多保真建模和校准是在工程设计中普遍出现的数据融合任务。在本文中，我们介绍了一种基于潜在地图高斯过程（LMGPS）的新方法，可实现高效准确的数据融合。在我们的方法中，我们将数据融合转换为潜在的空间学习问题，其中自动学习不同数据源之间的关系。这种转换赋予我们的方法具有有吸引力的优点，例如提高准确性，降低成本，灵活性，共同熔断任何数量的数据源，以及可视化数据源之间的相关性。该可视化允许用户通过拟合LMGP仅拟合到具有良好相关的数据源的子集的子集来检测模型形式误差或确定用于高保真仿真的最佳策略。我们还开发了一种新的内核功能，使LMGPS能够不仅构建概率的多保真代理，而且还具有高精度和一致性的估计参数。与现有技术相比，我们的方法的实施和使用易于更简单，更不容易出现数值问题。我们通过在广泛的示例中比较其对竞争方法的性能来证明基于LMGP的数据融合的好处。

Bayesian optimization (BO) is increasingly employed in critical applications such as materials design and drug discovery. An increasingly popular strategy in BO is to forgo the sole reliance on high-fidelity data and instead use an ensemble of information sources which provide inexpensive low-fidelity data. The overall premise of this strategy is to reduce the overall sampling costs by querying inexpensive low-fidelity sources whose data are correlated with high-fidelity samples. Here, we propose a multi-fidelity cost-aware BO framework that dramatically outperforms the state-of-the-art technologies in terms of efficiency, consistency, and robustness. We demonstrate the advantages of our framework on analytic and engineering problems and argue that these benefits stem from our two main contributions: (1) we develop a novel acquisition function for multi-fidelity cost-aware BO that safeguards the convergence against the biases of low-fidelity data, and (2) we tailor a newly developed emulator for multi-fidelity BO which enables us to not only simultaneously learn from an ensemble of multi-fidelity datasets, but also identify the severely biased low-fidelity sources that should be excluded from BO.

Real engineering and scientific applications often involve one or more qualitative inputs. Standard Gaussian processes (GPs), however, cannot directly accommodate qualitative inputs. The recently introduced latent variable Gaussian process (LVGP) overcomes this issue by first mapping each qualitative factor to underlying latent variables (LVs), and then uses any standard GP covariance function over these LVs. The LVs are estimated similarly to the other GP hyperparameters through maximum likelihood estimation, and then plugged into the prediction expressions. However, this plug-in approach will not account for uncertainty in estimation of the LVs, which can be significant especially with limited training data. In this work, we develop a fully Bayesian approach for the LVGP model and for visualizing the effects of the qualitative inputs via their LVs. We also develop approximations for scaling up LVGPs and fully Bayesian inference for the LVGP hyperparameters. We conduct numerical studies comparing plug-in inference against fully Bayesian inference over a few engineering models and material design applications. In contrast to previous studies on standard GP modeling that have largely concluded that a fully Bayesian treatment offers limited improvements, our results show that for LVGP modeling it offers significant improvements in prediction accuracy and uncertainty quantification over the plug-in approach.

我们考虑基于活动的运输模拟器的校准和不确定性分析问题。基于活动的模型（ABM）依靠单个旅行者行为的统计模型来预测大都市地区的高阶旅行模式。输入参数通常是使用最大似然从旅行者调查中估算的。我们开发了一种使用高斯工艺模拟器使用流量流数据校准这些参数的方法。我们的方法扩展了传统的模拟器，以处理运输模拟器的高维和非平稳性。我们介绍了一个深度学习维度降低模型，该模型与高斯工艺模型共同估计以近似模拟器。我们使用几个模拟示例以及校准伊利诺伊州布卢明顿的关键参数来证明方法。

封闭曲线的建模和不确定性量化是形状分析领域的重要问题，并且可以对随后的统计任务产生重大影响。这些任务中的许多涉及封闭曲线的集合，这些曲线通常在多个层面上表现出结构相似性。以有效融合这种曲线间依赖性的方式对多个封闭曲线进行建模仍然是一个具有挑战性的问题。在这项工作中，我们提出并研究了一个多数输出（又称多输出），多维高斯流程建模框架。我们说明了提出的方法学进步，并在几个曲线和形状相关的任务上证明了有意义的不确定性量化的实用性。这种基于模型的方法不仅解决了用内核构造对封闭曲线（及其形状）的推断问题，而且还为通常对功能对象的多层依赖性的非参数建模打开了门。

