解剖标志的本地化对于临床诊断,治疗计划和研究至关重要。在本文中,我们提出了一种新的深网络,名为特征聚合和细化网络(Farnet),用于自动检测解剖标记。为了减轻医疗领域的培训数据有限的问题,我们的网络采用了在自然图像上预先培训的深网络,因为骨干网络和几个流行的网络进行了比较。我们的FARNET还包括多尺度特征聚合模块,用于多尺度特征融合和用于高分辨率热图回归的特征精制模块。粗细的监督应用于两个模块,以方便端到端培训。我们进一步提出了一种名为指数加权中心损耗的新型损失函数,用于准确的热爱回归,这侧重于地标附近的像素的损失并抑制了远处的损失。我们的网络已经在三个公开的解剖学地标检测数据集中进行了评估,包括头部测量射线照片,手射线照片和脊柱射线照相,并在所有三个数据集上实现最先进的性能。代码可用:\ url {https://github.com/juvenileinwind/farnet}
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深度学习已被广​​泛用于医学图像分割,并且录制了录制了该领域深度学习的成功的大量论文。在本文中,我们使用深层学习技术对医学图像分割的全面主题调查。本文进行了两个原创贡献。首先,与传统调查相比,直接将深度学习的文献分成医学图像分割的文学,并为每组详细介绍了文献,我们根据从粗略到精细的多级结构分类目前流行的文献。其次,本文侧重于监督和弱监督的学习方法,而不包括无监督的方法,因为它们在许多旧调查中引入而且他们目前不受欢迎。对于监督学习方法,我们分析了三个方面的文献:骨干网络的选择,网络块的设计,以及损耗功能的改进。对于虚弱的学习方法,我们根据数据增强,转移学习和交互式分割进行调查文献。与现有调查相比,本调查将文献分类为比例不同,更方便读者了解相关理由,并将引导他们基于深度学习方法思考医学图像分割的适当改进。
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准确的面部标志是许多与人面孔有关的任务的重要先决条件。在本文中,根据级联变压器提出了精确的面部标志性检测器。我们将面部标志性检测作为坐标回归任务,以便可以端对端训练该模型。通过在变压器中的自我注意力,我们的模型可以固有地利用地标之间的结构化关系,这将受益于在挑战性条件(例如大姿势和遮挡)下具有里程碑意义的检测。在级联精炼期间,我们的模型能够根据可变形的注意机制提取目标地标周围的最相关图像特征,以进行坐标预测,从而带来更准确的对齐。此外,我们提出了一个新颖的解码器,可以同时完善图像特征和地标性位置。随着参数增加,检测性能进一步提高。我们的模型在几个标准的面部标准检测基准上实现了新的最新性能,并在跨数据库评估中显示出良好的概括能力。
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运动估计是用于评估目标器官解剖学和功能的动态医学图像处理的基本步骤。然而,通过评估局部图像相似性通过评估局部图像相似性优化运动场的基于图像的运动估计方法,易于产生令人难以置信的估计,尤其是在大运动的情况下。在这项研究中,我们提供了一种新颖的稀疏密度(DSD)的运动估计框架,其包括两个阶段。在第一阶段,我们处理原始密集图像以提取稀疏地标以表示目标器官解剖拓扑,并丢弃对运动估计不必要的冗余信息。为此目的,我们介绍一个无监督的3D地标检测网络,以提取用于目标器官运动估计的空间稀疏但代表性的地标。在第二阶段,我们从两个不同时间点的两个图像的提取稀疏地标的稀疏运动位移得出。然后,我们通过将稀疏地标位移突出回致密图像域,呈现运动重建网络来构造运动场。此外,我们从我们的两级DSD框架中使用估计的运动场作为初始化,并提高轻量级且有效的迭代优化中的运动估计质量。我们分别评估了两种动态医学成像任务的方法,分别为模型心脏运动和肺呼吸运动。与现有的比较方法相比,我们的方法产生了出色的运动估计精度。此外,广泛的实验结果表明,我们的解决方案可以提取良好代表性解剖标志,而无需手动注释。我们的代码在线公开提供。
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Localizing anatomical landmarks are important tasks in medical image analysis. However, the landmarks to be localized often lack prominent visual features. Their locations are elusive and easily confused with the background, and thus precise localization highly depends on the context formed by their surrounding areas. In addition, the required precision is usually higher than segmentation and object detection tasks. Therefore, localization has its unique challenges different from segmentation or detection. In this paper, we propose a zoom-in attentive network (ZIAN) for anatomical landmark localization in ocular images. First, a coarse-to-fine, or "zoom-in" strategy is utilized to learn the contextualized features in different scales. Then, an attentive fusion module is adopted to aggregate multi-scale features, which consists of 1) a co-attention network with a multiple regions-of-interest (ROIs) scheme that learns complementary features from the multiple ROIs, 2) an attention-based fusion module which integrates the multi-ROIs features and non-ROI features. We evaluated ZIAN on two open challenge tasks, i.e., the fovea localization in fundus images and scleral spur localization in AS-OCT images. Experiments show that ZIAN achieves promising performances and outperforms state-of-the-art localization methods. The source code and trained models of ZIAN are available at https://github.com/leixiaofeng-astar/OMIA9-ZIAN.
