了解模型预测在医疗保健方面至关重要,以促进模型正确性的快速验证,并防止利用利用混淆变量的模型。我们介绍了体积医学图像中可解释的多种异常分类的挑战新任务,其中模型必须指示用于预测每个异常的区域。为了解决这项任务,我们提出了一个多实例学习卷积神经网络,AxialNet,允许识别每个异常的顶部切片。接下来我们将赫雷库姆纳入注意机制,识别子切片区域。我们证明,对于Axialnet,Hirescam的说明得到保证,以反映所用模型的位置,与Grad-Cam不同,有时突出不相关的位置。使用一种产生忠实解释的模型,我们旨在通过一种新颖的面具损失来改善模型的学习,利用赫克斯克姆和3D允许的区域来鼓励模型仅预测基于器官的异常,其中出现的异常。 3D允许的区域通过新方法,分区自动获得,其组合从放射学报告中提取的位置信息与通过形态图像处理获得的器官分割图。总体而言,我们提出了第一种模型,用于解释容量医学图像中的可解释的多异常预测,然后使用掩模损耗来实现36,316扫描的Rad-Chessct数据集中多个异常的器官定位提高33%,代表状态本领域。这项工作推进了胸部CT卷中多种异常模型的临床适用性。
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解释方法有助于开发学习有意义的概念的模型,并避免利用杂散相关性。我们说明了对流行神经网络的先前未被识别的限制解释方法GRAC-CAM:作为梯度平均步骤的副作用,Grad-Cam有时突出显示模型实际使用的位置。为了解决这个问题,我们提出了一种新颖的类特定的解释方法,保证只能突出显示用于制作每个预测的模型的位置。我们证明了亨克斯姆是凸轮的泛化,探索赫什罕与基于梯度的解释方法之间的关系。 Pascal VOC 2012的实验,包括人群源评级,阐述了虽然亨克斯姆的解释忠实地反映了该模型,但Grad-Cam往往会扩大注意力创造更大和更平滑的可视化。总体而言,这项工作进展了卷积神经网络的解释方法,可以帮助开发敏感应用的可靠性模型。
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尽管有无数的同伴审查的论文,证明了新颖的人工智能(AI)基于大流行期间的Covid-19挑战的解决方案,但很少有临床影响。人工智能在Covid-19大流行期间的影响因缺乏模型透明度而受到极大的限制。这种系统审查考察了在大流行期间使用可解释的人工智能(Xai)以及如何使用它可以克服现实世界成功的障碍。我们发现,Xai的成功使用可以提高模型性能,灌输信任在最终用户,并提供影响用户决策所需的值。我们将读者介绍给常见的XAI技术,其实用程序以及其应用程序的具体例子。 XAI结果的评估还讨论了最大化AI的临床决策支持系统的价值的重要步骤。我们说明了Xai的古典,现代和潜在的未来趋势,以阐明新颖的XAI技术的演变。最后,我们在最近出版物支持的实验设计过程中提供了建议的清单。潜在解决方案的具体示例也解决了AI解决方案期间的共同挑战。我们希望本次审查可以作为提高未来基于AI的解决方案的临床影响的指导。
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世界目前正在经历持续的传染病大流行病,该传染病是冠状病毒疾病2019(即covid-19),这是由严重的急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-COV-2)引起的。计算机断层扫描(CT)在评估感染的严重程度方面发挥着重要作用,并且还可用于识别这些症状和无症状的Covid-19载体。随着Covid-19患者的累积数量的激增,放射科医师越来越强调手动检查CT扫描。因此,自动化3D CT扫描识别工具的需求量高,因为手动分析对放射科医师耗时,并且它们的疲劳可能导致可能的误判。然而,由于位于不同医院的CT扫描仪的各种技术规范,CT图像的外观可能显着不同,导致许多自动图像识别方法的失败。因此,多域和多扫描仪研究的多域移位问题是不可能对可靠识别和可再现和客观诊断和预后至关重要的至关重要。在本文中,我们提出了Covid-19 CT扫描识别模型即Coronavirus信息融合和诊断网络(CIFD-NET),可以通过新的强大弱监督的学习范式有效地处理多域移位问题。与其他最先进的方法相比,我们的模型可以可靠,高效地解决CT扫描图像中不同外观的问题。
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人工智能被出现为众多临床应用诊断和治疗决策的有用援助。由于可用数据和计算能力的快速增加,深度神经网络的性能与许多任务中的临床医生相同或更好。为了符合信任AI的原则,AI系统至关重要的是透明,强大,公平和确保责任。由于对决策过程的具体细节缺乏了解,目前的深神经系统被称为黑匣子。因此,需要确保在常规临床工作流中纳入常规神经网络之前的深度神经网络的可解释性。在这一叙述审查中,我们利用系统的关键字搜索和域专业知识来确定已经基于所产生的解释和技术相似性的类型的医学图像分析应用的深度学习模型来确定九种不同类型的可解释方法。此外,我们报告了评估各种可解释方法产生的解释的进展。最后,我们讨论了局限性,提供了利用可解释性方法和未来方向的指导,了解医学成像分析深度神经网络的解释性。
