药物 - 药物相互作用(DDIS)可能会阻碍药物的功能,在最坏的情况下,它们可能导致不良药物反应(ADR)。预测所有DDI是一个具有挑战性且关键的问题。大多数现有的计算模型都集成了来自不同来源的药物中心信息,并利用它们作为机器学习分类器中的功能来预测DDIS。但是,这些模型有很大的失败机会,尤其是对于所有信息都没有可用的新药。本文提出了一个新型的HyperGraph神经网络(HYGNN)模型,仅基于用于DDI预测问题的任何药物的微笑串。为了捕获药物的相似性,我们创建了从微笑字符串中提取的药物的化学子结构中创建的超图。然后,我们开发了由新型的基于注意力的超图边缘编码器组成的HYGNN,以使药物的表示形式和解码器,以预测药物对之间的相互作用。此外,我们进行了广泛的实验,以评估我们的模型并将其与几种最新方法进行比较。实验结果表明,我们提出的HYGNN模型有效地预测了DDI,并以最大的ROC-AUC和PR-AUC分别超过基准,分别为97.9%和98.1%。
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