Background and objective: COVID-19 and its variants have caused significant disruptions in over 200 countries and regions worldwide, affecting the health and lives of billions of people. Detecting COVID-19 from chest X-Ray (CXR) images has become one of the fastest and easiest methods for detecting COVID-19 since the common occurrence of radiological pneumonia findings in COVID-19 patients. We present a novel high-accuracy COVID-19 detection method that uses CXR images. Methods: Our method consists of two phases. One is self-supervised learning-based pertaining; the other is batch knowledge ensembling-based fine-tuning. Self-supervised learning-based pretraining can learn distinguished representations from CXR images without manually annotated labels. On the other hand, batch knowledge ensembling-based fine-tuning can utilize category knowledge of images in a batch according to their visual feature similarities to improve detection performance. Unlike our previous implementation, we introduce batch knowledge ensembling into the fine-tuning phase, reducing the memory used in self-supervised learning and improving COVID-19 detection accuracy. Results: On two public COVID-19 CXR datasets, namely, a large dataset and an unbalanced dataset, our method exhibited promising COVID-19 detection performance. Our method maintains high detection accuracy even when annotated CXR training images are reduced significantly (e.g., using only 10% of the original dataset). In addition, our method is insensitive to changes in hyperparameters. Conclusions: The proposed method outperforms other state-of-the-art COVID-19 detection methods in different settings. Our method can reduce the workloads of healthcare providers and radiologists.
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Purpose: Considering several patients screened due to COVID-19 pandemic, computer-aided detection has strong potential in assisting clinical workflow efficiency and reducing the incidence of infections among radiologists and healthcare providers. Since many confirmed COVID-19 cases present radiological findings of pneumonia, radiologic examinations can be useful for fast detection. Therefore, chest radiography can be used to fast screen COVID-19 during the patient triage, thereby determining the priority of patient's care to help saturated medical facilities in a pandemic situation. Methods: In this paper, we propose a new learning scheme called self-supervised transfer learning for detecting COVID-19 from chest X-ray (CXR) images. We compared six self-supervised learning (SSL) methods (Cross, BYOL, SimSiam, SimCLR, PIRL-jigsaw, and PIRL-rotation) with the proposed method. Additionally, we compared six pretrained DCNNs (ResNet18, ResNet50, ResNet101, CheXNet, DenseNet201, and InceptionV3) with the proposed method. We provide quantitative evaluation on the largest open COVID-19 CXR dataset and qualitative results for visual inspection. Results: Our method achieved a harmonic mean (HM) score of 0.985, AUC of 0.999, and four-class accuracy of 0.953. We also used the visualization technique Grad-CAM++ to generate visual explanations of different classes of CXR images with the proposed method to increase the interpretability. Conclusions: Our method shows that the knowledge learned from natural images using transfer learning is beneficial for SSL of the CXR images and boosts the performance of representation learning for COVID-19 detection. Our method promises to reduce the incidence of infections among radiologists and healthcare providers.
