深度学习和计算机视觉的最新进展减轻了许多瓶颈，从而使算法无标记，并且性能更好。具体而言，变形金刚提供了图像的全球视角，该图像卷积神经网络（CNN）缺乏设计。在这里，我们介绍了跨体系结构自学，这是一种新颖的自我监督学习方法，同时利用了变形金刚和CNN，同时也可以通过易于可用的云服务在计算上访问。与现有的最先进的自我监督学习方法相比，我们从经验上显示了经过CASS训练的CNN，而Transformers则使用100％标记的数据，平均获得8.5％，具有10％标记的数据，为11.5％，1.5％，1百分比在三个不同数据集中标记的数据。值得注意的是，一个被使用的数据集包括自身免疫性疾病的组织病理学幻灯片，这是医学成像中代表性不足的主题，并且数据最少。此外，我们的发现表明，就训练时间而言，CASS的效率是其他最先进方法的两倍。

通常用于诊断和研究目的的组织病理学图像中炎症细胞结构的当前研究排除了许多有关活检幻灯片的信息。在自身免疫性疾病中，关于哪种细胞类型参与组织水平的炎症以及它们如何相互作用，仍然存在重大的研究问题。尽管可以使用传统方法来部分回答这些问题，但人工智能方法进行分割和分类提供了一种更有效的方法来了解自身免疫性疾病中炎症的结构，并对新颖见解保持着巨大的希望。在本文中，我们从经验上开发了使用人类组织的皮肌炎活检来检测和鉴定炎症细胞的深度学习方法。我们的方法将分类绩效提高了26％，细分性能提高了5％。我们还提出了一种新颖的后处理自动编码器体系结构，可将细分性能额外提高3％。我们已经在https://github.com/pranavsinghps1/dedl开源了我们的方法和架构

变形金刚占据了自然语言处理领域，最近影响了计算机视觉区域。在医学图像分析领域中，变压器也已成功应用于全栈临床应用，包括图像合成/重建，注册，分割，检测和诊断。我们的论文旨在促进变压器在医学图像分析领域的认识和应用。具体而言，我们首先概述了内置在变压器和其他基本组件中的注意机制的核心概念。其次，我们回顾了针对医疗图像应用程序量身定制的各种变压器体系结构，并讨论其局限性。在这篇综述中，我们调查了围绕在不同学习范式中使用变压器，提高模型效率及其与其他技术的耦合的关键挑战。我们希望这篇评论可以为读者提供医学图像分析领域的读者的全面图片。

We introduce Bootstrap Your Own Latent (BYOL), a new approach to self-supervised image representation learning. BYOL relies on two neural networks, referred to as online and target networks, that interact and learn from each other. From an augmented view of an image, we train the online network to predict the target network representation of the same image under a different augmented view. At the same time, we update the target network with a slow-moving average of the online network. While state-of-the art methods rely on negative pairs, BYOL achieves a new state of the art without them. BYOL reaches 74.3% top-1 classification accuracy on ImageNet using a linear evaluation with a ResNet-50 architecture and 79.6% with a larger ResNet. We show that BYOL performs on par or better than the current state of the art on both transfer and semi-supervised benchmarks. Our implementation and pretrained models are given on GitHub. 3 * Equal contribution; the order of first authors was randomly selected.

在过去几年中，无监督的学习取得了很大的进展，特别是通过对比的自我监督学习。用于基准测试自我监督学习的主导数据集已经想象，最近的方法正在接近通过完全监督培训实现的性能。然而，ImageNet DataSet在很大程度上是以对象为中心的，并且目前尚不清楚这些方法的广泛不同的数据集和任务，这些方法是非以对象为中心的，例如数字病理学。虽然自我监督的学习已经开始在这个领域探讨了令人鼓舞的结果，但有理由看起来更接近这个环境与自然图像和想象成的不同。在本文中，我们对组织病理学进行了对比学学习的深入分析，引脚指向对比物镜的表现如何不同，由于组织病理学数据的特征。我们提出了一些考虑因素，例如对比目标和超参数调整的观点。在大量的实验中，我们分析了组织分类的下游性能如何受到这些考虑因素的影响。结果指出了对比学习如何减少数字病理中的注释工作，但需要考虑特定的数据集特征。为了充分利用对比学习目标，需要不同的视野和超参数校准。我们的结果为实现组织病理学应用的自我监督学习的全部潜力铺平了道路。

