Left-ventricular ejection fraction (LVEF) is an important indicator of heart failure. Existing methods for LVEF estimation from video require large amounts of annotated data to achieve high performance, e.g. using 10,030 labeled echocardiogram videos to achieve mean absolute error (MAE) of 4.10. Labeling these videos is time-consuming however and limits potential downstream applications to other heart diseases. This paper presents the first semi-supervised approach for LVEF prediction. Unlike general video prediction tasks, LVEF prediction is specifically related to changes in the left ventricle (LV) in echocardiogram videos. By incorporating knowledge learned from predicting LV segmentations into LVEF regression, we can provide additional context to the model for better predictions. To this end, we propose a novel Cyclical Self-Supervision (CSS) method for learning video-based LV segmentation, which is motivated by the observation that the heartbeat is a cyclical process with temporal repetition. Prediction masks from our segmentation model can then be used as additional input for LVEF regression to provide spatial context for the LV region. We also introduce teacher-student distillation to distill the information from LV segmentation masks into an end-to-end LVEF regression model that only requires video inputs. Results show our method outperforms alternative semi-supervised methods and can achieve MAE of 4.17, which is competitive with state-of-the-art supervised performance, using half the number of labels. Validation on an external dataset also shows improved generalization ability from using our method. Our code is available at https://github.com/xmed-lab/CSS-SemiVideo.
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图像回归任务,如骨矿物密度(BMD)估计和左心室喷射分数(LVEF)预测,在计算机辅助疾病评估中起重要作用。大多数深度回归方法用单一的回归损耗函数训练神经网络,如MSE或L1损耗。在本文中,我们提出了一种用于深度图像回归的第一个对比学习框架,即adacon,其包括通过新颖的自适应边缘对比损耗和回归预测分支的特征学习分支组成。我们的方法包含标签距离关系作为学习特征表示的一部分,这允许在下游回归任务中进行更好的性能。此外,它可以用作即插即用模块,以提高现有回归方法的性能。我们展示了adacon对来自X射线图像的骨矿物密度估计和来自超声心动图象的X射线图像和左心室喷射分数预测的骨矿物密度估计的有效性。 Adacon分别导致MAE在最先进的BMD估计和LVEF预测方法中相对提高3.3%和5.9%。
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半监控视频动作识别倾向于使深神经网络能够实现显着性能,即使具有非常有限的标记数据。然而,现有方法主要从当前的基于图像的方法转移(例如,FixMatch)。不具体利用时间动态和固有的多模式属性,它们的结果可能是次优。为了更好地利用视频中的编码的时间信息,我们将时间梯度引入了本文中的更多细小特征提取的额外模态。具体而言,我们的方法明确地蒸馏从时间梯度(TG)的细粒度运动表示,并施加不同方式的一致性(即RGB和TG)。在推理期间,没有额外的计算或参数,在没有额外的计算或参数的情况下显着提高了半监督动作识别的性能。我们的方法在若干典型的半监督设置(即标记数据的不同比率)下实现三个视频动作识别基准(即动态-400,UCF-101和HMDB-51)的最先进的性能。
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监管基于深度学习的方法,产生医学图像分割的准确结果。但是,它们需要大量标记的数据集,并获得它们是一种艰苦的任务,需要临床专业知识。基于半/自我监督的学习方法通​​过利用未标记的数据以及有限的注释数据来解决此限制。最近的自我监督学习方法使用对比损失来从未标记的图像中学习良好的全球层面表示,并在像想象网那样的流行自然图像数据集上实现高性能。在诸如分段的像素级预测任务中,对于学习良好的本地级别表示以及全局表示来说至关重要,以实现更好的准确性。然而,现有的局部对比损失的方法的影响仍然是学习良好本地表现的限制,因为类似于随机增强和空间接近定义了类似和不同的局部区域;由于半/自我监督设置缺乏大规模专家注释,而不是基于当地地区的语义标签。在本文中,我们提出了局部对比损失,以便通过利用从未标记的图像的未标记图像的伪标签获得的语义标签信息来学习用于分割的良好像素级别特征。特别地,我们定义了建议的损失,以鼓励具有相同伪标签/标签的像素的类似表示,同时与数据集中的不同伪标签/标签的像素的表示。我们通过联合优化标记和未标记的集合和仅限于标记集的分割损失,通过联合优化拟议的对比损失来进行基于伪标签的自培训和培训网络。我们在三个公共心脏和前列腺数据集上进行了评估,并获得高分割性能。
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由于数据注释的高成本,半监督行动识别是一个具有挑战性的,但重要的任务是。这个问题的常见方法是用伪标签分配未标记的数据,然后将其作为训练中的额外监督。通常在最近的工作中,通过在标记数据上训练模型来获得伪标签,然后使用模型的自信预测来教授自己。在这项工作中,我们提出了一种更有效的伪标签方案,称为跨模型伪标记(CMPL)。具体地,除了主要骨干内,我们还介绍轻量级辅助网络,并要求他们互相预测伪标签。我们观察到,由于其不同的结构偏差,这两种模型倾向于学习来自同一视频剪辑的互补表示。因此,通过利用跨模型预测作为监督,每个模型都可以受益于其对应物。对不同数据分区协议的实验表明我们对现有替代方案框架的重大改进。例如,CMPL在Kinetics-400和UCF-101上实现了17.6 \%$ 17.6 \%$ 25.1 \%$ 25.使用RGB模态和1 \%$标签数据,优于我们的基线模型,FIXMATCT,以$ 9.0 \% $和10.3美元\%$。
