在本文中,我们研究了推断空间变化的高斯马尔可夫随机场(SV-GMRF)的问题,其中的目标是学习代表基因之间网络关系的稀疏,特定于上下文的GMRF网络。 SV-GMRF的一个重要应用是推断来自空间分辨转录组学数据集的基因调节网络。当前有关SV-GMRF推断的工作基于正则最大似然估计(MLE),并且由于其高度非线性的性质而受到压倒性的计算成本。为了减轻这一挑战,我们提出了一个简单有效的优化问题,代替了配备强大的统计和计算保证的MLE。我们提出的优化问题在实践中非常有效:我们可以在不到2分钟的时间内解决具有超过200万变量的SV-GMRF的实例。我们将开发的框架应用于研究胶质母细胞瘤中的基因调节网络如何在组织内部空间重新连接,并确定转录因子Hes4和核糖体蛋白的显着活性是表征肿瘤血管周期壁iche中基因表达网络的特征抗性干细胞。
translated by 谷歌翻译
众所周知,许多网络系统,例如电网,大脑和舆论动态社交网络,都可以遵守保护法。这种现象的例子包括电网中的基尔乔夫法律和社交网络中的意见共识。网络系统中的保护定律可以建模为$ x = b^{*} y $的平衡方程,其中$ b^{*} $的稀疏模式捕获了网络的连接,$ y,x \在\ mathbb {r}^p $中分别是节点上“电势”和“注入流”的向量。节点电位$ y $会导致跨边缘的流量,并且在节点上注入的流量$ x $是网络动力学的无关紧要的。在几个实用的系统中,网络结构通常是未知的,需要从数据估算。为此,可以访问节点电位$ y $的样本,但只有节点注射$ x $的统计信息。在这个重要问题的激励下,我们研究了$ n $ y $ y $ y $ y $ y $ y $ y $ y $ b^{*} $稀疏结构的估计,假设节点注射$ x $遵循高斯分布,并带有已知的发行协方差$ \ sigma_x $。我们建议在高维度中为此问题的新$ \ ell_ {1} $ - 正则最大似然估计器,网络的大小$ p $大于样本量$ n $。我们表明,此优化问题是目标中的凸,并接受了独特的解决方案。在新的相互不一致的条件下,我们在三重$(n,p,d)$上建立了足够的条件,对于$ b^{*} $的精确稀疏恢复是可能的; $ d $是图的程度。我们还建立了在元素最大,Frobenius和运营商规范中回收$ b^{*} $的保证。最后,我们通过对拟议估计量对合成和现实世界数据的性能进行实验验证来补充这些理论结果。
translated by 谷歌翻译
我们研究了估计多元高斯分布中的精度矩阵的问题,其中所有部分相关性都是非负面的,也称为多变量完全阳性的顺序阳性($ \ mathrm {mtp} _2 $)。近年来,这种模型得到了重大关注,主要是由于有趣的性质,例如,无论底层尺寸如何,最大似然估计值都存在于两个观察。我们将此问题作为加权$ \ ell_1 $ -norm正常化高斯的最大似然估计下$ \ mathrm {mtp} _2 $约束。在此方向上,我们提出了一种新颖的预计牛顿样算法,该算法包含精心设计的近似牛顿方向,这导致我们具有与一阶方法相同的计算和内存成本的算法。我们证明提出的预计牛顿样算法会聚到问题的最小值。从理论和实验中,我们进一步展示了我们使用加权$ \ ell_1 $ -norm的制剂的最小化器能够正确地恢复基础精密矩阵的支持,而无需在$ \ ell_1 $ -norm中存在不连贯状态方法。涉及合成和实世界数据的实验表明,我们所提出的算法从计算时间透视比最先进的方法显着更有效。最后,我们在金融时序数据中应用我们的方法,这些数据对于显示积极依赖性,在那里我们在学习金融网络上的模块间值方面观察到显着性能。
translated by 谷歌翻译
在本文中,我们考虑了使用$ \ ell_1 $ regularized logistic回归的方法来估算与高维iSing模型相关的图形的元学习问题,用于每个节点的邻域选择。我们的目标是在学习新任务中使用从辅助任务中学到的信息来降低其足够的样本复杂性。为此,我们提出了一种新颖的生成模型以及不当的估计方法。在我们的设置中,所有任务均为\ emph {相似}在其\ emph {Random}模型参数和支持中。通过将所有样品从辅助任务汇总到\ emph {不正确}估计一个参数向量,我们可以恢复假定的尺寸很小的真实支持联合,具有很高的概率,具有足够的样品复杂性为$ \ omega(1) $每任务,对于$ k = \ omega(d^3 \ log P)$具有$ p $节点和最大邻域大小$ d $的ISING型号的任务。然后,在对新任务的支持仅限于估计的支持联盟的支持下,我们证明,可以通过降低$ \ omega(d^3 \ log d)$的足够样品复杂性来获得新任务的一致邻居选择。
translated by 谷歌翻译