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目的:医生可以手动检测胃炎的胃X射线图像,这是耗时且昂贵的。本文提出了一种自我监督的学习方法来解决这个问题。这项研究旨在使用一些注释的胃X射线图像来验证拟议的自我监督学习方法在胃炎检测中的有效性。方法:在本文中,我们提出了一种新的方法,该方法可以执行明确的自我监督学习,并从胃X射线图像中学习判别性表示。在数据集中对使用建议方法训练的模型进行了微调,并具有一些带注释的胃X射线图像。将五种自我监督的学习方法,即Simsiam,Byol,Pirl-Jigsaw,Pirl Rotation和Simc​​lr,与所提出的方法进行了比较。此外,将三种先前的方法与提议的方法进行了比较。结果:拟议的方法$'$ s的谐波平均值得分的灵敏度和特异性分别为10、20、30和40名患者的注释数据分别为0.875、0.911、0.915和0.931。所提出的方法优于所有比较方法,包括五个自我监督学习和先前的三种方法。实验结果表明,使用一些带注释的胃X射线图像,该方法在胃炎检测中的有效性。结论:拟议的自我监督学习方法显示了使用一些注释的胃X射线图像在胃炎检测中的潜在临床用途。
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胸部射线照相是一种相对便宜,广泛的医疗程序,可传达用于进行诊断决策的关键信息。胸部X射线几乎总是用于诊断呼吸系统疾病,如肺炎或最近的Covid-19。在本文中,我们提出了一个自我监督的深神经网络,其在未标记的胸部X射线数据集上掠夺。学习的陈述转移到下游任务 - 呼吸系统疾病的分类。在四个公共数据集获得的结果表明,我们的方法在不需要大量标记的培训数据的情况下产生竞争力。
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由于存在隐私保护问题以及传输和存储许多高分辨率医疗图像的巨大成本,因此在医院之间共享医疗数据集很具有挑战性。但是,数据集蒸馏可以合成一个小数据集,从而使对其进行训练的模型与原始大型数据集实现了可比的性能,这显示了解决现有的医疗共享问题的潜力。因此,本文提出了一种基于数据集蒸馏的新型医学数据集共享方法。Covid-19胸部X射线图像数据集的实验结果表明,即使使用稀缺的匿名胸部X射线图像,我们的方法也可以达到高检测性能。
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Covid-19-Pandemic继续在世界上迅速传播,并在全球人类健康和经济中造成巨大危机。它的早期检测和诊断对于控制进一步的扩散至关重要。已经提出了许多基于学习的深度方法,以帮助临床医生根据计算机断层扫描成像进行自动COVID-19诊断。但是,仍然存在挑战,包括现有数据集中的数据多样性,以及由于深度学习模型的准确性和敏感性不足而导致的检测不满意。为了增强数据多样性,我们设计了增量级别的增强技术,并将其应用于最大的开放式基准测试数据集Covidx CT-2A。同时,在本研究中提出了从对比度学习中得出的相似性正则化(SR),以使CNN能够学习更多参数有效的表示,从而提高了CNN的准确性和敏感性。七个常用CNN的结果表明,通过应用设计的增强和SR技术,可以稳定地提高CNN性能。特别是,具有SR的Densenet121在三个试验中的三类分类中达到99.44%的平均测试准确性,包括正常,非covid-19-19-19肺炎和Covid-19-19。 COVID-19肺炎类别的精确度,敏感性和特异性分别为98.40%,99.59%和99.50%。这些统计数据表明,我们的方法已经超过了COVIDX CT-2A数据集上现有的最新方法。
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2019年12月,一个名为Covid-19的新型病毒导致了迄今为止的巨大因果关系。与新的冠状病毒的战斗在西班牙语流感后令人振奋和恐怖。虽然前线医生和医学研究人员在控制高度典型病毒的传播方面取得了重大进展,但技术也证明了在战斗中的重要性。此外,许多医疗应用中已采用人工智能,以诊断许多疾病,甚至陷入困境的经验丰富的医生。因此,本调查纸探讨了提议的方法,可以提前援助医生和研究人员,廉价的疾病诊断方法。大多数发展中国家难以使用传统方式进行测试,但机器和深度学习可以采用显着的方式。另一方面,对不同类型的医学图像的访问已经激励了研究人员。结果,提出了一种庞大的技术数量。本文首先详细调了人工智能域中传统方法的背景知识。在此之后,我们会收集常用的数据集及其用例日期。此外,我们还显示了采用深入学习的机器学习的研究人员的百分比。因此,我们对这种情况进行了彻底的分析。最后,在研究挑战中,我们详细阐述了Covid-19研究中面临的问题,我们解决了我们的理解,以建立一个明亮健康的环境。
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We introduce Bootstrap Your Own Latent (BYOL), a new approach to self-supervised image representation learning. BYOL relies on two neural networks, referred to as online and target networks, that interact and learn from each other. From an augmented view of an image, we train the online network to predict the target network representation of the same image under a different augmented view. At the same time, we update the target network with a slow-moving average of the online network. While state-of-the art methods rely on negative pairs, BYOL achieves a new state of the art without them. BYOL reaches 74.3% top-1 classification accuracy on ImageNet using a linear evaluation with a ResNet-50 architecture and 79.6% with a larger ResNet. We show that BYOL performs on par or better than the current state of the art on both transfer and semi-supervised benchmarks. Our implementation and pretrained models are given on GitHub. 3 * Equal contribution; the order of first authors was randomly selected.