预测组合在预测社区中蓬勃发展，近年来，已经成为预测研究和活动主流的一部分。现在，由单个（目标）系列产生的多个预测组合通过整合来自不同来源收集的信息，从而提高准确性，从而减轻了识别单个“最佳”预测的风险。组合方案已从没有估计的简单组合方法演变为涉及时间变化的权重，非线性组合，组件之间的相关性和交叉学习的复杂方法。它们包括结合点预测和结合概率预测。本文提供了有关预测组合的广泛文献的最新评论，并参考可用的开源软件实施。我们讨论了各种方法的潜在和局限性，并突出了这些思想如何随着时间的推移而发展。还调查了有关预测组合实用性的一些重要问题。最后，我们以当前的研究差距和未来研究的潜在见解得出结论。

由于其数据效率，贝叶斯优化已经出现在昂贵的黑盒优化的最前沿。近年来，关于新贝叶斯优化算法及其应用的发展的研究激增。因此，本文试图对贝叶斯优化的最新进展进行全面和更新的调查，并确定有趣的开放问题。我们将贝叶斯优化的现有工作分为九个主要群体，并根据所提出的算法的动机和重点。对于每个类别，我们介绍了替代模型的构建和采集功能的适应的主要进步。最后，我们讨论了开放的问题，并提出了有希望的未来研究方向，尤其是在分布式和联合优化系统中的异质性，隐私保护和公平性方面。

我们建议使用贝叶斯推理和深度神经网络的技术，将地震成像中的不确定性转化为图像上执行的任务的不确定性，例如地平线跟踪。地震成像是由于带宽和孔径限制，这是一个不良的逆问题，由于噪声和线性化误差的存在而受到阻碍。但是，许多正规化方法，例如变形域的稀疏性促进，已设计为处理这些错误的不利影响，但是，这些方法具有偏向解决方案的风险，并且不提供有关图像空间中不确定性的信息以及如何提供信息。不确定性会影响图像上的某些任务。提出了一种系统的方法，以将由于数据中的噪声引起的不确定性转化为图像中自动跟踪视野的置信区间。不确定性的特征是卷积神经网络（CNN）并评估这些不确定性，样品是从CNN权重的后验分布中得出的，用于参数化图像。与传统先验相比，文献中认为，这些CNN引入了灵活的感应偏见，这非常适合各种问题。随机梯度Langevin动力学的方法用于从后验分布中采样。该方法旨在处理大规模的贝叶斯推理问题，即具有地震成像中的计算昂贵的远期操作员。除了提供强大的替代方案外，最大的后验估计值容易过度拟合外，访问这些样品还可以使我们能够在数据中的噪声中转换图像中的不确定性，以便在跟踪的视野上不确定性。例如，它承认图像上的重点标准偏差和自动跟踪视野的置信区间的估计值。

远期操作员的计算成本和选择适当的先前分布的计算成本挑战了贝叶斯对高维逆问题的推断。摊销的变异推理解决了这些挑战，在这些挑战中，训练神经网络以近似于现有模型和数据对的后验分布。如果以前看不见的数据和正态分布的潜在样品作为输入，则预处理的深神经网络（在我们的情况下是有条件的正常化流量）几乎没有成本的后验样品。然而，这种方法的准确性取决于高保真训练数据的可用性，由于地球的异质结构，由于地球物理逆问题很少存在。此外，准确的摊销变异推断需要从训练数据分布中汲取观察到的数据。因此，我们建议通过基于物理学的校正对有条件的归一化流量分布来提高摊销变异推断的弹性。为了实现这一目标，我们不是标准的高斯潜在分布，我们通过具有未知平均值和对角线协方差的高斯分布来对潜在分布进行参数化。然后，通过最小化校正后分布和真实后验分布之间的kullback-leibler差异来估算这些未知数量。尽管通用和适用于其他反问题，但通过地震成像示例，我们表明我们的校正步骤可提高摊销变异推理的鲁棒性，以相对于源实验数量的变化，噪声方差以及先前分布的变化。这种方法提供了伪像有限的地震图像，并评估其不确定性，其成本大致与五个反度迁移相同。

我们考虑了使用显微镜或X射线散射技术产生的图像数据自组装的模型的贝叶斯校准。为了说明BCP平衡结构中的随机远程疾病，我们引入了辅助变量以表示这种不确定性。然而，这些变量导致了高维图像数据的综合可能性，通常可以评估。我们使用基于测量运输的可能性方法以及图像数据的摘要统计数据来解决这一具有挑战性的贝叶斯推理问题。我们还表明，可以计算出有关模型参数的数据中的预期信息收益（EIG），而无需额外的成本。最后，我们介绍了基于二嵌段共聚物薄膜自组装和自上而下显微镜表征的ohta-kawasaki模型的数值案例研究。为了进行校准，我们介绍了一些基于域的能量和傅立叶的摘要统计数据，并使用EIG量化了它们的信息性。我们证明了拟议方法研究数据损坏和实验设计对校准结果的影响的力量。

