目的:二尖瓣修复是心脏瓣膜的复杂微创手术。在这种情况下,来自内窥镜图像的缝合线检测是一种高度相关的任务,该任务提供了分析缝合模式的定量信息,评估假肢配置并产生增强的现实可视化。面部或解剖标志性的检测任务通常包含固定数量的地标,并使用回归或固定的基于热线图的方法来定位标志性。然而,在内窥镜检查中,每个图像中存在不同数量的缝合线,并且缝合线可能发生在环形空中的任何位置,因为它们不是语义唯一的。方法:在这项工作中,我们将缝合检测任务制定为多实例的深热映射回归问题,以识别缝合线的进入和退出点。我们扩展了我们以前的工作,并介绍了一个新颖的使用2D高斯层,然后是可分辨率的2D空间软氩模层作为局部非最大抑制。结果:我们用多种热映射分布功能和所提出的模型的两个变体呈现广泛的实验。在术中帧内结构域中,变体1在基线上显示了+0.0422的平均f1。类似地,在模拟器域中,变体1在基线上显示了+0.0865的平均f1。结论:拟议的模型显示出在帧内和模拟器域中的基线上的改进。在Miccai Adaptor2021挑战HTTPS://Adaptor2021.github.io/的范围内公开可用,以及https://github.com/cardio-ai/suture-detection-pytorch/的代码。 DOI:10.1007 / S11548-021-02523-W。可以在此处找到与开放式接入文章的链接:https://link.springer.com/article/10.1007%2FS11548-021-02523
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胎儿镜检查激光​​光凝是一种广泛采用的方法,用于治疗双胞胎输血综合征(TTTS)。该过程涉及光凝病理吻合术以调节双胞胎之间的血液交换。由于观点有限,胎儿镜的可操作性差,可见性差和照明的可变性,因此该程序尤其具有挑战性。这些挑战可能导致手术时间增加和消融不完全。计算机辅助干预措施(CAI)可以通过识别场景中的关键结构并通过视频马赛克来扩展胎儿镜观景领域,从而为外科医生提供决策支持和背景意识。由于缺乏设计,开发和测试CAI算法的高质量数据,该领域的研究受到了阻碍。通过作为MICCAI2021内窥镜视觉挑战组织的胎儿镜胎盘胎盘分割和注册(FETREG2021)挑战,我们发布了第一个Largescale Multencentre TTTS数据集,用于开发广义和可靠的语义分割和视频摩擦质量algorithms。对于这一挑战,我们发布了一个2060张图像的数据集,该数据集是从18个体内TTTS胎儿镜检查程序和18个简短视频剪辑的船只,工具,胎儿和背景类别的像素通道。七个团队参与了这一挑战,他们的模型性能在一个看不见的测试数据集中评估了658个从6个胎儿镜程序和6个短剪辑的图像的图像。这项挑战为创建通用解决方案提供了用于胎儿镜面场景的理解和摩西式解决方案的机会。在本文中,我们介绍了FETREG2021挑战的发现,以及报告TTTS胎儿镜检查中CAI的详细文献综述。通过这一挑战,它的分析和多中心胎儿镜数据的发布,我们为该领域的未来研究提供了基准。
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解剖标志的本地化对于临床诊断,治疗计划和研究至关重要。在本文中,我们提出了一种新的深网络,名为特征聚合和细化网络(Farnet),用于自动检测解剖标记。为了减轻医疗领域的培训数据有限的问题,我们的网络采用了在自然图像上预先培训的深网络,因为骨干网络和几个流行的网络进行了比较。我们的FARNET还包括多尺度特征聚合模块,用于多尺度特征融合和用于高分辨率热图回归的特征精制模块。粗细的监督应用于两个模块,以方便端到端培训。我们进一步提出了一种名为指数加权中心损耗的新型损失函数,用于准确的热爱回归,这侧重于地标附近的像素的损失并抑制了远处的损失。我们的网络已经在三个公开的解剖学地标检测数据集中进行了评估,包括头部测量射线照片,手射线照片和脊柱射线照相,并在所有三个数据集上实现最先进的性能。代码可用:\ url {https://github.com/juvenileinwind/farnet}
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运动估计是用于评估目标器官解剖学和功能的动态医学图像处理的基本步骤。然而,通过评估局部图像相似性通过评估局部图像相似性优化运动场的基于图像的运动估计方法,易于产生令人难以置信的估计,尤其是在大运动的情况下。在这项研究中,我们提供了一种新颖的稀疏密度(DSD)的运动估计框架,其包括两个阶段。在第一阶段,我们处理原始密集图像以提取稀疏地标以表示目标器官解剖拓扑,并丢弃对运动估计不必要的冗余信息。为此目的,我们介绍一个无监督的3D地标检测网络,以提取用于目标器官运动估计的空间稀疏但代表性的地标。在第二阶段,我们从两个不同时间点的两个图像的提取稀疏地标的稀疏运动位移得出。然后,我们通过将稀疏地标位移突出回致密图像域,呈现运动重建网络来构造运动场。此外,我们从我们的两级DSD框架中使用估计的运动场作为初始化,并提高轻量级且有效的迭代优化中的运动估计质量。我们分别评估了两种动态医学成像任务的方法,分别为模型心脏运动和肺呼吸运动。与现有的比较方法相比,我们的方法产生了出色的运动估计精度。此外,广泛的实验结果表明,我们的解决方案可以提取良好代表性解剖标志,而无需手动注释。我们的代码在线公开提供。