While the Transformer architecture has become the de-facto standard for natural language processing tasks, its applications to computer vision remain limited. In vision, attention is either applied in conjunction with convolutional networks, or used to replace certain components of convolutional networks while keeping their overall structure in place. We show that this reliance on CNNs is not necessary and a pure transformer applied directly to sequences of image patches can perform very well on image classification tasks. When pre-trained on large amounts of data and transferred to multiple mid-sized or small image recognition benchmarks (ImageNet, CIFAR-100, VTAB, etc.), Vision Transformer (ViT) attains excellent results compared to state-of-the-art convolutional networks while requiring substantially fewer computational resources to train. 1

本文研究了两种技术，用于开发有效的自我监督视觉变压器（ESVIT）进行视觉表示学习。首先，我们通过一项全面的实证研究表明，具有稀疏自我生产的多阶段体系结构可以显着降低建模的复杂性，但具有失去捕获图像区域之间细粒度对应关系的能力的成本。其次，我们提出了一项新的区域匹配训练任务，该任务使模型可以捕获细粒的区域依赖性，因此显着提高了学习视觉表示的质量。我们的结果表明，ESVIT在ImageNet线性探针评估上结合两种技术，在ImageNet线性探针评估中获得了81.3％的TOP-1，优于先前的艺术，其较高吞吐量的顺序幅度约为较高。当转移到下游线性分类任务时，ESVIT在18个数据集中的17个中优于其受监督的对方。代码和模型可公开可用：https：//github.com/microsoft/esvit

监督学习可以学习大型代表性空间，这对于处理困难的学习任务至关重要。然而，由于模型的设计，经典图像分类方法争取在处理小型数据集时概括为新的问题和新情况。事实上，监督学习可能失去图像特征的位置，这导致在非常深刻的架构中的监督崩溃。在本文中，我们调查了如何有效地对未标记数据的强大和充分增强的自我监督，可以有效地培训神经网络的第一层，甚至比监督学习更好，无需数百万标记的数据。主要目标是通过获取通用任务 - 不可知的低级功能来断开像素数据与注释的连接。此外，我们调查视觉变形金刚（VIV）并表明，从自我监督架构中得出的低级功能可以提高这种紧急架构的鲁棒性和整体性能。我们在最小的开源数据集STL-​​10上评估了我们的方法，当从自我监督的学习架构输入到vit而不是原始时，我们获得了从41.66％的显着提升到83.25％。图片。

胸部射线照相是一种相对便宜，广泛的医疗程序，可传达用于进行诊断决策的关键信息。胸部X射线几乎总是用于诊断呼吸系统疾病，如肺炎或最近的Covid-19。在本文中，我们提出了一个自我监督的深神经网络，其在未标记的胸部X射线数据集上掠夺。学习的陈述转移到下游任务 - 呼吸系统疾病的分类。在四个公共数据集获得的结果表明，我们的方法在不需要大量标记的培训数据的情况下产生竞争力。

高质量注释的医学成像数据集的稀缺性是一个主要问题，它与医学成像分析领域的机器学习应用相撞并阻碍了其进步。自我监督学习是一种最近的培训范式，可以使学习强大的表示无需人类注释，这可以被视为有效的解决方案，以解决带注释的医学数据的稀缺性。本文回顾了自我监督学习方法的最新研究方向，用于图像数据，并将其专注于其在医学成像分析领域的应用。本文涵盖了从计算机视野领域的最新自我监督学习方法，因为它们适用于医学成像分析，并将其归类为预测性，生成性和对比性方法。此外，该文章涵盖了40个在医学成像分析中自学学习领域的最新研究论文，旨在阐明该领域的最新创新。最后，本文以该领域的未来研究指示结束。

Computational pathology can lead to saving human lives, but models are annotation hungry and pathology images are notoriously expensive to annotate. Self-supervised learning has shown to be an effective method for utilizing unlabeled data, and its application to pathology could greatly benefit its downstream tasks. Yet, there are no principled studies that compare SSL methods and discuss how to adapt them for pathology. To address this need, we execute the largest-scale study of SSL pre-training on pathology image data, to date. Our study is conducted using 4 representative SSL methods on diverse downstream tasks. We establish that large-scale domain-aligned pre-training in pathology consistently out-performs ImageNet pre-training in standard SSL settings such as linear and fine-tuning evaluations, as well as in low-label regimes. Moreover, we propose a set of domain-specific techniques that we experimentally show leads to a performance boost. Lastly, for the first time, we apply SSL to the challenging task of nuclei instance segmentation and show large and consistent performance improvements under diverse settings.

