自动睡眠评分对于诊断和治疗睡眠障碍至关重要,并在家庭环境中实现纵向睡眠跟踪。通常,对单渠道脑电图(EEG)进行基于学习的自动睡眠评分是积极研究的,因为困难在睡眠过程中获得多通道信号。但是,由于以下问题,来自原始脑电图信号的学习表示形式挑战:1)与睡眠相关的脑电图模式发生在不同的时间和频率尺度上,2)睡眠阶段共享相似的脑电图模式。为了解决这些问题,我们提出了一个名为Sleepyco的深度学习框架,该框架结合了1)功能金字塔和2)自动睡眠评分的监督对比度学习。对于特征金字塔,我们提出了一个名为sleepyco-backbone的骨干网络,以考虑在不同的时间和频率尺度上的多个特征序列。监督的对比学习允许网络通过最大程度地降低类内部特征之间的距离并同时最大程度地提高阶层间特征之间的距离来提取类别特征。对四个公共数据集的比较分析表明,Sleepyco始终优于基于单渠道EEG的现有框架。广泛的消融实验表明,Sleepyco表现出增强的总体表现,N1和快速眼运动(REM)阶段之间的歧视有了显着改善。
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近年来,深度学习显示了广泛区域的潜力和效率,包括计算机视觉,图像和信号处理。然而,由于缺乏算法决策和结果的解释性,用户应用程序仍然存在转化挑战。这个黑匣子问题对于高风险应用程序(例如与医疗相关的决策制定)尤其有问题。当前的研究目标是设计一个可解释的深度学习系统,用于对脑电图的时间序列分类(EEG)进行睡眠阶段评分,以此作为设计透明系统的一步。我们已经开发了一个可解释的深神经网络,该网络包括基于内核的层,该层是基于人类专家在视觉分析记录的视觉分析中用于睡眠评分的一组原理。将基于内核的卷积层定义并用作系统的第一层,并可用于用户解释。训练有素的系统及其结果从脑电图信号的微观结构(例如训练的内核)以及每个内核对检测到的阶段的效果,宏观结构(例如阶段之间的过渡)中解释了四个级别。拟议的系统表现出比先前的研究更大的性能,而解释的结果表明,该系统学习了与专家知识一致的信息。
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本文提出了一个新颖的框架,以根据权威的睡眠医学指导自动捕获人睡眠的脑电图(EEG)信号的时间频率。该框架由两个部分组成:第一部分通过将输入EEG频谱图将其划分为一系列时频贴片来提取信息特征。第二部分是由基于注意力的体系结构有效地搜索分配的时频贴片和并行睡眠阶段定义因素之间的相关性构成的。拟议的管道在Sleep Heart Health研究数据集上进行了验证,其阶段唤醒,N2和N3的新最新结果获得了相应的F1分数为0.93、0.88和0.87,仅使用EEG信号。该提出的方法还具有高评分者间可靠性为0.80 kappa。我们还可以看到睡眠分期决策与提出方法提取的特征之间的对应关系,为我们的模型提供了强大的解释性。
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准确的睡眠阶段分类对于睡眠健康评估很重要。近年来,已经开发了几种基于深度学习和机器学习的睡眠阶段算法,并且在人类注释方面取得了表现。尽管性能提高,但最深入学习算法的局限性是其黑盒行为,它限制了它们在临床环境中的使用。在这里,我们提出了跨模式变压器,这是一种基于变压器的睡眠阶段分类的方法。我们的模型通过最先进的方法实现了竞争性能,并通过利用注意模块的可解释性方面消除了深度学习模型的黑盒行为。提出的跨模式变压器由一种新型的跨模式变压器编码器结构以及多尺度的一维卷积神经网络组成,用于自动表示学习。基于此设计的我们的睡眠阶段分类器能够以与最先进的方法相同或更好地达到睡眠阶段分类性能,以及可解释性,参数数量减少了四倍,并且比较培训时间减少了。到当前的最新。我们的代码可从https://github.com/jathurshan0330/cross-modal-transformer获得。
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基于电动机图像(MI)的脑电脑界面(BCIS)允许通过解码神经生理现象来控制几种应用,这些现象通常通过使用非侵入性技术被脑电图(EEG)记录。尽管在基于MI的BCI的进展方面很大,但脑电图有特定于受试者和各种变化随时间。这些问题指出了提高分类绩效的重大挑战,特别是在独立的方式。为了克服这些挑战,我们提出了Min2Net,这是一个新的端到端多任务学习来解决这项任务。我们将深度度量学习集成到多任务AutoEncoder中,以从脑电图中学习紧凑且识别的潜在表示,并同时执行分类。这种方法降低了预处理的复杂性,导致EEG分类的显着性能改善。实验结果以本语独立的方式表明,MIN2Net优于最先进的技术,在SMR-BCI和OpenBMI数据集中分别实现了6.72%的F1分数提高,以及2.23%。我们证明MIN2NET在潜在代表中提高了歧视信息。本研究表明使用此模型的可能性和实用性为新用户开发基于MI的BCI应用,而无需校准。
