听力损失是人类的重大健康问题和心理负担。小鼠模型提供了阐明参与潜在发育和病理生理机制的基因的可能性。为此,大规模的鼠标表型计划包括单基因敲除小鼠线的听觉表型。使用听觉脑干响应(ABR)程序,德国鼠标诊所和全球类似设施已经产生了大型均匀的突变体和野生型小鼠的ABR原料数据。在标准ABR分析过程中,听力阈值通过训练有素的工作人员从增加声压水平的信号曲线进行视觉评估。这是令人耗时的,并且容易被读者偏向,以及图形显示质量和规模。为了减少工作量并提高质量和再现性,我们开发并比较了两种方法,用于从平均ABR原始数据中实现自动听力阈值识别:一个受监督方法,涉及在人生成的标签和自我监督方法上训练的两个组合神经网络,利用信号功率谱利用信号功率谱并将随机森林声级估计与转换曲线拟合算法结合起来进行阈值查找。我们表明,两种型号都很好地,胜过人类阈值检测,并且适用于快速,可靠和无偏见的听力阈值检测和质量控制。在高通量鼠标表型环境中,两种方法都以自动端到端筛选管道的一部分表现良好,以检测用于听力参与的候选基因。两种模型的代码以及用于此工作的数据都可以自由使用。
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随着天文学中检测到的瞬变数量的迅速增加,基于机器学习的分类方法正在越来越多地使用。他们的目标通常是要获得瞬态的确定分类,并且出于良好的性能,他们通常需要存在大量观察。但是,精心设计,有针对性的模型可以通过更少的计算资源来达到其分类目标。本文介绍了Snguess,该模型旨在找到高纯度附近的年轻外乳旋转瞬变。 Snguess可以使用一组功能,这些功能可以从天文警报数据中有效计算。其中一些功能是静态的,并且与警报元数据相关联,而其他功能必须根据警报中包含的光度观测值计算。大多数功能都足够简单,可以在其检测后的瞬态生命周期的早期阶段获得或计算。我们为从Zwicky Transient设施(ZTF)的一组标记的公共警报数据计算了这些功能。 Snguess的核心模型由一组决策树组成,这些集合是通过梯度提升训练的。 SNGUESS建议的候选人中约有88%的ZTF从2020年4月至2021年8月的一组警报中被发现是真正的相关超新星(SNE)。对于具有明亮检测的警报,此数字在92%至98%之间。自2020年4月以来,Snguess确定为ZTF Alert流中潜在SNE的瞬变已发布到AMPEL_ZTF_NEW组标识符下的瞬态名称服务器(TNS)。可以通过Web服务访问ZTF观察到的任何暂时性的SNGUESS分数。 Snguess的源代码可公开使用。
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尽管机器学习方法已在金融领域广泛使用,但在非常成功的学位上,这些方法仍然可以根据解释性,可比性和可重复性来定制特定研究和不透明。这项研究的主要目的是通过提供一种通用方法来阐明这一领域,该方法是调查 - 不合Snostic且可解释给金融市场从业人员,从而提高了其效率,降低了进入的障碍,并提高了实验的可重复性。提出的方法在两个自动交易平台组件上展示。也就是说,价格水平,众所周知的交易模式和一种新颖的2步特征提取方法。该方法依赖于假设检验,该假设检验在其他社会和科学学科中广泛应用,以有效地评估除简单分类准确性之外的具体结果。提出的主要假设是为了评估所选的交易模式是否适合在机器学习设置中使用。在整个实验中,我们发现在机器学习设置中使用所考虑的交易模式仅由统计数据得到部分支持,从而导致效果尺寸微不足道(反弹7- $ 0.64 \ pm 1.02 $,反弹11 $ 0.38 \ pm 0.98 $,并且篮板15- $ 1.05 \ pm 1.16 $),但允许拒绝零假设。我们展示了美国期货市场工具上的通用方法,并提供了证据表明,通过这种方法,我们可以轻松获得除传统绩效和盈利度指标之外的信息指标。这项工作是最早将这种严格的统计支持方法应用于金融市场领域的工作之一,我们希望这可能是更多研究的跳板。
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对自然和人制过程的研究通常会导致长时间有序值的长序列,也就是时间序列(TS)。这样的过程通常由多个状态组成,例如机器的操作模式,使观测过程中的状态变化会导致测量值形状的分布变化。时间序列分割(TSS)试图发现TS事后的这种变化,以推断数据生成过程的变化。通常将TSS视为无监督的学习问题,目的是识别某些统计属性可区分的细分。 TSS的当前算法要求用户设置依赖域的超参数,对TS值分布进行假设或可检测更改的类型,以限制其适用性。常见的超参数是段均匀性和变更点的数量的度量,对于每个数据集,这尤其难以调节。我们提出了TSS的一种新颖,高度准确,无参数和域的无义方法的方法。扣子分层将TS分为两个部分。更改点是通过训练每个可能的拆分点的二进制TS分类器来确定的,并选择最能识别从任何一个分区的子序列的一个拆分。 CLASP使用两种新颖的定制算法从数据中学习了其主要的两个模型参数。在我们使用115个数据集的基准测试的实验评估中,我们表明,扣子优于准确性,并且可以快速且可扩展。此外,我们使用几个现实世界的案例研究强调了扣子的特性。
