随着Covid-19在世界范围内的传播,需要快速,精确的自动分诊机制,以减少人类的努力,例如用于基于图像的诊断。尽管文献在这个方向上显示出了有希望的努力,但报告的结果并未考虑在不同情况下获得的CT扫描的可变性,因此,渲染模型不适合使用,例如使用例如使用例如不同的扫描仪技术。虽然现在可以使用PCR测试有效地进行COVID-19诊断,但该用例却例证了一种方法来克服数据可变性问题以使医疗图像分析模型更广泛地适用。在本文中,我们使用COVID-19诊断的示例明确解决了可变性问题,并提出了一种新颖的生成方法,旨在消除例如成像技术同时通过利用深度自动编码器的想法来同时引入CT扫描的最小变化。拟议的预性架构(PrepNet)(i)在多个CT扫描数据集上共同训练,(ii)能够提取改进的判别特征以改善诊断。三个公共数据集(SARS-COVID-2,UCSD COVID-CT,MOSMED)的实验结果表明,我们的模型将交叉数据集的概括提高了高达$ 11.84 $ $的百分比,尽管数据集绩效中的情况略有下降。
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COVID-19的诊断对于预防和控制该疾病是必要的。深度学习方法已被认为是一种快速准确的方法。在本文中,通过三个众所周知的预训练网络的平行组合,我们试图将感染的冠状病毒样品与健康样本区分开。负模样损耗函数已用于模型训练。SARS-COV-2数据集中的CT扫描图像用于诊断。SARS-COV-2数据集包含2482张肺CT扫描图像,其中1252张图像属于COVID-19感染的样品。提出的模型接近97%的准确性。
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2019年12月,一个名为Covid-19的新型病毒导致了迄今为止的巨大因果关系。与新的冠状病毒的战斗在西班牙语流感后令人振奋和恐怖。虽然前线医生和医学研究人员在控制高度典型病毒的传播方面取得了重大进展,但技术也证明了在战斗中的重要性。此外,许多医疗应用中已采用人工智能,以诊断许多疾病,甚至陷入困境的经验丰富的医生。因此,本调查纸探讨了提议的方法,可以提前援助医生和研究人员,廉价的疾病诊断方法。大多数发展中国家难以使用传统方式进行测试,但机器和深度学习可以采用显着的方式。另一方面,对不同类型的医学图像的访问已经激励了研究人员。结果,提出了一种庞大的技术数量。本文首先详细调了人工智能域中传统方法的背景知识。在此之后,我们会收集常用的数据集及其用例日期。此外,我们还显示了采用深入学习的机器学习的研究人员的百分比。因此,我们对这种情况进行了彻底的分析。最后,在研究挑战中,我们详细阐述了Covid-19研究中面临的问题,我们解决了我们的理解,以建立一个明亮健康的环境。
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自首次报道以来,2019年冠状病毒病(Covid-19)已在全球范围内传播,并成为人类面临的健康危机。放射学成像技术,例如计算机断层扫描(CT)和胸部X射线成像(CXR)是诊断CoVID-19的有效工具。但是,在CT和CXR图像中,感染区域仅占据图像的一小部分。一些整合大规模接受场的常见深度学习方法可能会导致图像细节的丢失,从而导致省略了COVID-19图像中感兴趣区域(ROI),因此不适合进一步处理。为此,我们提出了一个深空金字塔池(D-SPP)模块,以在不同的分辨率上整合上下文信息,旨在有效地在COVID-19的不同尺度下提取信息。此外,我们提出了COVID-19感染检测(CID)模块,以引起人们对病变区域的注意,并从无关信息中消除干扰。在四个CT和CXR数据集上进行的广泛实验表明,我们的方法在检测CT和CXR图像中检测COVID-19病变的准确性更高。它可以用作计算机辅助诊断工具,以帮助医生有效地诊断和筛选COVID-19。
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有必要开发负担得起且可靠的诊断工具,该工具允许包含COVID-19的扩散。已经提出了机器学习(ML)算法来设计支持决策系统以评估胸部X射线图像,事实证明,这些图像可用于检测和评估疾病进展。许多研究文章围绕此主题发表,这使得很难确定未来工作的最佳方法。本文介绍了使用胸部X射线图像应用于COVID-19检测的ML的系统综述,旨在就方法,体系结构,数据库和当前局限性为研究人员提供基线。
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Deep learning (DL) analysis of Chest X-ray (CXR) and Computed tomography (CT) images has garnered a lot of attention in recent times due to the COVID-19 pandemic. Convolutional Neural Networks (CNNs) are well suited for the image analysis tasks when trained on humongous amounts of data. Applications developed for medical image analysis require high sensitivity and precision compared to any other fields. Most of the tools proposed for detection of COVID-19 claims to have high sensitivity and recalls but have failed to generalize and perform when tested on unseen datasets. This encouraged us to develop a CNN model, analyze and understand the performance of it by visualizing the predictions of the model using class activation maps generated using (Gradient-weighted Class Activation Mapping) Grad-CAM technique. This study provides a detailed discussion of the success and failure of the proposed model at an image level. Performance of the model is compared with state-of-the-art DL models and shown to be comparable. The data and code used are available at https://github.com/aleesuss/c19.