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本文提出了一种名为定位变压器(LOTR)的新型变压器的面部地标定位网络。所提出的框架是一种直接坐标回归方法,利用变压器网络以更好地利用特征图中的空间信息。 LOTR模型由三个主要模块组成:1)将输入图像转换为特征图的视觉骨干板,2)改进Visual Backone的特征表示,以及3)直接预测的地标预测头部的变压器模块来自变压器的代表的地标坐标。给定裁剪和对齐的面部图像,所提出的LOTR可以训练结束到底,而无需任何后处理步骤。本文还介绍了光滑翼损失功能,它解决了机翼损耗的梯度不连续性,导致比L1,L2和机翼损耗等标准损耗功能更好地收敛。通过106点面部地标定位的第一个大挑战提供的JD地标数据集的实验结果表明了LOTR在排行榜上的现有方法和最近基于热爱的方法的优势。在WFLW DataSet上,所提出的Lotr框架与若干最先进的方法相比,展示了有希望的结果。此外,我们在使用我们提出的LOTRS面向对齐时,我们报告了最先进的面部识别性能的提高。
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在血管成形术的临床程序中(即开放式堵塞冠状动脉),在X射线荧光镜检查的指导下,需要将气球和支架等装置(例如气球和支架)放置在动脉中。由于X射线剂量的局限性,所得图像通常是嘈杂的。为了检查这些设备的正确放置,平均进行了多个运动补偿帧以增强视图。因此,设备跟踪是为此目的的必要过程。即使设计为具有易于跟踪的放射性标记的血管成形术设备,但由于标记尺寸较小和血管成形术中的复杂场景,当前的方法难以提供令人满意的结果。在本文中,我们提出了一个用于单个支架跟踪的端到端深度学习框架,该框架由三个层次模块组成:基于U-NET的Landmark检测,基于重新连接的支架提案和功能提取,以及图形卷积神经网络(GCN)基于暂时聚集空间信息和外观特征的支架跟踪。实验表明,与基于点的跟踪模型相比,我们的方法在检测中的性能明显更好。此外,其快速推理速度满足临床要求。
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基于Heatmap回归的深度学习模型彻底改变了面部地标定位的任务,现有模型在大型姿势,非均匀照明和阴影,闭塞和自闭合,低分辨率和模糊。然而,尽管采用了广泛的采用,Heatmap回归方法遭受与热图编码和解码过程相关的离散化引起的误差。在这项工作中,我们表明这些误差对面部对准精度具有令人惊讶的大量负面影响。为了减轻这个问题,我们通过利用底层连续分布提出了一种热爱编码和解码过程的新方法。为了充分利用新提出的编码解码机制,我们还介绍了基于暹罗的训练,该训练能够在各种几何图像变换上实施热线图一致性。我们的方法在多个数据集中提供了明显的增益,在面部地标本地化中设置新的最先进的结果。旁边的代码将在https://www.adrianbulat.com/face-alignment上提供
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我们提出了一条新型的神经管道Msgazenet,该管道通过通过多发射框架利用眼睛解剖学信息来学习凝视的表示。我们提出的解决方案包括两个组件,首先是一个用于隔离解剖眼区域的网络,以及第二个用于多发达凝视估计的网络。眼睛区域的隔离是通过U-NET样式网络进行的,我们使用合成数据集训练该网络,该数据集包含可见眼球和虹膜区域的眼睛区域掩模。此阶段使用的合成数据集是一个由60,000张眼睛图像组成的新数据集,我们使用眼视线模拟器Unityeyes创建。然后将眼睛区域隔离网络转移到真实域,以生成真实世界图像的面具。为了成功进行转移,我们在训练过程中利用域随机化,这允许合成图像从较大的差异中受益,并在类似于伪影的增强的帮助下从更大的差异中受益。然后,生成的眼睛区域掩模与原始眼睛图像一起用作我们凝视估计网络的多式输入。我们在三个基准凝视估计数据集(Mpiigaze,Eyediap和Utmultiview)上评估框架,在那里我们通过分别获得7.57%和1.85%的性能,在Eyediap和Utmultiview数据集上设置了新的最新技术Mpiigaze的竞争性能。我们还研究了方法在数据中的噪声方面的鲁棒性,并证明我们的模型对噪声数据不太敏感。最后,我们执行各种实验,包括消融研究,以评估解决方案中不同组件和设计选择的贡献。
