通过变分贝叶斯近似来提出框架,用于拟合逆问题模型。与标准马尔可夫链蒙特卡罗方法相比,这种方法可确保对广泛的应用,良好的应用,良好的精度性能和降低的模型拟合时间来灵活。我们描述的变分贝叶斯的消息传递和因子图片段方法促进了简化的近似推理算法的实现,并形成软件开发的基础。这种方法允许将许多响应分布和惩罚抑制到逆问题模型中。尽管我们的工作被赋予了一个和二维响应变量,但我们展示了一个基础设施,其中还可以导出基于变量之间的无效弱交互的有效算法更新,以便在更高维度中的逆问题。通过生物医学和考古问题激励的图像处理应用程序作为图示。
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We develop an optimization algorithm suitable for Bayesian learning in complex models. Our approach relies on natural gradient updates within a general black-box framework for efficient training with limited model-specific derivations. It applies within the class of exponential-family variational posterior distributions, for which we extensively discuss the Gaussian case for which the updates have a rather simple form. Our Quasi Black-box Variational Inference (QBVI) framework is readily applicable to a wide class of Bayesian inference problems and is of simple implementation as the updates of the variational posterior do not involve gradients with respect to the model parameters, nor the prescription of the Fisher information matrix. We develop QBVI under different hypotheses for the posterior covariance matrix, discuss details about its robust and feasible implementation, and provide a number of real-world applications to demonstrate its effectiveness.
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这项正在进行的工作旨在为统计学习提供统一的介绍,从诸如GMM和HMM等经典模型到现代神经网络(如VAE和扩散模型)缓慢地构建。如今,有许多互联网资源可以孤立地解释这一点或新的机器学习算法,但是它们并没有(也不能在如此简短的空间中)将这些算法彼此连接起来,或者与统计模型的经典文献相连现代算法出现了。同样明显缺乏的是一个单一的符号系统,尽管对那些已经熟悉材料的人(如这些帖子的作者)不满意,但对新手的入境造成了重大障碍。同样,我的目的是将各种模型(尽可能)吸收到一个用于推理和学习的框架上,表明(以及为什么)如何以最小的变化将一个模型更改为另一个模型(其中一些是新颖的,另一些是文献中的)。某些背景当然是必要的。我以为读者熟悉基本的多变量计算,概率和统计以及线性代数。这本书的目标当然不是​​完整性,而是从基本知识到过去十年中极强大的新模型的直线路径或多或少。然后,目标是补充而不是替换,诸如Bishop的\ emph {模式识别和机器学习}之类的综合文本,该文本现在已经15岁了。
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潜在位置网络模型是网络科学的多功能工具;应用程序包括集群实体,控制因果混淆,并在未观察的图形上定义前提。估计每个节点的潜在位置通常是贝叶斯推理问题的群体,吉布斯内的大都市是最流行的近似后分布的工具。然而,众所周知,GIBBS内的大都市对于大型网络而言是低效;接受比计算成本昂贵,并且所得到的后绘高度相关。在本文中,我们提出了一个替代的马尔可夫链蒙特卡罗战略 - 使用分裂哈密顿蒙特卡罗和萤火虫蒙特卡罗的组合定义 - 利用后部分布的功能形式进行更有效的后退计算。我们展示了这些战略在吉布斯和综合网络上的其他算法中优于大都市,以及学区的教师和工作人员的真正信息共享网络。
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One of the core problems of modern statistics is to approximate difficult-to-compute probability densities. This problem is especially important in Bayesian statistics, which frames all inference about unknown quantities as a calculation involving the posterior density. In this paper, we review variational inference (VI), a method from machine learning that approximates probability densities through optimization. VI has been used in many applications and tends to be faster than classical methods, such as Markov chain Monte Carlo sampling. The idea behind VI is to first posit a family of densities and then to find the member of that family which is close to the target. Closeness is measured by Kullback-Leibler divergence. We review the ideas behind mean-field variational inference, discuss the special case of VI applied to exponential family models, present a full example with a Bayesian mixture of Gaussians, and derive a variant that uses stochastic optimization to scale up to massive data. We discuss modern research in VI and highlight important open problems. VI is powerful, but it is not yet well understood. Our hope in writing this paper is to catalyze statistical research on this class of algorithms.
