Graph Neural Networks (GNNs) have achieved great successes in many learning tasks performed on graph structures. Nonetheless, to propagate information GNNs rely on a message passing scheme which can become prohibitively expensive when working with industrial-scale graphs. Inspired by the PPRGo model, we propose the CorePPR model, a scalable solution that utilises a learnable convex combination of the approximate personalised PageRank and the CoreRank to diffuse multi-hop neighbourhood information in GNNs. Additionally, we incorporate a dynamic mechanism to select the most influential neighbours for a particular node which reduces training time while preserving the performance of the model. Overall, we demonstrate that CorePPR outperforms PPRGo, particularly on large graphs where selecting the most influential nodes is particularly relevant for scalability. Our code is publicly available at: https://github.com/arielramos97/CorePPR.
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Neural message passing algorithms for semi-supervised classification on graphs have recently achieved great success. However, for classifying a node these methods only consider nodes that are a few propagation steps away and the size of this utilized neighborhood is hard to extend. In this paper, we use the relationship between graph convolutional networks (GCN) and PageRank to derive an improved propagation scheme based on personalized PageRank. We utilize this propagation procedure to construct a simple model, personalized propagation of neural predictions (PPNP), and its fast approximation, APPNP. Our model's training time is on par or faster and its number of parameters on par or lower than previous models. It leverages a large, adjustable neighborhood for classification and can be easily combined with any neural network. We show that this model outperforms several recently proposed methods for semi-supervised classification in the most thorough study done so far for GCN-like models. Our implementation is available online. 1
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在过去几年中,人们对代表性学习的图形神经网络(GNN)的兴趣不大。GNN提供了一个一般有效的框架,可以从图形结构化数据中学习。但是,GNN通常仅使用一个非常有限的邻域的信息来避免过度光滑。希望为模型提供更多信息。在这项工作中,我们将个性化Pagerank(PPR)的极限分布纳入图形注意力网络(GATS)中,以反映较大的邻居信息,而无需引入过度光滑。从直觉上讲,基于个性化Pagerank的消息聚合对应于无限的许多邻里聚合层。我们表明,对于四个广泛使用的基准数据集,我们的模型优于各种基线模型。我们的实施已在线公开。
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图形神经网络(GNNS)依赖于图形结构来定义聚合策略,其中每个节点通过与邻居的信息组合来更新其表示。已知GNN的限制是,随着层数的增加,信息被平滑,压扁并且节点嵌入式变得无法区分,对性能产生负面影响。因此,实用的GNN模型雇用了几层,只能在每个节点周围的有限邻域利用图形结构。不可避免地,实际的GNN不会根据图的全局结构捕获信息。虽然有几种研究GNNS的局限性和表达性,但是关于图形结构数据的实际应用的问题需要全局结构知识,仍然没有答案。在这项工作中,我们通过向几个GNN模型提供全球信息并观察其对下游性能的影响来认证解决这个问题。我们的研究结果表明,全球信息实际上可以为共同的图形相关任务提供显着的好处。我们进一步确定了一项新的正规化策略,导致所有考虑的任务的平均准确性提高超过5%。
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A prominent paradigm for graph neural networks is based on the message passing framework. In this framework, information communication is realized only between neighboring nodes. The challenge of approaches that use this paradigm is to ensure efficient and accurate \textit{long distance communication} between nodes, as deep convolutional networks are prone to over-smoothing. In this paper, we present a novel method based on time derivative graph diffusion (TIDE), with a learnable time parameter. Our approach allows to adapt the spatial extent of diffusion across different tasks and network channels, thus enabling medium and long-distance communication efficiently. Furthermore, we show that our architecture directly enables local message passing and thus inherits from the expressive power of local message passing approaches. We show that on widely used graph benchmarks we achieve comparable performance and on a synthetic mesh dataset we outperform state-of-the-art methods like GCN or GRAND by a significant margin.