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我们提出了一种新颖的形状意识的关系网络,用于内窥镜粘膜颌下粘膜释放(ESD)手术中的准确和实时地标检测。这项任务具有很大的临床意义,但由于复杂的手术环境中出血,照明反射和运动模糊而极其挑战。与现有解决方案相比,通过使用复杂的聚合方案忽略靶向对象之间的几何关系或捕获关系,所提出的网络能够实现令人满意的精度,同时通过充分利用地标之间的空间关系来保持实时性能。我们首先设计一种算法来自动生成关系关键点热量表,其能够直观地代表地标之间的空间关系的先验知识,而无需使用任何额外的手动注释工作。然后,我们开发两个互补正规计划,以逐步将先验知识纳入培训过程。虽然一个方案通过多任务学习引入像素级正则化,但另一个方案通过利用新设计的分组的一致性评估器来实现全局级正则化,该评估将关系约束以越野方式添加到所提出的网络。这两个方案都有利于训练模型,并且可以随时推动才能卸载,以实现实时检测。我们建立了一个大型内部数据集的ESD手术,用于食管癌,以验证我们提出的方法的有效性。广泛的实验结果表明,我们的方法在准确性和效率方面优于最先进的方法,更快地实现了更好的检测结果。在两个下游应用的有希望的结果进一步证实了我们在ESD临床实践中的方法的巨大潜力。
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这项研究提出了一种基于深度学习的超声(US)图像引导放射疗法的跟踪方法。拟议的级联深度学习模型由注意力网络,基于掩模区域的卷积神经网络(Mask R-CNN)和长期短期记忆(LSTM)网络组成。注意网络从美国图像到可疑的具有里程碑意义的运动区域,以减少搜索区域。然后,面膜R-CNN在减少区域中产生多个利益区域(ROI)建议,并通过三个网络头确定拟议的地标:边界框回归,提案分类和地标分段。 LSTM网络对连续的图像框架之间的时间关系建模,以进行边界框回归和建议分类。为了合并最终建议,根据顺序框架之间的相似性设计选择方法。该方法在肝脏美国跟踪数据集中测试了医疗图像计算和计算机辅助干预措施(MICCAI)2015年的挑战,其中有三位经验丰富的观察者注释了地标,以获得其平均位置。在24个鉴于我们具有地面真相的序列的24个序列上,所有地标的平均跟踪误差为0.65 +/- 0.56毫米,所有地标的误差均在2 mm之内。我们进一步测试了从测试数据集中的69个地标上提出的模型,该模型具有与训练模式相似的图像模式,从而导致平均跟踪误差为0.94 +/- 0.83 mm。我们的实验结果表明,我们提出的方法使用US图像跟踪肝解剖学地标的可行性和准确性,为放射治疗期间的主动运动管理提供了潜在的解决方案。
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现在,人工智能(AI)可以自动解释医学图像以供临床使用。但是,AI在介入图像中的潜在用途(相对于参与分类或诊断的图像),例如在手术期间的指导,在很大程度上尚未开发。这是因为目前,使用现场分析对现场手术收集的数据进行了事后分析,这是因为手术AI系统具有基本和实际限制,包括道德考虑,费用,可扩展性,数据完整性以及缺乏地面真相。在这里,我们证明从人类模型中创建逼真的模拟图像是可行的替代方法,并与大规模的原位数据收集进行了补充。我们表明,对现实合成数据的训练AI图像分析模型,结合当代域的概括或适应技术,导致在实际数据上的模型与在精确匹配的真实数据训练集中训练的模型相当地执行的模型。由于从基于人类的模型尺度的合成生成培训数据,因此我们发现我们称为X射线图像分析的模型传输范式(我们称为Syntheex)甚至可以超越实际数据训练的模型,因为训练的有效性较大的数据集。我们证明了合成在三个临床任务上的潜力:髋关节图像分析,手术机器人工具检测和COVID-19肺病变分割。 Synthex提供了一个机会,可以极大地加速基于X射线药物的智能系统的概念,设计和评估。此外,模拟图像环境还提供了测试新颖仪器,设计互补手术方法的机会,并设想了改善结果,节省时间或减轻人为错误的新技术,从实时人类数据收集的道德和实际考虑方面摆脱了人为错误。
