基于有效干预措施的早期疾病检测和预防方法正在引起人们的注意。机器学习技术通过捕获多元数据中的个体差异来实现精确的疾病预测。精确医学的进展表明,在个人层面的健康数据中存在实质性异质性,并且复杂的健康因素与慢性疾病的发展有关。但是,由于多种生物标志物之间的复杂关系,确定跨疾病发作过程中的个体生理状态变化仍然是一个挑战。在这里,我们介绍了健康疾病阶段图(HDPD),它通过可视化在疾病进展过程早期波动的多种生物标志物的边界值来代表个人健康状态。在HDPD中,未来的发作预测是通过扰动多个生物标志物值的情况来表示的,同时考虑变量之间的依赖性。我们从3,238个个体的纵向健康检查队列中构建了11种非传染性疾病(NCD)的HDPD,其中包括3,215个测量项目和遗传数据。 HDPD中非发病区域的生物标志物值的改善显着阻止了11个NCD中的7个未来的疾病发作。我们的结果表明,HDPD可以在发作过程中代表单个生理状态,并用作预防疾病的干预目标。
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肥胖是一个重大的健康问题,增加了各种主要慢性病的风险,如糖尿病,癌症和中风。虽然通过横断面BMI录音识别的肥胖作用已经过分研究,但BMI轨迹的作用远远不大。在这项研究中,我们利用从大型和地理位置的EHR数据集中提取的BMI轨迹捕获大约200万个人的健康状况为期六年的健康状况。我们根据BMI轨迹定义九个新的可解释和基于证据的变量,以使用K-Means聚类方法将患者聚类为子组。我们在人口统计学,社会经济和生理测量变量方面彻底审查了每个集群特征,以指定簇中患者的不同性质。在我们的实验中,已被重新建立肥胖,高血压,阿尔茨海默和痴呆症的肥胖,高血压,阿尔茨海默氏症和痴呆症的直接关系,并且已经发现有几种慢性疾病的特异性特征的不同簇符合或与现有的知识体系互补。
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谵妄是急性急性发病脑功能障碍,在紧急情况下,与较高的死亡率有关。由于其演示和风险因素难以检测和监测,这取决于患者的潜在病情。在我们的研究中,我们旨在识别谵妄人口中的亚型,并建立使用医疗信息MART进行密集护理IV(MIMIC-IV)数据来检测谵妄的亚组特定的预测模型。我们表明谵妄存在于谵妄中。对于特定于组的预测模型,还观察到特征重要性的差异。我们的工作可以重新校准每个谵妄亚组的现有谵妄预测模型,并提高ICU或急诊部门患者的谵妄检测和监测的精度。
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This report summarises the outcomes of a systematic literature search to identify Bayesian network models used to support decision making in healthcare. After describing the search methodology, the selected research papers are briefly reviewed, with the view to identify publicly available models and datasets that are well suited to analysis using the causal interventional analysis software tool developed in Wang B, Lyle C, Kwiatkowska M (2021). Finally, an experimental evaluation of applying the software on a selection of models is carried out and preliminary results are reported.
