在许多科学学科中，我们有兴趣推断一组观察到的时间序列的非线性动力学系统，这是面对混乱的行为和噪音，这是一项艰巨的任务。以前的深度学习方法实现了这一目标，通常缺乏解释性和障碍。尤其是，即使基本动力学生存在较低维的多种多样的情况下，忠实嵌入通常需要的高维潜在空间也会阻碍理论分析。在树突计算的新兴原则的推动下，我们通过线性样条基础扩展增强了动态解释和数学可牵引的分段线性（PL）复发性神经网络（RNN）。我们表明，这种方法保留了简单PLRNN的所有理论上吸引人的特性，但在相对较低的尺寸中提高了其近似任意非线性动态系统的能力。我们采用两个框架来训练该系统，一个将反向传播的时间（BPTT）与教师强迫结合在一起，另一个将基于快速可扩展的变异推理的基础。我们表明，树枝状扩展的PLRNN可以在各种动力学系统基准上获得更少的参数和尺寸，并与其他方法进行比较，同时保留了可拖动和可解释的结构。

Many, if not most, systems of interest in science are naturally described as nonlinear dynamical systems (DS). Empirically, we commonly access these systems through time series measurements, where often we have time series from different types of data modalities simultaneously. For instance, we may have event counts in addition to some continuous signal. While by now there are many powerful machine learning (ML) tools for integrating different data modalities into predictive models, this has rarely been approached so far from the perspective of uncovering the underlying, data-generating DS (aka DS reconstruction). Recently, sparse teacher forcing (TF) has been suggested as an efficient control-theoretic method for dealing with exploding loss gradients when training ML models on chaotic DS. Here we incorporate this idea into a novel recurrent neural network (RNN) training framework for DS reconstruction based on multimodal variational autoencoders (MVAE). The forcing signal for the RNN is generated by the MVAE which integrates different types of simultaneously given time series data into a joint latent code optimal for DS reconstruction. We show that this training method achieves significantly better reconstructions on multimodal datasets generated from chaotic DS benchmarks than various alternative methods.

物理学，生物学或医学中的经验观察时间序列通常由一些潜在的动态系统（DS）产生，这是科学兴趣的目标。收获机器学习方法越来越兴趣，以完全数据驱动，无人监督的方式重建这种潜在的DS。在许多科学领域，通常可以同时采样时间序列观察，例如，从许多数据模式中进行采样时间序列观察。典型神经科学实验中的电生理和行为时间序列。然而，用于重建DSS的当前机器学习工具通常只关注一个数据模型。在这里，我们提出了一种用于非线性DS识别和跨模态预测的多模态数据集成的一般框架。该框架基于动态可解释的复发性神经网络作为非线性DS的一般近似器，耦合到来自广义线性模型类的模态特定解码器模型集。预期最大化和模型培训的变分推理算法都是先进的和比较。我们在非线性DS基准上展示了我们的算法通过利用其他频道，我们的算法可以有效地补偿一个数据信道中的太吵或丢失的信息，并在实验神经科学数据上演示算法如何将不同的数据域链接到底层动态

复发性神经网络（RNN）是用于建模顺序和时间序列数据的广泛机器学习工具。众所周知，他们很难训练，因为他们的损失梯度在训练过程中倾向于饱和或差异。这被称为爆炸和消失的梯度问题。对该问题的先前解决方案要么建立在具有门控内存缓冲区的相当复杂的，专门设计的体系结构上，要么 - 最近 - 施加的约束，以确保收敛到固定点或限制（限制复发矩阵）。然而，这种限制传达了对RNN表现性的严重局限性。绝对的内在动态（例如多稳定性或混乱）被禁用。这本质上是在大自然和社会中遇到的许多（如果不是大多数时间）的混乱性质的脱节性。在科学应用中，尤其是一个旨在重建基本动力学系统的科学应用程序。在这里，我们通过将RNN培训期间的损耗梯度与RNN生成的轨道的lyapunov谱相关联，对该问题提供了全面的理论处理。我们从数学上证明，产生稳定平衡或环状行为的RNN具有有限的梯度，而混沌动力学的RNN梯度总是不同。基于这些分析和见解，我们建议如何根据系统的Lyapunov Spectrum，如何优化混乱数据的训练过程，无论使用的RNN架构如何。