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回归模型用于各种应用,为来自不同领域的研究人员提供强大的科学工具。线性或简单的参数,模型通常不足以描述输入变量与响应之间的复杂关系。通过诸如神经网络的灵活方法可以更好地描述这种关系,但这导致不太可解释的模型和潜在的过度装备。或者,可以使用特定的参数非线性函数,但是这种功能的规范通常是复杂的。在本文中,我们介绍了一种灵活的施工方法,高度灵活的非线性参数回归模型。非线性特征是分层的,类似于深度学习,但对要考虑的可能类型的功能具有额外的灵活性。这种灵活性,与变量选择相结合,使我们能够找到一小部分重要特征,从而可以更具可解释的模型。在可能的功能的空间内,考虑了贝叶斯方法,基于它们的复杂性引入功能的前沿。采用遗传修改模式跳跃马尔可夫链蒙特卡罗算法来执行贝叶斯推理和估计模型平均的后验概率。在各种应用中,我们说明了我们的方法如何用于获得有意义的非线性模型。此外,我们将其预测性能与多个机器学习算法进行比较。
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我们引入了一种新的经验贝叶斯方法,用于大规模多线性回归。我们的方法结合了两个关键思想:(i)使用灵活的“自适应收缩”先验,该先验近似于正常分布的有限混合物,近似于正常分布的非参数家族; (ii)使用变分近似来有效估计先前的超参数并计算近似后期。将这两个想法结合起来,将快速,灵活的方法与计算速度相当,可与快速惩罚的回归方法(例如Lasso)相当,并在各种场景中具有出色的预测准确性。此外,我们表明,我们方法中的后验平均值可以解释为解决惩罚性回归问题,并通过直接解决优化问题(而不是通过交叉验证来调整)从数据中学到的惩罚函数的精确形式。 。我们的方法是在r https://github.com/stephenslab/mr.ash.ash.alpha的r软件包中实现的
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本文介绍了使用基于补丁的先前分布的图像恢复的新期望传播(EP)框架。虽然Monte Carlo技术典型地用于从难以处理的后分布中进行采样,但它们可以在诸如图像恢复之类的高维推论问题中遭受可扩展性问题。为了解决这个问题,这里使用EP来使用多元高斯密度的产品近似后分布。此外,对这些密度的协方差矩阵施加结构约束允许更大的可扩展性和分布式计算。虽然该方法自然适于处理添加剂高斯观察噪声,但它也可以扩展到非高斯噪声。用于高斯和泊松噪声的去噪,染色和去卷积问题进行的实验说明了这种柔性近似贝叶斯方法的潜在益处,以实现与采样技术相比降低的计算成本。
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在本文中,我们提出了一个参数化因素,该因子可以对随机变量之间存在线性依赖性的高斯网络进行推理。我们的因素表示有效地是对传统高斯参数化的概括,在这种情况下,协方差矩阵的正定限制已被放松。为此,我们得出了各种统计操作和结果(例如,随机变量的边缘化,乘法和仿射转换)将高斯因子的能力扩展到这些退化设置。通过使用此原则性因素定义,可以以几乎没有额外的计算成本来准确,自动适应退化。作为例证,我们将方法应用于一个代表性的示例,该示例涉及合作移动机器人的递归状态估计。
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这是机器学习中(主要是)笔和纸练习的集合。练习在以下主题上:线性代数,优化,定向图形模型,无向图形模型,图形模型的表达能力,因子图和消息传递,隐藏马尔可夫模型的推断,基于模型的学习(包括ICA和非正态模型),采样和蒙特卡洛整合以及变异推断。
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结构化参数空间的自然梯度下降(NGD)(例如,低级CovariRces)是由于困难的Fisher矩阵计算而在计算上具有挑战性。我们通过使用\ emph {local-parameter坐标}来解决此问题,以获取灵活且高效的NGD方法,适用于各种结构化参数化。我们显示了四个应用程序,我们的方法(1)概括指数自然进化策略,(2)恢复现有的牛顿样算法,(3)通过矩阵组产生新的结构化二阶算法,(4)给出了新的算法高斯和基于Wishart的分布的协方差。我们展示了深度学习,变分推论和进化策略的一系列问题。我们的工作为可扩展结构化几何方法开辟了新的方向。
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神经网络最近显示出对无似然推理的希望,从而为经典方法提供了魔力的速度。但是,当从独立重复估计参数时,当前的实现是次优的。在本文中,我们使用决策理论框架来争辩说,如果这些模型的模拟很简单,则理想地放置了置换不变的神经网络,可用于为任意模型构造贝叶斯估计器。我们说明了这些估计量在传统空间模型以及高度参数化的空间发射模型上的潜力,并表明它们在其网络设计中不适当地说明复制的神经估计量相当大。同时,它们比基于传统可能性的估计量具有很高的竞争力和更快的速度。我们将估计量应用于红海中海面温度的空间分析,在训练之后,我们获得参数估计值,并通过引导采样对估计值进行不确定性定量,从一秒钟的数百个空间场中获取。
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Existing deep-learning based tomographic image reconstruction methods do not provide accurate estimates of reconstruction uncertainty, hindering their real-world deployment. This paper develops a method, termed as the linearised deep image prior (DIP), to estimate the uncertainty associated with reconstructions produced by the DIP with total variation regularisation (TV). Specifically, we endow the DIP with conjugate Gaussian-linear model type error-bars computed from a local linearisation of the neural network around its