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提出了一个新的框架,用于处理纵向,多元,异质临床数据的建模和分析的复杂任务。该方法使用时间抽象将数据转换为更合适的形式,用于建模,时间模式挖掘,以发现复杂,纵向数据和生存分析的机器学习模型中的模式,以选择发现的模式。该方法应用于阿尔茨海默氏病(AD)的现实世界研究,这是一种无法治愈的进行性神经退行性疾病。在生存分析模型中,发现的模式可预测AD的一致性指数高达0.8。这是使用AD的时间数据收集对AD数据进行生存分析的第一项工作。可视化模块还清楚地描绘了发现的模式,以易于解释。
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医疗保健数据集对机器学习和统计数据都带来了许多挑战,因为它们的数据通常是异质的,审查的,高维的,并且缺少信息。特征选择通常用于识别重要功能,但是当应用于高维数据时,可以产生不稳定的结果,从而在每次迭代中选择一组不同的功能。通过使用特征选择合奏,可以改善特征选择的稳定性,该合奏汇总了多个基本特征选择器的结果。必须将阈值应用于最终的聚合功能集,以将相关功能与冗余功能分开。通常应用的固定阈值不保证最终选定功能仅包含相关功能。这项工作开发了几个数据驱动的阈值,以自动识别集合功能选择器中的相关特征,并评估其预测精度和稳定性。为了证明这些方法对临床数据的适用性,它们被应用于来自两个现实世界中阿尔茨海默氏病(AD)研究的数据。 AD是一种没有已知治愈方法的进行性神经退行性疾病,至少在明显症状出现之前的2-3年开始,为研究人员提供了一个机会,可以鉴定出可能识别有患AD风险的患者的早期生物标志物。通过将这些方法应用于两个数据集来标识的功能反映了广告文献中的当前发现。
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如今,人工智能(AI)已成为临床和远程医疗保健应用程序的基本组成部分,但是最佳性能的AI系统通常太复杂了,无法自我解释。可解释的AI(XAI)技术被定义为揭示系统的预测和决策背后的推理,并且在处理敏感和个人健康数据时,它们变得更加至关重要。值得注意的是,XAI并未在不同的研究领域和数据类型中引起相同的关注,尤其是在医疗保健领域。特别是,许多临床和远程健康应用程序分别基于表格和时间序列数据,而XAI并未在这些数据类型上进行分析,而计算机视觉和自然语言处理(NLP)是参考应用程序。为了提供最适合医疗领域表格和时间序列数据的XAI方法的概述,本文提供了过去5年中文献的审查,说明了生成的解释的类型以及为评估其相关性所提供的努力和质量。具体而言,我们确定临床验证,一致性评估,客观和标准化质量评估以及以人为本的质量评估作为确保最终用户有效解释的关键特征。最后,我们强调了该领域的主要研究挑战以及现有XAI方法的局限性。
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本文介绍了一种使用旨在解决现实世界应用中CDSS的低适用性和可扩展性问题的数据驱动的预测模型来构建一致和适用的临床决策支持系统(CDSS)的方法。该方法基于域特定和数据驱动的支持程序的三种特定于域和数据驱动的支持程序,该程序将被纳入临床业务流程,具有更高的信任和预测结果和建议的解释性。在考虑的三个阶段,监管策略,数据驱动模式和解释程序被集成,以实现与决策者的自然域特定的互动,具有智能决策支持焦点的连续缩小。该提出的方法能够实现更高水平的自动化,可扩展性和CDSS的语义解释性。该方法是在软件解决方案中实现的,并在T2DM预测中进行了测试,使我们能够改善已知的临床尺度(例如FindRisk),同时保持与现有应用程序类似的特定问题的推理界面。这种继承与三分阶段的方法一起提供了更高的解决方案兼容性,并导致数据驱动的解决方案在现实案件中的信任,有效和解释应用。
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Real-time individual endpoint prediction has always been a challenging task but of great clinic utility for both patients and healthcare providers. With 6,879 chronic kidney disease stage 4 (CKD4) patients as a use case, we explored the feasibility and performance of gated recurrent units with decay that models Weibull probability density function (GRU-D-Weibull) as a semi-parametric longitudinal model for real-time individual endpoint prediction. GRU-D-Weibull has a maximum C-index of 0.77 at 4.3 years of follow-up, compared to 0.68 achieved by competing models. The L1-loss of GRU-D-Weibull is ~66% of XGB(AFT), ~60% of MTLR, and ~30% of AFT model at CKD4 index date. The average absolute L1-loss of GRU-D-Weibull is around one year, with a minimum of 40% Parkes serious error after index date. GRU-D-Weibull is not calibrated and significantly underestimates true survival probability. Feature importance tests indicate blood pressure becomes increasingly important during follow-up, while eGFR and blood albumin are less important. Most continuous features have non-linear/parabola impact on predicted survival time, and the results are generally consistent with existing knowledge. GRU-D-Weibull as a semi-parametric temporal model shows advantages in built-in parameterization of missing, native support for asynchronously arrived measurement, capability of output both probability and point estimates at arbitrary time point for arbitrary prediction horizon, improved discrimination and point estimate accuracy after incorporating newly arrived data. Further research on its performance with more comprehensive input features, in-process or post-process calibration are warranted to benefit CKD4 or alike terminally-ill patients.
