Convolutional Neural Networks (CNN) have shown promising results for displacement estimation in UltraSound Elastography (USE). Many modifications have been proposed to improve the displacement estimation of CNNs for USE in the axial direction. However, the lateral strain, which is essential in several downstream tasks such as the inverse problem of elasticity imaging, remains a challenge. The lateral strain estimation is complicated since the motion and the sampling frequency in this direction are substantially lower than the axial one, and a lack of carrier signal in this direction. In computer vision applications, the axial and the lateral motions are independent. In contrast, the tissue motion pattern in USE is governed by laws of physics which link the axial and lateral displacements. In this paper, inspired by Hooke's law, we first propose Physically Inspired ConsTraint for Unsupervised Regularized Elastography (PICTURE), where we impose a constraint on the Effective Poisson's ratio (EPR) to improve the lateral strain estimation. In the next step, we propose self-supervised PICTURE (sPICTURE) to further enhance the strain image estimation. Extensive experiments on simulation, experimental phantom and in vivo data demonstrate that the proposed methods estimate accurate axial and lateral strain maps.
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位移估计是几乎所有超声弹性图(使用)技术的关键步骤。与一般的光流问题相比,这两个主要功能使这项任务与众不同:超声射频(RF)数据的高频性质和位移字段上物理的管理定律。最近,已经对光流网络的体系结构进行了修改,以便能够使用RF数据。同样,通过考虑以第一和第二个衍生式正规化器的形式考虑位移连续性的先验知识,已采用半监督和无监督的技术来使用。尽管尝试了这些尝试,但尚未考虑组织压缩模式,并且假定轴向和横向方向的位移是独立的。然而,组织运动模式受使用的物理定律的控制,使轴向和横向位移高度相关。在本文中,我们提出了对无监督的正则弹性图(图)的身体启发的约束,在此我们对泊松比的约束以改善侧向位移估计值。有关幻影和体内数据的实验表明,图片大大提高了横向位移估计的质量。
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作为混合成像技术,光声显微镜(PAM)成像由于激光强度的最大允许暴露,组织中超声波的衰减以及换能器的固有噪声而受到噪声。去噪是降低噪声的后处理方法,并且可以恢复PAM图像质量。然而,之前的去噪技术通常严重依赖于数学前导者以及手动选择的参数,导致对不同噪声图像的不令人满意和慢的去噪能,这极大地阻碍了实用和临床应用。在这项工作中,我们提出了一种基于深度学习的方法,可以从PAM图像中除去复杂的噪声,没有数学前导者,并手动选择不同输入图像的设置。注意增强的生成对抗性网络用于提取图像特征并去除各种噪声。在合成和实际数据集上证明了所提出的方法,包括幻影(叶静脉)和体内(小鼠耳血管和斑马鱼颜料)实验。结果表明,与先前的PAM去噪方法相比,我们的方法在定性和定量上恢复图像时表现出良好的性能。此外,为256次\ times256 $像素的图像实现了0.016 s的去噪速度。我们的方法对于PAM图像的去噪有效和实用。
