相关特征的识别，即确定系统的过程或属性的驱动变量，是对具有大量变量的数据集分析的重要组成部分。量化这些特征相关性的数学严格方法是相互信息。相互信息确定特征在其联合相互依赖与感兴趣的财产方面的相关性。但是，相互信息需要作为输入概率分布，这不能可靠地从连续分布（例如长度或能量）等连续分布中估计。在这里，我们介绍了总累积共同信息（TCMI），这是对相互依赖关系的相关性的度量，该信息将相互信息扩展到基于累积概率分布的连续分布的随机变量。 TCMI是一种非参数，鲁棒和确定性的度量，可促进具有不同基数的特征集之间的比较和排名。 TCMI诱导的排名允许特征选择，即，考虑到数据示例的数量以及一组变量集的基数，识别与感兴趣属性的非线性统计学相关的变量集的识别。我们通过模拟数据评估测量的性能，将其性能与类似的多元依赖性度量进行比较，并在一组标准数据集中证明了我们的功能选择方法的有效性以及材料科学中的典型情况。

Selecting a minimal feature set that is maximally informative about a target variable is a central task in machine learning and statistics. Information theory provides a powerful framework for formulating feature selection algorithms -- yet, a rigorous, information-theoretic definition of feature relevancy, which accounts for feature interactions such as redundant and synergistic contributions, is still missing. We argue that this lack is inherent to classical information theory which does not provide measures to decompose the information a set of variables provides about a target into unique, redundant, and synergistic contributions. Such a decomposition has been introduced only recently by the partial information decomposition (PID) framework. Using PID, we clarify why feature selection is a conceptually difficult problem when approached using information theory and provide a novel definition of feature relevancy and redundancy in PID terms. From this definition, we show that the conditional mutual information (CMI) maximizes relevancy while minimizing redundancy and propose an iterative, CMI-based algorithm for practical feature selection. We demonstrate the power of our CMI-based algorithm in comparison to the unconditional mutual information on benchmark examples and provide corresponding PID estimates to highlight how PID allows to quantify information contribution of features and their interactions in feature-selection problems.

This paper proposes a new algorithm for an automatic variable selection procedure in High Dimensional Graphical Models. The algorithm selects the relevant variables for the node of interest on the basis of mutual information. Several contributions in literature have investigated the use of mutual information in selecting the appropriate number of relevant features in a large data-set, but most of them have focused on binary outcomes or required high computational effort. The algorithm here proposed overcomes these drawbacks as it is an extension of Chow and Liu's algorithm. Once, the probabilistic structure of a High Dimensional Graphical Model is determined via the said algorithm, the best path-step, including variables with the most explanatory/predictive power for a variable of interest, is determined via the computation of the entropy coefficient of determination. The latter, being based on the notion of (symmetric) Kullback-Leibler divergence, turns out to be closely connected to the mutual information of the involved variables. The application of the algorithm to a wide range of real-word and publicly data-sets has highlighted its potential and greater effectiveness compared to alternative extant methods.

我们介绍了数据科学预测生命周期中各个阶段开发和采用自动化的技术和文化挑战的说明概述，从而将重点限制为使用结构化数据集的监督学习。此外，我们回顾了流行的开源Python工具，这些工具实施了针对自动化挑战的通用解决方案模式，并突出了我们认为进步仍然需要的差距。

Network-based analyses of dynamical systems have become increasingly popular in climate science. Here we address network construction from a statistical perspective and highlight the often ignored fact that the calculated correlation values are only empirical estimates. To measure spurious behaviour as deviation from a ground truth network, we simulate time-dependent isotropic random fields on the sphere and apply common network construction techniques. We find several ways in which the uncertainty stemming from the estimation procedure has major impact on network characteristics. When the data has locally coherent correlation structure, spurious link bundle teleconnections and spurious high-degree clusters have to be expected. Anisotropic estimation variance can also induce severe biases into empirical networks. We validate our findings with ERA5 reanalysis data. Moreover we explain why commonly applied resampling procedures are inappropriate for significance evaluation and propose a statistically more meaningful ensemble construction framework. By communicating which difficulties arise in estimation from scarce data and by presenting which design decisions increase robustness, we hope to contribute to more reliable climate network construction in the future.

