Lesion segmentation requires both speed and accuracy. In this paper, we propose a simple yet efficient network DSNet, which consists of a encoder based on Transformer and a convolutional neural network(CNN)-based distinct pyramid decoder containing three dual-stream attention (DSA) modules. Specifically, the DSA module fuses features from two adjacent levels through the false positive stream attention (FPSA) branch and the false negative stream attention (FNSA) branch to obtain features with diversified contextual information. We compare our method with various state-of-the-art (SOTA) lesion segmentation methods with several public datasets, including CVC-ClinicDB, Kvasir-SEG, and ISIC-2018 Task 1. The experimental results show that our method achieves SOTA performance in terms of mean Dice coefficient (mDice) and mean Intersection over Union (mIoU) with low model complexity and memory consumption.
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卷积神经网络(CNN)的深度学习体系结构在计算机视野领域取得了杰出的成功。 CNN构建的编码器架构U-Net在生物医学图像分割方面取得了重大突破,并且已在各种实用的情况下应用。但是,编码器部分中每个下采样层和简单堆积的卷积的平等设计不允许U-NET从不同深度提取足够的特征信息。医学图像的复杂性日益增加为现有方法带来了新的挑战。在本文中,我们提出了一个更深层,更紧凑的分裂注意U形网络(DCSAU-NET),该网络有效地利用了基于两个新颖框架的低级和高级语义信息:主要功能保护和紧凑的分裂注意力堵塞。我们评估了CVC-ClinicDB,2018 Data Science Bowl,ISIC-2018和SEGPC-2021数据集的建议模型。结果,DCSAU-NET在联合(MIOU)和F1-SOCRE的平均交点方面显示出比其他最先进的方法(SOTA)方法更好的性能。更重要的是,提出的模型在具有挑战性的图像上表现出了出色的细分性能。我们的工作代码以及更多技术细节,请访问https://github.com/xq141839/dcsau-net。
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Transformer-based models have been widely demonstrated to be successful in computer vision tasks by modelling long-range dependencies and capturing global representations. However, they are often dominated by features of large patterns leading to the loss of local details (e.g., boundaries and small objects), which are critical in medical image segmentation. To alleviate this problem, we propose a Dual-Aggregation Transformer Network called DuAT, which is characterized by two innovative designs, namely, the Global-to-Local Spatial Aggregation (GLSA) and Selective Boundary Aggregation (SBA) modules. The GLSA has the ability to aggregate and represent both global and local spatial features, which are beneficial for locating large and small objects, respectively. The SBA module is used to aggregate the boundary characteristic from low-level features and semantic information from high-level features for better preserving boundary details and locating the re-calibration objects. Extensive experiments in six benchmark datasets demonstrate that our proposed model outperforms state-of-the-art methods in the segmentation of skin lesion images, and polyps in colonoscopy images. In addition, our approach is more robust than existing methods in various challenging situations such as small object segmentation and ambiguous object boundaries.