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胸部X射线(CXR)成像的作用,由于更具成本效益,可广泛可用,并且与CT相比具有更快的获取时间,在Covid-19-19-19大流行期间已经演变。为了提高CXR成像的诊断性能,越来越多的研究研究了监督深度学习方法是否可以提供额外的支持。但是,有监督的方法依靠大量标记的放射学图像,这是一项耗时且复杂的程序,需要专家临床医生的输入。由于COVID-19患者数据的相对稀缺性和昂贵的标签过程,因此,自我监督的学习方法已获得动力,并已提出与完全监督的学习方法相当的结果。在这项工作中,我们研究了从CXR图像诊断Covid-19疾病的背景下,自我监督学习的有效性。我们提出了一个多功能视觉变压器(VIT)引导体系结构,在该体系结构中我们部署了交叉注意机制,以从原始CXR图像和相应增强的局部CXR图像中学习信息。我们通过利用基于局部阶段的增强的CXR图像来进一步改善基线自学学习模型的性能。通过使用10 \%标记的CXR扫描,该模型可实现91.10 \%和96.21 \%的总体精度,总计为35,483 CXR的健康(8,851)(8,851),常规肺炎(6,045)和COVID-19(18,159)(18,159)(18,159)(18,159)(18,159)(18,159)扫描对最新技术的显着改善。代码可用https://github.com/endiqq/multi-feature-vit
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预训练为深入学习支持的X线射线分析中最近的成功奠定了基础。它通过在源域上进行大规模完全监督或自我监督的学习来学习可转移的图像表示。然而,监督的预培训需要复杂和劳动密集的两级人类辅助注释过程,而自我监督的学习不能与监督范例竞争。为了解决这些问题,我们提出了一个跨监督的方法,命名为审查监督(指的)的自由文本报告,该报告从射线照相中获取来自原始放射学报告的自由监督信号。该方法采用了视觉变压器,旨在从每个患者研究中的多种视图中学习联合表示。在极其有限的监督下,引用其在4个众所周知的X射线数据集上的转移学习和自我监督学习对应。此外,甚至是基于具有人辅助结构标签的射线照相的源区的甚至超越方法。因此,有可能取代规范的预训练方法。
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背景和目标:需要分享医疗数据以实现医疗保健信息的跨机构流量并构建高准确的计算机辅助诊断系统。但是,大量的医疗数据集,保存深度卷积神经网络(DCNN)模型的大量记忆以及患者的隐私保护是可能导致医疗数据共享效率低下的问题。因此,本研究提出了一种新型的软标签数据集蒸馏方法,用于医疗数据共享。方法:所提出的方法提炼医疗图像数据的有效信息,并生成几个带有不同数据分布的压缩图像,以供匿名医疗数据共享。此外,我们的方法可以提取DCNN模型的基本权重,以减少保存训练有素的模型以进行有效的医疗数据共享所需的内存。结果:所提出的方法可以将数万张图像压缩为几个软标签图像,并将受过训练的模型的大小减少到其原始大小的几百分之一。蒸馏后获得的压缩图像已在视觉上匿名化;因此,它们不包含患者的私人信息。此外,我们可以通过少量压缩图像实现高检测性能。结论:实验结果表明,所提出的方法可以提高医疗数据共享的效率和安全性。
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医学图像分析的申请遭受了医学专家正确注释的大量数据的急性短缺。监督的学习算法需要大量平衡数据才能学习稳健的表示。经常有监督的学习算法需要各种技术来处理不平衡的数据。另一方面,自我监督的学习算法在数据中是强大的,并且能够学习强大的表示。在这项工作中,我们使用梯度积累技术训练3D BYOL自制模型,以处理自我监督算法中通常需要的批处理中的大量样品。据我们所知,这项工作是该领域中第一个此类工作之一。我们比较了通过当代自我监督预训练的预训练方法以及用动力学400预训练的预训练的RESNET3D-18比较通过实验在ACL泪受损伤检测的下游任务中获得的结果。从下游任务实验中,很明显,所提出的框架优于现有基线。
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新的冠状病毒造成了超过一百万的死亡,并继续迅速传播。这种病毒靶向肺部,导致呼吸窘迫,这可以轻度或严重。肺的X射线或计算机断层扫描(CT)图像可以揭示患者是否感染Covid-19。许多研究人员正在尝试使用人工智能改善Covid-19检测。我们的动机是开发一种可以应对的自动方法,该方法可以应对标记数据的方案是耗时或昂贵的。在本文中,我们提出了使用依赖于Sobel边缘检测和生成对冲网络(GANS)的有限标记数据(SCLLD)的半监督分类来自动化Covid-19诊断。 GaN鉴别器输出是一种概率值,用于在这项工作中进行分类。建议的系统使用从Omid Hosparing收集的10,000 CT扫描培训,而公共数据集也用于验证我们的系统。将该方法与其他最先进的监督方法进行比较,例如高斯过程。据我们所知,这是第一次提出了对Covid-19检测的半监督方法。我们的系统能够从有限标记和未标记数据的混合学习,该数据由于缺乏足够量的标记数据而导致的监督学习者失败。因此,我们的半监督训练方法显着优于卷积神经网络(CNN)的监督培训,当标记的训练数据稀缺时。在精度,敏感性和特异性方面,我们的方法的95%置信区间分别为99.56±0.20%,99.88±0.24%和99.40±0.1.18%,而CNN的间隔(训练有素的监督)为68.34 + - 4.11%,91.2 + - 6.15%,46.40 + - 5.21%。