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在过去的几年中,自动睡眠评分的研究主要集中在开发日益复杂的深度学习体系结构上。但是,最近,这些方法仅实现了边际改进,通常以需要更多数据和更昂贵的培训程序为代价。尽管所有这些努力及其令人满意的表现,但在临床背景下,自动睡眠期临时解决方案并未被广泛采用。我们认为,由于很难训练,部署和繁殖,大多数对睡眠评分的深度学习解决方案在现实世界中的适用性受到限制。此外,这些解决方案缺乏可解释性和透明度,这通常是提高采用率的关键。在这项工作中,我们使用经典的机器学习来重新审视睡眠阶段分类的问题。结果表明,通过传统的机器学习管道可以实现最新的性能,该管道包括预处理,功能提取和简单的机器学习模型。特别是,我们分析了线性模型和非线性(梯度提升)模型的性能。我们的方法超过了两个公共数据集上的最新方法(使用相同的数据):Sleep--EDF SC-20(MF1 0.810)和Sleep-eDF ST(MF1 0.795),同时在Sleep-eDF上取得了竞争成果SC-78(MF1 0.775)和质量SS3(MF1 0.817)。我们表明,对于睡眠阶段评分任务,工程特征向量的表现力与深度学习模型的内部学表现相当。该观察结果为临床采用打开了大门,因为代表性功能向量允许利用传统机器学习模型的可解释性和成功记录。
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眼目光信息的收集为人类认知,健康和行为的许多关键方面提供了一个窗口。此外,许多神经科学研究补充了从眼睛跟踪中获得的行为信息,以及脑电图(EEG)提供的高时间分辨率和神经生理学标记。必不可少的眼睛跟踪软件处理步骤之一是将连续数据流的分割为与扫视,固定和眨眼等眼睛跟踪应用程序相关的事件。在这里,我们介绍了Detrtime,这是一个新颖的时间序列分割框架,该框架创建了不需要额外记录的眼睛跟踪模式并仅依靠脑电图数据的眼部事件检测器。我们的端到端基于深度学习的框架将计算机视觉的最新进展带到了脑电图数据的《时代》系列分割的最前沿。 Detr Time在各种眼睛追踪实验范式上实现眼部事件检测中的最新性能。除此之外,我们还提供了证据表明我们的模型在脑电图阶段分割的任务中很好地概括了。
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睡眠是一种基本的生理过程,对于维持健康的身心至关重要。临床睡眠监测的黄金标准是多核桃摄影(PSG),基于哪个睡眠可以分为五个阶段,包括尾脉冲睡眠(REM睡眠)/非REM睡眠1(N1)/非REM睡眠2 (n2)/非REM睡眠3(n3)。然而,PSG昂贵,繁重,不适合日常使用。对于长期睡眠监测,无处不在的感测可以是解决方案。最近,心脏和运动感测在分类三阶段睡眠方面变得流行,因为两种方式都可以从研究级或消费者级设备中获得(例如,Apple Watch)。但是,为最大准确性融合数据的最佳仍然是一个打开的问题。在这项工作中,我们综合地研究了深度学习(DL)的高级融合技术,包括三种融合策略,三个融合方法以及三级睡眠分类,基于两个公共数据集。实验结果表明,通过融合心脏/运动传感方式可以可靠地分类三阶段睡眠,这可能成为在睡眠中进行大规模睡眠阶段评估研究或长期自动跟踪的实用工具。为了加快普遍存在/可穿戴计算社区的睡眠研究的进展,我们制作了该项目开源,可以在:https://github.com/bzhai/ubi-sleepnet找到代码。
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Seizure type identification is essential for the treatment and management of epileptic patients. However, it is a difficult process known to be time consuming and labor intensive. Automated diagnosis systems, with the advancement of machine learning algorithms, have the potential to accelerate the classification process, alert patients, and support physicians in making quick and accurate decisions. In this paper, we present a novel multi-path seizure-type classification deep learning network (MP-SeizNet), consisting of a convolutional neural network (CNN) and a bidirectional long short-term memory neural network (Bi-LSTM) with an attention mechanism. The objective of this study was to classify specific types of seizures, including complex partial, simple