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在过去的几年中,卷积神经网络(CNN),尤其是U-NET,一直是医学图像处理时代的流行技术。具体而言,开创性的U-NET及其替代方案成功地设法解决了各种各样的医学图像分割任务。但是,这些体系结构在本质上是不完美的,因为它们无法表现出长距离相互作用和空间依赖性,从而导致具有可变形状和结构的医学图像分割的严重性能下降。针对序列到序列预测的初步提议的变压器已成为替代体系结构,以精确地模拟由自我激进机制辅助的全局信息。尽管设计了可行的设计,但利用纯变压器来进行图像分割目的,可能导致限制的定位容量,导致低级功能不足。因此,一系列研究旨在设计基于变压器的U-NET的强大变体。在本文中,我们提出了Trans-Norm,这是一种新型的深层分割框架,它随同将变压器模块合并为标准U-NET的编码器和跳过连接。我们认为,跳过连接的方便设计对于准确的分割至关重要,因为它可以帮助扩展路径和收缩路径之间的功能融合。在这方面,我们从变压器模块中得出了一种空间归一化机制,以适应性地重新校准跳过连接路径。对医学图像分割的三个典型任务进行了广泛的实验,证明了透气的有效性。代码和训练有素的模型可在https://github.com/rezazad68/transnorm上公开获得。
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卷积神经网络(CNN)已成为医疗图像分割任务的共识。但是,由于卷积操作的性质,它们在建模长期依赖性和空间相关性时受到限制。尽管最初开发了变压器来解决这个问题,但它们未能捕获低级功能。相比之下,证明本地和全球特征对于密集的预测至关重要,例如在具有挑战性的环境中细分。在本文中,我们提出了一种新型方法,该方法有效地桥接了CNN和用于医学图像分割的变压器。具体而言,我们使用开创性SWIN变压器模块和一个基于CNN的编码器设计两个多尺度特征表示。为了确保从上述两个表示获得的全局和局部特征的精细融合,我们建议在编码器编码器结构的跳过连接中提出一个双层融合(DLF)模块。在各种医学图像分割数据集上进行的广泛实验证明了Hiformer在计算复杂性以及定量和定性结果方面对其他基于CNN的,基于变压器和混合方法的有效性。我们的代码可在以下网址公开获取:https://github.com/amirhossein-kz/hiformer
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肺癌往往在晚期检测到,导致患者死亡率高。因此,最近的研究集中在早期疾病检测上。肺癌通常首先出现在气道壁的支气管上皮内发生的病变。支气管镜检查是有效无创支气化病变检测的选择程序。特别是,自身荧光支气管镜检查(AFB)区分了正常组织和患病组织的自荧光特性,在AFB视频帧中,病变在AFB视频帧中显得红棕色,而正常组织则为绿色。由于最近的研究表明AFB具有高病变敏感性的能力,因此在标准的支气管镜呼吸道考试中,它已成为一种潜在的关键方法,用于早期肺癌检测。不幸的是,对AFB视频的手动检查非常乏味且容易出错,而有限的努力已花费在可能更健壮的自动AFB病变检测和细分方面。我们提出了一个实时的深度学习体系结构ESFPNET,用于从AFB视频流中对支气管病变的强大检测和分割。该体系结构具有编码器结构,该结构可利用预审计的混合变压器(MIT)编码器和阶段特征金字塔(ESFP)解码器结构。来自肺癌患者气道考试的AFB视频的结果表明,我们的方法分别给出了平均骰子指数和0.782和0.658的IOU值,而处理吞吐量为27帧/秒。这些值优于使用混合变压器或基于CNN的编码器的其他竞争体系结构获得的结果。此外,ETIS-LaribpolypDB数据集的出色性能证明了其对其他域的潜在适用性。
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对医学图像的器官或病变的准确分割对于可靠的疾病和器官形态计量学的可靠诊断至关重要。近年来,卷积编码器解码器解决方案在自动医疗图像分割领域取得了重大进展。由于卷积操作中的固有偏见,先前的模型主要集中在相邻像素形成的局部视觉提示上,但无法完全对远程上下文依赖性进行建模。在本文中,我们提出了一个新型的基于变压器的注意力指导网络,称为Transattunet,其中多层引导注意力和多尺度跳过连接旨在共同增强语义分割体系结构的性能。受到变压器的启发,具有变压器自我注意力(TSA)和全球空间注意力(GSA)的自我意识注意(SAA)被纳入Transattunet中,以有效地学习编码器特征之间的非本地相互作用。此外,我们还使用解码器块之间的其他多尺度跳过连接来汇总具有不同语义尺度的上采样功能。这样,多尺度上下文信息的表示能力就可以增强以产生判别特征。从这些互补组件中受益,拟议的Transattunet可以有效地减轻卷积层堆叠和连续采样操作引起的细节损失,最终提高医学图像的细分质量。来自不同成像方式的多个医疗图像分割数据集进行了广泛的实验表明,所提出的方法始终优于最先进的基线。我们的代码和预培训模型可在以下网址找到:https://github.com/yishuliu/transattunet。
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计算机辅助医学图像分割已广泛应用于诊断和治疗,以获得靶器官和组织的形状和体积的临床有用信息。在过去的几年中,基于卷积神经网络(CNN)的方法(例如,U-Net)占主导地位,但仍遭受了不足的远程信息捕获。因此,最近的工作提出了用于医学图像分割任务的计算机视觉变压器变体,并获得了有希望的表现。这种变压器通过计算配对贴片关系来模拟远程依赖性。然而,它们促进了禁止的计算成本,尤其是在3D医学图像(例如,CT和MRI)上。在本文中,我们提出了一种称为扩张变压器的新方法,该方法在本地和全球范围内交替捕获的配对贴片关系进行自我关注。灵感来自扩张卷积核,我们以扩张的方式进行全球自我关注,扩大接收领域而不增加所涉及的斑块,从而降低计算成本。基于这种扩展变压器的设计,我们构造了一个用于3D医学图像分割的U形编码器解码器分层体系结构。 Synapse和ACDC数据集的实验表明,我们的D-Ager Model从头开始培训,以低计算成本从划痕训练,优于各种竞争力的CNN或基于变压器的分段模型,而不耗时的每训练过程。
