准确的术中诊断对于在脑肿瘤手术期间提供安全有效的护理至关重要。我们的护理标准诊断方法是时间,资源和劳动密集型,限制了获得最佳手术治疗的机会。为了解决这些局限性,我们提出了一种替代工作流程,该工作流程结合了刺激的拉曼组织学(SRH),一种快速的光学成像方法,以及对SRH图像的深层自动解释,用于术中脑肿瘤诊断和实时手术决策支持。在这里,我们介绍了OpenSRH,这是来自300多名脑肿瘤患者和1300多个独特全幻灯片光学图像的第一个公共数据集。 OPENSRH包含来自最常见的脑肿瘤诊断,完整的病理注释,整个幻灯片肿瘤分割,原始和加工的光学成像数据的数据,用于端到端模型的开发和验证。我们为使用弱(即患者级)诊断标签的基于补丁的整个幻灯片分类和推断提供了一个框架。最后,我们基准了两项计算机视觉任务:多类组织学脑肿瘤分类和基于斑块的对比表示学习。我们希望OpenSRH能够促进快速光学成像和基于ML的手术决策支持的临床翻译,以提高精密医学时代的癌症手术的获取,安全性和功效。数据集访问,代码和基准可在opensrh.mlins.org上找到。
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