通过医学成像检测疾病是由于其非侵入性的。医学成像支持多种数据模式,可以在人体内部进行彻底快速的外观。但是,解释成像数据通常是耗时的,需要大量的人类专业知识。深度学习模型可以加快解释并减轻人类专家的工作。但是,这些模型是数据密集型的,需要大量标记的图像进行培训。在新型疾病暴发(例如Covid-19)中,我们通常没有所需的标记成像数据,尤其是在流行病开始时。深度转移学习通过在公共领域中使用验证的模型来解决此问题,例如任何VGGNET,RESNET,INCEPTION,DENSENET等的变体都是功能学习者,以快速从较少的样本中适应目标任务。大多数审慎的模型都是深层建筑的深度。他们接受了大型多级数据集(例如ImageNet)的培训,并在建筑设计和超级参数调整方面进行了重大努力。我们提出了1个更简单的生成源模型,在单个但相关的概念上预估计,可以与现有较大的预审预周化模型一样有效。我们证明了生成转移学习的有用性,该学习需要较少的计算和培训数据,对于少数射击学习(FSL),使用COVID-19-19,二进制分类用例。我们将经典的深度转移学习与我们的方法进行了比较,还报告了FSL结果,三个设置为84、20和10个培训样本。用于COVID-19分类的生成FSL的模型实现可在https://github.com/suvarnak/generativefslcovid.git上公开获得。
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在研究中,我们开发了一种计算机视觉解决方案,以支持诊断放射区分在Covid-19肺炎,流感病毒肺炎和正常生物标志物之间。 Covid-19肺炎的胸部射线照相出现被认为是非特异性的,提出了挑战,以确定卷积神经网络(CNN)的最佳架构,该挑战是Covid-19和非-covid-19种肺炎。 Rahman(2021)指出Covid-19射线照相图像观察影响诊断过程的不可用和质量问题,并影响深度学习检测模型的准确性。 Covid-19造影图像的显着稀缺性引入了对我们使用过采样技术的数据的不平衡。在该研究中,我们包括具有Covid-19肺炎,流感病毒肺炎和正常生物标志物的人肺(CXR)的广泛的X射线成像,以实现可伸展和准确的CNN模型。在研究的实验阶段,我们评估了各种卷积网络架构,选择了具有两个传统卷积层和两个具有最大功能的汇集层的连续卷积网络。在其分类性能中,最佳性能模型展示了93%的验证精度,F1分数为0.95。我们选择了Azure机器学习服务来执行网络实验和解决方案部署。自动缩放计算集群在网络培训中提供了大量的减少。我们希望在人工智能和人类生物学领域看到科学家合作,并扩展建议的解决方案,以提供快速和全面的诊断,有效地减轻病毒的传播
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背景和目的:与生物医学分析相结合的人工智能(AI)方法在Pandemics期间具有关键作用,因为它有助于释放来自医疗保健系统和医生的压力压力。由于持续的Covid-19危机在具有茂密的人口和巴西和印度等测试套件中的国家恶化,放射性成像可以作为准确分类Covid-19患者的重要诊断工具,并在适当时期规定必要的治疗。通过这种动机,我们基于使用胸部X射线检测Covid-19感染肺的深度学习架构的研究。数据集:我们共收集了三种不同类标签的2470张图片,即健康的肺,普通肺炎和Covid-19感染的肺炎,其中470个X射线图像属于Covid-19类。方法:我们首先使用直方图均衡技术预处理所有图像,并使用U-Net架构进行它们。然后,VGG-16网络用于从预处理图像中的特征提取,该特征提取通过SMTE过采样技术进一步采样以实现平衡数据集。最后,使用具有10倍交叉验证的支持向量机(SVM)分类器分类类平衡功能,评估精度。结果和结论:我们的新方法结合了众所周知的预处理技术,特征提取方法和数据集平衡方法,使我们在2470 X射线图像的数据集中获得了Covid-19图像的优秀识别率为98% 。因此,我们的模型适用于用于筛选目的的医疗保健设施。
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In this paper, deep-learning-based approaches namely fine-tuning of pretrained convolutional neural networks (VGG16 and VGG19), and end-to-end training of a developed CNN model, have been used in order to classify X-Ray images into four different classes that include COVID-19, normal, opacity and pneumonia cases. A dataset containing more than 20,000 X-ray scans was retrieved from Kaggle and used in this experiment. A two-stage classification approach was implemented to be compared to the one-shot classification approach. Our hypothesis was that a two-stage model will be able to achieve better performance than a one-shot model. Our results show otherwise as VGG16 achieved 95% accuracy using one-shot approach over 5-fold of training. Future work will focus on a more robust implementation of the two-stage classification model Covid-TSC. The main improvement will be allowing data to flow from the output of stage-1 to the input of stage-2, where stage-1 and stage-2 models are VGG16 models fine-tuned on the Covid-19 dataset.
