我们提出了CKAM,周期性内核自适应大都市,该大都市结合了一个周期性的步骤尺寸方案,以控制探索和采样。我们表明,在精心设计的双峰分布中,现有的自适应大都市类型算法将无法融合到真正的后验分布。我们指出,这是因为自适应采样器使用链的过去历史估算局部/全局协方差结构,这将导致自适应算法被困在局部模式下。我们证明CKAM鼓励对后验分布进行探索,并使采样器能够从局部模式中逃脱,同时保持自适应方法的高性能。
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最近介绍基于梯度的MCMC用于离散空间具有巨大的希望,并带来了新离散的可能性的诱人可能性,即MALA和HMC等著名的连续方法。为了实现这一目标,我们介绍了几个在概念上受到MALA启发的分离大都会杂货样本,并在贝叶斯推理和基于能量的建模中表现出了一系列具有挑战性的采样问题。从方法上讲,我们确定了为什么对预处理的MALA的离散类似物通常是棘手的,激发了我们基于辅助变量和“高斯整体技巧”引入一种新型的预处理。
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Hamiltonian Monte Carlo (HMC) is a Markov chain Monte Carlo (MCMC) algorithm that avoids the random walk behavior and sensitivity to correlated parameters that plague many MCMC methods by taking a series of steps informed by first-order gradient information. These features allow it to converge to high-dimensional target distributions much more quickly than simpler methods such as random walk Metropolis or Gibbs sampling. However, HMC's performance is highly sensitive to two user-specified parameters: a step size and a desired number of steps L. In particular, if L is too small then the algorithm exhibits undesirable random walk behavior, while if L is too large the algorithm wastes computation. We introduce the No-U-Turn Sampler (NUTS), an extension to HMC that eliminates the need to set a number of steps L. NUTS uses a recursive algorithm to build a set of likely candidate points that spans a wide swath of the target distribution, stopping automatically when it starts to double back and retrace its steps. Empirically, NUTS perform at least as efficiently as and sometimes more efficiently than a well tuned standard HMC method, without requiring user intervention or costly tuning runs. We also derive a method for adapting the step size parameter on the fly based on primal-dual averaging. NUTS can thus be used with no hand-tuning at all. NUTS is also suitable for applications such as BUGS-style automatic inference engines that require efficient "turnkey" sampling algorithms.
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汉密尔顿蒙特卡罗(HMC)方法广泛用于利用高效率和良好的空间尺寸的效率和良好可扩展性,将样品从非正式化的目标密度绘制。然而,当目标分布是多式化的时,HMC奋斗,因为沿着模拟路径的势能函数(即负面日志密度函数)的最大增加是由初始动能的界限,这遵循$ \ Chi_d的一半^ 2 $分布,其中d是空间尺寸。在本文中,我们开发了一个汉密尔顿蒙特卡罗方法,其中构造的路径可以穿过高潜在的能量屏障。该方法不需要预先知道目标分布的模式。我们的方法通过连续改变模拟粒子的质量而在构造哈密顿路径时,我们的方法能够频繁跳跃。因此,该方法可以被认为是HMC和钢化转变方法的组合。与其他回火方法相比,我们的方法在GIBBS采样器设置中具有独特的优势,其中目标分布在每个步骤中发生变化。我们为我们的方法制定了实用的调整策略,并证明它可以使用法线和传感器网络定位问题的混合物来构建靶向高维的Markov链的全局混合马尔可夫链。
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重要性采样(IS)是一种强大的蒙特卡洛(MC)方法,用于近似积分,例如在贝叶斯推论的背景下。在IS中,从所谓的提案分布中模拟样品,并且该提案的选择是实现高性能的关键。在自适应IS(AIS)方法中,一组建议是迭代改进的。 AIS是一种相关和及时的方法论,尽管仍有许多局限性尚待克服,例如,高维和多模式问题的维度诅咒。此外,汉密尔顿蒙特卡洛(HMC)算法在机器学习和统计数据中变得越来越流行。 HMC具有几个吸引人的特征,例如其探索性行为,尤其是在其他方法遭受的情况下,尤其是在高维目标中。在本文中,我们介绍了新型的汉密尔顿自适应重要性采样(HAIS)方法。 Hais使用平行的HMC链实现了两步自适应过程,每次迭代都合作。拟议的HAI有效地适应了一系列建议,从而提取了HMC的优势。 HAI可以理解为具有额外重采样步骤的通用分层AIS家族的特定实例。 HAIS在高维问题W.R.T.方面取得了重大的绩效提高。最先进的算法。我们讨论了HAI的统计特性,并在两个具有挑战性的例子中显示了其高性能。