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深度学习的显着成功引起了人们对医学成像诊断的应用的兴趣。尽管最新的深度学习模型在分类不同类型的医学数据方面已经达到了人类水平的准确性,但这些模型在临床工作流程中几乎不采用,这主要是由于缺乏解释性。深度学习模型的黑盒子性提出了制定策略来解释这些模型的决策过程的必要性,从而导致了可解释的人工智能(XAI)主题的创建。在这种情况下,我们对应用于医学成像诊断的XAI进行了详尽的调查,包括视觉,基于示例和基于概念的解释方法。此外,这项工作回顾了现有的医学成像数据集和现有的指标,以评估解释的质量。此外,我们还包括一组基于报告生成的方法的性能比较。最后,还讨论了将XAI应用于医学成像以及有关该主题的未来研究指示的主要挑战。
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最近关于Covid-19的研究表明,CT成像提供了评估疾病进展和协助诊断的有用信息,以及帮助理解疾病。有越来越多的研究,建议使用深度学习来使用胸部CT扫描提供快速准确地定量Covid-19。兴趣的主要任务是胸部CT扫描的肺和肺病变的自动分割,确认或疑似Covid-19患者。在这项研究中,我们使用多中心数据集比较12个深度学习算法,包括开源和内部开发的算法。结果表明,合并不同的方法可以提高肺部分割,二元病变分割和多种子病变分割的总体测试集性能,从而分别为0.982,0.724和0.469的平均骰子分别。将得到的二元病变分段为91.3ml的平均绝对体积误差。通常,区分不同病变类型的任务更加困难,分别具有152mL的平均绝对体积差,分别为整合和磨碎玻璃不透明度为0.369和0.523的平均骰子分数。所有方法都以平均体积误差进行二元病变分割,该分段优于人类评估者的视觉评估,表明这些方法足以用于临床实践中使用的大规模评估。
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每年医生对患者的基于形象的诊断需求越来越大,是最近的人工智能方法可以解决的问题。在这种情况下,我们在医学图像的自动报告领域进行了调查,重点是使用深神经网络的方法,了解:(1)数据集,(2)架构设计,(3)解释性和(4)评估指标。我们的调查确定了有趣的发展,也是留下挑战。其中,目前对生成的报告的评估尤为薄弱,因为它主要依赖于传统的自然语言处理(NLP)指标,这不准确地捕获医疗正确性。
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人工智能(AI)技术具有重要潜力,可以实现有效,鲁棒和自动的图像表型,包括识别细微图案。基于AI的检测搜索图像空间基于模式和特征来找到兴趣区域。存在一种良性的肿瘤组织学,可以通过使用图像特征的基于AI的分类方法来识别。图像从图像中提取可用于的可覆盖方式,可以通过显式(手工/工程化)和深度辐射谱系框架来探索途径。辐射瘤分析有可能用作非侵入性技术,以准确表征肿瘤,以改善诊断和治疗监测。这项工作介绍基于AI的技术,专注于肿瘤宠物和PET / CT成像,用于不同的检测,分类和预测/预测任务。我们还讨论了所需的努力,使AI技术转换为常规临床工作流程,以及潜在的改进和互补技术,例如在电子健康记录和神经象征性AI技术上使用自然语言处理。
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机器学习和计算机视觉技术近年来由于其自动化,适合性和产生惊人结果的能力而迅速发展。因此,在本文中,我们调查了2014年至2022年之间发表的关键研究,展示了不同的机器学习算法研究人员用来分割肝脏,肝肿瘤和肝脉管结构的研究。我们根据感兴趣的组织(肝果,肝肿瘤或肝毒剂)对被调查的研究进行了划分,强调了同时解决多个任务的研究。此外,机器学习算法被归类为受监督或无监督的,如果属于某个方案的工作量很大,则将进一步分区。此外,对文献和包含上述组织面具的网站发现的不同数据集和挑战进行了彻底讨论,强调了组织者的原始贡献和其他研究人员的贡献。同样,在我们的评论中提到了文献中过度使用的指标,这强调了它们与手头的任务的相关性。最后,强调创新研究人员应对需要解决的差距的关键挑战和未来的方向,例如许多关于船舶分割挑战的研究的稀缺性以及为什么需要早日处理他们的缺席。
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最近的人工智能(AI)算法已在各种医学分类任务上实现了放射科医生级的性能。但是,只有少数研究涉及CXR扫描异常发现的定位,这对于向放射学家解释图像级分类至关重要。我们在本文中介绍了一个名为Vindr-CXR的可解释的深度学习系统,该系统可以将CXR扫描分类为多种胸部疾病,同时将大多数类型的关键发现本地化在图像上。 Vindr-CXR接受了51,485次CXR扫描的培训,并通过放射科医生提供的边界盒注释进行了培训。它表现出与经验丰富的放射科医生相当的表现,可以在3,000张CXR扫描的回顾性验证集上对6种常见的胸部疾病进行分类,而在接收器操作特征曲线(AUROC)下的平均面积为0.967(95%置信区间[CI]:0.958---------0.958------- 0.975)。 VINDR-CXR在独立患者队列中也得到了外部验证,并显示出其稳健性。对于具有14种类型病变的本地化任务,我们的自由响应接收器操作特征(FROC)分析表明,VINDR-CXR以每扫描确定的1.0假阳性病变的速率达到80.2%的敏感性。还进行了一项前瞻性研究,以衡量VINDR-CXR在协助六名经验丰富的放射科医生方面的临床影响。结果表明,当用作诊断工具时,提出的系统显着改善了放射科医生本身之间的一致性,平均Fleiss的Kappa的同意增加了1.5%。我们还观察到,在放射科医生咨询了Vindr-CXR的建议之后,在平均Cohen的Kappa中,它们和系统之间的一致性显着增加了3.3%。
