晚期钆增强磁共振成像(LGE MRI)通常用于可视化和量化左心房(LA)疤痕。疤痕的位置和程度提供了心理生理学和心房颤动进展的重要信息(AF)。因此,LGE MRI的La Scar分段和量化可用于AF患者的计算机辅助诊断和治疗分层。由于手动描绘可能是耗时的,并且经过专家内和专家间变异性,因此非常需要自动化这种计算,这然而仍然仍然具有挑战性和研究。本文旨在为La腔,墙壁,瘢痕和消融差距分割和LGE MRI的定量提供系统审查,以及AF研究的相关文献。具体而言,我们首先总结AF相关的成像技术,特别是LGE MRI。然后,我们详细介绍了四个计算任务的方法,并总结了每个任务中应用的验证策略。最后,概述了未来可能的未来发展,简要调查了上述方法的潜在临床应用。审查表明,该主题的研究仍处于早期阶段。虽然已经提出了几种方法,但特别是对于LA分割,由于与图像采集的高度变化相关的性能问题和图像采集差异有关的性能问题,仍有很大的算法发展。
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晚期钆增强磁共振成像(LGE MRI)的左心房(LA)和心房瘢痕分割是临床实践中的重要任务。 %,引导消融治疗和预测心房颤动(AF)患者的治疗结果。然而,由于图像质量差,各种La形状,薄壁和周围增强区域,自动分割仍然具有挑战性。以前的方法通常独立解决了这两个任务,并忽略了洛杉矶和疤痕之间的内在空间关系。在这项工作中,我们开发了一个新的框架,即atrialjsqnet,其中La分段,在La表面上的瘢痕投影以及疤痕量化,在端到端的样式中进行。我们通过明确的表面投影提出了一种形状注意(SA),以利用LA和LA瘢痕之间的固有相关性。具体而言,SA方案嵌入到多任务架构中以执行联合LA分段和瘢痕量化。此外,引入了空间编码(SE)丢失以包含目标的连续空间信息,以便在预测的分割中减少嘈杂的斑块。我们从Miccai2018 La挑战中评估了60 LGE MRIS上提出的框架。在公共数据集上的广泛实验表明了拟议的ATRIALJSQNET的效果,从而实现了最先进的竞争性能。明确探索了LA分割和瘢痕量化之间的相关性,并对这两个任务显示出显着的性能改进。一旦稿件接受通过https://zmiclab.github.io/projects.html,就会公开发布的代码和结果。
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精确的心脏计算,多种式图像的分析和建模对于心脏病的诊断和治疗是重要的。晚期钆增强磁共振成像(LGE MRI)是一种有希望的技术,可视化和量化心肌梗塞(MI)和心房疤痕。由于LGE MRI的低图像质量和复杂的增强图案,MI和心房疤痕的自动化量可能是具有挑战性的。此外,与带金标准标签的其他序列LGE MRIS相比特别有限,这表示用于开发用于自动分割和LGE MRIS定量的新型算法的另一个障碍。本章旨在总结最先进的基于深度学习的多模态心脏图像分析的先进贡献。首先,我们向基于多序心脏MRI的心肌和病理分割介绍了两个基准工作。其次,提出了两种新的左心房瘢痕分割和从LGE MRI定量的新型框架。第三,我们为跨型心脏图像分割提出了三种无监督的域适应技术。
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心肌活力的评估对于患有心肌梗塞的患者的诊断和治疗管理是必不可少的,并且心肌病理学的分类是本评估的关键。这项工作定义了医学图像分析的新任务,即进行心肌病理分割(MYOPS)结合三个序列的心脏磁共振(CMR)图像,该图像首次与Mycai 2020一起在Myops挑战中提出的。挑战提供了45个配对和预对准的CMR图像,允许算法将互补信息与三个CMR序列组合到病理分割。在本文中,我们提供了挑战的详细信息,从十五个参与者的作品调查,并根据五个方面解释他们的方法,即预处理,数据增强,学习策略,模型架构和后处理。此外,我们对不同因素的结果分析了结果,以检查关键障碍和探索解决方案的潜力,以及为未来的研究提供基准。我们得出结论,虽然报告了有前途的结果,但研究仍处于早期阶段,在成功应用于诊所之前需要更深入的探索。请注意,MyOPS数据和评估工具继续通过其主页(www.sdspeople.fudan.edu.cn/zhuangxiahai/0/myops20 /)注册注册。
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机器学习和计算机视觉技术近年来由于其自动化,适合性和产生惊人结果的能力而迅速发展。因此,在本文中,我们调查了2014年至2022年之间发表的关键研究,展示了不同的机器学习算法研究人员用来分割肝脏,肝肿瘤和肝脉管结构的研究。我们根据感兴趣的组织(肝果,肝肿瘤或肝毒剂)对被调查的研究进行了划分,强调了同时解决多个任务的研究。此外,机器学习算法被归类为受监督或无监督的,如果属于某个方案的工作量很大,则将进一步分区。此外,对文献和包含上述组织面具的网站发现的不同数据集和挑战进行了彻底讨论,强调了组织者的原始贡献和其他研究人员的贡献。同样,在我们的评论中提到了文献中过度使用的指标,这强调了它们与手头的任务的相关性。最后,强调创新研究人员应对需要解决的差距的关键挑战和未来的方向,例如许多关于船舶分割挑战的研究的稀缺性以及为什么需要早日处理他们的缺席。