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$ \ Texit {Fermi} $数据中的银河系中多余(GCE)的两个领先假设是一个未解决的微弱毫秒脉冲条件(MSP)和暗物质(DM)湮灭。这些解释之间的二分法通常通过将它们建模为两个单独的发射组分来反映。然而,诸如MSP的点源(PSS)在超微弱的极限中具有统计变质的泊松发射(正式的位置,预期每个来源平均贡献远低于一个光子),导致可能提出问题的歧义如排放是否是PS样或性质中的泊松人。我们提出了一种概念上的新方法,以统一的方式描述PS和泊松发射,并且刚刚从此获得的结果中获得了对泊松组件的约束。为了实现这种方法,我们利用深度学习技术,围绕基于神经网络的方法,用于直方图回归,其表达量数量的不确定性。我们证明我们的方法对许多困扰先前接近的系统,特别是DM / PS误操作来稳健。在$ \ texit {fermi} $数据中,我们发现由$ \ sim4 \ times 10 ^ {-11} \ \ text {counts} \ {counts} \ text {counts} \ text {counts} \ \ text {cm} ^ { - 2} \ \ text {s} ^ { - 1} $(对应于$ \ sim3 - 4 $每pL期望计数),这需要$ n \ sim \ mathcal {o}( 10 ^ 4)$源来解释整个过剩(中位数价值$ n = \文本{29,300} $横跨天空)。虽然微弱,但这种SCD允许我们获得95%信心的Poissonian比赛的约束$ \ eta_p \ leq 66 \%$。这表明大量的GCE通量是由于PSS 。
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在2015年和2019年之间,地平线的成员2020年资助的创新培训网络名为“Amva4newphysics”,研究了高能量物理问题的先进多变量分析方法和统计学习工具的定制和应用,并开发了完全新的。其中许多方法已成功地用于提高Cern大型Hadron撞机的地图集和CMS实验所执行的数据分析的敏感性;其他几个人,仍然在测试阶段,承诺进一步提高基本物理参数测量的精确度以及新现象的搜索范围。在本文中,在研究和开发的那些中,最相关的新工具以及对其性能的评估。
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The International Workshop on Reading Music Systems (WoRMS) is a workshop that tries to connect researchers who develop systems for reading music, such as in the field of Optical Music Recognition, with other researchers and practitioners that could benefit from such systems, like librarians or musicologists. The relevant topics of interest for the workshop include, but are not limited to: Music reading systems; Optical music recognition; Datasets and performance evaluation; Image processing on music scores; Writer identification; Authoring, editing, storing and presentation systems for music scores; Multi-modal systems; Novel input-methods for music to produce written music; Web-based Music Information Retrieval services; Applications and projects; Use-cases related to written music. These are the proceedings of the 3rd International Workshop on Reading Music Systems, held in Alicante on the 23rd of July 2021.
