用于培训糖尿病性视网膜病变分类器的公共可用数据是不平衡的。生成的对抗网络可以成功合成视网膜底面图像。为了使合成图像有益,图像必须具有高质量和多样化。目前,使用了几种评估指标来评估生成对抗网络合成的图像的质量和多样性。这项工作是对文献中用于评估生成对抗网络的评估指标的适用性的第一个此类经验评估,用于在糖尿病性视网膜病变的背景下生成视网膜底面图像。 Frechet成立距离,峰值信噪比和余弦距离评估合成增殖性糖尿病夺回图像的质量和多样性的能力。进行定量分析以启用改进的方法,以选择用于增强分类器培训数据集的合成图像。结果表明,Frechet的启动距离适合评估合成图像的多样性,并用于识别该图像是否具有与其类标签相对应的特征。峰值信噪比适合指示合成图像是否具有有效的糖尿病性视网膜病变,并且其特征是否与其类标记相对应。这些结果证明了执行这种经验评估的重要性,尤其是在旨在应用于应用环境中利用的生物医学领域的背景下。
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组织病理学分析是对癌前病变诊断的本金标准。从数字图像自动组织病理学分类的目标需要监督培训,这需要大量的专家注释,这可能是昂贵且耗时的收集。同时,精确分类从全幻灯片裁剪的图像斑块对于基于标准滑动窗口的组织病理学幻灯片分类方法是必不可少的。为了减轻这些问题,我们提出了一个精心设计的条件GaN模型,即hostogan,用于在类标签上合成现实组织病理学图像补丁。我们还研究了一种新颖的合成增强框架,可选择地添加由我们提出的HADOGAN生成的新的合成图像补丁,而不是直接扩展与合成图像的训练集。通过基于其指定标签的置信度和实际标记图像的特征相似性选择合成图像,我们的框架为合成增强提供了质量保证。我们的模型在两个数据集上进行评估:具有有限注释的宫颈组织病理学图像数据集,以及具有转移性癌症的淋巴结组织病理学图像的另一个数据集。在这里,我们表明利用具有选择性增强的组织产生的图像导致对宫颈组织病理学和转移性癌症数据集分别的分类性能(分别为6.7%和2.8%)的显着和一致性。
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In biomedical image analysis, the applicability of deep learning methods is directly impacted by the quantity of image data available. This is due to deep learning models requiring large image datasets to provide high-level performance. Generative Adversarial Networks (GANs) have been widely utilized to address data limitations through the generation of synthetic biomedical images. GANs consist of two models. The generator, a model that learns how to produce synthetic images based on the feedback it receives. The discriminator, a model that classifies an image as synthetic or real and provides feedback to the generator. Throughout the training process, a GAN can experience several technical challenges that impede the generation of suitable synthetic imagery. First, the mode collapse problem whereby the generator either produces an identical image or produces a uniform image from distinct input features. Second, the non-convergence problem whereby the gradient descent optimizer fails to reach a Nash equilibrium. Thirdly, the vanishing gradient problem whereby unstable training behavior occurs due to the discriminator achieving optimal classification performance resulting in no meaningful feedback being provided to the generator. These problems result in the production of synthetic imagery that is blurry, unrealistic, and less diverse. To date, there has been no survey article outlining the impact of these technical challenges in the context of the biomedical imagery domain. This work presents a review and taxonomy based on solutions to the training problems of GANs in the biomedical imaging domain. This survey highlights important challenges and outlines future research directions about the training of GANs in the domain of biomedical imagery.
