特征选择表示降低高维数据集的复杂性的度量,并在数据的系统变化中获得深度洞察。这方面在依赖于模型可解释性的域中具有特异性,例如生命科学。我们提出Ubayfs,一个嵌入在贝叶斯统计框架中的集合特征选择技术。我们的方法考虑了两个信息来源:数据和域知识。我们从基本特征选择器的集合构建一个元模型,并在多项可能性中聚合这些信息。用户通过加权特征和惩罚特定特征块或组合来引导UBayFS,通过Dirichlet-Type和正则化术语实现。在定量评估中,我们证明我们的框架(a)允许用户知识和数据观察之间的平衡权衡,并且(b)通过最先进的方法实现竞争性能。
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特征选择是数据科学流水线的重要步骤,以减少与大型数据集相关的复杂性。虽然对本主题的研究侧重于优化预测性能,但很少研究在特征选择过程的上下文中调查稳定性。在这项研究中,我们介绍了重复的弹性网技术(租金)进行特色选择。租金使用具有弹性净正常化的广义线性模型的集合,每个训练都培训了训练数据的不同子集。该特征选择基于三个标准评估所有基本模型的重量分布。这一事实导致选择具有高稳定性的特征,从而提高最终模型的稳健性。此外,与已建立的特征选择器不同,租金提供了有关在训练期间难以预测的数据中难以预测的对象的模型解释的有价值信息。在我们的实验中,我们在八个多变量数据集中对六个已建立的特征选择器进行基准测试,用于二进制分类和回归。在实验比较中,租金在预测性能和稳定之间展示了均衡的权衡。最后,我们强调了租金的额外解释价值与医疗保健数据集的探索性后HOC分析。
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大多数机器学习算法由一个或多个超参数配置,必须仔细选择并且通常会影响性能。为避免耗时和不可递销的手动试验和错误过程来查找性能良好的超参数配置,可以采用各种自动超参数优化(HPO)方法,例如,基于监督机器学习的重新采样误差估计。本文介绍了HPO后,本文审查了重要的HPO方法,如网格或随机搜索,进化算法,贝叶斯优化,超带和赛车。它给出了关于进行HPO的重要选择的实用建议,包括HPO算法本身,性能评估,如何将HPO与ML管道,运行时改进和并行化结合起来。这项工作伴随着附录,其中包含关于R和Python的特定软件包的信息,以及用于特定学习算法的信息和推荐的超参数搜索空间。我们还提供笔记本电脑,这些笔记本展示了这项工作的概念作为补充文件。
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我们介绍了数据科学预测生命周期中各个阶段开发和采用自动化的技术和文化挑战的说明概述,从而将重点限制为使用结构化数据集的监督学习。此外,我们回顾了流行的开源Python工具,这些工具实施了针对自动化挑战的通用解决方案模式,并突出了我们认为进步仍然需要的差距。
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无论是在功能选择的领域还是可解释的AI领域,都有基于其重要性的“排名”功能的愿望。然后可以将这种功能重要的排名用于:(1)减少数据集大小或(2)解释机器学习模型。但是,在文献中,这种特征排名没有以系统的,一致的方式评估。许多论文都有不同的方式来争论哪些具有重要性排名最佳的特征。本文通过提出一种新的评估方法来填补这一空白。通过使用合成数据集,可以事先知道特征重要性得分,从而可以进行更系统的评估。为了促进使用新方法的大规模实验,在Python建造了一个名为FSEVAL的基准测定框架。该框架允许并行运行实验,并在HPC系统上的计算机上分布。通过与名为“权重和偏见”的在线平台集成,可以在实时仪表板上进行交互探索图表。该软件作为开源软件发布,并在PYPI平台上以包裹发行。该研究结束时,探索了一个这样的大规模实验,以在许多方面找到参与算法的优势和劣势。
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预测组合在预测社区中蓬勃发展,近年来,已经成为预测研究和活动主流的一部分。现在,由单个(目标)系列产生的多个预测组合通过整合来自不同来源收集的信息,从而提高准确性,从而减轻了识别单个“最佳”预测的风险。组合方案已从没有估计的简单组合方法演变为涉及时间变化的权重,非线性组合,组件之间的相关性和交叉学习的复杂方法。它们包括结合点预测和结合概率预测。本文提供了有关预测组合的广泛文献的最新评论,并参考可用的开源软件实施。我们讨论了各种方法的潜在和局限性,并突出了这些思想如何随着时间的推移而发展。还调查了有关预测组合实用性的一些重要问题。最后,我们以当前的研究差距和未来研究的潜在见解得出结论。
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回归模型用于各种应用,为来自不同领域的研究人员提供强大的科学工具。线性或简单的参数,模型通常不足以描述输入变量与响应之间的复杂关系。通过诸如神经网络的灵活方法可以更好地描述这种关系,但这导致不太可解释的模型和潜在的过度装备。或者,可以使用特定的参数非线性函数,但是这种功能的规范通常是复杂的。在本文中,我们介绍了一种灵活的施工方法,高度灵活的非线性参数回归模型。非线性特征是分层的,类似于深度学习,但对要考虑的可能类型的功能具有额外的灵活性。这种灵活性,与变量选择相结合,使我们能够找到一小部分重要特征,从而可以更具可解释的模型。在可能的功能的空间内,考虑了贝叶斯方法,基于它们的复杂性引入功能的前沿。采用遗传修改模式跳跃马尔可夫链蒙特卡罗算法来执行贝叶斯推理和估计模型平均的后验概率。在各种应用中,我们说明了我们的方法如何用于获得有意义的非线性模型。此外,我们将其预测性能与多个机器学习算法进行比较。