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尽管对安全机器学习的重要性,但神经网络的不确定性量化远未解决。估计神经不确定性的最先进方法通常是混合的,将参数模型与显式或隐式(基于辍学的)合并结合。我们采取另一种途径,提出一种新颖的回归任务的不确定量化方法,纯粹是非参数的。从技术上讲,它通过基于辍学的子网分布来捕获梯级不确定性。这是通过一个新目标来实现的,这使得标签分布与模型分布之间的Wasserstein距离最小化。广泛的经验分析表明,在生产更准确和稳定的不确定度估计方面,Wasserstein丢失在香草测试数据以及在分类转移的情况下表现出最先进的方法。
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我们提出了一种新颖的方法,该方法将基于机器学习的交互式图像分割结合在一起,使用Supersoxels与聚类方法结合了用于自动识别大型数据集中类似颜色的图像的聚类方法,从而使分类器的指导重复使用。我们的方法解决了普遍的颜色可变性的问题,并且在生物学和医学图像中通常不可避免,这通常会导致分割恶化和量化精度,从而大大降低了必要的训练工作。效率的这种提高促进了大量图像的量化,从而为高通量成像中的最新技术进步提供了交互式图像分析。所呈现的方法几乎适用于任何图像类型,并代表通常用于图像分析任务的有用工具。
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语义图像分割是手术中的背景知识和自治机器人的重要前提。本领域的状态专注于在微创手术期间获得的传统RGB视频数据,但基于光谱成像数据的全景语义分割并在开放手术期间获得几乎没有注意到日期。为了解决文献中的这种差距,我们正在研究基于在开放手术环境中获得的猪的高光谱成像(HSI)数据的以下研究问题:(1)基于神经网络的HSI数据的充分表示是完全自动化的器官分割,尤其是关于数据的空间粒度(像素与Superpixels与Patches与完整图像)的空间粒度? (2)在执行语义器官分割时,是否有利用HSI数据使用HSI数据,即RGB数据和处理的HSI数据(例如氧合等组织参数)?根据基于20猪的506个HSI图像的全面验证研究,共注释了19个类,基于深度的学习的分割性能 - 贯穿模态 - 与输入数据的空间上下文一致。未处理的HSI数据提供优于RGB数据或来自摄像机提供商的处理数据,其中优势随着输入到神经网络的输入的尺寸而增加。最大性能(应用于整个图像的HSI)产生了0.89(标准偏差(SD)0.04)的平均骰子相似度系数(DSC),其在帧间间变异性(DSC为0.89(SD 0.07)的范围内。我们得出结论,HSI可以成为全自动手术场景理解的强大的图像模型,其具有传统成像的许多优点,包括恢复额外功能组织信息的能力。
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在过去二十年中,识别具有不同纵向数据趋势的群体的方法已经成为跨越许多研究领域的兴趣。为了支持研究人员,我们总结了文献关于纵向聚类的指导。此外,我们提供了一种纵向聚类方法,包括基于基团的轨迹建模(GBTM),生长混合模拟(GMM)和纵向K平均值(KML)。该方法在基本级别引入,并列出了强度,限制和模型扩展。在最近数据收集的发展之后,将注意这些方法的适用性赋予密集的纵向数据(ILD)。我们展示了使用R.中可用的包在合成数据集上的应用程序的应用。
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传输定时变化(TTV)可以提供用于通过运输观察的系统的有用信息,因为它们允许我们对观察到的行星的质量和偏心的限制,甚至限制存在非过转化伴侣的存在。然而,TTV也可以用作检测偏压,可以防止在运输调查中检测小行星,否则将被标准算法(如盒装最小二乘算法(BLS)检测到)如果它们的轨道没有扰乱。这种偏差特别存在于具有长基线的调查,例如开普勒,其中一些苔丝扇区以及即将到来的柏拉图任务。在这里,我们介绍了一种对大型TTV的稳健的检测方法,并通过恢复和确认围绕开普勒-1705的十个TTV的一对谐振超级地球来说明其使用。该方法基于培训的神经网络,以恢复河图中的低信噪比比(S / N)扰动行星的轨道。我们通过拟合光线曲线来恢复这些候选人的传输参数。电孔-1705b和c的各个运输S / n大约比具有3小时或更长时间的所有先前已知的行星低的三倍,推动这些小型动态活动行星的恢复中的边界。恢复这种类型的物体对于获得观察到的行星系统的完整图谱是必不可少的,并且解决在外产群体的统计研究中不经常考虑的偏差。此外,TTV是获得质量估计的方法,这对于研究通过过境调查发现的行星的内部结构是必不可少的。最后,我们表明,由于强大的轨道扰动,开普勒-1705的外谐振行星的旋转可能被捕获在子或超级同步的旋转轨道共振中。