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在许多图像引导的临床方法中,医学图像分割是一个基本和关键的步骤。基于深度学习的细分方法的最新成功通常取决于大量标记的数据,这特别困难且昂贵,尤其是在医学成像领域中,只有专家才能提供可靠和准确的注释。半监督学习已成为一种吸引人的策略,并广泛应用于医学图像分割任务,以训练注释有限的深层模型。在本文中,我们对最近提议的半监督学习方法进行了全面综述,并总结了技术新颖性和经验结果。此外,我们分析和讨论现有方法的局限性和几个未解决的问题。我们希望这篇评论可以激发研究界探索解决这一挑战的解决方案,并进一步促进医学图像细分领域的发展。
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Recent advancements in deep learning methods bring computer-assistance a step closer to fulfilling promises of safer surgical procedures. However, the generalizability of such methods is often dependent on training on diverse datasets from multiple medical institutions, which is a restrictive requirement considering the sensitive nature of medical data. Recently proposed collaborative learning methods such as Federated Learning (FL) allow for training on remote datasets without the need to explicitly share data. Even so, data annotation still represents a bottleneck, particularly in medicine and surgery where clinical expertise is often required. With these constraints in mind, we propose FedCy, a federated semi-supervised learning (FSSL) method that combines FL and self-supervised learning to exploit a decentralized dataset of both labeled and unlabeled videos, thereby improving performance on the task of surgical phase recognition. By leveraging temporal patterns in the labeled data, FedCy helps guide unsupervised training on unlabeled data towards learning task-specific features for phase recognition. We demonstrate significant performance gains over state-of-the-art FSSL methods on the task of automatic recognition of surgical phases using a newly collected multi-institutional dataset of laparoscopic cholecystectomy videos. Furthermore, we demonstrate that our approach also learns more generalizable features when tested on data from an unseen domain.
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Temporal action segmentation tags action labels for every frame in an input untrimmed video containing multiple actions in a sequence. For the task of temporal action segmentation, we propose an encoder-decoder-style architecture named C2F-TCN featuring a "coarse-to-fine" ensemble of decoder outputs. The C2F-TCN framework is enhanced with a novel model agnostic temporal feature augmentation strategy formed by the computationally inexpensive strategy of the stochastic max-pooling of segments. It produces more accurate and well-calibrated supervised results on three benchmark action segmentation datasets. We show that the architecture is flexible for both supervised and representation learning. In line with this, we present a novel unsupervised way to learn frame-wise representation from C2F-TCN. Our unsupervised learning approach hinges on the clustering capabilities of the input features and the formation of multi-resolution features from the decoder's implicit structure. Further, we provide the first semi-supervised temporal action segmentation results by merging representation learning with conventional supervised learning. Our semi-supervised learning scheme, called ``Iterative-Contrastive-Classify (ICC)'', progressively improves in performance with more labeled data. The ICC semi-supervised learning in C2F-TCN, with 40% labeled videos, performs similar to fully supervised counterparts.
