3D到2D视网膜血管分割是光学相干断层造影血管造影(OctA)图像中有挑战性的问题。准确的视网膜血管分割对于眼科疾病的诊断和预防是重要的。然而,充分利用Octa卷的3D数据是获得令人满意的分割结果的重要因素。在本文中,我们基于提取富有特征表示提取的注意机制,提出了一种渐进的关注增强网络(PAENET)。具体地,框架包括两个主要部分,三维特征学习路径和二维分割路径。在三维特征学习路径中,我们设计了一种新型自适应池模块(APM),并提出了一种新的四倍注意模块(QAM)。 APM沿着卷的投影方向捕获依赖关系,并学习一系列用于特征融合的池系数,从而有效地减少了特征尺寸。此外,QAM通过捕获四组交叉尺寸依赖性来重新重复该特征,这使得最大限度地使用4D特征张力。在二维分割路径中,为了获取更详细的信息,我们提出了一个特征融合模块(FFM)来将3D信息注入2D路径。同时,我们采用极化的自我关注(PSA)块分别在空间和通道尺寸中模拟语义相互依赖性。在实验上,我们在Octa-500数据集上进行了广泛的实验表明,与以前的方法相比,我们所提出的算法实现了最先进的性能。
translated by 谷歌翻译
光学相干断层扫描(OCT)有助于眼科医生评估黄斑水肿,流体的积累以及微观分辨率的病变。视网膜流体的定量对于OCT引导的治疗管理是必需的,这取决于精确的图像分割步骤。由于对视网膜流体的手动分析是一项耗时,主观和容易出错的任务,因此对快速和健壮的自动解决方案的需求增加了。在这项研究中,提出了一种名为Retifluidnet的新型卷积神经结构,用于多级视网膜流体分割。该模型受益于层次表示使用新的自适应双重注意(SDA)模块的纹理,上下文和边缘特征的学习,多个基于自适应的Skip Connections(SASC)以及一种新颖的多尺度深度自我监督学习(DSL)方案。拟议的SDA模块中的注意机制使该模型能够自动提取不同级别的变形感知表示,并且引入的SASC路径进一步考虑了空间通道相互依存,以串联编码器和解码器单元,从而提高了表示能力。还使用包含加权版本的骰子重叠和基于边缘的连接损失的联合损失函数进行了优化的retifluidnet,其中将多尺度局部损失的几个分层阶段集成到优化过程中。该模型根据三个公开可用数据集进行验证:润饰,Optima和Duke,并与几个基线进行了比较。数据集的实验结果证明了在视网膜OCT分割中提出的模型的有效性,并揭示了建议的方法比现有的最新流体分割算法更有效,以适应各种图像扫描仪器记录的视网膜OCT扫描。
translated by 谷歌翻译
在过去的几年中,卷积神经网络(CNN),尤其是U-NET,一直是医学图像处理时代的流行技术。具体而言,开创性的U-NET及其替代方案成功地设法解决了各种各样的医学图像分割任务。但是,这些体系结构在本质上是不完美的,因为它们无法表现出长距离相互作用和空间依赖性,从而导致具有可变形状和结构的医学图像分割的严重性能下降。针对序列到序列预测的初步提议的变压器已成为替代体系结构,以精确地模拟由自我激进机制辅助的全局信息。尽管设计了可行的设计,但利用纯变压器来进行图像分割目的,可能导致限制的定位容量,导致低级功能不足。因此,一系列研究旨在设计基于变压器的U-NET的强大变体。在本文中,我们提出了Trans-Norm,这是一种新型的深层分割框架,它随同将变压器模块合并为标准U-NET的编码器和跳过连接。我们认为,跳过连接的方便设计对于准确的分割至关重要,因为它可以帮助扩展路径和收缩路径之间的功能融合。在这方面,我们从变压器模块中得出了一种空间归一化机制,以适应性地重新校准跳过连接路径。对医学图像分割的三个典型任务进行了广泛的实验,证明了透气的有效性。代码和训练有素的模型可在https://github.com/rezazad68/transnorm上公开获得。
translated by 谷歌翻译
In this paper, we address the scene segmentation task by capturing rich contextual dependencies based on the self-attention mechanism. Unlike previous works that capture contexts by multi-scale feature fusion, we propose a Dual Attention Network (DANet) to adaptively integrate local features with their global dependencies. Specifically, we append two types of attention modules on top of dilated FCN, which model the semantic interdependencies in spatial and channel dimensions respectively. The position attention module selectively aggregates the feature at each position by a weighted sum of the features at all positions. Similar features would be related to each other regardless of their distances. Meanwhile, the channel attention module selectively emphasizes interdependent channel maps by integrating associated features among all channel maps. We sum the outputs of the two attention modules to further improve feature representation which contributes to more precise segmentation results. We achieve new state-of-theart segmentation performance on three challenging scene segmentation datasets, i.e., Cityscapes, PASCAL Context and COCO Stuff dataset. In particular, a Mean IoU score of 81.5% on Cityscapes test set is achieved without using coarse data. 1 .