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由于不规则的形状,正常和感染组织之间的各种尺寸和无法区分的边界,仍然是一种具有挑战性的任务,可以准确地在CT图像上进行Covid-19的感染病变。在本文中,提出了一种新的分段方案,用于通过增强基于编码器 - 解码器架构的不同级别的监督信息和融合多尺度特征映射来感染Covid-19。为此,提出了深入的协作监督(共同监督)计划,以指导网络学习边缘和语义的特征。更具体地,首先设计边缘监控模块(ESM),以通过将边缘监督信息结合到初始阶段的下采样的初始阶段来突出显示低电平边界特征。同时,提出了一种辅助语义监督模块(ASSM)来加强通过将掩码监督信息集成到稍后阶段来加强高电平语义信息。然后,通过使用注意机制来扩展高级和低电平特征映射之间的语义间隙,开发了一种注意融合模块(AFM)以融合不同级别的多个规模特征图。最后,在四个各种Covid-19 CT数据集上证明了所提出的方案的有效性。结果表明,提出的三个模块都是有希望的。基于基线(RESUNT),单独使用ESM,ASSM或AFM可以分别将骰子度量增加1.12 \%,1.95 \%,1.63 \%,而在我们的数据集中,通过将三个模型结合在一起可以上升3.97 \% 。与各个数据集的现有方法相比,所提出的方法可以在某些主要指标中获得更好的分段性能,并可实现最佳的泛化和全面的性能。
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注释的医学图像昂贵,有时甚至无法在一定程度上获得地标检测精度。半监督学习通过利用未标记的数据来了解解剖标志性的人口结构来减轻对大规模注释数据的依赖。全局形状约束是解剖标识的固有属性,为更加一致的伪标签提供了有价值的指导,这些指南在先前的半监督方法中被忽略。在本文中,我们通过完全考虑全局形状约束,提出了一种用于半监控地标检测的模型 - 不可知的形状调节的自我训练框架。具体而言,为了确保伪标签是可靠且保持一致的,基于PCA的形状模型调整伪标签并消除异常。一种新的区域注意力损失,使网络自动关注伪标签周围的结构一致区域。广泛的实验表明,我们的方法优于其他半监督方法,并在三个医学图像数据集中实现了显着的改进。此外,我们的框架是灵活的,可用作集成到最具监控方法的即插即用模块,以进一步提高性能。
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作为许多医疗应用的重要上游任务,监督的地标本地化仍然需要不可忽略的注释成本才能实现理想的绩效。此外,由于繁琐的收集程序,医疗地标数据集的规模有限,会影响大规模自我监督的预训练方法的有效性。为了应对这些挑战,我们提出了一个两阶段的单次医疗地标本地化框架,该框架首先通过无监督的注册从标记的示例中删除了地标,以便未​​标记的目标,然后利用这些嘈杂的伪标签来训练健壮的探测器。为了处理重要的结构变化,我们在包含边缘信息的新型损失函数的指导下学习了全球对齐和局部变形的端到端级联。在第二阶段,我们探索了选择可靠的伪标签和半监视学习的跨矛盾的自持矛盾。我们的方法在不同身体部位的公共数据集上实现了最先进的表现,这证明了其一般适用性。
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本文提出了一种名为定位变压器(LOTR)的新型变压器的面部地标定位网络。所提出的框架是一种直接坐标回归方法,利用变压器网络以更好地利用特征图中的空间信息。 LOTR模型由三个主要模块组成:1)将输入图像转换为特征图的视觉骨干板,2)改进Visual Backone的特征表示,以及3)直接预测的地标预测头部的变压器模块来自变压器的代表的地标坐标。给定裁剪和对齐的面部图像,所提出的LOTR可以训练结束到底,而无需任何后处理步骤。本文还介绍了光滑翼损失功能,它解决了机翼损耗的梯度不连续性,导致比L1,L2和机翼损耗等标准损耗功能更好地收敛。通过106点面部地标定位的第一个大挑战提供的JD地标数据集的实验结果表明了LOTR在排行榜上的现有方法和最近基于热爱的方法的优势。在WFLW DataSet上,所提出的Lotr框架与若干最先进的方法相比,展示了有希望的结果。此外,我们在使用我们提出的LOTRS面向对齐时,我们报告了最先进的面部识别性能的提高。
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Bottom-up human pose estimation methods have difficulties in predicting the correct pose for small persons due to challenges in scale variation. In this paper, we present HigherHRNet: a novel bottom-up human pose estimation method for learning scale-aware representations using high-resolution feature pyramids. Equipped with multi-resolution supervision for training and multiresolution aggregation for inference, the proposed approach is able to solve the scale variation challenge in bottom-up multi-person pose estimation and localize keypoints more precisely, especially for small person. The feature pyramid in HigherHRNet consists of feature map outputs from HRNet and upsampled higher-resolution outputs through a transposed convolution. HigherHR-Net outperforms the previous best bottom-up method by 2.5% AP for medium person on COCO test-dev, showing its effectiveness in