计算流体动力学(CFD)是一种有价值的工具,用于动脉中血流动力学的个性化,非侵入性评估,但其复杂性和耗时的大自然在实践中禁止大规模使用。最近,已经研究了利用深度学习进行CFD参数的快速估计,如表面网格上的壁剪切应力(WSS)。然而,现有方法通常取决于表面网格的手工制作的重新参数化以匹配卷积神经网络架构。在这项工作中,我们建议使用Mesh卷积神经网络,该网状神经网络直接在CFD中使用的相同的有限元表面网格操作。我们在使用从CFD模拟中获得的地面真理培训并在两种合成冠状动脉模型的两种数据集上培训和评估我们的方法。我们表明我们灵活的深度学习模型可以准确地预测该表面网上的3D WSS矢量。我们的方法在少于5分钟内处理新网格,始终如一地实现$ \ LEQ $ 1.6 [%]的标准化平均值误差,并且在保持测试集中的90.5 [%]中位近似精度为90.5 [%]的峰值,比较以前发表的工作。这证明了CFD代理建模的可行性,使用网状卷积神经网络进行动脉模型中的血流动力学参数估计。
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Computational fluid dynamics (CFD) is a valuable asset for patient-specific cardiovascular-disease diagnosis and prognosis, but its high computational demands hamper its adoption in practice. Machine-learning methods that estimate blood flow in individual patients could accelerate or replace CFD simulation to overcome these limitations. In this work, we consider the estimation of vector-valued quantities on the wall of three-dimensional geometric artery models. We employ group-equivariant graph convolution in an end-to-end SE(3)-equivariant neural network that operates directly on triangular surface meshes and makes efficient use of training data. We run experiments on a large dataset of synthetic coronary arteries and find that our method estimates directional wall shear stress (WSS) with an approximation error of 7.6% and normalised mean absolute error (NMAE) of 0.4% while up to two orders of magnitude faster than CFD. Furthermore, we show that our method is powerful enough to accurately predict transient, vector-valued WSS over the cardiac cycle while conditioned on a range of different inflow boundary conditions. These results demonstrate the potential of our proposed method as a plugin replacement for CFD in the personalised prediction of hemodynamic vector and scalar fields.
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定义网格上卷积的常用方法是将它们作为图形解释并应用图形卷积网络(GCN)。这种GCNS利用各向同性核,因此对顶点的相对取向不敏感,从而对整个网格的几何形状。我们提出了规范的等分性网状CNN,它概括了GCNS施加各向异性仪表等级核。由于产生的特征携带方向信息,我们引入了通过网格边缘并行传输特征来定义的几何消息传递方案。我们的实验验证了常规GCN和其他方法的提出模型的显着提高的表达性。
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事实证明,与对称性的对称性在深度学习研究中是一种强大的归纳偏见。关于网格处理的最新著作集中在各种天然对称性上,包括翻译,旋转,缩放,节点排列和仪表变换。迄今为止,没有现有的体系结构与所有这些转换都不相同。在本文中,我们提出了一个基于注意力的网格数据的架构,该体系结构与上述所有转换相似。我们的管道依赖于相对切向特征的使用:一种简单,有效,等效性的替代品,可作为输入作为输入。有关浮士德和TOSCA数据集的实验证实,我们提出的架构在这些基准测试中的性能提高了,并且确实是对各种本地/全球转换的均等,因此具有强大的功能。
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我们开发了一种从2D RGB图像生成3D手网格的旋转等级模型。这保证了当手的输入图像旋转时,所生成的网格经历相应的旋转。此外,这消除了经常通过无旋转标准天例的方法产生的网格中的不希望的变形。通过构建旋转等级模型,通过考虑问题的对称性,我们减少了对非常大的数据集训练的需求,以实现良好的网格重建。编码器在$ \ mathbb {z} ^ {2} $上定义的图像,并将这些映射到组$ c_ {8} $上定义的潜在函数。我们介绍了一种新颖的向量映射函数来将以$ c_ {8} $定义的函数映射到组$ \ mathrm {so}(2)$上定义的潜在点云空间。此外,我们介绍了一种3D投影函数,它从$ \ mathrm {so}(2)$潜空间中学习3D功能。最后,我们使用$ \ mathrm {so}(3)$ arifariant解码器,以确保旋转标准。我们的旋转设备模型优于现实世界数据集的最先进方法,我们证明它可以准确地捕获在输入手的旋转下产生的网格中的形状和姿势。
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Wind turbine wake modelling is of crucial importance to accurate resource assessment, to layout optimisation, and to the operational control of wind farms. This work proposes a surrogate model for the representation of wind turbine wakes based on a state-of-the-art graph representation learning method termed a graph neural network. The proposed end-to-end deep learning model operates directly on unstructured meshes and has been validated against high-fidelity data, demonstrating its ability to rapidly make accurate 3D flow field predictions for various inlet conditions and turbine yaw angles. The specific graph neural network model employed here is shown to generalise well to unseen data and is less sensitive to over-smoothing compared to common graph neural networks. A case study based upon a real world wind farm further demonstrates the capability of the proposed approach to predict farm scale power generation. Moreover, the proposed graph neural network framework is flexible and highly generic and as formulated here can be applied to any steady state computational fluid dynamics simulations on unstructured meshes.
