无似然推理涉及在给定的数据和模拟器模型的情况下推断参数值。模拟器是计算机代码,它采用参数,执行随机计算并输出模拟数据。在这项工作中,我们将模拟器视为一个函数,其输入为(1)参数和(2)伪随机绘制的向量。我们试图推断出以观察结果为条件的所有这些输入。这是具有挑战性的,因为最终的后验可能是高维且涉及强大的依赖性。我们使用归一化流量(柔性参数密度族)近似后验。训练数据是通过具有较大带宽值Epsilon的非似然重要性采样来生成的,这使得目标与先验相似。培训数据通过使用它来训练更新的归一流流程来“蒸馏”。该过程是迭代的,使用更新的流程作为重要性采样建议,并慢慢降低epsilon,从而使目标变得更接近后部。与大多数其他无似然的方法不同,我们避免将数据减少到低维汇总统计数据,因此可以实现更准确的结果。我们在两个充满挑战的排队和流行病学示例中说明了我们的方法。
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基于采样的推理技术是现代宇宙学数据分析的核心;然而,这些方法与维度不良,通常需要近似或顽固的可能性。在本文中,我们描述了截短的边际神经比率估计(TMNRE)(即所谓的基于模拟的推断的新方法)自然避免了这些问题,提高了$(i)$效率,$(ii)$可扩展性和$ (iii)推断后的后续后续的可信度。使用宇宙微波背景(CMB)的测量,我们表明TMNRE可以使用比传统马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)方法更少模拟器呼叫的数量级来实现融合的后海后。值得注意的是,所需数量的样本有效地独立于滋扰参数的数量。此外,称为\ MEMPH {本地摊销}的属性允许对基于采样的方法无法访问的严格统计一致性检查的性能。 TMNRE承诺成为宇宙学数据分析的强大工具,特别是在扩展宇宙学的背景下,其中传统的基于采样的推理方法所需的时间级数融合可以大大超过$ \ Lambda $ CDM等简单宇宙学模型的时间。为了执行这些计算,我们使用开源代码\ texttt {swyft}来使用TMNRE的实现。
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Normalizing flows provide a general mechanism for defining expressive probability distributions, only requiring the specification of a (usually simple) base distribution and a series of bijective transformations. There has been much recent work on normalizing flows, ranging from improving their expressive power to expanding their application. We believe the field has now matured and is in need of a unified perspective. In this review, we attempt to provide such a perspective by describing flows through the lens of probabilistic modeling and inference. We place special emphasis on the fundamental principles of flow design, and discuss foundational topics such as expressive power and computational trade-offs. We also broaden the conceptual framing of flows by relating them to more general probability transformations. Lastly, we summarize the use of flows for tasks such as generative modeling, approximate inference, and supervised learning.
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无似然方法是对可以模拟的隐式模型执行推断的必不可少的工具,但相应的可能性是棘手的。但是,常见的无可能方法不能很好地扩展到大量模型参数。一种有前途的无可能推理的有前途的方法涉及通过仅根据据信为低维成分提供信息的摘要统计数据来估计低维边缘后期,然后在某种程度上结合了低维近似值。在本文中,我们证明,对于看似直观的汇总统计选择,这种低维近似值在实践中可能是差的。我们描述了一个理想化的低维汇总统计量,原则上适用于边际估计。但是,在实践中很难直接近似理想的选择。因此,我们提出了一种替代的边际估计方法,该方法更容易实施和自动化。考虑到初始选择的低维摘要统计量可能仅对边缘后验位置有用,新方法通过使用所有摘要统计数据来确保全局可识别性来提高性能,从而提高性能使用低维摘要统计量进行精确的低维近似。我们表明,该方法的后部可以分别基于低维和完整的摘要统计数据将其表示为后验分布的对数库。在几个示例中说明了我们方法的良好性能。
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Simulation-based inference (SBI) solves statistical inverse problems by repeatedly running a stochastic simulator and inferring posterior distributions from model-simulations. To improve simulation efficiency, several inference methods take a sequential approach and iteratively adapt the proposal distributions from which model simulations are generated. However, many of these sequential methods are difficult to use in practice, both because the resulting optimisation problems can be challenging and efficient diagnostic tools are lacking. To overcome these issues, we present Truncated Sequential Neural Posterior Estimation (TSNPE). TSNPE performs sequential inference with truncated proposals, sidestepping the optimisation issues of alternative approaches. In addition, TSNPE allows to efficiently perform coverage tests that can scale to complex models with many parameters. We demonstrate that TSNPE performs on par with previous methods on established benchmark tasks. We then apply TSNPE to two challenging problems from neuroscience and show that TSNPE can successfully obtain the posterior distributions, whereas previous methods fail. Overall, our results demonstrate that TSNPE is an efficient, accurate, and robust inference method that can scale to challenging scientific models.