partial, absence, tonic, and tonic-clonic seizures, using only electroencephalogram (EEG) data. The EEG data is fed to our proposed model in two different representations. The CNN was fed with wavelet-based features extracted from the EEG signals, while the Bi-LSTM was fed with raw EEG signals to let our MP-SeizNet jointly learns from different representations of seizure data for more accurate information learning. The proposed MP-SeizNet was evaluated using the largest available EEG epilepsy database, the Temple University Hospital EEG Seizure Corpus, TUSZ v1.5.2. We evaluated our proposed model across different patient data using three-fold cross-validation and across seizure data using five-fold cross-validation, achieving F1 scores of 87.6% and 98.1%, respectively.
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目的:在本文中,我们旨在从大量未标记的脑电图(EEG)信号中学习强大的向量表示,以使学习的表示(1)表现得足以替代睡眠分期任务中的原始信号; (2)在较少的标签和嘈杂样本的情况下,提供了比监督模型更好的预测性能。材料和方法:我们提出了一个自我监督的模型,称为与世界表示形式(Contrawr)相比,用于EEG信号表示学习,该模型使用数据集中的全局统计信息来区分与不同睡眠阶段相关的信号。在包括在家中的三个现实世界EEG数据集上评估了Contrawr模型,这些模型既包括在家中录制设置。结果:Contrawr在三个数据集中的睡眠登台任务上,Moco,Simclr,Byol,Simsiam胜过最新的自我监督学习方法。当可用的培训标签较少时,Contrawr还会击败受监督的学习(例如,标记不到2%的数据时,精度提高了4%)。此外,该模型在2D投影中提供了信息表示。讨论:建议的模型可以推广到其他无监督的生理信号学习任务。未来的方向包括探索特定于任务的数据增强,并将自我监督与监督方法结合起来,这是基于本文自我监督学习的最初成功。结论:我们表明,Contrawr对噪声是强大的,并且可以为下游预测任务提供高质量的EEG表示。在低标签场景(例如,只有2%的数据具有标签),Contrawr的预测能力(例如,睡眠分期准确性提高了4%)比监督的基线要好得多。
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尽管最近对成人自动睡眠分期进行了巨大进展,但目前是未知的,如果最先进的算法概括为儿科人群,这在过夜多核心摄影(PSG)中显示出独特的特征。为了回答这个问题,在这项工作中,我们对儿科自动睡眠分期的最先进的深层学习方法进行了大规模比较研究。采用各种具有发散特征的六种不同的深神经网络的选择来评估超过1,200名儿童的样品,横跨宽度的阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)严重程度。我们的实验结果表明,在新科目评估时自动儿科睡眠滞高器的个性表现相当于在成人报告的专家级。将六个级别与集合模型相结合,进一步提高了暂存精度,达到了87.7%的整体准确性,一个0.837的Cohen的Kappa,在新科目评估时,单通道EEG的宏观F1分数为84.2%。当使用双通道EEG $ \ CDOT $ EOT时,达到88.8%的准确性,即0.852的精度,宏观F1分数为85.8%时,该性能进一步提高。同时,集合模型导致预测性不确定性降低。结果还表明,当训练和测试数据分开和临床干预后7个月记录7个月时,研究了算法及其集合对于概念漂移是强大的。详细分析进一步展示了自动分级彼此之间的“几乎完美”协议及其在分期错误上的类似模式。