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精确分割牙齿并识别牙科网格模型上的相应解剖标签在计算机辅助性正畸治疗中是必不可少的。手动执行这两个任务是耗时,繁琐的,更重要的是,由于患者牙齿的异常和大规模差异,高度依赖于矫正者的经验。一些基于机器学习的方法已经设计和应用于正畸场,以自动分割牙科网格(例如,口腔扫描)。相比之下,牙齿地标定位的研究数量仍然有限。本文提出了一种基于网格深度学习(称为TS-MDL)的两级框架,用于联合牙齿标签和原始内部扫描的地标识别。我们的TS-MDL首先采用端到端\ EMPH {i} MeshsegNet方法(即,现有网格孔的变体,具有改进的精度和效率),以在下采样扫描上标记每个牙齿。由分割输出引导,我们的TS-MDL进一步选择原始网格上的每个牙齿的感兴趣区域(ROI),以构造开头的光重变量(即PINTNET-REG),用于回归相应的地标热插块。我们的TS-MDL在实际的数据集上进行了评估,显示了有希望的细分和本地化性能。具体而言,TS-MDL的第一阶段中的\ EMPH {i} Meshsegnet达到了0.964 \ PM0.054 $ 0.964 \ PM0.054 $的平均骰子相似度系数(DSC),显着优于原始的Meshsegnet。在第二阶段,PointNet-Reg实现了0.597 \ PM0.761 \,预测和地面真理之间的平均绝对误差(MAE),以66美元的地标,与地标检测的其他网络相比,比较优越。所有这些结果表明我们在临床实践中的TS-MDL潜在使用。
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Automatic anatomical landmark localization has made great strides by leveraging deep learning methods in recent years. The ability to quantify the uncertainty of these predictions is a vital component needed for these methods to be adopted in clinical settings, where it is imperative that erroneous predictions are caught and corrected. We propose Quantile Binning, a data-driven method to categorize predictions by uncertainty with estimated error bounds. Our framework can be applied to any continuous uncertainty measure, allowing straightforward identification of the best subset of predictions with accompanying estimated error bounds. We facilitate easy comparison between uncertainty measures by constructing two evaluation metrics derived from Quantile Binning. We compare and contrast three epistemic uncertainty measures (two baselines, and a proposed method combining aspects of the two), derived from two heatmap-based landmark localization model paradigms (U-Net and patch-based). We show results across three datasets, including a publicly available Cephalometric dataset. We illustrate how filtering out gross mispredictions caught in our Quantile Bins significantly improves the proportion of predictions under an acceptable error threshold. Finally, we demonstrate that Quantile Binning remains effective on landmarks with high aleatoric uncertainty caused by inherent landmark ambiguity, and offer recommendations on which uncertainty measure to use and how to use it. The code and data are available at https://github.com/schobs/qbin.
