产生密集的注释数据是医学成像应用的困难而繁琐的任务。为了解决这个问题,我们提出了一种新颖的方法来为半监督语义细分产生监督。我们认为标记和未标记的图像之间的视觉上类似的区域可能包含相同的语义,因此应分享其标签。在此思想之后,我们使用少量标记的图像作为参考材料,并将未标记图像中的像素匹配到参考集中的最佳配合像素的语义。这样,我们避免诸如确认偏差的陷阱,纯粹是基于预测的伪标记。由于我们的方法不需要任何架构更改或伴随网络,因此可以轻松地将其插入现有框架中。我们在X射线解剖分段上实现了与标准完全监督模型相同的性能,尽管标记图像较少95%。除了对我们提出的方法的不同方面的深入分析,我们还通过比较我们对现有方法的方法对具有竞争性能的视网膜流体细分的现有方法来展示我们的参考引导学习范例的有效性,因为我们改进最近的工作15%的意思是iou。
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在许多图像引导的临床方法中,医学图像分割是一个基本和关键的步骤。基于深度学习的细分方法的最新成功通常取决于大量标记的数据,这特别困难且昂贵,尤其是在医学成像领域中,只有专家才能提供可靠和准确的注释。半监督学习已成为一种吸引人的策略,并广泛应用于医学图像分割任务,以训练注释有限的深层模型。在本文中,我们对最近提议的半监督学习方法进行了全面综述,并总结了技术新颖性和经验结果。此外,我们分析和讨论现有方法的局限性和几个未解决的问题。我们希望这篇评论可以激发研究界探索解决这一挑战的解决方案,并进一步促进医学图像细分领域的发展。
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监管基于深度学习的方法,产生医学图像分割的准确结果。但是,它们需要大量标记的数据集,并获得它们是一种艰苦的任务,需要临床专业知识。基于半/自我监督的学习方法通​​过利用未标记的数据以及有限的注释数据来解决此限制。最近的自我监督学习方法使用对比损失来从未标记的图像中学习良好的全球层面表示,并在像想象网那样的流行自然图像数据集上实现高性能。在诸如分段的像素级预测任务中,对于学习良好的本地级别表示以及全局表示来说至关重要,以实现更好的准确性。然而,现有的局部对比损失的方法的影响仍然是学习良好本地表现的限制,因为类似于随机增强和空间接近定义了类似和不同的局部区域;由于半/自我监督设置缺乏大规模专家注释,而不是基于当地地区的语义标签。在本文中,我们提出了局部对比损失,以便通过利用从未标记的图像的未标记图像的伪标签获得的语义标签信息来学习用于分割的良好像素级别特征。特别地,我们定义了建议的损失,以鼓励具有相同伪标签/标签的像素的类似表示,同时与数据集中的不同伪标签/标签的像素的表示。我们通过联合优化标记和未标记的集合和仅限于标记集的分割损失,通过联合优化拟议的对比损失来进行基于伪标签的自培训和培训网络。我们在三个公共心脏和前列腺数据集上进行了评估,并获得高分割性能。
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Jitendra Malik once said, "Supervision is the opium of the AI researcher". Most deep learning techniques heavily rely on extreme amounts of human labels to work effectively. In today's world, the rate of data creation greatly surpasses the rate of data annotation. Full reliance on human annotations is just a temporary means to solve current closed problems in AI. In reality, only a tiny fraction of data is annotated. Annotation Efficient Learning (AEL) is a study of algorithms to train models effectively with fewer annotations. To thrive in AEL environments, we need deep learning techniques that rely less on manual annotations (e.g., image, bounding-box, and per-pixel labels), but learn useful information from unlabeled data. In this thesis, we explore five different techniques for handling AEL.
