我们评估了深度神经网络(DNN)的泛化能力,培训培训,以使用相对较小的混合数据集将胸部X射线分类为Covid-19,正常或肺炎。我们提出了DNN进行肺分段和分类,堆叠分割模块(U-NET),原始中间模块和分类模块(DenSenet201)。为了评估泛化,我们将DNN与外部数据集(来自不同的地方)测试,并使用贝叶斯推理来估计性能度量的概率分布。我们的DNN在外部测试数据集上实现了0.917 AUC,以及没有分割的DENSENET,0.906。贝叶斯推理表示平均准确性为76.1%和[0.695,0.826] 95%HDI(高密度间隔,浓缩95%的公制概率质量),分段,没有分段,71.7%和[0.646,0.786]。我们提出了一种新型DNN评估技术,使用层性相关性传播(LRP)和Brixia得分。 LRP Heatmaps表示放射科医生发现强烈的Covid-19症状和归属高Brixia评分的区域是堆叠DNN分类最重要的。外部验证表现出比内部更小的精度,表明概括在泛化中,分割改善了。外部数据集和LRP分析中的性能表明DNN可以在小型和混合数据集中培训并检测Covid-19。
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这项工作引入了图像分类器的注意机制和相应的深神经网络(DNN)结构,称为ISNET。在训练过程中,ISNET使用分割目标来学习如何找到图像感兴趣的区域并将注意力集中在其上。该提案基于一个新颖的概念,即在说明热图中的背景相关性最小化。它几乎可以应用于任何分类神经网络体系结构,而在运行时没有任何额外的计算成本。能够忽略背景的单个DNN可以替换分段者的通用管道,然后是分类器,更快,更轻。我们测试了ISNET的三种应用:Covid-19和胸部X射线中的结核病检测以及面部属性估计。前两个任务采用了混合培训数据库,并培养了快捷方式学习。通过关注肺部并忽略背景中的偏见来源,ISNET减少了问题。因此,它改善了生物医学分类问题中外部(分布外)测试数据集的概括,超越了标准分类器,多任务DNN(执行分类和细分),注意力门控神经网络以及标准段 - 分类管道。面部属性估计表明,ISNET可以精确地集中在面孔上,也适用于自然图像。 ISNET提出了一种准确,快速和轻的方法,可忽略背景并改善各种领域的概括。
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在过去的几年中,卷积神经网络(CNN)占据了计算机视野的领域,这要归功于它们提取功能及其在分类问题中出色的表现,例如在自动分析X射线中。不幸的是,这些神经网络被认为是黑盒算法,即不可能了解该算法如何实现最终结果。要将这些算法应用于不同领域并测试方法论的工作原理,我们需要使用可解释的AI技术。医学领域的大多数工作都集中在二进制或多类分类问题上。但是,在许多现实生活中,例如胸部X射线射线,可以同时出现不同疾病的放射学迹象。这引起了所谓的“多标签分类问题”。这些任务的缺点是类不平衡,即不同的标签没有相同数量的样本。本文的主要贡献是一种深度学习方法,用于不平衡的多标签胸部X射线数据集。它为当前未充分利用的Padchest数据集建立了基线,并基于热图建立了可解释的AI技术。该技术还包括概率和模型间匹配。我们系统的结果很有希望,尤其是考虑到使用的标签数量。此外,热图与预期区域相匹配,即它们标志着专家将用来做出决定的区域。
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Pneumonia, a respiratory infection brought on by bacteria or viruses, affects a large number of people, especially in developing and impoverished countries where high levels of pollution, unclean living conditions, and overcrowding are frequently observed, along with insufficient medical infrastructure. Pleural effusion, a condition in which fluids fill the lung and complicate breathing, is brought on by pneumonia. Early detection of pneumonia is essential for ensuring curative care and boosting survival rates. The approach most usually used to diagnose pneumonia is chest X-ray imaging. The purpose of this work is to develop a method for the automatic diagnosis of bacterial and viral pneumonia in digital x-ray pictures. This article first presents the authors' technique, and then gives a comprehensive report on recent developments in the field of reliable diagnosis of pneumonia. In this study, here tuned a state-of-the-art deep convolutional neural network to classify plant diseases based on images and tested its performance. Deep learning architecture is compared empirically. VGG19, ResNet with 152v2, Resnext101, Seresnet152, Mobilenettv2, and DenseNet with 201 layers are among the architectures tested. Experiment data consists of two groups, sick and healthy X-ray pictures. To take appropriate action against plant diseases as soon as possible, rapid disease identification models are preferred. DenseNet201 has shown no overfitting or performance degradation in our experiments, and its accuracy tends to increase as the number of epochs increases. Further, DenseNet201 achieves state-of-the-art performance with a significantly a smaller number of parameters and within a reasonable computing time. This architecture outperforms the competition in terms of testing accuracy, scoring 95%. Each architecture was trained using Keras, using Theano as the backend.