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这项研究的目的是开发一个强大的基于深度学习的框架,以区分Covid-19,社区获得的肺炎(CAP)和基于使用各种方案和放射剂量在不同成像中心获得的胸部CT扫描的正常病例和正常情况。我们表明,虽然我们的建议模型是在使用特定扫描协议仅从一个成像中心获取的相对较小的数据集上训练的,但该模型在使用不同技术参数的多个扫描仪获得的异质测试集上表现良好。我们还表明,可以通过无监督的方法来更新模型,以应对火车和测试集之间的数据移动,并在从其他中心接收新的外部数据集时增强模型的鲁棒性。我们采用了合奏体系结构来汇总该模型的多个版本的预测。为了初始培训和开发目的,使用了171 Covid-19、60 CAP和76个正常情况的内部数据集,其中包含使用恒定的标准辐射剂量扫描方案从一个成像中心获得的体积CT扫描。为了评估模型,我们回顾了四个不同的测试集,以研究数据特征对模型性能的转移的影响。在测试用例中,有与火车组相似的CT扫描,以及嘈杂的低剂量和超低剂量CT扫描。此外,从患有心血管疾病或手术病史的患者中获得了一些测试CT扫描。这项研究中使用的整个测试数据集包含51 covid-19、28 CAP和51例正常情况。实验结果表明,我们提出的框架在所有测试集上的表现良好,达到96.15%的总准确度(95%CI:[91.25-98.74]),COVID-119,COVID-96.08%(95%CI:[86.54-99.5],95%),[86.54-99.5],),,),敏感性。帽敏感性为92.86%(95%CI:[76.50-99.19])。
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Computer tomography (CT) have been routinely used for the diagnosis of lung diseases and recently, during the pandemic, for detecting the infectivity and severity of COVID-19 disease. One of the major concerns in using ma-chine learning (ML) approaches for automatic processing of CT scan images in clinical setting is that these methods are trained on limited and biased sub-sets of publicly available COVID-19 data. This has raised concerns regarding the generalizability of these models on external datasets, not seen by the model during training. To address some of these issues, in this work CT scan images from confirmed COVID-19 data obtained from one of the largest public repositories, COVIDx CT 2A were used for training and internal vali-dation of machine learning models. For the external validation we generated Indian-COVID-19 CT dataset, an open-source repository containing 3D CT volumes and 12096 chest CT images from 288 COVID-19 patients from In-dia. Comparative performance evaluation of four state-of-the-art machine learning models, viz., a lightweight convolutional neural network (CNN), and three other CNN based deep learning (DL) models such as VGG-16, ResNet-50 and Inception-v3 in classifying CT images into three classes, viz., normal, non-covid pneumonia, and COVID-19 is carried out on these two datasets. Our analysis showed that the performance of all the models is comparable on the hold-out COVIDx CT 2A test set with 90% - 99% accuracies (96% for CNN), while on the external Indian-COVID-19 CT dataset a drop in the performance is observed for all the models (8% - 19%). The traditional ma-chine learning model, CNN performed the best on the external dataset (accu-racy 88%) in comparison to the deep learning models, indicating that a light-weight CNN is better generalizable on unseen data. The data and code are made available at https://github.com/aleesuss/c19.