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由于深度学习在放射学领域被广泛使用,因此在使用模型进行诊断时,这种模型的解释性越来越成为获得临床医生的信任至关重要的。在这项研究中,使用U-NET架构进行了三个实验集,以改善分类性能,同时通过在训练过程中结合热图生成器来增强与模型相对应的热图。所有实验均使用包含胸部X光片的数据集,来自三个条件之一(“正常”,“充血性心力衰竭(CHF)”和“肺炎”)的相关标签,以及有关放射科医师眼神坐标的数值信息在图像上。引入该数据集的论文(A. Karargyris和Moradi,2021年)开发了一个U-NET模型,该模型被视为这项研究的基线模型,以显示如何将眼目光数据用于多模式培训中的眼睛凝视数据以进行多模式培训以进行多模式训练。解释性改进。为了比较分类性能,测量了接收器操作特征曲线(AUC)下面积的95%置信区间(CI)。最佳方法的AUC为0.913(CI:0.860-0.966)。最大的改进是“肺炎”和“ CHF”类别,基线模型最努力地进行分类,导致AUCS 0.859(CI:0.732-0.957)和0.962(CI:0.933-0.989)。所提出的方法的解码器还能够产生概率掩模,以突出模型分类中确定的图像部分,类似于放射科医生的眼睛凝视数据。因此,这项工作表明,将热图发生器和眼睛凝视信息纳入训练可以同时改善疾病分类,并提供可解释的视觉效果,与放射线医生在进行诊断时如何看待胸部X光片。
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Age-related macular degeneration (AMD) is a degenerative disorder affecting the macula, a key area of the retina for visual acuity. Nowadays, it is the most frequent cause of blindness in developed countries. Although some promising treatments have been developed, their effectiveness is low in advanced stages. This emphasizes the importance of large-scale screening programs. Nevertheless, implementing such programs for AMD is usually unfeasible, since the population at risk is large and the diagnosis is challenging. All this motivates the development of automatic methods. In this sense, several works have achieved positive results for AMD diagnosis using convolutional neural networks (CNNs). However, none incorporates explainability mechanisms, which limits their use in clinical practice. In that regard, we propose an explainable deep learning approach for the diagnosis of AMD via the joint identification of its associated retinal lesions. In our proposal, a CNN is trained end-to-end for the joint task using image-level labels. The provided lesion information is of clinical interest, as it allows to assess the developmental stage of AMD. Additionally, the approach allows to explain the diagnosis from the identified lesions. This is possible thanks to the use of a CNN with a custom setting that links the lesions and the diagnosis. Furthermore, the proposed setting also allows to obtain coarse lesion segmentation maps in a weakly-supervised way, further improving the explainability. The training data for the approach can be obtained without much extra work by clinicians. The experiments conducted demonstrate that our approach can identify AMD and its associated lesions satisfactorily, while providing adequate coarse segmentation maps for most common lesions.