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有必要开发负担得起且可靠的诊断工具,该工具允许包含COVID-19的扩散。已经提出了机器学习(ML)算法来设计支持决策系统以评估胸部X射线图像,事实证明,这些图像可用于检测和评估疾病进展。许多研究文章围绕此主题发表,这使得很难确定未来工作的最佳方法。本文介绍了使用胸部X射线图像应用于COVID-19检测的ML的系统综述,旨在就方法,体系结构,数据库和当前局限性为研究人员提供基线。
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Deep learning (DL) analysis of Chest X-ray (CXR) and Computed tomography (CT) images has garnered a lot of attention in recent times due to the COVID-19 pandemic. Convolutional Neural Networks (CNNs) are well suited for the image analysis tasks when trained on humongous amounts of data. Applications developed for medical image analysis require high sensitivity and precision compared to any other fields. Most of the tools proposed for detection of COVID-19 claims to have high sensitivity and recalls but have failed to generalize and perform when tested on unseen datasets. This encouraged us to develop a CNN model, analyze and understand the performance of it by visualizing the predictions of the model using class activation maps generated using (Gradient-weighted Class Activation Mapping) Grad-CAM technique. This study provides a detailed discussion of the success and failure of the proposed model at an image level. Performance of the model is compared with state-of-the-art DL models and shown to be comparable. The data and code used are available at https://github.com/aleesuss/c19.
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新的冠状病毒造成了超过一百万的死亡,并继续迅速传播。这种病毒靶向肺部,导致呼吸窘迫,这可以轻度或严重。肺的X射线或计算机断层扫描(CT)图像可以揭示患者是否感染Covid-19。许多研究人员正在尝试使用人工智能改善Covid-19检测。我们的动机是开发一种可以应对的自动方法,该方法可以应对标记数据的方案是耗时或昂贵的。在本文中,我们提出了使用依赖于Sobel边缘检测和生成对冲网络(GANS)的有限标记数据(SCLLD)的半监督分类来自动化Covid-19诊断。 GaN鉴别器输出是一种概率值,用于在这项工作中进行分类。建议的系统使用从Omid Hosparing收集的10,000 CT扫描培训,而公共数据集也用于验证我们的系统。将该方法与其他最先进的监督方法进行比较,例如高斯过程。据我们所知,这是第一次提出了对Covid-19检测的半监督方法。我们的系统能够从有限标记和未标记数据的混合学习,该数据由于缺乏足够量的标记数据而导致的监督学习者失败。因此,我们的半监督训练方法显着优于卷积神经网络(CNN)的监督培训,当标记的训练数据稀缺时。在精度,敏感性和特异性方面,我们的方法的95%置信区间分别为99.56±0.20%,99.88±0.24%和99.40±0.1.18%,而CNN的间隔(训练有素的监督)为68.34 + - 4.11%,91.2 + - 6.15%,46.40 + - 5.21%。
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一种名为Covid-19的新发现的冠状病毒疾病主要影响人类呼吸系统。 Covid-19是一种由起源于中国武汉的病毒引起的传染病。早期诊断是医疗保健提供者的主要挑战。在较早的阶段,医疗机构令人眼花azz乱,因为没有适当的健康辅助工具或医学可以检测到COVID-19。引入了一种新的诊断工具RT-PCR(逆转录聚合酶链反应)。它从患者的鼻子或喉咙中收集拭子标本,在那里共有19个病毒。该方法有一些与准确性和测试时间有关的局限性。医学专家建议一种称为CT(计算机断层扫描)的替代方法,该方法可以快速诊断受感染的肺部区域并在早期阶段识别Covid-19。使用胸部CT图像,计算机研究人员开发了几种识别Covid-19疾病的深度学习模型。这项研究介绍了卷积神经网络(CNN)和基于VGG16的模型,用于自动化的COVID-19在胸部CT图像上识别。使用14320 CT图像的公共数据集的实验结果显示,CNN和VGG16的分类精度分别为96.34%和96.99%。