translated by 谷歌翻译
深度学习已被广​​泛用于医学图像分割,并且录制了录制了该领域深度学习的成功的大量论文。在本文中,我们使用深层学习技术对医学图像分割的全面主题调查。本文进行了两个原创贡献。首先,与传统调查相比,直接将深度学习的文献分成医学图像分割的文学,并为每组详细介绍了文献,我们根据从粗略到精细的多级结构分类目前流行的文献。其次,本文侧重于监督和弱监督的学习方法,而不包括无监督的方法,因为它们在许多旧调查中引入而且他们目前不受欢迎。对于监督学习方法,我们分析了三个方面的文献:骨干网络的选择,网络块的设计,以及损耗功能的改进。对于虚弱的学习方法,我们根据数据增强,转移学习和交互式分割进行调查文献。与现有调查相比,本调查将文献分类为比例不同,更方便读者了解相关理由,并将引导他们基于深度学习方法思考医学图像分割的适当改进。
translated by 谷歌翻译
Transformer-based models have been widely demonstrated to be successful in computer vision tasks by modelling long-range dependencies and capturing global representations. However, they are often dominated by features of large patterns leading to the loss of local details (e.g., boundaries and small objects), which are critical in medical image segmentation. To alleviate this problem, we propose a Dual-Aggregation Transformer Network called DuAT, which is characterized by two innovative designs, namely, the Global-to-Local Spatial Aggregation (GLSA) and Selective Boundary Aggregation (SBA) modules. The GLSA has the ability to aggregate and represent both global and local spatial features, which are beneficial for locating large and small objects, respectively. The SBA module is used to aggregate the boundary characteristic from low-level features and semantic information from high-level features for better preserving boundary details and locating the re-calibration objects. Extensive experiments in six benchmark datasets demonstrate that our proposed model outperforms state-of-the-art methods in the segmentation of skin lesion images, and polyps in colonoscopy images. In addition, our approach is more robust than existing methods in various challenging situations such as small object segmentation and ambiguous object boundaries.