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虽然生成的对抗网络(GaN)是他们对其更高的样本质量的流行,而与其他生成模型相反,但是它们遭受同样困难的产生样本的难度。必须牢记各个方面,如产生的样本的质量,课程的多样性(在课堂内和类别中),使用解除戒开的潜在空间,所述评估度量的协议与人类感知等。本文,我们提出了一个新的评分,即GM分数,这取得了各种因素,如样品质量,解除戒备的代表,阶级,级别的阶级和级别多样性等各种因素,以及诸如精确,召回和F1分数等其他指标用于可怜的性深度信仰网络(DBN)和限制Boltzmann机(RBM)的潜在空间。评估是针对不同的GANS(GAN,DCGAN,BIGAN,CGAN,CONFORDGON,LSGAN,SGAN,WAN,以及WGAN改进)的不同GANS(GAN,DCGAN,BIGAN,SCAN,WANT)在基准MNIST数据集上培训。
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Objective: Accurate visual classification of bladder tissue during Trans-Urethral Resection of Bladder Tumor (TURBT) procedures is essential to improve early cancer diagnosis and treatment. During TURBT interventions, White Light Imaging (WLI) and Narrow Band Imaging (NBI) techniques are used for lesion detection. Each imaging technique provides diverse visual information that allows clinicians to identify and classify cancerous lesions. Computer vision methods that use both imaging techniques could improve endoscopic diagnosis. We address the challenge of tissue classification when annotations are available only in one domain, in our case WLI, and the endoscopic images correspond to an unpaired dataset, i.e. there is no exact equivalent for every image in both NBI and WLI domains. Method: We propose a semi-surprised Generative Adversarial Network (GAN)-based method composed of three main components: a teacher network trained on the labeled WLI data; a cycle-consistency GAN to perform unpaired image-to-image translation, and a multi-input student network. To ensure the quality of the synthetic images generated by the proposed GAN we perform a detailed quantitative, and qualitative analysis with the help of specialists. Conclusion: The overall average classification accuracy, precision, and recall obtained with the proposed method for tissue classification are 0.90, 0.88, and 0.89 respectively, while the same metrics obtained in the unlabeled domain (NBI) are 0.92, 0.64, and 0.94 respectively. The quality of the generated images is reliable enough to deceive specialists. Significance: This study shows the potential of using semi-supervised GAN-based classification to improve bladder tissue classification when annotations are limited in multi-domain data.
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频谱图分类在分析引力波数据中起重要作用。在本文中,我们提出了一个框架来通过使用生成对抗网络(GAN)来改善分类性能。由于注释光谱图需要大量的努力和专业知识,因此训练示例的数量非常有限。但是,众所周知,只有当训练集的样本量足够大时,深层网络才能表现良好。此外,不同类别中的样本数量不平衡也会阻碍性能。为了解决这些问题,我们提出了一个基于GAN的数据增强框架。虽然无法在频谱图上应用常规图像的标准数据增强方法,但我们发现,甘恩(Progan)的一种变体能够生成高分辨率频谱图,这些光谱图与高分辨率原始图像的质量一致并提供了理想的多样性。我们通过将{\ it Gravity间谍}数据集中的小故障与GAN生成的频谱图分类为训练,从而验证了我们的框架。我们表明,所提出的方法可以为使用深网的分类提供转移学习的替代方法,即使用高分辨率GAN进行数据增强。此外,可以大大降低分类性能的波动,用于训练和评估的小样本量。在我们的框架中,使用训练有素的网络,我们还检查了{\ it Gravity Spy}中标签异常的频谱图。
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数据已成为当今世界上最有价值的资源。随着数据驱动算法的大量扩散,例如基于深度学习的方法,数据的可用性引起了极大的兴趣。在这种情况下,特别需要高质量的培训,验证和测试数据集。体积数据是医学中非常重要的资源,因为它范围从疾病诊断到治疗监测。如果数据集足够,则可以培训模型来帮助医生完成这些任务。不幸的是,在某些情况和应用程序中,大量数据不可用。例如,在医疗领域,罕见疾病和隐私问题可能导致数据可用性受到限制。在非医学领域,获得足够数量的高质量数据的高成本也可能引起人们的关注。解决这些问题的方法可能是生成合成数据,以结合其他更传统的数据增强方法来执行数据增强。因此,关于3D生成对抗网络(GAN)的大多数出版物都在医疗领域内。生成现实合成数据的机制的存在是克服这一挑战的好资产,尤其是在医疗保健中,因为数据必须具有良好的质量并且接近现实,即现实,并且没有隐私问题。在这篇综述中,我们提供了使用GAN生成现实的3D合成数据的作品的摘要。因此,我们概述了具有共同体系结构,优势和缺点的这些领域中基于GAN的方法。我们提出了一种新颖的分类学,评估,挑战和研究机会,以提供医学和其他领域甘恩当前状态的整体概述。