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无论是在功能选择的领域还是可解释的AI领域,都有基于其重要性的“排名”功能的愿望。然后可以将这种功能重要的排名用于:(1)减少数据集大小或(2)解释机器学习模型。但是,在文献中,这种特征排名没有以系统的,一致的方式评估。许多论文都有不同的方式来争论哪些具有重要性排名最佳的特征。本文通过提出一种新的评估方法来填补这一空白。通过使用合成数据集,可以事先知道特征重要性得分,从而可以进行更系统的评估。为了促进使用新方法的大规模实验,在Python建造了一个名为FSEVAL的基准测定框架。该框架允许并行运行实验,并在HPC系统上的计算机上分布。通过与名为“权重和偏见”的在线平台集成,可以在实时仪表板上进行交互探索图表。该软件作为开源软件发布,并在PYPI平台上以包裹发行。该研究结束时,探索了一个这样的大规模实验,以在许多方面找到参与算法的优势和劣势。
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大型和深度电子医疗保健记录(EHR)数据集的可用性有可能更好地了解现实世界中的患者旅行,并鉴定出新的患者亚组。基于ML的EHR数据集合主要是工具驱动的,即基于可用或新开发的方法的构建。但是,这些方法,它们的输入要求以及最重要的是,通常难以解释产量,尤其是没有深入的数据科学或统计培训。这危害了需要进行可行且具有临床意义的解释的最后一步。这项研究研究了使用大型EHR数据集和多种聚类方法进行临床研究的方法进行大规模进行患者分层分析的方法。我们已经开发了几种工具来促进无监督的患者分层结果的临床评估和解释,即模式筛查,元聚类,替代建模和策展。这些工具可以在分析中的不同阶段使用。与标准分析方法相比,我们证明了凝结结果并优化分析时间的能力。在元聚类的情况下,我们证明了患者簇的数量可以从72减少到3。在另一个分层的结果中,通过使用替代模型,我们可以迅速确定如果有血液钠测量值可用,则可以对心力衰竭患者进行分层。由于这是对所有心力衰竭患者进行的常规测量,因此表明数据偏差。通过使用进一步的队列和特征策展,可以去除这些患者和其他无关的特征以提高临床意义。这些示例显示了拟议方法的有效性,我们希望鼓励在该领域的进一步研究。
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射频干扰(RFI)缓解仍然是寻找无线电技术的主要挑战。典型的缓解策略包括原点方向(DOO)滤波器,如果在天空上的多个方向上检测到信号,则将信号分类为RFI。这些分类通常依赖于信号属性的估计,例如频率和频率漂移速率。卷积神经网络(CNNS)提供了对现有过滤器的有希望的补充,因为它们可以接受培训以直接分析动态光谱,而不是依赖于推断的信号属性。在这项工作中,我们编译了由标记的动态谱的图像组组成的几个数据集,并且我们设计和训练了可以确定在另一扫描中检测到的信号是否在另一扫描中检测到的CNN。基于CNN的DOO滤波器优于基线2D相关模型以及现有的DOO过滤器在一系列指标范围内,分别具有99.15%和97.81%的精度和召回值。我们发现CNN在标称情况下将传统的DOO过滤器施加6-16倍,减少了需要目视检查的信号数。
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通过生物手段自动验证一个人的身份是在每天的日常活动,如在机场访问银行服务和安全控制的一个重要应用。为了提高系统的可靠性,通常使用几个生物识别设备。这种组合系统被称为多模式生物测定系统。本文报道生物安全DS2(访问控制)评估由英国萨里大学举办的活动,包括面部,指纹和虹膜的个人认证生物特征的框架内进行基准研究,在媒体针对物理访问控制中的应用-size建立一些500人。虽然多峰生物测定是公调查对象,不存在基准融合算法的比较。朝着这个目标努力,我们设计了两组实验:质量依赖性和成本敏感的评估。质量依赖性评价旨在评估融合算法如何可以在变化的原始图像的质量主要是由于设备的变化来执行。在对成本敏感的评价,另一方面,研究了一种融合算法可以如何执行给定的受限的计算和在软件和硬件故障的存在,从而导致错误,例如失败到获取和失败到匹配。由于多个捕捉设备可用,融合算法应该能够处理这种非理想但仍然真实的场景。在这两种评价中,各融合算法被提供有从每个生物统计比较子系统以及两个模板和查询数据的质量度量得分。在活动的号召的响应证明是非常令人鼓舞的,与提交22个融合系统。据我们所知,这是第一次尝试基准品质为基础多模态融合算法。