translated by 谷歌翻译
大多数现有的基于深度学习的方法用于血管分割的方法忽略了视网膜血管的两个重要方面,一个是船只的定向信息,另一个是整个基底区域的上下文信息。在本文中,我们提出了一个强大的方向和上下文纠缠的网络(称为OCE-NET),该网络具有提取血管的复杂方向和上下文信息的能力。为了实现复杂的方向,提出了动态复杂方向意识卷积(DCOA Conv),以提取具有多种取向的复杂血管,以改善血管连续性。为了同时捕获全球上下文信息并强调重要的本地信息,开发了一个全球和局部融合模块(GLFM),以同时对船舶的长距离依赖性进行建模,并将足够的关注放在局部薄船上。提出了一种新颖的方向和上下文纠缠的非本地(OCE-NL)模块,以将方向和上下文信息纠缠在一起。此外,提出了不平衡的注意模块(UARM)来处理背景,厚和薄容器的不平衡像素数量。在几个常用的数据集(驱动器,凝视和ChasceB1)和一些更具挑战性的数据集(AV Wide,UOA-DR,RFMID和UK BioBANK)上进行了广泛的实验。消融研究表明,所提出的方法在保持薄血管的连续性方面取得了有希望的性能,比较实验表明,我们的OCE-NET可以在视网膜血管分割上实现最新性能。
translated by 谷歌翻译
现代的高性能语义分割方法采用沉重的主链和扩张的卷积来提取相关特征。尽管使用上下文和语义信息提取功能对于分割任务至关重要,但它为实时应用程序带来了内存足迹和高计算成本。本文提出了一种新模型,以实现实时道路场景语义细分的准确性/速度之间的权衡。具体来说,我们提出了一个名为“比例吸引的条带引导特征金字塔网络”(s \ textsuperscript {2} -fpn)的轻巧模型。我们的网络由三个主要模块组成:注意金字塔融合(APF)模块,比例吸引条带注意模块(SSAM)和全局特征Upsample(GFU)模块。 APF采用了注意力机制来学习判别性多尺度特征,并有助于缩小不同级别之间的语义差距。 APF使用量表感知的关注来用垂直剥离操作编码全局上下文,并建模长期依赖性,这有助于将像素与类似的语义标签相关联。此外,APF还采用频道重新加权块(CRB)来强调频道功能。最后,S \ TextSuperScript {2} -fpn的解码器然后采用GFU,该GFU用于融合APF和编码器的功能。已经对两个具有挑战性的语义分割基准进行了广泛的实验,这表明我们的方法通过不同的模型设置实现了更好的准确性/速度权衡。提出的模型已在CityScapes Dataset上实现了76.2 \%miou/87.3fps,77.4 \%miou/67fps和77.8 \%miou/30.5fps,以及69.6 \%miou,71.0 miou,71.0 \%miou,和74.2 \%\%\%\%\%\%。 miou在Camvid数据集上。这项工作的代码将在\ url {https://github.com/mohamedac29/s2-fpn提供。
translated by 谷歌翻译
Covid-19的传播给世界带来了巨大的灾难,自动分割感染区域可以帮助医生快速诊断并减少工作量。但是,准确和完整的分割面临一些挑战,例如散射的感染区分布,复杂的背景噪声和模糊的分割边界。为此,在本文中,我们提出了一个新的网络,用于从CT图像(名为BCS-NET)的自动covid-19肺部感染分割,该网络考虑了边界,上下文和语义属性。 BCS-NET遵循编码器架构,更多的设计集中在解码器阶段,该阶段包括三个逐渐边界上下文 - 语义重建(BCSR)块。在每个BCSR块中,注意引导的全局上下文(AGGC)模块旨在通过突出显示重要的空间和边界位置并建模全局上下文依赖性来学习解码器最有价值的编码器功能。此外,语义指南(SG)单元通过在中间分辨率上汇总多规模的高级特征来生成语义指南图来完善解码器特征。广泛的实验表明,我们提出的框架在定性和定量上都优于现有竞争对手。
translated by 谷歌翻译
最新的语义分段方法采用具有编码器解码器架构的U-Net框架。 U-Net仍然具有挑战性,具有简单的跳过连接方案来模拟全局多尺度上下文:1)由于编码器和解码器级的不兼容功能集的问题,并非每个跳过连接设置都是有效的,甚至一些跳过连接对分割性能产生负面影响; 2)原始U-Net比某些数据集上没有任何跳过连接的U-Net更糟糕。根据我们的调查结果,我们提出了一个名为Uctransnet的新分段框架(在U-Net中的提议CTRANS模块),从引导机制的频道视角。具体地,CTRANS模块是U-NET SKIP连接的替代,其包括与变压器(命名CCT)和子模块通道 - 明智的跨关注进行多尺度信道交叉融合的子模块(命名为CCA)以指导熔融的多尺度通道 - 明智信息,以有效地连接到解码器功能以消除歧义。因此,由CCT和CCA组成的所提出的连接能够替换原始跳过连接以解决精确的自动医学图像分割的语义间隙。实验结果表明,我们的UCTRANSNET产生更精确的分割性能,并通过涉及变压器或U形框架的不同数据集和传统架构的语义分割来实现一致的改进。代码:https://github.com/mcgregorwwwww/uctransnet。