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图形神经网络(GNN)已被广泛应用于各种领域,以通过图形结构数据学习。在各种任务(例如节点分类和图形分类)中,他们对传统启发式方法显示了显着改进。但是,由于GNN严重依赖于平滑的节点特征而不是图形结构,因此在链接预测中,它们通常比简单的启发式方法表现出差的性能,例如,结构信息(例如,重叠的社区,学位和最短路径)至关重要。为了解决这一限制,我们建议邻里重叠感知的图形神经网络(NEO-GNNS),这些神经网络(NEO-GNNS)从邻接矩阵中学习有用的结构特征,并估算了重叠的邻域以进行链接预测。我们的Neo-Gnns概括了基于社区重叠的启发式方法,并处理重叠的多跳社区。我们在开放图基准数据集(OGB)上进行的广泛实验表明,NEO-GNNS始终在链接预测中实现最新性能。我们的代码可在https://github.com/seongjunyun/neo_gnns上公开获取。
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Recently, graph neural networks (GNNs) have revolutionized the field of graph representation learning through effectively learned node embeddings, and achieved state-of-the-art results in tasks such as node classification and link prediction. However, current GNN methods are inherently flat and do not learn hierarchical representations of graphs-a limitation that is especially problematic for the task of graph classification, where the goal is to predict the label associated with an entire graph. Here we propose DIFFPOOL, a differentiable graph pooling module that can generate hierarchical representations of graphs and can be combined with various graph neural network architectures in an end-to-end fashion. DIFFPOOL learns a differentiable soft cluster assignment for nodes at each layer of a deep GNN, mapping nodes to a set of clusters, which then form the coarsened input for the next GNN layer. Our experimental results show that combining existing GNN methods with DIFFPOOL yields an average improvement of 5-10% accuracy on graph classification benchmarks, compared to all existing pooling approaches, achieving a new state-of-the-art on four out of five benchmark data sets.
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图表可以模拟实体之间的复杂交互,它在许多重要的应用程序中自然出现。这些应用程序通常可以投入到标准图形学习任务中,其中关键步骤是学习低维图表示。图形神经网络(GNN)目前是嵌入方法中最受欢迎的模型。然而,邻域聚合范例中的标准GNN患有区分\ EMPH {高阶}图形结构的有限辨别力,而不是\ EMPH {低位}结构。为了捕获高阶结构,研究人员求助于主题和开发的基于主题的GNN。然而,现有的基于主基的GNN仍然仍然遭受较少的辨别力的高阶结构。为了克服上述局限性,我们提出了一个新颖的框架,以更好地捕获高阶结构的新框架,铰接于我们所提出的主题冗余最小化操作员和注射主题组合的新颖框架。首先,MGNN生成一组节点表示W.R.T.每个主题。下一阶段是我们在图案中提出的冗余最小化,该主题在彼此相互比较并蒸馏出每个主题的特征。最后,MGNN通过组合来自不同图案的多个表示来执行节点表示的更新。特别地,为了增强鉴别的功率,MGNN利用重新注射功能来组合表示的函数w.r.t.不同的主题。我们进一步表明,我们的拟议体系结构增加了GNN的表现力,具有理论分析。我们展示了MGNN在节点分类和图形分类任务上的七个公共基准上表现出最先进的方法。
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数据处理的最新进展刺激了对非常大尺度的学习图的需求。众所周知,图形神经网络(GNN)是解决图形学习任务的一种新兴和有力的方法,很难扩大规模。大多数可扩展模型应用基于节点的技术来简化GNN的昂贵图形消息传播过程。但是,我们发现当应用于百万甚至数十亿尺度的图表时,这种加速度不足。在这项工作中,我们提出了Scara,这是一种可扩展的GNN,具有针对图形计算的特征优化。 Scara有效地计算出从节点功能中嵌入的图形,并进一步选择和重用功能计算结果以减少开销。理论分析表明,我们的模型在传播过程以及GNN培训和推理中具有确保精度,实现了子线性时间的复杂性。我们在各种数据集上进行了广泛的实验,以评估圣aca的功效和效率。与基线的性能比较表明,与快速收敛和可比精度相比,与当前的最新方法相比,圣aca最高可达到100倍的图形传播加速度。最值得注意的是,在100秒内处理最大的十亿个GNN数据集纸100m(1.11亿节点,1.6B边缘)上的预先计算是有效的。
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图神经网络(GNN)在图形深学习域中受到了很多关注。但是,从经验和理论上,最近的研究表明,深度GNN遭受了过度拟合和过度平滑的问题。通常的解决方案不能解决深度GNN的大量运行时,或者在同一特征空间中限制了图形卷积。我们提出了自适应图扩散网络(AGDN),该网络在具有中等复杂性和运行时的不同特征空间中执行多层广义图扩散。标准图扩散方法将过渡矩阵的大且密集的功率与预定义的加权系数结合在一起。取而代之的是,AGDN将较小的多跳节点表示与可学习的加权系数结合在一起。我们提出了两种可扩展的加权系数机制,以捕获多跳信息:趋于关注(HA)和霍普·沃斯卷积(HC)。我们评估了具有半监督节点分类和链接预测任务的多样性,挑战开放图基准(OGB)数据集的AGDN。直到提交日期(2022年8月26日),AGDNS在OGBN-ARXIV,OGBN-蛋白质和OGBL-DDI数据集中实现了TOP-1性能,并且在OGBL-Citater2数据集中获得了TOP-3性能。在类似的Tesla V100 GPU卡上,AGDNS优于可逆的GNNS(REVGNNS),其复杂性为13%,REVGNN在OGBN-Proteins数据集上的培训时间为1%。 AGDN还可以通过36%的训练来实现与密封的可比性能,而OGBL-Citation2数据集的密封量为0.2%的推理运行时。