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相关特征的识别,即确定系统的过程或属性的驱动变量,是对具有大量变量的数据集分析的重要组成部分。量化这些特征相关性的数学严格方法是相互信息。相互信息确定特征在其联合相互依赖与感兴趣的财产方面的相关性。但是,相互信息需要作为输入概率分布,这不能可靠地从连续分布(例如长度或能量)等连续分布中估计。在这里,我们介绍了总累积共同信息(TCMI),这是对相互依赖关系的相关性的度量,该信息将相互信息扩展到基于累积概率分布的连续分布的随机变量。 TCMI是一种非参数,鲁棒和确定性的度量,可促进具有不同基数的特征集之间的比较和排名。 TCMI诱导的排名允许特征选择,即,考虑到数据示例的数量以及一组变量集的基数,识别与感兴趣属性的非线性统计学相关的变量集的识别。我们通过模拟数据评估测量的性能,将其性能与类似的多元依赖性度量进行比较,并在一组标准数据集中证明了我们的功能选择方法的有效性以及材料科学中的典型情况。
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超参数优化构成了典型的现代机器学习工作流程的很大一部分。这是由于这样一个事实,即机器学习方法和相应的预处理步骤通常只有在正确调整超参数时就会产生最佳性能。但是在许多应用中,我们不仅有兴趣仅仅为了预测精度而优化ML管道;确定最佳配置时,必须考虑其他指标或约束,从而导致多目标优化问题。由于缺乏知识和用于多目标超参数优化的知识和容易获得的软件实现,因此通常在实践中被忽略。在这项工作中,我们向读者介绍了多个客观超参数优化的基础知识,并激励其在应用ML中的实用性。此外,我们从进化算法和贝叶斯优化的领域提供了现有优化策略的广泛调查。我们说明了MOO在几个特定ML应用中的实用性,考虑了诸如操作条件,预测时间,稀疏,公平,可解释性和鲁棒性之类的目标。
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Label noise is an important issue in classification, with many potential negative consequences. For example, the accuracy of predictions may decrease, whereas the complexity of inferred models and the number of necessary training samples may increase. Many works in the literature have been devoted to the study of label noise and the development of techniques to deal with label noise. However, the field lacks a comprehensive survey on the different types of label noise, their consequences and the algorithms that consider label noise. This paper proposes to fill this gap. First, the definitions and sources of label noise are considered and a taxonomy of the types of label noise is proposed. Second, the potential consequences of label noise are discussed. Third, label noise-robust, label noise cleansing, and label noise-tolerant algorithms are reviewed. For each category of approaches, a short discussion is proposed to help the practitioner to choose the most suitable technique in its own particular field of application. Eventually, the design of experiments is also discussed, what may interest the researchers who would like to test their own algorithms. In this paper, label noise consists of mislabeled instances: no additional information is assumed to be available like e.g. confidences on labels.