translated by 谷歌翻译
大多数息肉分段方法使用CNNS作为其骨干,导致在编码器和解码器之间的信息交换信息时的两个关键问题:1)考虑到不同级别特征之间的贡献的差异; 2)设计有效机制,以融合这些功能。不同于现有的基于CNN的方法,我们采用了一个变压器编码器,它学会了更强大和强大的表示。此外,考虑到息肉的图像采集影响和难以实现的性质,我们介绍了三种新模块,包括级联融合模块(CFM),伪装识别模块(CIM),A和相似性聚集模块(SAM)。其中,CFM用于从高级功能收集息肉的语义和位置信息,而CIM应用于在低级功能中伪装的息肉信息。在SAM的帮助下,我们将息肉区域的像素特征扩展到整个息肉区域的高电平语义位置信息,从而有效地融合了交叉级别特征。所提出的模型名为Polyp-PVT,有效地抑制了特征中的噪声,并显着提高了他们的表现力。在五个广泛采用的数据集上进行了广泛的实验表明,所提出的模型对各种具有挑战性的情况(例如,外观变化,小物体)比现有方法更加强大,并实现了新的最先进的性能。拟议的模型可在https://github.com/dengpingfan/polyp-pvt获得。
translated by 谷歌翻译
人行道表面数据的获取和评估在路面条件评估中起着至关重要的作用。在本文中,提出了一个称为RHA-NET的自动路面裂纹分割的有效端到端网络,以提高路面裂纹分割精度。 RHA-NET是通过将残留块(重阻)和混合注意块集成到编码器架构结构中来构建的。这些重组用于提高RHA-NET提取高级抽象特征的能力。混合注意块旨在融合低级功能和高级功能,以帮助模型专注于正确的频道和裂纹区域,从而提高RHA-NET的功能表现能力。构建并用于训练和评估所提出的模型的图像数据集,其中包含由自设计的移动机器人收集的789个路面裂纹图像。与其他最先进的网络相比,所提出的模型在全面的消融研究中验证了添加残留块和混合注意机制的功能。此外,通过引入深度可分离卷积生成的模型的轻加权版本可以更好地实现性能和更快的处理速度,而U-NET参数数量的1/30。开发的系统可以在嵌入式设备Jetson TX2(25 fps)上实时划分路面裂纹。实时实验拍摄的视频将在https://youtu.be/3xiogk0fig4上发布。
translated by 谷歌翻译
由于不规则的病变界限,病变与背景之间的对比度较差,以及伪影之间的对比度,皮肤病的自动分割是一种具有挑战性的任务。在这项工作中,提出了一种新的卷积神经网络的方法,用于皮肤病变分割。在这项工作中,提出了一种新型多尺度特征提取模块,用于提取更多辨别特征,以处理与复杂的皮肤病变有关的挑战;该模块嵌入在UNET中,替换标准架构中的卷积层。此外,在这项工作中,两个不同的关注机制完善了编码器提取的特征和后ups采样的特征。使用两个公开的数据集进行评估,包括ISBI2017和ISIC2018数据集。该方法报告了ISBI2017数据集中的准确性,召回和JSI,97.5%,94.29%,91.16%,95.92%,95.92%,95.37%,95.37%,91.52%在ISIC2018数据集。它在各个竞争中表现出现有的方法和排名的模型。
translated by 谷歌翻译
卷积神经网络(CNNS)成功地进行了压缩图像感测。然而,由于局部性和重量共享的归纳偏差,卷积操作证明了建模远程依赖性的内在限制。变压器,最初作为序列到序列模型设计,在捕获由于基于自我关注的架构而捕获的全局背景中,即使它可以配备有限的本地化能力。本文提出了一种混合框架,一个混合框架,其集成了从CNN提供的借用的优点以及变压器提供的全局上下文,以获得增强的表示学习。所提出的方法是由自适应采样和恢复组成的端到端压缩图像感测方法。在采样模块中,通过学习的采样矩阵测量图像逐块。在重建阶段,将测量投射到双杆中。一个是用于通过卷积建模邻域关系的CNN杆,另一个是用于采用全球自我关注机制的变压器杆。双分支结构是并发,并且本地特征和全局表示在不同的分辨率下融合,以最大化功能的互补性。此外,我们探索一个渐进的战略和基于窗口的变压器块,以降低参数和计算复杂性。实验结果表明了基于专用变压器的架构进行压缩感测的有效性,与不同数据集的最先进方法相比,实现了卓越的性能。
translated by 谷歌翻译
由于不规则的形状,正常和感染组织之间的各种尺寸和无法区分的边界,仍然是一种具有挑战性的任务,可以准确地在CT图像上进行Covid-19的感染病变。在本文中,提出了一种新的分段方案,用于通过增强基于编码器 - 解码器架构的不同级别的监督信息和融合多尺度特征映射来感染Covid-19。为此,提出了深入的协作监督(共同监督)计划,以指导网络学习边缘和语义的特征。更具体地,首先设计边缘监控模块(ESM),以通过将边缘监督信息结合到初始阶段的下采样的初始阶段来突出显示低电平边界特征。同时,提出了一种辅助语义监督模块(ASSM)来加强通过将掩码监督信息集成到稍后阶段来加强高电平语义信息。然后,通过使用注意机制来扩展高级和低电平特征映射之间的语义间隙,开发了一种注意融合模块(AFM)以融合不同级别的多个规模特征图。最后,在四个各种Covid-19 CT数据集上证明了所提出的方案的有效性。结果表明,提出的三个模块都是有希望的。基于基线(RESUNT),单独使用ESM,ASSM或AFM可以分别将骰子度量增加1.12 \%,1.95 \%,1.63 \%,而在我们的数据集中,通过将三个模型结合在一起可以上升3.97 \% 。与各个数据集的现有方法相比,所提出的方法可以在某些主要指标中获得更好的分段性能,并可实现最佳的泛化和全面的性能。