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The recent progress of CNN has dramatically improved face alignment performance. However, few works have paid attention to the error-bias with respect to error distribution of facial landmarks. In this paper, we investigate the error-bias issue in face alignment, where the distributions of landmark errors tend to spread along the tangent line to landmark curves. This error-bias is not trivial since it is closely connected to the ambiguous landmark labeling task. Inspired by this observation, we seek a way to leverage the error-bias property for better convergence of CNN model. To this end, we propose anisotropic direction loss (ADL) and anisotropic attention module (AAM) for coordinate and heatmap regression, respectively. ADL imposes strong binding force in normal direction for each landmark point on facial boundaries. On the other hand, AAM is an attention module which can get anisotropic attention mask focusing on the region of point and its local edge connected by adjacent points, it has a stronger response in tangent than in normal, which means relaxed constraints in the tangent. These two methods work in a complementary manner to learn both facial structures and texture details. Finally, we integrate them into an optimized end-to-end training pipeline named ADNet. Our ADNet achieves state-of-the-art results on 300W, WFLW and COFW datasets, which demonstrates the effectiveness and robustness.
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当有足够的训练数据时,在某些视力任务中,基于变压器的模型(例如Vision Transformer(VIT))可以超越跨趋化神经网络(CNN)。然而,(CNN)对视力任务(即翻译均衡和局部性)具有强大而有用的归纳偏见。在这项工作中,我们开发了一种新颖的模型架构,我们称之为移动鱼类地标检测网络(MFLD-NET)。我们已经使用基于VIT的卷积操作(即斑块嵌入,多层感知器)制作了该模型。 MFLD-NET可以在轻巧的同时获得竞争性或更好的结果,同时轻巧,因此适用于嵌入式和移动设备。此外,我们表明MFLD-NET可以在PAR上获得关键点(地标)估计精度,甚至比FISH图像数据集上的某些最先进的(CNN)更好。此外,与VIT不同,MFLD-NET不需要预训练的模型,并且在小型数据集中训练时可以很好地概括。我们提供定量和定性的结果,以证明该模型的概括能力。这项工作将为未来开发移动但高效的鱼类监测系统和设备的努力奠定基础。
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目前全面监督的面部地标检测方法迅速进行,实现了显着性能。然而,当在大型姿势和重闭合的面孔和重闭合时仍然遭受痛苦,以进行不准确的面部形状约束,并且标记的训练样本不足。在本文中,我们提出了一个半监督框架,即自我校准的姿势注意网络(SCPAN),以实现更具挑战性的情景中的更强大和精确的面部地标检测。具体地,建议通过定影边界和地标强度场信息来模拟更有效的面部形状约束的边界意识的地标强度(BALI)字段。此外,设计了一种自我校准的姿势注意力(SCPA)模型,用于提供自学习的目标函数,该功能通过引入自校准机制和姿势注意掩模而无需标签信息而无需标签信息。我们认为,通过将巴厘岛领域和SCPA模型集成到新颖的自我校准的姿势网络中,可以了解更多的面部现有知识,并且我们的面孔方法的检测精度和稳健性得到了改善。获得具有挑战性的基准数据集获得的实验结果表明,我们的方法优于文献中最先进的方法。