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现代深度学习方法构成了令人难以置信的强大工具,以解决无数的挑战问题。然而,由于深度学习方法作为黑匣子运作,因此与其预测相关的不确定性往往是挑战量化。贝叶斯统计数据提供了一种形式主义来理解和量化与深度神经网络预测相关的不确定性。本教程概述了相关文献和完整的工具集,用于设计,实施,列车,使用和评估贝叶斯神经网络,即使用贝叶斯方法培训的随机人工神经网络。
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The notion of uncertainty is of major importance in machine learning and constitutes a key element of machine learning methodology. In line with the statistical tradition, uncertainty has long been perceived as almost synonymous with standard probability and probabilistic predictions. Yet, due to the steadily increasing relevance of machine learning for practical applications and related issues such as safety requirements, new problems and challenges have recently been identified by machine learning scholars, and these problems may call for new methodological developments. In particular, this includes the importance of distinguishing between (at least) two different types of uncertainty, often referred to as aleatoric and epistemic. In this paper, we provide an introduction to the topic of uncertainty in machine learning as well as an overview of attempts so far at handling uncertainty in general and formalizing this distinction in particular.
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We consider the problem of estimating the interacting neighborhood of a Markov Random Field model with finite support and homogeneous pairwise interactions based on relative positions of a two-dimensional lattice. Using a Bayesian framework, we propose a Reversible Jump Monte Carlo Markov Chain algorithm that jumps across subsets of a maximal range neighborhood, allowing us to perform model selection based on a marginal pseudoposterior distribution of models. To show the strength of our proposed methodology we perform a simulation study and apply it to a real dataset from a discrete texture image analysis.
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机器学习(ML)应用程序的数据量不断增长。不仅是观察的数量,特别是测量变量的数量(特征)增加了持续的数字化。选择最适合预测建模的功能是ML在商业和研究中取得成功的重要杠杆。特征选择方法(FSM)独立于某种ML算法 - 所谓的过滤方法 - 已毫无意义地建议,但研究人员和定量建模的指导很少,以选择典型ML问题的适当方法。本次审查在特征选择基准上综合了大量文献,并评估了58种方法在广泛使用的R环境中的性能。对于具体的指导,我们考虑了四种典型的数据集方案,这些情况挑战ML模型(嘈杂,冗余,不平衡数据和具有比观察特征更多的案例)。绘制早期基准的经验,该基准测试较少的FSMS,我们根据四个标准进行比较方法的性能(预测性能,所选的相关功能数,功能集和运行时的稳定性)。我们发现依赖于随机森林方法的方法,双输入对称相关滤波器(浪费)和联合杂质滤波器(Jim)是给定的数据集方案的良好性候选方法。
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在许多科学领域中发现一个有意义的,尺寸同质的,象征性的表达是一个基本挑战。我们提出了一个新颖的开源计算框架,称为科学家机器方程探测器(Scimed),该框架将科学纪律智慧与科学家在循环的方法中融合在一起,并将其与最先进的符号回归(SR)方法相结合。Scimed将基于遗传算法的包装器选择方法与自动机器学习和两个SR方法结合在一起。我们对具有和没有非线性空气动力学阻力的球体沉降的四个配置进行了测试。我们表明,疲惫不堪的人足够坚固,可以从嘈杂的数据中发现正确的物理有意义的符号表达式。我们的结果表明,与最先进的SR软件包相比,这些任务的性能更好。
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医疗保健数据集通常包含一组高度相关的特征,例如来自同一生物系统的特征。当将功能选择应用于这些数据集以识别最重要的功能时,由于相关功能,由于相关特征而引起的某些多变量特征选择器固有的偏差使这些方法难以区分重要的和无关的特征,并且功能选择过程的结果CAN可以解决。不稳定。已经研究了特征选择合奏,该合奏汇总了多个单个基础特征选择器的结果,已被研究为稳定特征选择结果的一种手段,但不能解决相关特征的问题。我们提出了一个新颖的框架,可以从多元特征选择器中创建特征选择集合,同时考虑了相关特征组产生的偏差,并在预处理步骤中使用团聚层次聚类。这些方法从阿尔茨海默氏病(AD)的研究中应用于两个现实世界数据集,这是一种尚未治愈且尚未完全了解的进行性神经退行性疾病。我们的结果表明,在没有聚类的情况下选择在模型中选择的功能的稳定性有明显的改善,并且这些模型选择的功能与广告文献中的发现保持一致。