translated by 谷歌翻译
对医学图像的器官或病变的准确分割对于可靠的疾病和器官形态计量学的可靠诊断至关重要。近年来,卷积编码器解码器解决方案在自动医疗图像分割领域取得了重大进展。由于卷积操作中的固有偏见,先前的模型主要集中在相邻像素形成的局部视觉提示上,但无法完全对远程上下文依赖性进行建模。在本文中,我们提出了一个新型的基于变压器的注意力指导网络,称为Transattunet,其中多层引导注意力和多尺度跳过连接旨在共同增强语义分割体系结构的性能。受到变压器的启发,具有变压器自我注意力(TSA)和全球空间注意力(GSA)的自我意识注意(SAA)被纳入Transattunet中,以有效地学习编码器特征之间的非本地相互作用。此外,我们还使用解码器块之间的其他多尺度跳过连接来汇总具有不同语义尺度的上采样功能。这样,多尺度上下文信息的表示能力就可以增强以产生判别特征。从这些互补组件中受益,拟议的Transattunet可以有效地减轻卷积层堆叠和连续采样操作引起的细节损失,最终提高医学图像的细分质量。来自不同成像方式的多个医疗图像分割数据集进行了广泛的实验表明,所提出的方法始终优于最先进的基线。我们的代码和预培训模型可在以下网址找到:https://github.com/yishuliu/transattunet。
translated by 谷歌翻译
Breast cancer is one of the common cancers that endanger the health of women globally. Accurate target lesion segmentation is essential for early clinical intervention and postoperative follow-up. Recently, many convolutional neural networks (CNNs) have been proposed to segment breast tumors from ultrasound images. However, the complex ultrasound pattern and the variable tumor shape and size bring challenges to the accurate segmentation of the breast lesion. Motivated by the selective kernel convolution, we introduce an enhanced selective kernel convolution for breast tumor segmentation, which integrates multiple feature map region representations and adaptively recalibrates the weights of these feature map regions from the channel and spatial dimensions. This region recalibration strategy enables the network to focus more on high-contributing region features and mitigate the perturbation of less useful regions. Finally, the enhanced selective kernel convolution is integrated into U-net with deep supervision constraints to adaptively capture the robust representation of breast tumors. Extensive experiments with twelve state-of-the-art deep learning segmentation methods on three public breast ultrasound datasets demonstrate that our method has a more competitive segmentation performance in breast ultrasound images.
