目的:本研究旨在开发一种基于深入的学习工具,可以用胸部射线照片检测和定位肺结节(CXRS)。我们预期提高CXR的解释效率,降低肺癌延迟诊断的可能性。材料和方法:我们从Nckuh数据库和VBD收集了CXR,一个开源医学图像数据集,作为我们的培训和验证数据。来自卫生部和福利部的许多CXRS(MoHW)数据库服务于我们的测试数据。我们建立了一个分割模型,以识别CXRS的肺区,并将它们切成16个补丁。医生通过单击修补程序标记CXR。然后使用这些标记的贴片来培训和微调深神经网络(DNN)模型,将贴片分类为正或负片。最后,我们用来自MoHW的CXR肺补丁来测试DNN模型。结果:我们的分割模型从整个CXR鉴定了肺部地区。地面真理与分割结果之间的联盟(iou)的交叉点数为0.9228。此外,我们的DNN模型达到了0.81的敏感性,0.82的特异性,0.82分,98例为0.869的菌射。对于其他27个困难的病例,敏感性为0.54,特异性0.494和Auroc 0.682。总体而言,我们获得了0.78,特异性0.79的敏感性,Auroc 0.837。结论:我们的两步工作流程与来自CXRS定位肺结节的敏感性和特异性的最先进的算法相当。值得注意的是,我们的工作流程为专家提供了一种有效的方式来标记数据,这对于相关的研究是有价值的,因为标记的医学图像数据的相对罕见。
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肺癌近年来一直是最普遍的疾病之一。根据该领域的研究,每年在美国确定超过20万个案件。不受控制的繁殖和肺细胞的生长导致恶性肿瘤形成。最近,深入学习算法,特别是卷积神经网络(CNN),已成为自动诊断疾病的高级方式。本文的目的是审查不同的模型,导致诊断早期肺癌的不同准确性和敏感性,并帮助该领域的医生和研究人员。这项工作的主要目的是确定基于深度学习的肺癌存在的挑战。经过系统地编写了调查,这些调查结合了定期的映射和文献综述,从2016年到2021年审查该领域的32次会议和期刊文章。在分析和审查条款后,正在回答条款中提出的问题。由于对相关文章的完全审查和系统化,本领域,这项研究优于该领域的其他综述文章。
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最近的人工智能(AI)算法已在各种医学分类任务上实现了放射科医生级的性能。但是,只有少数研究涉及CXR扫描异常发现的定位,这对于向放射学家解释图像级分类至关重要。我们在本文中介绍了一个名为Vindr-CXR的可解释的深度学习系统,该系统可以将CXR扫描分类为多种胸部疾病,同时将大多数类型的关键发现本地化在图像上。 Vindr-CXR接受了51,485次CXR扫描的培训,并通过放射科医生提供的边界盒注释进行了培训。它表现出与经验丰富的放射科医生相当的表现,可以在3,000张CXR扫描的回顾性验证集上对6种常见的胸部疾病进行分类,而在接收器操作特征曲线(AUROC)下的平均面积为0.967(95%置信区间[CI]:0.958---------0.958------- 0.975)。 VINDR-CXR在独立患者队列中也得到了外部验证,并显示出其稳健性。对于具有14种类型病变的本地化任务,我们的自由响应接收器操作特征(FROC)分析表明,VINDR-CXR以每扫描确定的1.0假阳性病变的速率达到80.2%的敏感性。还进行了一项前瞻性研究,以衡量VINDR-CXR在协助六名经验丰富的放射科医生方面的临床影响。结果表明,当用作诊断工具时,提出的系统显着改善了放射科医生本身之间的一致性,平均Fleiss的Kappa的同意增加了1.5%。我们还观察到,在放射科医生咨询了Vindr-CXR的建议之后,在平均Cohen的Kappa中,它们和系统之间的一致性显着增加了3.3%。
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逆转录 - 聚合酶链反应(RT-PCR)目前是Covid-19诊断中的金标准。然而,它可以花几天来提供诊断,假负率相对较高。成像,特别是胸部计算断层扫描(CT),可以有助于诊断和评估这种疾病。然而,表明标准剂量CT扫描对患者提供了显着的辐射负担,尤其是需要多次扫描的患者。在这项研究中,我们考虑低剂量和超低剂量(LDCT和ULDCT)扫描方案,其减少靠近单个X射线的辐射曝光,同时保持可接受的分辨率以进行诊断目的。由于胸部放射学专业知识可能不会在大流行期间广泛使用,我们使用LDCT / ULDCT扫描的收集的数据集进行人工智能(AI)基础的框架,以研究AI模型可以提供人为级性能的假设。 AI模型使用了两个阶段胶囊网络架构,可以快速对Covid-19,社区获得的肺炎(帽)和正常情况进行分类,使用LDCT / ULDCT扫描。 AI模型实现Covid-19敏感性为89.5%+ - 0.11,帽敏感性为95%+ \ - 0.11,正常情况敏感性(特异性)85.7%+ - 0.16,精度为90%+ \ - 0.06。通过纳入临床数据(人口统计和症状),性能进一步改善了Covid-19敏感性为94.3%+ \ - PM 0.05,帽敏感性为96.7%+ \ - 0.07,正常情况敏感性(特异性)91%+ - 0.09,精度为94.1%+ \ - 0.03。所提出的AI模型基于降低辐射暴露的LDCT / ULDCT扫描来实现人级诊断。我们认为,所提出的AI模型有可能协助放射科医师准确,并迅速诊断Covid-19感染,并帮助控制大流行期间的传输链。
