计算机断层扫描(CT)成像对于诊断各种疾病可能非常实用。但是,CT图像的性质更加多样化,因为CT扫描的分辨率和数量由机器及其设置确定。传统的深度学习模型很难挠痒痒,因为深神经网络的基本要求是输入数据的一致形状。在本文中,我们提出了一种新颖,有效的两步方法,以彻底解决Covid-19症状分类的问题。首先,通过常规骨干网络提取CT扫描的每个切片的语义特征嵌入。然后,我们提出了长期的短期记忆(LSTM)和基于变压器的子网络来处理时间特征学习,从而导致时空特征表示学习。以这种方式,拟议的两步LSTM模型可以防止过度拟合,并提高性能。全面的实验表明,提出的两步方法不仅显示出出色的性能,而且可以互相补偿。更具体地说,两步LSTM模型的假阴性速率较低,而2步SWIN模型的假阳性速率较低。总而言之,建议模型合奏可以在现实世界应用中采用更稳定和有希望的性能。
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在过去的两年中,世界遭受了COVID-19(SARS-COV-2)的困扰,造成了人们的日常生活损失和变化。因此,使用深度学习对胸部计算机断层扫描(CT)扫描进行了深入学习的自动检测变得很有希望,这有助于有效纠正诊断。最近,提出了基于变压器的COVID-19检测方法,以利用CT体积中的3D信息。但是,其选择切片的采样方法并不是最佳的。为了利用CT体积中的丰富3D信息,我们使用新型的数据策展和适应性采样方法提出了基于变压器的COVID-19检测,并使用灰度级别同时出现矩阵(GLCM)。为了训练由CNN层组成的模型,然后是变压器体系结构,我们首先基于肺部分割执行数据策划,并利用CT卷中每个切片的GLCM值的熵来为预测选择重要切片。实验结果表明,所提出的方法以较大的边缘改善了检测性能,而没有对模型进行太多修改。
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随着Covid-19的爆发,近年来已经出现了大量相关研究。我们提出了一个基于肺CT扫描图像的自动COVID-19诊断框架,即PVT-COV19D。为了适应图像输入的不同维度,我们首先使用变压器模型对图像进行了分类,然后根据正常分布对数据集中进行采样,并将采样结果馈送到修改的PVTV2模型中以进行训练。COV19-CT-DB数据集上的大量实验证明了该方法的有效性。
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医学图像预处理中最有争议的研究领域之一是3D CT扫描。随着Covid-19的快速扩散,CT扫描在正确,迅速诊断疾病的功能变得至关重要。它对预防感染有积极影响。通过CT-Scan图像诊断疾病有许多任务,包括Covid-19。在本文中,我们提出了一种使用堆叠深神经网络的方法,通过一系列3D CT扫描图像来检测COVID 19。在我们的方法中,我们使用两个骨架进行实验是Densenet 121和Resnet101。此方法在某些评估指标上实现了竞争性能
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本文提出了一种用于图像分类的卷积神经网络(CNN)模型,旨在提高Covid-19诊断的预测性能,同时避免更深,因此更复杂的替代方案。所提出的模型包括四个类似的卷积层,然后是扁平化和两个致密层。这项工作提出了一种基于仅通过2D CNN模型的像素的图像的简单分类2D CT扫描片图像的较差的解决方案。尽管架构中的简单性,所提出的模型在宏F1分数方面,所提出的模型显示出超过最先进的图像上的定量结果超过了相同数据集。在这种情况下,从图像中提取特征,图像的分割部分,或其他更复杂的技术,最终瞄准图像分类,不会产生更好的结果。由此,本文介绍了一个简单而强大的深度学习的自动化Covid-19分类解决方案。
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本文介绍了有组织的第二次共同19号比赛的基线方法,该方法发生在欧洲计算机视觉会议(ECCV 2022)的Aimia研讨会框架内。它提出了COV19-CT-DB数据库,该数据库为COVID-19 DENCTICT注释,由约7,700 3-D CT扫描组成。通过四个COVID-19严重性条件,进一步注释了由COVID-19案例组成的数据库的一部分。我们已经在培训,验证和测试数据集中划分了数据库和后期。前两个数据集用于培训和验证机器学习模型,而后者将用于评估开发模型。基线方法由基于CNN-RNN网络的深度学习方法组成,并报告其在COVID19-CT-DB数据库上的性能。
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自2019年底Covid-19出现以来,Covid-19已成为人工智能(AI)社区的积极研究主题。最有趣的AI主题之一是COVID-19对医学成像的分析。 CT扫描成像是有关该疾病的最有用的工具。这项工作是第二次COV19D竞赛的一部分,在其中设定了两个挑战:COVID-19检测和COVID-19的严重性检测。对于从CT扫描的COVID-19检测,我们提出了具有Densenet-161模型的2D卷积块的集合。在这里,每个具有Densenet-161体系结构的2D卷积块是分别训练的,在测试阶段,集合模型基于其概率的平均值。另一方面,我们提出了一个卷积层的集合,该集合具有用于COVID-19的严重程度检测的成立模型。除了卷积层外,还使用了三个成立变体,即Inception-V3,Inception-V4和Inception-Resnet。我们提出的方法在第二COV19D竞赛的验证数据中的表现优于基线方法,分别为COVID-19检测和COVID-19的严重性检测分别为11%和16%。
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This paper presents our solution for the 2nd COVID-19 Severity Detection Competition. This task aims to distinguish the Mild, Moderate, Severe, and Critical grades in COVID-19 chest CT images. In our approach, we devise a novel infection-aware 3D Contrastive Mixup Classification network for severity grading. Specifcally, we train two segmentation networks to first extract the lung region and then the inner lesion region. The lesion segmentation mask serves as complementary information for the original CT slices. To relieve the issue of imbalanced data distribution, we further improve the advanced Contrastive Mixup Classification network by weighted cross-entropy loss. On the COVID-19 severity detection leaderboard, our approach won the first place with a Macro F1 Score of 51.76%. It significantly outperforms the baseline method by over 11.46%.