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最大程度地减少具有随机梯度下降(SGD)的包容性kullback-leibler(KL)差异,因为其梯度被定义为后部的积分。最近,已经提出了多种方法运行SGD,并从马尔可夫链中获得了偏置梯度估计。本文通过建立混合速率和梯度方差,对这些方法进行了首次对这些方法的非反应收敛分析。为此,我们证明了这些方法 - 我们共同将其称为马尔可夫链得分上升(MCSA)方法can被视为马尔可夫链梯度下降框架的特殊情况。此外,通过利用这种新的理解,我们开发了一种新颖的MCSA方案,即Parallal MCSA(PMCSA),该方案在梯度方差上实现了更严格的结合。我们证明了这一改进的理论结果转化为卓越的经验表现。
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我们开发了一个探索漏洞利用马尔可夫链Monte Carlo算法($ \ OperatorName {ex ^ 2mcmc} $),它结合了多个全局提议和本地移动。所提出的方法是巨大的平行化和极其计算的高效。我们证明$ \ operatorname {ex ^ 2mcmc} $下的$ v $ v $ -unique几何ergodicity在现实条件下,并计算混合速率的显式界限,显示多个全局移动带来的改进。我们展示$ \ operatorname {ex ^ 2mcmc} $允许通过提出依赖全局移动的新方法进行微调剥削(本地移动)和探索(全球移动)。最后,我们开发了一个自适应方案,$ \ OperatorName {Flex ^ 2mcmc} $,它学习使用归一化流的全局动作的分布。我们说明了许多经典采样基准测试的$ \ OperatorName {ex ^ 2mccmc} $及其自适应版本的效率。我们还表明,这些算法提高了对基于能量的模型的抽样GAN的质量。
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退火重要性采样(AIS)是一种流行的算法,用于估计深层生成模型的棘手边际可能性。尽管AIS可以保证为任何一组超参数提供无偏估计,但共同的实现依赖于简单的启发式方法,例如初始和目标分布之间的几何平均桥接分布,这些分布在计算预算有限时会影响估计性性能。由于使用Markov过渡中的大都市磨碎(MH)校正步骤,因此对完全参数AI的优化仍然具有挑战性。我们提出一个具有灵活中间分布的参数AIS过程,并优化桥接分布以使用较少数量的采样步骤。一种重新聚集方法,它允许我们优化分布序列和Markov转换的参数,该参数适用于具有MH校正的大型Markov内核。我们评估了优化AIS的性能,以进行深层生成模型的边际可能性估计,并将其与其他估计器进行比较。
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通过最小化kullback-leibler(kl)差异,变化推断近似于非差异分布。尽管这种差异对于计算有效,并且已在应用中广泛使用,但它具有一些不合理的属性。例如,它不是一个适当的度量标准,即,它是非对称的,也不保留三角形不等式。另一方面,最近的最佳运输距离显示出比KL差异的一些优势。在这些优势的帮助下,我们通过最大程度地减少切片的瓦斯汀距离,这是一种由最佳运输产生的有效度量,提出了一种新的变异推理方法。仅通过运行MCMC而不能解决任何优化问题,就可以简单地近似切片的Wasserstein距离。我们的近似值也不需要变异分布的易于处理密度函数,因此诸如神经网络之类的发电机可以摊销近似家庭。此外,我们提供了方法的理论特性分析。说明了关于合成和真实数据的实验,以显示提出的方法的性能。
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The kernel function and its hyperparameters are the central model selection choice in a Gaussian proces (Rasmussen and Williams, 2006). Typically, the hyperparameters of the kernel are chosen by maximising the marginal likelihood, an approach known as Type-II maximum likelihood (ML-II). However, ML-II does not account for hyperparameter uncertainty, and it is well-known that this can lead to severely biased estimates and an underestimation of predictive uncertainty. While there are several works which employ a fully Bayesian characterisation of GPs, relatively few propose such approaches for the sparse GPs paradigm. In this work we propose an algorithm for sparse Gaussian process regression which leverages MCMC to sample from the hyperparameter posterior within the variational inducing point framework of Titsias (2009). This work is closely related to Hensman et al. (2015b) but side-steps the need to sample the inducing points, thereby significantly improving sampling efficiency in the Gaussian likelihood case. We compare this scheme against natural baselines in literature along with stochastic variational GPs (SVGPs) along with an extensive computational analysis.
