人们对连续可穿戴生命体征传感器的兴趣越来越大,用于在家中远程监测患者。这些监视器通常与警报系统耦合,当生命体征测量值落在预定义的正常范围之外时,它会触发。生命体征的趋势(例如心率提高)通常表明健康状况恶化,但很少被纳入警报系统中。在这项工作中,我们提出了一种新型的离群检测算法,以识别这种异常生命体征趋势。我们引入了一种基于距离的措施,以比较生命体征轨迹。对于我们数据集中的每个患者,我们将生命体征时间序列分为180分钟的非重叠时期。然后,我们使用动态时间扭曲距离计算了所有时期对之间的距离。每个时期的特征都以其平均成对距离(平均链路距离)到所有其他时期,其距离为较大的距离。我们将此方法应用于1561多个患者小时的飞行员数据集,这些数据集是从最近在Covid-19收缩后出院的8例患者的1561个患者小时。我们表明,离群值时期与后来入院的患者相对应。我们还描述了一个这样的患者如何从正常异常转变为异常。
translated by 谷歌翻译
肥胖是一个重大的健康问题,增加了各种主要慢性病的风险,如糖尿病,癌症和中风。虽然通过横断面BMI录音识别的肥胖作用已经过分研究,但BMI轨迹的作用远远不大。在这项研究中,我们利用从大型和地理位置的EHR数据集中提取的BMI轨迹捕获大约200万个人的健康状况为期六年的健康状况。我们根据BMI轨迹定义九个新的可解释和基于证据的变量,以使用K-Means聚类方法将患者聚类为子组。我们在人口统计学,社会经济和生理测量变量方面彻底审查了每个集群特征,以指定簇中患者的不同性质。在我们的实验中,已被重新建立肥胖,高血压,阿尔茨海默和痴呆症的肥胖,高血压,阿尔茨海默氏症和痴呆症的直接关系,并且已经发现有几种慢性疾病的特异性特征的不同簇符合或与现有的知识体系互补。
translated by 谷歌翻译
谵妄是急性急性发病脑功能障碍,在紧急情况下,与较高的死亡率有关。由于其演示和风险因素难以检测和监测,这取决于患者的潜在病情。在我们的研究中,我们旨在识别谵妄人口中的亚型,并建立使用医疗信息MART进行密集护理IV(MIMIC-IV)数据来检测谵妄的亚组特定的预测模型。我们表明谵妄存在于谵妄中。对于特定于组的预测模型,还观察到特征重要性的差异。我们的工作可以重新校准每个谵妄亚组的现有谵妄预测模型,并提高ICU或急诊部门患者的谵妄检测和监测的精度。
translated by 谷歌翻译
最近应用于从密集护理单位收集的时间序列的机器学习方法的成功暴露了缺乏标准化的机器学习基准,用于开发和比较这些方法。虽然原始数据集(例如MIMIC-IV或EICU)可以在物理体上自由访问,但是选择任务和预处理的选择通常是针对每个出版物的ad-hoc,限制出版物的可比性。在这项工作中,我们的目标是通过提供覆盖大型ICU相关任务的基准来改善这种情况。使用HirID数据集,我们定义与临床医生合作开发的多个临床相关任务。此外,我们提供可重复的端到端管道,以构建数据和标签。最后,我们提供了对当前最先进的序列建模方法的深入分析,突出了这种类型数据的深度学习方法的一些限制。通过这款基准,我们希望为研究界提供合理比较的可能性。
translated by 谷歌翻译
大型和深度电子医疗保健记录(EHR)数据集的可用性有可能更好地了解现实世界中的患者旅行,并鉴定出新的患者亚组。基于ML的EHR数据集合主要是工具驱动的,即基于可用或新开发的方法的构建。但是,这些方法,它们的输入要求以及最重要的是,通常难以解释产量,尤其是没有深入的数据科学或统计培训。这危害了需要进行可行且具有临床意义的解释的最后一步。这项研究研究了使用大型EHR数据集和多种聚类方法进行临床研究的方法进行大规模进行患者分层分析的方法。我们已经开发了几种工具来促进无监督的患者分层结果的临床评估和解释,即模式筛查,元聚类,替代建模和策展。这些工具可以在分析中的不同阶段使用。与标准分析方法相比,我们证明了凝结结果并优化分析时间的能力。在元聚类的情况下,我们证明了患者簇的数量可以从72减少到3。在另一个分层的结果中,通过使用替代模型,我们可以迅速确定如果有血液钠测量值可用,则可以对心力衰竭患者进行分层。由于这是对所有心力衰竭患者进行的常规测量,因此表明数据偏差。通过使用进一步的队列和特征策展,可以去除这些患者和其他无关的特征以提高临床意义。这些示例显示了拟议方法的有效性,我们希望鼓励在该领域的进一步研究。
translated by 谷歌翻译
Although machine learning (ML) models of AI achieve high performances in medicine, they are not free of errors. Empowering clinicians to identify incorrect model recommendations is crucial for engendering trust in medical AI. Explainable AI (XAI) aims to address this requirement by clarifying AI reasoning to support the end users. Several studies on biomedical