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The classification of sleep stages plays a crucial role in understanding and diagnosing sleep pathophysiology. Sleep stage scoring relies heavily on visual inspection by an expert that is time consuming and subjective procedure. Recently, deep learning neural network approaches have been leveraged to develop a generalized automated sleep staging and account for shifts in distributions that may be caused by inherent inter/intra-subject variability, heterogeneity across datasets, and different recording environments. However, these networks ignore the connections among brain regions, and disregard the sequential connections between temporally adjacent sleep epochs. To address these issues, this work proposes an adaptive product graph learning-based graph convolutional network, named ProductGraphSleepNet, for learning joint spatio-temporal graphs along with a bidirectional gated recurrent unit and a modified graph attention network to capture the attentive dynamics of sleep stage transitions. Evaluation on two public databases: the Montreal Archive of Sleep Studies (MASS) SS3; and the SleepEDF, which contain full night polysomnography recordings of 62 and 20 healthy subjects, respectively, demonstrates performance comparable to the state-of-the-art (Accuracy: 0.867;0.838, F1-score: 0.818;0.774 and Kappa: 0.802;0.775, on each database respectively). More importantly, the proposed network makes it possible for clinicians to comprehend and interpret the learned connectivity graphs for sleep stages.
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目的:开发和验证一种自动化方法,用于对新生儿重症监护病房中睡眠状态波动的床旁监测。方法:基于深度学习的算法是使用30个近期新生儿的长期(a)脑电图监测的53个EEG录音设计和训练的。使用来自30个多摄影记录的外部数据集对结果进行了验证。除了训练和验证单个脑电图通道安静的睡眠探测器外,我们还构建了睡眠状态趋势(SST),这是一种可视化分类器输出的床旁准备手段。结果:训练数据中安静的睡眠检测的准确性为90%,在4电极记录中获得的所有双极派生中,精度是可比的(85-86%)。该算法很好地概括了外部数据集,尽管信号推导不同,但仍显示81%的总体精度。 SST允许对分类器输出的直观,清晰可视化。结论:可以从单个EEG通道的高保真度中检测到睡眠状态的波动,并且可以将结果可视化为床边监视器中透明和直观的趋势。意义:睡眠状态趋势(SST)可以为护理人员提供对睡眠状态波动及其周期性的实时视图。
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学习时间序列表示只有未标记的数据或几个标签样本可用时,可能是一项具有挑战性的任务。最近,通过对比,通过对比的不同数据观点从未标记的数据中提取有用的表示形式方面,对对比的自我监督学习表现出了很大的改进。在这项工作中,我们通过时间和上下文对比(TS-TCC)提出了一个新颖的时间序列表示学习框架,该框架从未标记的数据中学习了具有对比性学习的无标记数据的表示。具体而言,我们建议时间序列特定的弱和强大的增强,并利用他们的观点在拟议的时间对比模块中学习稳健的时间关系,除了通过我们提出的上下文对比模块学习判别性表示。此外,我们对时间序列数据增强选择进行系统研究,这是对比度学习的关键部分。我们还将TS-TCC扩展到了半监督的学习设置,并提出了一种类感知的TS-TCC(CA-TCC),从可用的少数标​​记数据中受益,以进一步改善TS-TCC学到的表示。具体而言,我们利用TS-TCC生成的强大伪标签来实现班级感知的对比损失。广泛的实验表明,对我们提议的框架所学的功能的线性评估与完全监督的培训相当。此外,我们的框架在少数标记的数据和转移学习方案中显示出高效率。该代码可在\ url {https://github.com/emadeldeen24/ts-tcc}上公开获得。