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这项研究中我们的主要目标是提出一种基于转移学习的方法,用于从计算机断层扫描(CT)图像中检测。用于任务的转移学习模型是验证的X受感受模型。使用了模型结构和ImageNet上的预训练权重。通过128批量的大小和224x224、3个通道输入图像训练所得的修改模型,并从原始512x512,灰度图像转换。使用的数据集是A COV19-CT-DB。数据集中的标签包括1919年COVID-1919检测的COVID-19病例和非旋转19例。首先,使用数据集的验证分区以及精确召回和宏F1分数的准确性和损失来衡量所提出方法的性能。验证集中的最终宏F1得分超过了基线模型。
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2019年12月,一个名为Covid-19的新型病毒导致了迄今为止的巨大因果关系。与新的冠状病毒的战斗在西班牙语流感后令人振奋和恐怖。虽然前线医生和医学研究人员在控制高度典型病毒的传播方面取得了重大进展,但技术也证明了在战斗中的重要性。此外,许多医疗应用中已采用人工智能,以诊断许多疾病,甚至陷入困境的经验丰富的医生。因此,本调查纸探讨了提议的方法,可以提前援助医生和研究人员,廉价的疾病诊断方法。大多数发展中国家难以使用传统方式进行测试,但机器和深度学习可以采用显着的方式。另一方面,对不同类型的医学图像的访问已经激励了研究人员。结果,提出了一种庞大的技术数量。本文首先详细调了人工智能域中传统方法的背景知识。在此之后,我们会收集常用的数据集及其用例日期。此外,我们还显示了采用深入学习的机器学习的研究人员的百分比。因此,我们对这种情况进行了彻底的分析。最后,在研究挑战中,我们详细阐述了Covid-19研究中面临的问题,我们解决了我们的理解,以建立一个明亮健康的环境。
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本文介绍了我们针对第二届COVID-19比赛的解决方案,该竞赛是在欧洲计算机视觉会议(ECCV 2022)的Aimia研讨会框架内举行的。在我们的方法中,我们采用有效的3D对比度混合分类网络,用于在胸部CT图像上进行COVID-19诊断,该图像由对比度表示学习和混合分类组成。对于COVID-19检测挑战,我们的方法在484验证CT扫描中达到0.9245宏F1得分,这显着优于基线方法的16.5%。在COVID-19的严重性检测挑战中,我们的方法在61个验证样本上达到0.7186宏F1得分,这也超过了基线8.86%。
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Computer tomography (CT) have been routinely used for the diagnosis of lung diseases and recently, during the pandemic, for detecting the infectivity and severity of COVID-19 disease. One of the major concerns in using ma-chine learning (ML) approaches for automatic processing of CT scan images in clinical setting is that these methods are trained on limited and biased sub-sets of publicly available COVID-19 data. This has raised concerns regarding the generalizability of these models on external datasets, not seen by the model during training. To address some of these issues, in this work CT scan images from confirmed COVID-19 data obtained from one of the largest public repositories, COVIDx CT 2A were used for training and internal vali-dation of machine learning models. For the external validation we generated Indian-COVID-19 CT dataset, an open-source repository containing 3D CT volumes and 12096 chest CT images from 288 COVID-19 patients from In-dia. Comparative performance evaluation of four state-of-the-art machine learning models, viz., a lightweight convolutional neural network (CNN), and three other CNN based deep learning (DL) models such as VGG-16, ResNet-50 and Inception-v3 in classifying CT images into three classes, viz., normal, non-covid pneumonia, and COVID-19 is carried out on these two datasets. Our analysis showed that the performance of all the models is comparable on the hold-out COVIDx CT 2A test set with 90% - 99% accuracies (96% for CNN), while on the external Indian-COVID-19 CT dataset a drop in the performance is observed for all the models (8% - 19%). The traditional ma-chine learning model, CNN performed the best on the external dataset (accu-racy 88%) in comparison to the deep learning models, indicating that a light-weight CNN is better generalizable on unseen data. The data and code are made available at https://github.com/aleesuss/c19.