我们考虑发现$ k $相关的高斯定向的非循环图(DAG)的问题,其中涉及的图形结构共享一致的因果秩序和支持的支持。在多任务学习设置下,我们提出了$ L_1 / L_2 $ -Regularized最大似然估计器(MLE),用于学习$ K $线性结构方程模型。理论上我们表明,通过利用相关任务利用数据来实现联合估算器可以实现比单独的估计更好的采样复杂性来恢复因果秩序(或拓扑阶)。此外,联合估计器能够通过与一些可识别的DAG一起估计它们来恢复不可识别的DAG。最后,我们的分析还显示了联盟支持恢复的协会的一致性。为了允许实际实现,我们设计了一种连续的优化问题,其优化器与联合估计器相同,并且可以通过迭代算法有效地近似。我们验证了实验中联合估计器的理论分析和有效性。
translated by 谷歌翻译
社区检测和正交组同步是科学和工程中各种重要应用的基本问题。在这项工作中,我们考虑了社区检测和正交组同步的联合问题,旨在恢复社区并同时执行同步。为此,我们提出了一种简单的算法,该算法由频谱分解步骤组成,然后是彼此枢转的QR分解(CPQR)。所提出的算法与数据点数线性有效且缩放。我们还利用最近开发的“休闲一淘汰”技术来建立近乎最佳保证,以确切地恢复集群成员资格,并稳定地恢复正交变换。数值实验证明了我们算法的效率和功效,并确认了我们的理论表征。
translated by 谷歌翻译
作为估计高维网络的工具,图形模型通常应用于钙成像数据以估计功能性神经元连接,即神经元活动之间的关系。但是,在许多钙成像数据集中,没有同时记录整个神经元的人群,而是部分重叠的块。如(Vinci等人2019年)最初引入的,这导致了图形缝问题,在该问题中,目的是在仅观察到功能的子集时推断完整图的结构。在本文中,我们研究了一种新颖的两步方法来绘制缝的方法,该方法首先使用低级协方差完成技术在估计图结构之前使用低级协方差完成技术划分完整的协方差矩阵。我们介绍了三种解决此问题的方法:阻止奇异价值分解,核标准惩罚和非凸低级别分解。尽管先前的工作已经研究了低级别矩阵的完成,但我们解决了阻碍遗失的挑战,并且是第一个在图形学习背景下研究问题的挑战。我们讨论了两步过程的理论特性,通过证明新颖的l无限 - 基 - 误差界的矩阵完成,以块错失性证明了一种提出的方​​法的图选择一致性。然后,我们研究了所提出的方法在模拟和现实世界数据示例上的经验性能,通过该方法,我们显示了这些方法从钙成像数据中估算功能连通性的功效。
translated by 谷歌翻译
我们提出了一种凸锥程序,可推断随机点产品图(RDPG)的潜在概率矩阵。优化问题最大化Bernoulli最大似然函数,增加核规范正则化术语。双重问题具有特别良好的形式,与众所周知的SemideFinite程序放松MaxCut问题有关。使用原始双功率条件,我们绑定了原始和双解决方案的条目和等级。此外,我们在轻微的技术假设下绑定了最佳目标值并证明了略微修改模型的概率估计的渐近一致性。我们对合成RDPG的实验不仅恢复了自然集群,而且还揭示了原始数据的下面的低维几何形状。我们还证明该方法在空手道俱乐部图表和合成美国参议图中恢复潜在结构,并且可以扩展到最多几百个节点的图表。
translated by 谷歌翻译
矩阵值数据在许多应用中越来越普遍。这种类型数据的大多数现有的聚类方法都是针对均值模型定制的,并且不考虑特征的依赖结构,这可能非常有信息,尤其是在高维设置中。要从群集结构中提取信息以进行群集,我们提出了一种以矩阵形式排列的特征的新潜在变量模型,其中一些未知的隶属矩阵表示行和列的群集。在该模型下,我们进一步提出了一类使用加权协方差矩阵的差异作为异化测量的分层聚类算法。从理论上讲,我们表明,在温和条件下,我们的算法在高维设置中达到聚类一致性。虽然这种一致性结果为我们的算法具有广泛的加权协方差矩阵,但该结果的条件取决于重量的选择。为了调查重量如何影响我们算法的理论性能,我们在我们的潜在变量模型下建立了群集的最小限制。鉴于这些结果,我们在使用此权重的意义上识别最佳权重,保证我们的算法在某些集群分离度量的大小方面是最佳的最佳速率。还讨论了我们具有最佳权重的算法的实际实现。最后,我们进行仿真研究以评估我们算法的有限样本性能,并将该方法应用于基因组数据集。
translated by 谷歌翻译
本文研究了主题模型中高维,离散,可能稀疏的混合模型的估计。数据包括在$ n $独立文档中观察到的$ p $单词的多项式计数。在主题模型中,$ p \ times n $预期的单词频率矩阵被认为被分解为$ p \ times k $ word-top-topic矩阵$ a $ a $和a $ k \ times n $ topic-document $ t $ t $ 。由于两个矩阵的列代表属于概率简单的条件概率,因此$ a $的列被视为$ p $ - 二维混合组件,这些混合组件是所有文档共有的,而$ t $的列被视为$ k $二维的混合物特定文档并允许稀疏的权重。主要的兴趣是提供鲜明的,有限的样本,$ \ ell_1 $ norm收敛速率,用于混合物重量$ t $的估计量,当$ a $是已知或未知时。对于已知的$ a $,我们建议MLE估计为$ t $。我们对MLE的非标准分析不仅建立了其$ \ ell_1 $收敛率,而且揭示了一个非凡的属性:MLE,没有额外的正则化,可能完全稀疏,并且包含$ t $的真实零模式。我们进一步表明,MLE既是最佳的最佳选择,又适应了一大批稀疏主题分布中未知的稀疏性。当$ a $未知时,我们通过优化与$ a $ a $的插件的可能性功能来估计$ t $。对于任何满足与$ a $ $ a $的详细条件的估计器$ \ hat {a} $,显示出$ t $的估计器可保留为MLE建立的属性。环境尺寸$ k $和$ p $可以随着样本量而增长。我们的应用是对文档生成分布之间1-Wasserstein距离的估计。我们建议,估计和分析两个概率文档表示之间的新1-Wasserstein距离。