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类别不平衡发生在许多实际应用程序中,包括图像分类,其中每个类中的图像数量显着不同。通过不平衡数据,生成的对抗网络(GANS)倾向于多数类样本。最近的两个方法,平衡GaN(Bagan)和改进的Bagan(Bagan-GP)被提出为增强工具来处理此问题并将余额恢复到数据。前者以无人监督的方式预先训练自动化器权重。但是,当来自不同类别的图像具有类似的特征时,它是不稳定的。后者通过促进监督的自动化培训培训,基于蒲甘进行改善,但预先培训偏向于多数阶级。在这项工作中,我们提出了一种新颖的条件变形式自动化器,具有用于生成的对抗性网络(CAPAN)的平衡训练,作为生成现实合成图像的增强工具。特别是,我们利用条件卷积改变自动化器,为GaN初始化和梯度惩罚培训提供了监督和平衡的预培训。我们所提出的方法在高度不平衡版本的MNIST,时尚 - MNIST,CIFAR-10和两个医学成像数据集中呈现出卓越的性能。我们的方法可以在FR \'回路截止距离,结构相似性指数测量和感知质量方面综合高质量的少数民族样本。
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气候变化正在增加有害藻华(HAB)的频率和严重程度,这些藻类在水产养殖场中造成大量鱼类死亡。这有助于海洋污染和温室气体(GHG)的排放,因为死鱼要么被倾倒到海洋中,要么被带到垃圾填埋场,进而对气候产生负面影响。当前,列举有害藻类和其他浮游植物的标准方法是在显微镜下手动观察并对其进行计数。这是一个耗时,乏味且容易出错的过程,导致农民的管理决定妥协。因此,自动化此过程以进行快速准确的HAB监控非常有帮助。但是,这需要大量且多样化的浮游植物图像数据集,并且这些数据集很难快速生产。在这项工作中,我们探讨了产生新型高分辨率的光真逼真的合成浮游植物图像的可行性,这些图像包含相同图像中的多个物种,并且给定了一小部分真实图像。为此,我们采用生成的对抗网络(GAN)来生成合成图像。我们使用标准图像质量指标评估了三种不同的GAN架构:ProjectedGan,Fastgan和styleganv2。我们从经验上显示了仅使用961个真实图像的训练数据集的高保真合成浮游植物图像的产生。因此,这项工作证明了甘斯从小型培训数据集中创建大型浮游植物的大型合成数据集的能力,从而朝着可持续的系统监测有害藻类绽放迈出了关键的一步。
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在过去的几十年中,数据科学领域已经存在着激烈的进展,而其他学科则不断受益于此。结构健康监测(SHM)是使用人工智能(AI)的那些领域之一,例如机器学习(ML)和深度学习(DL)算法,用于基于所收集的数据的民用结构的条件评估。 ML和DL方法需要大量的培训程序数据;但是,在SHM中,来自民间结构的数据收集非常详尽;特别是获得有用的数据(相关数据损坏)可能非常具有挑战性。本文使用1-D Wasserstein深卷积生成的对抗网络,使用梯度惩罚(1-D WDCGAN-GP)进行合成标记的振动数据生成。然后,通过使用1-D深卷积神经网络(1-D DCNN)来实现在不同级别的合成增强振动数据集的结构损伤检测。损伤检测结果表明,1-D WDCAN-GP可以成功地利用以解决基于振动的民用结构的损伤诊断数据稀缺。关键词:结构健康监测(SHM),结构损伤诊断,结构损伤检测,1-D深卷积神经网络(1-D DCNN),1-D生成对抗网络(1-D GAN),深卷积生成的对抗网络( DCGAN),Wassersein生成的对抗性网络具有梯度惩罚(WAN-GP)
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在这项工作中,我们介绍了DCGAN的实证研究,包括超参数启发式方法和图像质量评估,以解决研究数据集的稀缺性,以研究胎儿头超声。我们提出了实验,以显示不同图像分辨率,时期,数据集大小输入和对四个指标质量图像评估的学习速率的影响:互信息(MI),fr \'Echet Inception Inteption距离(FID),峰值信号到峰值信号-noise比率(PSNR)和局部二进制模式矢量(LBPV)。结果表明,FID和LBPV与临床图像质量评分具有更强的关系。复制此工作的资源可在\ url {https://github.com/budai4medtech/miua2022}中获得。
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It is well known that the performance of any classification model is effective if the dataset used for the training process and the test process satisfy some specific requirements. In other words, the more the dataset size is large, balanced, and representative, the more one can trust the proposed model's effectiveness and, consequently, the obtained results. Unfortunately, large-size anonymous datasets are generally not publicly available in biomedical applications, especially those dealing with pathological human face images. This concern makes using deep-learning-based approaches challenging to deploy and difficult to reproduce or verify some published results. In this paper, we suggest an efficient method to generate a realistic anonymous synthetic dataset of human faces with the attributes of acne disorders corresponding to three levels of severity (i.e. Mild, Moderate and Severe). Therefore, a specific hierarchy StyleGAN-based algorithm trained at distinct levels is considered. To evaluate the performance of the proposed scheme, we consider a CNN-based classification system, trained using the generated synthetic acneic face images and tested using authentic face images. Consequently, we show that an accuracy of 97,6\% is achieved using InceptionResNetv2. As a result, this work allows the scientific community to employ the generated synthetic dataset for any data processing application without restrictions on legal or ethical concerns. Moreover, this approach can also be extended to other applications requiring the generation of synthetic medical images. We can make the code and the generated dataset accessible for the scientific community.