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心肌运动和变形是表征心脏功能的丰富描述符。图像注册是心肌运动跟踪最常用的技术,是一个不当的反问题,通常需要先前对解决方案空间进行假设。与大多数现有的方法相反,它们强加了明确的通用正则化(例如平滑度),在这项工作中,我们提出了一种新的方法,该方法可以隐式地学习了特定于应用程序的生物力学知识,并将其嵌入了神经网络参数化转换模型中。尤其是,提出的方法利用基于变异自动编码器的生成模型来学习生物力学上合理变形的多种多样。然后,可以通过穿越学习的歧管来搜索最佳转换时,在考虑序列信息时搜索最佳转换。该方法在三个公共心脏Cine MRI数据集中进行了验证,并具有全面的评估。结果表明,所提出的方法可以胜过其他方法,从而获得更高的运动跟踪精度,并具有合理的量保存和更好地变化数据分布的概括性。它还可以更好地估计心肌菌株,这表明该方法在表征时空特征以理解心血管疾病方面的潜力。
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我们展示了OpenFWI,是用于地震全波形反演(FWI)的大型开源基准数据集的集合。OpenFWI是地球科学和机器学习界的一流,以促进对基于机器学习的FWI多元化,严谨和可重复的研究。OpenFWI包括多个尺度的数据集,包含不同的域,涵盖各种级别的模型复杂性。除了数据集之外,我们还对每个数据集进行实证研究,具有完全卷积的深度学习模型。OpenFWI已被核心维护,并将通过新数据和实验结果定期更新。我们感谢社区的投入,帮助我们进一步改进OpenFWI。在当前版本,我们在OpenFWI中发布了七个数据集,其中为3D FWI指定了一个,其余的是2D场景。所有数据集和相关信息都可以通过我们的网站访问https://openfwi.github.io/。
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用于医学图像重建的深度神经网络传统上使用高质量的地基图像作为训练目标训练。最近关于噪声的工作(N2N)已经示出了使用与具有地面真理的多个噪声测量的潜力。然而,现有的基于N2N的方法不适合于从经历非身份变形的物体的测量来学习。本文通过补偿对象变形来提出用于训练深层重建网络的变形补偿学习(DecoLearn)方法来解决此问题。DecoLearn的一个关键组件是一个深度登记模块,它与深度重建网络共同培训,没有任何地理监督。我们在模拟和实验收集的磁共振成像(MRI)数据上验证了甲板,并表明它显着提高了成像质量。
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低光图像增强(LLIE)旨在提高在环境中捕获的图像的感知或解释性,较差的照明。该领域的最新进展由基于深度学习的解决方案为主,其中许多学习策略,网络结构,丢失功能,培训数据等已被采用。在本文中,我们提供了全面的调查,以涵盖从算法分类到开放问题的各个方面。为了检查现有方法的概括,我们提出了一个低光图像和视频数据集,其中图像和视频是在不同的照明条件下的不同移动电话的相机拍摄的。除此之外,我们首次提供统一的在线平台,涵盖许多流行的LLIE方法,其中结果可以通过用户友好的Web界面生产。除了在公开和我们拟议的数据集上对现有方法的定性和定量评估外,我们还验证了他们在黑暗中的脸部检测中的表现。这项调查与拟议的数据集和在线平台一起作为未来研究的参考来源和促进该研究领域的发展。拟议的平台和数据集以及收集的方法,数据集和评估指标是公开可用的,并将经常更新。
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数字乳房X光检查仍然是乳腺癌筛选最常见的成像工具。虽然使用数字乳房X线照相术用于癌症筛查的益处超过了与X射线曝光相关的风险,但是辐射剂量必须尽可能低,同时保持所产生的图像的诊断效用,从而最大限度地减少患者风险。许多研究通过使用深神经网络恢复低剂量图像来调查剂量降低的可行性。在这些情况下,选择适当的培训数据库和丢失功能至关重要,并影响结果的质量。在这项工作中,提出了一种修改了具有分层跳过连接的Reset架构,以恢复低剂量数字乳房X光检查。我们将恢复的图像与标准的全剂量图像进行比较。此外,我们评估了此任务的几个损失函数的性能。出于培训目的,我们从回顾性临床乳腺X线摄影考试的400次图像数据集中提取了256,000个图像贴片,其中模拟了不同的剂量水平以产生低和标准剂量对。为了在真实情况下验证网络,使用物理拟人乳房乳房映射来在商业上可获得的乳房X线摄影系统中获得真实的低剂量和标准全剂量图像,然后通过我们培训的模型处理。以前呈现的低剂量数字乳房X线摄影的分析恢复模型用作这项工作中的基准。通过信噪比(SNR)进行客观评估,并且平均归一化平方误差(MNSE),分解成残余噪声和偏置。结果表明,感知损失功能(PL4)能够实现全剂量采集的几乎相同的噪声水平,同时导致与其他损耗功能相比较小的信号偏差。
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荧光显微镜是促进生物医学研究发现的关键驱动力。但是,随着显微镜硬件的局限性和观察到的样品的特征,荧光显微镜图像易受噪声。最近,已经提出了一些自我监督的深度学习(DL)denoising方法。但是,现有方法的训练效率和降解性能在实际场景噪声中相对较低。为了解决这个问题,本文提出了自我监督的图像denoising方法噪声2SR(N2SR),以训练基于单个嘈杂观察的简单有效的图像Denoising模型。我们的noings2SR Denoising模型设计用于使用不同维度的配对嘈杂图像进行训练。从这种训练策略中受益,Noige2SR更有效地自我监督,能够从单个嘈杂的观察结果中恢复更多图像细节。模拟噪声和真实显微镜噪声的实验结果表明,噪声2SR优于两个基于盲点的自我监督深度学习图像Denoising方法。我们设想噪声2SR有可能提高更多其他类型的科学成像质量。