In many engineering optimization problems, the number of function evaluations is severely limited by time or cost. These problems pose a special challenge to the field of global optimization, since existing methods often require more function evaluations than can be comfortably afforded. One way to address this challenge is to fit response surfaces to data collected by evaluating the objective and constraint functions at a few points. These surfaces can then be used for visualization, tradeoff analysis, and optimization. In this paper, we introduce the reader to a response surface methodology that is especially good at modeling the nonlinear, multimodal functions that often occur in engineering. We then show how these approximating functions can be used to construct an efficient global optimization algorithm with a credible stopping rule. The key to using response surfaces for global optimization lies in balancing the need to exploit the approximating surface (by sampling where it is minimized) with the need to improve the approximation (by sampling where prediction error may be high). Striking this balance requires solving certain auxiliary problems which have previously been considered intractable, but we show how these computational obstacles can be overcome.

在不断努力提高产品质量和降低运营成本中，越来越多地部署计算建模以确定产品设计或配置的可行性。通过本地模型代理这些计算机实验的建模，仅考虑短程交互，诱导稀疏性，可以解决复杂输入输出关系的巨大分析。然而，缩小到地方规模的重点意味着必须一遍又一遍地重新学习全球趋势。在本文中，我们提出了一种框架，用于将来自全局敏感性分析的信息纳入代理模型作为输入旋转和重新扫描预处理步骤。我们讨论了基于内核回归的几个敏感性分析方法的关系在描述它们如何产生输入变量的转换之前。具体而言，我们执行输入扭曲，使得“翘曲模拟器”对所有输入方向同样敏感，释放本地模型以专注于本地动态。观测数据和基准测试功能的数值实验，包括来自汽车行业的高维计算机模拟器，提供了实证验证。

数据驱动的设计显示了加速材料发现的希望，但由于搜索化学，结构和合成方法的庞大设计空间的高昂成本，这是具有挑战性的。贝叶斯优化（BO）采用不确定性的机器学习模型来选择有前途的设计来评估，从而降低成本。但是，在材料设计中特别感兴趣的具有混合数值和分类变量的BO尚未得到很好的研究。在这项工作中，我们调查了使用混合变量对机器学习的不确定性量化的常见主义者和贝叶斯方法。然后，我们使用来自每个组的流行代表模型，基于森林的LOLO模型（频繁主义者）和潜在的可变高斯过程模型（贝叶斯）进行了对BO中其表现的系统比较研究。我们研究了这两个模型在数学函数优化的功效以及结构和功能材料的特性，在其中我们观察到与问题维度和复杂性有关的性能差异。通过研究机器学习模型的预测性和不确定性估计功能，我们可以解释观察到的性能差异。我们的结果为在材料设计中的混合变量BO中选择频繁和贝叶斯不确定性的机器学习模型提供了实用的指导。

We present the GPry algorithm for fast Bayesian inference of general (non-Gaussian) posteriors with a moderate number of parameters. GPry does not need any pre-training, special hardware such as GPUs, and is intended as a drop-in replacement for traditional Monte Carlo methods for Bayesian inference. Our algorithm is based on generating a Gaussian Process surrogate model of the log-posterior, aided by a Support Vector Machine classifier that excludes extreme or non-finite values. An active learning scheme allows us to reduce the number of required posterior evaluations by two orders of magnitude compared to traditional Monte Carlo inference. Our algorithm allows for parallel evaluations of the posterior at optimal locations, further reducing wall-clock times. We significantly improve performance using properties of the posterior in our active learning scheme and for the definition of the GP prior. In particular we account for the expected dynamical range of the posterior in different dimensionalities. We test our model against a number of synthetic and cosmological examples. GPry outperforms traditional Monte Carlo methods when the evaluation time of the likelihood (or the calculation of theoretical observables) is of the order of seconds; for evaluation times of over a minute it can perform inference in days that would take months using traditional methods. GPry is distributed as an open source Python package (pip install gpry) and can also be found at https://github.com/jonaselgammal/GPry.