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现代的高性能语义分割方法采用沉重的主链和扩张的卷积来提取相关特征。尽管使用上下文和语义信息提取功能对于分割任务至关重要,但它为实时应用程序带来了内存足迹和高计算成本。本文提出了一种新模型,以实现实时道路场景语义细分的准确性/速度之间的权衡。具体来说,我们提出了一个名为“比例吸引的条带引导特征金字塔网络”(s \ textsuperscript {2} -fpn)的轻巧模型。我们的网络由三个主要模块组成:注意金字塔融合(APF)模块,比例吸引条带注意模块(SSAM)和全局特征Upsample(GFU)模块。 APF采用了注意力机制来学习判别性多尺度特征,并有助于缩小不同级别之间的语义差距。 APF使用量表感知的关注来用垂直剥离操作编码全局上下文,并建模长期依赖性,这有助于将像素与类似的语义标签相关联。此外,APF还采用频道重新加权块(CRB)来强调频道功能。最后,S \ TextSuperScript {2} -fpn的解码器然后采用GFU,该GFU用于融合APF和编码器的功能。已经对两个具有挑战性的语义分割基准进行了广泛的实验,这表明我们的方法通过不同的模型设置实现了更好的准确性/速度权衡。提出的模型已在CityScapes Dataset上实现了76.2 \%miou/87.3fps,77.4 \%miou/67fps和77.8 \%miou/30.5fps,以及69.6 \%miou,71.0 miou,71.0 \%miou,和74.2 \%\%\%\%\%\%。 miou在Camvid数据集上。这项工作的代码将在\ url {https://github.com/mohamedac29/s2-fpn提供。
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多尺度表示对于语义细分至关重要。社区目睹了利用多尺度上下文信息的语义分割卷积神经网络(CNN)的蓬勃发展。通过视觉变压器(VIV)的动机是强大的图像分类,最近提出了一些语义分割VITS,其中大多数是令人印象深刻的结果,但以计算经济为代价。在本文中,我们通过窗口注意机制成功地将多尺度表示引入语义分割vit,并进一步提高了性能和效率。为此,我们介绍了大型窗口关注,允许本地窗口在略微计算开销时仅查询大面积的上下文窗口。通过调节上下文区域与查询区域的比率,我们可以在多个尺度上捕获大量窗口注意。此外,采用空间金字塔汇集的框架与大窗口关注合作,这提出了一种名为大型窗口注意空​​间金字塔池(LawinAspp)的新型解码器,用于语义细分vit。我们所产生的Vit,草坪变压器由一个高效的定理视觉变压器(HVT)作为编码器和作为解码器的草坪Appp。实证结果表明,与现有方法相比,草坪变压器提供了提高的效率。草坪变压器进一步为城市景观(84.4 \%Miou),ADE20K(56.2 \%Miou)和Coco-incumate集进行了新的最先进的性能。代码将在https://github.com/yan-hao-tian/lawin发布。
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Semantic segmentation usually benefits from global contexts, fine localisation information, multi-scale features, etc. To advance Transformer-based segmenters with these aspects, we present a simple yet powerful semantic segmentation architecture, termed as IncepFormer. IncepFormer has two critical contributions as following. First, it introduces a novel pyramid structured Transformer encoder which harvests global context and fine localisation features simultaneously. These features are concatenated and fed into a convolution layer for final per-pixel prediction. Second, IncepFormer integrates an Inception-like architecture with depth-wise convolutions, and a light-weight feed-forward module in each self-attention layer, efficiently obtaining rich local multi-scale object features. Extensive experiments on five benchmarks show that our IncepFormer is superior to state-of-the-art methods in both accuracy and speed, e.g., 1) our IncepFormer-S achieves 47.7% mIoU on ADE20K which outperforms the existing best method by 1% while only costs half parameters and fewer FLOPs. 2) Our IncepFormer-B finally achieves 82.0% mIoU on Cityscapes dataset with 39.6M parameters. Code is available:github.com/shendu0321/IncepFormer.