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Pneumonia, a respiratory infection brought on by bacteria or viruses, affects a large number of people, especially in developing and impoverished countries where high levels of pollution, unclean living conditions, and overcrowding are frequently observed, along with insufficient medical infrastructure. Pleural effusion, a condition in which fluids fill the lung and complicate breathing, is brought on by pneumonia. Early detection of pneumonia is essential for ensuring curative care and boosting survival rates. The approach most usually used to diagnose pneumonia is chest X-ray imaging. The purpose of this work is to develop a method for the automatic diagnosis of bacterial and viral pneumonia in digital x-ray pictures. This article first presents the authors' technique, and then gives a comprehensive report on recent developments in the field of reliable diagnosis of pneumonia. In this study, here tuned a state-of-the-art deep convolutional neural network to classify plant diseases based on images and tested its performance. Deep learning architecture is compared empirically. VGG19, ResNet with 152v2, Resnext101, Seresnet152, Mobilenettv2, and DenseNet with 201 layers are among the architectures tested. Experiment data consists of two groups, sick and healthy X-ray pictures. To take appropriate action against plant diseases as soon as possible, rapid disease identification models are preferred. DenseNet201 has shown no overfitting or performance degradation in our experiments, and its accuracy tends to increase as the number of epochs increases. Further, DenseNet201 achieves state-of-the-art performance with a significantly a smaller number of parameters and within a reasonable computing time. This architecture outperforms the competition in terms of testing accuracy, scoring 95%. Each architecture was trained using Keras, using Theano as the backend.
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在过去的几年中,卷积神经网络(CNN)占据了计算机视野的领域,这要归功于它们提取功能及其在分类问题中出色的表现,例如在自动分析X射线中。不幸的是,这些神经网络被认为是黑盒算法,即不可能了解该算法如何实现最终结果。要将这些算法应用于不同领域并测试方法论的工作原理,我们需要使用可解释的AI技术。医学领域的大多数工作都集中在二进制或多类分类问题上。但是,在许多现实生活中,例如胸部X射线射线,可以同时出现不同疾病的放射学迹象。这引起了所谓的“多标签分类问题”。这些任务的缺点是类不平衡,即不同的标签没有相同数量的样本。本文的主要贡献是一种深度学习方法,用于不平衡的多标签胸部X射线数据集。它为当前未充分利用的Padchest数据集建立了基线,并基于热图建立了可解释的AI技术。该技术还包括概率和模型间匹配。我们系统的结果很有希望,尤其是考虑到使用的标签数量。此外,热图与预期区域相匹配,即它们标志着专家将用来做出决定的区域。
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自Covid-19大流行开始以来,研究人员已经开发了深入的学习模式,以分类Covid-19诱导的肺炎。与许多医学成像任务一样,可用数据的质量和数量通常是有限的。在这项工作中,我们在公开的Covid-19图像数据上培训深入学习模型,并评估当地医院胸部X射线数据的模型。这些数据已被两个放射科医师审查和标记,以确保模型的泛化能力的高质量估算。此外,我们正在使用生成的对抗网络来基于该数据生成合成X射线图像。我们的结果表明,使用这些用于数据增强的合成图像可以显着提高模型的性能。这可能是许多稀疏数据域的有希望的方法。