在许多学科中，动态系统的数据信息预测模型的开发引起了广泛的兴趣。我们提出了一个统一的框架，用于混合机械和机器学习方法，以从嘈杂和部分观察到的数据中识别动态系统。我们将纯数据驱动的学习与混合模型进行比较，这些学习结合了不完善的域知识。我们的公式与所选的机器学习模型不可知，在连续和离散的时间设置中都呈现，并且与表现出很大的内存和错误的模型误差兼容。首先，我们从学习理论的角度研究无内存线性（W.R.T.参数依赖性）模型误差，从而定义了过多的风险和概括误差。对于沿阵行的连续时间系统，我们证明，多余的风险和泛化误差都通过与T的正方形介于T的术语（指定训练数据的时间间隔）的术语界定。其次，我们研究了通过记忆建模而受益的方案，证明了两类连续时间复发性神经网络（RNN）的通用近似定理：两者都可以学习与内存有关的模型误差。此外，我们将一类RNN连接到储层计算，从而将学习依赖性错误的学习与使用随机特征在Banach空间之间进行监督学习的最新工作联系起来。给出了数值结果（Lorenz '63，Lorenz '96多尺度系统），以比较纯粹的数据驱动和混合方法，发现混合方法较少，渴望数据较少，并且更有效。最后，我们从数值上证明了如何利用数据同化来从嘈杂，部分观察到的数据中学习隐藏的动态，并说明了通过这种方法和培训此类模型来表示记忆的挑战。

神经网络的经典发展主要集中在有限维欧基德空间或有限组之间的学习映射。我们提出了神经网络的概括，以学习映射无限尺寸函数空间之间的运算符。我们通过一类线性积分运算符和非线性激活函数的组成制定运营商的近似，使得组合的操作员可以近似复杂的非线性运算符。我们证明了我们建筑的普遍近似定理。此外，我们介绍了四类运算符参数化：基于图形的运算符，低秩运算符，基于多极图形的运算符和傅里叶运算符，并描述了每个用于用每个计算的高效算法。所提出的神经运营商是决议不变的：它们在底层函数空间的不同离散化之间共享相同的网络参数，并且可以用于零击超分辨率。在数值上，与现有的基于机器学习的方法，达西流程和Navier-Stokes方程相比，所提出的模型显示出卓越的性能，而与传统的PDE求解器相比，与现有的基于机器学习的方法有关的基于机器学习的方法。

这是一门专门针对STEM学生开发的介绍性机器学习课程。我们的目标是为有兴趣的读者提供基础知识，以在自己的项目中使用机器学习，并将自己熟悉术语作为进一步阅读相关文献的基础。在这些讲义中，我们讨论受监督，无监督和强化学习。注释从没有神经网络的机器学习方法的说明开始，例如原理分析，T-SNE，聚类以及线性回归和线性分类器。我们继续介绍基本和先进的神经网络结构，例如密集的进料和常规神经网络，经常性的神经网络，受限的玻尔兹曼机器，（变性）自动编码器，生成的对抗性网络。讨论了潜在空间表示的解释性问题，并使用梦和对抗性攻击的例子。最后一部分致力于加强学习，我们在其中介绍了价值功能和政策学习的基本概念。

这本数字本书包含在物理模拟的背景下与深度学习相关的一切实际和全面的一切。尽可能多，所有主题都带有Jupyter笔记本的形式的动手代码示例，以便快速入门。除了标准的受监督学习的数据中，我们将看看物理丢失约束，更紧密耦合的学习算法，具有可微分的模拟，以及加强学习和不确定性建模。我们生活在令人兴奋的时期：这些方法具有从根本上改变计算机模拟可以实现的巨大潜力。

物理信息的神经网络（PINN）是神经网络（NNS），它们作为神经网络本身的组成部分编码模型方程，例如部分微分方程（PDE）。如今，PINN是用于求解PDE，分数方程，积分分化方程和随机PDE的。这种新颖的方法已成为一个多任务学习框架，在该框架中，NN必须在减少PDE残差的同时拟合观察到的数据。本文对PINNS的文献进行了全面的综述：虽然该研究的主要目标是表征这些网络及其相关的优势和缺点。该综述还试图将出版物纳入更广泛的基于搭配的物理知识的神经网络，这些神经网络构成了香草·皮恩（Vanilla Pinn）以及许多其他变体，例如物理受限的神经网络（PCNN），各种HP-VPINN，变量HP-VPINN，VPINN，VPINN，变体。和保守的Pinn（CPINN）。该研究表明，大多数研究都集中在通过不同的激活功能，梯度优化技术，神经网络结构和损耗功能结构来定制PINN。尽管使用PINN的应用范围广泛，但通过证明其在某些情况下比有限元方法（FEM）等经典数值技术更可行的能力，但仍有可能的进步，最著名的是尚未解决的理论问题。