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The devastation caused by the coronavirus pandemic makes it imperative to design automated techniques for a fast and accurate detection. We propose a novel non-invasive tool, using deep learning and imaging, for delineating COVID-19 infection in lungs. The Ensembling Attention-based Multi-scaled Convolution network (EAMC), employing Leave-One-Patient-Out (LOPO) training, exhibits high sensitivity and precision in outlining infected regions along with assessment of severity. The Attention module combines contextual with local information, at multiple scales, for accurate segmentation. Ensemble learning integrates heterogeneity of decision through different base classifiers. The superiority of EAMC, even with severe class imbalance, is established through comparison with existing state-of-the-art learning models over four publicly-available COVID-19 datasets. The results are suggestive of the relevance of deep learning in providing assistive intelligence to medical practitioners, when they are overburdened with patients as in pandemics. Its clinical significance lies in its unprecedented scope in providing low-cost decision-making for patients lacking specialized healthcare at remote locations.
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Deep learning (DL) analysis of Chest X-ray (CXR) and Computed tomography (CT) images has garnered a lot of attention in recent times due to the COVID-19 pandemic. Convolutional Neural Networks (CNNs) are well suited for the image analysis tasks when trained on humongous amounts of data. Applications developed for medical image analysis require high sensitivity and precision compared to any other fields. Most of the tools proposed for detection of COVID-19 claims to have high sensitivity and recalls but have failed to generalize and perform when tested on unseen datasets. This encouraged us to develop a CNN model, analyze and understand the performance of it by visualizing the predictions of the model using class activation maps generated using (Gradient-weighted Class Activation Mapping) Grad-CAM technique. This study provides a detailed discussion of the success and failure of the proposed model at an image level. Performance of the model is compared with state-of-the-art DL models and shown to be comparable. The data and code used are available at https://github.com/aleesuss/c19.