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背景和目的:与生物医学分析相结合的人工智能(AI)方法在Pandemics期间具有关键作用,因为它有助于释放来自医疗保健系统和医生的压力压力。由于持续的Covid-19危机在具有茂密的人口和巴西和印度等测试套件中的国家恶化,放射性成像可以作为准确分类Covid-19患者的重要诊断工具,并在适当时期规定必要的治疗。通过这种动机,我们基于使用胸部X射线检测Covid-19感染肺的深度学习架构的研究。数据集:我们共收集了三种不同类标签的2470张图片,即健康的肺,普通肺炎和Covid-19感染的肺炎,其中470个X射线图像属于Covid-19类。方法:我们首先使用直方图均衡技术预处理所有图像,并使用U-Net架构进行它们。然后,VGG-16网络用于从预处理图像中的特征提取,该特征提取通过SMTE过采样技术进一步采样以实现平衡数据集。最后,使用具有10倍交叉验证的支持向量机(SVM)分类器分类类平衡功能,评估精度。结果和结论:我们的新方法结合了众所周知的预处理技术,特征提取方法和数据集平衡方法,使我们在2470 X射线图像的数据集中获得了Covid-19图像的优秀识别率为98% 。因此,我们的模型适用于用于筛选目的的医疗保健设施。
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2019年12月,一个名为Covid-19的新型病毒导致了迄今为止的巨大因果关系。与新的冠状病毒的战斗在西班牙语流感后令人振奋和恐怖。虽然前线医生和医学研究人员在控制高度典型病毒的传播方面取得了重大进展,但技术也证明了在战斗中的重要性。此外,许多医疗应用中已采用人工智能,以诊断许多疾病,甚至陷入困境的经验丰富的医生。因此,本调查纸探讨了提议的方法,可以提前援助医生和研究人员,廉价的疾病诊断方法。大多数发展中国家难以使用传统方式进行测试,但机器和深度学习可以采用显着的方式。另一方面,对不同类型的医学图像的访问已经激励了研究人员。结果,提出了一种庞大的技术数量。本文首先详细调了人工智能域中传统方法的背景知识。在此之后,我们会收集常用的数据集及其用例日期。此外,我们还显示了采用深入学习的机器学习的研究人员的百分比。因此,我们对这种情况进行了彻底的分析。最后,在研究挑战中,我们详细阐述了Covid-19研究中面临的问题,我们解决了我们的理解,以建立一个明亮健康的环境。
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In this paper, deep-learning-based approaches namely fine-tuning of pretrained convolutional neural networks (VGG16 and VGG19), and end-to-end training of a developed CNN model, have been used in order to classify X-Ray images into four different classes that include COVID-19, normal, opacity and pneumonia cases. A dataset containing more than 20,000 X-ray scans was retrieved from Kaggle and used in this experiment. A two-stage classification approach was implemented to be compared to the one-shot classification approach. Our hypothesis was that a two-stage model will be able to achieve better performance than a one-shot model. Our results show otherwise as VGG16 achieved 95% accuracy using one-shot approach over 5-fold of training. Future work will focus on a more robust implementation of the two-stage classification model Covid-TSC. The main improvement will be allowing data to flow from the output of stage-1 to the input of stage-2, where stage-1 and stage-2 models are VGG16 models fine-tuned on the Covid-19 dataset.
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Deep learning (DL) analysis of Chest X-ray (CXR) and Computed tomography (CT) images has garnered a lot of attention in recent times due to the COVID-19 pandemic. Convolutional Neural Networks (CNNs) are well suited for the image analysis tasks when trained on humongous amounts of data. Applications developed for medical image analysis require high sensitivity and precision compared to any other fields. Most of the tools proposed for detection of COVID-19 claims to have high sensitivity and recalls but have failed to generalize and perform when tested on unseen datasets. This encouraged us to develop a CNN model, analyze and understand the performance of it by visualizing the predictions of the model using class activation maps generated using (Gradient-weighted Class Activation Mapping) Grad-CAM technique. This study provides a detailed discussion of the success and failure of the proposed model at an image level. Performance of the model is compared with state-of-the-art DL models and shown to be comparable. The data and code used are available at https://github.com/aleesuss/c19.