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目标:探索深度学习算法进一步简化和优化尿道板(UP)质量评估的能力,使用板客观评分工具(POST),旨在提高Hypospadias修复中提高评估的客观性和可重复性。方法:五个关键的邮政地标是由专家在691图像数据集中的专家标记,该数据集接受了原发性杂质修复的青春期前男孩。然后,该数据集用于开发和验证基于深度学习的地标检测模型。提出的框架始于瞥见和检测,其中输入图像是使用预测的边界框裁剪的。接下来,使用深层卷积神经网络(CNN)体系结构来预测五个邮政标记的坐标。然后,这些预测的地标用于评估远端催化性远端的质量。结果:所提出的模型准确地定位了gan区域,平均平均精度(地图)为99.5%,总体灵敏度为99.1%。在预测地标的坐标时,达到了0.07152的归一化平均误差(NME),平均平方误差(MSE)为0.001,在0.1 nme的阈值下为20.2%的故障率。结论:此深度学习应用程序在使用邮政评估质量时表现出鲁棒性和高精度。使用国际多中心基于图像的数据库进行进一步评估。外部验证可以使深度学习算法受益,并导致更好的评估,决策和对手术结果的预测。
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语义图像分割是手术中的背景知识和自治机器人的重要前提。本领域的状态专注于在微创手术期间获得的传统RGB视频数据,但基于光谱成像数据的全景语义分割并在开放手术期间获得几乎没有注意到日期。为了解决文献中的这种差距,我们正在研究基于在开放手术环境中获得的猪的高光谱成像(HSI)数据的以下研究问题:(1)基于神经网络的HSI数据的充分表示是完全自动化的器官分割,尤其是关于数据的空间粒度(像素与Superpixels与Patches与完整图像)的空间粒度? (2)在执行语义器官分割时,是否有利用HSI数据使用HSI数据,即RGB数据和处理的HSI数据(例如氧合等组织参数)?根据基于20猪的506个HSI图像的全面验证研究,共注释了19个类,基于深度的学习的分割性能 - 贯穿模态 - 与输入数据的空间上下文一致。未处理的HSI数据提供优于RGB数据或来自摄像机提供商的处理数据,其中优势随着输入到神经网络的输入的尺寸而增加。最大性能(应用于整个图像的HSI)产生了0.89(标准偏差(SD)0.04)的平均骰子相似度系数(DSC),其在帧间间变异性(DSC为0.89(SD 0.07)的范围内。我们得出结论,HSI可以成为全自动手术场景理解的强大的图像模型,其具有传统成像的许多优点,包括恢复额外功能组织信息的能力。
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地理定位的概念是指确定地球上的某些“实体”的位置的过程,通常使用全球定位系统(GPS)坐标。感兴趣的实体可以是图像,图像序列,视频,卫星图像,甚至图像中可见的物体。由于GPS标记媒体的大规模数据集由于智能手机和互联网而迅速变得可用,而深入学习已经上升以提高机器学习模型的性能能力,因此由于其显着影响而出现了视觉和对象地理定位的领域广泛的应用,如增强现实,机器人,自驾驶车辆,道路维护和3D重建。本文提供了对涉及图像的地理定位的全面调查,其涉及从捕获图像(图像地理定位)或图像内的地理定位对象(对象地理定位)的地理定位的综合调查。我们将提供深入的研究,包括流行算法的摘要,对所提出的数据集的描述以及性能结果的分析来说明每个字段的当前状态。
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Quantitative cephalometric analysis is the most widely used clinical and research tool in modern orthodontics. Accurate localization of cephalometric landmarks enables the quantification and classification of anatomical abnormalities, however, the traditional manual way of marking these landmarks is a very tedious job. Endeavours have constantly been made to develop automated cephalometric landmark detection systems but they are inadequate for orthodontic applications. The fundamental reason for this is that the amount of publicly available datasets as well as the images provided for training in these datasets are insufficient for an AI model to perform well. To facilitate the development of robust AI solutions for morphometric analysis, we organise the CEPHA29 Automatic Cephalometric Landmark Detection Challenge in conjunction with IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2023). In this context, we provide the largest known publicly available dataset, consisting of 1000 cephalometric X-ray images. We hope that our challenge will not only derive forward research and innovation in automatic cephalometric landmark identification but will also signal the beginning of a new era in the discipline.
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