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这项研究的目的是开发一个强大的基于深度学习的框架,以区分Covid-19,社区获得的肺炎(CAP)和基于使用各种方案和放射剂量在不同成像中心获得的胸部CT扫描的正常病例和正常情况。我们表明,虽然我们的建议模型是在使用特定扫描协议仅从一个成像中心获取的相对较小的数据集上训练的,但该模型在使用不同技术参数的多个扫描仪获得的异质测试集上表现良好。我们还表明,可以通过无监督的方法来更新模型,以应对火车和测试集之间的数据移动,并在从其他中心接收新的外部数据集时增强模型的鲁棒性。我们采用了合奏体系结构来汇总该模型的多个版本的预测。为了初始培训和开发目的,使用了171 Covid-19、60 CAP和76个正常情况的内部数据集,其中包含使用恒定的标准辐射剂量扫描方案从一个成像中心获得的体积CT扫描。为了评估模型,我们回顾了四个不同的测试集,以研究数据特征对模型性能的转移的影响。在测试用例中,有与火车组相似的CT扫描,以及嘈杂的低剂量和超低剂量CT扫描。此外,从患有心血管疾病或手术病史的患者中获得了一些测试CT扫描。这项研究中使用的整个测试数据集包含51 covid-19、28 CAP和51例正常情况。实验结果表明,我们提出的框架在所有测试集上的表现良好,达到96.15%的总准确度(95%CI:[91.25-98.74]),COVID-119,COVID-96.08%(95%CI:[86.54-99.5],95%),[86.54-99.5],),,),敏感性。帽敏感性为92.86%(95%CI:[76.50-99.19])。
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2019年12月,一个名为Covid-19的新型病毒导致了迄今为止的巨大因果关系。与新的冠状病毒的战斗在西班牙语流感后令人振奋和恐怖。虽然前线医生和医学研究人员在控制高度典型病毒的传播方面取得了重大进展,但技术也证明了在战斗中的重要性。此外,许多医疗应用中已采用人工智能,以诊断许多疾病,甚至陷入困境的经验丰富的医生。因此,本调查纸探讨了提议的方法,可以提前援助医生和研究人员,廉价的疾病诊断方法。大多数发展中国家难以使用传统方式进行测试,但机器和深度学习可以采用显着的方式。另一方面,对不同类型的医学图像的访问已经激励了研究人员。结果,提出了一种庞大的技术数量。本文首先详细调了人工智能域中传统方法的背景知识。在此之后,我们会收集常用的数据集及其用例日期。此外,我们还显示了采用深入学习的机器学习的研究人员的百分比。因此,我们对这种情况进行了彻底的分析。最后,在研究挑战中,我们详细阐述了Covid-19研究中面临的问题,我们解决了我们的理解,以建立一个明亮健康的环境。
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目的:本研究评估了市售可解释的AI算法在增强临床医生在胸部X射线(CXR)上鉴定肺癌的能力的影响。设计:这项回顾性研究评估了11位临床医生在胸部X光片中检测肺癌的表现,并在有和没有市售的AI算法的帮助下(红点,观察到),预测CXRS可疑的肺癌。根据临床确定的诊断评估了临床医生的表现。设置:该研究分析了NHS医院的匿名患者数据;该数据集由成年患者(18岁及以上)的400张胸部X光片组成,他们在2020年进行了CXR,并提供相应的临床文本报告。参与者:由11位临床医生(放射科医生,放射科医生受训者和报告射线照相师)组成的读者小组参加。主要结果指标:临床医生在CXR上检测肺癌的总体准确性,敏感性,特异性和精度,有或没有AI输入。还评估了有或没有AI输入的临床医生与绩效标准偏差之间的协议率。结果:临床医生对AI算法的使用导致肺部肿瘤检测的总体性能提高,从而达到了在CXR上鉴定出的肺癌的总体增长17.4% ,分别增加了13%和13%的阶段1和2期肺癌的检测,以及临床医生表现的标准化。结论:这项研究在AI算法的临床实用性方面表现出了巨大的希望,可以通过整体改善读者表现来改善早期肺癌诊断和促进健康平等,而不会影响下游成像资源。