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该技术报告建议将深卷卷神经网络用作初步的诊断方法,用于分析来自严重急性呼吸系统症状(SARS)症状的胸部计算机断层扫描图像(SARS)和怀疑的Covid-19疾病,尤其是在延迟时在RT-PCR结果和缺乏紧急护理的情况下,可能会导致严重的暂时,长期或永久性健康损害。该模型接受了83,391张图像的培训,并在15,297张验证,并在22,185个数字上进行了测试,在Cohen's Kappa中获得了98%的F1分数,准确性98.4%,损失为5.09%。与当前的金色标准检查,实时反向转录酶聚合酶链反应(RT-PCR)相比,证明高度准确的自动分类并提供的时间更少。 - o存在相关性\'orio t \'ecnico prop \ 〜oe a fituiliza \ c {c} \ 〜ao de uma de uma de uma de uma de uma de uma de uma rede refolucional refolucional profunda como m \'etodo' tomografia computadorizada tor \'accica em pacientes com sintomas de s \'indrome respirat \'oria aguda grave(srag) ^encia de cuidados ungratees poderia acartar graves danos temer \'arios,\`longo prazo,ou permanentes \ a a sa \'ude。 o Modelo Foi Treinado EM 83.391成像,VILEDADO EM 15.297,E TESTADO EM 22.185 FIGURAS,ATINGINDO PONTUA \ C {C} \ 〜AO no F1-SCORE DE 98%,97,59%EM COHEN KAPPA,98,4%DEACUR,98,4%DEACUR \'acia e 5,09%损失。 atestando uma classifica \ c {c} \ 〜ao aumatizada r \'apida e de alta precis \ 〜ao,e fornecendo resuldo exultado em tempo menor ao ao do exame padr \ 〜Ao-ao-outo atual,o实时反向转移酶聚合酶链链反应(RT-PCR)。
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有必要开发负担得起且可靠的诊断工具,该工具允许包含COVID-19的扩散。已经提出了机器学习(ML)算法来设计支持决策系统以评估胸部X射线图像,事实证明,这些图像可用于检测和评估疾病进展。许多研究文章围绕此主题发表,这使得很难确定未来工作的最佳方法。本文介绍了使用胸部X射线图像应用于COVID-19检测的ML的系统综述,旨在就方法,体系结构,数据库和当前局限性为研究人员提供基线。
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每年有大约4.5亿人受到肺炎的影响,导致250万人死亡。 Covid-19也影响了1.81亿人,这导致了392万人伤亡。如果早期诊断,两种疾病死亡可能会显着降低。然而,目前诊断肺炎(投诉+胸部X射线)和Covid-19(RT-PCR)的方法分别存在专家放射科医生和时间。在深度学习模型的帮助下,可以从胸部X射线或CT扫描立即检测肺炎和Covid-19。这样,诊断肺炎/ Covid-19的过程可以更有效和普遍地制作。在本文中,我们的目标是引出,解释和评估,定性和定量,深入学习方法的主要进步,旨在检测或定位社区获得的肺炎(帽),病毒肺炎和Covid-19从胸部X-的图像光线和CT扫描。作为一个系统的审查,本文的重点在于解释了深度学习模型架构,该架构已经被修改或从划痕,以便WIWTH对概括性的关注。对于每个模型,本文回答了模型所设计的方式的问题,特定模型克服的挑战以及修改模型到所需规格的折衷。还提供了本文描述的所有模型的定量分析,以量化不同模型的有效性与相似的目标。一些权衡无法量化,因此它们在定性分析中明确提到,在整个纸张中完成。通过在一个地方编译和分析大量的研究细节,其中包含所有数据集,模型架构和结果,我们的目标是为对此字段感兴趣的初学者和当前研究人员提供一站式解决方案。