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高质量注释的医学成像数据集的稀缺性是一个主要问题,它与医学成像分析领域的机器学习应用相撞并阻碍了其进步。自我监督学习是一种最近的培训范式,可以使学习强大的表示无需人类注释,这可以被视为有效的解决方案,以解决带注释的医学数据的稀缺性。本文回顾了自我监督学习方法的最新研究方向,用于图像数据,并将其专注于其在医学成像分析领域的应用。本文涵盖了从计算机视野领域的最新自我监督学习方法,因为它们适用于医学成像分析,并将其归类为预测性,生成性和对比性方法。此外,该文章涵盖了40个在医学成像分析中自学学习领域的最新研究论文,旨在阐明该领域的最新创新。最后,本文以该领域的未来研究指示结束。
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Pneumonia, a respiratory infection brought on by bacteria or viruses, affects a large number of people, especially in developing and impoverished countries where high levels of pollution, unclean living conditions, and overcrowding are frequently observed, along with insufficient medical infrastructure. Pleural effusion, a condition in which fluids fill the lung and complicate breathing, is brought on by pneumonia. Early detection of pneumonia is essential for ensuring curative care and boosting survival rates. The approach most usually used to diagnose pneumonia is chest X-ray imaging. The purpose of this work is to develop a method for the automatic diagnosis of bacterial and viral pneumonia in digital x-ray pictures. This article first presents the authors' technique, and then gives a comprehensive report on recent developments in the field of reliable diagnosis of pneumonia. In this study, here tuned a state-of-the-art deep convolutional neural network to classify plant diseases based on images and tested its performance. Deep learning architecture is compared empirically. VGG19, ResNet with 152v2, Resnext101, Seresnet152, Mobilenettv2, and DenseNet with 201 layers are among the architectures tested. Experiment data consists of two groups, sick and healthy X-ray pictures. To take appropriate action against plant diseases as soon as possible, rapid disease identification models are preferred. DenseNet201 has shown no overfitting or performance degradation in our experiments, and its accuracy tends to increase as the number of epochs increases. Further, DenseNet201 achieves state-of-the-art performance with a significantly a smaller number of parameters and within a reasonable computing time. This architecture outperforms the competition in terms of testing accuracy, scoring 95%. Each architecture was trained using Keras, using Theano as the backend.