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Surrogate models are necessary to optimize meaningful quantities in physical dynamics as their recursive numerical resolutions are often prohibitively expensive. It is mainly the case for fluid dynamics and the resolution of Navier-Stokes equations. However, despite the fast-growing field of data-driven models for physical systems, reference datasets representing real-world phenomena are lacking. In this work, we develop AirfRANS, a dataset for studying the two-dimensional incompressible steady-state Reynolds-Averaged Navier-Stokes equations over airfoils at a subsonic regime and for different angles of attacks. We also introduce metrics on the stress forces at the surface of geometries and visualization of boundary layers to assess the capabilities of models to accurately predict the meaningful information of the problem. Finally, we propose deep learning baselines on four machine learning tasks to study AirfRANS under different constraints for generalization considerations: big and scarce data regime, Reynolds number, and angle of attack extrapolation.
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预测具有微观结构的材料的代表性样品的演变是均质化的基本问题。在这项工作中,我们提出了一种图形卷积神经网络,其利用直接初始微结构的离散化表示,而无需分割或聚类。与基于特征和基于像素的卷积神经网络模型相比,所提出的方法具有许多优点:(a)它是深入的,因为它不需要卵容,但可以从中受益,(b)它具有简单的实现使用标准卷积滤波器和层,(c)它在没有插值的非结构化和结构网格数据上本身工作(与基于像素的卷积神经网络不同),并且(d)它可以保留与其他基于图形的卷积神经网络等旋转不变性。我们展示了所提出的网络的性能,并将其与传统的基于像素的卷积神经网络模型和基于传统的像素的卷积神经网络模型进行比较,并且在多个大型数据集上的基于特征的图形卷积神经网络。
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\ emph {几何深度学习}(GDL)的最新进展显示了其提供强大数据驱动模型的潜力。这提供了探索从图形数据中\ emph {部分微分方程}(PDES)控制的物理系统的新方法的动力。然而,尽管做出了努力和最近的成就,但几个研究方向仍未开发,进步仍然远非满足现实现象的身体要求。主要障碍之一是缺乏基准数据集和常见的物理评估协议。在本文中,我们提出了一个2-D Graph-Mesh数据集,以研究High Reynolds制度的机翼上的气流(从$ 10^6 $及以后)。我们还对翼型上的应力力引入指标,以评估重要的物理量的GDL模型。此外,我们提供广泛的GDL基准。
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部分微分方程(PDE)在许多复杂动态过程的数学建模中发挥着主导作用。解决这些PDE通常需要预定的计算成本,特别是当必须对不同的参数或条件进行多次评估时。在培训之后,神经运营商可以比传统的PDE溶剂更快地提供PDES解决方案。在这项工作中,检查两个神经运营商的不变性属性和计算复杂性,用于标量数量的运输PDE。基于图形内核网络(GKN)的神经运算符在图形结构数据上运行,以合并非识别依赖性。在这里,我们提出了改进的GKN制定以实现帧不变性。传染媒介云神经网络(VCNN)是一个具有嵌入式帧不变性的替代神经运算符,可在点云数据上运行。基于GKN的神经运营商与VCNN相比,略微更好地预测性能。然而,GKN需要过度高的计算成本,与VCNN的线性增加相比,随着越来越多的离散物对象而直角增加。
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基于简单的扩散层对空间通信非常有效的洞察力,我们对3D表面进行深度学习的新的通用方法。由此产生的网络是自动稳健的,以改变表面的分辨率和样品 - 一种对实际应用至关重要的基本属性。我们的网络可以在各种几何表示上离散化,例如三角网格或点云,甚至可以在一个表示上培训然后应用于另一个表示。我们优化扩散的空间支持,作为连续网络参数,从纯粹的本地到完全全球范围,从而消除手动选择邻域大小的负担。该方法中唯一的其他成分是在每个点处独立地施加的多层的Perceptron,以及用于支持方向滤波器的空间梯度特征。由此产生的网络简单,坚固,高效。这里,我们主要专注于三角网格表面,并且展示了各种任务的最先进的结果,包括表面分类,分割和非刚性对应。
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Many scientific fields study data with an underlying structure that is a non-Euclidean space. Some examples include social networks in computational social sciences, sensor networks in communications, functional networks in brain imaging, regulatory networks in genetics, and meshed surfaces in computer graphics. In many applications, such geometric data are large and complex (in the case of social networks, on the scale of billions), and are natural targets for machine learning techniques. In particular, we would like to use deep neural networks, which have recently proven to be powerful tools for a broad range of problems from computer vision, natural language processing, and audio analysis. However, these tools have been most successful on data with an underlying Euclidean or grid-like structure, and in cases where the invariances of these structures are built into networks used to model them.Geometric deep learning is an umbrella term for emerging techniques attempting to generalize (structured) deep neural models to non-Euclidean domains such as graphs and manifolds. The purpose of this paper is to overview different examples of geometric deep learning problems and present available solutions, key difficulties, applications, and future research directions in this nascent field.