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在过去的几年中,监督语义医学图像细分的深度学习方法越来越流行。在资源约束的设置中,获得大量带注释的图像非常困难,因为它主要需要专家,昂贵且耗时。监督分割可以是一个有吸引力的解决方案,其中使用了很少的标记图像以及大量未标记的图像。尽管在过去的几年中,针对分类问题已经大大减少了监督和半监督方法之间的差距,但分割方法仍然存在较大的差距。在这项工作中,我们将最先进的半监督分类方法FIXMATCH修复到语义分割任务中,并引入FixMatchSeg。 FIXMATCHSEG在不同的不同解剖结构和不同方式的四个不同的公开数据集中进行了评估:心脏超声,胸部X射线,视网膜眼睛图像和皮肤图像。当标签很少时,我们表明FixMatchSeg与强有力的监督基线相同。
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半监督学习方法已成为对打击获得大量注释数据的挑战的活跃研究领域。为了提高半监督学习方法表现的目标,我们提出了一种新颖的框架,Hiematch,一种半监督方法,利用分层信息来降低标签成本并表现以及vanilla半监督学习方法。分层信息通常是具有细粒标签的粗标签(例如,啄木鸟)的粗标签(例如,啄木鸟)的现有知识(例如,柔软的啄木鸟或金朝啄木鸟)。但是,尚未探讨使用使用粗类标签来改进半监督技术的监督。在没有细粒度的标签的情况下,Himatch利用标签层次结构,并使用粗级标签作为弱监控信号。此外,Himatch是一种改进任何半熟的学习框架的通用方法,我们使用我们的结果在最近的最先进的技术Mixmatch和Fixmatch上展示了这一点。我们评估了在两个基准数据集,即CiFar-100和Nabirds上的Himatch疗效。与MixMatch相比,HOMACHACT可以在CIFAR-100上减少50%的粒度标签50%的用量,仅在前1个精度的边缘下降0.59%。代码:https://github.com/07agarg/hiermatch.
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关于对比学习的最新研究仅通过在医学图像分割的背景下利用很少的标签来实现出色的性能。现有方法主要关注实例歧视和不变映射。但是,他们面临三个常见的陷阱:(1)尾巴:医疗图像数据通常遵循隐式的长尾分配。盲目利用训练中的所有像素会导致数据失衡问题,并导致性能恶化; (2)一致性:尚不清楚分割模型是否由于不同解剖学特征之间的类内变化而学会了有意义但一致的解剖学特征; (3)多样性:整个数据集中的切片内相关性已得到明显降低的关注。这促使我们寻求一种有原则的方法来战略利用数据集本身,以发现不同解剖学观点的类似但不同的样本。在本文中,我们介绍了一种新型的半监督医学图像分割框架,称其为您自己的解剖结构(MONA),并做出了三个贡献。首先,先前的工作认为,每个像素对模型培训都同样重要。我们从经验上观察到,仅此单单就不太可能定义有意义的解剖特征,这主要是由于缺乏监督信号。我们通过使用更强大的数据增强和最近的邻居展示了学习不变的两个简单解决方案。其次,我们构建了一组目标,鼓励模型能够以无监督的方式将医学图像分解为解剖特征的集合。最后,我们在具有不同标记设置的三个基准数据集上的广泛结果验证了我们提出的MONA的有效性,该数据在不同的标签设置下实现了新的最新设置。
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语义细分是一项具有挑战性的计算机视觉任务,要求大量像素级注释数据。产生此类数据是一个耗时且昂贵的过程,尤其是对于缺乏专家(例如医学或法医人类学)的领域。尽管已经开发了许多半监督方法,以从有限的标记数据和大量未标记的数据中获得最大的收益,但特定于领域的现实世界数据集通常具有特征,这些特征既可以降低现成的现成状态的有效性艺术方法,还提供了创建利用这些特征的新方法的机会。我们提出并评估一种半监督的方法,该方法通过利用现有相似性来重用可用的数据集图像,同时动态加权这些重复使用标签在培训过程中的影响。我们在人类分解图像的大数据集上评估了我们的方法,并发现我们的方法虽然在概念上却优于最先进的一致性和基于伪标记的方法,用于分割此数据集。本文包括人类分解的图形内容。
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Semi-supervised learning is becoming increasingly important because it can combine data carefully labeled by humans with abundant unlabeled data to train deep neural networks. Classic methods on semi-supervised learning that have focused on transductive learning have not been fully exploited in the inductive framework followed by modern deep learning. The same holds for the manifold assumption-that similar examples should get the same prediction. In this work, we employ a transductive label propagation method that is based on the manifold assumption to make predictions on the entire dataset and use these predictions to generate pseudo-labels for the unlabeled data and train a deep neural network. At the core of the transductive method lies a nearest neighbor graph of the dataset that we create based on the embeddings of the same network. Therefore our learning process iterates between these two steps. We improve performance on several datasets especially in the few labels regime and show that our work is complementary to current state of the art.