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Transformers have recently gained attention in the computer vision domain due to their ability to model long-range dependencies. However, the self-attention mechanism, which is the core part of the Transformer model, usually suffers from quadratic computational complexity with respect to the number of tokens. Many architectures attempt to reduce model complexity by limiting the self-attention mechanism to local regions or by redesigning the tokenization process. In this paper, we propose DAE-Former, a novel method that seeks to provide an alternative perspective by efficiently designing the self-attention mechanism. More specifically, we reformulate the self-attention mechanism to capture both spatial and channel relations across the whole feature dimension while staying computationally efficient. Furthermore, we redesign the skip connection path by including the cross-attention module to ensure the feature reusability and enhance the localization power. Our method outperforms state-of-the-art methods on multi-organ cardiac and skin lesion segmentation datasets without requiring pre-training weights. The code is publicly available at https://github.com/mindflow-institue/DAEFormer.
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识别息肉对于在计算机辅助临床支持系统中自动分析内窥镜图像的自动分析具有挑战性。已经提出了基于卷积网络(CNN),变压器及其组合的模型,以分割息肉以有希望的结果。但是,这些方法在模拟息肉的局部外观方面存在局限性,或者在解码过程中缺乏用于空间依赖性的多层次特征。本文提出了一个新颖的网络,即结肠形式,以解决这些局限性。 Colonformer是一种编码器架构,能够在编码器和解码器分支上对远程语义信息进行建模。编码器是一种基于变压器的轻量级体系结构,用于在多尺度上建模全局语义关系。解码器是一种层次结构结构,旨在学习多层功能以丰富特征表示。此外,添加了一个新的Skip连接技术,以完善整体地图中的息肉对象的边界以进行精确分割。已经在五个流行的基准数据集上进行了广泛的实验,以进行息肉分割,包括Kvasir,CVC-Clinic DB,CVC-ColondB,CVC-T和Etis-Larib。实验结果表明,我们的结肠构造者在所有基准数据集上的表现优于其他最先进的方法。
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Colonoscopy, currently the most efficient and recognized colon polyp detection technology, is necessary for early screening and prevention of colorectal cancer. However, due to the varying size and complex morphological features of colonic polyps as well as the indistinct boundary between polyps and mucosa, accurate segmentation of polyps is still challenging. Deep learning has become popular for accurate polyp segmentation tasks with excellent results. However, due to the structure of polyps image and the varying shapes of polyps, it is easy for existing deep learning models to overfit the current dataset. As a result, the model may not process unseen colonoscopy data. To address this, we propose a new state-of-the-art model for medical image segmentation, the SSFormer, which uses a pyramid Transformer encoder to improve the generalization ability of models. Specifically, our proposed Progressive Locality Decoder can be adapted to the pyramid Transformer backbone to emphasize local features and restrict attention dispersion. The SSFormer achieves stateof-the-art performance in both learning and generalization assessment.