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血浆定义为物质的第四个状态,在高电场下可以在大气压下产生非热血浆。现在众所周知,血浆激活液体(PAL)的强和广谱抗菌作用。机器学习(ML)在医疗领域的可靠适用性也鼓励其在等离子体医学领域的应用。因此,在PALS上的ML应用可以提出一种新的观点,以更好地了解各种参数对其抗菌作用的影响。在本文中,通过使用先前获得的数据来定性预测PAL的体外抗菌活性,从而介绍了比较监督的ML模型。进行了文献搜索,并从33个相关文章中收集了数据。在所需的预处理步骤之后,将两种监督的ML方法(即分类和回归)应用于数据以获得微生物灭活(MI)预测。对于分类,MI分为四类,对于回归,MI被用作连续变量。为分类和回归模型进行了两种不同的可靠交叉验证策略,以评估所提出的方法。重复分层的K折交叉验证和K折交叉验证。我们还研究了不同特征对模型的影响。结果表明,高参数优化的随机森林分类器(ORFC)和随机森林回归者(ORFR)分别比其他模型进行了分类和回归的模型更好。最后,获得ORFC的最佳测试精度为82.68%,ORFR的R2为0.75。 ML技术可能有助于更好地理解在所需的抗菌作用中具有主要作用的血浆参数。此外,此类发现可能有助于将来的血浆剂量定义。
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痴呆症是一种神经精神脑障碍,通常会在一个或多个脑细胞停止部分或根本停止工作时发生。在疾病的早期阶段诊断这种疾病是从不良后果中挽救生命并为他们提供更好的医疗保健的至关重要的任务。事实证明,机器学习方法在预测疾病早期痴呆症方面是准确的。痴呆的预测在很大程度上取决于通常从归一化的全脑体积(NWBV)和地图集缩放系数(ASF)收集的收集数据类型,这些数据通常测量并从磁共振成像(MRIS)中进行校正。年龄和性别等其他生物学特征也可以帮助诊断痴呆症。尽管许多研究使用机器学习来预测痴呆症,但我们无法就这些方法的稳定性得出结论,而这些方法在不同的实验条件下更准确。因此,本文研究了有关痴呆预测的机器学习算法的性能的结论稳定性。为此,使用7种机器学习算法和两种功能还原算法,即信息增益(IG)和主成分分析(PCA)进行大量实验。为了检查这些算法的稳定性,IG的特征选择阈值从20%更改为100%,PCA尺寸从2到8。这导致了7x9 + 7x7 = 112实验。在每个实验中,都记录了各种分类评估数据。获得的结果表明,在七种算法中,支持向量机和天真的贝叶斯是最稳定的算法,同时更改选择阈值。同样,发现使用IG似乎比使用PCA预测痴呆症更有效。
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医院住宿时间(LOS)是最重要的医疗保健度量之一,反映了医院的服务质量,有助于改善医院调度和管理。LOS预测有助于成本管理,因为留在医院的患者通常在资源受到严重限制的情况下这样做。在这项研究中,我们通过机器学习和统计方法审查了LOS预测的论文。我们的文献综述考虑了对卒中患者LOS预测的研究研究。一些受访的研究表明,作者达成了相应的结论。例如,患者的年龄被认为是一些研究中卒中患者LOS的重要预测因子,而其他研究则认为年龄不是一个重要因素。因此,在该领域需要额外的研究以进一步了解卒中患者LOS的预测因子。
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自2020年2月以来,世界一直在与Covid-19疾病进行激烈的斗争,随着疾病变成大流行,卫生系统受到悲惨的压力。这项研究的目的是使用对LogNNET储层神经网络的向后特征消除算法获得COVID-19的诊断和预后中最有效的常规血值(RBV)。该研究中的第一个数据集由5296例患者组成,具有相同数量的阴性和阳性COVID-19。 Lognnet模型在疾病诊断中的准确率为99.5%,其特征的精度为99.17%,只有平均红细胞血红蛋白浓度,平均性肌张力性血红蛋白和激活的部分凝血酶蛋白时间。第二个数据集由总共3899例COVID-19诊断为医院接受治疗的患者,其中203名患者是严重的患者,3696例患者是温和的患者。该模型以48个特征确定疾病预后的准确率达到94.4%,而仅红细胞沉降率,中性粒细胞计数和C反应性蛋白质特征,精度为82.7%。我们的方法将减少卫生部门的负压力,并帮助医生使用关键特征来了解Covid-19的发病机理。该方法有望在物联网中创建移动健康监控系统。