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图形神经网络(GNNS)在建模图形结构数据方面表明了它们的能力。但是,实际图形通常包含结构噪声并具有有限的标记节点。当在这些图表中培训时,GNN的性能会显着下降,这阻碍了许多应用程序的GNN。因此,与有限标记的节点开发抗噪声GNN是重要的。但是,这是一个相当有限的工作。因此,我们研究了在具有有限标记节点的嘈杂图中开发鲁棒GNN的新问题。我们的分析表明,嘈杂的边缘和有限的标记节点都可能损害GNN的消息传递机制。为减轻这些问题,我们提出了一种新颖的框架,该框架采用嘈杂的边缘作为监督,以学习去噪和密集的图形,这可以减轻或消除嘈杂的边缘,并促进GNN的消息传递,以缓解有限标记节点的问题。生成的边缘还用于规则地将具有标记平滑度的未标记节点的预测规范化,以更好地列车GNN。实验结果对现实世界数据集展示了在具有有限标记节点的嘈杂图中提出框架的稳健性。
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图形神经网络已成为从图形结构数据学习的不可缺少的工具之一,并且它们的实用性已在各种各样的任务中显示。近年来,建筑设计的巨大改进,导致各种预测任务的性能更好。通常,这些神经架构在同一层中使用可知的权重矩阵组合节点特征聚合和特征转换。这使得分析从各种跳过的节点特征和神经网络层的富有效力来挑战。由于不同的图形数据集显示在特征和类标签分布中的不同级别和异常级别,因此必须了解哪些特征对于没有任何先前信息的预测任务是重要的。在这项工作中,我们将节点特征聚合步骤和深度与图形神经网络分离,并经验分析了不同的聚合特征在预测性能中发挥作用。我们表明,并非通过聚合步骤生成的所有功能都很有用,并且通常使用这些较少的信息特征可能对GNN模型的性能有害。通过我们的实验,我们表明学习这些功能的某些子集可能会导致各种数据集的性能更好。我们建议使用Softmax作为常规器,并从不同跳距的邻居聚合的功能的“软选择器”;和L2 - GNN层的标准化。结合这些技术,我们呈现了一个简单浅的模型,特征选择图神经网络(FSGNN),并经验展示所提出的模型比九个基准数据集中的最先进的GNN模型实现了可比或甚至更高的准确性节点分类任务,具有显着的改进,可达51.1%。
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Graph neural networks have shown significant success in the field of graph representation learning. Graph convolutions perform neighborhood aggregation and represent one of the most important graph operations. Nevertheless, one layer of these neighborhood aggregation methods only consider immediate neighbors, and the performance decreases when going deeper to enable larger receptive fields. Several recent studies attribute this performance deterioration to the over-smoothing issue, which states that repeated propagation makes node representations of different classes indistinguishable. In this work, we study this observation systematically and develop new insights towards deeper graph neural networks. First, we provide a systematical analysis on this issue and argue that the key factor compromising the performance significantly is the entanglement of representation transformation and propagation in current graph convolution operations. After decoupling these two operations, deeper graph neural networks can be used to learn graph node representations from larger receptive fields. We further provide a theoretical analysis of the above observation when building very deep models, which can serve as a rigorous and gentle description of the over-smoothing issue. Based on our theoretical and empirical analysis, we propose Deep Adaptive Graph Neural Network (DAGNN) to adaptively incorporate information from large receptive fields. A set of experiments on citation, coauthorship, and co-purchase datasets have confirmed our analysis and insights and demonstrated the superiority of our proposed methods. CCS CONCEPTS• Mathematics of computing → Graph algorithms; • Computing methodologies → Artificial intelligence; Neural networks.