optimised parameters. To preserve conjugacy, we approximate the TV regulariser with a Gaussian surrogate. This approach provides pixel-wise uncertainty estimates and a marginal likelihood objective for hyperparameter optimisation. We demonstrate the method on synthetic data and real-measured high-resolution 2D $\mu$CT data, and show that it provides superior calibration of uncertainty estimates relative to previous probabilistic formulations of the DIP. Our code is available at https://github.com/educating-dip/bayes_dip.
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具有伽马超高提升的分层模型提供了一个灵活,稀疏的促销框架,用于桥接$ l ^ 1 $和$ l ^ 2 $ scalalizations在贝叶斯的配方中致正问题。尽管对这些模型具有贝叶斯动机,但现有的方法仅限于\ Textit {最大后验}估计。尚未实现执行不确定性量化的可能性。本文介绍了伽马超高图的分层逆问题的变分迭代交替方案。所提出的变分推理方法产生精确的重建,提供有意义的不确定性量化,易于实施。此外,它自然地引入了用于选择超参数的模型选择。我们说明了我们在几个计算的示例中的方法的性能,包括从时间序列数据的动态系统的解卷积问题和稀疏识别。
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Low-rank matrix approximations, such as the truncated singular value decomposition and the rank-revealing QR decomposition, play a central role in data analysis and scientific computing. This work surveys and extends recent research which demonstrates that randomization offers a powerful tool for performing low-rank matrix approximation. These techniques exploit modern computational architectures more fully than classical methods and open the possibility of dealing with truly massive data sets.This paper presents a modular framework for constructing randomized algorithms that compute partial matrix decompositions. These methods use random sampling to identify a subspace that captures most of the action of a matrix. The input matrix is then compressed-either explicitly or implicitly-to this subspace, and the reduced matrix is manipulated deterministically to obtain the desired low-rank factorization. In many cases, this approach beats its classical competitors in terms of accuracy, speed, and robustness. These claims are supported by extensive numerical experiments and a detailed error analysis.The specific benefits of randomized techniques depend on the computational environment. Consider the model problem of finding the k dominant components of the singular value decomposition of an m × n matrix. (i) For a dense input matrix, randomized algorithms require O(mn log(k)) floating-point operations (flops) in contrast with O(mnk) for classical algorithms. (ii) For a sparse input matrix, the flop count matches classical Krylov subspace methods, but the randomized approach is more robust and can easily be reorganized to exploit multi-processor architectures. (iii) For a matrix that is too large to fit in fast memory, the randomized techniques require only a constant number of passes over the data, as opposed to O(k) passes for classical algorithms. In fact, it is sometimes possible to perform matrix approximation with a single pass over the data.
