解决了选择最佳后门调整集的问题,以解决隐藏和条件变量的图形模型中的因果效应。以前的工作已经定义了实现最小的渐近估计方差,并且在没有隐藏变量的情况下派生的最佳集。对于隐藏变量的情况,可以有设置在没有最佳集合的情况下,并且目前仅导出有限适用性的足够的图形最优标准。在本工作中,最优性的特征在于最大化某个调整信息,该信息允许导出用于存在最佳调整集的必要和足够的图形标准和构造它的定义和算法。此外,如果仅存在有效调整集并且具有比Perkovi {\'C}等所提出的调整集更高(或等于)调整信息,则最佳集是有效的。 [机器学习研究学报,18:1--62,2018]任何图表。结果转化为一类估计的渐近估计差异,其渐近方差遵循某种信息理论关系。数值实验表明,渐近结果也适用于相对较小的样本尺寸,并且最佳调整集或其最小化变体通常也会产生更好的方差,也超出该估计类。令人惊讶的是,在随机创建的设置中,超过90 \%满足最优性条件,指示在许多现实世界场景中也可以保持。代码可用作Python Package \ URL {https://github.com/jakobrunge/tigramite}的一部分。
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我们研究了在个性化治疗规则下估算介入均值的调整集的选择。我们假设具有,可能是隐藏变量和由可观察变量组成的至少一个调整集的非参数因果图形模型。此外,我们假设可观察变量具有与它们相关的正成本。我们将可观察调整集的成本定义为包含它的变量成本的总和。我们认为,在此设置中,存在最小成本最佳的调整集,从而使其产生的非参数估计值与控制可观察到的可观察调整集中的最小渐近方差。我们的结果基于与原始因果图相关的特殊流量网络的构建。我们表明,可以通过计算网络上的最大流程,然后通过增强路径找到从源可到达的一组顶点来找到最低成本最佳调整集。 OptimalAdj Python包实现本文介绍的算法。
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在观察性研究中,经常遇到有关存在或缺乏因果边缘和路径的因果背景知识。由于背景知识而导致的马尔可夫等效dag的子类共享的指向边缘和链接可以由因果关系最大部分定向的无循环图(MPDAG)表示。在本文中,我们首先提供了因果MPDAG的声音和完整的图形表征,并提供了因果MPDAG的最小表示。然后,我们介绍了一种名为Direct Causal子句(DCC)的新颖表示,以统一形式表示所有类型的因果背景知识。使用DCC,我们研究因果背景知识的一致性和等效性,并表明任何因果背景知识集都可以等效地分解为因果MPDAG,以及最小的残留DCC。还提供了多项式时间算法,以检查一致性,等效性并找到分解的MPDAG和残留DCC。最后,有了因果背景知识,我们证明了一个足够且必要的条件来识别因果关系,并且出人意料地发现因果效应的可识别性仅取决于分解的MPDAG。我们还开发了局部IDA型算法,以估计无法识别效应的可能值。模拟表明因果背景知识可以显着提高因果影响的识别性。
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研究了与隐藏变量有关的非循环图(DAG)相关的因果模型中因果效应的识别理论。然而,由于估计它们输出的识别功能的复杂性,因此未耗尽相应的算法。在这项工作中,我们弥合了识别和估算涉及单一治疗和单一结果的人口水平因果效应之间的差距。我们派生了基于功能的估计,在大类隐藏变量DAG中表现出对所识别的效果的双重稳健性,其中治疗满足简单的图形标准;该类包括模型,产生调整和前门功能作为特殊情况。我们还提供必要的和充分条件,其中隐藏变量DAG的统计模型是非分子饱和的,并且意味着对观察到的数据分布没有平等约束。此外,我们推导了一类重要的隐藏变量DAG,这意味着观察到观察到的数据分布等同于完全观察到的DAG等同于(最高的相等约束)。在这些DAG类中,我们推出了实现兴趣目标的半导体效率界限的估计估计值,该估计是治疗满足我们的图形标准的感兴趣的目标。最后,我们提供了一种完整的识别算法,可直接产生基于权重的估计策略,以了解隐藏可变因果模型中的任何可识别效果。
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不观察到的混淆是观测数据的因果效应估计的主要障碍。仪器变量(IVS)广泛用于存在潜在混淆时的因果效应估计。利用标准IV方法,当给定的IV有效时,可以获得无偏估计,但标准IV的有效性要求是严格和不可能的。已经提出了通过调节一组观察变量(称为条件IV的调节装置)来放松标准IV的要求。然而,用于查找条件IV的调节集的标准需要完整的因果结构知识或指向的非循环图(DAG),其代表观察到和未观察的变量的因果关系。这使得无法发现直接从数据设置的调节。在本文中,通过利用潜在变量的因果推断中的最大祖先图(MAGS),我们提出了一种新型的MAG中的IV,祖先IV,并开发了支持给定祖传的调节装置的数据驱动的发现iv在mag。基于该理论,我们在MAG和观测数据中开发了一种与祖先IV的非偏见因果效应估计的算法。与现有IV方法相比,对合成和实际数据集的广泛实验表明了算法的性能。