translated by 谷歌翻译
Gaussian graphical models provide a powerful framework for uncovering conditional dependence relationships between sets of nodes; they have found applications in a wide variety of fields including sensor and communication networks, physics, finance, and computational biology. Often, one observes data on the nodes and the task is to learn the graph structure, or perform graphical model selection. While this is a well-studied problem with many popular techniques, there are typically three major practical challenges: i) many existing algorithms become computationally intractable in huge-data settings with tens of thousands of nodes; ii) the need for separate data-driven hyperparameter tuning considerably adds to the computational burden; iii) the statistical accuracy of selected edges often deteriorates as the dimension and/or the complexity of the underlying graph structures increase. We tackle these problems by developing the novel Minipatch Graph (MPGraph) estimator. Our approach breaks up the huge graph learning problem into many smaller problems by creating an ensemble of tiny random subsets of both the observations and the nodes, termed minipatches. We then leverage recent advances that use hard thresholding to solve the latent variable graphical model problem to consistently learn the graph on each minipatch. Our approach is computationally fast, embarrassingly parallelizable, memory efficient, and has integrated stability-based hyperparamter tuning. Additionally, we prove that under weaker assumptions than that of the Graphical Lasso, our MPGraph estimator achieves graph selection consistency. We compare our approach to state-of-the-art computational approaches for Gaussian graphical model selection including the BigQUIC algorithm, and empirically demonstrate that our approach is not only more statistically accurate but also extensively faster for huge graph learning problems.
