宫颈癌是女性中一种非常常见和致命的癌症类型。细胞病理学图像通常用于筛选这种癌症。鉴于在手动筛查期间可能发生许多错误,已经开发了一种基于深度学习的计算机辅助诊断系统。深度学习方法需要输入图像的固定维度,但临床医学图像的尺寸不一致。图像的纵横比在直接调整它们的同时受到影响。临床上,细胞病理学图像内的细胞的纵横比为医生诊断癌症提供重要信息。因此,很难直接调整大小。然而,许多现有研究直接调整了图像的大小,并获得了高度稳健的分类结果。为了确定合理的解释,我们进行了一系列比较实验。首先,预处理SipakMed数据集的原始数据以获得标准和缩放数据集。然后,将数据集调整为224 x 224像素。最后,22种深度学习模型用于分类标准和缩放数据集。该研究的结果表明,深度学习模型对宫颈细胞病理学图像中细胞的纵横比变化是鲁棒的。此结论也通过Herlev DataSet验证。
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近年来,大肠癌已成为危害人类健康最重要的疾病之一。深度学习方法对于结直肠组织病理学图像的分类越来越重要。但是,现有方法更多地集中在使用计算机而不是人类计算机交互的端到端自动分类。在本文中,我们提出了一个IL-MCAM框架。它基于注意机制和互动学习。提出的IL-MCAM框架包括两个阶段:自动学习(AL)和交互性学习(IL)。在AL阶段,使用包含三种不同注意机制通道和卷积神经网络的多通道注意机制模型用于提取多通道特征进行分类。在IL阶段,提出的IL-MCAM框架不断地将错误分类的图像添加到交互式方法中,从而提高了MCAM模型的分类能力。我们对数据集进行了比较实验,并在HE-NCT-CRC-100K数据集上进行了扩展实验,以验证拟议的IL-MCAM框架的性能,分别达到98.98%和99.77%的分类精度。此外,我们进行了消融实验和互换性实验,以验证三个通道的能力和互换性。实验结果表明,所提出的IL-MCAM框架在结直肠组织病理学图像分类任务中具有出色的性能。
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背景和目的:胃癌已经成为全球第五次常见的癌症,早期检测胃癌对于拯救生命至关重要。胃癌的组织病理学检查是诊断胃癌的金标准。然而,计算机辅助诊断技术是挑战,以评估由于公开胃组织病理学图像数据集的稀缺而评估。方法:在本文中,公布了一种贵族公共胃组织病理学子尺寸图像数据库(GashissdB)以识别分类器的性能。具体地,包括两种类型的数据:正常和异常,总共245,196个组织案例图像。为了证明图像分类领域的不同时期的方法在GashissdB上具有差异,我们选择各种分类器进行评估。选择七种古典机器学习分类器,三个卷积神经网络分类器和新颖的基于变压器的分类器进行测试,用于测试图像分类任务。结果:本研究采用传统机器学习和深入学习方法进行了广泛的实验,以证明不同时期的方法对GashissdB具有差异。传统的机器学习实现了86.08%的最佳精度率,最低仅为41.12%。深度学习的最佳准确性达到96.47%,最低为86.21%。分类器的精度率显着变化。结论:据我们所知,它是第一个公开的胃癌组织病理学数据集,包含大量的弱监督学习的图像。我们认为Gashissdb可以吸引研究人员来探索胃癌自动诊断的新算法,这可以帮助医生和临床环境中的患者。
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现有的胃癌诊断深层学习方法,常用卷积神经网络。最近,视觉变压器由于其性能和效率而引起了极大的关注,但其应用主要在计算机视野领域。本文提出了一种用于Gashis变压器的多尺度视觉变压器模型,用于胃组织病理学图像分类(GHIC),其使微观胃图像自动分类为异常和正常情况。 GASHIS-COMPURANCER模型由两个关键模块组成:全球信息模块和局部信息模块有效提取组织病理特征。在我们的实验中,具有280个异常和正常图像的公共血毒素和曙红(H&E)染色的胃组织病理学数据集分为训练,验证和测试组,比率为1:1:2胃组织病理学数据集测试组精度,召回,F1分数和准确性分别为98.0%,100.0%,96.0%和98.0%。此外,进行了关键的研究以评估Gashis变压器的稳健性,其中添加了10个不同的噪声,包括四种对抗性攻击和六种传统图像噪声。此外,执行临床上有意义的研究以测试Gashis变压器的胃肠癌鉴定性能,具有620个异常图像,精度达到96.8%。最后,进行比较研究以测试在淋巴瘤图像数据集和乳腺癌数据集上的H&E和免疫组织化学染色图像的概括性,产生可比的F1分数(85.6%和82.8%)和精度(83.9%和89.4%) , 分别。总之,Gashistransformer演示了高分类性能,并在GHIC任务中显示出其显着潜力。