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我们分析了在没有特定分布假设的常规设置中从观察数据的学习中学循环图形模型的复杂性。我们的方法是信息定理,并使用本地马尔可夫边界搜索程序,以便在基础图形模型中递归地构建祖先集。也许令人惊讶的是,我们表明,对于某些图形集合,一个简单的前向贪婪搜索算法(即没有向后修剪阶段)足以学习每个节点的马尔可夫边界。这显着提高了我们在节点的数量中显示的样本复杂性。然后应用这一点以在从文献中概括存在现有条件的新型标识性条件下学习整个图。作为独立利益的问题,我们建立了有限样本的保障,以解决从数据中恢复马尔可夫边界的问题。此外,我们将我们的结果应用于特殊情况的Polytrees,其中假设简化,并提供了多项识别的明确条件,并且在多项式时间中可以识别和可知。我们进一步说明了算法在仿真研究中易于实现的算法的性能。我们的方法是普遍的,用于无需分布假设的离散或连续分布,并且由于这种棚灯对有效地学习来自数据的定向图形模型结构所需的最小假设。
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估计平均因果效应的理想回归(如果有)是什么?我们在离散协变量的设置中研究了这个问题,从而得出了各种分层估计器的有限样本方差的表达式。这种方法阐明了许多广泛引用的结果的基本统计现象。我们的博览会结合了研究因果效应估计的三种不同的方法论传统的见解:潜在结果,因果图和具有加性误差的结构模型。
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也称为(非参数)结构方程模型(SEMS)的结构因果模型(SCM)被广泛用于因果建模目的。特别是,也称为递归SEM的无循环SCMS,形成了一个研究的SCM的良好的子类,概括了因果贝叶斯网络来允许潜在混淆。在本文中,我们调查了更多普通环境中的SCM,允许存在潜在混杂器和周期。我们展示在存在周期中,无循环SCM的许多方便的性质通常不会持有:它们并不总是有解决方案;它们并不总是诱导独特的观察,介入和反事实分布;边缘化并不总是存在,如果存在边缘模型并不总是尊重潜在的投影;他们并不总是满足马尔可夫财产;他们的图表并不总是与他们的因果语义一致。我们证明,对于SCM一般,这些属性中的每一个都在某些可加工条件下保持。我们的工作概括了SCM的结果,迄今为止仅针对某些特殊情况所知的周期。我们介绍了将循环循环设置扩展到循环设置的简单SCM的类,同时保留了许多方便的无环SCM的性能。用本文,我们的目标是为SCM提供统计因果建模的一般理论的基础。
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因果推断对于跨业务参与,医疗和政策制定等领域的数据驱动决策至关重要。然而,关于因果发现的研究已经与推理方法分开发展,从而阻止了两个领域方法的直接组合。在这项工作中,我们开发了深层端到端因果推理(DECI),这是一种基于流动的非线性添加噪声模型,该模型具有观察数据,并且可以执行因果发现和推理,包括有条件的平均治疗效果(CATE) )估计。我们提供了理论上的保证,即DECI可以根据标准因果发现假设恢复地面真实因果图。受应用影响的激励,我们将该模型扩展到具有缺失值的异质,混合型数据,从而允许连续和离散的治疗决策。我们的结果表明,与因果发现的相关基线相比,DECI的竞争性能和(c)在合成数据集和因果机器学习基准测试基准的一千多个实验中,跨数据类型和缺失水平进行了估计。
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In this paper we prove the so-called "Meek Conjecture". In particular, we show that if a DAG H is an independence map of another DAG G, then there exists a finite sequence of edge additions and covered edge reversals in G such that (1) after each edge modification H remains an independence map of G and ( 2) after all modifications G = H. As shown by Meek (1997), this result has an important consequence for Bayesian approaches to learning Bayesian networks from data: in the limit of large sample size, there exists a twophase greedy search algorithm that-when applied to a particular sparsely-connected search space-provably identifies a perfect map of the generative distribution if that perfect map is a DAG. We provide a new implementation of the search space, using equivalence classes as states, for which all operators used in the greedy search can be scored efficiently using local functions of the nodes in the domain. Finally, using both synthetic and real-world datasets, we demonstrate that the two-phase greedy approach leads to good solutions when learning with finite sample sizes.