translated by 谷歌翻译
我们提出了对学度校正随机块模型(DCSBM)的合适性测试。该测试基于调整后的卡方统计量,用于测量$ n $多项式分布的组之间的平等性,该分布具有$ d_1,\ dots,d_n $观测值。在网络模型的背景下,多项式的数量($ n $)的数量比观测值数量($ d_i $)快得多,与节点$ i $的度相对应,因此设置偏离了经典的渐近学。我们表明,只要$ \ {d_i \} $的谐波平均值生长到无穷大,就可以使统计量在NULL下分配。顺序应用时,该测试也可以用于确定社区数量。该测试在邻接矩阵的压缩版本上进行操作,因此在学位上有条件,因此对大型稀疏网络具有高度可扩展性。我们结合了一个新颖的想法,即在测试$ K $社区时根据$(k+1)$ - 社区分配来压缩行。这种方法在不牺牲计算效率的情况下增加了顺序应用中的力量,我们证明了它在恢复社区数量方面的一致性。由于测试统计量不依赖于特定的替代方案,因此其效用超出了顺序测试,可用于同时测试DCSBM家族以外的各种替代方案。特别是,我们证明该测试与具有社区结构的潜在可变性网络模型的一般家庭一致。
translated by 谷歌翻译
套索是一种高维回归的方法,当时,当协变量$ p $的订单数量或大于观测值$ n $时,通常使用它。由于两个基本原因,经典的渐近态性理论不适用于该模型:$(1)$正规风险是非平滑的; $(2)$估算器$ \ wideHat {\ boldsymbol {\ theta}} $与true参数vector $ \ boldsymbol {\ theta}^*$无法忽略。结果,标准的扰动论点是渐近正态性的传统基础。另一方面,套索估计器可以精确地以$ n $和$ p $大,$ n/p $的订单为一。这种表征首先是在使用I.I.D的高斯设计的情况下获得的。协变量:在这里,我们将其推广到具有非偏差协方差结构的高斯相关设计。这是根据更简单的``固定设计''模型表示的。我们在两个模型中各种数量的分布之间的距离上建立了非反应界限,它们在合适的稀疏类别中均匀地固定在信号上$ \ boldsymbol {\ theta}^*$。作为应用程序,我们研究了借助拉索的分布,并表明需要校正程度对于计算有效的置信区间是必要的。
translated by 谷歌翻译
我们调查与高斯的混合的数据分享共同但未知,潜在虐待协方差矩阵的数据。我们首先考虑具有两个等级大小的组件的高斯混合,并根据最大似然估计导出最大切割整数程序。当样品的数量在维度下线性增长时,我们证明其解决方案实现了最佳的错误分类率,直到对数因子。但是,解决最大切割问题似乎是在计算上棘手的。为了克服这一点,我们开发了一种高效的频谱算法,该算法达到最佳速率,但需要一种二次样本量。虽然这种样本复杂性比最大切割问题更差,但我们猜测没有多项式方法可以更好地执行。此外,我们收集了支持统计计算差距存在的数值和理论证据。最后,我们将MAX-CUT程序概括为$ k $ -means程序,该程序处理多组分混合物的可能性不平等。它享有相似的最优性保证,用于满足运输成本不平等的分布式的混合物,包括高斯和强烈的对数的分布。
translated by 谷歌翻译
我们考虑学习底层多变量数据的稀疏无向图的问题。我们专注于稀疏精度矩阵上的图表拉普拉斯相关的约束,它在与图形节点相关联的随机变量之间编码条件依赖性。在这些约束下,精度矩阵的偏差元素是非正(总阳性),并且精度矩阵可能不是全级。我们调查了对广泛使用惩罚的日志似然方法来强制执行总积极性但不是拉普拉斯结构的修改。然后可以从非对角线精密矩阵中提取图拉普拉斯。乘法器(ADMM)算法的交替方向方法被提出和分析了Laplacian相关约束和套索的约束优化以及自适应套索处罚。基于合成数据的数值结果表明,所提出的约束的自适应套索方法显着优于现有的基于拉普拉斯的方法。我们还评估了我们对实际财务数据的方法。
translated by 谷歌翻译
We study a multi-factor block model for variable clustering and connect it to the regularized subspace clustering by formulating a distributionally robust version of the nodewise regression. To solve the latter problem, we derive a convex relaxation, provide guidance on selecting the size of the robust region, and hence the regularization weighting parameter, based on the data, and propose an ADMM algorithm for implementation. We validate our method in an extensive simulation study. Finally, we propose and apply a variant of our method to stock return data, obtain interpretable clusters that facilitate portfolio selection and compare its out-of-sample performance with other clustering methods in an empirical study.