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人类生理学中的各种结构遵循特异性形态,通常在非常细的尺度上表达复杂性。这种结构的例子是胸前气道,视网膜血管和肝血管。可以观察到可以观察到可以观察到可以观察到可以观察到空间排列的磁共振成像(MRI),计算机断层扫描(CT),光学相干断层扫描(OCT)等医学成像模式(MRI),计算机断层扫描(CT),可以观察到空间排列的大量2D和3D图像的集合。这些结构在医学成像中的分割非常重要,因为对结构的分析提供了对疾病诊断,治疗计划和预后的见解。放射科医生手动标记广泛的数据通常是耗时且容易出错的。结果,在过去的二十年中,自动化或半自动化的计算模型已成为医学成像的流行研究领域,迄今为止,许多计算模型已经开发出来。在这项调查中,我们旨在对当前公开可用的数据集,细分算法和评估指标进行全面审查。此外,讨论了当前的挑战和未来的研究方向。
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多发性硬化症(MS)是中枢神经系统的慢性炎症和退行性疾病,其特征在于,白色和灰质的外观与个体患者的神经症状和标志进行地平整相关。磁共振成像(MRI)提供了详细的体内结构信息,允许定量和分类MS病变,其批判性地通知疾病管理。传统上,MS病变在2D MRI切片上手动注释,一个流程效率低,易于观察室内误差。最近,已经提出了自动统计成像分析技术以基于MRI体素强度检测和分段段病变。然而,它们的有效性受到MRI数据采集技术的异质性和MS病变的外观的限制。通过直接从图像学习复杂的病变表现,深度学习技术已经在MS病变分割任务中取得了显着的突破。在这里,我们提供了全面审查最先进的自动统计和深度学习MS分段方法,并讨论当前和未来的临床应用。此外,我们审查了域适应等技术策略,以增强现实世界临床环境中的MS病变分段。
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Clinical diagnostic and treatment decisions rely upon the integration of patient-specific data with clinical reasoning. Cancer presents a unique context that influence treatment decisions, given its diverse forms of disease evolution. Biomedical imaging allows noninvasive assessment of disease based on visual evaluations leading to better clinical outcome prediction and therapeutic planning. Early methods of brain cancer characterization predominantly relied upon statistical modeling of neuroimaging data. Driven by the breakthroughs in computer vision, deep learning became the de facto standard in the domain of medical imaging. Integrated statistical and deep learning methods have recently emerged as a new direction in the automation of the medical practice unifying multi-disciplinary knowledge in medicine, statistics, and artificial intelligence. In this study, we critically review major statistical and deep learning models and their applications in brain imaging research with a focus on MRI-based brain tumor segmentation. The results do highlight that model-driven classical statistics and data-driven deep learning is a potent combination for developing automated systems in clinical oncology.