建立具有可信赖性的AI模型非常重要，尤其是在医疗保健等受监管的地区。在解决Covid-19时，以前的工作将卷积神经网络用作骨干建筑，该骨干建筑物易于过度宣告和过度自信做出决策，使它们不那么值得信赖 - 在医学成像背景下的关键缺陷。在这项研究中，我们提出了一种使用视觉变压器的功能学习方法，该方法使用基于注意力的机制，并检查变形金刚作为医学成像的新骨干结构的表示能力。通过对COVID-19胸部X光片进行分类的任务，我们研究了概括能力是否仅从视觉变形金刚的建筑进步中受益。通过使用“信任评分”计算和视觉解释性技术，对模型的可信度进行了定量和定性评估。我们得出的结论是，基于注意力的特征学习方法在建立可信赖的医疗保健深度学习模型方面有希望。

早期发现视网膜疾病是预防患者部分或永久失明的最重要手段之一。在这项研究中，提出了一种新型的多标签分类系统，用于使用从各种来源收集的眼底图像来检测多种视网膜疾病。首先，使用许多公开可用的数据集来构建一个新的多标签视网膜疾病数据集，即梅里德数据集。接下来，应用了一系列后处理步骤，以确保图像数据的质量和数据集中存在的疾病范围。在眼底多标签疾病分类中，首次通过大量实验优化的基于变压器的模型用于图像分析和决策。进行了许多实验以优化所提出的系统的配置。结果表明，在疾病检测和疾病分类方面，该方法的性能比在同一任务上的最先进作品要好7.9％和8.1％。获得的结果进一步支持了基于变压器的架构在医学成像领域的潜在应用。

准确的术中诊断对于在脑肿瘤手术期间提供安全有效的护理至关重要。我们的护理标准诊断方法是时间，资源和劳动密集型，限制了获得最佳手术治疗的机会。为了解决这些局限性，我们提出了一种替代工作流程，该工作流程结合了刺激的拉曼组织学（SRH），一种快速的光学成像方法，以及对SRH图像的深层自动解释，用于术中脑肿瘤诊断和实时手术决策支持。在这里，我们介绍了OpenSRH，这是来自300多名脑肿瘤患者和1300多个独特全幻灯片光学图像的第一个公共数据集。 OPENSRH包含来自最常见的脑肿瘤诊断，完整的病理注释，整个幻灯片肿瘤分割，原始和加工的光学成像数据的数据，用于端到端模型的开发和验证。我们为使用弱（即患者级）诊断标签的基于补丁的整个幻灯片分类和推断提供了一个框架。最后，我们基准了两项计算机视觉任务：多类组织学脑肿瘤分类和基于斑块的对比表示学习。我们希望OpenSRH能够促进快速光学成像和基于ML的手术决策支持的临床翻译，以提高精密医学时代的癌症手术的获取，安全性和功效。数据集访问，代码和基准可在opensrh.mlins.org上找到。

尽管最近通过剩余网络的代表学习中的自我监督方法取得了进展，但它们仍然对ImageNet分类基准进行了高度的监督学习，限制了它们在性能关键设置中的适用性。在MITROVIC等人的现有理论上洞察中建立2021年，我们提出了RELICV2，其结合了明确的不变性损失，在各种适当构造的数据视图上具有对比的目标。 Relicv2在ImageNet上实现了77.1％的前1个分类准确性，使用线性评估使用Reset50架构和80.6％，具有较大的Reset型号，优于宽边缘以前的最先进的自我监督方法。最值得注意的是，RelicV2是使用一系列标准Reset架构始终如一地始终优先于类似的对比较中的监督基线的第一个表示学习方法。最后，我们表明，尽管使用Reset编码器，Relicv2可与最先进的自我监控视觉变压器相媲美。