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时间动作定位(TAL)旨在预测未修剪视频(即开始和结束时间)中动作实例的动作类别和时间边界。通常在大多数现有作品中都采用了完全监督的解决方案,并被证明是有效的。这些解决方案中的实际瓶颈之一是所需的大量标记培训数据。为了降低昂贵的人类标签成本,本文着重于很少调查但实用的任务,称为半监督TAL,并提出了一种有效的主动学习方法,名为Al-Stal。我们利用四个步骤来积极选择具有很高信息性的视频样本,并培训本地化模型,名为\ emph {火车,查询,注释,附加}。考虑定位模型的不确定性的两个评分函数配备了ALSTAL,从而促进了视频样本等级和选择。一个人将预测标签分布的熵作为不确定性的度量,称为时间提案熵(TPE)。另一个引入了基于相邻行动建议之间的共同信息的新指标,并评估视频样本的信息性,称为时间上下文不一致(TCI)。为了验证拟议方法的有效性,我们在两个基准数据集Thumos'14和ActivityNet 1.3上进行了广泛的实验。实验结果表明,与完全监督的学习相比,AL-Stal的表现优于现有竞争对手,并实现令人满意的表现。
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医学图像分割是许多临床方法的基本和关键步骤。半监督学习已被广​​泛应用于医学图像分割任务,因为它减轻了收购专家审查的注释的沉重负担,并利用了更容易获得的未标记数据的优势。虽然已被证明是通过实施不同分布下的预测的不变性的一致性学习,但现有方法无法充分利用来自未标记数据的区域级形状约束和边界级距离信息。在本文中,我们提出了一种新颖的不确定性引导的相互一致学习框架,通过将任务中的一致性学习与自组合和交叉任务一致性学习从任务级正则化的最新预测集成了任务内的一致性学习,从而有效地利用了未标记的数据利用几何形状信息。该框架是由模型的估计分割不确定性指导,以便为一致性学习选择相对某些预测,以便有效地利用来自未标记数据的更可靠的信息。我们在两个公开的基准数据集中广泛地验证了我们提出的方法:左心房分割(LA)数据集和大脑肿瘤分割(BRATS)数据集。实验结果表明,我们的方法通过利用未标记的数据和优于现有的半监督分段方法来实现性能增益。
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Surgical phase recognition is a fundamental task in computer-assisted surgery systems. Most existing works are under the supervision of expensive and time-consuming full annotations, which require the surgeons to repeat watching videos to find the precise start and end time for a surgical phase. In this paper, we introduce timestamp supervision for surgical phase recognition to train the models with timestamp annotations, where the surgeons are asked to identify only a single timestamp within the temporal boundary of a phase. This annotation can significantly reduce the manual annotation cost compared to the full annotations. To make full use of such timestamp supervisions, we propose a novel method called uncertainty-aware temporal diffusion (UATD) to generate trustworthy pseudo labels for training. Our proposed UATD is motivated by the property of surgical videos, i.e., the phases are long events consisting of consecutive frames. To be specific, UATD diffuses the single labelled timestamp to its corresponding high confident ( i.e., low uncertainty) neighbour frames in an iterative way. Our study uncovers unique insights of surgical phase recognition with timestamp supervisions: 1) timestamp annotation can reduce 74% annotation time compared with the full annotation, and surgeons tend to annotate those timestamps near the middle of phases; 2) extensive experiments demonstrate that our method can achieve competitive results compared with full supervision methods, while reducing manual annotation cost; 3) less is more in surgical phase recognition, i.e., less but discriminative pseudo labels outperform full but containing ambiguous frames; 4) the proposed UATD can be used as a plug and play method to clean ambiguous labels near boundaries between phases, and improve the performance of the current surgical phase recognition methods.