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大型和深度电子医疗保健记录(EHR)数据集的可用性有可能更好地了解现实世界中的患者旅行,并鉴定出新的患者亚组。基于ML的EHR数据集合主要是工具驱动的,即基于可用或新开发的方法的构建。但是,这些方法,它们的输入要求以及最重要的是,通常难以解释产量,尤其是没有深入的数据科学或统计培训。这危害了需要进行可行且具有临床意义的解释的最后一步。这项研究研究了使用大型EHR数据集和多种聚类方法进行临床研究的方法进行大规模进行患者分层分析的方法。我们已经开发了几种工具来促进无监督的患者分层结果的临床评估和解释,即模式筛查,元聚类,替代建模和策展。这些工具可以在分析中的不同阶段使用。与标准分析方法相比,我们证明了凝结结果并优化分析时间的能力。在元聚类的情况下,我们证明了患者簇的数量可以从72减少到3。在另一个分层的结果中,通过使用替代模型,我们可以迅速确定如果有血液钠测量值可用,则可以对心力衰竭患者进行分层。由于这是对所有心力衰竭患者进行的常规测量,因此表明数据偏差。通过使用进一步的队列和特征策展,可以去除这些患者和其他无关的特征以提高临床意义。这些示例显示了拟议方法的有效性,我们希望鼓励在该领域的进一步研究。
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食管障碍的发病机制与食管壁力学有关。因此,要了解各种食管障碍背后的潜在基本机制,将基于食管壁力学的参数映射到与改变的推注途径和超级性IBP对应的生理和病理生理学条件至关重要。在这项工作中,我们提出了一种混合框架,将流体力学和机器学习结合,以识别各种食管障碍的底层物理,并将它们映射到我们称之为虚拟疾病景观(VDL)的参数空间上。一维逆模型处理来自食道诊断装置的输出,称为内窥镜功能腔成像探针(endoflip)来估计食道的机械“健康”,通过预测一组基于机械基的参数,例如食道壁刚度,肌肉收缩食管墙的模式和活跃放松。然后使用基于机械基的参数来训练由改变空间(VAE)组成的神经网络,其产生潜在空间和侧面网络,该侧面网络预测用于估计食道古代结动性的机械工作度量。潜在的矢量以及一组基于基于机械的参数定义VDL并形成与各种食管疾病相对应的簇。 VDL不仅区分不同的疾病,而且还可用于预测疾病进展及时。最后,我们还证明了该框架的临床适用性,用于估算治疗后治疗和追踪患者状况的有效性。
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合成健康数据在共享数据以支持生物医学研究和创新医疗保健应用的发展时有可能减轻隐私问题。基于机器学习,尤其是生成对抗网络(GAN)方法的现代方法生成的现代方法继续发展并表现出巨大的潜力。然而,缺乏系统的评估框架来基准测试方法,并确定哪些方法最合适。在这项工作中,我们引入了一个可推广的基准测试框架,以评估综合健康数据的关键特征在实用性和隐私指标方面。我们将框架应用框架来评估来自两个大型学术医疗中心的电子健康记录(EHRS)数据的合成数据生成方法。结果表明,共享合成EHR数据存在公用事业私人关系权衡。结果进一步表明,在每个用例中,在所有标准上都没有明确的方法是最好的,这使得为什么需要在上下文中评估合成数据生成方法。
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目的:创建和评估人工智能深度学习平台(Oraicle)的准确性,能够仅使用视网膜眼睛图像来预测个人整体5年心血管风险(CVD)以及组件风险因素的相对贡献,这些因素包括这一点风险。方法:我们从47,236个患者就诊的数据库中使用了165,907个视网膜图像。最初,每个图像与生物识别数据年龄,种族,性别,性,存在和持续时间HDL/LDL比以及任何CVD事件Wtihin 5年的视网膜图像采集5年。计算了基于Framingham方程的风险评分。还确定了个人和整体人口的实际CVD事件率。最后,仅使用年龄,种族,性别加上视网膜图像对Oraicle进行训练。结果:与基于弗雷明厄姆的分数相比,在接下来的5年中,Oraicle在预测心血管事件方面的准确性高达12%,尤其是对于最高风险的人群。每个限制性模型的可靠性和准确性对Oraicle的性能均优于最佳性能,表明它使用了两组数据中的数据来得出其最终结果。结论:视网膜摄影是便宜的,只需要最少的培训才能获得全自动,廉价的摄像头系统,现在可以广泛使用。因此,基于AI的CVD风险算法(例如Oraicle)有望使CV健康筛查更加准确,更加相似,并且更容易访问。此外,Oraicle评估构成个人总体风险的组件相对贡献的独特能力将根据个人的特定需求为治疗决策提供信息,从而增加了阳性健康结果的可能性。