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Medical image segmentation methods typically rely on numerous dense annotated images for model training, which are notoriously expensive and time-consuming to collect. To alleviate this burden, weakly supervised techniques have been exploited to train segmentation models with less expensive annotations. In this paper, we propose a novel point-supervised contrastive variance method (PSCV) for medical image semantic segmentation, which only requires one pixel-point from each organ category to be annotated. The proposed method trains the base segmentation network by using a novel contrastive variance (CV) loss to exploit the unlabeled pixels and a partial cross-entropy loss on the labeled pixels. The CV loss function is designed to exploit the statistical spatial distribution properties of organs in medical images and their variance distribution map representations to enforce discriminative predictions over the unlabeled pixels. Experimental results on two standard medical image datasets demonstrate that the proposed method outperforms the state-of-the-art weakly supervised methods on point-supervised medical image semantic segmentation tasks.
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半监督语义分割的流行方法主要采用了使用卷积神经网络(CNN)(CNN)的统一网络模型,并在应用于输入或模型的小型扰动上实施模型预测的一致性。但是,这种学习范式受到a)基于CNN模型的学习能力有限; b)学习未标记数据的判别特征的能力有限; c)从整个图像中对全球和本地信息的学习有限。在本文中,我们提出了一种新型的半监督学习方法,称为Transformer-CNN队列(TCC),该方法由两个基于视觉变压器(VIT)的学生组成,另一种是基于CNN的学生。我们的方法巧妙地通过伪标记来纳入预测和异质特征空间上的多级一致性正则化,用于未标记的数据。首先,由于VIT学生的输入是图像贴片,因此特征地图提取了编码至关重要的类统计。为此,我们建议首先利用每个学生作为伪标签并生成类吸引功能(CF)映射的班级感知功能一致性蒸馏(CFCD)。然后,它通过学生之间的CF地图传输知识。其次,随着VIT学生对所有层具有更统一的表示,我们提出一致性感知的交叉蒸馏以在类像素方面的预测之间转移知识。我们在CityScapes和Pascal VOC 2012数据集上验证了TCC框架,该数据集大大优于现有的半监督方法。
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本文为半监督医学图像分割提供了一个简单而有效的两阶段框架。我们的主要洞察力是探索用标记和未标记的(即伪标记)图像的特征表示学习,以增强分段性能。在第一阶段,我们介绍了一种炼层的不确定感知方法,即Aua,以改善产生高质量伪标签的分割性能。考虑到医学图像的固有歧义,Aua自适应地规范了具有低歧义的图像的一致性。为了提高代表学习,我们提出了一种舞台适应性的对比学习方法,包括边界意识的对比损失,以规范第一阶段中标记的图像,并在第二阶段中的原型感知对比损失优化标记和伪标记的图像阶段。边界意识的对比损失仅优化分段边界周围的像素,以降低计算成本。原型感知对比损失通过为每个类构建质心来充分利用标记的图像和伪标记的图像,以减少对比较的计算成本。我们的方法在两个公共医学图像分割基准上实现了最佳结果。值得注意的是,我们的方法在结肠肿瘤分割的骰子上以5.7%的骰子依赖于只有5%标记的图像而表现出5.7%。