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从未标记的视频中学习时间通信对于计算机视觉至关重要,并且已经通过各种自我监督的借口来解决。对于自我监督的学习,最近的研究表明,尽管经过培训成本,但使用大型视频数据集。我们提出了一个时空的借口任务来解决培训数据成本问题。该任务由两个步骤组成。首先,我们使用来自未标记的静止图像数据的对比度学习来获得对外观敏感的特征。然后,我们切换到未标记的视频数据,并通过重建帧来学习运动敏感的功能。在第二步中,我们提出了一个全局相关蒸馏损失,以保留第一步中学到的外观灵敏度,以及金字塔结构中的局部相关蒸馏损失以应对时间不连续性。实验结果表明,我们的方法超过了一系列基于对应的任务的最新自我监督方法。进行的消融研究验证了提出的两步任务和损失功能的有效性。
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在这项工作中,我们专注于半监督学习的视频动作检测,该学习既利用标签和未标记的数据。我们提出了一种简单的基于端到端一致性的方法,该方法有效地利用了未标记的数据。视频动作检测需要,行动类预测以及动作的时空定位。因此,我们研究了两种类型的约束,分类一致性和时空的一致性。视频中主要背景和静态区域的存在使得利用时空的一致性进行动作检测使其具有挑战性。为了解决这个问题,我们提出了两个新颖的正规化约束,以实现时空的一致性。 1)时间相干性和2)梯度平滑度。这两个方面都利用视频中的动作的时间连续性,并且被发现有效利用未标记的视频进行动作检测。我们证明了所提出的方法对两个不同的动作检测基准数据集的有效性,即UCF101-24和JHMDB-21。此外,我们还展示了YouTube-VOS上提出的视频对象分割方法的有效性,该方法证明了其概括能力,与最近完全监督的方法相比,提出的方法仅在UCF101-24上仅使用20%的注释来实现竞争性能。在UCF101-24上,与监督方法相比,它分别在0.5 F-MAP和V-MAP时分别提高了 +8.9%和 +11%。
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我们提出了Parse,这是一种新颖的半监督结构,用于学习强大的脑电图表现以进行情感识别。为了减少大量未标记数据与标记数据有限的潜在分布不匹配,Parse使用成对表示对准。首先,我们的模型执行数据增强,然后标签猜测大量原始和增强的未标记数据。然后将其锐化的标签和标记数据的凸组合锐化。最后,进行表示对准和情感分类。为了严格测试我们的模型,我们将解析与我们实施并适应脑电图学习的几种最先进的半监督方法进行了比较。我们对四个基于公共EEG的情绪识别数据集,种子,种子IV,种子V和Amigos(价和唤醒)进行这些实验。该实验表明,我们提出的框架在种子,种子-IV和Amigos(Valence)中的标记样品有限的情况下,取得了总体最佳效果,同时接近种子V和Amigos中的总体最佳结果(达到第二好) (唤醒)。分析表明,我们的成对表示对齐方式通过减少未标记数据和标记数据之间的分布比对来大大提高性能,尤其是当每类仅1个样本被标记时。
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超声心动图参数的准确和一致的预测对于心血管诊断和治疗至关重要。特别是,左心室的分割可用于得出心室体积,射血分数(EF)和其他相关测量值。在本文中,我们提出了一种新的自动化方法,称为地位谱图,用于通过检测解剖关键来预测射血分数和分割左心室。基于图形卷积网络(GCN)的直接坐标回归模型用于检测关键点。 GCN可以学会根据每个关键点的局部外观以及所有关键点的全局空间和时间结构来表示心脏形状。我们在echonet基准数据集上评估了我们的电子位计模型。与语义分割相比,GCN显示出准确的分割和鲁棒性和推理运行时的改进。 EF是同时计算的与分割的,我们的方法还获得了最新的射血分数估计。源代码可在线获得:https://github.com/guybenyosef/echographs。
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时间动作分割对(长)视频序列中的每个帧的动作进行分类。由于框架明智标签的高成本,我们提出了第一种用于时间动作分割的半监督方法。我们对无监督的代表学习铰接,对于时间动作分割,造成独特的挑战。未经目针视频中的操作长度变化,并且具有未知的标签和开始/结束时间。跨视频的行动订购也可能有所不同。我们提出了一种新颖的方式,通过聚类输入特征来学习来自时间卷积网络(TCN)的帧智表示,其中包含增加的时间接近条件和多分辨率相似性。通过与传统的监督学习合并表示学习,我们开发了一个“迭代 - 对比 - 分类(ICC)”半监督学习计划。通过更多标记的数据,ICC逐步提高性能; ICC半监督学习,具有40%标记的视频,执行类似于完全监督的对应物。我们的ICC分别通过{+1.8,+ 5.6,+2.5}%的{+1.8,+ 5.6,+2.5}%分别改善了100%标记的视频。
