具有伽马超高提升的分层模型提供了一个灵活,稀疏的促销框架,用于桥接$ l ^ 1 $和$ l ^ 2 $ scalalizations在贝叶斯的配方中致正问题。尽管对这些模型具有贝叶斯动机,但现有的方法仅限于\ Textit {最大后验}估计。尚未实现执行不确定性量化的可能性。本文介绍了伽马超高图的分层逆问题的变分迭代交替方案。所提出的变分推理方法产生精确的重建,提供有意义的不确定性量化,易于实施。此外,它自然地引入了用于选择超参数的模型选择。我们说明了我们在几个计算的示例中的方法的性能,包括从时间序列数据的动态系统的解卷积问题和稀疏识别。
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我们引入了一种新的经验贝叶斯方法,用于大规模多线性回归。我们的方法结合了两个关键思想:(i)使用灵活的“自适应收缩”先验,该先验近似于正常分布的有限混合物,近似于正常分布的非参数家族; (ii)使用变分近似来有效估计先前的超参数并计算近似后期。将这两个想法结合起来,将快速,灵活的方法与计算速度相当,可与快速惩罚的回归方法(例如Lasso)相当,并在各种场景中具有出色的预测准确性。此外,我们表明,我们方法中的后验平均值可以解释为解决惩罚性回归问题,并通过直接解决优化问题(而不是通过交叉验证来调整)从数据中学到的惩罚函数的精确形式。 。我们的方法是在r https://github.com/stephenslab/mr.ash.ash.alpha的r软件包中实现的
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We develop an optimization algorithm suitable for Bayesian learning in complex models. Our approach relies on natural gradient updates within a general black-box framework for efficient training with limited model-specific derivations. It applies within the class of exponential-family variational posterior distributions, for which we extensively discuss the Gaussian case for which the updates have a rather simple form. Our Quasi Black-box Variational Inference (QBVI) framework is readily applicable to a wide class of Bayesian inference problems and is of simple implementation as the updates of the variational posterior do not involve gradients with respect to the model parameters, nor the prescription of the Fisher information matrix. We develop QBVI under different hypotheses for the posterior covariance matrix, discuss details about its robust and feasible implementation, and provide a number of real-world applications to demonstrate its effectiveness.
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从卫星图像中提取的大气运动向量(AMV)是唯一具有良好全球覆盖范围的风观测。它们是进食数值天气预测(NWP)模型的重要特征。已经提出了几种贝叶斯模型来估计AMV。尽管对于正确同化NWP模型至关重要,但很少有方法可以彻底表征估计误差。估计误差的困难源于后验分布的特异性,这既是很高的维度,又是由于奇异的可能性而导致高度不良的条件,这在缺少数据(未观察到的像素)的情况下特别重要。这项工作研究了使用基于梯度的Markov链Monte Carlo(MCMC)算法评估AMV的预期误差。我们的主要贡献是提出一种回火策略,这相当于在点估计值附近的AMV和图像变量的联合后验分布的局部近似。此外,我们提供了与先前家庭本身有关的协方差(分数布朗运动),并具有不同的超参数。从理论的角度来看,我们表明,在规律性假设下,随着温度降低到{optimal}高斯近似值,在最大a后验(MAP)对数密度给出的点估计下,温度降低到{optimal}高斯近似值。从经验的角度来看,我们根据一些定量的贝叶斯评估标准评估了提出的方法。我们对合成和真实气象数据进行的数值模拟揭示了AMV点估计的准确性及其相关的预期误差估计值的显着提高,但在MCMC算法的收敛速度方面也有很大的加速度。
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Existing deep-learning based tomographic image reconstruction methods do not provide accurate estimates of reconstruction uncertainty, hindering their real-world deployment. This paper develops a method, termed as the linearised deep image prior (DIP), to estimate the uncertainty associated with reconstructions produced by the DIP with total variation regularisation (TV). Specifically, we endow the DIP with conjugate Gaussian-linear model type error-bars computed from a local linearisation of the neural network around its optimised parameters. To preserve conjugacy, we approximate the TV regulariser with a Gaussian surrogate. This approach provides pixel-wise uncertainty estimates and a marginal likelihood objective for hyperparameter optimisation. We demonstrate the method on synthetic data and real-measured high-resolution 2D $\mu$CT data, and show that it provides superior calibration of uncertainty estimates relative to previous probabilistic formulations of the DIP. Our code is available at https://github.com/educating-dip/bayes_dip.