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我们考虑临床应用异常定位问题。虽然深入学习推动了最近的医学成像进展,但许多临床挑战都没有完全解决,限制了其更广泛的使用。虽然最近的方法报告了高的诊断准确性,但医生因普遍缺乏算法决策和解释性而涉及诊断决策的这些算法,这是关注这些算法。解决这个问题的一种潜在方法是进一步培训这些模型,以便除了分类它们之外,除了分类。然而,准确地进行这一临床专家需要大量的疾病定位注释,这是对大多数应用程序来实现昂贵的任务。在这项工作中,我们通过一种新的注意力弱监督算法来解决这些问题,该弱势监督算法包括分层关注挖掘框架,可以以整体方式统一激活和基于梯度的视觉关注。我们的关键算法创新包括明确序号注意约束的设计,实现了以弱监督的方式实现了原则的模型培训,同时还通过本地化线索促进了产生视觉关注驱动的模型解释。在两个大型胸部X射线数据集(NIH Chescx-Ray14和Chexpert)上,我们展示了对现有技术的显着本地化性能,同时也实现了竞争的分类性能。我们的代码可在https://github.com/oyxhust/ham上找到。
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用于头部和颈鳞状细胞癌(HNSCC)的诊断和治疗管理由常规诊断头和颈部计算断层扫描(CT)扫描引导,以识别肿瘤和淋巴结特征。折叠延伸(ECE)是患者的患者生存结果与HNSCC的强烈预测因子。在改变患者的暂存和管理时,必须检测ECE的发生至关重要。目前临床ECE检测依赖于放射科学医生进行的视觉鉴定和病理确认。基于机器学习(ML)的ECE诊断在近年来的潜力上表现出很高的潜力。然而,在大多数基于ML的ECE诊断研究中,手动注释是淋巴结区域的必要数据预处理步骤。此外,本手册注释过程是耗时,劳动密集型和容易出错。因此,在本文中,我们提出了一种梯度映射引导的可解释网络(GMGenet)框架,以自动执行ECE识别而不需要注释的淋巴结区域信息。提出了梯度加权类激活映射(GRAC-CAM)技术,以指导深度学习算法专注于与ECE高度相关的区域。提取信息丰富的兴趣(VoIS),无需标记淋巴结区域信息。在评估中,所提出的方法是使用交叉验证的训练和测试,可分别实现测试精度和90.2%和91.1%的AUC。已经分析了ECE的存在或不存在并与黄金标准组织病理学发现相关。
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We propose a technique for producing 'visual explanations' for decisions from a large class of Convolutional Neural Network (CNN)-based models, making them more transparent and explainable.Our approach -Gradient-weighted Class Activation Mapping (Grad-CAM), uses the gradients of any target concept (say 'dog' in a classification network or a sequence of words in captioning network) flowing into the final convolutional layer to produce a coarse localization map highlighting the important regions in the image for predicting the concept.Unlike previous approaches, Grad-CAM is applicable to a wide variety of CNN model-families: (1) CNNs with fullyconnected layers (e.g. VGG), (2) CNNs used for structured outputs (e.g. captioning), (3) CNNs used in tasks with multimodal inputs (e.g. visual question answering) or reinforcement learning, all without architectural changes or re-training. We combine Grad-CAM with existing fine-grained visualizations to create a high-resolution class-discriminative vi-