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AASM准则是为了有一种常用的方法,旨在标准化睡眠评分程序的数十年努力的结果。该指南涵盖了从技术/数字规格(例如,推荐的EEG推导)到相应的详细睡眠评分规则到年龄的几个方面。在睡眠评分自动化的背景下,与许多其他技术相比,深度学习表现出更好的性能。通常,临床专业知识和官方准则对于支持自动睡眠评分算法在解决任务时至关重要。在本文中,我们表明,基于深度学习的睡眠评分算法可能不需要充分利用临床知识或严格遵循AASM准则。具体而言,我们证明了U-Sleep是一种最先进的睡眠评分算法,即使使用临床非申请或非规定派生,也可以解决得分任务,即使无需利用有关有关的信息,也无需利用有关有关的信息。受试者的年代年龄。我们最终加强了一个众所周知的发现,即使用来自多个数据中心的数据始终导致与单个队列上的培训相比,可以使性能更好。确实,我们表明,即使增加了单个数据队列的大小和异质性,后者仍然有效。在我们的所有实验中,我们使用了来自13个不同临床研究的28528多个多摄影研究研究。
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近年来,基于脑电图的情绪识别的进步已受到人机相互作用和认知科学领域的广泛关注。但是,如何用有限的标签识别情绪已成为一种新的研究和应用瓶颈。为了解决这个问题,本文提出了一个基于人类中刺激一致的脑电图信号的自我监督组减数分裂对比学习框架(SGMC)。在SGMC中,开发了一种新型遗传学启发的数据增强方法,称为减数分裂。它利用了组中脑电图样品之间的刺激对齐,通过配对,交换和分离来生成增强组。该模型采用组投影仪,从相同的情感视频刺激触发的脑电图样本中提取组级特征表示。然后,使用对比度学习来最大程度地提高具有相同刺激的增强群体的组级表示的相似性。 SGMC在公开可用的DEAP数据集上实现了最先进的情感识别结果,其价值为94.72%和95.68%的价和唤醒维度,并且在公共种子数据集上的竞争性能也具有94.04的竞争性能。 %。值得注意的是,即使使用有限的标签,SGMC也会显示出明显的性能。此外,功能可视化的结果表明,该模型可能已经学习了与情感相关的特征表示,以改善情绪识别。在超级参数分析中进一步评估了组大小的影响。最后,进行了对照实验和消融研究以检查建筑的合理性。该代码是在线公开提供的。
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目的:脑电图(EEG)和肌电图(EMG)是两个非侵入性的生物信号,它们在人类机器界面(HMI)技术(EEG-HMI和EMG-HMI范式)中广泛用于康复,用于康复的物理残疾人。将脑电图和EMG信号成功解码为各自的控制命令是康复过程中的关键步骤。最近,提出了几个基于卷积的神经网络(CNN)架构,它们直接将原始的时间序列信号映射到决策空间中,并同时执行有意义的特征提取和分类的过程。但是,这些网络是根据学习给定生物信号的预期特征量身定制的,并且仅限于单个范式。在这项工作中,我们解决了一个问题,即我们可以构建一个单个体系结构,该架构能够从不同的HMI范式中学习不同的功能并仍然成功地对其进行分类。方法:在这项工作中,我们引入了一个称为Controanet的单个混合模型,该模型基于CNN和Transformer架构,该模型对EEG-HMI和EMG-HMI范式同样有用。 Contranet使用CNN块在模型中引入电感偏置并学习局部依赖性,而变压器块则使用自我注意机制来学习信号中的长距离依赖性,这对于EEG和EMG信号的分类至关重要。主要结果:我们在三个属于EEG-HMI和EMG-HMI范式的公开数据集上评估并比较了Contronet与最先进的方法。 Contranet在所有不同类别任务(2级,3类,4级和10级解码任务)中的表现优于其对应。意义:结果表明,与当前的最新算法状态相比,从不同的HMI范式中学习不同的特征并概述了矛盾。
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自我监督学习(SSL)是一个新的范式,用于学习判别性表示没有标记的数据,并且与受监督的对手相比,已经达到了可比甚至最新的结果。对比度学习(CL)是SSL中最著名的方法之一,试图学习一般性的信息表示数据。 CL方法主要是针对仅使用单个传感器模态的计算机视觉和自然语言处理应用程序开发的。但是,大多数普遍的计算应用程序都从各种不同的传感器模式中利用数据。虽然现有的CL方法仅限于从一个或两个数据源学习,但我们提出了可可(Crockoa)(交叉模态对比度学习),这是一种自我监督的模型,该模型采用新颖的目标函数来通过计算多功能器数据来学习质量表示形式不同的数据方式,并最大程度地减少了无关实例之间的相似性。我们评估可可对八个最近引入最先进的自我监督模型的有效性,以及五个公共数据集中的两个受监督的基线。我们表明,可可与所有其他方法相比,可可的分类表现出色。同样,可可比其他可用标记数据的十分之一的基线(包括完全监督的模型)的标签高得多。