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Machine Unerning是在收到删除请求时从机器学习(ML)模型中删除某些培训数据的影响的过程。虽然直接而合法,但从划痕中重新训练ML模型会导致高计算开销。为了解决这个问题,在图像和文本数据的域中提出了许多近似算法,其中SISA是最新的解决方案。它将训练集随机分配到多个碎片中,并为每个碎片训练一个组成模型。但是,将SISA直接应用于图形数据可能会严重损害图形结构信息,从而导致的ML模型实用程序。在本文中,我们提出了Grapheraser,这是一种针对图形数据量身定制的新型机器学习框架。它的贡献包括两种新型的图形分区算法和一种基于学习的聚合方法。我们在五个现实世界图数据集上进行了广泛的实验,以说明Grapheraser的学习效率和模型实用程序。它可以实现2.06 $ \ times $(小数据集)至35.94 $ \ times $(大数据集)未学习时间的改进。另一方面,Grapheraser的实现最高62.5美元\%$更高的F1分数,我们提出的基于学习的聚合方法可达到高达$ 112 \%$ $ F1分数。 github.com/minchen00/graph-unlearning}。}。}
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图表神经网络(GNNS)在各种机器学习任务中获得了表示学习的提高。然而,应用邻域聚合的大多数现有GNN通常在图中的图表上执行不良,其中相邻的节点属于不同的类。在本文中,我们示出了在典型的异界图中,边缘可以被引导,以及是否像是处理边缘,也可以使它们过度地影响到GNN模型的性能。此外,由于异常的限制,节点对来自本地邻域之外的类似节点的消息非常有益。这些激励我们开发一个自适应地学习图表的方向性的模型,并利用潜在的长距离相关性节点之间。我们首先将图拉普拉斯概括为基于所提出的特征感知PageRank算法向数字化,该算法同时考虑节点之间的图形方向性和长距离特征相似性。然后,Digraph Laplacian定义了一个图形传播矩阵,导致一个名为{\ em diglaciangcn}的模型。基于此,我们进一步利用节点之间的通勤时间测量的节点接近度,以便在拓扑级别上保留节点的远距离相关性。具有不同级别的10个数据集的广泛实验,同意级别展示了我们在节点分类任务任务中对现有解决方案的有效性。
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最近,图形神经网络(GNN)通过利用图形结构和节点特征的知识来表现出图表表示的显着性能。但是,他们中的大多数都有两个主要限制。首先,GNN可以通过堆叠更多的层来学习高阶结构信息,但由于过度光滑的问题,无法处理较大的深度。其次,由于昂贵的计算成本和高内存使用情况,在大图上应用这些方法并不容易。在本文中,我们提出了节点自适应特征平滑(NAFS),这是一种简单的非参数方法,该方法构建了没有参数学习的节点表示。 NAFS首先通过特征平滑提取每个节点及其不同啤酒花的邻居的特征,然后自适应地结合了平滑的特征。此外,通过不同的平滑策略提取的平滑特征的合奏可以进一步增强构建的节点表示形式。我们在两个不同的应用程序方案上对四个基准数据集进行实验:节点群集和链接预测。值得注意的是,具有功能合奏的NAFS优于这些任务上最先进的GNN,并减轻上述大多数基于学习的GNN对应物的两个限制。
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Graph Neural Networks (GNNs) have been widely applied in the semi-supervised node classification task, where a key point lies in how to sufficiently leverage the limited but valuable label information. Most of the classical GNNs solely use the known labels for computing the classification loss at the output. In recent years, several methods have been designed to additionally utilize the labels at the input. One part of the methods augment the node features via concatenating or adding them with the one-hot encodings of labels, while other methods optimize the graph structure by assuming neighboring nodes tend to have the same label. To bring into full play the rich information of labels, in this paper, we present a label-enhanced learning framework for GNNs, which first models each label as a virtual center for intra-class nodes and then jointly learns the representations of both nodes and labels. Our approach could not only smooth the representations of nodes belonging to the same class, but also explicitly encode the label semantics into the learning process of GNNs. Moreover, a training node selection technique is provided to eliminate the potential label leakage issue and guarantee the model generalization ability. Finally, an adaptive self-training strategy is proposed to iteratively enlarge the training set with more reliable pseudo labels and distinguish the importance of each pseudo-labeled node during the model training process. Experimental results on both real-world and synthetic datasets demonstrate our approach can not only consistently outperform the state-of-the-arts, but also effectively smooth the representations of intra-class nodes.