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One of the core problems of modern statistics is to approximate difficult-to-compute probability densities. This problem is especially important in Bayesian statistics, which frames all inference about unknown quantities as a calculation involving the posterior density. In this paper, we review variational inference (VI), a method from machine learning that approximates probability densities through optimization. VI has been used in many applications and tends to be faster than classical methods, such as Markov chain Monte Carlo sampling. The idea behind VI is to first posit a family of densities and then to find the member of that family which is close to the target. Closeness is measured by Kullback-Leibler divergence. We review the ideas behind mean-field variational inference, discuss the special case of VI applied to exponential family models, present a full example with a Bayesian mixture of Gaussians, and derive a variant that uses stochastic optimization to scale up to massive data. We discuss modern research in VI and highlight important open problems. VI is powerful, but it is not yet well understood. Our hope in writing this paper is to catalyze statistical research on this class of algorithms.
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度量的运输提供了一种用于建模复杂概率分布的多功能方法,并具有密度估计,贝叶斯推理,生成建模及其他方法的应用。单调三角传输地图$ \ unicode {x2014} $近似值$ \ unicode {x2013} $ rosenblatt(kr)重新安排$ \ unicode {x2014} $是这些任务的规范选择。然而,此类地图的表示和参数化对它们的一般性和表现力以及对从数据学习地图学习(例如,通过最大似然估计)出现的优化问题的属性产生了重大影响。我们提出了一个通用框架,用于通过平滑函数的可逆变换来表示单调三角图。我们建立了有关转化的条件,以使相关的无限维度最小化问题没有伪造的局部最小值,即所有局部最小值都是全球最小值。我们展示了满足某些尾巴条件的目标分布,唯一的全局最小化器与KR地图相对应。鉴于来自目标的样品,我们提出了一种自适应算法,该算法估计了基础KR映射的稀疏半参数近似。我们证明了如何将该框架应用于关节和条件密度估计,无可能的推断以及有向图形模型的结构学习,并在一系列样本量之间具有稳定的概括性能。
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我们考虑了使用显微镜或X射线散射技术产生的图像数据自组装的模型的贝叶斯校准。为了说明BCP平衡结构中的随机远程疾病,我们引入了辅助变量以表示这种不确定性。然而,这些变量导致了高维图像数据的综合可能性,通常可以评估。我们使用基于测量运输的可能性方法以及图像数据的摘要统计数据来解决这一具有挑战性的贝叶斯推理问题。我们还表明,可以计算出有关模型参数的数据中的预期信息收益(EIG),而无需额外的成本。最后,我们介绍了基于二嵌段共聚物薄膜自组装和自上而下显微镜表征的ohta-kawasaki模型的数值案例研究。为了进行校准,我们介绍了一些基于域的能量和傅立叶的摘要统计数据,并使用EIG量化了它们的信息性。我们证明了拟议方法研究数据损坏和实验设计对校准结果的影响的力量。
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我们提出了一种变分贝叶斯比例危险模型,用于预测和可变选择的关于高维存活数据。我们的方法基于平均场变分近似,克服了MCMC的高计算成本,而保留有用的特征,提供优异的点估计,并通过后夹层概念提供可变选择的自然机制。我们提出的方法的性能通过广泛的仿真进行评估,并与其他最先进的贝叶斯变量选择方法进行比较,展示了可比或更好的性能。最后,我们展示了如何在两个转录组数据集上使用所提出的方法进行审查的生存结果,其中我们识别具有预先存在的生物解释的基因。
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我们开发了一个计算程序,以估计具有附加噪声的半摩托车高斯过程回归模型的协方差超参数。也就是说,提出的方法可用于有效估计相关误差的方差,以及基于最大化边际似然函数的噪声方差。我们的方法涉及适当地降低超参数空间的维度,以简化单变量的根发现问题的估计过程。此外,我们得出了边际似然函数及其衍生物的边界和渐近线,这对于缩小高参数搜索的初始范围很有用。使用数值示例,我们证明了与传统参数优化相比,提出方法的计算优势和鲁棒性。
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Modern statistical learning algorithms are capable of amazing flexibility, but struggle with interpretability. One possible solution is sparsity: making inference such that many of the parameters are estimated as being identically 0, which may be imposed through the use of nonsmooth penalties such as the $\ell_1$ penalty. However, the $\ell_1$ penalty introduces significant bias when high sparsity is desired. In this article, we retain the $\ell_1$ penalty, but define learnable penalty weights $\lambda_p$ endowed with hyperpriors. We start the article by investigating the optimization problem this poses, developing a proximal operator associated with the $\ell_1$ norm. We then study the theoretical properties of this variable-coefficient $\ell_1$ penalty in the context of penalized likelihood. Next, we investigate application of this penalty to Variational Bayes, developing a model we call the Sparse Bayesian Lasso which allows for behavior qualitatively like Lasso regression to be applied to arbitrary variational models. In simulation studies, this gives us the Uncertainty Quantification and low bias properties of simulation-based approaches with an order of magnitude less computation. Finally, we apply our methodology to a Bayesian lagged spatiotemporal regression model of internal displacement that occurred during the Iraqi Civil War of 2013-2017.