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我们对最近的自我和半监督ML技术进行严格的评估,从而利用未标记的数据来改善下游任务绩效,以河床分割的三个遥感任务,陆地覆盖映射和洪水映射。这些方法对于遥感任务特别有价值,因为易于访问未标记的图像,并获得地面真理标签通常可以昂贵。当未标记的图像(标记数据集之外)提供培训时,我们量化性能改进可以对这些遥感分割任务进行期望。我们还设计实验以测试这些技术的有效性,当测试集相对于训练和验证集具有域移位时。
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近年来,随着深度神经网络方法的普及,手术计算机视觉领域经历了相当大的突破。但是,用于培训的标准全面监督方法需要大量的带注释的数据,从而实现高昂的成本;特别是在临床领域。已经开始在一般计算机视觉社区中获得吸引力的自我监督学习(SSL)方法代表了对这些注释成本的潜在解决方案,从而使仅从未标记的数据中学习有用的表示形式。尽管如此,SSL方法在更复杂和有影响力的领域(例如医学和手术)中的有效性仍然有限且未开发。在这项工作中,我们通过在手术计算机视觉的背景下研究了四种最先进的SSL方法(Moco V2,Simclr,Dino,SWAV),以解决这一关键需求。我们对这些方法在cholec80数据集上的性能进行了广泛的分析,以在手术环境理解,相位识别和工具存在检测中为两个基本和流行的任务。我们检查了它们的参数化,然后在半监督设置中相对于训练数据数量的行为。如本工作所述和进行的那样,将这些方法的正确转移到手术中,可以使SSL的一般用途获得可观的性能 - 相位识别率高达7%,而在工具存在检测方面,则具有20% - 半监督相位识别方法高达14%。该代码将在https://github.com/camma-public/selfsupsurg上提供。
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手术场景细分对于促使机器人手术的认知援助至关重要。但是,以逐帧方式以像素为单位的注释视频是昂贵且耗时的。为了大大减轻标签负担,在这项工作中,我们从机器人手术视频中研究了半监督的场景细分,这实际上是必不可少的,但以前很少探索。我们考虑在等距采样下的临床上适当的注释情况。然后,我们提出了PGV-CL,这是一种新型的伪标签引导的跨视频对比学习方法,以增强场景分割。它有效地利用了未标记的数据来实现可信赖和全球模型的正则化,从而产生更具歧视性的特征表示。具体来说,对于可信赖的表示学习,我们建议合并伪标签以指导对选择,从而获得更可靠的代表对像素对比度。此外,我们将代表学习空间从以前的图像级扩展到交叉视频,该图像可以捕获全球语义以使学习过程受益。我们广泛评估了公共机器人手术数据集Edovis18和公共白内障数据集Cadis的方法。实验结果证明了我们方法的有效性,在不同的标签比下始终超过了最先进的半监督方法,甚至超过了10.1%标签的destovis18上的全面监督培训。
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自我训练在半监督学习中表现出巨大的潜力。它的核心思想是使用在标记数据上学习的模型来生成未标记样本的伪标签,然后自我教学。为了获得有效的监督,主动尝试通常会采用动量老师进行伪标签的预测,但要观察确认偏见问题,在这种情况下,错误的预测可能会提供错误的监督信号并在培训过程中积累。这种缺点的主要原因是,现行的自我训练框架充当以前的知识指导当前状态,因为老师仅与过去的学生更新。为了减轻这个问题,我们提出了一种新颖的自我训练策略,该策略使模型可以从未来学习。具体而言,在每个培训步骤中,我们都会首先优化学生(即,在不将其应用于模型权重的情况下缓存梯度),然后用虚拟未来的学生更新老师,最后要求老师为伪标记生产伪标签目前的学生作为指导。这样,我们设法提高了伪标签的质量,从而提高了性能。我们还通过深入(FST-D)和广泛(FST-W)窥视未来,开发了我们未来自我训练(FST)框架的两个变体。将无监督的域自适应语义分割和半监督语义分割的任务作为实例,我们在广泛的环境下实验表明了我们方法的有效性和优越性。代码将公开可用。
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