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We present SegFormer, a simple, efficient yet powerful semantic segmentation framework which unifies Transformers with lightweight multilayer perceptron (MLP) decoders. SegFormer has two appealing features: 1) SegFormer comprises a novel hierarchically structured Transformer encoder which outputs multiscale features. It does not need positional encoding, thereby avoiding the interpolation of positional codes which leads to decreased performance when the testing resolution differs from training. 2) SegFormer avoids complex decoders. The proposed MLP decoder aggregates information from different layers, and thus combining both local attention and global attention to render powerful representations. We show that this simple and lightweight design is the key to efficient segmentation on Transformers. We scale our approach up to obtain a series of models from SegFormer-B0 to SegFormer-B5, reaching significantly better performance and efficiency than previous counterparts. For example, SegFormer-B4 achieves 50.3% mIoU on ADE20K with 64M parameters, being 5× smaller and 2.2% better than the previous best method. Our best model, SegFormer-B5, achieves 84.0% mIoU on Cityscapes validation set and shows excellent zero-shot robustness on Cityscapes-C. Code will be released at: github.com/NVlabs/SegFormer.Preprint. Under review.
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最新的语义分段方法采用具有编码器解码器架构的U-Net框架。 U-Net仍然具有挑战性,具有简单的跳过连接方案来模拟全局多尺度上下文:1)由于编码器和解码器级的不兼容功能集的问题,并非每个跳过连接设置都是有效的,甚至一些跳过连接对分割性能产生负面影响; 2)原始U-Net比某些数据集上没有任何跳过连接的U-Net更糟糕。根据我们的调查结果,我们提出了一个名为Uctransnet的新分段框架(在U-Net中的提议CTRANS模块),从引导机制的频道视角。具体地,CTRANS模块是U-NET SKIP连接的替代,其包括与变压器(命名CCT)和子模块通道 - 明智的跨关注进行多尺度信道交叉融合的子模块(命名为CCA)以指导熔融的多尺度通道 - 明智信息,以有效地连接到解码器功能以消除歧义。因此,由CCT和CCA组成的所提出的连接能够替换原始跳过连接以解决精确的自动医学图像分割的语义间隙。实验结果表明,我们的UCTRANSNET产生更精确的分割性能,并通过涉及变压器或U形框架的不同数据集和传统架构的语义分割来实现一致的改进。代码:https://github.com/mcgregorwwwww/uctransnet。