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一种名为Covid-19的新发现的冠状病毒疾病主要影响人类呼吸系统。 Covid-19是一种由起源于中国武汉的病毒引起的传染病。早期诊断是医疗保健提供者的主要挑战。在较早的阶段,医疗机构令人眼花azz乱,因为没有适当的健康辅助工具或医学可以检测到COVID-19。引入了一种新的诊断工具RT-PCR(逆转录聚合酶链反应)。它从患者的鼻子或喉咙中收集拭子标本,在那里共有19个病毒。该方法有一些与准确性和测试时间有关的局限性。医学专家建议一种称为CT(计算机断层扫描)的替代方法,该方法可以快速诊断受感染的肺部区域并在早期阶段识别Covid-19。使用胸部CT图像,计算机研究人员开发了几种识别Covid-19疾病的深度学习模型。这项研究介绍了卷积神经网络(CNN)和基于VGG16的模型,用于自动化的COVID-19在胸部CT图像上识别。使用14320 CT图像的公共数据集的实验结果显示,CNN和VGG16的分类精度分别为96.34%和96.99%。
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我们为Covid-19的快速准确CT(DL-FACT)测试提供了一系列深度学习的计算框架。我们开发了基于CT的DL框架,通过基于DL的CT图像增强和分类来提高Covid-19(加上其变体)的测试速度和准确性。图像增强网络适用于DDNet,短暂的Dennet和基于Deconvolulate的网络。为了展示其速度和准确性,我们在Covid-19 CT图像的几个来源中评估了DL-FARE。我们的结果表明,DL-FACT可以显着缩短几天到几天的周转时间,并提高Covid-19测试精度高达91%。DL-FACT可以用作诊断和监测Covid-19的医学专业人员的软件工具。
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The Coronavirus disease 2019 (COVID-19) was first identified in Wuhan, China, in early December 2019 and now becoming a pandemic. When COVID-19 patients undergo radiography examination, radiologists can observe the present of radiographic abnormalities from their chest X-ray (CXR) images. In this study, a deep convolutional neural network (CNN) model was proposed to aid radiologists in diagnosing COVID-19 patients. First, this work conducted a comparative study on the performance of modified VGG-16, ResNet-50 and DenseNet-121 to classify CXR images into normal, COVID-19 and viral pneumonia. Then, the impact of image augmentation on the classification results was evaluated. The publicly available COVID-19 Radiography Database was used throughout this study. After comparison, ResNet-50 achieved the highest accuracy with 95.88%. Next, after training ResNet-50 with rotation, translation, horizontal flip, intensity shift and zoom augmented dataset, the accuracy dropped to 80.95%. Furthermore, an ablation study on the effect of image augmentation on the classification results found that the combinations of rotation and intensity shift augmentation methods obtained an accuracy higher than baseline, which is 96.14%. Finally, ResNet-50 with rotation and intensity shift augmentations performed the best and was proposed as the final classification model in this work. These findings demonstrated that the proposed classification model can provide a promising result for COVID-19 diagnosis.