imaging achieved promising results recently. Nevertheless, solutions for models using tabular data are not sufficient to meet the requirements of clinicians yet. This paper proposes a methodology to support clinicians in identifying failures of ML models trained with tabular data. We built our methodology on three main pillars: decomposing the feature set by leveraging clinical context latent space, assessing the clinical association of global explanations, and Latent Space Similarity (LSS) based local explanations. We demonstrated our methodology on ML-based recognition of preterm infant morbidities caused by infection. The risk of mortality, lifelong disability, and antibiotic resistance due to model failures was an open research question in this domain. We achieved to identify misclassification cases of two models with our approach. By contextualizing local explanations, our solution provides clinicians with actionable insights to support their autonomy for informed final decisions.
translated by 谷歌翻译
如今,人工智能(AI)已成为临床和远程医疗保健应用程序的基本组成部分,但是最佳性能的AI系统通常太复杂了,无法自我解释。可解释的AI(XAI)技术被定义为揭示系统的预测和决策背后的推理,并且在处理敏感和个人健康数据时,它们变得更加至关重要。值得注意的是,XAI并未在不同的研究领域和数据类型中引起相同的关注,尤其是在医疗保健领域。特别是,许多临床和远程健康应用程序分别基于表格和时间序列数据,而XAI并未在这些数据类型上进行分析,而计算机视觉和自然语言处理(NLP)是参考应用程序。为了提供最适合医疗领域表格和时间序列数据的XAI方法的概述,本文提供了过去5年中文献的审查,说明了生成的解释的类型以及为评估其相关性所提供的努力和质量。具体而言,我们确定临床验证,一致性评估,客观和标准化质量评估以及以人为本的质量评估作为确保最终用户有效解释的关键特征。最后,我们强调了该领域的主要研究挑战以及现有XAI方法的局限性。
translated by 谷歌翻译
基于签名的技术使数学洞察力洞悉不断发展的数据的复杂流之间的相互作用。这些见解可以自然地转化为理解流数据的数值方法,也许是由于它们的数学精度,已被证明在数据不规则而不是固定的情况下分析流的数据以及数据和数据的尺寸很有用样本量均为中等。了解流的多模式数据是指数的:$ d $ d $的字母中的$ n $字母中的一个单词可以是$ d^n $消息之一。签名消除了通过采样不规则性引起的指数级噪声,但仍然存在指数量的信息。这项调查旨在留在可以直接管理指数缩放的域中。在许多问题中,可伸缩性问题是一个重要的挑战,但需要另一篇调查文章和进一步的想法。这项调查描述了一系列环境集足够小以消除大规模机器学习的可能性,并且可以有效地使用一小部分免费上下文和原则性功能。工具的数学性质可以使他们对非数学家的使用恐吓。本文中介绍的示例旨在弥合此通信差距,并提供从机器学习环境中绘制的可进行的工作示例。笔记本可以在线提供这些示例中的一些。这项调查是基于伊利亚·雪佛兰(Ilya Chevryev)和安德烈·科米利津(Andrey Kormilitzin)的早期论文,它们在这种机械开发的较早时刻大致相似。本文说明了签名提供的理论见解是如何在对应用程序数据的分析中简单地实现的,这种方式在很大程度上对数据类型不可知。
translated by 谷歌翻译
电子医疗保健记录是可用于患者分层的重要信息来源,以探索新型疾病表型。但是,它们可能具有挑战性,因为数据往往稀疏和不规则地采样。解决这些限制的一种方法是学习密集的嵌入,其代表使用经常性神经网络AutoEncoder(RNN-AE)的单个患者轨迹。该过程可以易于对不需要的数据偏差影响。我们表明,使用先前提出的RNN-AE模型的患者嵌入和群集可能受到轨迹偏差的影响,这意味着结果由每个患者轨迹中包含的数据量主导,而不是临床相关细节。我们调查了2个数据集(来自不同医院)和2个疾病区域的偏差,以及使用患者轨迹的不同部分。我们使用2个以前公布的基线方法的结果表示事件到最终轨迹的情况下特别强烈的偏见。我们提出了一种方法,可以使用RNN-AE顶部的对抗培训方案来克服这个问题。我们的研究结果表明,我们的方法可以减少所有情况下的轨迹偏差。