像长期短期内存网络（LSTMS）和门控复发单元（GRUS）相同的经常性神经网络（RNN）是建模顺序数据的流行选择。它们的门控机构允许以来自传入观测的新信息在隐藏状态中编码的先前历史。在许多应用程序中，例如医疗记录，观察时间是不规则的并且携带重要信息。然而，LSTM和GRUS在观察之间假设恒定的时间间隔。为了解决这一挑战，我们提出了连续的经常性单位（CRU）-A神经结构，可以自然地处理观察之间的不规则时间间隔。 CRU的浇注机制采用卡尔曼滤波器的连续制剂，并且根据线性随机微分方程（SDE）和（2）潜伏状态在新观察进入时，在（1）之间的连续潜在传播之间的交替。在实证研究，我们表明CRU可以比神经常规差分方程（神经颂歌）的模型更好地插值不规则时间序列。我们还表明，我们的模型可以从IM-AGES推断动力学，并且卡尔曼有效地单挑出候选人的候选人，从而从嘈杂的观察中获得有价值的状态更新。

动态模型是我们理解和预测自然系统行为的能力。无论是从第一原理推导还是从观察数据开发的动力模型，它们都基于我们选择状态变量。状态变量的选择是由便利性和直觉驱动的，在数据​​驱动的情况下，观察到的变量通常被选择为状态变量。这些变量的维度（以及动态模型）可以任意大，从而掩盖了系统的基本行为。实际上，这些变量通常是高度冗余的，并且该系统是由一组潜在的内在变量集驱动的。在这项研究中，我们将流形的数学理论与神经网络的代表能力相结合，以开发一种方法，该方法直接从时间序列数据中学习了系统的内在状态变量，还可以学习其动力学的预测模型。我们方法的区别在于，它有能力将数据减少到其居住的非线性流形的固有维度。从流形理论中的图表和地图集的概念可以实现这种能力，从而使歧管由缝制在一起的贴片的集合表示，这是获得内在维度的必要表示。我们在几个具有低维行为的高维系统上证明了这种方法。最终的框架提供了开发最低维度的动态模型的能力，从而捕获了系统的本质。

经常性神经网络（RNNS）是强大的动态模型，广泛用于机器学习（ML）和神经科学。之前的理论作品集中在具有添加剂相互作用的RNN上。然而，门控 - 即乘法 - 相互作用在真神经元中普遍存在，并且也是ML中最佳性能RNN的中心特征。在这里，我们表明Gating提供灵活地控制集体动态的两个突出特征：i）时间尺寸和ii）维度。栅极控制时间尺度导致新颖的稳定状态，网络用作灵活积分器。与以前的方法不同，Gating允许这种重要功能而没有参数微调或特殊对称。门还提供一种灵活的上下文相关机制来重置存储器跟踪，从而补充存储器功能。调制维度的栅极可以诱导新颖的不连续的混沌转变，其中输入将稳定的系统推向强的混沌活动，与通常稳定的输入效果相比。在这种转变之上，与添加剂RNN不同，关键点（拓扑复杂性）的增殖与混沌动力学的外观解耦（动态复杂性）。丰富的动态总结在相图中，从而为ML从业者提供了一个原理参数初始化选择的地图。

预测性编码提供了对皮质功能的潜在统一说明 - 假设大脑的核心功能是最小化有关世界生成模型的预测错误。该理论与贝叶斯大脑框架密切相关，在过去的二十年中，在理论和认知神经科学领域都产生了重大影响。基于经验测试的预测编码的改进和扩展的理论和数学模型，以及评估其在大脑中实施的潜在生物学合理性以及该理论所做的具体神经生理学和心理学预测。尽管存在这种持久的知名度，但仍未对预测编码理论，尤其是该领域的最新发展进行全面回顾。在这里，我们提供了核心数学结构和预测编码的逻辑的全面综述，从而补充了文献中最新的教程。我们还回顾了该框架中的各种经典和最新工作，从可以实施预测性编码的神经生物学现实的微电路到预测性编码和广泛使用的错误算法的重新传播之间的紧密关系，以及对近距离的调查。预测性编码和现代机器学习技术之间的关系。

神经普通微分方程模型的动态系统，\ textit {ode}由神经网络学习。但是，ODE从根本上是不足以建模具有长期依赖性或不连续性的系统，这些系统在工程和生物系统中很常见。已经提出了更广泛的微分方程（DE）类作为补救措施，包括延迟微分方程和整数差异方程。此外，当通过分段强迫函数对硬质量和odes进行建模时，神经颂歌会遭受数值的不稳定性。在这项工作中，我们提出了\ textit {neural laplace}，这是一个学习不同类别的统一框架，包括上述所有类别。我们没有在时间域中对动态进行建模，而是在拉普拉斯域中对其进行建模，在拉普拉斯域中，可以将历史依赖性和时间的不连续性表示为复杂指数的求和。为了提高学习效率，我们使用Riemann Sphere的几何立体图来诱导Laplace域中的平滑度。在实验中，神经拉普拉斯在建模和推断DES类别的轨迹方面表现出卓越的性能，包括具有复杂历史依赖性和突然变化的DES类别。

