中期图像的染色体分析和鉴定是基于细胞遗传学的医学诊断的关键部分。它主要用于识别遗传疾病和疾病的宪法,产前和获得异常。从中期鉴定染色体的过程是一个乏味的过程,需要训练有素的人员和几个小时才能进行。挑战尤其是在中期图像中处理触摸,重叠和聚集的染色体方面存在挑战,如果未正确进行分割,则会导致错误的分类。我们提出了一种自动化从给定的中期图像的检测和分割过程的方法,并在使用深层CNN体系结构中对其进行分类以了解染色体类型。我们已经使用了两种方法来处理中期中发现的重叠染色体的分离 - 一种涉及流域算法的方法,其次是自动编码器,另一种纯粹基于流域算法的方法。这些方法涉及自动化和非常最小的手动努力来执行分割,从而产生输出。手动努力确保了人类的直觉得到考虑,尤其是在处理触摸,重叠和聚类染色体时。分割后,使用深CNN模型将单个染色体图像分类为95.75 \%精度。此外,我们将分布策略从给定输出(通常可以在正常情况下的46个单个图像组成)中分类为单个类别,准确性为98 \%。我们的研究有助于得出结论,通过图像处理技术可以将参与染色体分割的纯手动努力自动化至非常好的水平,从而产生可靠且令人满意的结果。
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为了产生最大的影响,必须使用基于证据的决策制定公共卫生计划。创建机器学习算法是为了收集,存储,处理和分析数据以提供知识和指导决策。任何监视系统的关键部分是图像分析。截至最近,计算机视觉和机器学习的社区最终对此感到好奇。这项研究使用各种机器学习和图像处理方法来检测和预测疟疾疾病。在我们的研究中,我们发现了深度学习技术作为具有更广泛适用于疟疾检测的智能工具的潜力,通过协助诊断病情,可以使医生受益。我们研究了针对计算机框架和组织的深度学习的共同限制,计算需要准备数据,准备开销,实时执行和解释能力,并发现对这些限制的轴承的未来询问。
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X-ray imaging technology has been used for decades in clinical tasks to reveal the internal condition of different organs, and in recent years, it has become more common in other areas such as industry, security, and geography. The recent development of computer vision and machine learning techniques has also made it easier to automatically process X-ray images and several machine learning-based object (anomaly) detection, classification, and segmentation methods have been recently employed in X-ray image analysis. Due to the high potential of deep learning in related image processing applications, it has been used in most of the studies. This survey reviews the recent research on using computer vision and machine learning for X-ray analysis in industrial production and security applications and covers the applications, techniques, evaluation metrics, datasets, and performance comparison of those techniques on publicly available datasets. We also highlight some drawbacks in the published research and give recommendations for future research in computer vision-based X-ray analysis.
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血液涂片图像的自动化红细胞(RBC)分类有助于血液医生在降低的时间和成本下分析RBC实验室的结果。但是,重叠的单元格可能会导致错误的预测结果,因此必须在分类之前将它们分成多个RBC。为了对具有深度学习进行深度学习的多个类,医学成像中的不平衡问题是常见的,因为正常样本总是高于罕见疾病样本。本文提出了一种新方法,用于从血液涂片图像进行分类和分类RBC,专门用于解决细胞重叠和数据不平衡问题。专注于重叠的细胞分离,我们的分割过程首先估计省略号来代表RBC。该方法检测凹点,然后使用指向椭圆拟合找到椭圆点。 20血涂片图像的精度为0.889。分类需要平衡的培训数据集。但是,一些RBC类型很少见。来自20,875个单独的RBC样本的12个RBC课程的该数据集的不平衡比为34.538。因此,使用机器学习与不平衡数据集的RBC分类是比许多其他应用更具挑战性的。我们分析了处理这个问题的技术。最佳精度和F1分数分别使用带增强的有效网络-B1分别为0.921和0.8679。实验结果表明,通过改善少数群体课程的F1分数,增强的重量平衡技术有可能处理不平衡问题,而数据增强显着提高了整体分类性能。
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组织学图像中核和腺体的实例分割是用于癌症诊断,治疗计划和生存分析的计算病理学工作流程中的重要一步。随着现代硬件的出现,大规模质量公共数据集的最新可用性以及社区组织的宏伟挑战已经看到了自动化方法的激增,重点是特定领域的挑战,这对于技术进步和临床翻译至关重要。在这项调查中,深入分析了过去五年(2017-2022)中发表的原子核和腺体实例细分的126篇论文,进行了深入分析,讨论了当前方法的局限性和公开挑战。此外,提出了潜在的未来研究方向,并总结了最先进方法的贡献。此外,还提供了有关公开可用数据集的概括摘要以及关于说明每种挑战的最佳性能方法的巨大挑战的详细见解。此外,我们旨在使读者现有研究的现状和指针在未来的发展方向上开发可用于临床实践的方法,从而可以改善诊断,分级,预后和癌症的治疗计划。据我们所知,以前没有工作回顾了朝向这一方向的组织学图像中的实例细分。
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Background: Image analysis applications in digital pathology include various methods for segmenting regions of interest. Their identification is one of the most complex steps, and therefore of great interest for the study of robust methods that do not necessarily rely on a machine learning (ML) approach. Method: A fully automatic and optimized segmentation process for different datasets is a prerequisite for classifying and diagnosing Indirect ImmunoFluorescence (IIF) raw data. This study describes a deterministic computational neuroscience approach for identifying cells and nuclei. It is far from the conventional neural network approach, but it is equivalent to their quantitative and qualitative performance, and it is also solid to adversative noise. The method is robust, based on formally correct functions, and does not suffer from tuning on specific data sets. Results: This work demonstrates the robustness of the method against the variability of parameters, such as image size, mode, and signal-to-noise ratio. We validated the method on two datasets (Neuroblastoma and NucleusSegData) using images annotated by independent medical doctors. Conclusions: The definition of deterministic and formally correct methods, from a functional to a structural point of view, guarantees the achievement of optimized and functionally correct results. The excellent performance of our deterministic method (NeuronalAlg) to segment cells and nuclei from fluorescence images was measured with quantitative indicators and compared with those achieved by three published ML approaches.