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随着Covid-19在世界范围内的传播,需要快速,精确的自动分诊机制,以减少人类的努力,例如用于基于图像的诊断。尽管文献在这个方向上显示出了有希望的努力,但报告的结果并未考虑在不同情况下获得的CT扫描的可变性,因此,渲染模型不适合使用,例如使用例如使用例如不同的扫描仪技术。虽然现在可以使用PCR测试有效地进行COVID-19诊断,但该用例却例证了一种方法来克服数据可变性问题以使医疗图像分析模型更广泛地适用。在本文中,我们使用COVID-19诊断的示例明确解决了可变性问题,并提出了一种新颖的生成方法,旨在消除例如成像技术同时通过利用深度自动编码器的想法来同时引入CT扫描的最小变化。拟议的预性架构(PrepNet)(i)在多个CT扫描数据集上共同训练,(ii)能够提取改进的判别特征以改善诊断。三个公共数据集(SARS-COVID-2,UCSD COVID-CT,MOSMED)的实验结果表明,我们的模型将交叉数据集的概括提高了高达$ 11.84 $ $的百分比,尽管数据集绩效中的情况略有下降。
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COVID-19的诊断对于预防和控制该疾病是必要的。深度学习方法已被认为是一种快速准确的方法。在本文中,通过三个众所周知的预训练网络的平行组合,我们试图将感染的冠状病毒样品与健康样本区分开。负模样损耗函数已用于模型训练。SARS-COV-2数据集中的CT扫描图像用于诊断。SARS-COV-2数据集包含2482张肺CT扫描图像,其中1252张图像属于COVID-19感染的样品。提出的模型接近97%的准确性。
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为医学图像评估构建准确和强大的人工智能系统,不仅需要高级深度学习模型的研究和设计,还需要创建大型和策划的注释训练示例。然而,构造这种数据集通常非常昂贵 - 由于注释任务的复杂性和解释医学图像所需的高度专业知识(例如,专家放射科医师)。为了对此限制来说,我们提出了一种基于对比学习和在线特征聚类的丰富图像特征自我监督学习方法。为此目的,我们利用各种方式的大超过100,000,000个医学图像的大型训练数据集,包括放射线照相,计算机断层扫描(CT),磁共振(MR)成像和超声检查。我们建议使用这些功能来指导在各种下游任务的监督和混合自我监督/监督制度的模型培训。我们突出了这种策略对射线照相,CT和MR:1的挑战性图像评估问题的许多优点,与最先进的(例如,检测3-7%的AUC升压为3-7%胸部射线照相扫描的异常和脑CT的出血检测); 2)与使用无预先训练(例如,83%,在培训MR扫描MR扫描中的脑转移的模型时,在训练期间训练期间的模型收敛在训练期间的培训期高达85%。 3)对各种图像增强的鲁棒性增加,例如在场中看到的数据变化的强度变化,旋转或缩放反射。
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We introduce Bootstrap Your Own Latent (BYOL), a new approach to selfsupervised image representation learning. BYOL relies on two neural networks, referred to as online and target networks, that interact and learn from each other. From an augmented view of an image, we train the online network to predict the target network representation of the same image under a different augmented view. At the same time, we update the target network with a slow-moving average of the online network. While state-of-the art methods rely on negative pairs, BYOL achieves a new state of the art without them. BYOL reaches 74.3% top-1 classification accuracy on ImageNet using a linear evaluation with a ResNet-50 architecture and 79.6% with a larger ResNet. We show that BYOL performs on par or better than the current state of the art on both transfer and semi-supervised benchmarks. Our implementation and pretrained models are given on GitHub. 3 * Equal contribution; the order of first authors was randomly selected. 3
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监督学习可以学习大型代表性空间,这对于处理困难的学习任务至关重要。然而,由于模型的设计,经典图像分类方法争取在处理小型数据集时概括为新的问题和新情况。事实上,监督学习可能失去图像特征的位置,这导致在非常深刻的架构中的监督崩溃。在本文中,我们调查了如何有效地对未标记数据的强大和充分增强的自我监督,可以有效地培训神经网络的第一层,甚至比监督学习更好,无需数百万标记的数据。主要目标是通过获取通用任务 - 不可知的低级功能来断开像素数据与注释的连接。此外,我们调查视觉变形金刚(VIV)并表明,从自我监督架构中得出的低级功能可以提高这种紧急架构的鲁棒性和整体性能。我们在最小的开源数据集STL-​​10上评估了我们的方法,当从自我监督的学习架构输入到vit而不是原始时,我们获得了从41.66%的显着提升到83.25%。图片。
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