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We propose a novel teacher-student model for semi-supervised multi-organ segmentation. In teacher-student model, data augmentation is usually adopted on unlabeled data to regularize the consistent training between teacher and student. We start from a key perspective that fixed relative locations and variable sizes of different organs can provide distribution information where a multi-organ CT scan is drawn. Thus, we treat the prior anatomy as a strong tool to guide the data augmentation and reduce the mismatch between labeled and unlabeled images for semi-supervised learning. More specifically, we propose a data augmentation strategy based on partition-and-recovery N$^3$ cubes cross- and within- labeled and unlabeled images. Our strategy encourages unlabeled images to learn organ semantics in relative locations from the labeled images (cross-branch) and enhances the learning ability for small organs (within-branch). For within-branch, we further propose to refine the quality of pseudo labels by blending the learned representations from small cubes to incorporate local attributes. Our method is termed as MagicNet, since it treats the CT volume as a magic-cube and $N^3$-cube partition-and-recovery process matches with the rule of playing a magic-cube. Extensive experiments on two public CT multi-organ datasets demonstrate the effectiveness of MagicNet, and noticeably outperforms state-of-the-art semi-supervised medical image segmentation approaches, with +7% DSC improvement on MACT dataset with 10% labeled images.
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半监督的语义细分需要对未标记的数据进行丰富而强大的监督。一致性学习强制执行相同的像素在不同的增强视图中具有相似的特征,这是一个强大的信号,但忽略了与其他像素的关系。相比之下,对比学习考虑了丰富的成对关系,但是为像素对分配二进制阳性阴性监督信号可能是一个难题。在本文中,我们竭尽所能,并提出多视图相关性一致性(MVCC)学习:它考虑了自相关矩阵中的丰富成对关系,并将它们匹配到视图中以提供强大的监督。加上这种相关性一致性损失,我们提出了一个视图增强策略,可以保证不同观点之间的像素像素对应关系。在两个数据集上的一系列半监督设置中,我们报告了与最先进方法相比的竞争精度。值得注意的是,在CityScapes上,我们以1/8标记的数据达到76.8%的MIOU,比完全监督的Oracle差0.6%。
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我们对自我监督,监督或半监督设置的代表学习感兴趣。在应用自我监督学习的平均移位思想的事先工作,通过拉动查询图像来概括拜尔的想法,不仅更接近其其他增强,而且还可以到其他增强的最近邻居(NNS)。我们认为,学习可以从选择远处与查询相关的邻居选择遥远的邻居。因此,我们建议通过约束最近邻居的搜索空间来概括MSF算法。我们显示我们的方法在SSL设置中优于MSF,当约束使用不同的图像时,并且当约束确保NNS具有与查询相同的伪标签时,在半监控设置中优于培训资源的半监控设置中的爪子。
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最近,利用卷积神经网络(CNNS)和变压器的深度学习表明,令人鼓舞的医学图像细分导致结果。但是,他们仍然具有挑战性,以实现有限的培训的良好表现。在这项工作中,我们通过在CNN和变压器之间引入交叉教学,为半监控医学图像分割提供了一个非常简单但有效的框架。具体而言,我们简化了从一致性正则化的经典深度共同训练交叉教学,其中网络的预测用作伪标签,直接端到端监督其他网络。考虑到CNN和变压器之间的学习范例的差异,我们在CNN和变压器之间引入了交叉教学,而不是使用CNNS。在公共基准测试中的实验表明,我们的方法优于八个现有的半监督学习方法,只需更简单的框架。值得注意的是,这项工作可能是第一次尝试将CNN和变压器组合以进行半监督的医学图像分割,并在公共基准上实现有前途的结果。该代码将发布:https://github.com/hilab-git/sl4mis。