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肝脏是脊椎动物中最关键的代谢器官之一,由于其在人体中的重要功能,例如废物产物和药物的血液排毒。由于肝肿瘤引起的肝病是全球最常见的死亡率之一。因此,在肿瘤发育的早期阶段检测肝肿瘤是医疗治疗的关键部分。许多成像方式可以用作检测肝肿瘤的帮助工具。计算机断层扫描(CT)是软组织器官(例如肝脏)最常用的成像方式。这是因为它是一种侵入性方式,可以相对迅速捕获。本文提出了一个有效的自动肝分割框架,以使用3D CNN深度元网络模型检测和分割肝脏腹部扫描。许多研究采用了精确分割肝区域,然后使用分割的肝区域作为肿瘤分割方法的输入,因为它降低了由于将腹部器官分割为肿瘤而导致的错误率。所提出的3D CNN DeepMedic模型具有两个输入途径,而不是一个途径,如原始3D CNN模型所示。在本文中,该网络提供了多个腹部CT版本,这有助于提高细分质量。提出的模型分别达到94.36%,94.57%,91.86%和93.14%的精度,灵敏度,特异性和骰子相似性得分。实验结果表明该方法的适用性。
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我们提出了一种新颖的方法,该方法将基于机器学习的交互式图像分割结合在一起,使用Supersoxels与聚类方法结合了用于自动识别大型数据集中类似颜色的图像的聚类方法,从而使分类器的指导重复使用。我们的方法解决了普遍的颜色可变性的问题,并且在生物学和医学图像中通常不可避免,这通常会导致分割恶化和量化精度,从而大大降低了必要的训练工作。效率的这种提高促进了大量图像的量化,从而为高通量成像中的最新技术进步提供了交互式图像分析。所呈现的方法几乎适用于任何图像类型,并代表通常用于图像分析任务的有用工具。
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The correct functioning of photovoltaic (PV) cells is critical to ensuring the optimal performance of a solar plant. Anomaly detection techniques for PV cells can result in significant cost savings in operation and maintenance (O&M). Recent research has focused on deep learning techniques for automatically detecting anomalies in Electroluminescence (EL) images. Automated anomaly annotations can improve current O&M methodologies and help develop decision-making systems to extend the life-cycle of the PV cells and predict failures. This paper addresses the lack of anomaly segmentation annotations in the literature by proposing a combination of state-of-the-art data-driven techniques to create a Golden Standard benchmark. The proposed method stands out for (1) its adaptability to new PV cell types, (2) cost-efficient fine-tuning, and (3) leverage public datasets to generate advanced annotations. The methodology has been validated in the annotation of a widely used dataset, obtaining a reduction of the annotation cost by 60%.