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世界目前正在经历持续的传染病大流行病,该传染病是冠状病毒疾病2019(即covid-19),这是由严重的急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-COV-2)引起的。计算机断层扫描(CT)在评估感染的严重程度方面发挥着重要作用,并且还可用于识别这些症状和无症状的Covid-19载体。随着Covid-19患者的累积数量的激增,放射科医师越来越强调手动检查CT扫描。因此,自动化3D CT扫描识别工具的需求量高,因为手动分析对放射科医师耗时,并且它们的疲劳可能导致可能的误判。然而,由于位于不同医院的CT扫描仪的各种技术规范,CT图像的外观可能显着不同,导致许多自动图像识别方法的失败。因此,多域和多扫描仪研究的多域移位问题是不可能对可靠识别和可再现和客观诊断和预后至关重要的至关重要。在本文中,我们提出了Covid-19 CT扫描识别模型即Coronavirus信息融合和诊断网络(CIFD-NET),可以通过新的强大弱监督的学习范式有效地处理多域移位问题。与其他最先进的方法相比,我们的模型可以可靠,高效地解决CT扫描图像中不同外观的问题。
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2019年12月,中国武汉的全球大流行Covid-19影响了人类生活和全球经济。因此,需要有效的诊断系统来控制其传播。然而,自动诊断系统带来的挑战有限,标记的数据,较小的对比度变化以及感染和背景之间的高结构相似性。在这方面,提出了一种新的两阶段深卷卷卷神经网络(CNN)诊断系统来检测微小的不规则性并分析COVID-19的感染。在第一阶段,提出了一种新型的SB-STM-BRNET CNN,并结合了一个新的通道并增强并增强(SB),并基于卷积的分裂转换合并(STM)块,以检测COVID-19受感染的CT肺部图像。新的STM块执行了多路径区域平滑和边界操作,这有助于学习较小的对比度变化和全局COVID-19的特定模式。此外,使用SB和在STM块中传输学习概念来实现不同的增强渠道,以学习Covid-19特异性图像和健康图像之间的纹理变化。在第二阶段,向新型的Covid-CB-Reseg-Reseg-Rese分割CNN提供了COVID-19的感染图像,以识别和分析COVID-19的感染区域。拟议的COVID-CB-RESEG有条不紊地采用了区域同质性,异质性操作以及使用每个编码器和解码器块中的辅助通道的渠道增强,以同时学习COVID-19受感染区域的低照明和边界。提出的诊断系统在准确性方面产生良好的性能:98.21%,F-评分:98.24%,骰子相似性:96.40%,IOU:COVID-19受感染区域的98.85%。拟议的诊断系统将减轻负担,并加强放射科医生对快速准确的COVID-19诊断的决定。
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胸部射线照相是一种相对便宜,广泛的医疗程序,可传达用于进行诊断决策的关键信息。胸部X射线几乎总是用于诊断呼吸系统疾病,如肺炎或最近的Covid-19。在本文中,我们提出了一个自我监督的深神经网络,其在未标记的胸部X射线数据集上掠夺。学习的陈述转移到下游任务 - 呼吸系统疾病的分类。在四个公共数据集获得的结果表明,我们的方法在不需要大量标记的培训数据的情况下产生竞争力。
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每年有大约4.5亿人受到肺炎的影响,导致250万人死亡。 Covid-19也影响了1.81亿人,这导致了392万人伤亡。如果早期诊断,两种疾病死亡可能会显着降低。然而,目前诊断肺炎(投诉+胸部X射线)和Covid-19(RT-PCR)的方法分别存在专家放射科医生和时间。在深度学习模型的帮助下,可以从胸部X射线或CT扫描立即检测肺炎和Covid-19。这样,诊断肺炎/ Covid-19的过程可以更有效和普遍地制作。在本文中,我们的目标是引出,解释和评估,定性和定量,深入学习方法的主要进步,旨在检测或定位社区获得的肺炎(帽),病毒肺炎和Covid-19从胸部X-的图像光线和CT扫描。作为一个系统的审查,本文的重点在于解释了深度学习模型架构,该架构已经被修改或从划痕,以便WIWTH对概括性的关注。对于每个模型,本文回答了模型所设计的方式的问题,特定模型克服的挑战以及修改模型到所需规格的折衷。还提供了本文描述的所有模型的定量分析,以量化不同模型的有效性与相似的目标。一些权衡无法量化,因此它们在定性分析中明确提到,在整个纸张中完成。通过在一个地方编译和分析大量的研究细节,其中包含所有数据集,模型架构和结果,我们的目标是为对此字段感兴趣的初学者和当前研究人员提供一站式解决方案。
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2019年新型冠状病毒疾病(Covid-19)是一种致命的传染病,于2019年12月在中国武汉武汉(Wuhan)首次识别,并且一直处于流行状态。在这种情况下,在感染人群中检测到Covid-19变得越来越重要。如今,与感染人群数量相比,测试套件的数量逐渐减少。在最近的流行条件下,通过分析胸部CT(计算机断层扫描)图像诊断肺部疾病已成为COVID-19患者诊断和预言的重要工具。在这项研究中,已经提出了一种从CT图像检测COVID-19感染的转移学习策略(CNN)。在拟议的模型中,已经设计了具有转移学习模型V3的多层卷积神经网络(CNN)。与CNN类似,它使用卷积和汇总来提取功能,但是该传输学习模型包含数据集成像网的权重。因此,它可以非常有效地检测功能,从而使其在获得更好的准确性方面具有优势。
