自动生物医学图像分析的领域至关重要地取决于算法验证的可靠和有意义的性能指标。但是，当前的度量使用通常是不明智的，并且不能反映基本的域名。在这里，我们提出了一个全面的框架，该框架指导研究人员以问题意识的方式选择绩效指标。具体而言，我们专注于生物医学图像分析问题，这些问题可以解释为图像，对象或像素级别的分类任务。该框架首先编译域兴趣 - 目标结构 - ，数据集和算法与输出问题相关的属性的属性与问题指纹相关，同时还将其映射到适当的问题类别，即图像级分类，语义分段，实例，实例细分或对象检测。然后，它指导用户选择和应用一组适当的验证指标的过程，同时使他们意识到与个人选择相关的潜在陷阱。在本文中，我们描述了指标重新加载推荐框架的当前状态，目的是从图像分析社区获得建设性的反馈。当前版本是在由60多个图像分析专家的国际联盟中开发的，将在社区驱动的优化之后公开作为用户友好的工具包提供。

我们提出了连续重复的退火流传输蒙特卡洛（CRAFT），该方法结合了顺序的蒙特卡洛（SMC）采样器（本身是退火重要性采样的概括）与使用归一化流量的变异推断。直接训练了归一化的流量，可用于使用KL差异进行每个过渡，以在退火温度之间运输。使用归一化流/SMC近似值估算了此优化目标。我们从概念上展示并使用多个经验示例，这些示例可以改善退火流运输蒙特卡洛（Arbel等，2021），并在其上建造，也可以在基于马尔可夫链蒙特卡洛（MCMC）基于基于的随机归一化流（Wu等人。2020）。通过将工艺纳入粒子MCMC中，我们表明，这种学识渊博的采样器可以在具有挑战性的晶格场理论示例中获得令人印象深刻的准确结果。

深度学习（DL）模型为各种医学成像基准挑战提供了最先进的性能，包括脑肿瘤细分（BRATS）挑战。然而，局灶性病理多隔室分割（例如，肿瘤和病变子区）的任务特别具有挑战性，并且潜在的错误阻碍DL模型转化为临床工作流程。量化不确定形式的DL模型预测的可靠性，可以实现最不确定的地区的临床审查，从而建立信任并铺平临床翻译。最近，已经引入了许多不确定性估计方法，用于DL医学图像分割任务。开发指标评估和比较不确定性措施的表现将有助于最终用户制定更明智的决策。在本研究中，我们探索并评估在Brats 2019-2020任务期间开发的公制，以对不确定量化量化（Qu-Brats），并旨在评估和排列脑肿瘤多隔室分割的不确定性估计。该公制（1）奖励不确定性估计，对正确断言产生高置信度，以及在不正确的断言处分配低置信水平的估计数，（2）惩罚导致更高百分比的无关正确断言百分比的不确定性措施。我们进一步基准测试由14个独立参与的Qu-Brats 2020的分割不确定性，所有这些都参与了主要的Brats细分任务。总体而言，我们的研究结果证实了不确定性估计提供了分割算法的重要性和互补价值，因此突出了医学图像分析中不确定性量化的需求。我们的评估代码在HTTPS://github.com/ragmeh11/qu-brats公开提供。

我们研究了一类算法，用于在内部级别物镜强烈凸起时求解随机和确定性设置中的彼此优化问题。具体地，我们考虑基于不精确的隐含区分的算法，并且我们利用热门开始策略来摊销精确梯度的估计。然后，我们介绍了一个统一的理论框架，受到奇异的扰动系统（Habets，1974）的研究来分析这种摊销算法。通过使用此框架，我们的分析显示了匹配可以访问梯度无偏见估计的Oracle方法的计算复杂度的算法，从而优于彼此优化的许多现有结果。我们在合成实验中说明了这些发现，并展示了这些算法对涉及几千个变量的超参数优化实验的效率。

深度加强学习的最近成功的大部分是由正常化的政策优化（RPO）算法驱动，具有跨多个域的强大性能。在这家族的方法中，代理经过培训，以在惩罚某些引用或默认策略的行为中的偏差时最大化累积奖励。除了经验的成功外，还有一个强大的理论基础，了解应用于单一任务的RPO方法，与自然梯度，信任区域和变分方法有关。但是，对于多任务设置中的默认策略，对所需属性的正式理解有限，越来越重要的域作为现场转向培训更有能力的代理商。在这里，我们通过将默认策略的质量与其对优化的影响正式链接到其对其影响的效果方面，进行第一步才能填补这种差距。使用这些结果，我们将获得具有强大性能保证的多任务学习的原则性的RPO算法。