随着变压器作为语言处理的标准及其在计算机视觉方面的进步，参数大小和培训数据的数量相应地增长。许多人开始相信，因此，变形金刚不适合少量数据。这种趋势引起了人们的关注，例如：某些科学领域中数据的可用性有限，并且排除了该领域研究资源有限的人。在本文中，我们旨在通过引入紧凑型变压器来提出一种小规模学习的方法。我们首次表明，具有正确的尺寸，卷积令牌化，变压器可以避免在小数据集上过度拟合和优于最先进的CNN。我们的模型在模型大小方面具有灵活性，并且在获得竞争成果的同时，参数可能仅为0.28亿。当在CIFAR-10上训练Cifar-10，只有370万参数训练时，我们的最佳模型可以达到98％的准确性，这是与以前的基于变形金刚的模型相比，数据效率的显着提高，比其他变压器小于10倍，并且是15％的大小。在实现类似性能的同时，重新NET50。 CCT还表现优于许多基于CNN的现代方法，甚至超过一些基于NAS的方法。此外，我们在Flowers-102上获得了新的SOTA，具有99.76％的TOP-1准确性，并改善了Imagenet上现有基线（82.71％精度，具有29％的VIT参数）以及NLP任务。我们针对变压器的简单而紧凑的设计使它们更可行，可以为那些计算资源和/或处理小型数据集的人学习，同时扩展了在数据高效变压器中的现有研究工作。我们的代码和预培训模型可在https://github.com/shi-labs/compact-transformers上公开获得。

Quantifying the perceptual similarity of two images is a long-standing problem in low-level computer vision. The natural image domain commonly relies on supervised learning, e.g., a pre-trained VGG, to obtain a latent representation. However, due to domain shift, pre-trained models from the natural image domain might not apply to other image domains, such as medical imaging. Notably, in medical imaging, evaluating the perceptual similarity is exclusively performed by specialists trained extensively in diverse medical fields. Thus, medical imaging remains devoid of task-specific, objective perceptual measures. This work answers the question: Is it necessary to rely on supervised learning to obtain an effective representation that could measure perceptual similarity, or is self-supervision sufficient? To understand whether recent contrastive self-supervised representation (CSR) may come to the rescue, we start with natural images and systematically evaluate CSR as a metric across numerous contemporary architectures and tasks and compare them with existing methods. We find that in the natural image domain, CSR behaves on par with the supervised one on several perceptual tests as a metric, and in the medical domain, CSR better quantifies perceptual similarity concerning the experts' ratings. We also demonstrate that CSR can significantly improve image quality in two image synthesis tasks. Finally, our extensive results suggest that perceptuality is an emergent property of CSR, which can be adapted to many image domains without requiring annotations.

作为新一代神经体系结构的变形金刚在自然语言处理和计算机视觉方面表现出色。但是，现有的视觉变形金刚努力使用有限的医学数据学习，并且无法概括各种医学图像任务。为了应对这些挑战，我们将Medformer作为数据量表变压器呈现为可推广的医学图像分割。关键设计结合了理想的电感偏差，线性复杂性的层次建模以及以空间和语义全局方式以线性复杂性的关注以及多尺度特征融合。 Medformer可以在不预训练的情况下学习微小至大规模的数据。广泛的实验表明，Medformer作为一般分割主链的潜力，在三个具有多种模式（例如CT和MRI）和多样化的医学靶标（例如，健康器官，疾病，疾病组织和肿瘤）的三个公共数据集上优于CNN和视觉变压器。我们将模型和评估管道公开可用，为促进广泛的下游临床应用提供固体基线和无偏比较。

最近，蒙面图像建模（MIM）由于其能力从大量未标记的数据中学习而引起了人们的关注，并且已被证明对涉及自然图像的各种视觉任务有效。同时，由于未标记的图像的数量高，预计3D医学图像中的自我监督学习的潜力预计将是巨大的，以及质量标签的费用和困难。但是，MIM对医学图像的适用性仍然不确定。在本文中，我们证明了掩盖的图像建模方法还可以推进3D医学图像分析，除了自然图像。我们研究掩盖图像建模策略如何从3D医学图像分割的角度利用性能作为代表性的下游任务：i）与天真的对比度学习相比，蒙版的图像建模方法可以加快监督培训的收敛性，甚至更快（1.40美元$ \ times $ \ times $ $ $ ）并最终产生更高的骰子分数； ii）预测具有较高掩盖比和相对较小的贴片大小的原始体素值是用于医学图像建模的非平凡的自我监督借口任务； iii）重建的轻质解码器或投影头设计对于3D医学图像上的掩盖图像建模非常有力，该图像加快了训练并降低成本； iv）最后，我们还研究了在不同的实际情况下使用不同图像分辨率和标记的数据比率的MIM方法的有效性。