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大多数机器学习算法由一个或多个超参数配置,必须仔细选择并且通常会影响性能。为避免耗时和不可递销的手动试验和错误过程来查找性能良好的超参数配置,可以采用各种自动超参数优化(HPO)方法,例如,基于监督机器学习的重新采样误差估计。本文介绍了HPO后,本文审查了重要的HPO方法,如网格或随机搜索,进化算法,贝叶斯优化,超带和赛车。它给出了关于进行HPO的重要选择的实用建议,包括HPO算法本身,性能评估,如何将HPO与ML管道,运行时改进和并行化结合起来。这项工作伴随着附录,其中包含关于R和Python的特定软件包的信息,以及用于特定学习算法的信息和推荐的超参数搜索空间。我们还提供笔记本电脑,这些笔记本展示了这项工作的概念作为补充文件。
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剪切粘度虽然是所有液体的基本特性,但在计算上估计分子动力学模拟的计算昂贵。最近,机器学习(ML)方法已被用于在许多情况下增强分子模拟,从而显示出以相对廉价的方式估算粘度的希望。但是,ML方法面临重大挑战,例如当数据集的大小很小时,粘度也很小。在这项工作中,我们训练多个ML模型,以预测Lennard-Jones(LJ)流体的剪切粘度,特别强调解决由小型数据集引起的问题。具体而言,研究了与模型选择,绩效估计和不确定性定量有关的问题。首先,我们表明使用单个看不见的数据集的广泛使用的性能估计步骤显示了小数据集的广泛可变性。在这种情况下,可以使用交叉验证(CV)选择超参数(模型选择)的常见实践,以估算概括误差(性能估计)。我们比较了两个简单的简历程序,以便他们同时选择模型选择和性能估计的能力,并发现基于K折CV的过程显示出较低的误差估计差异。我们讨论绩效指标在培训和评估中的作用。最后,使用高斯工艺回归(GPR)和集合方法来估计单个预测的不确定性。 GPR的不确定性估计还用于构建适用性域,使用ML模型对本工作中生成的另一个小数据集提供了更可靠的预测。总体而言,这项工作中规定的程序共同导致了针对小型数据集的强大ML模型。
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We review clustering as an analysis tool and the underlying concepts from an introductory perspective. What is clustering and how can clusterings be realised programmatically? How can data be represented and prepared for a clustering task? And how can clustering results be validated? Connectivity-based versus prototype-based approaches are reflected in the context of several popular methods: single-linkage, spectral embedding, k-means, and Gaussian mixtures are discussed as well as the density-based protocols (H)DBSCAN, Jarvis-Patrick, CommonNN, and density-peaks.
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普通交叉验证(CV)等方法,如k倍交叉验证或Monte-Carlo交叉验证估计学习者的预测性能,通过重复在给定数据的大部分数据和对剩余数据上测试的大部分中进行训练。这些技术有两个主要缺点。首先,它们可以在大型数据集上不必要地慢。其次,除了估计最终性能之外,它们几乎没有进入验证算法的学习过程中的见解。在本文中,我们提出了一种基于学习曲线(LCCV)的验证的新方法。 LCCV迭代地增加用于训练的实例数量而不是创建火车测试分裂。在模型选择的背景下,它丢弃了不太可能成为竞争的模型。我们在从自动化基准测试的67个数据集上运行大规模的实验,并经验显示使用LCCV超过90%的案例,导致使用5/10倍的CV相似的性能(最多1.5%)。然而,它平均产生超过20%的大量运行时间减少。此外,它提供了重要的见解,例如允许评估获取更多数据的益处。这些结果与Automl领域的其他进步正交。
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