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本文介绍了使用基于补丁的先前分布的图像恢复的新期望传播(EP)框架。虽然Monte Carlo技术典型地用于从难以处理的后分布中进行采样,但它们可以在诸如图像恢复之类的高维推论问题中遭受可扩展性问题。为了解决这个问题,这里使用EP来使用多元高斯密度的产品近似后分布。此外,对这些密度的协方差矩阵施加结构约束允许更大的可扩展性和分布式计算。虽然该方法自然适于处理添加剂高斯观察噪声,但它也可以扩展到非高斯噪声。用于高斯和泊松噪声的去噪,染色和去卷积问题进行的实验说明了这种柔性近似贝叶斯方法的潜在益处,以实现与采样技术相比降低的计算成本。
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我们制定自然梯度变推理(VI),期望传播(EP),和后线性化(PL)作为牛顿法用于优化贝叶斯后验分布的参数扩展。这种观点明确地把数值优化框架下的推理算法。我们表明,通用近似牛顿法从优化文献,即高斯 - 牛顿和准牛顿方法(例如,该BFGS算法),仍然是这种“贝叶斯牛顿”框架下有效。这导致了一套这些都保证以产生半正定协方差矩阵,不像标准VI和EP新颖算法。我们统一的观点提供了新的见解各种推理方案之间的连接。所有提出的方法适用于具有高斯事先和非共轭的可能性,这是我们与(疏)高斯过程和状态空间模型展示任何模型。
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我们建议使用贝叶斯推理和深度神经网络的技术,将地震成像中的不确定性转化为图像上执行的任务的不确定性,例如地平线跟踪。地震成像是由于带宽和孔径限制,这是一个不良的逆问题,由于噪声和线性化误差的存在而受到阻碍。但是,许多正规化方法,例如变形域的稀疏性促进,已设计为处理这些错误的不利影响,但是,这些方法具有偏向解决方案的风险,并且不提供有关图像空间中不确定性的信息以及如何提供信息。不确定性会影响图像上的某些任务。提出了一种系统的方法,以将由于数据中的噪声引起的不确定性转化为图像中自动跟踪视野的置信区间。不确定性的特征是卷积神经网络(CNN)并评估这些不确定性,样品是从CNN权重的后验分布中得出的,用于参数化图像。与传统先验相比,文献中认为,这些CNN引入了灵活的感应偏见,这非常适合各种问题。随机梯度Langevin动力学的方法用于从后验分布中采样。该方法旨在处理大规模的贝叶斯推理问题,即具有地震成像中的计算昂贵的远期操作员。除了提供强大的替代方案外,最大的后验估计值容易过度拟合外,访问这些样品还可以使我们能够在数据中的噪声中转换图像中的不确定性,以便在跟踪的视野上不确定性。例如,它承认图像上的重点标准偏差和自动跟踪视野的置信区间的估计值。
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变性推理(VI)为基于传统的采样方法提供了一种吸引人的替代方法,用于实施贝叶斯推断,因为其概念性的简单性,统计准确性和计算可扩展性。然而,常见的变分近似方案(例如平均场(MF)近似)需要某些共轭结构以促进有效的计算,这可能会增加不必要的限制对可行的先验分布家族,并对变异近似族对差异进行进一步的限制。在这项工作中,我们开发了一个通用计算框架,用于实施MF-VI VIA WASSERSTEIN梯度流(WGF),这是概率度量空间上的梯度流。当专门针对贝叶斯潜在变量模型时,我们将分析基于时间消化的WGF交替最小化方案的算法收敛,用于实现MF近似。特别是,所提出的算法类似于EM算法的分布版本,包括更新潜在变量变异分布的E step以及在参数的变异分布上进行最陡峭下降的m step。我们的理论分析依赖于概率度量空间中的最佳运输理论和细分微积分。我们证明了时间限制的WGF的指数收敛性,以最大程度地减少普通大地测量学严格的凸度的通用物镜功能。我们还提供了通过使用时间限制的WGF的固定点方程从MF近似获得的变异分布的指数收缩的新证明。我们将方法和理论应用于两个经典的贝叶斯潜在变量模型,即高斯混合模型和回归模型的混合物。还进行了数值实验,以补充这两个模型下的理论发现。
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近几十年来,科学和工程的可用数据数量的重大增长彻底改变了。然而,尽管现在收集和存储数据的空前很容易,但通过补充每个功能的标签来标记数据仍然是具有挑战性的。标签过程需要专家知识或乏味且耗时的说明任务包括用诊断X射线标记X射线,具有蛋白质类型的蛋白质序列,其主题的文本,通过其情感推文或视频通过其类型的视频。在这些和许多其他示例中,由于成本和时间限制,只能手动标记一些功能。我们如何才能最好地将标签信息从少数昂贵的标签功能到大量未标记的标签信息传播?这是半监督学习(SSL)提出的问题。本文概述了基于图的贝叶斯SSL的最新基础发展,这是一种使用功能之间的相似性的标签传播概率框架。 SSL是一个活跃的研究领域,对现有文献的彻底回顾超出了本文的范围。我们的重点将放在我们自己的研究中得出的主题,这些主题说明了对基于图的贝叶斯SSL的统计准确性和计算效率进行严格研究的广泛数学工具和思想。
