组织病理学图像提供了癌症诊断的明确来源,其中包含病理学家用来识别和分类恶性疾病的信息,并指导治疗选择。这些图像包含大量信息,其中大部分目前不可用人类的解释。有监督的深度学习方法对于分类任务非常有力,但它们本质上受注释的成本和质量限制。因此,我们开发了组织形态表型学习,这是一种无监督的方法,它不需要注释,并且通过小图像瓷砖中的歧视性图像特征的自我发现进行操作。瓷砖分为形态上相似的簇,这些簇似乎代表了自然选择下出现的肿瘤生长的复发模式。这些簇具有不同的特征,可以使用正交方法识别。应用于肺癌组织,我们表明它们与患者的结局紧密保持一致,组织病理学识别的肿瘤类型和生长模式以及免疫表型的转录组度量。
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机器学习和临床研究社区利用现实世界数据(RWD)的方法,包括电子健康记录中捕获的数据(EHR)截然不同。虽然临床研究人员谨慎使用RWD进行临床研究,但用于医疗团队的ML会消费公共数据集,并以最少的审查来开发新算法。这项研究通过开发和验证ML-DQA来弥合这一差距,ML-DQA是基于RWD最佳实践的数据质量保证框架。 ML-DQA框架适用于两个地理位置的五个ML项目,分别是不同的医疗状况和不同的人群。在这五个项目中,共收集了247,536名患者的RWD,共有2,999项质量检查和24份质量报告。出现了五种可推广的实践:所有项目都使用类似的方法来分组冗余数据元素表示;所有项目都使用自动实用程序来构建诊断和药物数据元素;所有项目都使用了一个共同的基于规则的转换库;所有项目都使用统一的方法将数据质量检查分配给数据元素;所有项目都使用类似的临床裁决方法。包括临床医生,数据科学家和受训者在内的平均有5.8个人参与每个项目实施ML-DQA,每个项目平均进行了23.4个数据元素。这项研究证明了ML-DQA在医疗项目中的重要性作用,并为团队提供了开展这些基本活动的框架。
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读取文本读取序列的确定是对记录理解的基础。在文本组织成一系列行和垂直对准的页面中,可以轻松解决此问题,并运行页面的高度(生成可以从左到右读取的多列)。我们展示了一种情况 - 目录页面解析问题 - 以不规则,视觉组织的二维格式在页面上呈现信息。目录页面在金融招股说明书中相当常见,并携带有关组织,其地址和关系的信息,这是客户在车内客户端的关键。有趣的是,目录页有时有分层结构,激励需要将读取序列概括为读取树。我们向识别目录页面和构建读取树的问题提供解决方案,使用(学习)文本段和自下而上的(向左,左上,顶部顶部)遍历的段的横向。该解决方案是支持从客户端船上文件自动提取组织,地址和关系信息的生产服务的关键部分。
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