handling scale variation. Furthermore, HigherHRNet achieves new state-of-the-art result on COCO test-dev (70.5% AP) without using refinement or other post-processing techniques, surpassing all existing bottom-up methods. HigherHRNet even surpasses all topdown methods on CrowdPose test (67.6% AP), suggesting its robustness in crowded scene. The code and models are available at https://github.com/HRNet/ Higher-HRNet-Human-Pose-Estimation.
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In this paper, we are interested in the human pose estimation problem with a focus on learning reliable highresolution representations. Most existing methods recover high-resolution representations from low-resolution representations produced by a high-to-low resolution network. Instead, our proposed network maintains high-resolution representations through the whole process.We start from a high-resolution subnetwork as the first stage, gradually add high-to-low resolution subnetworks one by one to form more stages, and connect the mutliresolution subnetworks in parallel. We conduct repeated multi-scale fusions such that each of the high-to-low resolution representations receives information from other parallel representations over and over, leading to rich highresolution representations. As a result, the predicted keypoint heatmap is potentially more accurate and spatially more precise. We empirically demonstrate the effectiveness of our network through the superior pose estimation results over two benchmark datasets: the COCO keypoint detection dataset and the MPII Human Pose dataset. In addition, we show the superiority of our network in pose tracking on the PoseTrack dataset. The code and models have been publicly available at https://github.com/leoxiaobin/ deep-high-resolution-net.pytorch.
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目前全面监督的面部地标检测方法迅速进行,实现了显着性能。然而,当在大型姿势和重闭合的面孔和重闭合时仍然遭受痛苦,以进行不准确的面部形状约束,并且标记的训练样本不足。在本文中,我们提出了一个半监督框架,即自我校准的姿势注意网络(SCPAN),以实现更具挑战性的情景中的更强大和精确的面部地标检测。具体地,建议通过定影边界和地标强度场信息来模拟更有效的面部形状约束的边界意识的地标强度(BALI)字段。此外,设计了一种自我校准的姿势注意力(SCPA)模型,用于提供自学习的目标函数,该功能通过引入自校准机制和姿势注意掩模而无需标签信息而无需标签信息。我们认为,通过将巴厘岛领域和SCPA模型集成到新颖的自我校准的姿势网络中,可以了解更多的面部现有知识,并且我们的面孔方法的检测精度和稳健性得到了改善。获得具有挑战性的基准数据集获得的实验结果表明,我们的方法优于文献中最先进的方法。
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精确分割牙齿并识别牙科网格模型上的相应解剖标签在计算机辅助性正畸治疗中是必不可少的。手动执行这两个任务是耗时,繁琐的,更重要的是,由于患者牙齿的异常和大规模差异,高度依赖于矫正者的经验。一些基于机器学习的方法已经设计和应用于正畸场,以自动分割牙科网格(例如,口腔扫描)。相比之下,牙齿地标定位的研究数量仍然有限。本文提出了一种基于网格深度学习(称为TS-MDL)的两级框架,用于联合牙齿标签和原始内部扫描的地标识别。我们的TS-MDL首先采用端到端\ EMPH {i} MeshsegNet方法(即,现有网格孔的变体,具有改进的精度和效率),以在下采样扫描上标记每个牙齿。由分割输出引导,我们的TS-MDL进一步选择原始网格上的每个牙齿的感兴趣区域(ROI),以构造开头的光重变量(即PINTNET-REG),用于回归相应的地标热插块。我们的TS-MDL在实际的数据集上进行了评估,显示了有希望的细分和本地化性能。具体而言,TS-MDL的第一阶段中的\ EMPH {i} Meshsegnet达到了0.964 \ PM0.054 $ 0.964 \ PM0.054 $的平均骰子相似度系数(DSC),显着优于原始的Meshsegnet。在第二阶段,PointNet-Reg实现了0.597 \ PM0.761 \,预测和地面真理之间的平均绝对误差(MAE),以66美元的地标,与地标检测的其他网络相比,比较优越。所有这些结果表明我们在临床实践中的TS-MDL潜在使用。