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医疗保健数据集通常包含一组高度相关的特征,例如来自同一生物系统的特征。当将功能选择应用于这些数据集以识别最重要的功能时,由于相关功能,由于相关特征而引起的某些多变量特征选择器固有的偏差使这些方法难以区分重要的和无关的特征,并且功能选择过程的结果CAN可以解决。不稳定。已经研究了特征选择合奏,该合奏汇总了多个单个基础特征选择器的结果,已被研究为稳定特征选择结果的一种手段,但不能解决相关特征的问题。我们提出了一个新颖的框架,可以从多元特征选择器中创建特征选择集合,同时考虑了相关特征组产生的偏差,并在预处理步骤中使用团聚层次聚类。这些方法从阿尔茨海默氏病(AD)的研究中应用于两个现实世界数据集,这是一种尚未治愈且尚未完全了解的进行性神经退行性疾病。我们的结果表明,在没有聚类的情况下选择在模型中选择的功能的稳定性有明显的改善,并且这些模型选择的功能与广告文献中的发现保持一致。
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目的:提高地理访问仍然是确定卫生政策设计中区域医疗资源充足的关键问题。然而,患者的选择可以是各种因素的复杂交互的结果。本研究的目的是提出深度神经网络方法来模拟患者选择在旅行距离中的复杂决定,以获取护理,这是分配资源的决策制定的重要指标。方法:我们使用了台湾的4年全国保险数据,并积累了早期文献中讨论的可能特征。本研究提出使用卷积神经网络(CNN)基于框架来进行预测。模型性能对其他机器学习方法进行了测试。使用集成梯度(IG)进一步解释了所提出的框架来分析特征权重。结果:我们成功地证明了使用基于CNN的框架来预测患者的旅行距离的有效性,实现0.968,AUC的精度,0.969,敏感性为0.960,比0.989的特异性。基于CNN的框架优于所有其他方法。在这项研究中,IG重量可能是可解释的;然而,这种关系与公共卫生中的已知指标不相似,类似于普通共识。结论:我们的结果表明了基于深度学习的旅行距离预测模型的可行性。它有可能在资源分配中指导政策制定。
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背景:几项研究突出了考虑急性冠状动脉综合征(ACS)诊断和治疗性差异的重要性。然而,几乎已经研究了ACS子群中的性别特异性风险标志物。本研究旨在探索机器学习(ML)模型,以识别从电子健康记录(EHR)的公共数据库中的ACS子群体中的妇女和男性的住院死亡率标志。方法:从医疗信息MART中提取1,299名患有的ST升高的心肌梗死(Stemi)和2,820名非St-Expation心肌梗死患者进行重症监护(MIMIC)-III数据库。我们培训和验证了死亡率预测模型,并使用了可解释性技术来识别每个子群体的性别特异性标记。结果:基于极端梯度升压的模型(XGBoost)实现了最高性能:STEMI和AUC = 0.94(95 \%CI:0.80- 0.90)为nstemi。对于STEMI,女性的顶部标记是慢性肾功能衰竭,心率高,年龄超过70岁。对于男性来说,顶部标记是急性肾功能衰竭,高肌钙蛋白T水平,年龄超过75岁。然而,对于NStemi,女性的顶部标记较低,肌钙蛋白水平低,尿素水平高,80多年。对于男性来说,顶部标记是高心率,肌酐水平,年龄超过70岁。结论:我们的结果表明,通过解释ehrs培训的ML死亡率模型,通过解释ML死亡率模型显示不同ACS子群的可能的显着和相干的性别特异性风险标记。在妇女与男性的确定风险标志中观察到差异,突出了考虑性别特异性标记在实施更适当的治疗策略和更好的临床结果方面的重要性。
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