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癌症是人体内部异常细胞的无法控制的细胞分裂,可以蔓延到其他身体器官。它是非传染性疾病(NCDS)和NCDS之一,占全世界总死亡人数的71%,而肺癌是女性乳腺癌后第二次诊断的癌症。肺癌的癌症生存率仅为19%。有各种方法用于诊断肺癌,如X射线,CT扫描,PET-CT扫描,支气管镜检查和活组织检查。然而,为了了解基于组织型H和E染色的肺癌亚型,广泛使用,其中染色在从活组织检查中吸入的组织上进行。研究报道,组织学类型与肺癌预后和治疗相关。因此,早期和准确地检测肺癌组织学是一种迫切需要,并且由于其治疗取决于疾病的组织学,分子曲线和阶段的类型,最重要的是分析肺癌的组织病理学图像。因此,为了加快肺癌诊断的重要过程,减少病理学家的负担,使用深层学习技术。这些技术表明了在分析癌症组织病变幻灯片的分析中提高了疗效。几项研究报告说,卷积神经网络(CNN)在脑,皮肤,乳腺癌,肺癌等各种癌症类型的组织病理学图片的分类中的重要性。在本研究中,通过使用Reset50,VGG-19,Inception_Resnet_V2和DenSenet进行特征提取和三重态丢失来引导CNN以引导CNN,以引导CNN,以引导CNN使得其增加群集间距离并减少集群内距离。
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随着计算机技术的开发,人工智能已经出现了各种模型。在自然语言处理(NLP)成功之后,变压器模型已应用于计算机视觉(CV)。放射科医生在当今迅速发展的医疗领域中继续面临多重挑战,例如增加工作量和增加的诊断需求。尽管以前有一些常规的肺癌检测方法,但仍需要提高其准确性,尤其是在现实的诊断情况下。本文创造性地提出了一种基于有效变压器的分割方法,并将其应用于医学图像分析。该算法通过分析肺癌数据来完成肺癌分类和细分的任务,并旨在为医务人员提供有效的技术支持。此外,我们在各个方面进行了评估并比较了结果。对于分类任务,通过定期培训和SWIN-B在两项决议中通过预训练的最高准确性可高达82.3%。对于分割任务,我们使用预训练来帮助模型提高实验的准确性。这三个模型的准确性达到95%以上。实验表明该算法可以很好地应用于肺癌分类和分割任务。
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世界目前正在经历持续的传染病大流行病,该传染病是冠状病毒疾病2019(即covid-19),这是由严重的急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-COV-2)引起的。计算机断层扫描(CT)在评估感染的严重程度方面发挥着重要作用,并且还可用于识别这些症状和无症状的Covid-19载体。随着Covid-19患者的累积数量的激增,放射科医师越来越强调手动检查CT扫描。因此,自动化3D CT扫描识别工具的需求量高,因为手动分析对放射科医师耗时,并且它们的疲劳可能导致可能的误判。然而,由于位于不同医院的CT扫描仪的各种技术规范,CT图像的外观可能显着不同,导致许多自动图像识别方法的失败。因此,多域和多扫描仪研究的多域移位问题是不可能对可靠识别和可再现和客观诊断和预后至关重要的至关重要。在本文中,我们提出了Covid-19 CT扫描识别模型即Coronavirus信息融合和诊断网络(CIFD-NET),可以通过新的强大弱监督的学习范式有效地处理多域移位问题。与其他最先进的方法相比,我们的模型可以可靠,高效地解决CT扫描图像中不同外观的问题。
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了解模型预测在医疗保健方面至关重要,以促进模型正确性的快速验证,并防止利用利用混淆变量的模型。我们介绍了体积医学图像中可解释的多种异常分类的挑战新任务,其中模型必须指示用于预测每个异常的区域。为了解决这项任务,我们提出了一个多实例学习卷积神经网络,AxialNet,允许识别每个异常的顶部切片。接下来我们将赫雷库姆纳入注意机制,识别子切片区域。我们证明,对于Axialnet,Hirescam的说明得到保证,以反映所用模型的位置,与Grad-Cam不同,有时突出不相关的位置。使用一种产生忠实解释的模型,我们旨在通过一种新颖的面具损失来改善模型的学习,利用赫克斯克姆和3D允许的区域来鼓励模型仅预测基于器官的异常,其中出现的异常。 3D允许的区域通过新方法,分区自动获得,其组合从放射学报告中提取的位置信息与通过形态图像处理获得的器官分割图。总体而言,我们提出了第一种模型,用于解释容量医学图像中的可解释的多异常预测,然后使用掩模损耗来实现36,316扫描的Rad-Chessct数据集中多个异常的器官定位提高33%,代表状态本领域。这项工作推进了胸部CT卷中多种异常模型的临床适用性。