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本文提出了一个改进金字塔变压器(复制器),以进行健壮的面部标志性检测。大多数面部地标探测器都专注于学习代表性图像特征。但是,这些基于CNN的功能表示不足以处理复杂的现实世界情景,因为忽略了地标的内部结构以及地标和环境之间的关系。在这项工作中,我们制定了面部标志性检测任务,作为沿金字塔记忆的提炼里程碑式的查询。具体而言,引入了金字塔变压器头(PTH),以在地标之间建立同源关系,以及地标和跨尺度环境之间的异源关系。此外,动态里程碑改进(DLR)模块旨在将地标回归分解为端到端的细化过程,其中动态聚合的查询被转换为残留坐标预测。对四个面部标志检测基准及其各种子集进行的广泛实验结果表明,我们的框架具有卓越的性能和较高的鲁棒性。
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卷积神经网络(CNN)已在许多计算机视觉任务中广泛使用。但是,CNN具有固定的接收场,并且缺乏远程感知的能力,这对于人类的姿势估计至关重要。由于其能够捕获像素之间的远程依赖性的能力,因此最近对计算机视觉应用程序采用了变压器体系结构,并被证明是一种高效的体系结构。我们有兴趣探索其在人类姿势估计中的能力,因此提出了一个基于变压器结构的新型模型,并通过特征金字塔融合结构增强了。更具体地说,我们使用预训练的Swin变压器作为主链,并从输入图像中提取特征,我们利用特征金字塔结构从不同阶段提取特征图。通过将功能融合在一起,我们的模型可以预测关键点热图。我们研究的实验结果表明,与最新的基于CNN的模型相比,提出的基于变压器的模型可以实现更好的性能。
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作为新一代神经体系结构的变形金刚在自然语言处理和计算机视觉方面表现出色。但是,现有的视觉变形金刚努力使用有限的医学数据学习,并且无法概括各种医学图像任务。为了应对这些挑战,我们将Medformer作为数据量表变压器呈现为可推广的医学图像分割。关键设计结合了理想的电感偏差,线性复杂性的层次建模以及以空间和语义全局方式以线性复杂性的关注以及多尺度特征融合。 Medformer可以在不预训练的情况下学习微小至大规模的数据。广泛的实验表明,Medformer作为一般分割主链的潜力,在三个具有多种模式(例如CT和MRI)和多样化的医学靶标(例如,健康器官,疾病,疾病组织和肿瘤)的三个公共数据集上优于CNN和视觉变压器。我们将模型和评估管道公开可用,为促进广泛的下游临床应用提供固体基线和无偏比较。
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Face Restoration (FR) aims to restore High-Quality (HQ) faces from Low-Quality (LQ) input images, which is a domain-specific image restoration problem in the low-level computer vision area. The early face restoration methods mainly use statistic priors and degradation models, which are difficult to meet the requirements of real-world applications in practice. In recent years, face restoration has witnessed great progress after stepping into the deep learning era. However, there are few works to study deep learning-based face restoration methods systematically. Thus, this paper comprehensively surveys recent advances in deep learning techniques for face restoration. Specifically, we first summarize different problem formulations and analyze the characteristic of the face image. Second, we discuss the challenges of face restoration. Concerning these challenges, we present a comprehensive review of existing FR methods, including prior based methods and deep learning-based methods. Then, we explore developed techniques in the task of FR covering network architectures, loss functions, and benchmark datasets. We also conduct a systematic benchmark evaluation on representative methods. Finally, we discuss future directions, including network designs, metrics, benchmark datasets, applications,etc. We also provide an open-source repository for all the discussed methods, which is available at https://github.com/TaoWangzj/Awesome-Face-Restoration.
