高斯工艺(GPS)模型是具有由内核功能控制的电感偏差的功能丰富的分布。通过使用边际似然作为目标优化内核超参数来实现学习。这种称为II类型最大似然(ML-II)的经典方法产生了高参数的点估计,并继续成为培训GPS的默认方法。然而,这种方法在低估预测不确定性并且易于在有许多近似数目时易于过度拟合。此外,基于梯度的优化使ML-II点估计高度易受局部最小值的存在。这项工作提出了一种替代的学习过程,其中核心函数的超参数使用嵌套采样(NS)被边缘化,这是一种非常适合于复杂的多模态分布来采样的技术。我们专注于具有频谱混合物(SM)粒子的回归任务,并发现定量模型不确定性的原则方法导致在一系列合成和基准数据集中的预测性能中的大量收益。在这种情况下,还发现嵌套的抽样在汉密尔顿蒙特卡罗(HMC)上提供了速度优势,广泛认为是基于MCMC推断的金标准。
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The kernel function and its hyperparameters are the central model selection choice in a Gaussian proces (Rasmussen and Williams, 2006). Typically, the hyperparameters of the kernel are chosen by maximising the marginal likelihood, an approach known as Type-II maximum likelihood (ML-II). However, ML-II does not account for hyperparameter uncertainty, and it is well-known that this can lead to severely biased estimates and an underestimation of predictive uncertainty. While there are several works which employ a fully Bayesian characterisation of GPs, relatively few propose such approaches for the sparse GPs paradigm. In this work we propose an algorithm for sparse Gaussian process regression which leverages MCMC to sample from the hyperparameter posterior within the variational inducing point framework of Titsias (2009). This work is closely related to Hensman et al. (2015b) but side-steps the need to sample the inducing points, thereby significantly improving sampling efficiency in the Gaussian likelihood case. We compare this scheme against natural baselines in literature along with stochastic variational GPs (SVGPs) along with an extensive computational analysis.
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内核选择在确定高斯过程(GP)模型中的性能方面发挥着核心作用,因为所选择的内核在之前的GP下确定了电感偏差和在GP下的功能的先前支持。这项工作解决了为高维GP回归模型构建自定义内核功能的挑战。从最近的深度学习进步中汲取灵感,我们介绍了一个名为Kitt的新方法:通过变压器识别内核识别。 KITT利用基于变压器的架构,以在0.1秒内生成内核建议,这比传统的内核搜索算法快几个数量级。我们使用从已知内核的词汇表中从前线生成的合成数据训练我们的模型。通过利用自我关注机制的性质,KITT能够处理具有任意尺寸的输入的数据集。我们证明,KITT选择的内核会在各种回归基准集合中产生强烈的表现。
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贝叶斯分析中的先验者通常编码信息域知识,这些知识可用于使推理过程更有效。但是,有时,先验可能是给定数据集的参数值的代表性的,这可能导致参数空间探索效率低下,甚至是错误的推论,尤其是对于嵌套采样(NS)算法。在这种情况下,仅仅在某些应用中扩大了先验可能是不合适的或不可能的。因此,我们以前对该问题的解决方案(称为后验电源(PR))在保持产品固定的同时重新定义了先前和可能性,以使后验推断和证据估计保持不变,但是NS过程的效率显着提高。 PR在其最实用的形式中提高了某些功率beta的提高,该beta是作为一个辅助变量引入的,必须根据具体情况确定,通常是通过根据某些预定的“退火时间表”降低beta的统一性来确定的。 '直到产生的推论会收敛到一致的解决方案。在这里,我们提出了一种非常简单但功能强大的替代贝叶斯方法,其中beta被视为从数据与问题的原始参数一起从数据推断出来的超参数,然后边缘化以获得最终推断。我们通过数值示例表明,这种贝叶斯PR(BPR)方法为使用NS的贝叶斯推断中未代表性的先验问题提供了一种非常健壮,自我适应和计算有效的“手持”解决方案。此外,与原始PR方法不同,我们表明,即使对于代表性的PRIORS,BPR也相对于标准嵌套采样而具有可忽略的计算间接费用,这表明它应在所有NS分析中用作默认值。
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We present the GPry algorithm for fast Bayesian inference of general (non-Gaussian) posteriors with a moderate number of parameters. GPry does not need any pre-training, special hardware such as GPUs, and is intended as a drop-in replacement for traditional Monte Carlo methods for Bayesian inference. Our algorithm is based on generating a Gaussian Process surrogate model of the log-posterior, aided by a Support Vector Machine classifier that excludes extreme or non-finite values. An active learning scheme allows us to reduce the number of required posterior evaluations by two orders of magnitude compared to traditional Monte Carlo inference. Our algorithm allows for parallel evaluations of the posterior at optimal locations, further reducing wall-clock times. We significantly improve performance using properties of the posterior in our active learning scheme and for the definition of the GP prior. In particular we account for the expected dynamical range of the posterior in different dimensionalities. We test our model against a number of synthetic and cosmological examples. GPry outperforms traditional Monte Carlo methods when the evaluation time of the likelihood (or the calculation of theoretical observables) is of the order of seconds; for evaluation times of over a minute it can perform inference in days that would take months using traditional methods. GPry is distributed as an open source Python package (pip install gpry) and can also be found at https://github.com/jonaselgammal/GPry.