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肺癌是癌症相关死亡率的主要原因。尽管新技术(例如图像分割)对于改善检测和较早诊断至关重要,但治疗该疾病仍然存在重大挑战。特别是,尽管治愈性分辨率增加,但许多术后患者仍会出现复发性病变。因此,非常需要预后工具,可以更准确地预测患者复发的风险。在本文中,我们探讨了卷积神经网络(CNN)在术前计算机断层扫描(CT)图像中存在的分割和复发风险预测。首先,随着医学图像分割的最新进展扩展,剩余的U-NET用于本地化和表征每个结节。然后,确定的肿瘤将传递给第二个CNN进行复发风险预测。该系统的最终结果是通过随机的森林分类器产生的,该分类器合成具有临床属性的第二个网络的预测。分割阶段使用LIDC-IDRI数据集,并获得70.3%的骰子得分。复发风险阶段使用了国家癌症研究所的NLST数据集,并获得了73.0%的AUC。我们提出的框架表明,首先,自动结节分割方法可以概括地为各种多任务系统提供管道,其次,深度学习和图像处理具有改善当前预后工具的潜力。据我们所知,这是第一个完全自动化的细分和复发风险预测系统。
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人工智能(AI)技术具有重要潜力,可以实现有效,鲁棒和自动的图像表型,包括识别细微图案。基于AI的检测搜索图像空间基于模式和特征来找到兴趣区域。存在一种良性的肿瘤组织学,可以通过使用图像特征的基于AI的分类方法来识别。图像从图像中提取可用于的可覆盖方式,可以通过显式(手工/工程化)和深度辐射谱系框架来探索途径。辐射瘤分析有可能用作非侵入性技术,以准确表征肿瘤,以改善诊断和治疗监测。这项工作介绍基于AI的技术,专注于肿瘤宠物和PET / CT成像,用于不同的检测,分类和预测/预测任务。我们还讨论了所需的努力,使AI技术转换为常规临床工作流程,以及潜在的改进和互补技术,例如在电子健康记录和神经象征性AI技术上使用自然语言处理。
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This paper presents our solution for the 2nd COVID-19 Severity Detection Competition. This task aims to distinguish the Mild, Moderate, Severe, and Critical grades in COVID-19 chest CT images. In our approach, we devise a novel infection-aware 3D Contrastive Mixup Classification network for severity grading. Specifcally, we train two segmentation networks to first extract the lung region and then the inner lesion region. The lesion segmentation mask serves as complementary information for the original CT slices. To relieve the issue of imbalanced data distribution, we further improve the advanced Contrastive Mixup Classification network by weighted cross-entropy loss. On the COVID-19 severity detection leaderboard, our approach won the first place with a Macro F1 Score of 51.76%. It significantly outperforms the baseline method by over 11.46%.