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胰腺癌是世界上最严重恶性的癌症之一,这种癌症迅速迅速,具有很高的死亡率。快速的现场评估(玫瑰)技术通过立即分析与现场病理学家的快速染色的细胞影析学形象来创新工作流程,这使得在这种紧压的过程中能够更快的诊断。然而,由于缺乏经验丰富的病理学家,玫瑰诊断的更广泛的扩张已经受到阻碍。为了克服这个问题,我们提出了一个混合高性能深度学习模型,以实现自动化工作流程,从而释放占据病理学家的宝贵时间。通过使用我们特定的多级混合设计将变压器块引入该字段,由卷积神经网络(CNN)产生的空间特征显着增强了变压器全球建模。转向多级空间特征作为全球关注指导,这种设计将鲁棒性与CNN的感应偏差与变压器的复杂全球建模功能相结合。收集4240朵Rose图像的数据集以评估此未开发领域的方法。所提出的多级混合变压器(MSHT)在分类精度下实现95.68%,其鲜明地高于最先进的模型。面对对可解释性的需求,MSHT以更准确的关注区域表达其对应物。结果表明,MSHT可以以前所未有的图像规模精确地区分癌症样本,奠定了部署自动决策系统的基础,并在临床实践中扩大玫瑰。代码和记录可在:https://github.com/sagizty/multi-stage-ybrid-transformer。
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Pneumonia, a respiratory infection brought on by bacteria or viruses, affects a large number of people, especially in developing and impoverished countries where high levels of pollution, unclean living conditions, and overcrowding are frequently observed, along with insufficient medical infrastructure. Pleural effusion, a condition in which fluids fill the lung and complicate breathing, is brought on by pneumonia. Early detection of pneumonia is essential for ensuring curative care and boosting survival rates. The approach most usually used to diagnose pneumonia is chest X-ray imaging. The purpose of this work is to develop a method for the automatic diagnosis of bacterial and viral pneumonia in digital x-ray pictures. This article first presents the authors' technique, and then gives a comprehensive report on recent developments in the field of reliable diagnosis of pneumonia. In this study, here tuned a state-of-the-art deep convolutional neural network to classify plant diseases based on images and tested its performance. Deep learning architecture is compared empirically. VGG19, ResNet with 152v2, Resnext101, Seresnet152, Mobilenettv2, and DenseNet with 201 layers are among the architectures tested. Experiment data consists of two groups, sick and healthy X-ray pictures. To take appropriate action against plant diseases as soon as possible, rapid disease identification models are preferred. DenseNet201 has shown no overfitting or performance degradation in our experiments, and its accuracy tends to increase as the number of epochs increases. Further, DenseNet201 achieves state-of-the-art performance with a significantly a smaller number of parameters and within a reasonable computing time. This architecture outperforms the competition in terms of testing accuracy, scoring 95%. Each architecture was trained using Keras, using Theano as the backend.