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We present the GPry algorithm for fast Bayesian inference of general (non-Gaussian) posteriors with a moderate number of parameters. GPry does not need any pre-training, special hardware such as GPUs, and is intended as a drop-in replacement for traditional Monte Carlo methods for Bayesian inference. Our algorithm is based on generating a Gaussian Process surrogate model of the log-posterior, aided by a Support Vector Machine classifier that excludes extreme or non-finite values. An active learning scheme allows us to reduce the number of required posterior evaluations by two orders of magnitude compared to traditional Monte Carlo inference. Our algorithm allows for parallel evaluations of the posterior at optimal locations, further reducing wall-clock times. We significantly improve performance using properties of the posterior in our active learning scheme and for the definition of the GP prior. In particular we account for the expected dynamical range of the posterior in different dimensionalities. We test our model against a number of synthetic and cosmological examples. GPry outperforms traditional Monte Carlo methods when the evaluation time of the likelihood (or the calculation of theoretical observables) is of the order of seconds; for evaluation times of over a minute it can perform inference in days that would take months using traditional methods. GPry is distributed as an open source Python package (pip install gpry) and can also be found at https://github.com/jonaselgammal/GPry.
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最近的统计有限元方法(STATFEM)提供了一种相干统计框架,用于用观察到的数据合成有限元模型。通过嵌入控制方程内的不确定性,更新有限元解决方案以提供后部分布,该分布量化与模型相关的所有不确定性源。然而,为了纳入所有不确定性来源,必须整合与模型参数相关的不确定性,该不确定量的已知前向问题。在本文中,我们利用Langevin动力学来解决统计信息前进问题,研究了不调整的Langevin算法(ULA)的效用,是一种无马达罗夫的马尔可夫链蒙特卡罗采样器,以构建基于样品的特征,否则难以置化措施。由于STATFEM问题的结构,这些方法能够解决不明确的全PDE解决的前向问题,只需要稀疏的矩阵矢量产品。 ULA也是基于梯度的,因此提供了可扩展的方法,达到了高度自由度。利用基于Langevin的采样器背后的理论,我们提供了对采样器性能的理论保证,展示了在克洛拉 - 莱布勒分歧的先前和后后的收敛性,以及在Wassersein-2中,进一步得到了预处理的影响。对于先前和后部,还提供了数值实验,以证明采样器的功效,并且还包括Python封装。
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颗粒滤波方法广泛应用于非线性非高斯状态空间模型内的顺序状态估计。然而,传统的颗粒过滤方法在高维状态空间模型中遭受重量退化。目前,有许多方法可以提高高维状态空间模型中粒子滤波的性能。其中,更先进的方法是通过实施复合Metropolis-Hasting(MH)内核来构建顺序Makov Chian Monte Carlo(SMCMC)框架。在本文中,我们提出了离散的示出ZAG采样器,并在SMCMC框架内的复合MH内核的细化阶段应用Zig-Zag采样器,其在联合拉伸阶段中的可逆颗粒流动实现。通过挑战复杂的高维过滤实施例的数值实验,我们评估所提出的方法的性能。无限的实验表明,在高维状态估计例中,所提出的方法提高了估计精度并增加了与最先进的过滤方法相比的接收比率。
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潜在位置网络模型是网络科学的多功能工具;应用程序包括集群实体,控制因果混淆,并在未观察的图形上定义前提。估计每个节点的潜在位置通常是贝叶斯推理问题的群体,吉布斯内的大都市是最流行的近似后分布的工具。然而,众所周知,GIBBS内的大都市对于大型网络而言是低效;接受比计算成本昂贵,并且所得到的后绘高度相关。在本文中,我们提出了一个替代的马尔可夫链蒙特卡罗战略 - 使用分裂哈密顿蒙特卡罗和萤火虫蒙特卡罗的组合定义 - 利用后部分布的功能形式进行更有效的后退计算。我们展示了这些战略在吉布斯和综合网络上的其他算法中优于大都市,以及学区的教师和工作人员的真正信息共享网络。
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从观察到的调查数据中,宇宙学的正向建模方法使在宇宙开头重建初始条件成为可能。但是,参数空间的高维度仍然构成挑战,探索完整的后部,传统算法(例如汉密尔顿蒙特卡洛(HMC))由于产生相关样本而在计算上效率低下发散(损失)功能。在这里,我们开发了一种称为变异自动采样(VBS)的混合方案,以通过学习用于蒙特卡洛采样的建议分布的变异近似来减轻这两种算法的缺点,并将其与HMC结合。变异分布被参数化为正常化的流量,并通过即时生成的样品学习,而从中提取的建议则减少了MCMC链中的自动相关长度。我们的归一化流程使用傅立叶空间卷积和元素的操作来扩展到高维度。我们表明,经过短暂的初始热身和训练阶段,VBS比简单的VI方法产生了更好的样品质量,并将采样阶段的相关长度缩短了10-50倍,仅使用HMC探索初始的后验64 $^3 $和128 $^3 $维度问题的条件,高信噪比数据观察的收益较大。