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Despite high global prevalence of hepatic steatosis, no automated diagnostics demonstrated generalizability in detecting steatosis on multiple international datasets. Traditionally, hepatic steatosis detection relies on clinicians selecting the region of interest (ROI) on computed tomography (CT) to measure liver attenuation. ROI selection demands time and expertise, and therefore is not routinely performed in populations. To automate the process, we validated an existing artificial intelligence (AI) system for 3D liver segmentation and used it to purpose a novel method: AI-ROI, which could automatically select the ROI for attenuation measurements. AI segmentation and AI-ROI method were evaluated on 1,014 non-contrast enhanced chest CT images from eight international datasets: LIDC-IDRI, NSCLC-Lung1, RIDER, VESSEL12, RICORD-1A, RICORD-1B, COVID-19-Italy, and COVID-19-China. AI segmentation achieved a mean dice coefficient of 0.957. Attenuations measured by AI-ROI showed no significant differences (p = 0.545) and a reduction of 71% time compared to expert measurements. The area under the curve (AUC) of the steatosis classification of AI-ROI is 0.921 (95% CI: 0.883 - 0.959). If performed as a routine screening method, our AI protocol could potentially allow early non-invasive, non-pharmacological preventative interventions for hepatic steatosis. 1,014 expert-annotated liver segmentations of patients with hepatic steatosis annotations can be downloaded here: https://drive.google.com/drive/folders/1-g_zJeAaZXYXGqL1OeF6pUjr6KB0igJX.
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肺癌是全球癌症死亡的主要原因,肺腺癌是最普遍的肺癌形式。 EGFR阳性肺腺癌已被证明对TKI治疗的反应率很高,这是肺癌分子测试的基本性质。尽管目前的指南考虑必要测试,但很大一部分患者并未常规化,导致数百万的人未接受最佳治疗肺癌。测序是EGFR突变分子测试的黄金标准,但是结果可能需要数周的时间才能回来,这在时间限制的情况下并不理想。能够快速,便宜地检测EGFR突变的替代筛查工具的开发,同时保存组织以进行测序可以帮助减少受比较治疗的患者的数量。我们提出了一种多模式方法,该方法将病理图像和临床变量整合在一起,以预测EGFR突变状态,迄今为止最大的临床队列中的AUC为84%。这样的计算模型可以以很少的额外成本进行大部分部署。它的临床应用可以减少中国接受亚最佳治疗的患者数量53.1%,在美国将高达96.6%的患者减少96.6%。
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我们为Covid-19的快速准确CT(DL-FACT)测试提供了一系列深度学习的计算框架。我们开发了基于CT的DL框架,通过基于DL的CT图像增强和分类来提高Covid-19(加上其变体)的测试速度和准确性。图像增强网络适用于DDNet,短暂的Dennet和基于Deconvolulate的网络。为了展示其速度和准确性,我们在Covid-19 CT图像的几个来源中评估了DL-FARE。我们的结果表明,DL-FACT可以显着缩短几天到几天的周转时间,并提高Covid-19测试精度高达91%。DL-FACT可以用作诊断和监测Covid-19的医学专业人员的软件工具。
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目的:将人工智能(AI)作为第二读者比较胸部X射线(CXR)与两个双性机构的放射科医生的第二读者,并在使用两种不同的模式时评估AI性能:审查)。方法:分析了日本放射科学学会的CXR公共数据库(n = 247),具有各种类型和大小的肺结节。八位放射科医生评估了CXR图像关于肺结节和结节象征的存在。在放射科医生审查之后,AI软件以最高的结节可能性处理并标记了CXR。计算出的精度指标是曲线下的面积(AUC),灵敏度,特异性,F1分数,虚假案例数(FN)以及不同AI模式(自动/辅助)对结节检测准确性的影响。结果:对于放射科医生而言,平均AUC值为0.77 $ \ pm $ 0.07,而平均FN为52.63 $ \ pm $ 17.53(所有研究)和32 $ \ pm $ 11.59(研究包含一个恶性病理的研究= 32%错过的恶性结节的速率)。 AI模式(自动化和辅助)均可平均提高灵敏度(提高14%和12%)和F1得分(5%和6%)和特异性的降低(分别为10%和3%) )。结论:两种AI模式都标记了放射科医生在大量病例中错过的肺结节。 AI作为第二读者具有提高诊断准确性和放射学工作流程的高潜力。 AI可能比放射科医生早期检测到某些肺结核,对患者预后产生了潜在的显着影响。
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