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The success of Deep Learning applications critically depends on the quality and scale of the underlying training data. Generative adversarial networks (GANs) can generate arbitrary large datasets, but diversity and fidelity are limited, which has recently been addressed by denoising diffusion probabilistic models (DDPMs) whose superiority has been demonstrated on natural images. In this study, we propose Medfusion, a conditional latent DDPM for medical images. We compare our DDPM-based model against GAN-based models, which constitute the current state-of-the-art in the medical domain. Medfusion was trained and compared with (i) StyleGan-3 on n=101,442 images from the AIROGS challenge dataset to generate fundoscopies with and without glaucoma, (ii) ProGAN on n=191,027 from the CheXpert dataset to generate radiographs with and without cardiomegaly and (iii) wGAN on n=19,557 images from the CRCMS dataset to generate histopathological images with and without microsatellite stability. In the AIROGS, CRMCS, and CheXpert datasets, Medfusion achieved lower (=better) FID than the GANs (11.63 versus 20.43, 30.03 versus 49.26, and 17.28 versus 84.31). Also, fidelity (precision) and diversity (recall) were higher (=better) for Medfusion in all three datasets. Our study shows that DDPM are a superior alternative to GANs for image synthesis in the medical domain.
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The success of deep learning is largely due to the availability of large amounts of training data that cover a wide range of examples of a particular concept or meaning. In the field of medicine, having a diverse set of training data on a particular disease can lead to the development of a model that is able to accurately predict the disease. However, despite the potential benefits, there have not been significant advances in image-based diagnosis due to a lack of high-quality annotated data. This article highlights the importance of using a data-centric approach to improve the quality of data representations, particularly in cases where the available data is limited. To address this "small-data" issue, we discuss four methods for generating and aggregating training data: data augmentation, transfer learning, federated learning, and GANs (generative adversarial networks). We also propose the use of knowledge-guided GANs to incorporate domain knowledge in the training data generation process. With the recent progress in large pre-trained language models, we believe it is possible to acquire high-quality knowledge that can be used to improve the effectiveness of knowledge-guided generative methods.