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糖尿病(DM)可导致严重的微脉管破坏,最终导致糖尿病性视网膜病变(DR)或由于糖尿病引起的眼睛并发症。如果不受组织的检查,这种疾病会随着时间的流逝而增加,并最终导致完全视力丧失。检测到这种光学发展的一般方法是通过检查视网膜图像的血管,视神经头,微型毛发,出血,渗出液等。最终,这受到经验丰富的眼科医生和大量DM案例的数量的限制。为了启用早期有效的DR诊断,眼科领域需要强大的计算机辅助诊断(CAD)系统。我们的审查旨在为从学生到成熟的研究人员提供给任何人,他们想了解CAD系统及其算法可以完成的工作,再到建模以及计算机视觉和模式识别中的视网膜图像处理领域的发展方向。对于刚开始的人来说,我们特别强调了不同数据库和算法框架的逻辑,优势和缺点,重点是最近的方法。
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The rapid development of remote sensing technologies have gained significant attention due to their ability to accurately localize, classify, and segment objects from aerial images. These technologies are commonly used in unmanned aerial vehicles (UAVs) equipped with high-resolution cameras or sensors to capture data over large areas. This data is useful for various applications, such as monitoring and inspecting cities, towns, and terrains. In this paper, we presented a method for classifying and segmenting city road traffic dashed lines from aerial images using deep learning models such as U-Net and SegNet. The annotated data is used to train these models, which are then used to classify and segment the aerial image into two classes: dashed lines and non-dashed lines. However, the deep learning model may not be able to identify all dashed lines due to poor painting or occlusion by trees or shadows. To address this issue, we proposed a method to add missed lines to the segmentation output. We also extracted the x and y coordinates of each dashed line from the segmentation output, which can be used by city planners to construct a CAD file for digital visualization of the roads.
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视网膜血管的拓扑和几何分析是早期检测许多常见疾病的成本效益。同时,在泛化能力方面仍然缺乏自动化血管分割和血管树分析。在这项工作中,我们构建了一种新的基准Reta,其中81个标记的船舶掩模,旨在促进视网膜血管分析。提出了一种半自动粗到精细的工作流到注释血管像素。在数据集建设期间,我们通过对自发专用软件进行多级注释和标签歧义来控制注释器间可变性和内部注入者的变化。除了二元血管面罩外,我们还获得了血管标记期间含有动脉/静脉面罩,血管骨骼,分叉,树木和异常的血管注释。标记船面罩的主观和客观质量验证都表现出在其他公共数据集上的显着提高。注释软件也公开可用于船舶注释可视化。用户可以使用我们的数据集开发船只分段算法或评估船只分段性能。此外,我们的数据集可能是跨型号管状结构分割的良好研究来源。
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The International Workshop on Reading Music Systems (WoRMS) is a workshop that tries to connect researchers who develop systems for reading music, such as in the field of Optical Music Recognition, with other researchers and practitioners that could benefit from such systems, like librarians or musicologists. The relevant topics of interest for the workshop include, but are not limited to: Music reading systems; Optical music recognition; Datasets and performance evaluation; Image processing on music scores; Writer identification; Authoring, editing, storing and presentation systems for music scores; Multi-modal systems; Novel input-methods for music to produce written music; Web-based Music Information Retrieval services; Applications and projects; Use-cases related to written music. These are the proceedings of the 3rd International Workshop on Reading Music Systems, held in Alicante on the 23rd of July 2021.