translated by 谷歌翻译
我们研究稀疏的线性回归在一个代理网络上,建模为无向图(没有集中式节点)。估计问题被制定为当地套索损失函数的最小化,加上共识约束的二次惩罚 - 后者是获取分布式解决方案方法的工具。虽然在优化文献中广泛研究了基于惩罚的共识方法,但其高维设置中的统计和计算保证仍不清楚。这项工作提供了对此公开问题的答案。我们的贡献是两倍。 First, we establish statistical consistency of the estimator: under a suitable choice of the penalty parameter, the optimal solution of the penalized problem achieves near optimal minimax rate $\mathcal{O}(s \log d/N)$ in $\ell_2 $ -loss,$ s $是稀疏性值,$ d $是环境维度,$ n $是网络中的总示例大小 - 这与集中式采样率相匹配。其次,我们表明,应用于惩罚问题的近端梯度算法,它自然导致分布式实现,线性地收敛到集中统计误差的顺序的公差 - 速率比例为$ \ mathcal {o}( d)$,揭示不可避免的速度准确性困境。数值结果证明了衍生的采样率和收敛速率缩放的紧张性。
translated by 谷歌翻译
矩阵正常模型,高斯矩阵变化分布的系列,其协方差矩阵是两个较低尺寸因子的Kronecker乘积,经常用于模拟矩阵变化数据。张量正常模型将该家庭推广到三个或更多因素的Kronecker产品。我们研究了矩阵和张量模型中协方差矩阵的Kronecker因子的估计。我们向几个自然度量中的最大似然估计器(MLE)实现的误差显示了非因素界限。与现有范围相比,我们的结果不依赖于条件良好或稀疏的因素。对于矩阵正常模型,我们所有的所有界限都是最佳的对数因子最佳,对于张量正常模型,我们对最大因数和整体协方差矩阵的绑定是最佳的,所以提供足够的样品以获得足够的样品以获得足够的样品常量Frobenius错误。在与我们的样本复杂性范围相同的制度中,我们表明迭代程序计算称为触发器算法称为触发器算法的MLE的线性地收敛,具有高概率。我们的主要工具是Fisher信息度量诱导的正面矩阵的几何中的测地强凸性。这种强大的凸起由某些随机量子通道的扩展来决定。我们还提供了数值证据,使得将触发器算法与简单的收缩估计器组合可以提高缺乏采样制度的性能。
translated by 谷歌翻译
Network data are ubiquitous in modern machine learning, with tasks of interest including node classification, node clustering and link prediction. A frequent approach begins by learning an Euclidean embedding of the network, to which algorithms developed for vector-valued data are applied. For large networks, embeddings are learned using stochastic gradient methods where the sub-sampling scheme can be freely chosen. Despite the strong empirical performance of such methods, they are not well understood theoretically. Our work encapsulates representation methods using a subsampling approach, such as node2vec, into a single unifying framework. We prove, under the assumption that the graph is exchangeable, that the distribution of the learned embedding vectors asymptotically decouples. Moreover, we characterize the asymptotic distribution and provided rates of convergence, in terms of the latent parameters, which includes the choice of loss function and the embedding dimension. This provides a theoretical foundation to understand what the embedding vectors represent and how well these methods perform on downstream tasks. Notably, we observe that typically used loss functions may lead to shortcomings, such as a lack of Fisher consistency.
translated by 谷歌翻译
我们考虑使用共享结构估算两个功能无向图形模型之间的差异的问题。在许多应用中,数据自然被认为是随机函数的向量而不是标量的矢量。例如,脑电图(EEG)数据更适当地被视为时间函数。在这样的问题中,不仅可以每个样本测量的函数数量大,而且每个功能都是自身是无限尺寸对象,使估计模型参数具有挑战性。这进一步复杂于曲线通常仅在离散时间点观察到。我们首先定义一个功能差异图,捕获两个功能图形模型之间的差异,并在功能性差分图定义良好时正式表征。然后,我们提出了一种方法,软件,直接估计功能差异图,而不首先估计每个图形。这在各个图形是密集的情况下,这是特别有益的,但差分图是稀疏的。我们表明,融合始终估计功能差图,即使在全面观察和离散的功能路径的高维设置中也是如此。我们通过仿真研究说明了我们方法的有限样本性质。我们还提出了一种竞争方法,该方法是关节功能图形套索,它概括了关节图形套索到功能设置。最后,我们将我们的方法应用于EEG数据,以揭示一群含有酒精使用障碍和对照组的个体之间的功能性脑连接的差异。
translated by 谷歌翻译