translated by 谷歌翻译
现有的多尺度解决方案会导致仅增加接受场大小的风险,同时忽略小型接受场。因此,有效构建自适应神经网络以识别各种空间尺度对象是一个具有挑战性的问题。为了解决这个问题,我们首先引入一个新的注意力维度,即除了现有的注意力维度(例如渠道,空间和分支)之外,并提出了一个新颖的选择性深度注意网络,以对称地处理各种视觉中的多尺度对象任务。具体而言,在给定神经网络的每个阶段内的块,即重新连接,输出层次功能映射共享相同的分辨率但具有不同的接收场大小。基于此结构属性,我们设计了一个舞台建筑模块,即SDA,其中包括树干分支和类似SE的注意力分支。躯干分支的块输出融合在一起,以通过注意力分支指导其深度注意力分配。根据提出的注意机制,我们可以动态选择不同的深度特征,这有助于自适应调整可变大小输入对象的接收场大小。这样,跨块信息相互作用会导致沿深度方向的远距离依赖关系。与其他多尺度方法相比,我们的SDA方法结合了从以前的块到舞台输出的多个接受场,从而提供了更广泛,更丰富的有效接收场。此外,我们的方法可以用作其他多尺度网络以及注意力网络的可插入模块,并创造为SDA- $ x $ net。它们的组合进一步扩展了有效的接受场的范围,可以实现可解释的神经网络。我们的源代码可在\ url {https://github.com/qingbeiguo/sda-xnet.git}中获得。
translated by 谷歌翻译
从医用试剂染色图像中分割牙齿斑块为诊断和确定随访治疗计划提供了宝贵的信息。但是,准确的牙菌斑分割是一项具有挑战性的任务,需要识别牙齿和牙齿斑块受到语义腔区域的影响(即,在牙齿和牙齿斑块之间的边界区域中存在困惑的边界)以及实例形状的复杂变化,这些变化均未完全解决。现有方法。因此,我们提出了一个语义分解网络(SDNET),该网络介绍了两个单任务分支,以分别解决牙齿和牙齿斑块的分割,并设计了其他约束,以学习每个分支的特定类别特征,从而促进语义分解并改善该类别的特征牙齿分割的性能。具体而言,SDNET以分裂方式学习了两个单独的分割分支和牙齿的牙齿,以解除它们之间的纠缠关系。指定类别的每个分支都倾向于产生准确的分割。为了帮助这两个分支更好地关注特定类别的特征,进一步提出了两个约束模块:1)通过最大化不同类别表示之间的距离来学习判别特征表示,以了解判别特征表示形式,以减少减少负面影响关于特征提取的语义腔区域; 2)结构约束模块(SCM)通过监督边界感知的几何约束提供完整的结构信息,以提供各种形状的牙菌斑。此外,我们构建了一个大规模的开源染色牙菌斑分割数据集(SDPSEG),该数据集为牙齿和牙齿提供高质量的注释。 SDPSEG数据集的实验结果显示SDNET达到了最新的性能。
translated by 谷歌翻译
Focusing on the complicated pathological features, such as blurred boundaries, severe scale differences between symptoms, background noise interference, etc., in the task of retinal edema lesions joint segmentation from OCT images and enabling the segmentation results more reliable. In this paper, we propose a novel reliable multi-scale wavelet-enhanced transformer network, which can provide accurate segmentation results with reliability assessment. Specifically, aiming at improving the model's ability to learn the complex pathological features of retinal edema lesions in OCT images, we develop a novel segmentation backbone that integrates a wavelet-enhanced feature extractor network and a multi-scale transformer module of our newly designed. Meanwhile, to make the segmentation results more reliable, a novel uncertainty segmentation head based on the subjective logical evidential theory is introduced to generate the final segmentation results with a corresponding overall uncertainty evaluation score map. We conduct comprehensive experiments on the public database of AI-Challenge 2018 for retinal edema lesions segmentation, and the results show that our proposed method achieves better segmentation accuracy with a high degree of reliability as compared to other state-of-the-art segmentation approaches. The code will be released on: https://github.com/LooKing9218/ReliableRESeg.
translated by 谷歌翻译