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非线性动态系统的识别仍然是整个工程的重大挑战。这项工作提出了一种基于贝叶斯过滤的方法,以提取和确定系统中未知的非线性项的贡献,可以将其视为恢复力表面类型方法的替代观点。为了实现这种识别,最初将非线性恢复力的贡献作为高斯过程建模。该高斯过程将转换为状态空间模型,并与系统的线性动态组件结合使用。然后,通过推断过滤和平滑分布,可以提取系统的内部状态和非线性恢复力。在这些状态下,可以构建非线性模型。在模拟案例研究和实验基准数据集中,该方法被证明是有效的。
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引入了涉及高斯流程(GPS)的模型,以同时处理多个功能数据的多任务学习,聚类和预测。该过程充当了功能数据的基于模型的聚类方法,也是对新任务进行后续预测的学习步骤。该模型是将多任务GPS与常见平均过程的混合物实例化。得出了一种用于处理超参数的优化以及超构件对潜在变量和过程的估计的优化。我们建立了明确的公式,用于将平均过程和潜在聚类变量整合到预测分布中,这是两个方面的不确定性。该分布定义为集群特异性GP预测的混合物,在处理组结构数据时,可以增强性能。该模型处理观察的不规则网格,并提供了关于协方差结构的不同假设,用于在任务之间共享其他信息。聚类和预测任务上的性能将通过各种模拟方案和真实数据集进行评估。总体算法称为magmaclust,可公开作为R包。
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标准GPS为行为良好的流程提供了灵活的建模工具。然而,预计与高斯的偏差有望在现实世界数据集中出现,结构异常值和冲击通常会观察到。在这些情况下,GP可能无法充分建模不确定性,并且可能会过度推动。在这里,我们将GP框架扩展到一类新的时间变化的GP,从而可以直接建模重尾非高斯行为,同时通过非均匀GPS表示的无限混合物保留了可拖动的条件GP结构。有条件的GP结构是通过在潜在转化的输入空间上调节观测值来获得的,并使用L \'{e} Vy过程对潜在转化的随机演变进行建模,该过程允许贝叶斯在后端预测密度和潜在转化中的贝叶斯推断功能。我们为该模型提供了马尔可夫链蒙特卡洛推理程序,并证明了与标准GP相比的潜在好处。
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许多机器学习问题可以在估计功能的背景下构成,并且通常是时间依赖的功能,随着观察结果的到来,这些功能是实时估计的。高斯工艺(GPS)是建模实现非线性函数的吸引人选择,这是由于其灵活性和不确定性定量。但是,典型的GP回归模型有几个缺点:1)相对于观测值的常规GP推理量表$ O(n^{3})$; 2)顺序更新GP模型并非微不足道; 3)协方差内核通常在该函数上执行平稳性约束,而具有非平稳协方差内核的GP通常在实践中使用了很难使用。为了克服这些问题,我们提出了一种顺序的蒙特卡洛算法,以适合GP的无限混合物,这些混合物捕获非平稳行为,同时允许在线分布式推理。我们的方法从经验上改善了在时间序列数据中存在非平稳性的在线GP估计的最先进方法的性能。为了证明我们在应用设置中提出的在线高斯流程混合物方法的实用性,我们表明我们可以使用在线高斯工艺匪徒成功实现优化算法。
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贝叶斯后期和模型证据的计算通常需要数值整合。贝叶斯正交(BQ)是一种基于替代模型的数值整合方法,能够具有出色的样品效率,但其缺乏并行化阻碍了其实际应用。在这项工作中,我们提出了一种并行的(批次)BQ方法,该方法采用了核正素的技术,该技术具有证明是指数的收敛速率。另外,与嵌套采样一样,我们的方法允许同时推断后期和模型证据。重新选择了来自BQ替代模型的样品,通过内核重组算法获得一组稀疏的样品,需要可忽略的额外时间来增加批处理大小。从经验上讲,我们发现我们的方法显着优于在包括锂离子电池分析在内的各种现实世界数据集中,最先进的BQ技术和嵌套采样的采样效率。
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基于采样的推理技术是现代宇宙学数据分析的核心;然而,这些方法与维度不良,通常需要近似或顽固的可能性。在本文中,我们描述了截短的边际神经比率估计(TMNRE)(即所谓的基于模拟的推断的新方法)自然避免了这些问题,提高了$(i)$效率,$(ii)$可扩展性和$ (iii)推断后的后续后续的可信度。使用宇宙微波背景(CMB)的测量,我们表明TMNRE可以使用比传统马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)方法更少模拟器呼叫的数量级来实现融合的后海后。值得注意的是,所需数量的样本有效地独立于滋扰参数的数量。此外,称为\ MEMPH {本地摊销}的属性允许对基于采样的方法无法访问的严格统计一致性检查的性能。 TMNRE承诺成为宇宙学数据分析的强大工具,特别是在扩展宇宙学的背景下,其中传统的基于采样的推理方法所需的时间级数融合可以大大超过$ \ Lambda $ CDM等简单宇宙学模型的时间。为了执行这些计算,我们使用开源代码\ texttt {swyft}来使用TMNRE的实现。