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定量超声(例如,组织中的回答速度(SOS))提供有关具有诊断值的组织特性的信息。最近的研究表明,使用深层神经网络从Pulse-Echo超声原始数据(又称RF数据)中提取SOS信息的可能性,这些神经网络在模拟数据上进行了充分训练。这些方法将传感器域数据(即RF数据)作为输入和以端到端方式训练网络,以了解RF数据域和SOS域之间的隐式映射。但是,此类网络容易拟合模拟数据,这在测量数据测试时会导致性能和不稳定。我们提出了一种新的方法,用于使用从两个链接的自动编码器中学习的表示形式进行SOS映射。我们测试了从模仿幻影的人乳房获取的模拟和测量数据的方法。我们证明使用链接的自动编码器可以使用SOS映射。所提出的方法在模拟数据上的平均绝对百分比误差(MAPE)为2.39%。在测得的数据上,所提出的方法的预测接近MAPE为1.1%的预期值。与端到端训练的网络相比,提出的方法显示出更高的稳定性和可重复性。
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图像去噪是许多领域下游任务的先决条件。低剂量和光子计数计算断层扫描(CT)去噪可以在最小化辐射剂量下优化诊断性能。监督深层去噪方法是流行的,但需要成对的清洁或嘈杂的样本通常在实践中不可用。受独立噪声假设的限制,电流无监督的去噪方法不能处理与CT图像中的相关噪声。在这里,我们提出了一种基于类似的类似性的无人监督的无监督的深度去噪方法,称为Coxing2Sim,以非局部和非线性方式起作用,不仅抑制独立而且还具有相关的噪音。从理论上讲,噪声2SIM在温和条件下渐近相当于监督学习方法。通过实验,Nosie2SIM从嘈杂的低剂量CT和光子计数CT图像中的内在特征,从视觉上,定量和统计上有效地或甚至优于实际数据集的监督学习方法。 Coke2Sim是一般无监督的去噪方法,在不同的应用中具有很大的潜力。
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目的:并行成像通过用一系列接收器线圈获取其他灵敏度信息,从而加速了磁共振成像(MRI)数据,从而降低了相位编码步骤。压缩传感磁共振成像(CS-MRI)在医学成像领域中获得了普及,因为其数据要求较少,而不是平行成像。并行成像和压缩传感(CS)均通过最大程度地减少K空间中捕获的数据量来加快传统MRI获取。由于采集时间与样品的数量成反比,因此从缩短的K空间样品中的图像的反向形成会导致收购更快,但具有混乱的伪像。本文提出了一种新型的生成对抗网络(GAN),即雷德格尔(Recgan-gr)受到多模式损失的监督,以消除重建的图像。方法:与现有的GAN网络相反,我们提出的方法引入了一种新型的发电机网络,即与双域损耗函数集成的弹药网络,包括加权幅度和相位损耗函数以及基于平行成像的损失,即Grappa一致性损失。提出了K空间校正块,以使GAN网络自动化生成不必要的数据,从而使重建过程的收敛性更快。结果:全面的结果表明,拟议的Recgan-GR在基于GAN的方法中的PSNR有4 dB的改善,并且在文献中可用的传统最先进的CNN方法中有2 dB的改进。结论和意义:拟议的工作有助于显着改善低保留数据的图像质量,从而更快地获取了5倍或10倍。
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在本文中,我们考虑使用Palentir在两个和三个维度中对分段常数对象的恢复和重建,这是相对于当前最新ART的显着增强的参数级别集(PALS)模型。本文的主要贡献是一种新的PALS公式,它仅需要一个单个级别的函数来恢复具有具有多个未知对比度的分段常数对象的场景。我们的模型比当前的多对抗性,多对象问题提供了明显的优势,所有这些问题都需要多个级别集并明确估计对比度大小。给定对比度上的上限和下限,我们的方法能够以任何对比度分布恢复对象,并消除需要知道给定场景中的对比度或其值的需求。我们提供了一个迭代过程,以找到这些空间变化的对比度限制。相对于使用径向基函数(RBF)的大多数PAL方法,我们的模型利用了非异型基函数,从而扩展了给定复杂性的PAL模型可以近似的形状类别。最后,Palentir改善了作为参数识别过程一部分所需的Jacobian矩阵的条件,因此通过控制PALS扩展系数的幅度来加速优化方法,固定基本函数的中心,以及参数映射到图像映射的唯一性,由新参数化提供。我们使用X射线计算机断层扫描,弥漫性光学断层扫描(DOT),Denoising,DeonConvolution问题的2D和3D变体证明了新方法的性能。应用于实验性稀疏CT数据和具有不同类型噪声的模拟数据,以进一步验证所提出的方法。
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定量超声(QUS)提供了有关组织特性的重要信息。可以通过将包络数据分为小重叠贴片并计算不同的斑点统计信息,例如中Nakagami的参数和knody k-Distribution(HK-Distribution)来形成QUS参数图像。计算出的QUS参数图像可能是错误的,因为补丁中只有几个独立的样本可用。另一个挑战是,假定斑块内的包膜样品来自相同的分布,这一假设通常会违反,因为该组织通常不是同质的。在本文中,我们提出了一种基于卷积神经网络(CNN)的方法,以估算QUS参数图像而无需修补。我们构建一个从HK分布中采样的大数据集,具有随机形状和QUS参数值的区域。然后,我们使用众所周知的网络以多任务学习方式估算QUS参数。我们的结果证实,所提出的方法能够减少错误并改善QUS参数图像中的边界定义。