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为了产生最大的影响,必须使用基于证据的决策制定公共卫生计划。创建机器学习算法是为了收集,存储,处理和分析数据以提供知识和指导决策。任何监视系统的关键部分是图像分析。截至最近,计算机视觉和机器学习的社区最终对此感到好奇。这项研究使用各种机器学习和图像处理方法来检测和预测疟疾疾病。在我们的研究中,我们发现了深度学习技术作为具有更广泛适用于疟疾检测的智能工具的潜力,通过协助诊断病情,可以使医生受益。我们研究了针对计算机框架和组织的深度学习的共同限制,计算需要准备数据,准备开销,实时执行和解释能力,并发现对这些限制的轴承的未来询问。
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癌症是人体内部异常细胞的无法控制的细胞分裂,可以蔓延到其他身体器官。它是非传染性疾病(NCDS)和NCDS之一,占全世界总死亡人数的71%,而肺癌是女性乳腺癌后第二次诊断的癌症。肺癌的癌症生存率仅为19%。有各种方法用于诊断肺癌,如X射线,CT扫描,PET-CT扫描,支气管镜检查和活组织检查。然而,为了了解基于组织型H和E染色的肺癌亚型,广泛使用,其中染色在从活组织检查中吸入的组织上进行。研究报道,组织学类型与肺癌预后和治疗相关。因此,早期和准确地检测肺癌组织学是一种迫切需要,并且由于其治疗取决于疾病的组织学,分子曲线和阶段的类型,最重要的是分析肺癌的组织病理学图像。因此,为了加快肺癌诊断的重要过程,减少病理学家的负担,使用深层学习技术。这些技术表明了在分析癌症组织病变幻灯片的分析中提高了疗效。几项研究报告说,卷积神经网络(CNN)在脑,皮肤,乳腺癌,肺癌等各种癌症类型的组织病理学图片的分类中的重要性。在本研究中,通过使用Reset50,VGG-19,Inception_Resnet_V2和DenSenet进行特征提取和三重态丢失来引导CNN以引导CNN,以引导CNN,以引导CNN使得其增加群集间距离并减少集群内距离。
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The Coronavirus disease 2019 (COVID-19) was first identified in Wuhan, China, in early December 2019 and now becoming a pandemic. When COVID-19 patients undergo radiography examination, radiologists can observe the present of radiographic abnormalities from their chest X-ray (CXR) images. In this study, a deep convolutional neural network (CNN) model was proposed to aid radiologists in diagnosing COVID-19 patients. First, this work conducted a comparative study on the performance of modified VGG-16, ResNet-50 and DenseNet-121 to classify CXR images into normal, COVID-19 and viral pneumonia. Then, the impact of image augmentation on the classification results was evaluated. The publicly available COVID-19 Radiography Database was used throughout this study. After comparison, ResNet-50 achieved the highest accuracy with 95.88%. Next, after training ResNet-50 with rotation, translation, horizontal flip, intensity shift and zoom augmented dataset, the accuracy dropped to 80.95%. Furthermore, an ablation study on the effect of image augmentation on the classification results found that the combinations of rotation and intensity shift augmentation methods obtained an accuracy higher than baseline, which is 96.14%. Finally, ResNet-50 with rotation and intensity shift augmentations performed the best and was proposed as the final classification model in this work. These findings demonstrated that the proposed classification model can provide a promising result for COVID-19 diagnosis.
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全景牙科射线照相(PDR)图像处理是法医医学中最广泛使用的方法之一。深度学习模型由于其高处理速度,准确性和稳定性而被广泛用于当今放射学图像的自动分析。提出了一些使用转移学习的方法来分类PDR图像。在这项研究中,使用了Densenet121卷积神经网络(CNN)分类器,该分类器是预先训练的深度学习体系结构之一。提出的Densenet121网络已在最后一层之前进行了几层扩展和微调,以提高其从数据中理解更复杂模式的能力。在此阶段结束时,它已经通过包含PDR图像的牙科数据集进行了培训,并变得更有经验。采用了K折的交叉验证方法来提高所提出的Densenet121模型的准确性。在这项研究中,对于4,800个测试数据集的分类精度为97.25%,实现了最佳性能。提出的模型以及基于Grad-CAM的分析还表明,下颌骨和牙齿是性别分类中最重要的领域。
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乳腺癌是女性可能发生的最严重的癌症之一。通过分析组织学图像(HIS)来自动诊断乳腺癌对患者及其预后很重要。他的分类为临床医生提供了对疾病的准确了解,并使他们可以更有效地治疗患者。深度学习(DL)方法已成功地用于各种领域,尤其是医学成像,因为它们有能力自动提取功能。这项研究旨在使用他的乳腺癌对不同类型的乳腺癌进行分类。在这项研究中,我们提出了一个增强的胶囊网络,该网络使用RES2NET块和四个额外的卷积层提取多尺度特征。此外,由于使用了小的卷积内核和RES2NET块,因此所提出的方法具有较少的参数。结果,新方法的表现优于旧方法,因为它会自动学习最佳功能。测试结果表明该模型的表现优于先前的DL方法。
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With the development of a series of Galaxy sky surveys in recent years, the observations increased rapidly, which makes the research of machine learning methods for galaxy image recognition a hot topic. Available automatic galaxy image recognition researches are plagued by the large differences in similarity between categories, the imbalance of data between different classes, and the discrepancy between the discrete representation of Galaxy classes and the essentially gradual changes from one morphological class to the adjacent class (DDRGC). These limitations have motivated several astronomers and machine learning experts to design projects with improved galaxy image recognition capabilities. Therefore, this paper proposes a novel learning method, ``Hierarchical Imbalanced data learning with Weighted sampling and Label smoothing" (HIWL). The HIWL consists of three key techniques respectively dealing with the above-mentioned three problems: (1) Designed a hierarchical galaxy classification model based on an efficient backbone network; (2) Utilized a weighted sampling scheme to deal with the imbalance problem; (3) Adopted a label smoothing technique to alleviate the DDRGC problem. We applied this method to galaxy photometric images from the Galaxy Zoo-The Galaxy Challenge, exploring the recognition of completely round smooth, in between smooth, cigar-shaped, edge-on and spiral. The overall classification accuracy is 96.32\%, and some superiorities of the HIWL are shown based on recall, precision, and F1-Score in comparing with some related works. In addition, we also explored the visualization of the galaxy image features and model attention to understand the foundations of the proposed scheme.