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深尾学习旨在培训有用的深层网络,以实用现实世界中的不平衡分布,其中大多数尾巴类别的标签都与一些样本相关联。有大量的工作来训练判别模型,以进行长尾分布的视觉识别。相比之下,我们旨在训练有条件的生成对抗网络,这是一类长尾分布的图像生成模型。我们发现,类似于识别图像产生的最新方法类似,也遭受了尾部类别的性能降解。性能降解主要是由于尾部类别的类别模式塌陷,我们观察到与调节参数矩阵的光谱爆炸相关。我们提出了一种新型的组光谱正规剂(GSR),以防止光谱爆炸减轻模式崩溃,从而导致尾巴类别的形象产生多样化和合理的图像产生。我们发现GSR有效地与现有的增强和正则化技术结合在一起,从而导致长尾数据上的最新图像生成性能。广泛的实验证明了我们的常规器在不同程度不平衡的长尾数据集上的功效。
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缺乏足够大的开放医疗数据库是AI驱动的医疗保健中最大的挑战之一。使用生成对抗网络(GAN)创建的合成数据似乎是减轻隐私政策问题的好解决方案。另一种类型的治疗是在多个医疗机构之间进行分散方案,而无需交换本地数据样本。在本文中,我们探讨了集中式和分散的设置中的无条件和有条件的gan。集中式设置模仿了对大型但高度不平衡的皮肤病变数据集的研究,而分散的人则通过三个机构模拟了更现实的医院情况。我们评估了模型的性能,从忠诚度,多样性,训练速度和对生成合成数据进行培训的分类器的预测能力。此外,我们通过探索潜在空间和嵌入投影的解释性。计算出的真实图像及其在潜在空间中的投影之间的距离证明了训练有素的gan的真实性和概括,这是此类应用程序中的主要关注点之一。用于进行研究的开源代码可在\ url {https://github.com/aidse/stylegan2-ada-pytorch}上公开获得。
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生成模型生成的合成数据可以增强医学成像中渴望数据深度学习模型的性能和能力。但是,(1)(合成)数据集的可用性有限,并且(2)生成模型训练很复杂,这阻碍了它们在研究和临床应用中的采用。为了减少此入口障碍,我们提出了Medigan,Medigan是一站式商店,用于验证的生成型号,该型号是开源框架 - 不合骨python图书馆。 Medigan允许研究人员和开发人员仅在几行代码中创建,增加和域名。在基于收集的最终用户需求的设计决策的指导下,我们基于生成模型的模块化组件(i)执行,(ii)可视化,(iii)搜索和排名以及(iv)贡献。图书馆的可伸缩性和设计是通过其越来越多的综合且易于使用的验证生成模型来证明的,该模型由21种模型组成,利用9种不同的生成对抗网络体系结构在4个域中在11个数据集中训练,即乳腺摄影,内窥镜检查,X射线和X射线和X射线镜头,X射线和X型。 MRI。此外,在这项工作中分析了Medigan的3个应用,其中包括(a)启用社区范围内的限制数据共享,(b)研究生成模型评估指标以及(c)改进临床下游任务。在(b)中,扩展了公共医学图像综合评估和报告标准,我们根据图像归一化和特定于放射学特征提取了Fr \'Echet Inception距离变异性。
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生成对抗网络(GAN)是现实图像合成的最新生成模型之一。虽然培训和评估GAN变得越来越重要,但当前的GAN研究生态系统并未提供可靠的基准,以始终如一地进行评估。此外,由于GAN实施很少,因此研究人员将大量时间用于重现基线。我们研究了GAN方法的分类法,并提出了一个名为Studiogan的新开源库。 Studiogan支持7种GAN体系结构,9种调理方法,4种对抗损失,13个正则化模块,3个可区分的增强,7个评估指标和5个评估骨干。通过我们的培训和评估协议,我们使用各种数据集(CIFAR10,ImageNet,AFHQV2,FFHQ和Baby/Papa/Granpa-Imagenet)和3个不同的评估骨干(InceptionV3,Swav,Swav和Swin Transformer)提出了大规模的基准。与GAN社区中使用的其他基准不同,我们在统一的培训管道中培训了包括Biggan,stylegan2和stylegan3在内的代表GAN,并使用7个评估指标量化了生成性能。基准测试评估其他尖端生成模型(例如,stylegan-xl,adm,maskgit和rq-transformer)。 Studiogan提供了预先训练的权重的GAN实现,培训和评估脚本。 Studiogan可从https://github.com/postech-cvlab/pytorch-studiogan获得。
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在这项工作中,我们研究了生成图像模型的性能和评估如何受到其培训数据集的种族组成的影响。通过检查和控制各种培训数据集中的种族分布,我们能够观察不同培训分布对生成的图像质量和生成图像的种族分布的影响。我们的结果表明,生成的图像的种族组成成功地保留了培训数据。但是,我们观察到截断是一种用于在推断过程中生成更高质量图像的技术,加剧了数据中的种族失衡。最后,在检查图像质量与种族之间的关系时,我们发现给定种族的最高可感知的视觉质量图像来自该种族代表性很好的分布,并且注释者始终偏爱白人的生成图像,而不是黑人。
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评估图像生成模型(例如生成对抗网络(GAN))是一个具有挑战性的问题。一种常见的方法是比较地面真相图像集和生成的测试图像集的分布。 Frech \'Et启动距离是评估gan的最广泛使用的指标之一,该指标假定一组图像的训练有素的启动模型中的特征遵循正态分布。在本文中,我们认为这是一个过度简化的假设,这可能会导致不可靠的评估结果,并且可以使用截断的广义正态分布来实现更准确的密度估计。基于此,我们提出了一个新的度量,以准确评估gan,称为趋势(截断了截断的正常密度估计,对嵌入植物的嵌入)。我们证明我们的方法大大减少了密度估计的错误,因此消除了评估结果错误的风险。此外,我们表明所提出的指标可显着提高评估结果的鲁棒性,以防止图像样品数量变化。
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