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语义分割是开发医学图像诊断系统的重要任务。但是,构建注释的医疗数据集很昂贵。因此,在这种情况下,半监督方法很重要。在半监督学习中,标签的质量在模型性能中起着至关重要的作用。在这项工作中,我们提出了一种新的伪标签策略,可提高用于培训学生网络的伪标签的质量。我们遵循多阶段的半监督训练方法,该方法在标记的数据集上训练教师模型,然后使用训练有素的老师将伪标签渲染用于学生培训。通过这样做,伪标签将被更新,并且随着培训的进度更加精确。上一个和我们的方法之间的关键区别在于,我们在学生培训过程中更新教师模型。因此,在学生培训过程中,提高了伪标签的质量。我们还提出了一种简单但有效的策略,以使用动量模型来提高伪标签的质量 - 训练过程中原始模型的慢复制版本。通过应用动量模型与学生培训期间的重新渲染伪标签相结合,我们在五个数据集中平均达到了84.1%的骰子分数(即Kvarsir,CVC-ClinicdB,Etis-laribpolypdb,cvc-colondb,cvc-colondb,cvc-colondb和cvc-300)和CVC-300)只有20%的数据集用作标记数据。我们的结果超过了3%的共同实践,甚至在某些数据集中取得了完全监督的结果。我们的源代码和预培训模型可在https://github.com/sun-asterisk-research/online学习SSL上找到
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神经网络在医疗图像分割任务上的成功通常依赖于大型标记的数据集用于模型培训。但是,由于数据共享和隐私问题,获取和手动标记大型医疗图像集是资源密集的,昂贵的,有时是不切实际的。为了应对这一挑战,我们提出了一个通用的对抗数据增强框架Advchain,旨在提高培训数据对医疗图像分割任务的多样性和有效性。 AdvChain通过动态数据增强来增强数据,从而产生随机链接的光线像和几何转换,以类似于现实而又具有挑战性的成像变化以扩展训练数据。通过在培训期间共同优化数据增强模型和分割网络,可以生成具有挑战性的示例,以增强下游任务的网络可推广性。所提出的对抗数据增强不依赖生成网络,可以用作通用分割网络中的插件模块。它在计算上是有效的,适用于低声监督和半监督学习。我们在两个MR图像分割任务上分析和评估该方法:心脏分割和前列腺分割具有有限的标记数据。结果表明,所提出的方法可以减轻对标记数据的需求,同时提高模型泛化能力,表明其在医学成像应用中的实际价值。
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Despite significant advances, the performance of state-of-the-art continual learning approaches hinges on the unrealistic scenario of fully labeled data. In this paper, we tackle this challenge and propose an approach for continual semi-supervised learning -- a setting where not all the data samples are labeled. An underlying issue in this scenario is the model forgetting representations of unlabeled data and overfitting the labeled ones. We leverage the power of nearest-neighbor classifiers to non-linearly partition the feature space and learn a strong representation for the current task, as well as distill relevant information from previous tasks. We perform a thorough experimental evaluation and show that our method outperforms all the existing approaches by large margins, setting a strong state of the art on the continual semi-supervised learning paradigm. For example, on CIFAR100 we surpass several others even when using at least 30 times less supervision (0.8% vs. 25% of annotations).
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我们对最近的自我和半监督ML技术进行严格的评估,从而利用未标记的数据来改善下游任务绩效,以河床分割的三个遥感任务,陆地覆盖映射和洪水映射。这些方法对于遥感任务特别有价值,因为易于访问未标记的图像,并获得地面真理标签通常可以昂贵。当未标记的图像(标记数据集之外)提供培训时,我们量化性能改进可以对这些遥感分割任务进行期望。我们还设计实验以测试这些技术的有效性,当测试集相对于训练和验证集具有域移位时。
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