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X-ray imaging technology has been used for decades in clinical tasks to reveal the internal condition of different organs, and in recent years, it has become more common in other areas such as industry, security, and geography. The recent development of computer vision and machine learning techniques has also made it easier to automatically process X-ray images and several machine learning-based object (anomaly) detection, classification, and segmentation methods have been recently employed in X-ray image analysis. Due to the high potential of deep learning in related image processing applications, it has been used in most of the studies. This survey reviews the recent research on using computer vision and machine learning for X-ray analysis in industrial production and security applications and covers the applications, techniques, evaluation metrics, datasets, and performance comparison of those techniques on publicly available datasets. We also highlight some drawbacks in the published research and give recommendations for future research in computer vision-based X-ray analysis.
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计算机辅助诊断数字病理学正在变得普遍存在,因为它可以提供更有效和客观的医疗保健诊断。最近的进展表明,卷积神经网络(CNN)架构是一种完善的深度学习范式,可用于设计一种用于乳腺癌检测的计算机辅助诊断(CAD)系统。然而,探索了污染变异性因污染变异性和染色常规化的影响,尚未得到很好的挑战。此外,对于高吞吐量筛选可能是重要的网络模型的性能分析,这也不适用于高吞吐量筛查,也不熟悉。要解决这一挑战,我们考虑了一些当代CNN模型,用于涉及(1)的乳房组织病理学图像的二进制分类。使用基于自适应颜色解卷积(ACD)的颜色归一化算法来处理污染归一化图像的数据以处理染色变量; (2)应用基于转移学习的一些可动性更高效的CNN模型的培训,即视觉几何组网络(VGG16),MobileNet和效率网络。我们在公开的Brankhis数据集上验证了培训的CNN网络,适用于200倍和400x放大的组织病理学图像。实验分析表明,大多数情况下预染额网络在数据增强乳房组织病理学图像中产生更好的质量,而不是污染归一化的情况。此外,我们使用污染标准化图像评估了流行轻量级网络的性能和效率,并发现在测试精度和F1分数方面,高效网络优于VGG16和MOBILENET。我们观察到在测试时间方面的效率比其他网络更好; vgg net,mobilenet,在分类准确性下没有太大降低。
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我们提出“ AITLAS:基准竞技场” - 一个开源基准测试框架,用于评估地球观察中图像分类的最新深度学习方法(EO)。为此,我们介绍了从九种不同的最先进的体系结构得出的400多个模型的全面比较分析,并将它们与来自22个具有不同尺寸的数据集的各种多级和多标签分类任务进行比较和属性。除了完全在这些数据集上训练的模型外,我们还基于在转移学习的背景下训练的模型,利用预训练的模型变体,因为通常在实践中执行。所有提出的方法都是一般的,可以轻松地扩展到本研究中未考虑的许多其他遥感图像分类任务。为了确保可重复性并促进更好的可用性和进一步的开发,所有实验资源在内的所有实验资源,包括训练的模型,模型配置和数据集的处理详细信息(以及用于培训和评估模型的相应拆分)都在存储库上公开可用:HTTPS ://github.com/biasvariancelabs/aitlas-arena。