translated by 谷歌翻译
Both clustering and outlier detection play an important role for meteorological measurements. We present the AWT algorithm, a clustering algorithm for time series data that also performs implicit outlier detection during the clustering. AWT integrates ideas of several well-known K-Means clustering algorithms. It chooses the number of clusters automatically based on a user-defined threshold parameter, and it can be used for heterogeneous meteorological input data as well as for data sets that exceed the available memory size. We apply AWT to crowd sourced 2-m temperature data with an hourly resolution from the city of Vienna to detect outliers and to investigate if the final clusters show general similarities and similarities with urban land-use characteristics. It is shown that both the outlier detection and the implicit mapping to land-use characteristic is possible with AWT which opens new possible fields of application, specifically in the rapidly evolving field of urban climate and urban weather.
translated by 谷歌翻译
心脏听诊是用于检测和识别许多心脏病的最具成本效益的技术之一。基于Auscultation的计算机辅助决策系统可以支持他们的决定中的医生。遗憾的是,在临床试验中的应用仍然很小,因为它们中的大多数仅旨在检测音盲局部信号中的额外或异常波的存在,即,仅提供二进制地面真理变量(普通VS异常)。这主要是由于缺乏大型公共数据集,其中存在对这种异常波(例如,心脏杂音)的更详细描述。为基于听诊的医疗建议系统铺平了更有效的研究,我们的团队准备了目前最大的儿科心声数据集。从1568名患者的四个主要听诊位置收集了5282个录音,在此过程中,手动注释了215780人的心声。此外,并且首次通过专家注释器根据其定时,形状,俯仰,分级和质量来手动注释每个心脏杂音。此外,鉴定了杂音的听诊位置以及杂音更集中检测到杂音的位置位置。对于相对大量的心脏声音的这种详细描述可以为新机器学习算法铺平道路,该算法具有真实世界的应用,用于检测和分析诊断目的的杂波。
translated by 谷歌翻译
机器学习可用于分析几种目的的生理数据。脑缺血的检测是对患者护理产生高影响的成就。我们试图研究来自非侵入性监测器的连续生理数据,以及使用机器学习的分析可以检测不同环境中的脑缺血,在颈动脉胚胎切除术后和急性中风中的血管内血栓切除术期间。我们将两个不同组和一名患者的结果进行详细地比较。虽然CEA患者的结果是一致的,但从血栓切除术患者的结果不是并且经常含有极值,例如1.0的精确值。我们突出了这一点,这是程序的持续时间和具有质量不好的数据,导致小数据集。因此,这些结果不能值得信任。
translated by 谷歌翻译
鉴于ICU(重症监护股)监测心脏病患者,用于大脑活动,我们如何尽早预测其健康结果?早期决策在许多应用中至关重要,例如,监测患者可能有助于早期干预和改善护理。另一方面,EEG数据的早期预测造成了几个挑战:(i)早期准确性权衡;观察更多数据通常会提高精度,但牺牲了,(ii)大规模(用于训练)和流传输(在线决策)数据处理,(iii)多变化(由于多个电极)和多长度(由于变化患者的逗留时间)时间序列。通过这种现实世界的应用程序,我们提供了从早期预测中耗尽的受益者,以及从错误分类到统一的区域特定目标中的成本。统一这两种数量允许我们直接估计单个目标(即益处),重要的是,准确地指示输出预测的时间:当益处估计变为肯定时。 Eventitter(a)是高效且快速的,在输入序列的数量中具有训练时间线性,并且可以实时运行以进行决策,(b)可以处理多变化和可变长度的时间序列,适用于患者数据和(c)是有效的,与竞争对手相比,提供高达2倍的时间,具有相同或更好的准确性。