大多数机器学习算法由一个或多个超参数配置，必须仔细选择并且通常会影响性能。为避免耗时和不可递销的手动试验和错误过程来查找性能良好的超参数配置，可以采用各种自动超参数优化（HPO）方法，例如，基于监督机器学习的重新采样误差估计。本文介绍了HPO后，本文审查了重要的HPO方法，如网格或随机搜索，进化算法，贝叶斯优化，超带和赛车。它给出了关于进行HPO的重要选择的实用建议，包括HPO算法本身，性能评估，如何将HPO与ML管道，运行时改进和并行化结合起来。这项工作伴随着附录，其中包含关于R和Python的特定软件包的信息，以及用于特定学习算法的信息和推荐的超参数搜索空间。我们还提供笔记本电脑，这些笔记本展示了这项工作的概念作为补充文件。

现代深度学习方法构成了令人难以置信的强大工具，以解决无数的挑战问题。然而，由于深度学习方法作为黑匣子运作，因此与其预测相关的不确定性往往是挑战量化。贝叶斯统计数据提供了一种形式主义来理解和量化与深度神经网络预测相关的不确定性。本教程概述了相关文献和完整的工具集，用于设计，实施，列车，使用和评估贝叶斯神经网络，即使用贝叶斯方法培训的随机人工神经网络。

Estimating the probability of failure for complex real-world systems using high-fidelity computational models is often prohibitively expensive, especially when the probability is small. Exploiting low-fidelity models can make this process more feasible, but merging information from multiple low-fidelity and high-fidelity models poses several challenges. This paper presents a robust multi-fidelity surrogate modeling strategy in which the multi-fidelity surrogate is assembled using an active learning strategy using an on-the-fly model adequacy assessment set within a subset simulation framework for efficient reliability analysis. The multi-fidelity surrogate is assembled by first applying a Gaussian process correction to each low-fidelity model and assigning a model probability based on the model's local predictive accuracy and cost. Three strategies are proposed to fuse these individual surrogates into an overall surrogate model based on model averaging and deterministic/stochastic model selection. The strategies also dictate which model evaluations are necessary. No assumptions are made about the relationships between low-fidelity models, while the high-fidelity model is assumed to be the most accurate and most computationally expensive model. Through two analytical and two numerical case studies, including a case study evaluating the failure probability of Tristructural isotropic-coated (TRISO) nuclear fuels, the algorithm is shown to be highly accurate while drastically reducing the number of high-fidelity model calls (and hence computational cost).

这项研究的目的是评估历史匹配的潜力（HM），以调整具有多尺度动力学的气候系统。通过考虑玩具气候模型，即两尺度的Lorenz96模型并在完美模型设置中生产实验，我们详细探讨了如何需要仔细测试几种内置选择。我们还展示了在参数范围内引入物理专业知识的重要性，这是运行HM的先验性。最后，我们重新审视气候模型调整中的经典过程，该程序包括分别调整慢速和快速组件。通过在Lorenz96模型中这样做，我们说明了合理参数的非唯一性，并突出了从耦合中出现的指标的特异性。本文也有助于弥合不确定性量化，机器学习和气候建模的社区，这是通过在每个社区使用的术语之间建立相同概念的术语并提出有希望的合作途径，从而使气候建模研究受益。

潜在位置网络模型是网络科学的多功能工具;应用程序包括集群实体，控制因果混淆，并在未观察的图形上定义前提。估计每个节点的潜在位置通常是贝叶斯推理问题的群体，吉布斯内的大都市是最流行的近似后分布的工具。然而，众所周知，GIBBS内的大都市对于大型网络而言是低效;接受比计算成本昂贵，并且所得到的后绘高度相关。在本文中，我们提出了一个替代的马尔可夫链蒙特卡罗战略 - 使用分裂哈密顿蒙特卡罗和萤火虫蒙特卡罗的组合定义 - 利用后部分布的功能形式进行更有效的后退计算。我们展示了这些战略在吉布斯和综合网络上的其他算法中优于大都市，以及学区的教师和工作人员的真正信息共享网络。

这项正在进行的工作旨在为统计学习提供统一的介绍，从诸如GMM和HMM等经典模型到现代神经网络（如VAE和扩散模型）缓慢地构建。如今，有许多互联网资源可以孤立地解释这一点或新的机器学习算法，但是它们并没有（也不能在如此简短的空间中）将这些算法彼此连接起来，或者与统计模型的经典文献相连现代算法出现了。同样明显缺乏的是一个单一的符号系统，尽管对那些已经熟悉材料的人（如这些帖子的作者）不满意，但对新手的入境造成了重大障碍。同样，我的目的是将各种模型（尽可能）吸收到一个用于推理和学习的框架上，表明（以及为什么）如何以最小的变化将一个模型更改为另一个模型（其中一些是新颖的，另一些是文献中的）。某些背景当然是必要的。我以为读者熟悉基本的多变量计算，概率和统计以及线性代数。这本书的目标当然不是​​完整性，而是从基本知识到过去十年中极强大的新模型的直线路径或多或少。然后，目标是补充而不是替换，诸如Bishop的\ emph {模式识别和机器学习}之类的综合文本，该文本现在已经15岁了。