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重要的加权是调整蒙特卡洛集成以说明错误分布中抽取的一种一般方法,但是当重要性比的右尾巴较重时,最终的估计值可能是高度可变的。当目标分布的某些方面无法通过近似分布捕获,在这种情况下,可以通过修改极端重要性比率来获得更稳定的估计。我们提出了一种新的方法,该方法使用拟合模拟重要性比率的上尾的广义帕累托分布来稳定重要性权重。该方法在经验上的性能要比现有方法稳定重要性采样估计值更好,包括稳定的有效样本量估计,蒙特卡洛误差估计和收敛诊断。提出的帕累托$ \ hat {k} $有限样本收敛率诊断对任何蒙特卡洛估计器都有用。
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Scientists continue to develop increasingly complex mechanistic models to reflect their knowledge more realistically. Statistical inference using these models can be highly challenging, since the corresponding likelihood function is often intractable, and model simulation may be computationally burdensome or infeasible. Fortunately, in many of these situations, it is possible to adopt a surrogate model or approximate likelihood function. It may be convenient to base Bayesian inference directly on the surrogate, but this can result in bias and poor uncertainty quantification. In this paper we propose a new method for adjusting approximate posterior samples to reduce bias and produce more accurate uncertainty quantification. We do this by optimising a transform of the approximate posterior that minimises a scoring rule. Our approach requires only a (fixed) small number of complex model simulations and is numerically stable. We demonstrate good performance of the new method on several examples of increasing complexity.
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潜在位置网络模型是网络科学的多功能工具;应用程序包括集群实体,控制因果混淆,并在未观察的图形上定义前提。估计每个节点的潜在位置通常是贝叶斯推理问题的群体,吉布斯内的大都市是最流行的近似后分布的工具。然而,众所周知,GIBBS内的大都市对于大型网络而言是低效;接受比计算成本昂贵,并且所得到的后绘高度相关。在本文中,我们提出了一个替代的马尔可夫链蒙特卡罗战略 - 使用分裂哈密顿蒙特卡罗和萤火虫蒙特卡罗的组合定义 - 利用后部分布的功能形式进行更有效的后退计算。我们展示了这些战略在吉布斯和综合网络上的其他算法中优于大都市,以及学区的教师和工作人员的真正信息共享网络。
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The choice of approximate posterior distribution is one of the core problems in variational inference. Most applications of variational inference employ simple families of posterior approximations in order to allow for efficient inference, focusing on mean-field or other simple structured approximations. This restriction has a significant impact on the quality of inferences made using variational methods. We introduce a new approach for specifying flexible, arbitrarily complex and scalable approximate posterior distributions. Our approximations are distributions constructed through a normalizing flow, whereby a simple initial density is transformed into a more complex one by applying a sequence of invertible transformations until a desired level of complexity is attained. We use this view of normalizing flows to develop categories of finite and infinitesimal flows and provide a unified view of approaches for constructing rich posterior approximations. We demonstrate that the theoretical advantages of having posteriors that better match the true posterior, combined with the scalability of amortized variational approaches, provides a clear improvement in performance and applicability of variational inference.