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由于能够提高几个诊断任务的性能,深度神经网络越来越多地被用作医疗保健应用中的辅助工具。然而,由于基于深度学习系统的可靠性,概括性和可解释性的实际限制,这些方法在临床环境中不被广泛采用。因此,已经开发了方法,这在网络培训期间强加了额外的限制,以获得更多的控制,并改善探讨他们在医疗界的接受。在这项工作中,我们调查使用正交球(OS)约束对胸部X射线图像进行Covid-19案例的分类的益处。 OS约束可以写成一个简单的正交性术语,其与分类网络训练期间的标准交叉熵损耗结合使用。以前的研究表明,在对深度学习模型上对这种限制应用于应用这些限制方面表现出显着的益处。我们的研究结果证实了这些观察结果,表明正常性损失函数有效地通过Gradcam可视化,增强的分类性能和减少的模型校准误差产生了改进的语义本地化。我们的方法分别实现了两性和三类分类的准确性提高1.6%和4.8%;找到了应用数据增强的模型的类似结果。除了这些发现之外,我们的工作还提出了OS规范器在医疗保健中的新应用,提高了CoVID-19分类深度学习模型的后HOC可解释性和性能,以便于在临床环境中采用这些方法。我们还确定了我们将来可以探索进一步研究的战略的局限性。
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最近关于Covid-19的研究表明,CT成像提供了评估疾病进展和协助诊断的有用信息,以及帮助理解疾病。有越来越多的研究,建议使用深度学习来使用胸部CT扫描提供快速准确地定量Covid-19。兴趣的主要任务是胸部CT扫描的肺和肺病变的自动分割,确认或疑似Covid-19患者。在这项研究中,我们使用多中心数据集比较12个深度学习算法,包括开源和内部开发的算法。结果表明,合并不同的方法可以提高肺部分割,二元病变分割和多种子病变分割的总体测试集性能,从而分别为0.982,0.724和0.469的平均骰子分别。将得到的二元病变分段为91.3ml的平均绝对体积误差。通常,区分不同病变类型的任务更加困难,分别具有152mL的平均绝对体积差,分别为整合和磨碎玻璃不透明度为0.369和0.523的平均骰子分数。所有方法都以平均体积误差进行二元病变分割,该分段优于人类评估者的视觉评估,表明这些方法足以用于临床实践中使用的大规模评估。
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自从2020年的Covid-19流行病发作以来,数百万人屈服于这种致命的病毒。已经制定了许多尝试来设计一种可以检测到病毒的自动测试方法。全球各地的研究人员提出了基于深度学习的方法,以使用胸部X射线检测Covid-19。但是,在大多数研究人员使用的公开胸部X射线数据集中,已经提出了问题。在本文中,我们提出了一个2分阶段的方法来解决这个主题问题。已经进行了两个实验作为在数据集中出现偏置存在的方法的第1阶段的一部分。随后,已经提出了在方法的第2阶段中提出了一种图像分割,超分辨率和基于CNN的流水线以及不同的图像增强技术,以减少偏置的效果。 InceptionResNetv2在胸部X射线图像上培训,随着直方图均衡而增强,其次通过阶段2中提出的管道时γ校正,为3级(正常,肺炎和Covid-19)分类产生了90.47%的最高精度任务。
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在COVID-19大流行期间,在COVID-19诊断的紧急环境中进行的大量成像量导致临床CXR获取的差异很大。在所使用的CXR投影,添加图像注释以及临床图像的旋转程度和旋转程度中可以看到这种变化。图像分析社区试图通过开发自动化的CoVID-19诊断算法来减轻大流行期间过度拉伸放射学部门的负担,该诊断算法是CXR成像的输入。已利用大量公开的CXR数据集来改善CoVID-19诊断的深度学习算法。然而,公开可用数据集中临床可获得的CXR的可变质量可能会对算法性能产生深远的影响。 COVID-19可以通过图像标签等图像上的非动物特征的算法来推断诊断。这些成像快捷方式可能是数据集特定的,并限制了AI系统的概括性。因此,了解和纠正CXR图像中的关键潜在偏差是CXR图像分析之前的重要第一步。在这项研究中,我们提出了一种简单有效的逐步方法,以预处理Covid-19胸部X射线数据集以消除不希望的偏见。我们进行消融研究以显示每个单个步骤的影响。结果表明,使用我们提出的管道可以将基线共证检测算法的精度提高到13%。