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基于治疗期间的单投影图像的器官形状重建具有广泛的临床范围,例如在图像引导放射治疗和手术指导中。我们提出了一种图形卷积网络,该网络实现了用于单视点2D投影图像的3D器官网格的可变形登记。该框架使得能够同时训练两种类型的变换:从2D投影图像到位移图,以及从采样的每周顶点特征到满足网格结构的几何约束的3D位移。假设申请放射治疗,验证了2D / 3D可变形的登记性能,用于尚未瞄准迄今为止,即肝脏,胃,十二指肠和肾脏以及胰腺癌的多个腹部器官。实验结果表明,考虑多个器官之间的关系的形状预测可用于预测临床上可接受的准确性的数字重建射线照片的呼吸运动和变形。
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The identification of material parameters occurring in constitutive models has a wide range of applications in practice. One of these applications is the monitoring and assessment of the actual condition of infrastructure buildings, as the material parameters directly reflect the resistance of the structures to external impacts. Physics-informed neural networks (PINNs) have recently emerged as a suitable method for solving inverse problems. The advantages of this method are a straightforward inclusion of observation data. Unlike grid-based methods, such as the finite element method updating (FEMU) approach, no computational grid and no interpolation of the data is required. In the current work, we aim to further develop PINNs towards the calibration of the linear-elastic constitutive model from full-field displacement and global force data in a realistic regime. We show that normalization and conditioning of the optimization problem play a crucial role in this process. Therefore, among others, we identify the material parameters for initial estimates and balance the individual terms in the loss function. In order to reduce the dependence of the identified material parameters on local errors in the displacement approximation, we base the identification not on the stress boundary conditions but instead on the global balance of internal and external work. In addition, we found that we get a better posed inverse problem if we reformulate it in terms of bulk and shear modulus instead of Young's modulus and Poisson's ratio. We demonstrate that the enhanced PINNs are capable of identifying material parameters from both experimental one-dimensional data and synthetic full-field displacement data in a realistic regime. Since displacement data measured by, e.g., a digital image correlation (DIC) system is noisy, we additionally investigate the robustness of the method to different levels of noise.