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高斯流程是许多灵活的统计和机器学习模型的关键组成部分。但是,由于需要倒转和存储完整的协方差矩阵,它们表现出立方计算的复杂性和高内存约束。为了解决这个问题,已经考虑了高斯流程专家的混合物,其中数据点被分配给独立专家,从而通过允许基于较小的局部协方差矩阵来降低复杂性。此外,高斯流程专家的混合物大大富含模型的灵活性,从而允许诸如非平稳性,异方差和不连续性等行为。在这项工作中,我们基于嵌套的蒙特卡洛采样器构建了一种新颖的推理方法,以同时推断门控网络和高斯工艺专家参数。与重要性采样相比,这大大改善了推断,尤其是在固定高斯流程不合适的情况下,同时仍然完全平行。
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使用马尔可夫链蒙特卡洛(Monte Carlo)以贝叶斯方式将理论模型拟合到实验数据中,通常需要一个评估数千(或数百万)型的型号。当模型是慢速到计算的物理模拟时,贝叶斯模型拟合就变得不可行。为了解决这个问题,可以使用模拟输出的第二个统计模型,该模型可以用来代替模型拟合期间的完整仿真。选择的典型仿真器是高斯过程(GP),这是一种灵活的非线性模型,在每个输入点提供了预测均值和方差。高斯流程回归对少量培训数据($ n <10^3 $)非常有效,但是当数据集大小变大时,训练和用于预测的速度慢。可以使用各种方法来加快中高级数据集制度($ n> 10^5 $)的加快高斯流程,从而使人们的预测准确性大大降低了。这项工作研究了几种近似高斯过程模型的准确度折叠 - 稀疏的变异GP,随机变异GP和深内核学习的GP - 在模拟密度功能理论(DFT)模型的预测时。此外,我们使用模拟器以贝叶斯的方式校准DFT模型参数,使用观察到的数据,解决数据集大小所施加的计算屏障,并将校准结果与先前的工作进行比较。这些校准的DFT模型的实用性是根据观察到的数据对实验意义的核素的性质进行预测,例如超重核。
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高斯流程已成为各种安全至关重要环境的有前途的工具,因为后方差可用于直接估计模型误差并量化风险。但是,针对安全 - 关键环境的最新技术取决于核超参数是已知的,这通常不适用。为了减轻这种情况,我们在具有未知的超参数的设置中引入了强大的高斯过程统一误差界。我们的方法计算超参数空间中的一个置信区域,这使我们能够获得具有任意超参数的高斯过程模型误差的概率上限。我们不需要对超参数的任何界限,这是相关工作中常见的假设。相反,我们能够以直观的方式从数据中得出界限。我们还采用了建议的技术来为一类基于学习的控制问题提供绩效保证。实验表明,界限的性能明显优于香草和完全贝叶斯高斯工艺。
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随机微分方程的系统定义了一系列随机波动率模型。尽管这些模型在金融和统计气候学等领域中取得了广泛的成功,但它们通常缺乏在历史数据上条件产生真正的后验分布的能力。为了解决这一基本限制,我们展示了如何将一类随机波动率模型重新塑造为具有专门协方差函数的层次高斯工艺(GP)模型。该GP模型保留了随机波动率模型的电感偏差,同时提供了GP推断给出的后验预测分布。在此框架内,我们从研究良好的域中汲取灵感,以引入新的型号,即Volt和Magpie,这些模型在库存和风速预测中的表现明显超过了基线,并且自然扩展到多任务设置。
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引力波(GW)检测现在是普遍的,并且随着GW探测器的全球网络的灵敏度,我们将观察每年瞬态GW事件的$ \ MATHCAL {O}(100)美元。用于估计其源参数的目前的方法采用最佳敏感但是计算昂贵的贝叶斯推理方法,其中典型的分析在6小时和5天之间取。对于二元中子星和中子星黑洞系统提示,预计在1秒 - 1分钟的时间尺度和用于提醒EM随访观察员的最快方法,可以提供估计在$ \ mathcal {o }(1)$分钟,在有限的关键源参数范围内。在这里,我们表明,在二进制黑洞信号上预先培训的条件变形Autiachoder可以返回贝叶斯后概率估计。仅针对给定的先前参数空间执行一次训练程序,然后可以将所得培训的机器能够生成描述后部分配$ \ SIM 6 $幅度的样本比现有技术更快。
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隐式过程(IPS)代表一个灵活的框架,可用于描述各种模型,从贝叶斯神经网络,神经抽样器和数据生成器到许多其他模型。 IP还允许在功能空间上进行大致推断。公式的这种变化解决了参数空间的固有退化问题近似推断,即参数数量及其在大型模型中的强大依赖性。为此,文献中先前的作品试图采用IPS来设置先验并近似产生的后部。但是,这被证明是一项具有挑战性的任务。现有的方法可以调整先前的IP导致高斯预测分布,该分布未能捕获重要的数据模式。相比之下,通过使用另一个IP近似后验过程产生灵活预测分布的方法不能将先前的IP调整到观察到的数据中。我们在这里建议第一个可以实现这两个目标的方法。为此,我们依赖于先前IP的诱导点表示,就像在稀疏高斯过程中所做的那样。结果是一种可扩展的方法,用于与IP的近似推断,可以将先前的IP参数调整到数据中,并提供准确的非高斯预测分布。