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2019年12月,一个名为Covid-19的新型病毒导致了迄今为止的巨大因果关系。与新的冠状病毒的战斗在西班牙语流感后令人振奋和恐怖。虽然前线医生和医学研究人员在控制高度典型病毒的传播方面取得了重大进展,但技术也证明了在战斗中的重要性。此外,许多医疗应用中已采用人工智能,以诊断许多疾病,甚至陷入困境的经验丰富的医生。因此,本调查纸探讨了提议的方法,可以提前援助医生和研究人员,廉价的疾病诊断方法。大多数发展中国家难以使用传统方式进行测试,但机器和深度学习可以采用显着的方式。另一方面,对不同类型的医学图像的访问已经激励了研究人员。结果,提出了一种庞大的技术数量。本文首先详细调了人工智能域中传统方法的背景知识。在此之后,我们会收集常用的数据集及其用例日期。此外,我们还显示了采用深入学习的机器学习的研究人员的百分比。因此,我们对这种情况进行了彻底的分析。最后,在研究挑战中,我们详细阐述了Covid-19研究中面临的问题,我们解决了我们的理解,以建立一个明亮健康的环境。
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这项研究中我们的主要目标是提出一种基于转移学习的方法,用于从计算机断层扫描(CT)图像中检测。用于任务的转移学习模型是验证的X受感受模型。使用了模型结构和ImageNet上的预训练权重。通过128批量的大小和224x224、3个通道输入图像训练所得的修改模型,并从原始512x512,灰度图像转换。使用的数据集是A COV19-CT-DB。数据集中的标签包括1919年COVID-1919检测的COVID-19病例和非旋转19例。首先,使用数据集的验证分区以及精确召回和宏F1分数的准确性和损失来衡量所提出方法的性能。验证集中的最终宏F1得分超过了基线模型。
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根据研究人员在歧视和校准性能方面采用的标准评估实践,这项工作旨在了解阶级不平衡对胸部X射线分类器的性能的影响。首先,我们进行了一项文献研究,分析了普通科学实践并确认:(1)即使在处理高度不平衡的数据集时,社区也倾向于使用由大多数阶级主导的指标; (2)包括包括胸部X射线分类器的校准研究仍然罕见,尽管其在医疗保健的背景下的重要性。其次,我们对两个主要胸部X射线数据集进行了系统实验,探讨了不同类别比率下的几种性能指标的行为,并显示了广泛采用的指标可以隐藏少数阶级中的性能。最后,我们提出了通过两个替代度量,精密召回曲线和平衡的Brier得分,这更好地反映了系统在这种情况下的性能。我们的研究结果表明,胸部X射线分类器研究界采用的当前评估实践可能无法反映真实临床情景中计算机辅助诊断系统的性能,并建议改善这种情况的替代方案。
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胸部射线照相是一种相对便宜,广泛的医疗程序,可传达用于进行诊断决策的关键信息。胸部X射线几乎总是用于诊断呼吸系统疾病,如肺炎或最近的Covid-19。在本文中,我们提出了一个自我监督的深神经网络,其在未标记的胸部X射线数据集上掠夺。学习的陈述转移到下游任务 - 呼吸系统疾病的分类。在四个公共数据集获得的结果表明,我们的方法在不需要大量标记的培训数据的情况下产生竞争力。
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SARS-COV2病毒对人口引起了大量趋势。可以准确地确定一个人是否被Covid-19感染的预测建模是必要的。该研究提出了一种利用深色特征提取技术的新方法,预先训练的Reset50作用为网络的骨干,与Logistic回归相结合作为头部模型。拟议的模型已经在Kaggle Covid-19射线照相数据集上培训。所提出的模型在CoVID-19和正常的X射线图像类上实现了100%的交叉验证精度。同样,当在组合三类上测试时,所提出的模型精度达到98.84%。
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Computer vision and machine learning are playing an increasingly important role in computer-assisted diagnosis; however, the application of deep learning to medical imaging has challenges in data availability and data imbalance, and it is especially important that models for medical imaging are built to be trustworthy. Therefore, we propose TRUDLMIA, a trustworthy deep learning framework for medical image analysis, which adopts a modular design, leverages self-supervised pre-training, and utilizes a novel surrogate loss function. Experimental evaluations indicate that models generated from the framework are both trustworthy and high-performing. It is anticipated that the framework will support researchers and clinicians in advancing the use of deep learning for dealing with public health crises including COVID-19.