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The devastation caused by the coronavirus pandemic makes it imperative to design automated techniques for a fast and accurate detection. We propose a novel non-invasive tool, using deep learning and imaging, for delineating COVID-19 infection in lungs. The Ensembling Attention-based Multi-scaled Convolution network (EAMC), employing Leave-One-Patient-Out (LOPO) training, exhibits high sensitivity and precision in outlining infected regions along with assessment of severity. The Attention module combines contextual with local information, at multiple scales, for accurate segmentation. Ensemble learning integrates heterogeneity of decision through different base classifiers. The superiority of EAMC, even with severe class imbalance, is established through comparison with existing state-of-the-art learning models over four publicly-available COVID-19 datasets. The results are suggestive of the relevance of deep learning in providing assistive intelligence to medical practitioners, when they are overburdened with patients as in pandemics. Its clinical significance lies in its unprecedented scope in providing low-cost decision-making for patients lacking specialized healthcare at remote locations.
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在本文中,我们研究了使用深度学习模型时的可转移性限制,用于对CT图像中肺炎感染区域的语义分割。拟议的方法采用4通道输入;基于Hounsfield量表的3个通道,以及一个表示肺部区域的通道(二进制)。我们使用了3个不同的公开可用的CT数据集。如果没有肺部面罩,深度学习模型会生成代理图像。实验结果表明,在创建共同分割模型时,应仔细使用可转移性;在大量数据中重新训练该模型多次以上会导致分割精度的降低。
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在过去的两年中,Covid-19-19的到来引起的动荡继续带来新的挑战。在这次COVID-19大流行期间,需要快速鉴定感染患者和计算机断层扫描(CT)图像中感染区域的特定描述。尽管已迅速建立了深层监督的学习方法,但图像级和像素级标签的稀缺性以及缺乏可解释的透明度仍然阻碍了AI的适用性。我们可以识别受感染的患者并以极端的监督描绘感染吗?半监督的学习表明,在有限的标记数据和足够的未标记数据下,表现出了有希望的表现。受到半监督学习的启发,我们提出了一种模型不可静止的校准伪标记策略,并将其应用于一致性正则化框架下,以生成可解释的识别和描述结果。我们通过有限的标记数据和足够的未标记数据或弱标记数据的组合证明了模型的有效性。广泛的实验表明,我们的模型可以有效利用有限的标记数据,并为临床常规中的决策提供可解释的分类和分割结果。该代码可从https://github.com/ayanglab/xai covid-11获得。
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本文介绍了有组织的第二次共同19号比赛的基线方法,该方法发生在欧洲计算机视觉会议(ECCV 2022)的Aimia研讨会框架内。它提出了COV19-CT-DB数据库,该数据库为COVID-19 DENCTICT注释,由约7,700 3-D CT扫描组成。通过四个COVID-19严重性条件,进一步注释了由COVID-19案例组成的数据库的一部分。我们已经在培训,验证和测试数据集中划分了数据库和后期。前两个数据集用于培训和验证机器学习模型,而后者将用于评估开发模型。基线方法由基于CNN-RNN网络的深度学习方法组成,并报告其在COVID19-CT-DB数据库上的性能。
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