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随着深度学习方法的进步,如深度卷积神经网络,残余神经网络,对抗网络的进步。 U-Net架构最广泛利用生物医学图像分割,以解决目标区域或子区域的识别和检测的自动化。在最近的研究中,基于U-Net的方法在不同应用中显示了最先进的性能,以便在脑肿瘤,肺癌,阿尔茨海默,乳腺癌等疾病的早期诊断和治疗中发育计算机辅助诊断系统等,使用各种方式。本文通过描述U-Net框架来提出这些方法的成功,然后通过执行1)型号的U-Net变体进行综合分析,2)模特内分类,建立更好的见解相关的挑战和解决方案。此外,本文还强调了基于U-Net框架在持续的大流行病,严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-COV-2)中的贡献也称为Covid-19。最后,分析了这些U-Net变体的优点和相似性以及生物医学图像分割所涉及的挑战,以发现该领域的未来未来的研究方向。
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深度学习已被广​​泛用于医学图像分割,并且录制了录制了该领域深度学习的成功的大量论文。在本文中,我们使用深层学习技术对医学图像分割的全面主题调查。本文进行了两个原创贡献。首先,与传统调查相比,直接将深度学习的文献分成医学图像分割的文学,并为每组详细介绍了文献,我们根据从粗略到精细的多级结构分类目前流行的文献。其次,本文侧重于监督和弱监督的学习方法,而不包括无监督的方法,因为它们在许多旧调查中引入而且他们目前不受欢迎。对于监督学习方法,我们分析了三个方面的文献:骨干网络的选择,网络块的设计,以及损耗功能的改进。对于虚弱的学习方法,我们根据数据增强,转移学习和交互式分割进行调查文献。与现有调查相比,本调查将文献分类为比例不同,更方便读者了解相关理由,并将引导他们基于深度学习方法思考医学图像分割的适当改进。
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组织学图像中核和腺体的实例分割是用于癌症诊断,治疗计划和生存分析的计算病理学工作流程中的重要一步。随着现代硬件的出现,大规模质量公共数据集的最新可用性以及社区组织的宏伟挑战已经看到了自动化方法的激增,重点是特定领域的挑战,这对于技术进步和临床翻译至关重要。在这项调查中,深入分析了过去五年(2017-2022)中发表的原子核和腺体实例细分的126篇论文,进行了深入分析,讨论了当前方法的局限性和公开挑战。此外,提出了潜在的未来研究方向,并总结了最先进方法的贡献。此外,还提供了有关公开可用数据集的概括摘要以及关于说明每种挑战的最佳性能方法的巨大挑战的详细见解。此外,我们旨在使读者现有研究的现状和指针在未来的发展方向上开发可用于临床实践的方法,从而可以改善诊断,分级,预后和癌症的治疗计划。据我们所知,以前没有工作回顾了朝向这一方向的组织学图像中的实例细分。
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通过磁共振成像(MRI)评估肿瘤负担对于评估胶质母细胞瘤的治疗反应至关重要。由于疾病的高异质性和复杂性,该评估的性能很复杂,并且与高变异性相关。在这项工作中,我们解决了这个问题,并提出了一条深度学习管道,用于对胶质母细胞瘤患者进行全自动的端到端分析。我们的方法同时确定了肿瘤的子区域,包括第一步的肿瘤,周围肿瘤和手术腔,然后计算出遵循神经符号学(RANO)标准的当前响应评估的体积和双相测量。此外,我们引入了严格的手动注释过程,其随后是人类专家描绘肿瘤子区域的,并捕获其分割的信心,后来在训练深度学习模型时被使用。我们广泛的实验研究的结果超过了760次术前和504例从公共数据库获得的神经胶质瘤后患者(2021 - 2020年在19个地点获得)和临床治疗试验(47和69个地点,可用于公共数据库(在19个地点获得)(47和69个地点)术前/术后患者,2009-2011)并以彻底的定量,定性和统计分析进行了备份,表明我们的管道在手动描述时间的一部分中对术前和术后MRI进行了准确的分割(最高20比人更快。二维和体积测量与专家放射科医生非常吻合,我们表明RANO测量并不总是足以量化肿瘤负担。