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我们为Covid-19的快速准确CT(DL-FACT)测试提供了一系列深度学习的计算框架。我们开发了基于CT的DL框架,通过基于DL的CT图像增强和分类来提高Covid-19(加上其变体)的测试速度和准确性。图像增强网络适用于DDNet,短暂的Dennet和基于Deconvolulate的网络。为了展示其速度和准确性,我们在Covid-19 CT图像的几个来源中评估了DL-FARE。我们的结果表明,DL-FACT可以显着缩短几天到几天的周转时间,并提高Covid-19测试精度高达91%。DL-FACT可以用作诊断和监测Covid-19的医学专业人员的软件工具。
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世界目前正在经历持续的传染病大流行病,该传染病是冠状病毒疾病2019(即covid-19),这是由严重的急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-COV-2)引起的。计算机断层扫描(CT)在评估感染的严重程度方面发挥着重要作用,并且还可用于识别这些症状和无症状的Covid-19载体。随着Covid-19患者的累积数量的激增,放射科医师越来越强调手动检查CT扫描。因此,自动化3D CT扫描识别工具的需求量高,因为手动分析对放射科医师耗时,并且它们的疲劳可能导致可能的误判。然而,由于位于不同医院的CT扫描仪的各种技术规范,CT图像的外观可能显着不同,导致许多自动图像识别方法的失败。因此,多域和多扫描仪研究的多域移位问题是不可能对可靠识别和可再现和客观诊断和预后至关重要的至关重要。在本文中,我们提出了Covid-19 CT扫描识别模型即Coronavirus信息融合和诊断网络(CIFD-NET),可以通过新的强大弱监督的学习范式有效地处理多域移位问题。与其他最先进的方法相比,我们的模型可以可靠,高效地解决CT扫描图像中不同外观的问题。
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Lung cancer is a severe menace to human health, due to which millions of people die because of late diagnoses of cancer; thus, it is vital to detect the disease as early as possible. The Computerized chest analysis Tomography of scan is assumed to be one of the efficient solutions for detecting and classifying lung nodules. The necessity of high accuracy of analyzing C.T. scan images of the lung is considered as one of the crucial challenges in detecting and classifying lung cancer. A new long-short-term-memory (LSTM) based deep fusion structure, is introduced, where, the texture features computed from lung nodules through new volumetric grey-level-co-occurrence-matrices (GLCM) computations are applied to classify the nodules into: benign, malignant and ambiguous. An improved Otsu segmentation method combined with the water strider optimization algorithm (WSA) is proposed to detect the lung nodules. Otsu-WSA thresholding can overcome the restrictions present in previous thresholding methods. Extended experiments are run to assess this fusion structure by considering 2D-GLCM computations based 2D-slices fusion, and an approximation of this 3D-GLCM with volumetric 2.5D-GLCM computations-based LSTM fusion structure. The proposed methods are trained and assessed through the LIDC-IDRI dataset, where 94.4%, 91.6%, and 95.8% Accuracy, sensitivity, and specificity are obtained, respectively for 2D-GLCM fusion and 97.33%, 96%, and 98%, accuracy, sensitivity, and specificity, respectively, for 2.5D-GLCM fusion. The yield of the same are 98.7%, 98%, and 99%, for the 3D-GLCM fusion. The obtained results and analysis indicate that the WSA-Otsu method requires less execution time and yields a more accurate thresholding process. It is found that 3D-GLCM based LSTM outperforms its counterparts.