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链接预测是图神经网络(GNN)的重要应用。链接预测的大多数现有GNN基于一维Weisfeiler-Lehman(1-WL)测试。 1-wl-gnn首先通过迭代的相邻节点特征来计算中心,然后通过汇总成对节点表示来获得链接表示。正如先前的作品所指出的那样,这两步过程会导致较低的区分功能,因为自然而然地学习节点级表示而不是链接级别。在本文中,我们研究了一种完全不同的方法,该方法可以基于\ textit {二维WEISFEILER-LEHMAN(2-WL)测试直接获得节点对(链接)表示。 2-WL测试直接使用链接(2个小说)作为消息传递单元而不是节点,因此可以直接获得链接表示。我们理论上分析了2-WL测试的表达能力以区分非晶状体链接,并证明其优越的链接与1-WL相比。基于不同的2-WL变体,我们提出了一系列用于链路预测的新型2-WL-GNN模型。在广泛的现实数据集上进行的实验证明了它们对最先进的基线的竞争性能以及优于普通1-WL-GNN的优势。
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图神经网络(GNN)是一类流行的机器学习模型。受到学习解释(L2X)范式的启发,我们提出了L2XGNN,这是一个可解释的GNN的框架,该框架通过设计提供了忠实的解释。L2XGNN学习了一种选择解释性子图(主题)的机制,该机制仅在GNNS消息通话操作中使用。L2XGNN能够为每个输入图选择具有特定属性的子图,例如稀疏和连接。对主题施加这种限制通常会导致更容易解释和有效的解释。几个数据集的实验表明,L2XGNN使用整个输入图实现了与基线方法相同的分类精度,同时确保仅使用提供的解释来进行预测。此外,我们表明L2XGNN能够识别负责预测图形属性的主题。
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由于大型数据集中的深度学习模型需要大量时间和资源,因此希望构建一个小型合成数据集,我们可以通过该数据集充分训练深度学习模型。最近有一些作品通过复杂的BI级优化探索了有关凝结图像数据集的解决方案。例如,数据集冷凝(DC)匹配网络梯度W.R.T.大型数据和小合成数据,在每个外迭代处,网络权重优化了多个步骤。但是,现有方法具有其固有的局限性:(1)它们不直接适用于数据离散的图表; (2)由于所涉及的嵌套优化,冷凝过程在计算上昂贵。为了弥合差距,我们研究了针对图形数据集量身定制的有效数据集冷凝,在该数据集中我们将离散图结构模拟为概率模型。我们进一步提出了一个单步梯度匹配方案,该方案仅执行一个步骤,而无需训练网络权重。我们的理论分析表明,该策略可以生成合成图,从而导致实际图上的分类损失降低。各种图数据集的广泛实验证明了该方法的有效性和效率。特别是,我们能够将数据集大小降低90%,同时大约98%的原始性能,并且我们的方法明显快于多步梯度匹配(例如,CIFAR10中的15倍用于合成500个图)。
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