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在对抗Covid-19的斗争中,对人们的生活产生灾难性影响的关键步骤是对患有严重COVID-19症状的诊所中出现的患者进行有效筛查。胸部射线照相是有前途的筛查方法之一。许多研究报告说,使用深度学习准确地检测到胸部X射线射线的Covid-19。对许多已发表的方法的严重局限性是对解释深度学习模型做出的决定的不足。使用可解释的人工智能方法,我们证明模型决策可能依赖于混杂因素而不是医学病理学。在分析了在胸部X射线图像上发现的潜在混杂因素后,我们提出了一种新颖的方法来最大程度地减少其负面影响。我们表明,我们所提出的方法比以前试图应对混杂因素(例如ECG铅的胸部X射线铅)的尝试更强大,这些因素通常会影响模型分类决策。除了强大之外,我们的方法还达到了与最先进的结果相当的结果。源代码和预训练的权重可在(https://github.com/tomek1911/pother)上公开获得。
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本文提出了一种用于图像分类的卷积神经网络(CNN)模型,旨在提高Covid-19诊断的预测性能,同时避免更深,因此更复杂的替代方案。所提出的模型包括四个类似的卷积层,然后是扁平化和两个致密层。这项工作提出了一种基于仅通过2D CNN模型的像素的图像的简单分类2D CT扫描片图像的较差的解决方案。尽管架构中的简单性,所提出的模型在宏F1分数方面,所提出的模型显示出超过最先进的图像上的定量结果超过了相同数据集。在这种情况下,从图像中提取特征,图像的分割部分,或其他更复杂的技术,最终瞄准图像分类,不会产生更好的结果。由此,本文介绍了一个简单而强大的深度学习的自动化Covid-19分类解决方案。
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胸部射线照相是一种相对便宜,广泛的医疗程序,可传达用于进行诊断决策的关键信息。胸部X射线几乎总是用于诊断呼吸系统疾病,如肺炎或最近的Covid-19。在本文中,我们提出了一个自我监督的深神经网络,其在未标记的胸部X射线数据集上掠夺。学习的陈述转移到下游任务 - 呼吸系统疾病的分类。在四个公共数据集获得的结果表明,我们的方法在不需要大量标记的培训数据的情况下产生竞争力。
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在过去的十年中,使用深度学习方法从胸部X光片检测到胸部X光片是一个活跃的研究领域。大多数以前的方法试图通过识别负责对模型预测的重要贡献的空间区域来关注图像的患病器官。相比之下,专家放射科医生在确定这些区域是否异常之前首先找到突出的解剖结构。因此,将解剖学知识纳入深度学习模型可能会带来自动疾病分类的大幅改善。在此激励的情况下,我们提出了解剖学XNET,这是一种基于解剖学注意的胸腔疾病分类网络,该网络优先考虑由预识别的解剖区域引导的空间特征。我们通过利用可用的小规模器官级注释来采用半监督的学习方法,将解剖区域定位在没有器官级注释的大规模数据集中。拟议的解剖学XNET使用预先训练的Densenet-121作为骨干网络,具有两个相应的结构化模块,解剖学意识到($^3 $)和概率加权平均池(PWAP),在凝聚力框架中引起解剖学的关注学习。我们通过实验表明,我们提出的方法通过在三个公开可用的大规模CXR数据集中获得85.78%,92.07%和84.04%的AUC得分来设置新的最先进基准测试。和模拟CXR。这不仅证明了利用解剖学分割知识来改善胸病疾病分类的功效,而且还证明了所提出的框架的普遍性。
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快速准确地检测该疾病可以大大帮助减少任何国家医疗机构对任何大流行期间死亡率降低死亡率的压力。这项工作的目的是使用新型的机器学习框架创建多模式系统,该框架同时使用胸部X射线(CXR)图像和临床数据来预测COVID-19患者的严重程度。此外,该研究还提出了一种基于nom图的评分技术,用于预测高危患者死亡的可能性。这项研究使用了25种生物标志物和CXR图像,以预测意大利第一波Covid-19(3月至6月2020年3月至6月)在930名Covid-19患者中的风险。提出的多模式堆叠技术分别产生了89.03%,90.44%和89.03%的精度,灵敏度和F1分数,以识别低风险或高危患者。与CXR图像或临床数据相比,这种多模式方法可提高准确性6%。最后,使用多元逻辑回归的列线图评分系统 - 用于对第一阶段确定的高风险患者的死亡风险进行分层。使用随机森林特征选择模型将乳酸脱氢酶(LDH),O2百分比,白细胞(WBC)计数,年龄和C反应蛋白(CRP)鉴定为有用的预测指标。开发了五个预测因素参数和基于CXR图像的列函数评分,以量化死亡的概率并将其分为两个风险组:分别存活(<50%)和死亡(> = 50%)。多模式技术能够预测F1评分为92.88%的高危患者的死亡概率。开发和验证队列曲线下的面积分别为0.981和0.939。
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