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对于诊断各种疾病的诊断,对睡眠阶段进行分类至关重要。但是,现有的自动诊断方法主要采用“金标准”局部脑图(EEG)或医院中多摄像机仪(PSG)机器的其他单型模式传感信号,这些信号昂贵,导入且因此不适合保健点监测在家。为了在家中启用睡眠阶段监控,我们在本文中分析了红外视频与脑电图信号之间的关系,并提出了一项新任务:通过将有用的知识从EEG信号提炼到视觉视频,使用红外视频对睡眠阶段进行分类。为了为该应用程序建立可靠的跨模式基准,我们开发了一个新的数据集,称为通过红外视频和脑电图($ s^3ve $)看到您的睡眠阶段。 $ s^3ve $是一个大型数据集,包括用于睡眠阶段分类的同步红外视频和脑电图信号,包括105个主题和154,573个视频剪辑,长度超过1100小时。我们的贡献不仅限于数据集,而且还涉及一种新型的跨模式蒸馏基线模型,即结构感知的对比度蒸馏(SACD),以将脑电图知识提升为红外视频特征。 SACD在我们的$ S^3ve $和现有的跨模式蒸馏基准上都达到了最先进的表演。基准方法和基线方法都将被释放给社区。我们希望在睡眠阶段分类中提高更多注意力并促进更多的发展,更重要的是,从临床信号/媒体到传统媒体的跨模式蒸馏。
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Neuropsychological studies suggest that co-operative activities among different brain functional areas drive high-level cognitive processes. To learn the brain activities within and among different functional areas of the brain, we propose LGGNet, a novel neurologically inspired graph neural network, to learn local-global-graph representations of electroencephalography (EEG) for Brain-Computer Interface (BCI). The input layer of LGGNet comprises a series of temporal convolutions with multi-scale 1D convolutional kernels and kernel-level attentive fusion. It captures temporal dynamics of EEG which then serves as input to the proposed local and global graph-filtering layers. Using a defined neurophysiologically meaningful set of local and global graphs, LGGNet models the complex relations within and among functional areas of the brain. Under the robust nested cross-validation settings, the proposed method is evaluated on three publicly available datasets for four types of cognitive classification tasks, namely, the attention, fatigue, emotion, and preference classification tasks. LGGNet is compared with state-of-the-art methods, such as DeepConvNet, EEGNet, R2G-STNN, TSception, RGNN, AMCNN-DGCN, HRNN and GraphNet. The results show that LGGNet outperforms these methods, and the improvements are statistically significant (p<0.05) in most cases. The results show that bringing neuroscience prior knowledge into neural network design yields an improvement of classification performance. The source code can be found at https://github.com/yi-ding-cs/LGG
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