在过去几十年中，已经提出了各种方法，用于估计回归设置中的预测间隔，包括贝叶斯方法，集合方法，直接间隔估计方法和保形预测方法。重要问题是这些方法的校准：生成的预测间隔应该具有预定义的覆盖水平，而不会过于保守。在这项工作中，我们从概念和实验的角度审查上述四类方法。结果来自各个域的基准数据集突出显示从一个数据集中的性能的大波动。这些观察可能归因于违反某些类别的某些方法所固有的某些假设。我们说明了如何将共形预测用作提供不具有校准步骤的方法的方法的一般校准程序。

Variable and feature selection have become the focus of much research in areas of application for which datasets with tens or hundreds of thousands of variables are available. These areas include text processing of internet documents, gene expression array analysis, and combinatorial chemistry. The objective of variable selection is three-fold: improving the prediction performance of the predictors, providing faster and more cost-effective predictors, and providing a better understanding of the underlying process that generated the data. The contributions of this special issue cover a wide range of aspects of such problems: providing a better definition of the objective function, feature construction, feature ranking, multivariate feature selection, efficient search methods, and feature validity assessment methods.

我们介绍了强大的子组发现的问题，即，找到一个关于一个或多个目标属性的脱颖而出的子集的一组可解释的描述，2）是统计上的鲁棒，并且3）非冗余。许多尝试已经挖掘了局部强壮的子组或解决模式爆炸，但我们是第一个从全球建模角度同时解决这两个挑战的爆炸。首先，我们制定广泛的模型类别的子组列表，即订购的子组，可以组成的单次组和多变量目标，该目标可以由标称或数字变量组成，并且包括其定义中的传统Top-1子组发现。这种新颖的模型类允许我们使用最小描述长度（MDL）原理来形式地形化最佳强大的子组发现，在那里我们分别为标称和数字目标的最佳归一化最大可能性和贝叶斯编码而度假。其次，正如查找最佳子组列表都是NP-Hard，我们提出了SSD ++，一个贪婪的启发式，找到了很好的子组列表，并保证了根据MDL标准的最重要的子组在每次迭代中添加，这被显示为等同于贝叶斯一个样本比例，多项式或子组之间的多项式或T检验，以及数据集边际目标分布以及多假设检测罚款。我们经验上显示了54个数据集，即SSD ++优于先前的子组设置发现方法和子组列表大小。

大多数机器学习算法由一个或多个超参数配置，必须仔细选择并且通常会影响性能。为避免耗时和不可递销的手动试验和错误过程来查找性能良好的超参数配置，可以采用各种自动超参数优化（HPO）方法，例如，基于监督机器学习的重新采样误差估计。本文介绍了HPO后，本文审查了重要的HPO方法，如网格或随机搜索，进化算法，贝叶斯优化，超带和赛车。它给出了关于进行HPO的重要选择的实用建议，包括HPO算法本身，性能评估，如何将HPO与ML管道，运行时改进和并行化结合起来。这项工作伴随着附录，其中包含关于R和Python的特定软件包的信息，以及用于特定学习算法的信息和推荐的超参数搜索空间。我们还提供笔记本电脑，这些笔记本展示了这项工作的概念作为补充文件。

This paper proposes a new tree-based ensemble method for supervised classification and regression problems. It essentially consists of randomizing strongly both attribute and cut-point choice while splitting a tree node. In the extreme case, it builds totally randomized trees whose structures are independent of the output values of the learning sample. The strength of the randomization can be tuned to problem specifics by the appropriate choice of a parameter. We evaluate the robustness of the default choice of this parameter, and we also provide insight on how to adjust it in particular situations. Besides accuracy, the main strength of the resulting algorithm is computational efficiency. A bias/variance analysis of the Extra-Trees algorithm is also provided as well as a geometrical and a kernel characterization of the models induced.

我们引入了一种新颖的方式，将增强功能与高斯工艺和混合效应模型相结合。首先，在高斯过程中先前的平均函数的零或线性假设可以放松，并以灵活的非参数方式分组随机效应模型，其次，第二个在大多数增强算法中做出的独立性假设。前者有利于预测准确性和避免模型错误。后者对于有效学习固定效应预测函数和获得概率预测很重要。我们提出的算法也是用于处理培养树木中高心电图分类变量的新颖解决方案。此外，我们提出了一个扩展名，该扩展是使用维奇亚近似为高斯工艺模型缩放到大数据的，该模型依靠新的结果进行协方差参数推断。与几个模拟和现实世界数据集的现有方法相比，我们获得了提高的预测准确性。

无论是在功能选择的领域还是可解释的AI领域，都有基于其重要性的“排名”功能的愿望。然后可以将这种功能重要的排名用于：（1）减少数据集大小或（2）解释机器学习模型。但是，在文献中，这种特征排名没有以系统的，一致的方式评估。许多论文都有不同的方式来争论哪些具有重要性排名最佳的特征。本文通过提出一种新的评估方法来填补这一空白。通过使用合成数据集，可以事先知道特征重要性得分，从而可以进行更系统的评估。为了促进使用新方法的大规模实验，在Python建造了一个名为FSEVAL的基准测定框架。该框架允许并行运行实验，并在HPC系统上的计算机上分布。通过与名为“权重和偏见”的在线平台集成，可以在实时仪表板上进行交互探索图表。该软件作为开源软件发布，并在PYPI平台上以包裹发行。该研究结束时，探索了一个这样的大规模实验，以在许多方面找到参与算法的优势和劣势。