translated by 谷歌翻译
Health sensing for chronic disease management creates immense benefits for social welfare. Existing health sensing studies primarily focus on the prediction of physical chronic diseases. Depression, a widespread complication of chronic diseases, is however understudied. We draw on the medical literature to support depression prediction using motion sensor data. To connect human expertise in the decision-making, safeguard trust for this high-stake prediction, and ensure algorithm transparency, we develop an interpretable deep learning model: Temporal Prototype Network (TempPNet). TempPNet is built upon the emergent prototype learning models. To accommodate the temporal characteristic of sensor data and the progressive property of depression, TempPNet differs from existing prototype learning models in its capability of capturing the temporal progression of depression. Extensive empirical analyses using real-world motion sensor data show that TempPNet outperforms state-of-the-art benchmarks in depression prediction. Moreover, TempPNet interprets its predictions by visualizing the temporal progression of depression and its corresponding symptoms detected from sensor data. We further conduct a user study to demonstrate its superiority over the benchmarks in interpretability. This study offers an algorithmic solution for impactful social good - collaborative care of chronic diseases and depression in health sensing. Methodologically, it contributes to extant literature with a novel interpretable deep learning model for depression prediction from sensor data. Patients, doctors, and caregivers can deploy our model on mobile devices to monitor patients' depression risks in real-time. Our model's interpretability also allows human experts to participate in the decision-making by reviewing the interpretation of prediction outcomes and making informed interventions.
translated by 谷歌翻译
源于机器学习和优化的临床决策支持工具可以为医疗保健提供者提供显着的价值,包括通过更好地管理重症监护单位。特别是,重要的是,患者排放任务在降低患者的住宿时间(以及相关住院费用)和放弃决策后的入院甚至死亡的风险之间存在对细微的折衷。这项工作介绍了一个端到端的一般框架,用于捕获这种权衡,以推荐患者电子健康记录的最佳放电计时决策。数据驱动方法用于导出捕获患者的生理条件的解析,离散状态空间表示。基于该模型和给定的成本函数,在数值上制定并解决了无限的地平线折扣明马尔科夫决策过程,以计算最佳的排放政策,其价值使用违规评估策略进行评估。进行广泛的数值实验以使用现实生活重症监护单元患者数据来验证所提出的框架。