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基于2D图像的3D对象的推理由于从不同方向查看对象引起的外观差异很大,因此具有挑战性。理想情况下,我们的模型将是对物体姿势变化的不变或等效的。不幸的是,对于2D图像输入,这通常是不可能的,因为我们没有一个先验模型,即在平面外对象旋转下如何改变图像。唯一的$ \ mathrm {so}(3)$ - 当前存在的模型需要点云输入而不是2D图像。在本文中,我们提出了一种基于Icosahedral群卷积的新型模型体系结构,即通过将输入图像投影到iCosahedron上,以$ \ mathrm {so(3)} $中的理由。由于此投影,该模型大致与$ \ mathrm {so}(3)$中的旋转大致相当。我们将此模型应用于对象构成估计任务,并发现它的表现优于合理的基准。
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3D网格的几何特征学习是计算机图形的核心,对于许多视觉应用非常重要。然而,由于缺乏所需的操作和/或其有效的实现,深度学习目前滞后于异构3D网格的层次建模。在本文中,我们提出了一系列模块化操作,以实现异构3D网格的有效几何深度学习。这些操作包括网格卷曲,(UN)池和高效的网格抽取。我们提供这些操作的开源实施,统称为\ Texit {Picasso}。 Picasso的网格抽取模块是GPU加速的模块,可以在飞行中加工一批用于深度学习的网格。我们(联合国)汇集操作在不同分辨率的网络层跨网络层计算新创建的神经元的功能。我们的网格卷曲包括FaceT2Vertex,Vertex2Facet和FaceT2Facet卷积,用于利用VMF混合物和重心插值来包含模糊建模。利用Picasso的模块化操作,我们贡献了一个新型的分层神经网络Picassonet-II,以了解3D网格的高度辨别特征。 Picassonet-II接受原始地理学和Mesh Facet的精细纹理作为输入功能,同时处理完整场景网格。我们的网络达到了各种基准的形状分析和场景的竞争性能。我们在github https://github.com/enyahermite/picasso发布Picasso和Picassonet-II。
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从3D点云数据学习迅速获得了势头,这是通过深度学习的成功和图像的增加的3D数据的可用性。在本文中,我们的目标是构建直接在源点云的表面上工作的各向异性卷积。这是具有挑战性的,因为缺乏在表面上的切向方向的全局坐标系。我们介绍一个名为Deltaconv的新卷积运算符,将几何运算符从外部计算结合起来,以便在点云上构建各向异性滤波器。因为这些运算符在标量和向量字段上定义,所以我们将网络分开到标量和矢量流,由运算符连接。矢量流使网络能够明确表示,评估和处理方向信息。我们的卷轴稳健且易于实施,并显示出与最先进的基准相比提高准确性,同时加快培训和推理。
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将对称性作为归纳偏置纳入神经网络体系结构已导致动态建模的概括,数据效率和身体一致性的提高。诸如CNN或e夫神经网络之类的方法使用重量绑定来强制执行对称性,例如偏移不变性或旋转率。但是,尽管物理定律遵守了许多对称性,但实际动力学数据很少符合严格的数学对称性,这是由于嘈杂或不完整的数据或基础动力学系统中的对称性破坏特征。我们探索近似模棱两可的网络,这些网络偏向于保存对称性,但并非严格限制这样做。通过放松的均衡约束,我们发现我们的模型可以胜过两个基线,而在模拟的湍流域和现实世界中的多流射流流中都没有对称性偏差和基线,并且具有过度严格的对称性。
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计算流体动力学(CFD)可用于模拟血管血流动力学并分析潜在的治疗方案。 CFD已显示对改善患者预后有益。但是,尚未实现CFD的实施CFD。 CFD的障碍包括高计算资源,设计模拟设置所需的专业经验以及较长的处理时间。这项研究的目的是探索使用机器学习(ML)以自动和快速回归模型复制常规主动脉CFD。用于训练/测试的数据该模型由在合成生成的3D主动脉形状上执行的3,000个CFD模拟组成。这些受试者是由基于实际患者特异性主动脉(n = 67)的统计形状模型(SSM)生成的。对200个测试形状进行的推理导致压力和速度的平均误差分别为6.01%+/- 3.12 SD和3.99%+/- 0.93 SD。我们的基于ML的模型在〜0.075秒内执行CFD(比求解器快4,000倍)。这项研究表明,可以使用ML以更快的速度,自动过程和高精度来复制常规血管CFD的结果。