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Computer tomography (CT) have been routinely used for the diagnosis of lung diseases and recently, during the pandemic, for detecting the infectivity and severity of COVID-19 disease. One of the major concerns in using ma-chine learning (ML) approaches for automatic processing of CT scan images in clinical setting is that these methods are trained on limited and biased sub-sets of publicly available COVID-19 data. This has raised concerns regarding the generalizability of these models on external datasets, not seen by the model during training. To address some of these issues, in this work CT scan images from confirmed COVID-19 data obtained from one of the largest public repositories, COVIDx CT 2A were used for training and internal vali-dation of machine learning models. For the external validation we generated Indian-COVID-19 CT dataset, an open-source repository containing 3D CT volumes and 12096 chest CT images from 288 COVID-19 patients from In-dia. Comparative performance evaluation of four state-of-the-art machine learning models, viz., a lightweight convolutional neural network (CNN), and three other CNN based deep learning (DL) models such as VGG-16, ResNet-50 and Inception-v3 in classifying CT images into three classes, viz., normal, non-covid pneumonia, and COVID-19 is carried out on these two datasets. Our analysis showed that the performance of all the models is comparable on the hold-out COVIDx CT 2A test set with 90% - 99% accuracies (96% for CNN), while on the external Indian-COVID-19 CT dataset a drop in the performance is observed for all the models (8% - 19%). The traditional ma-chine learning model, CNN performed the best on the external dataset (accu-racy 88%) in comparison to the deep learning models, indicating that a light-weight CNN is better generalizable on unseen data. The data and code are made available at https://github.com/aleesuss/c19.
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这项研究的目的是开发一个强大的基于深度学习的框架,以区分Covid-19,社区获得的肺炎(CAP)和基于使用各种方案和放射剂量在不同成像中心获得的胸部CT扫描的正常病例和正常情况。我们表明,虽然我们的建议模型是在使用特定扫描协议仅从一个成像中心获取的相对较小的数据集上训练的,但该模型在使用不同技术参数的多个扫描仪获得的异质测试集上表现良好。我们还表明,可以通过无监督的方法来更新模型,以应对火车和测试集之间的数据移动,并在从其他中心接收新的外部数据集时增强模型的鲁棒性。我们采用了合奏体系结构来汇总该模型的多个版本的预测。为了初始培训和开发目的,使用了171 Covid-19、60 CAP和76个正常情况的内部数据集,其中包含使用恒定的标准辐射剂量扫描方案从一个成像中心获得的体积CT扫描。为了评估模型,我们回顾了四个不同的测试集,以研究数据特征对模型性能的转移的影响。在测试用例中,有与火车组相似的CT扫描,以及嘈杂的低剂量和超低剂量CT扫描。此外,从患有心血管疾病或手术病史的患者中获得了一些测试CT扫描。这项研究中使用的整个测试数据集包含51 covid-19、28 CAP和51例正常情况。实验结果表明,我们提出的框架在所有测试集上的表现良好,达到96.15%的总准确度(95%CI:[91.25-98.74]),COVID-119,COVID-96.08%(95%CI:[86.54-99.5],95%),[86.54-99.5],),,),敏感性。帽敏感性为92.86%(95%CI:[76.50-99.19])。
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自从2020年的Covid-19流行病发作以来,数百万人屈服于这种致命的病毒。已经制定了许多尝试来设计一种可以检测到病毒的自动测试方法。全球各地的研究人员提出了基于深度学习的方法,以使用胸部X射线检测Covid-19。但是,在大多数研究人员使用的公开胸部X射线数据集中,已经提出了问题。在本文中,我们提出了一个2分阶段的方法来解决这个主题问题。已经进行了两个实验作为在数据集中出现偏置存在的方法的第1阶段的一部分。随后,已经提出了在方法的第2阶段中提出了一种图像分割,超分辨率和基于CNN的流水线以及不同的图像增强技术,以减少偏置的效果。 InceptionResNetv2在胸部X射线图像上培训,随着直方图均衡而增强,其次通过阶段2中提出的管道时γ校正,为3级(正常,肺炎和Covid-19)分类产生了90.47%的最高精度任务。
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