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Delineation of the left ventricular cavity, myocardium and right ventricle from cardiac magnetic resonance images (multi-slice 2D cine MRI) is a common clinical task to establish diagnosis. The automation of the corresponding tasks has thus been the subject of intense research over the past decades. In this paper, we introduce the "Automatic Cardiac Diagnosis Challenge" dataset (ACDC), the largest publicly-available and fully-annotated dataset for the purpose of Cardiac MRI (CMR) assessment. The dataset contains data from 150 multi-equipments CMRI recordings with reference measurements and classification O. Bernard and F. Cervenansky are with the
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人工智能(AI)技术具有重要潜力,可以实现有效,鲁棒和自动的图像表型,包括识别细微图案。基于AI的检测搜索图像空间基于模式和特征来找到兴趣区域。存在一种良性的肿瘤组织学,可以通过使用图像特征的基于AI的分类方法来识别。图像从图像中提取可用于的可覆盖方式,可以通过显式(手工/工程化)和深度辐射谱系框架来探索途径。辐射瘤分析有可能用作非侵入性技术,以准确表征肿瘤,以改善诊断和治疗监测。这项工作介绍基于AI的技术,专注于肿瘤宠物和PET / CT成像,用于不同的检测,分类和预测/预测任务。我们还讨论了所需的努力,使AI技术转换为常规临床工作流程,以及潜在的改进和互补技术,例如在电子健康记录和神经象征性AI技术上使用自然语言处理。
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对骨关节炎(OA)的磁共振成像(MRI)扫描的客观评估可以解决当前OA评估的局限性。 OA客观评估是必需的骨,软骨和关节液的分割。大多数提出的分割方法都不执行实例分割,并且遭受了类不平衡问题。这项研究部署了蒙版R-CNN实例分割并改进了IT(改进的面罩R-CNN(IMASKRCNN)),以获得与OA相关组织的更准确的广义分割。该方法的训练和验证是使用骨关节炎倡议(OAI)数据集的500次MRI膝盖和有症状髋关节OA患者的97次MRI扫描进行的。掩盖R-CNN的三个修改产生了iMaskRCNN:添加第二个Roialigned块,在掩码标先中添加了额外的解码器层,并通过跳过连接将它们连接起来。使用Hausdorff距离,骰子评分和变异系数(COV)评估结果。与面膜RCNN相比,iMaskRCNN导致骨骼和软骨分割的改善,这表明股骨的骰子得分从95%增加到98%,胫骨的95%到97%,股骨软骨的71%至80%,81%和81%胫骨软骨的%至82%。对于积液检测,iMaskRCNN 72%比MaskRCNN 71%改善了骰子。 Reader1和Mask R-CNN(0.33),Reader1和ImaskRCNN(0.34),Reader2和Mask R-CNN(0.22),Reader2和iMaskRCNN(0.29)之间的积液检测的COV值(0.34),读取器2和mask r-CNN(0.22)接近COV之间,表明人类读者与蒙版R-CNN和ImaskRCNN之间的一致性很高。蒙版R-CNN和ImaskRCNN可以可靠,同时提取与OA有关的不同规模的关节组织,从而为OA的自动评估构成基础。 iMaskRCNN结果表明,修改改善了边缘周围的网络性能。