translated by 谷歌翻译
心脏切断(CTG)是用于劳动期间胎儿监测的主要工具。对CTG的解释需要实时动态模式识别。它被认为是具有高度和观察者内部观察者分歧的艰巨任务。机器学习为客观和可靠的CTG评估提供了可行的路径。在这项研究中,使用自回归移动平均(ARMA)模型基于临床专业知识和系统控制理论来开发新的CTG特征,以表征胎儿心率与收缩的响应。在机器学习模型中评估特征,以评估它们在识别胎儿妥协时的功效。ARMA功能在顶级特征中排名,用于检测胎儿妥协。此外,包括基于信号质量的机器学习模型和修剪数据中的临床因素提高了分类器的性能。
translated by 谷歌翻译
基于电子健康记录(EHR)的健康预测建筑模型已成为一个活跃的研究领域。 EHR患者旅程数据由患者定期的临床事件/患者访问组成。大多数现有研究的重点是建模访问之间的长期依赖性,而无需明确考虑连续访问之间的短期相关性,在这种情况下,将不规则的时间间隔(并入为辅助信息)被送入健康预测模型中以捕获患者期间的潜在渐进模式。 。我们提出了一个具有四个模块的新型深神经网络,以考虑各种变量对健康预测的贡献:i)堆叠的注意力模块在每个患者旅程中加强了临床事件中的深层语义,并产生访问嵌入,ii)短 - 术语时间关注模块模型在连续访问嵌入之间的短期相关性,同时捕获这些访问嵌入中时间间隔的影响,iii)长期时间关注模块模型的长期依赖模型,同时捕获时间间隔内的时间间隔的影响这些访问嵌入,iv),最后,耦合的注意模块适应了短期时间关注和长期时间注意模块的输出,以做出健康预测。对模拟III的实验结果表明,与现有的最新方法相比,我们的模型的预测准确性以及该方法的可解释性和鲁棒性。此外,我们发现建模短期相关性有助于局部先验的产生,从而改善了患者旅行的预测性建模。
translated by 谷歌翻译
高流量鼻腔插管(HFNC)为批判性儿童提供了非侵入性呼吸支持,这些儿童可能比其他非侵入性(NIV)技术更容易耐受。及时预测HFNC故障可以提供增加呼吸支持的指示。这项工作开发并比较了机器学习模型来预测HFNC故障。从2010年1月到2月20日至2月的患者EMR进行了患者EMR进行了回顾性研究。培训了长期内记忆(LSTM)模型,以产生连续预测HFNC故障。在HFNC启动后的各个时间使用接收器操作曲线(AUROC)下的区域评估性能。还评估了HFNC启动后2小时后预测的敏感性,特异性,正面和消极预测值(PPV,NPV)。这些指标也以主要呼吸诊断的群组计算。 834 HFNC试验[455培训,173次验证,206检验]符合纳入标准,其中175 [103,30,42](21.0%)升级至NIV或插管。具有转移学习的LSTM模型通常比LR模型更好地执行,最佳LSTM模型在启动后2小时实现0.78,VS 0.66的AUTOC。使用EMR数据培训的机器学习模型能够在发起24小时内识别出现在HFNC中失败的风险的风险。 LSTM模型结合了转移学习,输入数据持久性和合奏显示的性能提高了LR和标准LSTM模型。
translated by 谷歌翻译
纵向电子健康记录(EHR)数据的可用性增加导致改善对疾病的理解和新颖表型的发现。大多数聚类算法仅关注患者轨迹,但具有类似轨迹的患者可能具有不同的结果。寻找不同轨迹和结果的患者亚组可以引导未来的药物开发,改善临床试验的招募。我们使用可以加权的重建,结果和聚类损耗开发经常性神经网络自动拓群体以群集EHR数据,以查找不同类型的患者群集。我们展示我们的模型能够从数据偏差和结果差异中发现已知的集群,表现优于基线模型。我们展示了29,222,229美元糖尿病患者的模型性能,显示出发现患有不同轨迹和不同结果的患者的簇,可用于帮助临床决策。
translated by 谷歌翻译
严重冠状病毒疾病19(Covid-19)的患者通常需要补充氧作为必要的治疗方法。我们开发了一种基于深度加强学习(RL)的机器学习算法,用于持续管理缺氧率为重症监护下的关键病患者,这可以识别最佳的个性化氧气流速,具有强大的潜力,以降低相对于死亡率目前的临床实践。基本上,我们为Covid-19患者的氧气流动轨迹建模,并作为马尔可夫决策过程。基于个体患者特征和健康状况,基于加强学习的氧气控制政策,实时推荐氧气流速降低死亡率。我们通过使用从纽约大学Langone Health的Covid-19的叙述队员使用纽约大学Langone Healthation Mearchatory Maculation Mearchatory Chare,从2020年4月20日至1月2021年使用电子健康记录,通过交叉验证评估了拟议方法的表现。算法低于护理标准的2.57%(95%CI:2.08-3.06)减少(P <0.001)在我们的算法下的护理标准下的7.94%,平均推荐的氧气流量为1.28 L /分钟(95%CI:1.14-1.42)低于实际递送给患者的速率。因此,RL算法可能导致更好的重症监护治疗,可以降低死亡率,同时节省氧气稀缺资源。它可以减少氧气短缺问题,在Covid-19大流行期间改善公共卫生。
translated by 谷歌翻译