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近年来,随着传感器和智能设备的广泛传播,物联网(IoT)系统的数据生成速度已大大增加。在物联网系统中,必须经常处理,转换和分析大量数据,以实现各种物联网服务和功能。机器学习(ML)方法已显示出其物联网数据分析的能力。但是,将ML模型应用于物联网数据分析任务仍然面临许多困难和挑战,特别是有效的模型选择,设计/调整和更新,这给经验丰富的数据科学家带来了巨大的需求。此外,物联网数据的动态性质可能引入概念漂移问题,从而导致模型性能降解。为了减少人类的努力,自动化机器学习(AUTOML)已成为一个流行的领域,旨在自动选择,构建,调整和更新机器学习模型,以在指定任务上实现最佳性能。在本文中,我们对Automl区域中模型选择,调整和更新过程中的现有方法进行了审查,以识别和总结将ML算法应用于IoT数据分析的每个步骤的最佳解决方案。为了证明我们的发现并帮助工业用户和研究人员更好地实施汽车方法,在这项工作中提出了将汽车应用于IoT异常检测问题的案例研究。最后,我们讨论并分类了该领域的挑战和研究方向。
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Selecting a minimal feature set that is maximally informative about a target variable is a central task in machine learning and statistics. Information theory provides a powerful framework for formulating feature selection algorithms -- yet, a rigorous, information-theoretic definition of feature relevancy, which accounts for feature interactions such as redundant and synergistic contributions, is still missing. We argue that this lack is inherent to classical information theory which does not provide measures to decompose the information a set of variables provides about a target into unique, redundant, and synergistic contributions. Such a decomposition has been introduced only recently by the partial information decomposition (PID) framework. Using PID, we clarify why feature selection is a conceptually difficult problem when approached using information theory and provide a novel definition of feature relevancy and redundancy in PID terms. From this definition, we show that the conditional mutual information (CMI) maximizes relevancy while minimizing redundancy and propose an iterative, CMI-based algorithm for practical feature selection. We demonstrate the power of our CMI-based algorithm in comparison to the unconditional mutual information on benchmark examples and provide corresponding PID estimates to highlight how PID allows to quantify information contribution of features and their interactions in feature-selection problems.
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我们引入了一种新的经验贝叶斯方法,用于大规模多线性回归。我们的方法结合了两个关键思想:(i)使用灵活的“自适应收缩”先验,该先验近似于正常分布的有限混合物,近似于正常分布的非参数家族; (ii)使用变分近似来有效估计先前的超参数并计算近似后期。将这两个想法结合起来,将快速,灵活的方法与计算速度相当,可与快速惩罚的回归方法(例如Lasso)相当,并在各种场景中具有出色的预测准确性。此外,我们表明,我们方法中的后验平均值可以解释为解决惩罚性回归问题,并通过直接解决优化问题(而不是通过交叉验证来调整)从数据中学到的惩罚函数的精确形式。 。我们的方法是在r https://github.com/stephenslab/mr.ash.ash.alpha的r软件包中实现的
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即使机器学习算法已经在数据科学中发挥了重要作用,但许多当前方法对输入数据提出了不现实的假设。由于不兼容的数据格式,或数据集中的异质,分层或完全缺少的数据片段,因此很难应用此类方法。作为解决方案,我们提出了一个用于样本表示,模型定义和培训的多功能,统一的框架,称为“ Hmill”。我们深入审查框架构建和扩展的机器学习的多个范围范式。从理论上讲,为HMILL的关键组件的设计合理,我们将通用近似定理的扩展显示到框架中实现的模型所实现的所有功能的集合。本文还包含有关我们实施中技术和绩效改进的详细讨论,该讨论将在MIT许可下发布供下载。该框架的主要资产是其灵活性,它可以通过相同的工具对不同的现实世界数据源进行建模。除了单独观察到每个对象的一组属性的标准设置外,我们解释了如何在框架中实现表示整个对象系统的图表中的消息推断。为了支持我们的主张,我们使用框架解决了网络安全域的三个不同问题。第一种用例涉及来自原始网络观察结果的IoT设备识别。在第二个问题中,我们研究了如何使用以有向图表示的操作系统的快照可以对恶意二进制文件进行分类。最后提供的示例是通过网络中实体之间建模域黑名单扩展的任务。在所有三个问题中,基于建议的框架的解决方案可实现与专业方法相当的性能。
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