尽管自动图像分析的重要性不断增加，但最近的元研究揭示了有关算法验证的主要缺陷。性能指标对于使用的自动算法的有意义，客观和透明的性能评估和验证尤其是关键，但是在使用特定的指标进行给定的图像分析任务时，对实际陷阱的关注相对较少。这些通常与（1）无视固有的度量属性，例如在存在类不平衡或小目标结构的情况下的行为，（2）无视固有的数据集属性，例如测试的非独立性案例和（3）无视指标应反映的实际生物医学领域的兴趣。该动态文档的目的是说明图像分析领域通常应用的性能指标的重要局限性。在这种情况下，它重点介绍了可以用作图像级分类，语义分割，实例分割或对象检测任务的生物医学图像分析问题。当前版本是基于由全球60多家机构的国际图像分析专家进行的关于指标的Delphi流程。

我们介绍了用于生成建模的广义能量模型（GEBM）。这些模型组合了两个训练有素的组件：基本分布（通常是隐式模型），可以在高维空间中学习具有低固有尺寸的数据的支持;和能量功能，优化学习支持的概率质量。能量函数和基座都共同构成了最终模型，与GANS不同，它仅保留基本分布（“发电机”）。通过在学习能量和基础之间交替进行培训GEBMS。我们表明，两种培训阶段都明确定义：通过最大化广义可能性来学习能量，并且由此产生的能源的损失提供了学习基础的信息梯度。可以通过MCMC获得来自训练模型的潜在空间的后部的样品，从而在该空间中找到产生更好的质量样本的区域。经验上，图像生成任务上的GEBM样本比来自学习发电机的图像更好，表明所有其他相同，GEBM将优于同样复杂性的GAN。当使用归一化流作为基础测量时，GEBMS成功地启动密度建模任务，返回相当的性能以直接相同网络的最大可能性。

We investigate the training and performance of generative adversarial networks using the Maximum Mean Discrepancy (MMD) as critic, termed MMD GANs. As our main theoretical contribution, we clarify the situation with bias in GAN loss functions raised by recent work: we show that gradient estimators used in the optimization process for both MMD GANs and Wasserstein GANs are unbiased, but learning a discriminator based on samples leads to biased gradients for the generator parameters. We also discuss the issue of kernel choice for the MMD critic, and characterize the kernel corresponding to the energy distance used for the Cramér GAN critic. Being an integral probability metric, the MMD benefits from training strategies recently developed for Wasserstein GANs. In experiments, the MMD GAN is able to employ a smaller critic network than the Wasserstein GAN, resulting in a simpler and faster-training algorithm with matching performance. We also propose an improved measure of GAN convergence, the Kernel Inception Distance, and show how to use it to dynamically adapt learning rates during GAN training.

Dataset distillation has emerged as a prominent technique to improve data efficiency when training machine learning models. It encapsulates the knowledge from a large dataset into a smaller synthetic dataset. A model trained on this smaller distilled dataset can attain comparable performance to a model trained on the original training dataset. However, the existing dataset distillation techniques mainly aim at achieving the best trade-off between resource usage efficiency and model utility. The security risks stemming from them have not been explored. This study performs the first backdoor attack against the models trained on the data distilled by dataset distillation models in the image domain. Concretely, we inject triggers into the synthetic data during the distillation procedure rather than during the model training stage, where all previous attacks are performed. We propose two types of backdoor attacks, namely NAIVEATTACK and DOORPING. NAIVEATTACK simply adds triggers to the raw data at the initial distillation phase, while DOORPING iteratively updates the triggers during the entire distillation procedure. We conduct extensive evaluations on multiple datasets, architectures, and dataset distillation techniques. Empirical evaluation shows that NAIVEATTACK achieves decent attack success rate (ASR) scores in some cases, while DOORPING reaches higher ASR scores (close to 1.0) in all cases. Furthermore, we conduct a comprehensive ablation study to analyze the factors that may affect the attack performance. Finally, we evaluate multiple defense mechanisms against our backdoor attacks and show that our attacks can practically circumvent these defense mechanisms.

We present a dynamic path planning algorithm to navigate an amphibious rotor craft through a concave time-invariant obstacle field while attempting to minimize energy usage. We create a nonlinear quaternion state model that represents the rotor craft dynamics above and below the water. The 6 degree of freedom dynamics used within a layered architecture to generate motion paths for the vehicle to follow and the required control inputs. The rotor craft has a 3 dimensional map of its surroundings that is updated via limited range onboard sensor readings within the current medium (air or water). Path planning is done via PRM and D* Lite.