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多年来,卷积神经网络(CNN)已成为多种计算机视觉任务的事实上的标准。尤其是,基于开创性体系结构(例如具有跳过连接的U形模型)或具有金字塔池的Artous卷积的深度神经网络已针对广泛的医学图像分析任务量身定制。此类架构的主要优点是它们容易拘留多功能本地功能。然而,作为一般共识,CNN无法捕获由于卷积操作的固有性能的内在特性而捕获长期依赖性和空间相关性。另外,从全球信息建模中获利的变压器源于自我发项机制,最近在自然语言处理和计算机视觉方面取得了出色的表现。然而,以前的研究证明,局部和全局特征对于密集预测的深层模型至关重要,例如以不同的形状和配置对复杂的结构进行分割。为此,本文提出了TransDeeplab,这是一种新型的DeepLab样纯变压器,用于医学图像分割。具体而言,我们用移动的窗口利用层次旋转式变形器来扩展DeepLabV3并建模非常有用的空间金字塔池(ASPP)模块。对相关文献的彻底搜索结果是,我们是第一个用基于纯变压器模型对开创性DeepLab模型进行建模的人。关于各种医学图像分割任务的广泛实验证明,我们的方法在视觉变压器和基于CNN的方法的合并中表现出色或与大多数当代作品相提并论,并显着降低了模型复杂性。代码和训练有素的模型可在https://github.com/rezazad68/transdeeplab上公开获得
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基于CNN的方法已经实现了医学图像分割的令人印象深刻的结果,但由于卷积操作的内在局部,它们未能捕获远程依赖性。基于变压器的方法最近在愿景任务中流行,因为它们的远程依赖性和有希望的性能。但是,它缺乏建模本地背景。本文以医学图像分割为例,我们呈现了MissFormer,一种有效和强大的医学图像分割变压器。 MissFormer是具有两个吸引人设计的分层编码器 - 解码器网络:1)通过所提出的增强型变压器块重新设计前馈网络,该熵增强了远程依赖性并补充本地上下文,使得该特征更加辨别。 2)我们提出了增强的变压器上下文网桥,与以前的模拟全局信息的方法不同,所提出的上下文网桥与增强变压器块提取了由我们的层级变压器编码器产生的多尺度特征的远程依赖性和本地语境。由这两个设计驱动,MissFormer显示了捕获更多辨别性依赖性和在医学图像分割中的识别依赖性和上下文的牢固能力。多器官和心脏分割任务的实验表明了我们的错过更优越性,有效性和稳健性,训练了从划伤的痕迹甚至高于想象的最先进方法。核心设计可以推广到其他视觉分段任务。代码已在GitHub上发布:https://github.com/zhifangdeng/missformer
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在广泛的实用应用中,需要进行远程感知的城市场景图像的语义细分,例如土地覆盖地图,城市变化检测,环境保护和经济评估。在深度学习技术的快速发展,卷积神经网络(CNN)的迅速发展。 )多年来一直在语义细分中占主导地位。 CNN采用层次特征表示,证明了局部信息提取的强大功能。但是,卷积层的本地属性限制了网络捕获全局上下文。最近,作为计算机视觉领域的热门话题,Transformer在全球信息建模中展示了其巨大的潜力,从而增强了许多与视觉相关的任务,例如图像分类,对象检测,尤其是语义细分。在本文中,我们提出了一个基于变压器的解码器,并为实时城市场景细分构建了一个类似Unet的变压器(UneTformer)。为了有效的分割,不显示器将轻量级RESNET18选择作为编码器,并开发出有效的全球关注机制,以模拟解码器中的全局和局部信息。广泛的实验表明,我们的方法不仅运行速度更快,而且与最先进的轻量级模型相比,其准确性更高。具体而言,拟议的未显示器分别在无人机和洛夫加数据集上分别达到了67.8%和52.4%的MIOU,而在单个NVIDIA GTX 3090 GPU上输入了512x512输入的推理速度最多可以达到322.4 fps。在进一步的探索中,拟议的基于变压器的解码器与SWIN变压器编码器结合使用,还可以在Vaihingen数据集上实现最新的结果(91.3%F1和84.1%MIOU)。源代码将在https://github.com/wanglibo1995/geoseg上免费获得。
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我们提出Segnext,这是一种简单的卷积网络体系结构,用于语义分割。由于自我注意力在编码空间信息中的效率,基于变压器的最新模型已主导语义分割领域。在本文中,我们表明卷积注意是一种比变形金刚中的自我注意机制更有效的编码上下文信息的方法。通过重新检查成功分割模型所拥有的特征,我们发现了几个关键组件,从而导致分割模型的性能提高。这促使我们设计了一个新型的卷积注意网络,该网络使用廉价的卷积操作。没有铃铛和哨子,我们的Segnext显着提高了先前最先进的方法对流行基准测试的性能,包括ADE20K,CityScapes,Coco-stuff,Pascal VOC,Pascal Context和ISAID。值得注意的是,segnext优于w/ nas-fpn的效率超过lavenet-l2,在帕斯卡VOC 2012测试排行榜上仅使用1/10参数,在Pascal VOC 2012测试排行榜上达到90.6%。平均而言,与具有相同或更少计算的ADE20K数据集上的最新方法相比,Segnext的改进约为2.0%。代码可在https://github.com/uyzhang/jseg(jittor)和https://github.com/visual-cratch-network/segnext(pytorch)获得。
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