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居住在美国的每个妇女在8次发育侵袭性乳腺癌的可能性下有大约1。有丝分裂细胞计数是评估乳腺癌侵袭性或等级最常见的测试之一。在该预后,必须通过病理学家使用高分辨率显微镜检查组织病理学图像以计算细胞。不幸的是,可以是一种完整的任务,可重复性差,特别是对于非专家来说。最近深入学习网络适用于能够自动定位这些感兴趣区域的医学应用。然而,这些基于区域的网络缺乏利用通常用作唯一检测方法的完整图像CNN产生的分割特征的能力。因此,所提出的方法利用更快的RCNN进行对象检测,同时使用RGB图像特征的UNET产生的分割特征,以实现在Mitos-Atypia 2014分数上的F分数为0.508,计数数据集,优于最先进的攻击方法。
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该卷包含来自机器学习挑战的选定贡献“发现玛雅人的奥秘”,该挑战在欧洲机器学习和数据库中知识发现的欧洲挑战赛曲目(ECML PKDD 2021)中提出。遥感大大加速了古代玛雅人森林地区的传统考古景观调查。典型的探索和发现尝试,除了关注整个古老的城市外,还集中在单个建筑物和结构上。最近,已经成功地尝试了使用机器学习来识别古代玛雅人定居点。这些尝试虽然相关,但却集中在狭窄的区域上,并依靠高质量的空中激光扫描(ALS)数据,该数据仅涵盖古代玛雅人曾经定居的地区的一小部分。另一方面,由欧洲航天局(ESA)哨兵任务制作的卫星图像数据很丰富,更重要的是公开。旨在通过执行不同类型的卫星图像(Sentinel-1和Sentinel-2和ALS)的集成图像细分来定位和识别古老的Maya架构(建筑物,Aguadas和平台)的“发现和识别古代玛雅体系结构(建筑物,Aguadas和平台)的挑战的“发现和识别古老的玛雅体系结构(建筑物,阿吉达斯和平台)的“发现玛雅的奥秘”的挑战, (LIDAR)数据。
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视频分析的图像分割在不同的研究领域起着重要作用,例如智能城市,医疗保健,计算机视觉和地球科学以及遥感应用。在这方面,最近致力于发展新的细分策略;最新的杰出成就之一是Panoptic细分。后者是由语义和实例分割的融合引起的。明确地,目前正在研究Panoptic细分,以帮助获得更多对视频监控,人群计数,自主驾驶,医学图像分析的图像场景的更细致的知识,以及一般对场景更深入的了解。为此,我们介绍了本文的首次全面审查现有的Panoptic分段方法,以获得作者的知识。因此,基于所采用的算法,应用场景和主要目标的性质,执行现有的Panoptic技术的明确定义分类。此外,讨论了使用伪标签注释新数据集的Panoptic分割。继续前进,进行消融研究,以了解不同观点的Panoptic方法。此外,讨论了适合于Panoptic分割的评估度量,并提供了现有解决方案性能的比较,以告知最先进的并识别其局限性和优势。最后,目前对主题技术面临的挑战和吸引不久的将来吸引相当兴趣的未来趋势,可以成为即将到来的研究研究的起点。提供代码的文件可用于:https://github.com/elharroussomar/awesome-panoptic-egation
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在本文中,使用聚类和阈值算法实现了DIBA数据集细菌属和物种的半自动注释。深度学习模型经过训练,以实现细菌物种的语义分割和分类。分类精度达到95%。深度学习模型在生物医学图像处理中发现了巨大的应用。从革兰氏阴性微观图像中自动分割细菌对于诊断呼吸道和尿路感染,检测癌症等至关重要。深度学习将有助于生物学家在更少的时间内获得可靠的结果。此外,可以减少许多人类干预措施。这项工作可能有助于检测尿液涂片图像,痰液涂片图像等的细菌,以诊断尿路感染,结核病,肺炎等。
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由于图像的复杂性和活细胞的时间变化,来自明亮场光显微镜图像的活细胞分割具有挑战性。最近开发的基于深度学习(DL)的方法由于其成功和有希望的结果而在医学和显微镜图像分割任务中变得流行。本文的主要目的是开发一种基于U-NET的深度学习方法,以在明亮场传输光学显微镜中分割HeLa系的活细胞。为了找到适合我们数据集的最合适的体系结构,提出了剩余的注意U-net,并将其与注意力和简单的U-NET体系结构进行了比较。注意机制突出了显着的特征,并抑制了无关图像区域中的激活。残余机制克服了消失的梯度问题。对于简单,注意力和剩余的关注U-NET,我们数据集的平均值得分分别达到0.9505、0.9524和0.9530。通过将残留和注意机制应用在一起,在平均值和骰子指标中实现了最准确的语义分割结果。应用的分水岭方法适用于这种最佳的(残留的关注)语义分割结果,使每个单元格的特定信息进行了分割。
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随着深度学习方法的进步,如深度卷积神经网络,残余神经网络,对抗网络的进步。 U-Net架构最广泛利用生物医学图像分割,以解决目标区域或子区域的识别和检测的自动化。在最近的研究中,基于U-Net的方法在不同应用中显示了最先进的性能,以便在脑肿瘤,肺癌,阿尔茨海默,乳腺癌等疾病的早期诊断和治疗中发育计算机辅助诊断系统等,使用各种方式。本文通过描述U-Net框架来提出这些方法的成功,然后通过执行1)型号的U-Net变体进行综合分析,2)模特内分类,建立更好的见解相关的挑战和解决方案。此外,本文还强调了基于U-Net框架在持续的大流行病,严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-COV-2)中的贡献也称为Covid-19。最后,分析了这些U-Net变体的优点和相似性以及生物医学图像分割所涉及的挑战,以发现该领域的未来未来的研究方向。
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机器学习和计算机视觉技术近年来由于其自动化,适合性和产生惊人结果的能力而迅速发展。因此,在本文中,我们调查了2014年至2022年之间发表的关键研究,展示了不同的机器学习算法研究人员用来分割肝脏,肝肿瘤和肝脉管结构的研究。我们根据感兴趣的组织(肝果,肝肿瘤或肝毒剂)对被调查的研究进行了划分,强调了同时解决多个任务的研究。此外,机器学习算法被归类为受监督或无监督的,如果属于某个方案的工作量很大,则将进一步分区。此外,对文献和包含上述组织面具的网站发现的不同数据集和挑战进行了彻底讨论,强调了组织者的原始贡献和其他研究人员的贡献。同样,在我们的评论中提到了文献中过度使用的指标,这强调了它们与手头的任务的相关性。最后,强调创新研究人员应对需要解决的差距的关键挑战和未来的方向,例如许多关于船舶分割挑战的研究的稀缺性以及为什么需要早日处理他们的缺席。
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