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因果关系是理解世界的科学努力的基本组成部分。不幸的是,在心理学和社会科学中,因果关系仍然是禁忌。由于越来越多的建议采用因果方法进行研究的重要性,我们重新制定了心理学研究方法的典型方法,以使不可避免的因果理论与其余的研究渠道协调。我们提出了一个新的过程,该过程始于从因果发现和机器学习的融合中纳入技术的发展,验证和透明的理论形式规范。然后,我们提出将完全指定的理论模型的复杂性降低到与给定目标假设相关的基本子模型中的方法。从这里,我们确定利息量是否可以从数据中估算出来,如果是的,则建议使用半参数机器学习方法来估计因果关系。总体目标是介绍新的研究管道,该管道可以(a)促进与测试因果理论的愿望兼容的科学询问(b)鼓励我们的理论透明代表作为明确的数学对象,(c)将我们的统计模型绑定到我们的统计模型中该理论的特定属性,因此减少了理论到模型间隙通常引起的规范不足问题,以及(d)产生因果关系和可重复性的结果和估计。通过具有现实世界数据的教学示例来证明该过程,我们以摘要和讨论来结论。
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最近,已经提出了利用预测模型在不断变化的环境方面的不变性来推断响应变量的因果父母的子集的不变性。如果环境仅影响少数基本机制,则例如不变因果预测(ICP)确定的子集可能很小,甚至是空的。我们介绍了最小不变性的概念,并提出了不变的血统搜索(IAS)。在其人群版本中,IAS输出了一个仅包含响应祖先的集合,并且是ICP输出的超集。当应用于数据时,如果不变性的基础测试具有渐近水平和功率,则相应的保证会渐近。我们开发可扩展算法并在模拟和真实数据上执行实验。
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尽管在治疗和结果之间存在未衡量的混杂因素,但前门标准可用于识别和计算因果关系。但是,关键假设 - (i)存在充分介导治疗对结果影响的变量(或一组变量)的存在,(ii)同时并不遭受类似的混淆问题的困扰 - outcome对 - 通常被认为是难以置信的。本文探讨了这些假设的可检验性。我们表明,在涉及辅助变量的轻度条件下,可以通过广义平等约束也可以测试前门模型中编码的假设(以及简单的扩展)。我们基于此观察结果提出了两个合适性测试,并评估我们对真实和合成数据的提议的疗效。我们还将理论和经验比较与仪器可变方法处理未衡量的混杂。
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In this review, we discuss approaches for learning causal structure from data, also called causal discovery. In particular, we focus on approaches for learning directed acyclic graphs (DAGs) and various generalizations which allow for some variables to be unobserved in the available data. We devote special attention to two fundamental combinatorial aspects of causal structure learning. First, we discuss the structure of the search space over causal graphs. Second, we discuss the structure of equivalence classes over causal graphs, i.e., sets of graphs which represent what can be learned from observational data alone, and how these equivalence classes can be refined by adding interventional data.
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从观察数据中推断出因果关系很少直接,但是在高维度中,问题尤其困难。对于这些应用,因果发现算法通常需要参数限制或极端稀疏限制。我们放松这些假设,并专注于一个重要但更专业的问题,即在已知的变量子中恢复因果秩序,这些变量已知会从某些(可能很大的)混杂的协变量(即$ \ textit {Confounder Blanset} $)中降下。这在许多环境中很有用,例如,在研究具有背景信息的遗传数据的动态生物分子子系统时。在一个称为$ \ textit {混杂的毯子原理} $的结构假设下,我们认为这对于在高维度中的可拖动因果发现至关重要,我们的方法可容纳低或高稀疏性的图形,同时保持多项式时间复杂性。我们提出了一种结构学习算法,相对于所谓的$ \ textit {Lazy Oracle} $,该算法是合理且完整的。我们设计了线性和非线性系统有限样本误差控制的推理过程,并在一系列模拟和现实世界数据集上演示了我们的方法。随附的$ \ texttt {r} $ package,$ \ texttt {cbl} $可从$ \ texttt {cran} $获得。
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在科学研究和现实世界应用的许多领域中,非实验数据的因果效应的无偏估计对于理解数据的基础机制以及对有效响应或干预措施的决策至关重要。从不同角度对这个具有挑战性的问题进行了大量研究。对于数据中的因果效应估计,始终做出诸如马尔可夫财产,忠诚和因果关系之类的假设。在假设下,仍然需要一组协变量或基本因果图之类的全部知识。一个实用的挑战是,在许多应用程序中,没有这样的全部知识或只有某些部分知识。近年来,研究已经出现了基于图形因果模型的搜索策略,以从数据中发现有用的知识,以进行因果效应估计,并具有一些温和的假设,并在应对实际挑战方面表现出了诺言。在这项调查中,我们回顾了方法,并关注数据驱动方法所面临的挑战。我们讨论数据驱动方法的假设,优势和局限性。我们希望这篇综述将激励更多的研究人员根据图形因果建模设计更好的数据驱动方法,以解决因果效应估计的具有挑战性的问题。
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常用图是表示和可视化因果关系的。对于少量变量,这种方法提供了简洁和清晰的方案的视图。随着下属的变量数量增加,图形方法可能变得不切实际,并且表示的清晰度丢失。变量的聚类是减少因果图大小的自然方式,但如果任意实施,可能会错误地改变因果关系的基本属性。我们定义了一种特定类型的群集,称为Transit Cluster,保证在某些条件下保留因果效应的可识别性属性。我们提供了一种用于在给定图中查找所有传输群集的声音和完整的算法,并演示集群如何简化因果效应的识别。我们还研究了逆问题,其中一个人以群集的图形开始,寻找扩展图,其中因果效应的可识别性属性保持不变。我们表明这种结构稳健性与过境集群密切相关。
