研究细胞形态的时间变化对于了解细胞迁移机制至关重要。在这项工作中,我们向基于深度的学习的工作流程到嵌入3D胶原矩阵中的分段癌细胞并与相位对比显微镜进行成像。我们的方法使用转移学习和经常性卷积的长期存储单元来利用过去的时间信息并提供一致的分段结果。最后,我们提出了一种研究癌细胞形态学的几何表征方法。我们的方法及时提供稳定的结果,它对不同的重量初始化或培训数据采样具有强大。我们为2D单元分割和跟踪引入了新的注释数据集,以及打开源实现,以复制实验或使其适应新的图像处理问题。
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