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在使用多模式贝叶斯后部分布时,马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)算法难以在模式之间移动,并且默认变分或基于模式的近似推动将低估后不确定性。并且,即使找到最重要的模式,难以评估后部的相对重量。在这里,我们提出了一种使用MCMC,变分或基于模式的模式的并行运行的方法,以便尽可能多地击中多种模式或分离的区域,然后使用贝叶斯堆叠来组合这些用于构建分布的加权平均值的可扩展方法。通过堆叠从多模式后分布的堆叠,最小化交叉验证预测误差的结果,并且代表了比变分推断更好的不确定度,但它不一定是相当于渐近的,以完全贝叶斯推断。我们呈现理论一致性,其中堆叠推断逼近来自未衰退的模型和非混合采样器的真实数据生成过程,预测性能优于完全贝叶斯推断,因此可以被视为祝福而不是模型拼写下的诅咒。我们展示了几个模型家庭的实际实施:潜在的Dirichlet分配,高斯过程回归,分层回归,马蹄素变量选择和神经网络。
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从降压和嘈杂的测量值(例如MRI和低剂量计算机断层扫描(CT))中重建图像是数学上不良的反问题。我们提出了一种基于期望传播(EP)技术的易于使用的重建方法。我们将蒙特卡洛(MC)方法,马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)和乘数(ADMM)算法的交替方向方法纳入EP方法,以解决EP中遇到的棘手性问题。我们在复杂的贝叶斯模型上演示了图像重建的方法。我们的技术应用于伽马相机扫描中的图像。我们仅将EPMC,EP-MCMC,EP-ADMM方法与MCMC进行比较。指标是更好的图像重建,速度和参数估计。在真实和模拟数据中使用伽马相机成像进行的实验表明,我们提出的方法在计算上比MCMC昂贵,并且产生相对更好的图像重建。
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语境。斑点检测是天文学中的常见问题。一个例子是在恒星种群建模中,其中从观察结果推断出星系中恒星年龄和金属性的分布。在这种情况下,斑点可能对应于原位的恒星与从卫星中吸收的恒星相对应,而BLOB检测的任务是解散这些组件。当分布带来重大不确定性时,就会出现一个困难,就像从未解决的恒星系统的建模光谱中推断出的恒星种群的情况一样。目前没有不确定性检测BLOB检测的令人满意的方法。目标。我们介绍了一种在恒星系统综合光谱的恒星种群建模的背景下开发的不确定性感知斑点检测方法。方法。我们为经典的blob检测方法的经典laplacian方法的不确定性感知版本开发了理论和计算工具,我们称之为ULOG。这确定了考虑各种尺度的重要斑点。作为将ULOG应用于恒星种群建模的先决条件,我们引入了一种有效计算光谱建模不确定性的方法。该方法基于截断的奇异值分解和马尔可夫链蒙特卡洛采样(SVD-MCMC)。结果。我们将方法应用于星团M54的数据。我们表明,SVD-MCMC推断与标准MCMC的推断相匹配,但计算速度更快。我们将ULOG应用于推断的M54年龄/金属性分布,识别其恒星中的2或3个显着不同的种群。
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This paper extends quantile factor analysis to a probabilistic variant that incorporates regularization and computationally efficient variational approximations. By means of synthetic and real data experiments it is established that the proposed estimator can achieve, in many cases, better accuracy than a recently proposed loss-based estimator. We contribute to the literature on measuring uncertainty by extracting new indexes of low, medium and high economic policy uncertainty, using the probabilistic quantile factor methodology. Medium and high indexes have clear contractionary effects, while the low index is benign for the economy, showing that not all manifestations of uncertainty are the same.
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