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背景:宫颈癌严重影响了女性生殖系统的健康。光学相干断层扫描(OCT)作为宫颈疾病检测的非侵入性,高分辨率成像技术。然而,OCT图像注释是知识密集型和耗时的,这阻碍了基于深度学习的分类模型的培训过程。目的:本研究旨在基于自我监督学习,开发一种计算机辅助诊断(CADX)方法来对体内宫颈OCT图像进行分类。方法:除了由卷积神经网络(CNN)提取的高电平语义特征外,建议的CADX方法利用了通过对比纹理学习来利用未标记的宫颈OCT图像的纹理特征。我们在中国733名患者的多中心临床研究中对OCT图像数据集进行了十倍的交叉验证。结果:在用于检测高风险疾病的二元分类任务中,包括高级鳞状上皮病变和宫颈癌,我们的方法实现了0.9798加号或减去0.0157的面积曲线值,灵敏度为91.17加或对于OCT图像贴片,减去4.99%,特异性为93.96加仑或减去4.72%;此外,它在测试集上的四位医学专家中表现出两种。此外,我们的方法在使用交叉形阈值投票策略的118名中国患者中达到了91.53%的敏感性和97.37%的特异性。结论:所提出的基于对比 - 学习的CADX方法表现优于端到端的CNN模型,并基于纹理特征提供更好的可解释性,其在“见和治疗”的临床协议中具有很大的潜力。
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大多数杂草物种都会通过竞争高价值作物所需的营养而产生对农业生产力的不利影响。手动除草对于大型种植区不实用。已经开展了许多研究,为农业作物制定了自动杂草管理系统。在这个过程中,其中一个主要任务是识别图像中的杂草。但是,杂草的认可是一个具有挑战性的任务。它是因为杂草和作物植物的颜色,纹理和形状类似,可以通过成像条件,当记录图像时的成像条件,地理或天气条件进一步加剧。先进的机器学习技术可用于从图像中识别杂草。在本文中,我们调查了五个最先进的深神经网络,即VGG16,Reset-50,Inception-V3,Inception-Resnet-V2和MobileNetv2,并评估其杂草识别的性能。我们使用了多种实验设置和多个数据集合组合。特别是,我们通过组合几个较小的数据集,通过数据增强构成了一个大型DataSet,缓解了类别不平衡,并在基于深度神经网络的基准测试中使用此数据集。我们通过保留预先训练的权重来调查使用转移学习技术来利用作物和杂草数据集的图像提取特征和微调它们。我们发现VGG16比小规模数据集更好地执行,而ResET-50比其他大型数据集上的其他深网络更好地执行。
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这项研究提出了一个可靠的模型,用于识别具有最高精度的不同建筑材料,该模型被利用为用于广泛的施工应用(例如自动进度监控)的有利工具。在这项研究中,一种称为视觉变压器(VIT)的新型深度学习结构用于检测和分类建筑材料。使用不同的图像数据集评估了所采用方法的鲁棒性。为此,对模型进行了训练和测试,并在两个大型不平衡数据集上进行了测试,即建筑材料库(CML)和建筑材料数据集(BMD)。还通过组合CML和BMD来创建更不平衡的数据集并评估使用方法的功能来生成第三个数据集。所达到的结果揭示了评估指标的精度为100%,例如三个不同数据集的每个材料类别的准确性,精度,召回率和F1得分。据信,建议的模型实现了用于检测和分类不同材料类型的强大工具。迄今为止,许多研究试图自动对仍然存在一些错误的各种建筑材料进行分类。这项研究将解决上述缺点,并提出一个模型以更高的精度检测材料类型。所采用的模型也能够被推广到不同的数据集。
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组织病理学仍然是各种癌症诊断的黄金标准。计算机视觉的最新进展,特别是深度学习,促进了针对各种任务的组织病理学图像的分析,包括免疫细胞检测和微卫星不稳定性分类。每个任务的最新工作通常采用鉴定的基础体系结构,这些体系结构已鉴定为图像分类。开发组织病理学分类器的标准方法倾向于将重点放在优化单个任务的模型上,而不是考虑建模创新的各个方面,从而改善了跨任务的概括。在这里,我们提出了Champkit(模型预测工具包的全面组织病理学评估):可扩展的,完全可重现的基准测试工具包,由大量的斑点级图像分类任务组成,跨不同的癌症。 Champkit能够系统地记录模型和方法中提议改进的性能影响的一种方法。 Champkit源代码和数据可在https://github.com/kaczmarj/champkit上自由访问。
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乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤,每年负责超过50万人死亡。因此,早期和准确的诊断至关重要。人类专业知识是诊断和正确分类乳腺癌并定义适当的治疗,这取决于评价不同生物标志物如跨膜蛋白受体HER2的表达。该评估需要几个步骤,包括免疫组织化学或原位杂交等特殊技术,以评估HER2状态。通过降低诊断中的步骤和人类偏差的次数的目标,赫洛挑战是组织的,作为第16届欧洲数字病理大会的并行事件,旨在自动化仅基于苏木精和曙红染色的HER2地位的评估侵袭性乳腺癌的组织样本。评估HER2状态的方法是在全球21个团队中提出的,并通过一些提议的方法实现了潜在的观点,以推进最先进的。
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