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标准化流是可易处理的密度模型,可以近似复杂的目标分布,例如物理系统的玻尔兹曼分布。但是,当前的训练流量要么具有寻求模式的行为,要么使用昂贵的MCMC模拟事先生成的目标样本,要么使用具有很高差异的随机损失。为了避免这些问题,我们以退火重要性采样(AIS)增强流量,并最大程度地减少覆盖$ \ alpha $ -divergence的质量,并使用$ \ alpha = 2 $,从而最大程度地减少了重要性的重量差异。我们的方法是流动性Bootstrap(Fab),使用AIS在流动较差的目标区域中生成样品,从而促进了新模式的发现。我们以AIS的最小差异分布来定位,以通过重要性抽样来估计$ \ alpha $ -Divergence。我们还使用优先的缓冲区来存储和重复使用AIS样本。这两个功能显着提高了Fab的性能。我们将FAB应用于复杂的多模式目标,并表明我们可以在以前的方法失败的情况下非常准确地近似它们。据我们所知,我们是第一个仅使用非均衡目标密度学习丙氨酸二肽分子的玻璃体分布,而无需通过分子动力学(MD)模拟生成的样品:FAB与通过最大可能性训练更好的效果,而不是通过最大可能性产生的结果。在MD样品上使用100倍的目标评估。在重新获得重要权重的样品后,我们获得了与地面真相几乎相同的二面角的无偏直方图。
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统计模型是机器学习的核心,具有广泛适用性,跨各种下游任务。模型通常由通过最大似然估计从数据估计的自由参数控制。但是,当面对现实世界数据集时,许多模型运行到一个关键问题:它们是在完全观察到的数据方面配制的,而在实践中,数据集会困扰缺失数据。来自不完整数据的统计模型估计理论在概念上类似于潜在变量模型的估计,其中存在强大的工具,例如变分推理(VI)。然而,与标准潜在变量模型相比,具有不完整数据的参数估计通常需要估计缺失变量的指数 - 许多条件分布,因此使标准的VI方法是棘手的。通过引入变分Gibbs推理(VGI),是一种新的通用方法来解决这个差距,以估计来自不完整数据的统计模型参数。我们在一组合成和实际估算任务上验证VGI,从不完整的数据中估算重要的机器学习模型,VAE和标准化流程。拟议的方法,同时通用,实现比现有的特定模型特定估计方法竞争或更好的性能。
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这是模型选择和假设检测的边缘似然计算的最新介绍和概述。计算概率模型(或常量比率)的常规规定常数是许多统计数据,应用数学,信号处理和机器学习中的许多应用中的基本问题。本文提供了对主题的全面研究。我们突出了不同技术之间的局限性,优势,连接和差异。还描述了使用不正确的前沿的问题和可能的解决方案。通过理论比较和数值实验比较一些最相关的方法。
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我们提出了连续重复的退火流传输蒙特卡洛(CRAFT),该方法结合了顺序的蒙特卡洛(SMC)采样器(本身是退火重要性采样的概括)与使用归一化流量的变异推断。直接训练了归一化的流量,可用于使用KL差异进行每个过渡,以在退火温度之间运输。使用归一化流/SMC近似值估算了此优化目标。我们从概念上展示并使用多个经验示例,这些示例可以改善退火流运输蒙特卡洛(Arbel等,2021),并在其上建造,也可以在基于马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)基于基于的随机归一化流(Wu等人。2020)。通过将工艺纳入粒子MCMC中,我们表明,这种学识渊博的采样器可以在具有挑战性的晶格场理论示例中获得令人印象深刻的准确结果。
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变异推理(VI)的核心原理是将计算复杂后概率密度计算的统计推断问题转换为可拖动的优化问题。该属性使VI比几种基于采样的技术更快。但是,传统的VI算法无法扩展到大型数据集,并且无法轻易推断出越野数据点,而无需重新运行优化过程。该领域的最新发展,例如随机,黑框和摊销VI,已帮助解决了这些问题。如今,生成的建模任务广泛利用摊销VI来实现其效率和可扩展性,因为它利用参数化函数来学习近似的后验密度参数。在本文中,我们回顾了各种VI技术的数学基础,以构成理解摊销VI的基础。此外,我们还概述了最近解决摊销VI问题的趋势,例如摊销差距,泛化问题,不一致的表示学习和后验崩溃。最后,我们分析了改善VI优化的替代差异度量。
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本文介绍了一个新的神经网络,在$ \ mathbb r ^ d $的真实值函数之前,通过施工更容易和便宜地缩放到域维数$ d $与通常的karhunen-lo \`eve相比功能空间之前。新的先前是高斯神经网络,其中每个重量和偏差都有一个独立的高斯的先前,但是差异的关键差异是,差异在网络的宽度下减小,使得所得到的函数几乎肯定地定义了很多无限宽度网络的极限。我们表明,在推断未知功能的贝叶斯治疗中,使用希尔伯特Space Markov链蒙特卡罗(MCMC)方法,诱导的后续功能均可用于蒙特卡罗采样。这种类型的MCMC很受欢迎,例如,在贝叶斯逆问题文献中,因为它在网眼细化下稳定,即接受概率不会缩小到0美元,因为函数之前的更多参数甚至是AD Infinitum。在数值例子中,我们展示了其他功能空间前沿的这些竞争优势。我们还在贝叶斯加固学习中实施示例以自动化数据的任务,并首次演示MCMC的稳定性以对这些类型的问题进行网格细化。
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我们提出了一种非常重要的抽样方法,该方法适用于估计高维问题中的罕见事件概率。我们将一般重要性抽样问题中的最佳重要性分布近似为在订单保留转换组成下的参考分布的推动力,在这种转换的组成下,每种转换都是由平方的张量训练 - 培训分解形成的。平方张量训练的分解提供了可扩展的ANSATZ,用于通过密度近似值来构建具有订单的高维转换。沿着一系列桥接密度移动的地图组成的使用减轻了直接近似浓缩密度函数的难度。为了计算对非规范概率分布的期望,我们设计了一个比率估计器,该比率估计器使用单独的重要性分布估算归一化常数,这再次通过张量训练格式的转换组成构建。与自称的重要性抽样相比,这提供了更好的理论差异,因此为贝叶斯推理问题中罕见事件概率的有效计算打开了大门。关于受微分方程约束的问题的数值实验显示,计算复杂性几乎没有增加,事件概率将零,并允许对迄今为止对复杂,高维后密度的罕见事件概率的迄今无法获得的估计。