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本文介绍了一种基于新的条件独立性(CI)的线性和非线性,滞后和同期因因果发现的方法,从而在因果上足够的情况下。基于CI的基于CI的方法,如PC算法以及来自其他框架的常见方法遭受低召回和部分充气的误报,用于强大的自相关,这是时间序列中无处不在的挑战。小说方法PCMCI $ ^ + $,扩展PCMCI [Runge等,2019B],包括发现同期链接。 PCMCI $ ^ + $通过优化调节套件的选择甚至从自相关的益处来提高CI测试的可靠性。该方法在Oracle案例中是单独无关的且一致。广泛的数值实验表明,与其他方法相比,PCMCI $ ^ + $具有更高的邻接检测功率,尤其是同时定向召回,同时更好地控制误报。优化的调节集还会导致比PC算法更短的运行时间。 PCMCI $ ^ + $可以在许多真实世界应用方案中具有相当大的用途,其中通常时间分辨率太粗糙以解决时间延迟,并且存在强大的自相关。
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This review presents empirical researchers with recent advances in causal inference, and stresses the paradigmatic shifts that must be undertaken in moving from traditional statistical analysis to causal analysis of multivariate data. Special emphasis is placed on the assumptions that underly all causal inferences, the languages used in formulating those assumptions, the conditional nature of all causal and counterfactual claims, and the methods that have been developed for the assessment of such claims. These advances are illustrated using a general theory of causation based on the Structural Causal Model (SCM) described in Pearl (2000a), which subsumes and unifies other approaches to causation, and provides a coherent mathematical foundation for the analysis of causes and counterfactuals. In particular, the paper surveys the development of mathematical tools for inferring (from a combination of data and assumptions) answers to three types of causal queries: (1) queries about the effects of potential interventions, (also called "causal effects" or "policy evaluation") (2) queries about probabilities of counterfactuals, (including assessment of "regret," "attribution" or "causes of effects") and (3) queries about direct and indirect effects (also known as "mediation"). Finally, the paper defines the formal and conceptual relationships between the structural and potential-outcome frameworks and presents tools for a symbiotic analysis that uses the strong features of both.
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Front-door adjustment is a classic technique to estimate causal effects from a specified directed acyclic graph (DAG) and observed data. The advantage of this approach is that it uses observed mediators to identify causal effects, which is possible even in the presence of unobserved confounding. While the statistical properties of the front-door estimation are quite well understood, its algorithmic aspects remained unexplored for a long time. Recently, Jeong, Tian, and Barenboim [NeurIPS 2022] have presented the first polynomial-time algorithm for finding sets satisfying the front-door criterion in a given DAG, with an $O(n^3(n+m))$ run time, where $n$ denotes the number of variables and $m$ the number of edges of the graph. In our work, we give the first linear-time, i.e. $O(n+m)$, algorithm for this task, which thus reaches the asymptotically optimal time complexity, as the size of the input is $\Omega(n+m)$. We also provide an algorithm to enumerate all front-door adjustment sets in a given DAG with delay $O(n(n + m))$. These results improve the algorithms by Jeong et al. [2022] for the two tasks by a factor of $n^3$, respectively.
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