我们建议采用统计回归作为投影操作员，以使数据驱动以数据为基础的Mori-Zwanzig形式主义中的运营商学习。我们提出了一种原则性方法，用于为任何回归模型提取Markov和内存操作员。我们表明，线性回归的选择导致了基于Mori的投影操作员最近提出的数据驱动的学习算法，这是一种高阶近似Koopman学习方法。我们表明，更具表现力的非线性回归模型自然填补了高度理想化和计算有效的MORI投影操作符和最佳迄今为止计算上最佳的Zwanzig投影仪之间的差距。我们进行了数值实验，并提取了一系列基于回归的投影的运算符，包括线性，多项式，样条和基于神经网络的回归，随着回归模型的复杂性的增加而显示出渐进的改进。我们的命题提供了一个通用框架来提取内存依赖性校正，并且可以轻松地应用于文献中固定动力学系统的一系列数据驱动的学习方法。

众所周知，混乱的系统对预测的挑战是挑战，因为它们对时间的敏感性和由于阶梯时间而引起的错误和错误。尽管这种不可预测的行为，但对于许多耗散系统，长期轨迹的统计数据仍受到一套被称为全球吸引子的不变措施的管辖。对于许多问题，即使状态空间是无限的维度，该集合是有限维度的。对于马尔可夫系统，长期轨迹的统计特性由解决方案操作员唯一确定，该解决方案操作员将系统的演变映射到任意正时间增量上。在这项工作中，我们提出了一个机器学习框架，以学习耗散混沌系统的基础解决方案操作员，这表明所得的学习操作员准确地捕获了短期轨迹和长期统计行为。使用此框架，我们能够预测湍流Kolmogorov流动动力学的各种统计数据，雷诺数为5000。

Normalizing flows provide a general mechanism for defining expressive probability distributions, only requiring the specification of a (usually simple) base distribution and a series of bijective transformations. There has been much recent work on normalizing flows, ranging from improving their expressive power to expanding their application. We believe the field has now matured and is in need of a unified perspective. In this review, we attempt to provide such a perspective by describing flows through the lens of probabilistic modeling and inference. We place special emphasis on the fundamental principles of flow design, and discuss foundational topics such as expressive power and computational trade-offs. We also broaden the conceptual framing of flows by relating them to more general probability transformations. Lastly, we summarize the use of flows for tasks such as generative modeling, approximate inference, and supervised learning.

The success of machine learning algorithms generally depends on data representation, and we hypothesize that this is because different representations can entangle and hide more or less the different explanatory factors of variation behind the data. Although specific domain knowledge can be used to help design representations, learning with generic priors can also be used, and the quest for AI is motivating the design of more powerful representation-learning algorithms implementing such priors. This paper reviews recent work in the area of unsupervised feature learning and deep learning, covering advances in probabilistic models, auto-encoders, manifold learning, and deep networks. This motivates longer-term unanswered questions about the appropriate objectives for learning good representations, for computing representations (i.e., inference), and the geometrical connections between representation learning, density estimation and manifold learning.

基于近似基础的Koopman操作员或发电机的数据驱动的非线性动力系统模型已被证明是预测，功能学习，状态估计和控制的成功工具。众所周知，用于控制膜系统的Koopman发电机还对输入具有仿射依赖性，从而导致动力学的方便有限维双线性近似。然而，仍然存在两个主要障碍，限制了当前方法的范围，以逼近系统的koopman发电机。首先，现有方法的性能在很大程度上取决于要近似Koopman Generator的基础函数的选择；目前，目前尚无通用方法来为无法衡量保存的系统选择它们。其次，如果我们不观察到完整的状态，我们可能无法访问足够丰富的此类功能来描述动态。这是因为在有驱动时，通常使用时间延迟的可观察物的方法失败。为了解决这些问题，我们将Koopman Generator控制的可观察到的动力学写为双线性隐藏Markov模型，并使用预期最大化（EM）算法确定模型参数。 E-Step涉及标准的Kalman滤波器和更光滑，而M-Step类似于发电机的控制效果模式分解。我们在三个示例上证明了该方法的性能，包括恢复有限的Koopman-Invariant子空间，用于具有缓慢歧管的驱动系统；估计非强制性行驶方程的Koopman本征函数；仅基于提升和阻力的嘈杂观察，对流体弹球系统的模型预测控制。

我们介绍了一个名为统计信息的神经网络（SINN）的机器学习框架，用于从数据中学习随机动力学。从理论上讲，这种新的架构是受到随机系统的通用近似定理的启发，我们在本文中介绍了它，以及用于随机建模的投影手术形式。我们设计了训练神经网络模型的机制，以重现目标随机过程的正确\ emph {统计}行为。数值模拟结果表明，受过良好训练的SINN可以可靠地近似马尔可夫和非马克维亚随机动力学。我们证明了SINN对粗粒问题和过渡动力学的建模的适用性。此外，我们表明可以在时间粗粒的数据上训练所获得的减少阶模型，因此非常适合稀有事实模拟。