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We present the GPry algorithm for fast Bayesian inference of general (non-Gaussian) posteriors with a moderate number of parameters. GPry does not need any pre-training, special hardware such as GPUs, and is intended as a drop-in replacement for traditional Monte Carlo methods for Bayesian inference. Our algorithm is based on generating a Gaussian Process surrogate model of the log-posterior, aided by a Support Vector Machine classifier that excludes extreme or non-finite values. An active learning scheme allows us to reduce the number of required posterior evaluations by two orders of magnitude compared to traditional Monte Carlo inference. Our algorithm allows for parallel evaluations of the posterior at optimal locations, further reducing wall-clock times. We significantly improve performance using properties of the posterior in our active learning scheme and for the definition of the GP prior. In particular we account for the expected dynamical range of the posterior in different dimensionalities. We test our model against a number of synthetic and cosmological examples. GPry outperforms traditional Monte Carlo methods when the evaluation time of the likelihood (or the calculation of theoretical observables) is of the order of seconds; for evaluation times of over a minute it can perform inference in days that would take months using traditional methods. GPry is distributed as an open source Python package (pip install gpry) and can also be found at https://github.com/jonaselgammal/GPry.
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概率分布允许从业者发现数据中的隐藏结构,并构建模型,以使用有限的数据解决监督的学习问题。该报告的重点是变异自动编码器,这是一种学习大型复杂数据集概率分布的方法。该报告提供了对变异自动编码器的理论理解,并巩固了该领域的当前研究。该报告分为多个章节,第一章介绍了问题,描述了变异自动编码器并标识了该领域的关键研究方向。第2、3、4和5章深入研究了每个关键研究领域的细节。第6章总结了报告,并提出了未来工作的指示。具有机器学习基本思想但想了解机器学习研究中的一般主题的读者可以从报告中受益。该报告解释了有关学习概率分布的中心思想,人们为使这种危险做些什么,并介绍了有关当前如何应用深度学习的细节。该报告还为希望为这个子场做出贡献的人提供了温和的介绍。
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远期操作员的计算成本和选择适当的先前分布的计算成本挑战了贝叶斯对高维逆问题的推断。摊销的变异推理解决了这些挑战,在这些挑战中,训练神经网络以近似于现有模型和数据对的后验分布。如果以前看不见的数据和正态分布的潜在样品作为输入,则预处理的深神经网络(在我们的情况下是有条件的正常化流量)几乎没有成本的后验样品。然而,这种方法的准确性取决于高保真训练数据的可用性,由于地球的异质结构,由于地球物理逆问题很少存在。此外,准确的摊销变异推断需要从训练数据分布中汲取观察到的数据。因此,我们建议通过基于物理学的校正对有条件的归一化流量分布来提高摊销变异推断的弹性。为了实现这一目标,我们不是标准的高斯潜在分布,我们通过具有未知平均值和对角线协方差的高斯分布来对潜在分布进行参数化。然后,通过最小化校正后分布和真实后验分布之间的kullback-leibler差异来估算这些未知数量。尽管通用和适用于其他反问题,但通过地震成像示例,我们表明我们的校正步骤可提高摊销变异推理的鲁棒性,以相对于源实验数量的变化,噪声方差以及先前分布的变化。这种方法提供了伪像有限的地震图像,并评估其不确定性,其成本大致与五个反度迁移相同。
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变异推理通常从近似分布q到后p中最小化“反向” kullbeck-leibeler(kl)kl(q || p)。最近的工作研究“正向” KL KL(P || Q),它与反向KL不同并不能导致低估不确定性的变异近似值。本文介绍了运输评分攀登(TSC),该方法通过使用汉密尔顿蒙特卡洛(HMC)和新型的自适应传输图来优化KL(P || Q)。传输图通过充当潜在变量空间和扭曲空间之间变量的变化来改善HMC的轨迹。TSC使用HMC样品在优化KL时动态训练传输图(P || Q)。TSC利用协同作用,在该协同作用下,更好的运输地图会导致更好的HMC采样,从而导致更好的传输地图。我们在合成和真实数据上演示了TSC。我们发现,在训练大规模数据的变异自动编码器时,TSC可以实现竞争性能。
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