回归模型用于各种应用，为来自不同领域的研究人员提供强大的科学工具。线性或简单的参数，模型通常不足以描述输入变量与响应之间的复杂关系。通过诸如神经网络的灵活方法可以更好地描述这种关系，但这导致不太可解释的模型和潜在的过度装备。或者，可以使用特定的参数非线性函数，但是这种功能的规范通常是复杂的。在本文中，我们介绍了一种灵活的施工方法，高度灵活的非线性参数回归模型。非线性特征是分层的，类似于深度学习，但对要考虑的可能类型的功能具有额外的灵活性。这种灵活性，与变量选择相结合，使我们能够找到一小部分重要特征，从而可以更具可解释的模型。在可能的功能的空间内，考虑了贝叶斯方法，基于它们的复杂性引入功能的前沿。采用遗传修改模式跳跃马尔可夫链蒙特卡罗算法来执行贝叶斯推理和估计模型平均的后验概率。在各种应用中，我们说明了我们的方法如何用于获得有意义的非线性模型。此外，我们将其预测性能与多个机器学习算法进行比较。

Mutual Information (MI) based feature selection makes use of MI to evaluate each feature and eventually shortlists a relevant feature subset, in order to address issues associated with high-dimensional datasets. Despite the effectiveness of MI in feature selection, we notice that many state-of-the-art algorithms disregard the so-called unique relevance (UR) of features, and arrive at a suboptimal selected feature subset which contains a non-negligible number of redundant features. We point out that the heart of the problem is that all these MIBFS algorithms follow the criterion of Maximize Relevance with Minimum Redundancy (MRwMR), which does not explicitly target UR. This motivates us to augment the existing criterion with the objective of boosting unique relevance (BUR), leading to a new criterion called MRwMR-BUR. Depending on the task being addressed, MRwMR-BUR has two variants, termed MRwMR-BUR-KSG and MRwMR-BUR-CLF, which estimate UR differently. MRwMR-BUR-KSG estimates UR via a nearest-neighbor based approach called the KSG estimator and is designed for three major tasks: (i) Classification Performance. (ii) Feature Interpretability. (iii) Classifier Generalization. MRwMR-BUR-CLF estimates UR via a classifier based approach. It adapts UR to different classifiers, further improving the competitiveness of MRwMR-BUR for classification performance oriented tasks. The performance of both MRwMR-BUR-KSG and MRwMR-BUR-CLF is validated via experiments using six public datasets and three popular classifiers. Specifically, as compared to MRwMR, the proposed MRwMR-BUR-KSG improves the test accuracy by 2% - 3% with 25% - 30% fewer features being selected, without increasing the algorithm complexity. MRwMR-BUR-CLF further improves the classification performance by 3.8%- 5.5% (relative to MRwMR), and it also outperforms three popular classifier dependent feature selection methods.

我们考虑了使用显微镜或X射线散射技术产生的图像数据自组装的模型的贝叶斯校准。为了说明BCP平衡结构中的随机远程疾病，我们引入了辅助变量以表示这种不确定性。然而，这些变量导致了高维图像数据的综合可能性，通常可以评估。我们使用基于测量运输的可能性方法以及图像数据的摘要统计数据来解决这一具有挑战性的贝叶斯推理问题。我们还表明，可以计算出有关模型参数的数据中的预期信息收益（EIG），而无需额外的成本。最后，我们介绍了基于二嵌段共聚物薄膜自组装和自上而下显微镜表征的ohta-kawasaki模型的数值案例研究。为了进行校准，我们介绍了一些基于域的能量和傅立叶的摘要统计数据，并使用EIG量化了它们的信息性。我们证明了拟议方法研究数据损坏和实验设计对校准结果的影响的力量。

Function estimation/approximation is viewed from the perspective of numerical optimization in function space, rather than parameter space. A connection is made between stagewise additive expansions and steepestdescent minimization. A general gradient descent "boosting" paradigm is developed for additive expansions based on any fitting criterion. Specific algorithms are presented for least-squares, least absolute deviation, and Huber-M loss functions for regression, and multiclass logistic likelihood for classification. Special enhancements are derived for the particular case where the individual additive components are regression trees, and tools for interpreting such "TreeBoost" models are presented. Gradient boosting of regression trees produces competitive, highly robust, interpretable procedures for both regression and classification, especially appropriate for mining less than clean data. Connections between this approach and the boosting methods of Freund and Shapire and Friedman, Hastie and Tibshirani are discussed.