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一种名为Covid-19的新发现的冠状病毒疾病主要影响人类呼吸系统。 Covid-19是一种由起源于中国武汉的病毒引起的传染病。早期诊断是医疗保健提供者的主要挑战。在较早的阶段,医疗机构令人眼花azz乱,因为没有适当的健康辅助工具或医学可以检测到COVID-19。引入了一种新的诊断工具RT-PCR(逆转录聚合酶链反应)。它从患者的鼻子或喉咙中收集拭子标本,在那里共有19个病毒。该方法有一些与准确性和测试时间有关的局限性。医学专家建议一种称为CT(计算机断层扫描)的替代方法,该方法可以快速诊断受感染的肺部区域并在早期阶段识别Covid-19。使用胸部CT图像,计算机研究人员开发了几种识别Covid-19疾病的深度学习模型。这项研究介绍了卷积神经网络(CNN)和基于VGG16的模型,用于自动化的COVID-19在胸部CT图像上识别。使用14320 CT图像的公共数据集的实验结果显示,CNN和VGG16的分类精度分别为96.34%和96.99%。
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表示技术的快速发展和大规模医学成像数据的可用性必须在3D医学图像分析中快速增加机器学习的使用。特别是,深度卷积神经网络(D-CNN)是关键参与者,并被医学成像界采用,以协助临床医生和医学专家进行疾病诊断。然而,培训深层神经网络,例如在高分辨率3D体积的计算机断层扫描(CT)扫描中进行诊断任务的D-CNN带来了强大的计算挑战。这提出了开发基于深度学习的方法,这些方法在2D图像中具有强大的学习表示形式,而是3D扫描。在本文中,我们提出了一种新的策略,以根据沿轴的相邻切片的描述来训练CT扫描上的\ emph {slice level}分类器。特别是,每一个都是通过卷积神经网络(CNN)提取的。该方法适用于具有每片标签的CT数据集,例如RSNA颅内出血(ICH)数据集,该数据集旨在预测ICH的存在并将其分类为5个不同的子类型。我们在RSNA ICH挑战的最佳4 \%最佳解决方案中获得了单个模型,其中允许模型集成。实验还表明,所提出的方法显着优于CQ500上的基线模型。所提出的方法是一般的,可以应用于其他3D医学诊断任务,例如MRI成像。为了鼓励该领域的新进步,我们将在接受论文后制定我们的代码和预培训模型。
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最近关于Covid-19的研究表明,CT成像提供了评估疾病进展和协助诊断的有用信息,以及帮助理解疾病。有越来越多的研究,建议使用深度学习来使用胸部CT扫描提供快速准确地定量Covid-19。兴趣的主要任务是胸部CT扫描的肺和肺病变的自动分割,确认或疑似Covid-19患者。在这项研究中,我们使用多中心数据集比较12个深度学习算法,包括开源和内部开发的算法。结果表明,合并不同的方法可以提高肺部分割,二元病变分割和多种子病变分割的总体测试集性能,从而分别为0.982,0.724和0.469的平均骰子分别。将得到的二元病变分段为91.3ml的平均绝对体积误差。通常,区分不同病变类型的任务更加困难,分别具有152mL的平均绝对体积差,分别为整合和磨碎玻璃不透明度为0.369和0.523的平均骰子分数。所有方法都以平均体积误差进行二元病变分割,该分段优于人类评估者的视觉评估,表明这些方法足以用于临床实践中使用的大规模评估。
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Deep learning (DL) analysis of Chest X-ray (CXR) and Computed tomography (CT) images has garnered a lot of attention in recent times due to the COVID-19 pandemic. Convolutional Neural Networks (CNNs) are well suited for the image analysis tasks when trained on humongous amounts of data. Applications developed for medical image analysis require high sensitivity and precision compared to any other fields. Most of the tools proposed for detection of COVID-19 claims to have high sensitivity and recalls but have failed to generalize and perform when tested on unseen datasets. This encouraged us to develop a CNN model, analyze and understand the performance of it by visualizing the predictions of the model using class activation maps generated using (Gradient-weighted Class Activation Mapping) Grad-CAM technique. This study provides a detailed discussion of the success and failure of the proposed model at an image level. Performance of the model is compared with state-of-the-art DL models and shown to be comparable. The data and code used are available at https://github.com/aleesuss/c19.
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在本文中,我们研究了使用深度学习模型时的可转移性限制,用于对CT图像中肺炎感染区域的语义分割。拟议的方法采用4通道输入;基于Hounsfield量表的3个通道,以及一个表示肺部区域的通道(二进制)。我们使用了3个不同的公开可用的CT数据集。如果没有肺部面罩,深度学习模型会生成代理图像。实验结果表明,在创建共同分割模型时,应仔细使用可转移性;在大量数据中重新训练该模型多次以上会导致分割精度的降低。
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