进行简单调整,以进一步改善所得的重建。
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近年来,基于深度学习的平行成像(PI)取得了巨大进展,以加速磁共振成像(MRI)。然而,现有方法的性能和鲁棒性仍然可以是不受欢迎的。在这项工作中,我们建议通过柔性PI重建,创建的重量K-Space Genera-Tive模型(WKGM)来探索K空间域学习。具体而言,WKGM是一种通用的K空间域模型,在其中有效地纳入了K空间加权技术和高维空间增强设计,用于基于得分的Genererative模型训练,从而实现良好和强大的重建。此外,WKGM具有灵活性,因此可以与各种传统的K空间PI模型协同结合,从而产生基于学习的先验以产生高保真重建。在具有不同采样模式和交流电因子的数据集上进行实验性重新构建表明,WKGM可以通过先验良好的K-Space生成剂获得最新的重建结果。
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最近关于其他方式的核化图像T1辅助MRI重建的研究表明,进一步加速MRI收购其他方式的潜力。大多数最先进的方法通过开发用于固定的欠采样模式的网络架构来实现改进,而不完全利用方式之间的互补信息。尽管可以简单地修改现有的下采样模式学习算法以允许完全采样的T1加权MR图像来辅助模式学习,但是可以实现重建任务的显着改进。为此,我们提出了一个迭代框架,优化了MRI获取的另一种方式的采样下采样模式,可以在不同的下抽样因子中补充完全采样的T1加权MR图像,同时共同优化T1辅助MRI重建模型。具体地,我们所提出的方法利用两种模式之间的潜在信息的差异来确定可以最大化T1加权MR图像的辅助功率在改善MRI重建时最大化的采样模式。与常用的下采样模式和最先进的方法相比,我们在公共数据集中展示了我们在公共数据集上的学习的下采样模式的卓越表现,可以联合优化重建网络和欠采样模式以8倍的取样因子。
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物理驱动的深度学习方法已成为计算磁共振成像(MRI)问题的强大工具,将重建性能推向新限制。本文概述了将物理信息纳入基于学习的MRI重建中的最新发展。我们考虑了用于计算MRI的线性和非线性正向模型的逆问题,并回顾了解决这些方法的经典方法。然后,我们专注于物理驱动的深度学习方法,涵盖了物理驱动的损失功能,插件方法,生成模型和展开的网络。我们重点介绍了特定于领域的挑战,例如神经网络的实现和复杂值的构建基块,以及具有线性和非线性正向模型的MRI转换应用。最后,我们讨论常见问题和开放挑战,并与物理驱动的学习与医学成像管道中的其他下游任务相结合时,与物理驱动的学习的重要性联系在一起。
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深度学习方法已成为重建MR重建的最新采样的状态。特别是对于地面真理不可行或不可能的情况,要获取完全采样的数据,重建的自我监督的机器学习方法正在越来越多地使用。但是,在验证此类方法及其普遍性的验证中的潜在问题仍然没有得到充实的态度。在本文中,我们研究了自制算法验证未采样MR图像的重要方面:对前瞻性重建的定量评估,前瞻性和回顾性重建之间的潜在差异,常用的定量衡量标准的适用性和普遍性。研究了两种基于自我监督的denoising和先验的深层图像的自我监督算法。将这些方法与使用体内和幻影数据的最小二乘拟合以及压缩感测重建进行比较。它们的推广性通过前瞻性采样的数据与培训不同的数据进行了测试。我们表明,相对于回顾性重建/地面真理,前瞻性重建可能表现出严重的失真。此外,与感知度量相比,与像素定量指标的定量指标可能无法准确捕获感知质量的差异。此外,所有方法均显示出泛化的潜力。然而,与其他变化相比,概括性的影响更大。我们进一步表明,无参考图像指标与人类对图像质量的评级很好地对应,以研究概括性。最后,我们证明了经过调整的压缩感测重建和学习的DeNoising在所有数据上都相似地执行。
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在本文中,我们开发了一种高效的回顾性深度学习方法,称为堆叠U-网,具有自助前沿,解决MRI中刚性运动伪影的问题。拟议的工作利用损坏的图像本身使用额外的知识前瞻,而无需额外的对比度数据。所提出的网络通过共享来自相同失真对象的连续片的辅助信息来学习错过的结构细节。我们进一步设计了一种堆叠的U-网的细化,便于保持图像空间细节,从而提高了像素到像素依赖性。为了执行网络培训,MRI运动伪像的模拟是不可避免的。我们使用各种类型的图像前瞻呈现了一个密集的分析:来自同一主题的其他图像对比的提出的自助前锋和前锋。实验分析证明了自助前锋的有效性和可行性,因为它不需要任何进一步的数据扫描。
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深度学习在加速磁共振成像(MRI)中表现出惊人的性能。最先进的深度学习重建采用强大的卷积神经网络,并且由于许多磁共振图像或其对应的k空间是2D的许多磁共振图像或其对应的k空间。在这项工作中,我们展示了一种探讨了1D卷积的新方法,使得深度网络更容易受到培训和广义。我们进一步将1D卷积集成到所提出的深网络中,命名为一维深度低级和稀疏网络(ODL),它展开了低级和稀疏重建模型的迭代过程。在体内膝盖和脑数据集中的广泛结果表明,所提出的ODLS非常适合培训受试者的情况,并提供比视觉和定量的最先进的方法改进的重建性能。此外,ODL还向不同的欠采样场景显示出良好的稳健性以及培训和测试数据之间的一些不匹配。总之,我们的工作表明,在快速MRI中,1D深度学习方案是内存高效且强大的。
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The data consistency for the physical forward model is crucial in inverse problems, especially in MR imaging reconstruction. The standard way is to unroll an iterative algorithm into a neural network with a forward model embedded. The forward model always changes in clinical practice, so the learning component's entanglement with the forward model makes the reconstruction hard to generalize. The proposed method is more generalizable for different MR acquisition settings by separating the forward model from the deep learning component. The deep learning-based proximal gradient descent was proposed to create a learned regularization term independent of the forward model. We applied the one-time trained regularization term to different MR acquisition settings to validate the proposed method and compared the reconstruction with the commonly used $\ell_1$ regularization. We showed ~3 dB improvement in the peak signal to noise ratio, compared with conventional $\ell_1$ regularized reconstruction. We demonstrated the flexibility of the proposed method in choosing different undersampling patterns. We also evaluated the effect of parameter tuning for the deep learning regularization.
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