特征选择是数据科学流水线的重要步骤，以减少与大型数据集相关的复杂性。虽然对本主题的研究侧重于优化预测性能，但很少研究在特征选择过程的上下文中调查稳定性。在这项研究中，我们介绍了重复的弹性网技术（租金）进行特色选择。租金使用具有弹性净正常化的广义线性模型的集合，每个训练都培训了训练数据的不同子集。该特征选择基于三个标准评估所有基本模型的重量分布。这一事实导致选择具有高稳定性的特征，从而提高最终模型的稳健性。此外，与已建立的特征选择器不同，租金提供了有关在训练期间难以预测的数据中难以预测的对象的模型解释的有价值信息。在我们的实验中，我们在八个多变量数据集中对六个已建立的特征选择器进行基准测试，用于二进制分类和回归。在实验比较中，租金在预测性能和稳定之间展示了均衡的权衡。最后，我们强调了租金的额外解释价值与医疗保健数据集的探索性后HOC分析。

这项正在进行的工作旨在为统计学习提供统一的介绍，从诸如GMM和HMM等经典模型到现代神经网络（如VAE和扩散模型）缓慢地构建。如今，有许多互联网资源可以孤立地解释这一点或新的机器学习算法，但是它们并没有（也不能在如此简短的空间中）将这些算法彼此连接起来，或者与统计模型的经典文献相连现代算法出现了。同样明显缺乏的是一个单一的符号系统，尽管对那些已经熟悉材料的人（如这些帖子的作者）不满意，但对新手的入境造成了重大障碍。同样，我的目的是将各种模型（尽可能）吸收到一个用于推理和学习的框架上，表明（以及为什么）如何以最小的变化将一个模型更改为另一个模型（其中一些是新颖的，另一些是文献中的）。某些背景当然是必要的。我以为读者熟悉基本的多变量计算，概率和统计以及线性代数。这本书的目标当然不是​​完整性，而是从基本知识到过去十年中极强大的新模型的直线路径或多或少。然后，目标是补充而不是替换，诸如Bishop的\ emph {模式识别和机器学习}之类的综合文本，该文本现在已经15岁了。

由于其出色的经验表现，随机森林是过去十年中使用的机器学习方法之一。然而，由于其黑框的性质，在许多大数据应用中很难解释随机森林的结果。量化各个特征在随机森林中的实用性可以大大增强其解释性。现有的研究表明，一些普遍使用的特征对随机森林的重要性措施遭受了偏见问题。此外，对于大多数现有方法，缺乏全面的规模和功率分析。在本文中，我们通过假设检验解决了问题，并提出了一个自由化特征 - 弥散性相关测试（事实）的框架，以评估具有偏见性属性的随机森林模型中给定特征的重要性，我们零假设涉及该特征是否与所有其他特征有条件地独立于响应。关于高维随机森林一致性的一些最新发展，对随机森林推断的这种努力得到了赋予的能力。在存在功能依赖性的情况下，我们的事实测试的香草版可能会遇到偏见问题。我们利用偏置校正的不平衡和调节技术。我们通过增强功率的功能转换将合奏的想法进一步纳入事实统计范围。在相当普遍的具有依赖特征的高维非参数模型设置下，我们正式确定事实可以提供理论上合理的随机森林具有P值，并通过非催化分析享受吸引人的力量。新建议的方法的理论结果和有限样本优势通过几个模拟示例和与Covid-19的经济预测应用进行了说明。

度量的运输提供了一种用于建模复杂概率分布的多功能方法，并具有密度估计，贝叶斯推理，生成建模及其他方法的应用。单调三角传输地图$ \ unicode {x2014} $近似值$ \ unicode {x2013} $ rosenblatt（kr）重新安排$ \ unicode {x2014} $是这些任务的规范选择。然而，此类地图的表示和参数化对它们的一般性和表现力以及对从数据学习地图学习（例如，通过最大似然估计）出现的优化问题的属性产生了重大影响。我们提出了一个通用框架，用于通过平滑函数的可逆变换来表示单调三角图。我们建立了有关转化的条件，以使相关的无限维度最小化问题没有伪造的局部最小值，即所有局部最小值都是全球最小值。我们展示了满足某些尾巴条件的目标分布，唯一的全局最小化器与KR地图相对应。鉴于来自目标的样品，我们提出了一种自适应算法，该算法估计了基础KR映射的稀疏半参数近似。我们证明了如何将该框架应用于关节和条件密度估计，无可能的推断以及有向图形模型的结构学习，并在一系列样本量之间具有稳定的概括性能。