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在使用多模式贝叶斯后部分布时,马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)算法难以在模式之间移动,并且默认变分或基于模式的近似推动将低估后不确定性。并且,即使找到最重要的模式,难以评估后部的相对重量。在这里,我们提出了一种使用MCMC,变分或基于模式的模式的并行运行的方法,以便尽可能多地击中多种模式或分离的区域,然后使用贝叶斯堆叠来组合这些用于构建分布的加权平均值的可扩展方法。通过堆叠从多模式后分布的堆叠,最小化交叉验证预测误差的结果,并且代表了比变分推断更好的不确定度,但它不一定是相当于渐近的,以完全贝叶斯推断。我们呈现理论一致性,其中堆叠推断逼近来自未衰退的模型和非混合采样器的真实数据生成过程,预测性能优于完全贝叶斯推断,因此可以被视为祝福而不是模型拼写下的诅咒。我们展示了几个模型家庭的实际实施:潜在的Dirichlet分配,高斯过程回归,分层回归,马蹄素变量选择和神经网络。
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Leveraging well-established MCMC strategies, we propose MCMC-interactive variational inference (MIVI) to not only estimate the posterior in a time constrained manner, but also facilitate the design of MCMC transitions. Constructing a variational distribution followed by a short Markov chain that has parameters to learn, MIVI takes advantage of the complementary properties of variational inference and MCMC to encourage mutual improvement. On one hand, with the variational distribution locating high posterior density regions, the Markov chain is optimized within the variational inference framework to efficiently target the posterior despite a small number of transitions. On the other hand, the optimized Markov chain with considerable flexibility guides the variational distribution towards the posterior and alleviates its underestimation of uncertainty. Furthermore, we prove the optimized Markov chain in MIVI admits extrapolation, which means its marginal distribution gets closer to the true posterior as the chain grows. Therefore, the Markov chain can be used separately as an efficient MCMC scheme. Experiments show that MIVI not only accurately and efficiently approximates the posteriors but also facilitates designs of stochastic gradient MCMC and Gibbs sampling transitions.
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我们提出了离散的Langevin提案(DLP),这是一种简单且可扩展的基于梯度的建议,用于对复杂的高维离散分布进行采样。与基于Gibbs采样的方法相反,DLP能够单个步骤并行更新所有坐标,并且更改的幅度由步骤尺寸控制。这允许在高维且密切相关的变量的空间中进行廉价,有效的探索。我们通过证明其固定分布的渐近偏置对于对数季度分布而言是零,并且对于接近对数季度的分布而言,我们证明了DLP的效率为零。使用DLP,我们开发了几种采样算法的变体,包括未经调整的,大都市调整后的,随机和预处理版本。DLP在各种任务上都优于许多受欢迎的替代方案,包括ISING模型,受限的Boltzmann机器,基于深层的基于能量的模型,二进制神经网络和语言生成。
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我们介绍了本地自动平衡采样器(LSB),这是一种本地马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)方法,用于在纯离散域中采样,该方法能够自主适应目标分布并减少收敛所需的目标评估数量。LSB基于(i)局部平衡建议的参数化,(ii)基于相互信息的新提出的目标函数和(iii)自平衡学习过程,该过程最大程度地降低了提议的目标以更新提案参数。基于能量的模型和马尔可夫网络的实验表明,与最近的本地MCMC采样器相比,LSB使用较少数量的Oracle分布收敛。
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从降压和嘈杂的测量值(例如MRI和低剂量计算机断层扫描(CT))中重建图像是数学上不良的反问题。我们提出了一种基于期望传播(EP)技术的易于使用的重建方法。我们将蒙特卡洛(MC)方法,马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)和乘数(ADMM)算法的交替方向方法纳入EP方法,以解决EP中遇到的棘手性问题。我们在复杂的贝叶斯模型上演示了图像重建的方法。我们的技术应用于伽马相机扫描中的图像。我们仅将EPMC,EP-MCMC,EP-ADMM方法与MCMC进行比较。指标是更好的图像重建,速度和参数估计。在真实和模拟数据中使用伽马相机成像进行的实验表明,我们提出的方法在计算上比MCMC昂贵,并且产生相对更好的图像重建。
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