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Matrix factorization exploits the idea that, in complex high-dimensional data, the actual signal typically lies in lower-dimensional structures. These lower dimensional objects provide useful insight, with interpretability favored by sparse structures. Sparsity, in addition, is beneficial in terms of regularization and, thus, to avoid over-fitting. By exploiting Bayesian shrinkage priors, we devise a computationally convenient approach for high-dimensional matrix factorization. The dependence between row and column entities is modeled by inducing flexible sparse patterns within factors. The availability of external information is accounted for in such a way that structures are allowed while not imposed. Inspired by boosting algorithms, we pair the the proposed approach with a numerical strategy relying on a sequential inclusion and estimation of low-rank contributions, with data-driven stopping rule. Practical advantages of the proposed approach are demonstrated by means of a simulation study and the analysis of soccer heatmaps obtained from new generation tracking data.
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从卫星图像中提取的大气运动向量(AMV)是唯一具有良好全球覆盖范围的风观测。它们是进食数值天气预测(NWP)模型的重要特征。已经提出了几种贝叶斯模型来估计AMV。尽管对于正确同化NWP模型至关重要,但很少有方法可以彻底表征估计误差。估计误差的困难源于后验分布的特异性,这既是很高的维度,又是由于奇异的可能性而导致高度不良的条件,这在缺少数据(未观察到的像素)的情况下特别重要。这项工作研究了使用基于梯度的Markov链Monte Carlo(MCMC)算法评估AMV的预期误差。我们的主要贡献是提出一种回火策略,这相当于在点估计值附近的AMV和图像变量的联合后验分布的局部近似。此外,我们提供了与先前家庭本身有关的协方差(分数布朗运动),并具有不同的超参数。从理论的角度来看,我们表明,在规律性假设下,随着温度降低到{optimal}高斯近似值,在最大a后验(MAP)对数密度给出的点估计下,温度降低到{optimal}高斯近似值。从经验的角度来看,我们根据一些定量的贝叶斯评估标准评估了提出的方法。我们对合成和真实气象数据进行的数值模拟揭示了AMV点估计的准确性及其相关的预期误差估计值的显着提高,但在MCMC算法的收敛速度方面也有很大的加速度。
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最近有一项激烈的活动在嵌入非常高维和非线性数据结构的嵌入中,其中大部分在数据科学和机器学习文献中。我们分四部分调查这项活动。在第一部分中,我们涵盖了非线性方法,例如主曲线,多维缩放,局部线性方法,ISOMAP,基于图形的方法和扩散映射,基于内核的方法和随机投影。第二部分与拓扑嵌入方法有关,特别是将拓扑特性映射到持久图和映射器算法中。具有巨大增长的另一种类型的数据集是非常高维网络数据。第三部分中考虑的任务是如何将此类数据嵌入中等维度的向量空间中,以使数据适合传统技术,例如群集和分类技术。可以说,这是算法机器学习方法与统计建模(所谓的随机块建模)之间的对比度。在论文中,我们讨论了两种方法的利弊。调查的最后一部分涉及嵌入$ \ mathbb {r}^ 2 $,即可视化中。提出了三种方法:基于第一部分,第二和第三部分中的方法,$ t $ -sne,UMAP和大节。在两个模拟数据集上进行了说明和比较。一个由嘈杂的ranunculoid曲线组成的三胞胎,另一个由随机块模型和两种类型的节点产生的复杂性的网络组成。
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这是模型选择和假设检测的边缘似然计算的最新介绍和概述。计算概率模型(或常量比率)的常规规定常数是许多统计数据,应用数学,信号处理和机器学习中的许多应用中的基本问题。本文提供了对主题的全面研究。我们突出了不同技术之间的局限性,优势,连接和差异。还描述了使用不正确的前沿的问题和可能的解决方案。通过理论比较和数值实验比较一些最相关的方法。
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我们提出了一种新的非参数混合物模型,用于多变量回归问题,灵感来自概率K-Nearthimest邻居算法。使用有条件指定的模型,对样本外输入的预测基于与每个观察到的数据点的相似性,从而产生高斯混合物表示的预测分布。在混合物组件的参数以及距离度量标准的参数上,使用平均场变化贝叶斯算法进行后推断,并具有基于随机梯度的优化过程。在与数据大小相比,输入 - 输出关系很复杂,预测分布可能偏向或多模式的情况下,输入相对较高的尺寸,该方法尤其有利。对五个数据集进行的计算研究,其中两个是合成生成的,这说明了我们的高维输入的专家混合物方法的明显优势,在验证指标和视觉检查方面都优于竞争者模型。
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