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相位检索(PR)是从其仅限强度测量中恢复复杂值信号的长期挑战,由于其在数字成像中的广泛应用,引起了很大的关注。最近,开发了基于深度学习的方法,这些方法在单发PR中取得了成功。这些方法需要单个傅立叶强度测量,而无需对测量数据施加任何其他约束。然而,由于PR问题的输入和输出域之间存在很大的差异,香草深神经网络(DNN)并没有提供良好的性能。物理信息的方法试图将傅立叶强度测量结果纳入提高重建精度的迭代方法。但是,它需要一个冗长的计算过程,并且仍然无法保证准确性。此外,其中许多方法都在模拟数据上工作,这些数据忽略了一些常见问题,例如实用光学PR系统中的饱和度和量化错误。在本文中,提出了一种新型的物理驱动的多尺度DNN结构,称为PPRNET。与其他基于深度学习的PR方法类似,PPRNET仅需要一个傅立叶强度测量。物理驱动的是,网络被指导遵循不同尺度的傅立叶强度测量,以提高重建精度。 PPRNET具有前馈结构,可以端到端训练。因此,它比传统物理驱动的PR方法更快,更准确。进行了实用光学平台上的大量模拟和实验。结果证明了拟议的PPRNET比传统的基于基于学习的PR方法的优势和实用性。
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物体的内部材料特性,而对人眼不可见,确定在其表面上观察到的运动。我们提出一种方法,该方法从其表面振动的单眼视频估计物体的异质材料特性。具体来说,我们展示了如何在具有已知几何形状的3D对象中估算杨氏模量和密度。了解这些值如何变化对象的变化对于模拟其运动和表征任何缺陷非常有用。传统的非破坏性测试方法,通常需要昂贵的仪器,通常只估计均质材料特性或只是识别缺陷的存在。相反,我们的方法利用单目一体视频来从物体的子像素运动识别图像空间模式,(2)直接从观察到的模式推断出空间不同的杨氏模量和密度值。我们在模拟和真实视频上展示了我们的方法。
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本文介绍了一种来自单个离焦图像的边缘散焦模糊估计方法。我们首先将位于深度不连续(称为深度边缘的边缘)的边缘区分从近似恒定的深度区域(称为模糊估计的被称为模糊估计的图案边缘)的边缘中的深度不连续性(含义模糊估计是模糊的)。然后,我们仅估计图案边缘的散焦模糊量,并探索基于引导滤波器的内插方案,该导向滤波器防止检测到的深度边缘的数据传播,以获得具有明确定义的对象边界的密集模糊图。两个任务(边缘分类和模糊估计)由深度卷积神经网络(CNNS)执行,该网络(CNN)共享权重以从边缘位置为中心的多尺度补丁学习有意义的本地特征。在自然散焦的图像上的实验表明,该方法提出了优异的最先进(SOTA)方法的定性和定量结果,在运行时间和准确度之间具有良好的折衷。
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人类生理学中的各种结构遵循特异性形态,通常在非常细的尺度上表达复杂性。这种结构的例子是胸前气道,视网膜血管和肝血管。可以观察到可以观察到可以观察到可以观察到可以观察到空间排列的磁共振成像(MRI),计算机断层扫描(CT),光学相干断层扫描(OCT)等医学成像模式(MRI),计算机断层扫描(CT),可以观察到空间排列的大量2D和3D图像的集合。这些结构在医学成像中的分割非常重要,因为对结构的分析提供了对疾病诊断,治疗计划和预后的见解。放射科医生手动标记广泛的数据通常是耗时且容易出错的。结果,在过去的二十年中,自动化或半自动化的计算模型已成为医学成像的流行研究领域,迄今为止,许多计算模型已经开发出来。在这项调查中,我们旨在对当前公开可用的数据集,细分算法和评估指标进行全面审查。此外,讨论了当前的挑战和未来的研究方向。
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