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我们介绍了CheBlieset,一种对(各向异性)歧管的组成的方法。对基于GRAP和基于组的神经网络的成功进行冲浪,我们利用了几何深度学习领域的最新发展,以推导出一种新的方法来利用数据中的任何各向异性。通过离散映射的谎言组,我们开发由各向异性卷积层(Chebyshev卷积),空间汇集和解凝层制成的图形神经网络,以及全球汇集层。集团的标准因素是通过具有各向异性左不变性的黎曼距离的图形上的等级和不变的运算符来实现的。由于其简单的形式,Riemannian公制可以在空间和方向域中模拟任何各向异性。这种对Riemannian度量的各向异性的控制允许平衡图形卷积层的不变性(各向异性度量)的平衡(各向异性指标)。因此,我们打开大门以更好地了解各向异性特性。此外,我们经验证明了在CIFAR10上的各向异性参数的存在(数据依赖性)甜点。这一关键的结果是通过利用数据中的各向异性属性来获得福利的证据。我们还评估了在STL10(图像数据)和ClimateNet(球面数据)上的这种方法的可扩展性,显示了对不同任务的显着适应性。
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血流特征的预测对于了解血液动脉网络的行为至关重要,特别是在血管疾病(如狭窄)的存在下。计算流体动力学(CFD)提供了一种强大而有效的工具,可以确定包括网络内的压力和速度字段的这些特征。尽管该领域有许多研究,但CFD的极高计算成本导致研究人员开发新的平台,包括机器学习方法,而是以更低的成本提供更快的分析。在这项研究中,我们提出了一个深度神经网络框架,以预测冠状动脉网络中的流动行为,在存在像狭窄等异常存在下具有不同的性质。为此,使用合成数据训练人工神经网络(ANN)模型,使得它可以预测动脉网络内的压力和速度。培训神经网络所需的数据是从ABAQUS软件的特定特征的次数的CFD分析中获得了培训神经网络的数据。狭窄引起的血压下降,这是诊断心脏病诊断中最重要的因素之一,可以使用我们所提出的模型来了解冠状动脉的任何部分的几何和流动边界条件。使用Lad血管的三个实际几何形状来验证模型的效率。所提出的方法精确地预测了血流量的血流动力学行为。压力预测的平均精度为98.7%,平均速度幅度精度为93.2%。根据测试三个患者特定几何形状的模型的结果,模型可以被认为是有限元方法的替代方案以及其他难以实现的耗时数值模拟。
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A recent trend in deep learning research features the application of graph neural networks for mesh-based continuum mechanics simulations. Most of these frameworks operate on graphs in which each edge connects two nodes. Inspired by the data connectivity in the finite element method, we connect the nodes by elements rather than edges, effectively forming a hypergraph. We implement a message-passing network on such a node-element hypergraph and explore the capability of the network for the modeling of fluid flow. The network is tested on two common benchmark problems, namely the fluid flow around a circular cylinder and airfoil configurations. The results show that such a message-passing network defined on the node-element hypergraph is able to generate more stable and accurate temporal roll-out predictions compared to the baseline generalized message-passing network defined on a normal graph. Along with adjustments in activation function and training loss, we expect this work to set a new strong baseline for future explorations of mesh-based fluid simulations with graph neural networks.
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