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现代的高性能语义分割方法采用沉重的主链和扩张的卷积来提取相关特征。尽管使用上下文和语义信息提取功能对于分割任务至关重要,但它为实时应用程序带来了内存足迹和高计算成本。本文提出了一种新模型,以实现实时道路场景语义细分的准确性/速度之间的权衡。具体来说,我们提出了一个名为“比例吸引的条带引导特征金字塔网络”(s \ textsuperscript {2} -fpn)的轻巧模型。我们的网络由三个主要模块组成:注意金字塔融合(APF)模块,比例吸引条带注意模块(SSAM)和全局特征Upsample(GFU)模块。 APF采用了注意力机制来学习判别性多尺度特征,并有助于缩小不同级别之间的语义差距。 APF使用量表感知的关注来用垂直剥离操作编码全局上下文,并建模长期依赖性,这有助于将像素与类似的语义标签相关联。此外,APF还采用频道重新加权块(CRB)来强调频道功能。最后,S \ TextSuperScript {2} -fpn的解码器然后采用GFU,该GFU用于融合APF和编码器的功能。已经对两个具有挑战性的语义分割基准进行了广泛的实验,这表明我们的方法通过不同的模型设置实现了更好的准确性/速度权衡。提出的模型已在CityScapes Dataset上实现了76.2 \%miou/87.3fps,77.4 \%miou/67fps和77.8 \%miou/30.5fps,以及69.6 \%miou,71.0 miou,71.0 \%miou,和74.2 \%\%\%\%\%\%。 miou在Camvid数据集上。这项工作的代码将在\ url {https://github.com/mohamedac29/s2-fpn提供。
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识别息肉对于在计算机辅助临床支持系统中自动分析内窥镜图像的自动分析具有挑战性。已经提出了基于卷积网络(CNN),变压器及其组合的模型,以分割息肉以有希望的结果。但是,这些方法在模拟息肉的局部外观方面存在局限性,或者在解码过程中缺乏用于空间依赖性的多层次特征。本文提出了一个新颖的网络,即结肠形式,以解决这些局限性。 Colonformer是一种编码器架构,能够在编码器和解码器分支上对远程语义信息进行建模。编码器是一种基于变压器的轻量级体系结构,用于在多尺度上建模全局语义关系。解码器是一种层次结构结构,旨在学习多层功能以丰富特征表示。此外,添加了一个新的Skip连接技术,以完善整体地图中的息肉对象的边界以进行精确分割。已经在五个流行的基准数据集上进行了广泛的实验,以进行息肉分割,包括Kvasir,CVC-Clinic DB,CVC-ColondB,CVC-T和Etis-Larib。实验结果表明,我们的结肠构造者在所有基准数据集上的表现优于其他最先进的方法。
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在血管成形术的临床程序中(即开放式堵塞冠状动脉),在X射线荧光镜检查的指导下,需要将气球和支架等装置(例如气球和支架)放置在动脉中。由于X射线剂量的局限性,所得图像通常是嘈杂的。为了检查这些设备的正确放置,平均进行了多个运动补偿帧以增强视图。因此,设备跟踪是为此目的的必要过程。即使设计为具有易于跟踪的放射性标记的血管成形术设备,但由于标记尺寸较小和血管成形术中的复杂场景,当前的方法难以提供令人满意的结果。在本文中,我们提出了一个用于单个支架跟踪的端到端深度学习框架,该框架由三个层次模块组成:基于U-NET的Landmark检测,基于重新连接的支架提案和功能提取,以及图形卷积神经网络(GCN)基于暂时聚集空间信息和外观特征的支架跟踪。实验表明,与基于点的跟踪模型相比,我们的方法在检测中的性能明显更好。此外,其快速推理速度满足临床要求。
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