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数据已成为当今世界上最有价值的资源。随着数据驱动算法的大量扩散,例如基于深度学习的方法,数据的可用性引起了极大的兴趣。在这种情况下,特别需要高质量的培训,验证和测试数据集。体积数据是医学中非常重要的资源,因为它范围从疾病诊断到治疗监测。如果数据集足够,则可以培训模型来帮助医生完成这些任务。不幸的是,在某些情况和应用程序中,大量数据不可用。例如,在医疗领域,罕见疾病和隐私问题可能导致数据可用性受到限制。在非医学领域,获得足够数量的高质量数据的高成本也可能引起人们的关注。解决这些问题的方法可能是生成合成数据,以结合其他更传统的数据增强方法来执行数据增强。因此,关于3D生成对抗网络(GAN)的大多数出版物都在医疗领域内。生成现实合成数据的机制的存在是克服这一挑战的好资产,尤其是在医疗保健中,因为数据必须具有良好的质量并且接近现实,即现实,并且没有隐私问题。在这篇综述中,我们提供了使用GAN生成现实的3D合成数据的作品的摘要。因此,我们概述了具有共同体系结构,优势和缺点的这些领域中基于GAN的方法。我们提出了一种新颖的分类学,评估,挑战和研究机会,以提供医学和其他领域甘恩当前状态的整体概述。
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胎儿超声(US)中胎盘的自动分割由于(i)(i)胎盘外观的高度多样性而具有挑战性我们禁止在妊娠晚期进行整个胎盘评估的观点。在这项工作中,我们通过多任务学习方法解决了这三个挑战,该方法结合了单个卷积神经网络中胎盘位置(例如,前,后部)和语义胎盘分段的分类。通过分类任务,模型可以从更大,更多样化的数据集中学习,同时在有限的训练集条件下提高分割任务的准确性。通过这种方法,我们研究了多个评估者的注释的变异性,并表明我们的自动分割(前胎盘的骰子为0.86,后胎盘的骰子为0.83),与观察者内和观察者间的变异性相比,我们的自动段性能达到了人级的性能。最后,我们的方法可以使用由三个阶段组成的多视图US采集管道提供整个胎盘分割:多探针图像采集,图像融合和图像分段。这会导致对较大结构(例如胎盘中的胎盘)的高质量分割,其图像伪像降低,这超出了单个探针的视野。
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在许多图像引导的临床方法中,医学图像分割是一个基本和关键的步骤。基于深度学习的细分方法的最新成功通常取决于大量标记的数据,这特别困难且昂贵,尤其是在医学成像领域中,只有专家才能提供可靠和准确的注释。半监督学习已成为一种吸引人的策略,并广泛应用于医学图像分割任务,以训练注释有限的深层模型。在本文中,我们对最近提议的半监督学习方法进行了全面综述,并总结了技术新颖性和经验结果。此外,我们分析和讨论现有方法的局限性和几个未解决的问题。我们希望这篇评论可以激发研究界探索解决这一挑战的解决方案,并进一步促进医学图像细分领域的发展。
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糖尿病(DM)可导致严重的微脉管破坏,最终导致糖尿病性视网膜病变(DR)或由于糖尿病引起的眼睛并发症。如果不受组织的检查,这种疾病会随着时间的流逝而增加,并最终导致完全视力丧失。检测到这种光学发展的一般方法是通过检查视网膜图像的血管,视神经头,微型毛发,出血,渗出液等。最终,这受到经验丰富的眼科医生和大量DM案例的数量的限制。为了启用早期有效的DR诊断,眼科领域需要强大的计算机辅助诊断(CAD)系统。我们的审查旨在为从学生到成熟的研究人员提供给任何人,他们想了解CAD系统及其算法可以完成的工作,再到建模以及计算机视觉和模式识别中的视网膜图像处理领域的发展方向。对于刚开始的人来说,我们特别强调了不同数据库和算法框架的逻辑,优势和缺点,重点是最近的方法。
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信号处理是几乎任何传感器系统的基本组件,具有不同科学学科的广泛应用。时间序列数据,图像和视频序列包括可以增强和分析信息提取和量化的代表性形式的信号。人工智能和机器学习的最近进步正在转向智能,数据驱动,信号处理的研究。该路线图呈现了最先进的方法和应用程序的关键概述,旨在突出未来的挑战和对下一代测量系统的研究机会。它涵盖了广泛的主题,从基础到工业研究,以简明的主题部分组织,反映了每个研究领域的当前和未来发展的趋势和影响。此外,它为研究人员和资助机构提供了识别新前景的指导。
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