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人类生理学中的各种结构遵循特异性形态,通常在非常细的尺度上表达复杂性。这种结构的例子是胸前气道,视网膜血管和肝血管。可以观察到可以观察到可以观察到可以观察到可以观察到空间排列的磁共振成像(MRI),计算机断层扫描(CT),光学相干断层扫描(OCT)等医学成像模式(MRI),计算机断层扫描(CT),可以观察到空间排列的大量2D和3D图像的集合。这些结构在医学成像中的分割非常重要,因为对结构的分析提供了对疾病诊断,治疗计划和预后的见解。放射科医生手动标记广泛的数据通常是耗时且容易出错的。结果,在过去的二十年中,自动化或半自动化的计算模型已成为医学成像的流行研究领域,迄今为止,许多计算模型已经开发出来。在这项调查中,我们旨在对当前公开可用的数据集,细分算法和评估指标进行全面审查。此外,讨论了当前的挑战和未来的研究方向。
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每年有大约4.5亿人受到肺炎的影响,导致250万人死亡。 Covid-19也影响了1.81亿人,这导致了392万人伤亡。如果早期诊断,两种疾病死亡可能会显着降低。然而,目前诊断肺炎(投诉+胸部X射线)和Covid-19(RT-PCR)的方法分别存在专家放射科医生和时间。在深度学习模型的帮助下,可以从胸部X射线或CT扫描立即检测肺炎和Covid-19。这样,诊断肺炎/ Covid-19的过程可以更有效和普遍地制作。在本文中,我们的目标是引出,解释和评估,定性和定量,深入学习方法的主要进步,旨在检测或定位社区获得的肺炎(帽),病毒肺炎和Covid-19从胸部X-的图像光线和CT扫描。作为一个系统的审查,本文的重点在于解释了深度学习模型架构,该架构已经被修改或从划痕,以便WIWTH对概括性的关注。对于每个模型,本文回答了模型所设计的方式的问题,特定模型克服的挑战以及修改模型到所需规格的折衷。还提供了本文描述的所有模型的定量分析,以量化不同模型的有效性与相似的目标。一些权衡无法量化,因此它们在定性分析中明确提到,在整个纸张中完成。通过在一个地方编译和分析大量的研究细节,其中包含所有数据集,模型架构和结果,我们的目标是为对此字段感兴趣的初学者和当前研究人员提供一站式解决方案。
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使用深度学习模型从组织学数据中诊断癌症提出了一些挑战。这些图像中关注区域(ROI)的癌症分级和定位通常依赖于图像和像素级标签,后者需要昂贵的注释过程。深度弱监督的对象定位(WSOL)方法为深度学习模型的低成本培训提供了不同的策略。仅使用图像级注释,可以训练这些方法以对图像进行分类,并为ROI定位进行分类类激活图(CAM)。本文综述了WSOL的​​最先进的DL方法。我们提出了一种分类法,根据模型中的信息流,将这些方法分为自下而上和自上而下的方法。尽管后者的进展有限,但最近的自下而上方法目前通过深层WSOL方法推动了很多进展。早期作品的重点是设计不同的空间合并功能。但是,这些方法达到了有限的定位准确性,并揭示了一个主要限制 - 凸轮的不足激活导致了高假阴性定位。随后的工作旨在减轻此问题并恢复完整的对象。评估和比较了两个具有挑战性的组织学数据集的分类和本地化准确性,对我们的分类学方法进行了评估和比较。总体而言,结果表明定位性能差,特别是对于最初设计用于处理自然图像的通用方法。旨在解决组织学数据挑战的方法产生了良好的结果。但是,所有方法都遭受高假阳性/阴性定位的影响。在组织学中应用深WSOL方法的应用是四个关键的挑战 - 凸轮的激活下/过度激活,对阈值的敏感性和模型选择。
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目的:为全身CT设计多疾病分类扫描使用自动提取标签从放射科文reports.Materials和方法三个不同的器官系统:这项回顾性研究共有12,092例患者(平均年龄57 + - 18; 6172名妇女)包括对模型开发和测试(2012-2017自)。基于规则的算法被用来从12,092患者提取13667身体CT扫描19,225疾病的标签。使用三维DenseVNet,三个器官系统是分段的:肺和胸膜;肝胆;和肾脏及输尿管。对于每个器官,三维卷积神经网络分类没有明显的疾病与四种常见疾病为跨越所有三个模型总共15个不同的标签。测试是在相对于2875个手动导出的参考标签2158个CT体积的子集从2133名患者( - ; 1079名妇女18,平均年龄58 +)进行。性能报告为曲线(AUC)与通过方法德朗95%置信区间下接收器的操作特性的区域。结果:提取的标签说明书验证确认91%横跨15个不同的唱片公司99%的准确率。对于肺和胸膜标签的AUC分别为:肺不张0.77(95%CI:0.74,0.81),结节0.65(0.61,0.69),肺气肿0.89(0.86,0.92),积液0.97(0.96,0.98),并且没有明显的疾病0.89( 0.87,0.91)。对于肝和胆囊的AUC分别为:肝胆钙化0.62(95%CI:0.56,0.67),病变0.73(0.69,0.77),扩张0.87(0.84,0.90),脂肪0.89(0.86,0.92),并且没有明显的疾病0.82( 0.78,0.85)。对于肾脏及输尿管的AUC分别为:石0.83(95%CI:0.79,0.87),萎缩0.92(0.89,0.94),病变0.68(0.64,0.72),囊肿0.70(0.66,0.73),并且没有明显的疾病0.79(0.75 ,0.83)。结论:弱监督深度学习模型能够在多器官系统不同的疾病分类。
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