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上印度河盆地喜马拉雅山为2.7亿人和无数的生态系统提供水。然而,在这一领域,降水是水文建模的关键组成部分。围绕这种不确定性的关键挑战来自整个盆地降水的复杂时空分布。在这项工作中,我们提出了具有结构化非平稳核的高斯过程,以模拟UIB中的降水模式。先前试图在印度库什karakoram喜马拉雅地区量化或建模降水的尝试通常是定性的,或者包括在较低分辨率下无法解决的粗略假设和简化。这项研究也几乎没有错误传播。我们用非平稳的Gibbs内核参数为输入依赖性长度尺度来解释降水的空间变化。这允许后函数样品适应印度河地区不同基础地形所固有的不同降水模式。输入依赖的长度尺寸由带有固定平方 - 指数内核的潜在高斯过程控制,以使功能级别的超参数平稳变化。在消融实验中,我们通过证明其对空间协方差,时间结构和关节时空重建的能力来激励所提出的内核的每个组成部分。我们通过固定的高斯工艺和深度高斯工艺进行基准测试模型。
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Stellar photospheric activity is known to limit the detection and characterisation of extra-solar planets. In particular, the study of Earth-like planets around Sun-like stars requires data analysis methods that can accurately model the stellar activity phenomena affecting radial velocity (RV) measurements. Gaussian Process Regression Networks (GPRNs) offer a principled approach to the analysis of simultaneous time-series, combining the structural properties of Bayesian neural networks with the non-parametric flexibility of Gaussian Processes. Using HARPS-N solar spectroscopic observations encompassing three years, we demonstrate that this framework is capable of jointly modelling RV data and traditional stellar activity indicators. Although we consider only the simplest GPRN configuration, we are able to describe the behaviour of solar RV data at least as accurately as previously published methods. We confirm the correlation between the RV and stellar activity time series reaches a maximum at separations of a few days, and find evidence of non-stationary behaviour in the time series, associated with an approaching solar activity minimum.
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语境。斑点检测是天文学中的常见问题。一个例子是在恒星种群建模中,其中从观察结果推断出星系中恒星年龄和金属性的分布。在这种情况下,斑点可能对应于原位的恒星与从卫星中吸收的恒星相对应,而BLOB检测的任务是解散这些组件。当分布带来重大不确定性时,就会出现一个困难,就像从未解决的恒星系统的建模光谱中推断出的恒星种群的情况一样。目前没有不确定性检测BLOB检测的令人满意的方法。目标。我们介绍了一种在恒星系统综合光谱的恒星种群建模的背景下开发的不确定性感知斑点检测方法。方法。我们为经典的blob检测方法的经典laplacian方法的不确定性感知版本开发了理论和计算工具,我们称之为ULOG。这确定了考虑各种尺度的重要斑点。作为将ULOG应用于恒星种群建模的先决条件,我们引入了一种有效计算光谱建模不确定性的方法。该方法基于截断的奇异值分解和马尔可夫链蒙特卡洛采样(SVD-MCMC)。结果。我们将方法应用于星团M54的数据。我们表明,SVD-MCMC推断与标准MCMC的推断相匹配,但计算速度更快。我们将ULOG应用于推断的M54年龄/金属性分布,识别其恒星中的2或3个显着不同的种群。
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